36
Tartu Ülikool Loodus- ja Tehnoloogiateaduskond Ökoloogia ja Maateaduste Instituut Botaanika osakond Triin Sakermaa SOONTAIMEDE FÜLOGENEETILINE MITMEKESISUS PAEKIVIKARJÄÄRIDES Magistritöö Juhendaja: teadur Pille Gerhold Tartu 2011

SOONTAIMEDE FÜLOGENEETILINE MITMEKESISUS ......lähisugulased on ökoloogiliselt sarnasemad kui kaugelt suguluses olevad liigid. Peale selle võib liigiteke leida aset ka ilma mõõdetavate

  • Upload
    others

  • View
    0

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

  • Tartu Ülikool

    Loodus- ja Tehnoloogiateaduskond

    Ökoloogia ja Maateaduste Instituut

    Botaanika osakond

    Triin Sakermaa

    SOONTAIMEDE FÜLOGENEETILINE

    MITMEKESISUS PAEKIVIKARJÄÄRIDES

    Magistritöö

    Juhendaja: teadur Pille Gerhold

    Tartu 2011

  • 2

    Sisukord

    1. SISSEJUHATUS ...................................................................................................... 3

    1.1 FÜLOGENEETILINE MITMEKESISUS ......................................................................... 3 1.2 KOOSLUSTE FÜLOGENEETILINE STRUKTUUR .......................................................... 4 1.3 LEITUD MITTE-JUHUSLIKUD FÜLOGENEETILISED MUSTRID KOOSLUSTE STRUKTUURIS .............................................................................................................. 6 1.4 TÖÖ EESMÄRGID .................................................................................................... 9

    2. MATERJAL JA METOODIKA ........................................................................... 11

    2.1 UURIMISALADE ISELOOMUSTUS ........................................................................... 11 2.2 ANDMETÖÖTLUS .................................................................................................. 11

    3. TULEMUSED ........................................................................................................ 13

    4. ARUTELU .............................................................................................................. 19

    5. KOKKUVÕTE ....................................................................................................... 24

    6. SUMMARY ............................................................................................................ 26

    7. TÄNUAVALDUSED .............................................................................................. 28

    8. KASUTATUD KIRJANDUS ................................................................................ 29

    9. LISAD ..................................................................................................................... 34

  • 3

    1. Sissejuhatus

    1.1 Fülogeneetiline mitmekesisus

    Ökolooge on läbi aegade huvitanud küsimus, mis mõjutab looduslike koosluste liigilist koosseisu.

    On selleks koosluste liigifond, liikidevahelised interaktsioonid (nt konkurents) või toimub liikide

    valik hoopis keskkonna faktorite mõjul, kui kasvukohtade ökoloogilised tingimused määravad

    liigilise koosseisu?

    Uudne lähenemine koosluste liigilise koosseisu uurimisel on analüüsida liikide fülogeneesi.

    Koosluse fülogeneetiline struktuur kirjeldab koosluses esinevate liikide sugulusastet – kui lähedalt

    või kaugelt suguluses on antud koosluses leiduvad liigid. Evolutsiooni dimensiooni kaasamine

    biodiversiteedi uurimustesse pakub uusi võimalusi võrrelda erinevaid ökoloogilisi protsesse (Chave

    et al. 2007; Emerson & Gillespie 2008). Fülogeneetilist mitmekesisust mõõtvatel näitajatel on ka

    kaks eelist taksonoomilise mitmekesisuse indeksite ees (Agrawal et al. 2007). Esiteks, võttes

    arvesse liikide vahelised fülogeneetilised kaugused, annab fülogeneetiline mitmekesisus aimu

    liikide geneetilisest erinevusest (Agrawal et al. 2007). Teiseks ei sõltu fülogeneetiline mitmekesisus

    liikide ja teiste taksonoomiliste üksuste definitsioonist, mis on tihti meelevaldsed ja vaieldavad

    (Agrawal et al. 2007; Vamosi et al. 2009).

    Mitmed uurimused on tõestanud, et fülogeneetiline mitmekesisus on iseseisev biodiversiteedi

    näitaja ning sõltumatu taksonoomilisest liigirikkusest (Chave et al. 2007; Forest et al. 2007;

    Dinnage 2009). Forest et al. (2007) uurisid Lõuna-Aafrika neeme liigirikkast piirkonda. Nende

    eesmärgiks oli näidata taksonoomilise ja fülogeneetilise mitmekesisuse omavahelist sõltumatust,

    mida uurimuse tulemused ka tõestasid. Neeme läänepoolne ning kaks korda liigirikkam osa oli

    fülogeneetiliselt vaesem, samas kui neeme idapoolne, suhteliselt liigivaesem piirkond oli

    fülogeneetiliselt mitmekesisem (Forest et al. 2007). 124 troopilise Lõuna-Ameerika piirkonna

    uurimisest selgus, et liigirikkamates piirkondades ei olnud fülogeneetiline liigirikkus suurem

    (Chave et al. 2007). Sellest järeldub, et fülogeneetiline ja taksonoomiline mitmekesisus ei ole

    korreleeritud (Chave et al. 2007).

    Koosluste fülogeneetilise struktuuri uurimine on oluline mitmel põhjusel. Cadotte et al. (2008)

    näitasid, et fülogeneetiline mitmekesisus ennustab koosluste produktiivsust paremini kui liigirikkus

    ja funktsionaalsete gruppide rikkus. Seega peaks fülogeneetiline hajutatus ehk mitmekesisus

    suurendama ökosüsteemi produktiivsust, sest maksimiseerib ressursside kasutamist (Cavender-

  • 4

    Bares et al. 2009). Lisaks arutlesid Cavender-Bares et al. (2009), et kõrge fülogeneetiline

    mitmekesisus suurendab ökosüsteemi stabiilsust, sest leidub rohkem ökoloogilisi strateegiaid, mis

    tagavad ökosüsteemi säilimise muutuvates oludes. Fülogeneetilist mitmekesisust võib seostada ka

    invasioonidele vastuvõtlikkuse, mulla süsiniku akumuleerumise, toitainete ringlemise ja teiste

    ökosüsteemide protsessidega (Cavender-Bares et al. 2009).

    Tähelepanu on juhitud looduskaitse praktikalegi, kus kaitse alla võetakse taksonoomiliselt

    liigirikkad alad, mis ei pruugi aga olla ka fülogeneetiliselt liigirikkaimad (Chave et al. 2007; Forest

    et al. 2007). Fülogeneetiline mitmekesisus on aga ülioluline muutuvas keskkonnas, sest

    fülogeneetiliselt rikkad kooslused on geenide ja tunnuste osas mitmekesisemad ja suudavad

    suurema tõenäosusega muutuvates tingimustes säilida ning funktsioneerida (Forest et al. 2007,

    Cavender-Bares et al. 2009). Seega on koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse hindamine kõrge

    biodiversiteediga aladel looduskaitse strateegiate määramisel ülimalt oluline (Chave et al. 2007).

    1.2 Koosluste fülogeneetiline struktuur

    Koosluste fülogeneetilist struktuuri kujundavate protsesside hindamisel on levinud kolm teooriat.

    Neutraalse teooria järgi on koosluste struktuur avatud, pidevalt muutuv, mitte tasakaaluline kogum

    liike, mille hulga määravad juhuslikud liigitekked, väljasuremised, levik ja muud stohhastilised

    protsessid (Hardy & Senterre 2007; Cavender-Bares et al. 2009). Sellest teooriast järeldub, et

    koosluste fülogeneetiline struktuur on juhuslik ning selles ei esine mingisuguseid mustreid.

    Koosluse neutraalse kujunemise teooriat lükkavad ümber aga mitmed uurimused, kus koosluste

    fülogeneetiline struktuur ei ole juhuslik. Kirjeldan neid uurimusi edaspidi pikemalt.

    Üldine eeldus on, et kuna mitmed taimede tunnused ühes sugupuus on evolutsiooniliselt

    konservatiivsed, see tähendab, et lähisugulastel on sarnased tunnused, siis oodatakse positiivset

    korrelatsiooni liikide suguluse ja ökoloogilise sarnasuse vahel (Webb 2000). See seos esineb, kuna

    liigid on pärinud mingisuguse arengulise raja, mis põhjustab takistusi evolutsioonilistele muutustele

    ning võib seega piirata olemasolevat tunnuse ruumi ehk varieeruvuse amplituudi, millele looduslik

    valik saaks mõjuda (Webb 2000). Lisaks on näidatud erinevatel skaaladel, et taimede ökoloogiline

    nišš on fülogeneetiliselt konservatiivne (Prinzing et al. 2001; Crisp et al. 2009), millest järeldub, et

    lähisugulased on ökoloogiliselt sarnasemad kui kaugelt suguluses olevad liigid. Peale selle võib

    liigiteke leida aset ka ilma mõõdetavate muutusteta ökoloogilises niššis (Peterson et al. 1999).

    Niisiis, kuna lähedalt suguluses olevad liigid on ökoloogiliselt sarnasemad, peaksid koosluste

  • 5

    liigilist koosseisu kujundavad ökoloogilised protsessid kajastuma koosluse fülogeneetilises

    struktuuris (Kraft et al. 2007). Mitte-juhuslik koosluste fülogeneetiline struktuur võib olla

    fülogeneetiliselt a) klasterdunud (ingl k phylogenetically clustered), mis tähendab, et koosluses

    kasvab rohkem lähedalt suguluses olevaid taimeliike või b) hajutatud (ingl k phylogenetically

    overdispersed), kui koosluses kasvavad taimeliigid on üksteisega vaid kaugelt suguluses.

    Mitte-juhuslike fülogeneetiliste mustrite esinemist kooslustes seletab kaks vastanduvat teooriat.

    Kasvukoha filtreerimise teooria kohaselt esinevad kooslustes lähedalt suguluses olevad liigid, sest

    nende nõudlused keskkonnatingimustele on sarnased (Webb 2000). Selliste koosluste

    fülogeneetiline struktuur on klasterdunud ning fülogeneetiline mitmekesisus väiksem.

    Klassikaline konkurentsiteooria ütleb aga, et lähedalt suguluses olevad liigid ei saa koos

    eksisteerida, sest kasutavad samu ressursse, mis välistab seega lähisugulaste kasvamise samas

    koosluses. Ökoloogiliselt sarnaste liikide vahel on konkurents intensiivsem kui vähem sarnaste

    liikide vahel (Johansson & Keddy 1991). Negatiivset korrelatsiooni fülogeneetilise kauguse ja

    konkurentsi intensiivsuse vahel on näidanud ka Cahill et al. (2008). Selline kooslus, kus konkurents

    limiteerib ökoloogiliselt sarnaste liikide koosesinemist, on fülogeneetiliselt hajutatud ning selle

    fülogeneetiline mitmekesisus on suurem.

    Kuigi kaks viimati mainitud teooriat on koosluste ökoloogias pälvinud kõige rohkem tähelepanu,

    võivad liigilist koosseisu kujundada ka teised faktorid nagu mutualism, fassilitatsioon jms (Vamosi

    et al. 2009). Samuti võivad liikide interaktsioonid ja kasvukoha filtreerimine mõjuda samal ajal,

    toimides võrdsel jõul vastassuundades (Cavender-Bares et al. 2006), mis kajastub koosluse

    fülogeneetilise struktuuri juhuslikkuses. Juhuslikke mustreid koosluste struktuuris võivad aga

    põhjustada ka eelmainitud protsessid, juhul kui tunnused on evolutsiooniliselt konvergentsed (Webb

    et al. 2002). Näiteks Brasiilia savannides läbiviidud uurimus näitas kooslustes puuliikide juhuslikku

    fülogeneetilist struktuuri, sest puude tunnused ei olnud konservatiivsed (Silva & Batalha 2009).

    Autorid ei lükanud ümber kasvukoha filtreerimise olulisust, vaid pigem rõhutasid seoste keerukust

    tunnuste, keskkonna filtrite ja fülogeneetilise ajaloo vahel (Silva & Batalha 2009). Lisaks võib

    juhuslik struktuur liigirikastes kooslustes nagu savannid esineda seetõttu, et kõrge liigirikkusega

    aladel on suurem tõenäosus, et kaugelt suguluses olevatel liikidel tekivad evolutsiooni käigus

    juhuslikult sarnased tunnused (Kraft et al. 2007; Silva & Batalha 2009).

    Koosluste fülogeneetilise struktuuri mustrite leidmisel omab suurt rolli uuritava ala ruumiline

    skaala, sest fülogeneetiline klasterdumine ja hajutatus sõltuvad skaalast (Webb et al. 2002; Swenson

  • 6

    et al. 2006). Näiteks kontinentaalsel skaalal (1000 – 10 000 km) toimub fülogeneetiline

    klasterdumine, mis on põhjustatud biogeograafilistest protsessidest suurtel aladel (Webb et al.

    2002). Biogeograafilise ajaloo tõttu suureneb skaalaga fülogeneetiline klasterdumine, sest liigid

    samast klaadist on kontsentreerunud alale, kus klaad on evolutsioonis tekkinud (Cavender-Bares et

    al. 2009). Seetõttu on uuritavas piirkonnas suur hulk taksoneid keskmiselt üksteisega lähemalt

    suguluses kui taksonitega teistes piirkondades (Cavender-Bares et al. 2009). Regiooni tasemel (10 -

    1000 km) võib aset leida fenotüübiline sorteerumine erinevate koosluste vahel nagu näiteks

    märgalad ja mäed (Webb et al. 2002). See võib omakorda põhjustada fülogeneetilise klasterdumise

    või hajutatuse, sõltuvalt sellest, kas olulised tunnused on konservatiivsed või konvergentsed (Webb

    et al. 2002). Samas on Cavender-Bares et al. (2009) väitnud, et hiljuti divergeerunud liikide

    tendents kasvada sarnastes kasvukohtades põhjustab regiooni skaalal fülogeneetilist klasterdumist.

    Koosluste tasemel (100 m - 1 km) peaksid liigid koonduma vastavalt valitsevale ökoloogilisele

    protsessile: kasvukoha filtreerimine või konkurents sarnaste liikide vahel (Webb et al. 2002).

    Konkurents, kuid ka teised tihedusest sõltuvad mehhanismid, on ennustatavalt kõige tugevamad

    väikesel ruumilisel skaalal, mis võib tingida fülogeneetilise hajutatuse (Cavender-Bares et al. 2009).

    Lisaks sõltub koosluse fülogeneetiline struktuur uurimuse fülogeneetilisest skaalast (Cavender-

    Bares et al. 2006; Swenson et al. 2006).

    Koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse uurimisel on aga mitmeid takistusi. Nimelt on

    fülogeneesipuud veel tõestamata hüpoteesid, mis tähendab, et nende kasutamisel järelduste

    tegemiseks koosluste koosseisu kujundavate protsesside kohta tuleb arvestada nende oletatava ja

    ebakindla olemusega (Webb et al. 2002). Samuti nõuaks liikide suguluse ja ökoloogilise sarnasuse

    vaheline seos mahukat ning keerulist uurimust, et selgitada välja, millised tunnused on

    evolutsiooniliselt konvergentsed ja millised konservatiivsed (Webb 2000).

    1.3 Leitud mitte-juhuslikud fülogeneetilised mustrid koosluste struktuuris

    Viimastel aastatel on fülogeneetiliste uurimuste levimisega ökoloogias leitud mitte-juhuslikke

    fülogeneetilisi mustreid koosluste koosseisus erinevates paikades üle maailma (Webb 2000;

    Cavender-Bares et al. 2004; Cavender-Bares et al. 2006; Proches et al. 2006, Hardy & Senterre

    2007; Dinnage 2009; Letcher 2010). Lisaks viidi 2009. aastal 24 artikli põhjal läbi metaanalüüs, mis

    täheldas, et levinuim vaadeldud muster kooslustes on fülogeneetiline klasterdumine (Vamosi et al.

    2009). Siinkohal kirjeldan mõnda uurimust lähemalt.

  • 7

    Cavender-Bares et al. (2004) uurisid Florida metsamaade kooslusi, kus dominantseks liigiks oli

    tamm ning leidsid, et neis kooslustes esines kaugemalt suguluses olevaid tammeliike oodatust

    tihedamini ehk kooslus oli fülogeneetiliselt hajutatud. Leiti, et peamiseks koosluste struktuuri

    kujundavaks protsessiks oli kasvukoha filtreerimine, mis põhjustas koosluse fülogeneetilise

    hajutatuse, sest olulised ökoloogilised tunnused olid evolutsioonis konvergentsed (Cavender-Bares

    et al. 2004). Samas väitsid autorid tulemuste põhjal, et Florida metsakoosluste struktuuri on

    kujundanud peale kasvukoha filtreerimise ka liikidevahelised interaktsioonid (Cavender-Bares et al.

    2004). Lisaks toodi välja oluline asjaolu, et fülogeneetilise mustri leidmine on sõltuvuses

    fülogeneetilisest skaalast (Cavender-Bares et al. 2004). Selles töös oli uurimise all üks

    taimeperekond – Quercus, seega oli fülogeneetiline skaala väga kitsas (Cavender-Bares et al. 2004).

    Järgmises uurimuses näitasid Cavender-Bares et al. (2006), et kui suurendada ruumilist ja

    fülogeneetilist skaalat, erinevad tulemused suuresti. Kui uurimise alla võeti kogu Florida osariik,

    suurenes nii koosluste varieeruvus (rannikualad ja subtroopilised kooslused) kui ka keskkonna

    heterogeensus, mistõttu suurenes ka taksonite arv (arvestati kõiki seemnetaimi; Cavender-Bares et

    al. 2006). Märgati selget fülogeneetilise klasterdumise mustrit ehk liigid olid lähemalt suguluses,

    kui oodati (Cavender-Bares et al. 2006). Selle tööga püüavad autorid leida lahendust ühele

    suurimale vastuolule ökoloogias kasvukoha filtreerimise ja limiteeriva sarnasuse teooria vahel,

    näidates, et kooslusi kujundav domineeriv protsess sõltub skaalast, millel kooslusi uuritakse

    (Cavender-Bares et al. 2006). Suuremal skaalal määrab koosluse struktuuri kasvukoha filtreerimine

    ning väiksemal skaalal limiteerivad liikide koosesinemist negatiivsed interaktsioonid nagu

    konkurents (Cavender-Bares et al. 2006). Samuti tõestavad nad oma eelmises töös (Cavender-Bares

    et al. 2004), et koosluste fülogeneetiline struktuur sõltub ka fülogeneetilisest skaalast ehk sellest,

    milliseid taksone uurimuses arvesse võetakse (Cavender-Bares et al. 2006). Sama regiooni

    kooslused näivad hajutatud kitsamal fülogeneetilisel skaalal (üks takson, nt tamme perekond,

    Cavender-Bares et al. 2004), aga klasterdunud laiemal skaalal (kõik seemnetaimed, Cavender-Bares

    et al. 2006). Selle näite varal on selgesti näha, et erinevatel ruumi ja fülogeneetilistel skaaladel, kuid

    samas uurimussüsteemis võivad korraga esineda nii fülogeneetiline hajutatus kui klasterdumine.

    Ka Webb (2000) otsis oma töös Borneo vihmametsade puuliikide fülogeneetilisest struktuurist

    lahendust küsimusele, kumb protsess mõjutab koosluste koosseisu – kasvukoha filtreerimine või

    konkurentsed interaktsioonid. Ta väitis, et kui liigid uuritavates kooslustes on oodatust

    ökoloogiliselt sarnasemad, tähendaks see seda, et kasvukoht ehk abiootilised tegurid määraksid

    koosluste struktuuri (Webb 2000). Kui aga liigid on oodatust ökoloogiliselt vähem sarnased,

    tõestaks see konkurentsi teooriat, et limiteeriv sarnasus takistab lähisugulastel kooseksisteerida

  • 8

    (Webb 2000). Uurimuse tulemused näitavad, et Borneo vihmametsades esineb puuliikide

    fülogeneetiline klasterdumine (Webb 2000). Eeldades, et fülogeneetiline sugulus ja ökoloogiline

    sarnasus on positiivselt korreleeritud, väitis autor oma tulemustele toetudes, et kasvukoha

    filtreerimine mängib koosluste liigilise koosseisu kujunemisel olulisemat rolli kui väljatõrjumine

    konkurentsi poolt (Webb 2000). Metsapuude fülogeneetilist klasterdumist troopikas näitasid ka

    Hardy & Senterre (2007) uurimustöö tulemused.

    Kanadas läbiviidud uurimuses hinnati häiritud ja pikka aega häirimata koosluste fülogeneetilist

    struktuuri (Dinnage 2009). Analüüsiti vanade põldude fülogeneetilist struktuuri ning leiti, et hiljuti

    küntud ehk häiritud kooslused on oodatust fülogeneetiliselt klasterdunumad (Dinnage 2009). Sellise

    struktuuri on ilmselt põhjustanud keskkonna filtreerimine (Dinnage 2009). Häirimata koosluste

    fülogeneetilises struktuuris mingisugust mustrit aga ei leitud (Dinnage 2009). Samuti näitab see

    uurimus taaskord, et fülogeneetiline ja taksonoomiline mitmekesisus ei ole korreleeritud (Dinnage

    2009). Häiritud kooslustes, mis olid fülogeneetiliselt vaesemad, leidus häirimata kooslustest 70%

    võrra rohkem liike (Dinnage 2009).

    Fülogeneetilist mitmekesisust seletavad ka keskkonna parameetrid. On näidatud, et puude

    fülogeneetiline mitmekesisus troopikas korreleerub tugevasti keskkonna parameetritega (Tallents et

    al. 2005; Slik et al. 2009). Fülogeneetilise mitmekesisuse suurenemist metsades seletas kõrgus

    merepinnast ja temperatuuri kõikumine (Slik et al. 2009). Madalike metsad olid fülogeneetiliselt

    klasterdunud, samas kui suurtel kõrgustel olid kooslused fülogeneetiliselt hajutatud (Tallents et al.

    2005; Slik et al. 2009). Aastane sademetehulk, sademete sesoonsus ja temperatuuri aastane vahemik

    mõjutasid fülogeneetilist mitmekesisust negatiivselt (Slik et al. 2009). Mulla parameetrid olid

    puude fülogeneetilise mitmekesisuse kujundamisel väheolulised (Slik et al. 2009).

    Uuritud on ka puukoosluste fülogeneetilise struktuuri dünaamikat troopilise metsa suktsessiooni

    käigus (Letcher 2010). Erinevas vanuses troopilised suktsessioonilised metsad (5 vanuseklassi, 10 -

    40 aasta vanused ja vanemad metsad) olid fülogeneetiliselt hajutatud, mis näitab, et suktsessioon

    põhjustab taimekoosluste struktuuris mitte-juhuslikke fülogeneetilisi mustreid (Letcher 2010).

    Suktsessiooni algusjärgus olevates metsades oli fülogeneetiline hajutatus vähem tähtis kui

    vanemates metsades (Letcher 2010). Suktsessiooni käigus suureneb liigirikkus, mistõttu tõuseb

    biootiliste interaktsioonide tähtsus ning suurenenud konkurents tekitab koosluses fülogeneetiliselt

    hajutatud struktuuri (Letcher 2010).

  • 9

    1.4 Töö eesmärgid

    Sarnaselt Letcheri (2010) uurimusele on käesolevaski töös uurimuse alla võetud dünaamiline

    taimekooslus, kus toimub suktsessioon. Mahajäetud paekivikarjäärides, kus majandustegevuse

    lõppedes hakkab kooslus suktsessiooni käigus taastuma, on võimalik uurida liigilise koosseisu

    muutumist liikide loodusliku lisandumisega. Eeldatakse, et karjäär muutub suktsessiooni käigus

    looniidu (kaevandamisele eelnenud koosluse) sarnaseks, sest kõrge pHga õhukesel mullakihil

    saavad kasvada eelkõige looliigid. Loopealseid iseloomustab kõrge liigirikkus (Pärtel et al. 1996),

    seda nii looliikide kui ka mitte-looliikide osas, sest looniitude majandamine ühtlustab konkurentsi

    ning loopealsete aluselistele muldadele on kohastunud palju liike (Pärtel 2002).

    Kasutades fülogeneesi võib olla võimalik välja selgitada, milline ökoloogiline protsess mängib

    suuremat rolli suktsessioonilise koosluse koosseisu kujundamisel - kas limiteeriv sarnasus

    (konkurents) või kasvukoha filtreerimine (Dinnage 2009). On arvatud, et kahe valitseva protsessi

    tasakaal muutub suktsessiooni käigus ning põhjustab seega muutusi koosluse fülogeneetilises

    struktuuris (Dinnage 2009). Huvi pakub, kas kooslusse tulevad lähedamalt suguluses olevad liigid

    või kaugemalt ehk kas kooslus muutub fülogeneetiliselt klasterdunumaks või hajutatumaks.

    Täpsemalt uuritakse, kas koosluses esinevad liigid on lähemalt või kaugemalt suguluses kui

    nullmudelites, milles liikide levik liigifondist kooslusesse on randomiseeritud. Nullmudeliks

    võetakse vastava koosluse regionaalse liigifondi fülogeneetiline mitmekesisus. Lisaks uuritakse,

    millised koosluste abiootilised parameetrid mõjutavad ühe või teise fülogeneetilise mustri

    domineerimist. Selliste dünaamiliste koosluste jälgimine fülogeneetilisel tasemel aitab meil

    paremini mõista, millised ökoloogilised protsessid kooslusi kujundavad.

    Käesolevast uurimusest oodatakse, et majandatavates karjäärides ei ole juhuslikkusest erinevat

    fülogeneetilist mustrit, sest tegu on kooslustega, kus häiring on parasjagu toimumas; seega on

    liikide saabumine kooslusesse ja seal püsimine juhuslik ning koosluse fülogeneetiline struktuur ei

    ole välja kujunenud. Eeldatakse, et ida- ja lõunapoolsemate hüljatud karjääride kooslused on

    fülogeneetiliselt vaesemad kui Põhja- ja Lääne-Eesti karjäärides, sest Põhja- ja Lääne-Eestis asub

    rohkem loopealseid. Seega on nende piirkondade kohalikus liigifondis suurem looliikide

    mitmekesisus. Samuti võiks eeldada, et õhemal mullakihil on suurem fülogeneetiline mitmekesisus,

    sest lisanduvad liigid on looliigid, kes on kohastunud paekivi peal kasvama. Püstitatakse hüpotees,

    et karjääride kooslused on fülogeneetiliselt seda rohkem hajutunud, mida rohkem loopealseid kui

    karjäärides enne kaevandamise algust valitsenud kooslusi on nende ümbruses. Säärast mustrit

    oodatakse põhjusel, et mahajäetud karjääridesse lisanduvad liigid on tõenäosemalt looliigid, mis on

  • 10

    omavahel kaugelt suguluses. Oodatakse koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse tõusu karjääri

    pindalaga, sest suuremad karjäärid on heterogeensemad ning neis on rohkem eriilmelisi kasvukohti.

    Eeldatakse, et looliigid on Põhja-ja Lääne-Eesti karjäärides fülogeneetiliselt hajutatumad, sest

    nendes piirkondades on rohkem loopealseid ning looliikide mitmekesisus on suurem. Sellest

    tuleneb ka hüpotees, et looliigid on fülogeneetiliselt hajutatumad karjäärides, mille ümber asub

    rohkem loopealseid. Eeldatakse, et looliikide fülogeneetiline mitmekesisus väheneb mullakihi

    tüsenemisega, sest looliigid on kohastunud õhematel muldadel kasvama. Oodatakse looliikide

    fülogeneetilise mitmekesisuse tõusu karjääri pindalaga, sest suuremad karjäärid on

    heterogeensemad ning pakuvad seega erinevamaid kasvukohti.

  • 11

    2. Materjal ja metoodika

    2.1 Uurimisalade iseloomustus

    Uurimise alla võeti 24 erinevalt majandatavat paekivikarjääri Põhja-, Kesk-, Lääne-Eestist ning

    saartelt (Lisa 1). Kuus karjääri asuvad Saaremaal, kaks karjääri Muhu saarel ning ülejäänud 16

    karjääri paiknevad mandril. Valitud karjäärid asuvad Ordoviitsiumi või Siluri ladestute avamusalal.

    Seetõttu on tegu lubjakivi- või dolomiidikarjääridega, sest eelmainitud ladestud koosnevad

    peamiselt karbonaatsetest kivimitest (Perens & Kala 2007).

    Välitöödel, mida viisid läbi teadur Aveliina Helm, magistrant Ave Uustal ning doktorandid Liina

    Saar ja Krista Takkis koostati karjääride liiginimekiri, millesse lisati kõik karjääris leidunud

    soontaimeliigid. Lisaks koguti andmeid karjääride abiootiliste parameetrite kohta. Välitöödel

    mõõdeti mullakihi tüsedus ning märgiti karjääri asukoht x ja y koordinaadistikus. Samuti leiti

    karjääri pindala ning loopealsete (kui kaevandamisele eelnenult praegu kaevandatud alal valitsenud

    looduslikud kooslused) pindala 3 kilomeetri ja loopealsete pindala 10 kilomeetri kaugusel karjäärist

    ESRI ArcGIS programmi kasutades. Käesoleva töö käigus selgitati Maa-ameti kaardirakenduse

    (http://geoportaal.maaamet.ee/) abil välja, kas karjäär on tegev või hüljatud (Lisa 2).

    2.2 Andmetöötlus

    Liikide vahelise fülogeneetilise suguluse hindamiseks kasutati andmebaasi BioFlor koondatud

    Kesk-Euroopa soontaimeliikide molekulaarsetel meetoditel põhinevaid fülogeneetilisi koode (Klotz

    et al. 2002). Selle andmebaasi kasutamiseks kontrolliti karjääride liiginimekirjas olevad liiginimed

    andmebaasi liiginimede vastu. Liigid, mida andmebaasis ei leidunud, eemaldati liiginimekirjast

    (314st liigist 29 liiki).

    Edasised fülogeneetilised arvutused viidi läbi tarkvara keskkonnas R 2.11.1. (R Development Core

    Team; http://www.R-project.org). BioFlori andmebaasi fülogeneetilised koodid kirjeldavad liikide

    vahelist fülogeneetilist kaugust fülogeneetilise puu sõlmede arvu abil CAIC formaadis ehk

    tähtkoodidena. Need koodid aitas R keskkonna jaoks Newick formaati viia prof. Meelis Pärtel.

    Käesoleva töö jaoks koostati kaks fülogeneetilist puud: ainult looliikidega puu ja kõikide liikidega

    (looliikide ja mitte-looliikidega) puu. Liikide looliikide alla paigutamisel kasutati Pärtel et al. poolt

    koostatud Eesti pool-looduslike ökosüsteemide soontaimede karakteerse floora nimekirja (Pärtel et

    al. 2007). Tarkvara keskkonna R kasutamiseks oli vajalik täita ka fülogeneetilistele puudele seatud

  • 12

    tingimused nagu ultrameetrilisus ja oksapikkuste olemasolu, mis arvutati paketis Ape (Paradis et al.

    2004).

    Karjääride fülogeneetilise mitmekesisuse arvutamiseks kasutati R keskkonnas paketti Picante

    (Kembel et al. 2010). Fülogeneetilist mitmekesisust arvutati indeksi SESMPD (ingl k standardized

    effect size of mean pairwise distances; Webb et al. 2008) abil, mis näitab, kui lähedalt suguluses on

    omavahel keskmine liigipaar võrreldes nullmudeliga. Teisisõnu mõõdab antud indeks koosluses

    leiduvate kõikide liikide keskmise fülogeneetilise kauguse üksteisest ning kirjeldab erinevusi antud

    koosluse ja randomiseerimise abil koostatud nullkoosluse fülogeneetiliste kauguste vahel järgmise

    valemi abil:

    SESMPD =MPDvaadeldud - keskmine(MPDnull)/standardhälve(MPDnull),

    milles

    MPDvaadeldud = uuritavas koosluses vaadeldud liigipaaride keskmine fülogeneetiline kaugus

    üksteisest

    MPDnull = liigipaaride keskmine fülogeneetiline kaugus nullkoosluses

    SESMPD arvutati kahes eraldiseisvas analüüsis. Esimeses analüüsis kasutati ainult liiginimekirjas

    esinevaid looliike. Teises analüüsis kaasati kõik liiginimekirjas kirjeldatud liigid.

    Indeksi arvutamiseks sisestati R keskkonda kaks maatriksit. Esimene sisaldas karjääre ja nendes

    leiduvaid liike. Teine, fülogeneetilisest puust arvutatud maatriks, kajastas liikidevahelisi kaugusi.

    Nullkoosluste loomisel kasutati nullmudelina mudelit 'phylogeny.pool', mis randomiseerib

    karjääride liikide maatriksi, võttes juhuslikult liike kauguste maatriksist võrdse tõenäosusega.

    SESMPD arvutamisel randomiseeriti 99 korda ja iteratsioone tehti 1000.

    Saadud tulemusi (Lisa 3) analüüsiti Statistica programmiga kasutades regressioonmudelit (GRM).

    Mudeli abil hinnati fülogeneetilise mitmekesisuse indeksi SESMPD sõltuvust karjääride abiootilise

    keskkonna parameetritest nagu karjääri pindala, asukoht geograafilisel laius- ja pikkuskraadil,

    mullakihi tüsedus ning loopealsete pindala 3 kilomeetri ja 10 kilomeetri kaugusel karjäärist.

    Koostati kaks erinevat mudelit: hüljatud ja tegevate karjääride jaoks.

    Enne statistiliste analüüside tegemist kontrolliti ka andmete normaaljaotust. Järgmiste parameetrite

    väärtused logaritmiti normaaljaotuse saamiseks: karjääri pindala, loopealsete pindala 3 kilomeetri ja

    10 kilomeetri kaugusel karjäärist.

  • 13

    3. Tulemused

    Töös uuriti 24 Eesti paekivikarjääri fülogeneetilist mitmekesisust. Nendest karjääridest kaheksa olid

    tegevad ja 16 hüljatud (Eesti Maa-ameti kaardirakendus).

    Kõikide karjäärides leidunud taimeliikide (n=285) fülogeneetilise mitmekesisuse (SESMPD, ingl k

    „standardized effect size of mean pairwise distances“) ja liigirikkuse vahel ei olnud olulist seost.

    Samuti ei olnud olulist seost karjäärides leidunud looliikide (n=139) fülogeneetilise mitmekesisuse

    ja looliikide liigirikkuse vahel. Seega on fülogeneetilise mitmekesisuse uurimine SESMPD abil

    õigustatud, sest indeks on sõltumatu biodiversiteedi näitaja.

    Uuritud karjääride koosluste fülogeneetiline mitmekesisus varieerus indeksi negatiivsetest

    väärtustest positiivseteni (Joonis 1). Seega on uuritud karjääride hulgas nii fülogeneetiliselt

    klasterdunud (negatiivsed väärtused) kui ka fülogeneetiliselt hajutatud (positiivsed väärtused)

    kooslusi.

    -2,0 -1,5 -1,0 -0,5 0,0 0,5 1,0 1,5 2,0 2,5

    SESMPD

    0

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    7

    Karjääride arv

    Joonis 1: Uuritud karjäärides (n=24) leidunud taimeliikide fülogeneetiline mitmekesisus

    (SESMPD). Positiivsed SESMPD väärtused näitavad fülogeneetilist hajutatust, negatiivsed

    klasterdumist.

    Ka ainult looliike arvestades omab uuritud karjääride koosluste fülogeneetiline mitmekesisus

    skaalal nii negatiivseid kui positiivseid väärtusi, kuigi indeksi negatiivseid väärtusi esineb rohkem

    (Joonis 2). Seega on looliikide osas samuti uuritud karjääride hulgas nii fülogeneetiliselt

    klasterdunud kui ka fülogeneetiliselt hajutatud kooslusi.

  • 14

    -4,0 -3,5 -3,0 -2,5 -2,0 -1,5 -1,0 -0,5 0,0 0,5 1,0 1,5 2,0

    SESMPD

    0

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    7

    Karjääride arv

    Joonis 2: Uuritud karjäärides (n=24) leidunud looliikide fülogeneetiline mitmekesisus (SESMPD).

    Positiivsed SESMPD väärtused näitavad fülogeneetilist hajutatust, negatiivsed klasterdumist.

    Väljaselgitamaks, kas ja kuidas mõjutavad koosluste fülogeneetilisi mustreid karjääride abiootilised

    parameetrid, uuriti fülogeneetilise mitmekesisuse ja karjääride parameetrite vahelisi regressioone.

    Tegevate karjääride puhul ei leitud olulisi seoseid koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse ja

    karjääride parameetrite vahel. Hüljatud karjääride andmestikuga läbiviidud analüüsid näitasid

    koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse sõltuvust mitmetest karjääride parameetritest.

    Tabel 1: Hüljatud karjäärides (n=16) leidunud taimeliikide fülogeneetilise mitmekesisuse

    (SESMPD) sõltuvus karjääri parameetritest GRM mudelis (R²=0,73; p=0,031).

    Efekt df SS F t p

    mulla sügavus 1 2,35 8,37 -2,89 0,018

    y-koordinaat 1 2,57 9,13 -3,02 0,014

    x-koordinaat 1 1,48 5,26 2,29 0,047

    loopealsete pindala

    3km raadiuses 1 0,03 0,09 -0,30 >0,05

    loopealsete pindala

    10km raadiuses 1 1,75 6,21 -2,49 0,034

    karjääri pindala 1 0,50 1,79 1,34 >0,05

    viga 9 2,53

  • 15

    Analüüsis, kuhu võeti kõik karjäärides leidunud liigid (nii looliigid kui mitte-looliigid), osutus

    GRM mudel oluliseks (R²=0,73; p=0,031; Tabel 1). Mudelisse kuulusid järgmised karjääride

    parameetrid: karjääri pindala, mulla sügavus, x- ja y-koordinaadid, loopealsete pindala 3 kilomeetri

    raadiuses ja loopealsete pindala 10 kilomeetri raadiuses.

    0 2 4 6 8 10 12

    mulla sügavus (cm)

    -2,6

    -2,4

    -2,2

    -2,0

    -1,8

    -1,6

    -1,4

    -1,2

    -1,0

    -0,8

    -0,6

    -0,4

    -0,2

    0,0

    0,2SESMPD

    Joonis 3: Hüljatud karjääride (n=16) koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse (SESMPD osajäägid)

    sõltuvus karjääri mulla sügavusest (GRM; t=-2,89; p=0,018).

    3,6E53,8E5

    4E54,2E5

    4,4E54,6E5

    4,8E55E5

    5,2E55,4E5

    5,6E55,8E5

    6E56,2E5

    6,4E56,6E5

    y-koordinaat

    -11

    -10

    -9

    -8

    -7

    -6

    -5

    SESMPD

    Joonis 4: Hüljatud karjääride (n=16) koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse (SESMPD osajäägid)

    sõltuvus karjääri asukohast geograafilisel pikkuskraadil (y-koordinaat; GRM; t=-3,02; p=0,014).

  • 16

    6,46E66,48E6

    6,5E66,52E6

    6,54E66,56E6

    6,58E66,6E6

    x-koordinaat

    103,0

    103,5

    104,0

    104,5

    105,0

    105,5

    106,0

    106,5

    SESMPD

    Joonis 5: Hüljatud karjääride (n=16) koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse (SESMPD osajäägid)

    sõltuvus karjääri asukohast geograafilisel laiuskraadil (x-koordinaat; GRM; t=2,29; p=0,047).

    -1 0 1 2 3 4 5 6 7

    Log loopealsete pindala 10 km raadiuses (ha)

    -3,5

    -3,0

    -2,5

    -2,0

    -1,5

    -1,0

    -0,5

    0,0

    0,5

    1,0

    SESMPD

    Joonis 6: Hüljatud karjääride (n=16) koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse (SESMPD osajäägid)

    sõltuvus loopealsete pindalast 10 km raadiuses karjääri ümber (GRM; t=-2,49; p=0,034).

    Analüüsist selgus, et õhemate muldadega karjäärides oli koosluste fülogeneetiline mitmekesisus

    suurem (p=0,018; Tabel 1; Joonis 3). Koosluste fülogeneetiline mitmekesisus oli suurem

    karjäärides, mille 10 kilomeetri raadiuses asuvate loopealsete pindala oli väiksem (p=0,034; Tabel

    1; Joonis 6). Väiksematel pikkuskraadidel asuvates karjäärides oli koosluste fülogeneetiline

    mitmekesisus suurem (p=0,014; Tabel 1; Joonis 4). Oluliseks osutus ka seos, et suurematel

    laiuskraadidel asuvate karjääride kooslused on fülogeneetiliselt mitmekesisemad (p=0,047; Tabel 1;

    Joonis 5).

  • 17

    Tabel 2: Hüljatud karjäärides (n=16) leidunud looliikide fülogeneetilise mitmekesisuse (SESMPD)

    sõltuvus karjääri parameetritest GRM mudelis (R²=0,67; p=0,068).

    Efekt df SS F t p

    mulla sügavus 1 4,97 11,45 -3,38 0,008

    y-koordinaat 1 0,22 0,51 -0,72 >0,05

    x-koordinaat 1 0,04 0,09 0,31 >0,05

    loopealsete pindala

    3km raadiuses 1 0,17 0,38 0,62 >0,05

    loopealsete pindala

    10km raadiuses 1 1,35 3,10 -1,76 >0,05

    karjääri pindala 1 2,68 6,16 2,48 0,035

    viga 9 3,91

    Ainult looliikidega läbiviidud GRM mudel osutus marginaalselt oluliseks (R²=0,67; p=0,068; Tabel

    2). Mudelisse kuulusid karjääri pindala, mulla sügavus, x- ja y-koordinaadid ning loopealsete

    pindala 3 kilomeetri ja loopealsete pindala 10 kilomeetri raadiuses.

    0 2 4 6 8 10 12

    mulla sügavus (cm)

    -3,5

    -3,0

    -2,5

    -2,0

    -1,5

    -1,0

    -0,5

    0,0

    SESMPD

    Joonis 7: Hüljatud karjäärides (n=16) leidunud looliikide fülogeneetilise mitmekesisuse (SESMPD

    osajäägid) sõltuvus karjääri mulla sügavusest (GRM; t=-3,38; p=0,008).

  • 18

    -1,5 -1,0 -0,5 0,0 0,5 1,0 1,5 2,0 2,5 3,0

    Log karjääri pindala (ha)

    -2,0

    -1,5

    -1,0

    -0,5

    0,0

    0,5

    1,0

    1,5

    2,0

    SESMPD

    Joonis 8: Hüljatud karjäärides (n=16) leidunud looliikide fülogeneetilise mitmekesisuse (SESMPD

    osajäägid) sõltuvus karjääri pindalast (GRM; t=2,48; p=0,035).

    Sellest analüüsist selgus, et õhemate muldadega karjäärides oli suurem looliikide fülogeneetiline

    mitmekesisus (p=0,008; Tabel 2; Joonis 7). Samuti näitasid tulemused, et suuremad karjäärid olid

    looliikide poolest fülogeneetiliselt mitmekesisemad (p=0,035; Tabel 2; Joonis 8).

  • 19

    4. Arutelu

    Käesoleva töö eesmärgiks oli uurida paekivikarjääride taimekoosluste fülogeneetilist mitmekesisust

    ning selle seoseid karjääride abiootiliste parameetritega. Uurimise all olid nii hüljatud kui ka

    tegevate karjääride kooslused. Peale kõikide liikide fülogeneetilise struktuuri uuriti eraldi looliikide

    fülogeneetilist struktuuri.

    Uuritud paekivikarjääride kooslustes esines nii fülogeneetilist hajutatust kui fülogeneetilist

    klasterdumist, hoolimata sellest, kas arvestatud oli kõiki liike või ainult looliike. Fülogeneetilise

    mitmekesisuse indeksi SESMPD väärtused mõlemal juhul varieerusid skaala negatiivsest osast

    positiivse osani.

    Tegevate karjääride (n=8) puhul ei leitud ühtegi seost karjääri parameetrite ja koosluse

    fülogeneetilise mitmekesisuse vahel. Selline tulemus oli ootuspärane, sest majandatavad karjäärid

    on püsivalt häiritud kooslused, kus liigiline koosseis on küllaltki ebastabiilne ning fülogeneetiline

    struktuur veel väljakujunemata. Tegevate karjääride koosluste fülogeneetilise struktuuri juhuslikkust

    võivad põhjustada ka üsna ebaühtlased karjäärisisesed kasvutingimused. Majandatavate karjääride

    mõned osad on parasjagu kaevandatavad ning mullakiht puudub, teistes osades on aga

    kaevandamine lõpetatud, õhuke mullakiht olemas ning toimub karjääri kinnikasvamine. Seega on

    tegevad karjäärid ebaühtlaselt majandatud ning koosluse struktuuri mõjutavad erinevad protsessid.

    Välitööde käigus tegevates karjäärides lisati liiginimekirja liike karjääri kõikidest osadest, mistõttu

    koosluse üldine fülogeneetiline struktuur on juhuslik. Peale selle määravad liigilist koosseisu

    suktsessiooni niivõrd varases staadiumis pigem stohhastilised protsessid nagu leviste saabumine

    ning ellujäämine karjääri majandamise tingimustes (Hardy & Senterre 2007; Cavender-Bares et al.

    2009). Leviku piirangute tähtsus koosluste fülogeneetilise struktuuri mõjutamisel on veel suuresti

    teadmata (Vamosi et al. 2009). Edasistes uurimustes peaks arvesse võtma ka liikide

    esinemisarvukust, et liigid, mida ühes suures karjääris kasvab ehk ainult üks eksemplar, ei kallutaks

    statistilisi analüüse (Kraft et al. 2007).

    Hüljatud karjäärides (n=16) leiti mitu olulist seost karjääride parameetrite ja koosluste

    fülogeneetilise mitmekesisuse vahel. Ootuspäraselt vähenes mahajäetud karjäärides koosluste

    fülogeneetiline mitmekesisus mullakihi tüseduse suurenemisega. Fülogeneetiliselt hajunud

    struktuuri õhematel muldadel võib põhjustada mullatüseduse nõudlust määrava tunnuse

    konvergentsus fülogeneesis. See tähendab, et kasvukoha filtreerimine põhjustab koosluses tunnuse

  • 20

    klasterdumise. Eeldades, et mullatüseduse nõudlust määrav tunnus on evolutsioonis konvergentne,

    tekitab tunnuse klasterdumine koosluses fülogeneetiliselt hajutatud mustri. Analüüsi tulemused

    näitavad, et kuna õhemate muldadega kooslused on fülogeneetiliselt hajutatud, siis liigid, mis

    eelistavad kasvada väga õhukese mullakihiga kooslustes, on kaugemalt suguluses. Seega võib

    järeldada, et õhemate muldadega koosluste fülogeneetilises struktuuris põhjustab hajutatust

    konvergentsete tunnuste kasvukoha filtreerimine.

    Fülogeneetiline mitmekesisus suurenes geograafilise pikkuskraadi vähenemisega ehk idast läände,

    mis näitab, et fülogeneetiliselt rikkamate kooslustega karjäärid asuvad Lääne-Eestis. Selline

    tulemus oli ootuspärane, sest Lääne-Eesti on lubjarikaste muldade tõttu liigirikkam kui kooslused

    happelistel muldadel Ida-Eestis. Parasvöötme aladel, kus mullad on aluselise reaktsiooniga ehk

    lubjarikkad, on liigirikkus suurem kui happelistel muldadel, sest liigifondid pärinevad kõrge pHga

    aladelt (Pärtel 2002). Mere lähedus loob Lääne-Eestis tingimused mitmekesisemale taimestikule,

    sest koosluses kasvab palju taimeliike, mida sisemaal ei leidu või mis on seal haruldased (näiteks

    Anthyllis coccinea, Cirsium arvense, Sedum album, Sesleria caerulea). Selliste liikide esinemine

    koosluses suurendab koosluse fülogeneetilist hajutatust, sest need liigid on erinevatest

    sugukondadest ning kaugelt suguluses. Tõenäoliselt seetõttu on Lääne-Eesti paekivikarjäärides

    koosluste fülogeneetiline mitmekesisus suurem kui Ida-Eestis.

    Samuti suurenes fülogeneetiline mitmekesisus geograafilise laiuskraadiga. Fülogeneetiliselt

    mitmekesisemad kooslused hüljatud karjäärides asusid suurema tõenäosusega Põhja-Eestis. Sellist

    leidu käesolevas töös põhjustab ilmselt asjaolu, et sarnaselt Lääne-Eestile on Põhja-Eestis

    lubjarikkad mullad ning rohkelt liigirikkaid loopealseid, samas kui Lõuna-Eesti happelistel

    muldadel loopealseid ei leidu. Niisiis on lõunapoolsemate karjääride ümbruse piirkondades vähem

    taimeliike, mis on suutelised kasvama ekstreemsetel kasvukohtadel nagu loopealsed ja karjäärid

    ning mis karjääridesse leviks. Põhja-Eestis leidub rohkem liike, mille ökoloogiline nišš kattub

    hüljatud karjäärides vabade niššidega. Seetõttu on Põhja-Eesti hüljatud karjäärides kooslused

    fülogeneetiliselt mitmekesisemad.

    Üheks oodatud tulemuseks oleks olnud koosluste fülogeneetilise hajutatuse suurenemine ehk

    fülogeneetilise mitmekesisuse kasv loopealsete pindala suurenemisega 3 kilomeetri raadiuses.

    Sellise mustri leid oleks olnud põhjendatud, sest lähedal asuvatel loopealsetel kasvavad liigid, mis

    oleksid võimelised mahajäetud karjäärides kasvama. Looliigid ei ole lähedalt suguluses olevad

    liigid, sest kuuluvad erinevatesse pere- ja sugukondadesse (Pärtel et al. 2007). Vastupidiselt

    ootustele ei näidanud käesolevas töös koosluste fülogeneetiline mitmekesisus olulist sõltuvust

  • 21

    karjäärist 3 kilomeetri raadiuses olevatest loopealsete pindalast. Fülogeneetilise mitmekesisuse

    seose puudumine looalade pindalaga 3 kilomeetri raadiuses võib olla tingitud juhuslikest faktoritest,

    mida käesolevas töös ei mõõdetud.

    Koosluste fülogeneetiline mitmekesisus oli aga suurem karjäärides, mille 10 kilomeetri raadiuses

    asub vähem loopealseid. Fülogeneetilise mitmekesisuse suurenemist 10 kilomeetri raadiuses

    asuvate loopealsete pindala vähenemisega on raske seletada, võttes arvesse, et oodati fülogeneetilise

    mitmekesisuse kasvu loopealsete pindala suurenemisega. On võimalik, et fülogeneetilise

    mitmekesisuse seose puudumine loopealsete pindalaga 3 kilomeetri raadiuses ja negatiivse seose

    esinemine loopealsete pindalaga 10 kilomeetri raadiuses on juhuslikud tulemused ning seotud

    karjääre ümbritseva maastiku iseärasustega (näiteks põllualade või inimasulate lähedusega), mida

    käesolevas töös ei vaadeldud.

    Käesolevas töös ei leidnud tõestust looliikide fülogeneetilise mitmekesisuse sõltuvus ümbritsevate

    loopealsete pindalast ega karjääride geograafilisest asukohast.

    Ootuspäraselt suurenes looliikide fülogeneetiline mitmekesisus mullakihi tüseduse vähenemisega.

    Looliigid on kohastunud kasvama paepealsetel karbonaatsetel ja õhukestel muldadel. Väiksema

    mullakihiga koosluste looliikide fülogeneetiline struktuur on hajutatud, sest looliigid pole lähedalt

    suguluses olevad liigid (Pärtel et al. 2007). Samuti esineb vaadeldud muster tõenäoliselt seetõttu, et

    õhematele lubjarikastele muldadele parasvöötmes on kohastunud rohkem looliike, mis põhjustab

    looliikide fülogeneetiliselt mitmekesisema koosluse (Pärtel 2002).

    Looliikide fülogeneetiline mitmekesisus hüljatud karjäärides suurenes karjääri pindalaga. Sarnaselt

    tegevate karjääridega on ka mahajäetud karjäärid erinevates osades erinevalt majandatud. Mida

    suurem on karjäär, seda eriilmelisemad on seal kasvukohad. Mõned karjääri osad on olnud kauem

    majandamata kui teised, mistõttu on seal liikide lisandumise protsess jõudnud kauem kesta.

    Väiksema pindalaga karjäärid on ühtlasemate keskkonnatingimustega. Nõnda põhjustab

    väiksemates karjäärides kasvukoha filtreerimine koosluse fülogeneetilise struktuuri klasterdumist.

    Suuremates karjäärides on rohkem erinevaid ökoloogilisi nišše ning seetõttu on lisanduvad looliigid

    kaugemalt suguluses ning koosluste struktuur on fülogeneetiliselt hajutatum.

    Huvitav oleks ka jälgida hüljatud karjäärides koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse sõltuvust

    karjääride vanusest. Vanemad kooslused on suurema tõenäosusega fülogeneetiliselt rohkem

    hajutatud kui nooremad kooslused (Vamosi et al. 2009). Brasiilia vihmametsades uuriti

  • 22

    metsafragmentide fülogeneetilist mitmekesisust ning märgati fülogeneetilise mitmekesisuse

    eksponentsiaalset suurenemist metsafragmentide vanuse kasvuga (Santos et al. 2010). Ka

    suktsessioonilises troopilises metsas märgati fülogeneetilise mitmekesisuse suurenemist ajaga

    (Letcher 2010). Seega võib eeldada, et mahajäetud karjääride vanuse kasvuga suureneb

    fülogeneetiline mitmekesisus ka nendes kooslustes. Mõned autorid seletavad koosluste

    fülogeneetilise mitmekesisuse suurenemist ajas konkurentsi intensiivistumisega, mistõttu

    lähisugulased sarnaste nõudlustega kasvukohtadele kaovad ning asemele tulevad kaugemalt

    suguluses olevad, vähem sarnased taimeliigid, suurendades nõnda fülogeneetilist hajutatust (Vamosi

    et al. 2009). Koosluste fülogeneetilise klasterdumise vähenemist ajaga hüljatud karjäärides võib aga

    tekitada kasvukoha heterogeensuse suurenemine, mistõttu lisandub erinevate ökoloogiliste

    niššidega ning seega kaugelt suguluses olevaid liike. Samuti võivad vanemates kooslustes rolli

    mängida ka liikide positiivsed interaktsioonid nagu fassilitatsioon, kui ühe liigi olemasolu hõlbustab

    teise liigi säilimist. Seeläbi jõuavad kooslusse ajapikku ka liigid, mis ei ole nii ekstreemsetele

    tingimustele kohastunud nagu looliigid ning on ka kaugemalt suguluses. Samuti muutuvad hüljatud

    karjäärid aja edenedes aina enam loopealsetega sarnasemaks ning suureneb looliikide arv, mis on

    omavahel kaugelt suguluses.

    Käesolevas töös leitud mitte-juhuslikud fülogeneetilised mustrid näivad olevat tekkinud erinevate

    ökoloogiliste protsesside dünaamika tõttu. Fülogeneetilist hajutatust põhjustab kasvukoha

    filtreerimine looliikide kooslusse sorteerumise näol. Vaadeldud struktuuri tekitab arvatavasti

    looliikide kasvukohta määravate tunnuste evolutsiooniline konvergentsus. Fülogeneetilist hajutatust

    tekitab kasvukoha suurem heterogeensus või konkurents, mis välistab koosluses lähisugulaste koos

    kasvamise. Nende protsesside võimsus ilmselt vaheldub ajas. Võiks arvata, et nooremates, hiljaaegu

    hüljatud karjäärides domineerib kasvukoha filtreerimine, sest uutele kasvukohtadele lisanduvad

    eelkõige liigid, mis on sellele juba kohastunud (Emerson & Gillespie 2008). Siin on tähtsal kohal

    ümbritsevas maastikus leiduvate koosluste olemus. Kui piirkonnas asus rohkem loopealseid, olid

    karjääride kooslused fülogeneetiliselt mitmekesisemad. Vanemate karjääride kooslustes võib aga

    lisaks rolli mängida kasvukohtade heterogeensuse suurenemine ja fassilitatsioon.

    Kahtluse alla on seatud teooria, et fülogeneetilist hajutatust põhjustavad liikide vahelised

    negatiivsed interaktsioonid (Prinzing et al. 2008). Liikide vahelised interaktsioonid mõjutavad

    kooslustes hoopis tunnuste koosseisu ning põhjustavad tunnuste hajutatust (Prinzing et al. 2008).

    Negatiivsed interaktsioonid tekitavad aga tunnuste konvergentsuse korral koosluses pigem

    fülogeneetilist klasterdumist või juhuslikku mustrit (Cavender-Bares et al. 2004). Seda teooriat

    tõestavad ka selles töös leitud tulemused. Õhematel muldadel on kooslused fülogeneetiliselt

  • 23

    hajutatud, sest ilmselt on mullatüseduse nõudlust määrav tunnus fülogeneetiliselt konvergentne.

    Järelduste tegemine kooslusi mõjutavate protsesside kohta on aga üsna raske, sest tunnuse ja nišši

    evolutsiooniline ajalugu ning interaktsioonid ökoloogiliste protsesside seas võivad viia keeruliste

    fülogeneetiliste mustriteni, mis raskendab jälgitud struktuuri seostamist ühe kindla protsessiga

    (Kembel & Hubbell 2006).

    Fülogeneetilise mitmekesisuse hindamisel on ka praktilisi väärtusi. Fülogeneetiliselt

    mitmekesisemates kooslustes on rohkem evolutsioonilisi sugupuid (Gerhold et al. 2008) ning see on

    oluline omadus, mida alade kaitse alla võtmisel arvestada. Sellised kooslused omavad suuremat

    tõenäosust tulevikus, muutuvates keskkonnatingimustes säiluda (Forest et al. 2007). Samuti on

    fülogeneetiliselt mitmekesisemad kooslused produktiivsemad kui fülogeneetiliselt vaesed kooslused

    (Cadotte et al. 2008). Seega omab koosluste fülogeneetiline mitmekesisus suurt tähtsust

    looduskaitses (Chave et al. 2007; Gerhold et al. 2008; Cavender-Bares et al. 2009).

    On oluline testida erinevaid fülogeneetilise mitmekesisuse indekseid ning meetodeid fülogeneetilise

    mitmekesisuse mõõtmiseks, et leida kõige sobivamad ja õigemini fülogeneetilist mitmekesisust

    hindavad vahendid, mida kaitsealade valimisel kasutada. See suurendab tõenäosust, et tänapäeva

    looduskaitsealad ka tuleviku keskkonnatingimustes sellisel kujul säiluvad.

  • 24

    Soontaimede fülogeneetiline mitmekesisus paekivikarjäärides

    Triin Sakermaa

    5. Kokkuvõte

    Ökolooge on läbi aegade huvitanud küsimus, mis mõjutab looduslike koosluste liigilist koosseisu.

    Uudne lähenemine koosluste liigilise koosseisu uurimisel on analüüsida liikide fülogeneesi. Kuna

    lähedalt suguluses olevad liigid on ökoloogiliselt sarnasemad, peaksid koosluste liigilist koosseisu

    kujundavad ökoloogilised protsessid kajastuma koosluse fülogeneetilises struktuuris.

    Käesolevas töös uuriti dünaamilisi taimekooslusi, kus toimub suktsessioon. Mahajäetud

    paekivikarjäärides, kus enne kaevandamist valitsesid loopealsete kooslused, hakkab

    majandustegevuse lõppedes kooslus suktsessiooni käigus taastuma ning on võimalik uurida liigilise

    koosseisu muutumist soontaimeliikide loodusliku lisandumisega.

    Uuritud 24 paekivikarjääri hulgas oli nii fülogeneetiliselt klasterdunud kui ka fülogeneetiliselt

    hajutatud kooslusi. Väljaselgitamaks, kas ja kuidas mõjutavad koosluste fülogeneetilisi mustreid

    karjääride abiootilised parameetrid, uuriti fülogeneetilise mitmekesisuse indeksi ja karjääride

    parameetrite vahelisi regressioone.

    Tegevate karjääride puhul ei leitud olulisi seoseid koosluste fülogeneetilise mitmekesisuse ja

    karjääride parameetrite vahel. Sellised karjäärid on püsivalt häiritud kooslused, kus liigiline

    koosseis on küllaltki ebastabiilne ning fülogeneetiline struktuur veel väljakujunemata.

    Analüüsist selgus, et õhemate muldadega hüljatud karjäärides oli koosluste fülogeneetiline

    mitmekesisus suurem. Õhemate muldadega koosluste fülogeneetilises struktuuris põhjustab

    arvatavasti hajutatust konvergentsete tunnuste kasvukoha filtreerimine. Koosluste fülogeneetiline

    mitmekesisus oli suurem karjäärides, mille 10 kilomeetri raadiuses asuvate loopealsete pindala oli

    väiksem. Koosluste fülogeneetiline mitmekesisus oli suurem Põhja- ja Lääne-Eestis asuvates

    hüljatud karjäärides, sest nendes piirkondades asub enamik Eesti loopealsetest.

    Selgus ka, et õhemate muldadega karjäärides oli suurem looliikide fülogeneetiline mitmekesisus.

    Suuremad karjäärid olid looliikide poolest fülogeneetiliselt mitmekesisemad, kuna suuremates

    karjäärides on eriilmelisemad kasvukohad.

  • 25

    Edasistesse uurimustesse võiks kaasata ka karjääride vanused. Võib arvata, et mahajäetud karjääride

    vanuse kasvuga suureneb nendes kooslustes fülogeneetiline mitmekesisus. Koosluste

    fülogeneetilise klasterdumise vähenemist ajaga hüljatud karjäärides võib tekitada kasvukoha

    heterogeensuse suurenemine, mistõttu lisandub erinevate ökoloogiliste niššidega ning seega kaugelt

    suguluses olevaid liike. Samuti võivad vanemates kooslustes rolli mängida ka liikide positiivsed

    interaktsioonid nagu fassilitatsioon.

    Järelduste tegemine kooslusi mõjutavate protsesside kohta on aga üsna raske, sest tunnuse ja nišši

    evolutsiooniline ajalugu ning interaktsioonid ökoloogiliste protsesside seas võivad viia keeruliste

    fülogeneetiliste mustriteni, mis raskendab jälgitud struktuuri seostamist ühe kindla protsessiga.

    Koosluste fülogeneetiline struktuur omab suurt tähtsust looduskaitses. Fülogeneetiliselt

    mitmekesisemad kooslused omavad suuremat tõenäosust tulevikus, muutuvates

    keskkonnatingimustes säiluda. On oluline testida erinevaid fülogeneetilise mitmekesisuse indekseid

    ning meetodeid fülogeneetilise mitmekesisuse mõõtmiseks, et leida kõige sobivamad ja õigemini

    fülogeneetilist mitmekesisust hindavad vahendid, mida kaitsealade valimisel kasutada. See

    suurendab tõenäosust, et tänapäeva looduskaitsealad ka tuleviku keskkonnatingimustes sellisel

    kujul säiluvad.

  • 26

    Phylogenetic diversity of vascular plants in carbonate rock quarries Triin Sakermaa

    6. Summary Ecologists have long been intrigued by the processes that cause patterns in species compositions. To

    study these patterns there is a new approach of measuring phylogenetic diversity. Since closely

    related species are ecologically more similar, the phylogenetic structure of a community should

    provide insight into the ecological processes that organize the community.

    The aim of this thesis was to study the phylogenetic structure of a successional plant community.

    Abandoned carbonate rock quarries, former alvar grasslands, where the community recovers after

    the cessation of excavation enable us to study the changes in species composition with the natural

    addition of plant species.

    There were phylogenetically clustered and overdispersed communities among the 24 studied

    quarries. In order to find out if and how abiotic parameters of quarries affect the phylogenetic

    patterns of communities regressions between phylogenetic diversity index and quarry parameters

    were explored.

    There were no significant relationships between the phylogenetic diversity of communities and the

    parameters of operational quarries. Operational quarries are continuously disturbed communities.

    Disturbance causes a rather unstable species composition and thus an incipient phylogenetic

    structure.

    The results show that abandoned quarry communities on thinner soils are phylogenetically more

    diverse. Phylogenetic overdispersion in such communities is probably caused by habitat filtering of

    convergent traits. Phylogenetic diversity was also higher in communities surrounded by less alvar

    grasslands within 10 kilometer radius. Communities in Northern and Western Estonian quarries

    were phylogenetically overdispersed, as most of the alvar grasslands in Estonia are located in these

    areas.

    Phylogenetic overdispersion of alvar plant species was also observed in quarries on thinner soils. In

    addition, alvar species in bigger quarries were phylogenetically overdispersed probably because

    bigger quarries have a higher habitat diversity.

  • 27

    In future research the age of the quarries should also be taken into account. It is expected that

    phylogenetic diversity increases with the age of an abandoned quarry. This is caused by an increase

    in environmental heterogeneity which enables the establishment of distantly related species with

    different ecological niches. Positive species interactions such as fascilitation could also have an

    impact in older communities.

    However drawing conclusions on the processes that affect community composition is rather

    difficult, because the history of trait and niche evolution, and interactions among multiple

    ecological processes may lead to complex phylogenetic structure and complicate assigning a pattern

    to a certain process.

    Community phylogenetic structure is an important feature in conservation planning.

    Phylogenetically overdispersed communities are more likely to resist changing environmental

    conditions in the future. It is essential to test different phylogenetic diversity indices in order to find

    the most suitable and correct means to assess phylogenetic diversity in potential conservation areas.

    This enhances the probability that conservation areas today still exist in the future.

  • 28

    7. Tänuavaldused

    Tahan eelkõige südamest tänada oma juhendajat Pille Gerholdi, kelle nõu ja abiga käesolev töö

    sellisel kujul valmis. Tänan ka Meelis Pärtelit, kes aitas mind palju töö metoodika osas. Suur tänu

    kuulub ka Aveliina Helmile, Ave Uustalile, Krista Takkisele ja Liina Saarele, kelle välitöödel

    kogutud andmeid kasutasin oma töös. Aitäh Ave Uustalile loa eest, kasutada oma töös tema

    koostatud kaarti.

  • 29

    8. Kasutatud kirjandus

    Agrawal, A.A., Ackerly, D.D., Adler, F., Arnold, A.E., Caceres, C., Doak, D.F., Post, E., Hudson,

    P.J., Maron, J., Mooney, K.A., Power, M., Schemske, D., Stachowicz, J., Strauss, S., Turner, M.G. &

    Werner, E. (2007) Filling key gaps in population and community ecology. Frontiers in Ecology and

    the Environment, 5, 145-152.

    Cadotte, M.W., Cardinale, B.J. & Oakley, T.H. (2008) Evolutionary history and the effect of

    biodiversity on plant productivity. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United

    States of America, 105, 17012-17017.

    Cahill, J.F.Jr., Kembel, S.W., Lamb, E.G. & Keddy, P.A. (2008) Does phylogenetic relatedness

    influence the strength of competition among vascular plants? Perspectives in Plant Ecology,

    Evolution and Systematics, 10, 41-50.

    Cavender-Bares, J., Ackerly, D.D., Baum, D.A. & Bazzaz, F.A. (2004) Phylogenetic Overdispersion

    in Floridan Oak communities. The American Naturalist, 163, 824-843.

    Cavender-Bares, J., Keen, A. & Miles, B. (2006) Phylogenetic structure of Floridian plant

    communities depends on taxonomic and spatial scale. Ecology, 87, 109-122.

    Cavender-Bares, J., Kozak, K.H., Fine, V.A. & Kembel, S.W. (2009) The merging of community

    ecology and phylogenetic biology. Ecology letters, 12, 693-715.

    Chave, J., Chust, G. & Thébaud, C. (2007) The importance of phylogenetic structure in biodiversity

    studies. Scaling biodiversity, (toim. D. Storch, P. Marquet & J.H. Brown), lk 150-167. Cambridge

    University Press.

    Crisp, M. D., Arroyo, M. T. K., Cook, L.G., Gandolfo, M. A., Jordan, G. J., McGlone, M. S.,

    Weston, P. H., Westoby, M., Wilf, P. & Linder, H. P. (2009) Phylogenetic biome conservatism on a

    global scale. Nature, 458, 754-759.

  • 30

    Dinnage, R. (2009) Disturbance alters the Phylogenetic Composition and Structure of Plant

    Communities in an Old Field System. Plos one.

    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2740862/

    Emerson, B.C. & Gillespie, R.G. (2008) Phylogenetic analysis of community assembly and

    structure over space and time. Trends in Ecology and Evolution, 23, 619-630.

    Forest, F., Grenyer, R., Rouget, M., Davies, T.J., Cowling, R.M., Faith, D.P., Balmford, A.,

    Manning, J.C., Proches¸, S¸.,van der Bank, M., Reeves, G., Hedderson, T.A.J. & Savolainen, V.

    (2007) Preserving the evolutionary potential of floras in biodiversity hotspots. Nature, 445, 757-

    760.

    Gerhold, P., Pärtel, M., Liira, J., Zobel, K. & Prinzing, A. (2008) Phylogenetic structure of local

    communities predicts the size of the regional species pool. Journal of Ecology, 96, 709-712.

    Hardy, O.J. & Senterre, B. (2007) Characterizing the phylogenetic structure of communities by an

    additive partitioning of phylogenetic diversity. Journal of Ecology, 95, 493-506.

    Johansson, M.E. & Keddy, P.A. (1991) Intensity and asymmetry of competition between plant pairs

    of different degrees of similarity: an experimental study on two guilds of wetland plants. OIKOS,

    60, 27-34.

    Kembel, S.W. & Hubbell, S.P. (2006) The phylogenetic structure of a neotropical forest tree

    community. Ecology, 87, S86-S99.

    Kembel, S.W., Cowan, P.D., Helmus, M.R., Cornwell, W.K., Morlon, H., Ackerly, D.D., Blomberg,

    S.P. & Webb, C.O. (2010) Picante: R tools for integrating phylogenies and ecology. Bioinformatics,

    26, 1463-1464.

  • 31

    Kraft, N.J.B., Cornwell, W.K. Webb, C.O. & Ackerly, D.D. (2007) Trait Evolution, Community

    Assembly and the Phylogenetic Structure of Ecological Communities. The American Naturalist,

    170, 271-283.

    Letcher, S.G. (2010) Phylogenetic structure of angiosperm communities during tropical forest

    succession. Proceedings of the Royal Society B, 277, 97-104.

    Paradis, E., Claude, J. & Strimmer, K. (2004) APE: analyses of phylogenetics and evolution in R

    language. Bioinformatics, 20, 289-290.

    Perens, H. & Kala, E. (2007) Paekivi – Eesti rahvuskivi. Geoguide Baltoscandia, Tallinn.

    Peterson,T., Sobero, J. & Sanchez-Cordero, V. (1999) Conservatism of Ecological Niches in

    Evolutionary Time. Science, 285, 1265-1267.

    Prinzing, A., Durka, W., Klotz, S. & Brandl, R. (2001) The niche of higher plants : evidence for

    phylogenetic conservatism. Proceedings of The Royal Society B, 268, 2383-2389.

    Prinzing, A., Reiffers, R., Braakhekke, W.G., Hennekens, S.M., Tackenberg, O., Ozinga, W.A.,

    Schaminée, J.H.J. & van Groenendael M.J. (2008) Less lineages – more trait variation:

    phylogenetically clustered plant communities are functionally more diverse. Ecology Letters, 11,

    809-819.

    Proches, S., Wilson, J.R.U. & Cowling, R.M. (2006) How much evolutionary history in a 10x10m

    plot? Proceedings of The Royal Society B, 273, 1143-1148.

    Pärtel, M., Zobel, M., Zobel, K. & van der Maarel, E. (1996) The species pool and its relation to

    species richness: Evidence from Estonian plant communities. Oikos, 75, 111-117.

    Pärtel, M. (2002) Local plant diversity patterns and evolutionary history at the regional scale.

  • 32

    Ecology, 83, 2361-2366.

    Pärtel, M., Helm, A., Roosaluste, E. & Zobel, M. (2007) Bioloogiline mitmekesisus Eesti pool-

    looduslikes ökosüsteemides. Keskkonnauuringute nüüdisprobleeme (toim. J.-M. Punning), lk 223-

    302. Tallinna Ülikooli Ökoloogia Instituut, Tallinn.

    Santos, B.A., Arroyo-Rodríguez, V., Moreno, C.E. & Tabarelli, M. (2010) Edge-related loss of tree

    phylogenetic diversity in the severly fragmented Brazilian atlantic forest. Public Library Of Science

    ONE 5, e12625, doi:10.1371/journal.pone.0012625.

    Silva, I.A. & Batalha, M.A. (2009) Co-occurrence of tree species at fine spatial scale in a woodland

    cerrado, southeastern Brazil. Plant Ecology, 200, 277-286.

    Slik, J.W.F., Raes, N., Aiba, S.-I., Brearley, F.Q., Cannon, C.H., Meijaard, E., Nagamasu, H., Nilus,

    R. Paoli, G., Poulsen, A.D., Sheil, D., Suzuki, E., van Valkenburg, J.L.C.H., Webb, C.O., Wilkie, P.

    & Wulffraat, S. (2009) Environmental correlates for tropical tree diversity and distribution patterns

    in Borneo. Diversity and Distributions, 15, 523-532.

    Swenson, N.G., Enquist, B.J., Pither, J., Thompson, J. & Zimmerman, J.K. (2006) The problem and

    promise of scale dependency in community phylogenetics. Ecology, 87, 2418-2424.

    Tallents, L.A., Lovett, J.C., Hall, J.B. & Hamilton, A.C. (2005) Phylogenetic diversity of forest

    trees in the Usambara mountains of Tanzania: correlations with altitude. Botanical Journal of the

    Linnean Society, 149, 217-228.

    Vamosi, S.M., Heard, S.B., Vamosi, J.C. & Webb, C.O. (2009) Emerging patterns in the

    comparative analysis of phylogenetic community structure. Molecular Ecology, 18, 572-592.

    Webb, C.O. (2000) Exploring the Phylogenetic Structure of Ecological Communities: An Example

    for Rain Forest Trees. The american Naturalist, 156, 145-155.

  • 33

    Webb, C.O., Ackerly, D.D., McPeek, M.A. & Donoghue, M.J. (2002) Phylogenies and Community

    Ecology. Annual Review of Ecology and Systematics, 33, 475-505.

    Webb, C.O., Ackerly, D.D., and Kembel, S.W. (2008) Phylocom: software for the analysis of

    phylogenetic community structure and trait evolution. Version

    4.0.1. http://www.phylodiversity.net/phylocom/.

    R Development Core Team (2010). R: A language and environment for statistical computing. R

    Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. ISBN 3-900051-07-0, URL http://www.R-

    project.org.

  • 34

    9. Lisad

    Lisa 1: Kaart uuritud 24 karjääri asukohaga (kaardi koostas Ave Uustal)

  • 35

    Lisa 2: Uuritud karjäärid ja nende parameetrid.

    ALA NIM

    I Looliiki-

    de arv

    Mitte-

    looliikide

    arv

    Liikide

    koguarv

    Karjääri

    pindala

    (ha)

    Loopealsete

    pindala 3

    km

    raadiuses

    (ha)

    Loopealsete

    pindala 10

    km

    raadiuses

    (ha)

    Tegev/hüljatud y-koordinaadid x-koordinaadid

    Keskmine

    mulla

    sügavus (cm)

    Alu

    vere

    5

    0

    46

    9

    6

    2,8

    9

    0,0

    0

    0,0

    0

    ljatu

    d

    636731

    6584858,66

    5,93

    Har

    ku

    52

    4

    5

    97

    7

    ,25

    9

    ,36

    346,22

    ljatu

    d

    533816,9

    6585928,89

    4,68

    Jaag

    arah

    u

    57

    2

    1

    78

    0

    ,28

    1

    13

    ,72

    592,88

    ljatu

    d

    381333,6

    6475426,49

    2,53

    Kaa

    rma

    61

    3

    0

    91

    0

    ,90

    0

    ,00

    153,45

    tege

    v

    410776,2

    6467608,17

    8,33

    Ko

    gula

    8

    5

    36

    1

    21

    1

    0,4

    3

    14

    ,38

    118,53

    tege

    v

    398042,4

    6461986,63

    7,63

    Ku

    nd

    a 3

    8

    32

    7

    0

    15

    ,76

    4

    ,90

    1

    9,3

    8

    tege

    v

    641298,4

    6592321,68

    5,15

    Maa

    rdu

    5

    1

    33

    8

    4

    2,0

    1

    46

    ,27

    1

    67

    ,52

    h

    ülja

    tud

    559918

    6590298,8

    4,28

    Mu

    hu

    Ko

    guva

    8

    1

    39

    1

    20

    1

    3,0

    1

    39

    ,76

    5

    30

    ,57

    h

    ülja

    tud

    447442,9

    6497349,99

    3,65

    Pae

    kna

    69

    1

    9

    88

    1

    ,29

    4

    ,34

    6

    ,00

    h

    ülja

    tud

    545816,4

    6570089,39

    3,30

    Pae

    välja

    5

    9

    49

    1

    08

    1

    2,2

    0

    0,0

    0

    21

    ,38

    h

    ülja

    tud

    546428,9

    6590737,97

    3,68

    Pal

    dis

    ki

    57

    3

    7

    94

    5

    ,41

    6

    9,0

    7

    79

    ,32

    h

    ülja

    tud

    502151,2

    6581370,32

    8,38

    Pal

    dis

    ki t

    ipp

    5

    8

    33

    9

    1

    1,0

    8

    69

    ,07

    7

    9,3

    2

    ljatu

    d

    503334,9

    6582977,6

    2,70

    Pu

    sku

    5

    2

    28

    8

    0

    3,4

    2

    18

    ,98

    3

    2,0

    9

    tege

    v

    469414,6

    6528216,31

    3,78

    Ru

    mm

    u

    57

    4

    3

    10

    0

    3,6

    0

    9,30

    53,72

    ljatu

    d

    513452,7

    6565456,68

    11,13

    Selg

    ase

    5

    3

    17

    7

    0

    0,8

    8

    27

    ,38

    105,57

    tege

    v

    394388,9

    6478847,38

    2,30

    Sep

    akü

    la

    59

    4

    6

    10

    5

    2,3

    0

    18

    ,98

    3

    2,0

    9

    ljatu

    d

    470240,2

    6527407,52

    5,18

    Sääs

    e

    53

    3

    9

    92

    1

    ,00

    0

    ,00

    0

    ,00

    h

    ülja

    tud

    622384,9

    6559420,95

    4,15

    Tag

    ave

    re

    69

    4

    1

    11

    0

    4,7

    2

    6,9

    8

    19

    2,0

    8

    tege

    v

    435611,4

    6489380,57

    6,23

    Tam

    salu

    4

    2

    28

    7

    0

    0,9

    0

    0,0

    0

    0,0

    0

    ljatu

    d

    619548,5

    6560165,1

    6,48

    Un

    dva

    5

    6

    26

    8

    2

    1,8

    2

    23

    ,25

    3

    55

    ,01

    h

    ülja

    tud

    378700,8

    6487649

    2,00

    Van

    a

    Sep

    akü

    la

    71

    2

    4

    95

    1

    ,56

    1

    8,9

    8

    32

    ,09

    h

    ülja

    tud

    470600,1

    6527254,92

    3,65

    Vas

    ale

    mm

    a 6

    1

    32

    9

    3

    13

    ,20

    9

    ,30

    5

    3,4

    3

    tege

    v

    517812,1

    6566387,7

    5,89

    Vir

    tsu

    7

    2

    30

    1

    02

    1

    ,64

    1

    89

    ,52

    624,53

    tege

    v

    474975,7

    6497188,33

    10,80

    Üü

    gu p

    ank

    39

    1

    0

    49

    0

    ,31

    1

    44

    ,19

    534,67

    ljatu

    d

    455850,3

    6503762,06

    3,65

  • 36

    Lisa 3: Kõikide liikide ja looliikide fülogeneetiline mitmekesisus SESMPD (ingl k „standardized

    effect size of mean pairwise distances“) uuritud karjäärides.

    Karjäär

    SESMPD

    (kõik liigid)

    SESMPD

    (looliigid)

    Aluvere -0,383 0,317

    Harku 0,661 -0,618

    Jaagarahu -0,357 -1,085

    Kaarma 1,056 -0,204

    Kogula -0,320 -0,535

    Kunda 0,846 0,171

    Maardu -0,484 -1,274

    Muhu

    Koguva 0,040 0,210

    Paekna 1,329 -0,366

    Paevälja 0,953 0,828

    Paldiski 0,231 -0,917

    Paldiski tipp 0,894 0,187

    SESMPD

    (kõik liigid)

    SESMPD

    (looliigid)

    Pusku 2,098 1,277

    Rummu -0,545 -1,700

    Selgase -0,474 -1,983

    Sepaküla 0,776 -0,286

    Sääse 1,247 0,765

    Tagavere 0,807 0,433

    Tamsalu -0,099 -2,267

    Undva 1,151 -0,298

    Vana Sepaküla 1,015 -0,012

    Vasalemma 0,400 -3,215

    Virtsu 0,126 0,028

    Üügu pank -1,289 -1,335