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SNOMED CT o maior projecto de ontologias na área de saúde Stefan Schulz Institut für Medizinische Biometrie und Medizinische Informatik Universitätsklinikum Freiburg

SNOMED CT o maior projecto de ontologias na área de saúde Stefan Schulz Institut für Medizinische Biometrie und Medizinische Informatik Universitätsklinikum

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Page 1: SNOMED CT o maior projecto de ontologias na área de saúde Stefan Schulz Institut für Medizinische Biometrie und Medizinische Informatik Universitätsklinikum

SNOMED CT

o maior projecto de

ontologias na área de

saúde

Stefan SchulzInstitut für Medizinische Biometrie und

Medizinische Informatik

Universitätsklinikum Freiburg

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SNOMED CT

Standardized Nomenclature of Medicine – Clinical Terms:

Sistema de codificação para todo o conteudo do prontuário eletrônico

Padrão terminológico global

Manutenção / desenvolvimento: IHTSDO (International Health

Terminology Standards Development Organisation):

Membros: US, UK, AU, NZ, CA, DK, SE, NL, LV, ES

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SNOMED CT:

SNOMED CT como vocabulário controlado

SNOMED CT como sistema formal

SNOMED CT como ontologia

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SNOMED CT como vocabulário controlado

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SNOMED CT como vocabulário controlado

Termos médicos (inclusive sinônimos

e traduções) são conectados com

conceitos (portadores de significado)

z.Zt.311 000

conceitos

z.Zt. 732 000 termos em

Inglês

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SNOMED CT como sistema formal

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SNOMED CT como sistema formal

taxonomias:espscialização

(is-a)

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SNOMED CT como sistema formal

Restrições: lógica de descriçãoC1 – Rel – C2 significa:x: instanceOf(x, C1) y: instanceOf(C2) Rel(x,y)ouC1 ⊑ Rel.C2

Relações (Attributos): Associated morphologyFinding site

(50 tipos)

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Lógica de descrição

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SNOMED CT como sistema formal

definierte vs. primitive Konzepte

conceitos definidos conceitos primitivos ⊑

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Déficit de versões anteriores da SNOMED

D5-46210 Acute appendicitis, NOS

D5-46100 Appendicitis, NOS

G-A231 Acute

M-41000 Acute inflammation, NOS

G-C006 In

T-59200 Appendix, NOS

G-A231 Acute

M-40000 Inflammation

G-C006 In

T-59200 Appendix, NOS

SNOMED INTERNATIONAL

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SNOMED CT como Ontologia

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SNOMED CT como Ontologia

Ordem de um domínio de acordo com propriedades genéricas e invariáveis

Ontologia: categorias disjuntas com critérios estritos(process, object, substance, quality)

Número restrito de relações (z.B. part-of, has-location, …) „Ontological commitment“: quais são as instâncias?

objetos no mundo (“minha dor de estômago”) objetos de documentação (o que está documentado sobre minha

dor de cabeza conhecimento (o que o médico atualmente sabe sobre

minha dor de cabeça)

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Social context (10)CommunityFamilyGroup

(…)Special concept

Namespace conceptNavigational conceptNon-current concept

Specimen (45)Biopsy sampleBody substance sampleCardiovascular sample(…)

Staging and scales (6)Assessment scalesEndometriosis

classificationof American Fertility

Society(…)

Substance (11)Allergen classBiological substanceBody substance (…)

Body structure (10)Acquired body structureAnatomical organizational pattern(…)

Clinical finding (22)Administrative statusesAdverse incident outcome categories

(…)Environment or geographical location

EnvironmentGeogr. and/or political region of the

worldEvent (19)

AbuseAccidental eventBioterrorism related event (…)

Linkage conceptAttributeLink assertion

Observable entityAge AND/OR growth periodBody product observable (…)

Clin. history / examination observable (21)Device observableDrug therapy observableFeature of Entity (…)

Organism (11)AnimalChromistaInfectious agent (…)

Pharmaceutical / biologic product (58)Alcohol productsAlopecia preparationAlternative medicines (…)

Physical force (21)AltitudeElectricity (…)

Physical object (8)DeviceDomestic, office and

garden artefactFastening (…)

Procedure (23)Administrative procedureCommunity health

procedure(…)

Qualifier value (52)ActionAdditional dosage

instructions(…)

Record artifactRecord organizerRecord type

Situation with explicit context (17)A/N risk factorsCritical incident factors

(…)

SNOMED CT Top

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SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

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SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

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SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

Disorder of appendix (disorder)Disorder of digestive system (disorder)Disease (disorder)Appendicitis (disorder)Disorder of digestive organ (disorder)Disorder of lower gastrointestinal tract (disorder)Disorder of digestive tract (disorder)Disorder of intestine (disorder)Finding by site (finding)Finding of large intestine (finding)Disorder of abdomen (disorder)Disorder of gastrointestinal tract (disorder)General finding of abdomen (finding)Disorder of large intestine (disorder)Disorder by body site (disorder)Disorder of trunk (disorder)Inflammatory disorder (disorder)Acute inflammatory disease (disorder)

Inflammatory disorder of digestive tract (disorder)SNOMED CT Concept (SNOMED RT+CTV3)Abdominal organ finding (finding)Bowel finding (finding)Finding of appendix (finding)Finding of body region (finding)Inflammation of large intestine (disorder)Finding of trunk structure (finding)Disorder of body system (disorder)Inflammation of specific body organs (disorder)Inflammation of specific body structures or tissue (disorder)Inflammation of specific body systems (disorder)Inflammatory disorder of digestive system (disorder)Digestive system finding (finding)Gastrointestinal tract finding (finding)Disorder of body cavity (disorder)Clinical finding (finding)Viscus structure finding (finding)

Root Concept: Acute appendicitis (disorder)The following 36 "Is a" antecedents are present in the SNOMED hierarchy: