38
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci Biokemija - Syllabus Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje lijekova Broj predmeta: BIL 202 Web stranica predmeta: http://www.biotech.uniri.hr ECTS bodovi: 12 Nastavno opterećenje/sati: 120 sati (40 P + 40 S + 40 V) Nositelj predmeta: Dr.sc. Roberto Antolović, red.prof. Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci Radmile Matejčić 2 Konzultacije: Telefon: e-mail: [email protected] Web stranica: http://www.biotech.uniri.hr/ Asistent: Dr.sc. Sandra Kraljević Pavelić, izv.prof. Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci Radmile Matejčić 2 Telefon: e-mail: [email protected] Web stranica: http://www.biotech.uniri.hr/ Asistent: Dr.sc. Mirela Sedić, docent Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci Radmile Matejčić 2 Telefon: Asistent: Dr.sc. Željka Maglica, docent Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci Radmile Matejčić 2 Konzultacije: Telefon: e-mail: [email protected] Web stranica: http://www.biotech.uniri.hr/ Asistent: Andrea Tomljanović Paravić Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci Radmile Matejčić 2 Konzultacije: Telefon: Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 1

Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci

Biokemija - Syllabus

Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje lijekova

Broj predmeta: BIL 202

Web stranica predmeta: http://www.biotech.uniri.hr

ECTS bodovi: 12

Nastavno opterećenje/sati: 120 sati (40 P + 40 S + 40 V)

Nositelj predmeta:Dr.sc. Roberto Antolović, red.prof.Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u RijeciRadmile Matejčić 2Konzultacije:Telefon: e-mail: [email protected] stranica: http://www.biotech.uniri.hr/

Asistent:Dr.sc. Sandra Kraljević Pavelić, izv.prof.Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u RijeciRadmile Matejčić 2Telefon: e-mail: [email protected] stranica: http://www.biotech.uniri.hr/

Asistent:Dr.sc. Mirela Sedić, docentOdjel za biotehnologiju Sveučilišta u RijeciRadmile Matejčić 2Telefon: e-mail: [email protected] stranica: http://www.biotech.uniri.hr/

Asistent:Dr.sc. Željka Maglica, docentOdjel za biotehnologiju Sveučilišta u RijeciRadmile Matejčić 2Konzultacije:Telefon: e-mail: [email protected] stranica: http://www.biotech.uniri.hr/

Asistent:Andrea Tomljanović ParavićOdjel za biotehnologiju Sveučilišta u RijeciRadmile Matejčić 2Konzultacije:Telefon: e-mail: [email protected] stranica: http://www.biotech.uniri.hr/

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 1

Page 2: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci

Osnovne informacije o kolegiju:

Predavanja, seminari i vježbe se održavaju od 08.02.2016. do 01.04.2016.

Literatura za pomoć pri svladavanju nastavnog gradiva iz biokemije, praćenje predavanja i seminara te za pripremu provjere znanja na kolokvijima i završnom ispitu je:

Jeremy M.Berg, John L.Tymoczko, Lubert Stryer: BIOKEMIJA, Školska knjiga, Zagreb, 2013.

Robert K. Murray, David A. Bender, Kathleen M. Botham, Peter J. Kennelly,Victor W. Rodwell, P. Anthony Weil: Harperova ilustrirana biokemija, Medicinska naklada, Zagreb, 2011.

Peter Karlson: Biokemija za studente kemije i medicine, Školska knjiga, Zagreb, 1988.

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 2

Page 3: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciOPIS PREDMETAKolegij u planu nastave obrađuje temelje biokemijskih procesa u stanici na molekularnoj osnovi. Kolegij biokemije pruža mogućnost studentima da steknu teoretska i praktična znanja koja su im potrebna za praćenje drugih nastavnih kolegija te praktično izvođenje biokemijskih eksperimenta na vježbama iz biokemije. Na kolegiju biokemije studente se podučava osnovnoj kemijskoj građi i svojstvima biološki važnih molekula. Na taj način studente se uvodi u osnove najvažnijih biokemijskih puteva u stanici, načinu prijenosa signala u stanici te regulacije biokemijskih i patobiokemijskih staničnih procesa. Studentima se na zanimljiv i prihvatljiv način objašnjava način prijetvorbe, korištenja i utroška energije u stanici kao i važnost regulacije prijenosa signala u stanicama te međusobne komunikacije stanica živog organizma. Osnovna znanja koja student dobiva na kolegiju biokemije prijeko su potrebna za razumjevanje drugih kolegija kao primjerice fiziologije, patofiziologije, farmakologije, molekularne medicine, itd.. Studentima će se uz gore navedeno prikazati i objasniti promjene biokemijskih procesa koje dovode do nastanka patoloških stanja i metaboličkih bolesti uz prikaz molekularnog principa liječenja metaboličkih bolesti. Ukratko kolegij biokemije nudi studentima mogućnost stjecanja prijeko potrebnog znanja iz područja biokemije i upoznavanje biološki važnih molekula, međusobno povezanih u sustavu stanice, organa i organizma, te razumjevanje biokemijskih promjena koje dovode do bolesti stanice i organizma.

Uvijet za upis kolegija Biokemija:Da bi student redovno mogao pohađati nastavu iz kolegija biokemije student/ica mora dobro vladati gradivom organske kemije i biologije te prilikom upisa na kolegij biokemije mora imati odslušane kolegije iz predmeta biologija i organska kemija. ZA PRISTUPANJE ZAVRŠNOM ISPITU IZ PREDMETA BIOKEMIJA STUDENT/ICA MORA IMATI POLOŽENI ISPIT IZ OPĆE I ORGANSKE KEMIJE!!!

Ciljevi i očekivani ishodi predmeta (razvijanje općih i specifičnih kompetencija)Opće kompetencije koje će se razvijati na predmetu: A1, A2, A3, A5, A8, B1, B3, B4; B5; C1, C2, C3, C4.

Specifične kompetencije koje će se razvijati na predmetu: Nakon uspješno završenog programa iz ovog predmeta studenti će biti sposobni:a) Prepoznati i objasniti značenje važnih molekula uključenih u biokemijske procese

stanice te objansiti važnost tih biokemijskih procesa i reakcija za stanicu i organizam u kojima te molekule sudjeluju

b) Naučiti, shvatiti i vladati molekularnim osnovama biokemijskih procesa c) Sigurno i učinkovito rukovati uzorcima, provesti biokemijsku analizu prema unaprijed

danom protokolu, razumljivo prikazati rezultate te izvesti potreban zaključak iz dobivenih rezultata izvršenog testa (proceduralno znanje).

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 3

Page 4: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciIshodi nakon izvršavanja svih programom predviđenih obveza:

A. Predavanja:

1. Uvod u biokemiju: - uvod u kolegij - čime se bavi biokemija- povijest biokemije

2. Stanica i stanične strukture:- stanična membrana kao zaštitna barijera;- uloga stanične membrane u komunikaciji s okolinom;- stanične organele- transport tvari kroz staničnu membranu

3. Aminokiseline: - struktura i podjele aminokiselina;- svojstva i uloge aminokiselina

4. Peptidi, proteini: - nomneklatura i određivanje peptida;- prirodni peptidi- resorpcija

5. Strukture proteina: - proteinske strukture, njihovo nastajanje i određivanje;- denaturacija i renaturacija proteina;- enzimi koji sudjeluju u razgradnji proteina;

6. Razgradnja proteina, proteolitički enzimi:- razgradnja proteina in vivo i in vitro

7. Metode proteinske kemije:- kromatografske metode- izoelektrična točka i izoelektrično fokusiranje;- elektroforeza;- Western blot analiza;- imunoprecipitacija- ciljana proteoliza proteina i detekcija peptidnih fragmenata

8. Vitamini: - podjela vitamina- svojstva vitamina- važnost vitamina u biokemijskim reakcijama-

9. Koenzimi: - koenzimi i prostetske skupine;- prijenos grupa i njihov potencijal;- koenzimi C1- i C2-metabolizma;

10. Enzimi i enzimska kataliza: - energija aktivacije;

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 4

Page 5: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci- enzimi kao čimbenici ubrzavanja kemijskih reakcija;- supstrati i inhibitori enzima s primjerima

11. Enzimska kinetika:- Enzimi, supstrati, inhibitori;- Michaelis-Mentenova konstanta;

12. Inhibicija enzima: - specifičnost enzimske katalize;- inhibicije enzima,

13. Ugljikohidrati - nomenklatura i struktura jednostavnih šećera:- monosaharidi i oligosaharidi;

14. Razgradnja šećera u probavnom traktu;- razgradnja i resorpcija ugljikohidrata u probavnom traktu;- simport glukoze i Na+;- glukoza u stanici

15. Glikoliza:- aerobna razgradnja glukoze;- anaerobna razgradnja glukoze- alkoholno vrenje (laktat, etanol, propionat, butirat)

16. Glukogeneza:- sinteza glukoze u organizmu;- hormonska kontrola glukoneogeneze;- Cori ciklus;

17. Glikogen i metabolizam glikogena:- metabolizam glikogena;- bolesti vezane za spremanje glikogena;- hormonska kontrola metabolizma glikogena

18. Aktivirani šećeri:- UDP glukoza kao račvište metabolizma;- sinteza laktoze;- stvaranje i uloga glukuronske kiseline;- glikoproteini;- hijaluronska kiselina

19. Ciklus pentoza fosfata:- biološki značaj pentozafosfatnog ciklusa

20. Ciklus limunske kiseline:- oksidativna dekarboksilacija piruvata;- citratini ciklus i njegova energetska bilanca;- biološki značaj citratnog ciklusa;

21. Masti i lipidi - struktura masnih kiselina- sastav masti

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 5

Page 6: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci- razgradnja masti u probavnom traktu;- hilomikroni i lipoproteini;- uloga lipoproteina i transport lipida;

22. -oksidacija masnih kiselina:- -oksidacija masnih kiselina;- karnitin i transport masnih kiselina;- ketogeneza;

23. Sinteza masnih kiselina:- biosinteza masnih kiselina;- biosinteza kolesterola i njena regulacija;- metabolizam kolesterola

24. Žučne kiseline:- sinteza žušnih kiselina;- enterohepatična cirkulacija;

25. Ikozanoidi i prostaglandini:- leukotrieni i prostaglandini;- fosfolipidi; - sfingomielini i cerebrozidi - gradivni elementi stanične membrane;

26. Steroidi i steroidni hormoni;- struktura steroida;- metabolizam steroidnih hormona;- djelovanje steroidnih hormona na stanicu;

27. Razgradnja aminokiselina i transport dušika u tijelu sisavaca:- transaminaze i piridoksalfosfat;- dezaminacija serina i treonina;- transport dušika do jetre;- izlučivanje amonijaka;

28. Ciklusu mokraćne kiseline:- štetnost amonijaka za organizam- ciklus mokraćne kiseline;

29. Oksidacijska fosforilacija:- redoks reakcije: FAD i NAD;- veza između reakcija koje proizvode i onih koje troše energiju;- energijom bogati spojevi;

30. Dobivanje ATP-a:- disanje i sinteza ATP-a;- mehanizam ATP sinteze;- respiratorni lanac i termogeneza

31. Biosineteza purina i pirimidina:- biosinteza purina i pirimidina;- regulacija purin i pirimidin biosinteze;- djelovanje antimetabolita;

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 6

Page 7: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci

32. Nukleinske kiseline:- gradivni elementi;- primarna struktura;- vodikove veze;- dvostruka uzvojnica;

33. Tetrahidrofolna kiselina:- uloga folne kiseline u mijeni tvari, inhibitori sinteze folne kiseline;- razgradnja purinskih i pirimidinskih nukleotida i izlučivanje metabolita;

34. DNA i RNA- DNA biosinteza i uloga - replikacija DNA;- RNA biosinteza;- RNA i njena uloga;

35. Regulacija izražavanja gena:- regulacija ekspresije gena u pro i eukariota;- DANN kloniranje u pro i eukariota;- transgenične životinje;

36. Molekularno biološke metode u biokemiji:- izolacija DNA i RNA;- PCR, RT PCR, RFLP, osnove i njihove primjene;- ELISA

37. Metode velikog probira u farmaceutskoj industriji:- HTS, HCS

B. Seminari:

1. Uvod u biokemiju, ponavljanje i inicijalna provjera stečenog znanja iz organske kemije i biologije

2. Aminokiseline, peptidi, proteini – struktura, metabolizam, izolacija a) odjeljivanje aminokiselina;b) aminokiseline kao zwiter ioni;c) određivanje izoelektrične točke aminokiselina;d) određivanje koncentracije proteina, SDS-PAGE, Western blot, e) princip izgradnje, nomenklatura i određivanje peptida, prirodni peptidi;

struktura i reverzibilna denaturacija proteina amonij sulfatom;f) termička obrada seruma i izolacija imunoglobulina klase G;g) kromatografske metode;h) obilježavanje proteina ubikvitinacijom;i) razgradnja proteina u lizosomu i proteasomu;

3.Vitamini i koenzimi: a) podjela vitaminab) biologija i važnost vitamina c) važnost vitamina kao koenzima;

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 7

Page 8: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci

4. Enzimi i enzimska kinetikaa) vrste enzimskih inhibicija;b) karakterizacija aktivnog centra enzima;c) kristalizacija enzima i SAR.

5. Ugljikohidratia) monosaharidi, disaharidi, polisaharidi,b) metabolizam glikogena;c) hormonska kontrola metabolizam glukoze i glikogena, d) bolesti vezane za spremanje glikogena u jetrima e) G-protein povezani receptori i adrenalin;f) sinteza i uloga adrenalina;

6. Metabolizam mastia) probava masti i hilomikroni;b) uloga lipoproteina i transport lipida c) leukotrieni i prostaglandini, nastanak i veza s upalnim procesima; d) upala;

7. Energijom bogati spojevi:a) ATP sinteza; b) ATP kao supstrat;c) pirofopsfatd) kiselinski anhidridi

8. Respiratorni lanac i termogeneza, oksidacijski stres i antioksidansi

9. Metode molekularne biologije:a) izolacija DNA i RNA; b) genomska DNA; c) primjena metoda PCR, RT PCR, RFLP;

10. Metode proteinske kemijea) kromatografijab) izoelektrično fokusiranjec) elektroforezad) westernblot

11. Prijenos signala u stanici i stanični ciklusa) stanična signalizacija; b) translacija; c) posttranslacijske modifikacije; d) MAP kinazni put;

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 8

Page 9: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci12. Apoptoza:

a) programirana stanična smrt; b) signalizacija za početak apoptoze i povezanost s malignim bolestima;

13. Hormoni i receptori:a) endokrine žlijezde sisavaca;b) receptori – proteini koji prepoznaju hormone;

14. Steroidni hormoni i hormonska regulacija:a) steroidni hormoni – struktura, zadaća;b) receptori steroidnih hormona;c) transporteri steroidnih hormona;d) gemomski i ne genomiski učinci;e) hormonska regulacija razine glukoze u krvi inzulinom i glukagonom;f) diabetes tip I i diabetes tip II

15. Razvoj ljekova

C. Vježbe:

1. Analitičke metodeOsnove fotometriranja; fotometrijsko određivanje anorganskog fosfata; određivanje kiselinski labilnog i anorganskog fosfata;

2. Metabolizam aminokiselina; – obojene reakcije aminokiselina i proteina, taložne reakcija aminokiselina i proteina

3. Proteini;Obaranje proteina u nativnom stanju; obaranje kazeina u izoelektričnoj točci; Taloženje bjelančevina uz istovremenu ireverzibilnu denaturaciju; Određivanje ukupne količine proteina u uzorku metodom po Lowry-u. Izračunavanje koncentracije proteina nepoznatog uzorka.

4. Priprema i određivanje proteina SDS elektorforezomPriprema SDS gelova i uzoraka za razdvajanje proteina u denaturirajućem obliku u poliakrilamidnom gelu, Coomasie bojanje i odrečivanje molekulske mase proteina na osnovi dužine migracije vrpce uzorka u samom gelu.

5. Enzimi i njihova svojstva;specifičnost djelovanja amilaze, specifičnost djelovanja ureaze, utjecaj temperature na enzimsku aktivnost, ovisnost enzimske reakcije o pH vrijednosti, aktivacija i inhibicija enzima.

6. Aktivacija i inhibicija enzima. Enzimska kinetika

7. Metabolizam uljikohidrata; – Identifikacija monosaharida obojenim reakcijama, dokazivanje glukoze i fruktoze, identifikacija disaharida dokazivanje saharoze i laktoze

8. Metabolizam škroba, razgradnja škroba i njegovo dokazivanje..

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 9

Page 10: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci9. Metabolizam masti; – razgradnja triglicerida lipazom, određivanje nastanka

masnihkiselina. Tankoslojna kromatografija. Određivanje ketonskih tijela

10. PCR;Izvođenje lančane reakcije polimerazom i dokaz nastalog PCR produkta agar elektroforezom i/ili kvantitativnim PCR-om

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 10

Page 11: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciKorelativnost i korespondentnost predmeta:Program je korespondentan s programima referentnih sveučilišta: Program kolegija Biokemija je korespondentan sa sličnim programima u području prirodnih znanosti i biomedicine.

BIOKEMIJA BIL202 – Sadržaj Kolegija

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 11

Page 12: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16.

Vrsta TEMA Broj sati nastve

P1 Uvod u kolegij 2P2 Stanica, stanične strukture 1P3 Aminokiseline 1P4 Peptidi, proteini, proteolitički enzimi 1P5 Struktura proteina 2P6 Razgradnja proteina 1P7 Metode proteinske kemije 1P8 Vitamini 1P9 Koenzimi. 1P10 Enzimska kataliza 1P11 Enzimska kinetika 1P12 Inhibicija enzima 1P13 Ugljikohidrati. 2

Kolokvij 1P14 Razgradnja i resorpcija šećera u organizmu 1P15 Glikoliza 1P16 Glukoneogeneza 1P17 Metabolizam glikogena 1P18 Aktivirani šećeri 1P19 Ciklus pentoza fosfata 1P20 Oksidacijska dekarboksilacija i ciklus limunske

kiseline1

P21 Masti i lipidi 1P22 Beta oksidacija masnih kiselina, karnitin,

ketogeneza1

P23 Sinteza masnih kiselina, biosinteza kolesterola i njena ragulacija, metabolizam kolesterola

1

P24 Sinteza žučnih kiselina 1P25 Fosfolipidi, eikozanoidi, leukotrieni,

prostaglandini1

Kolokvij 2P26 Steroidi i steroidni hormoni 1P27 Transaminaze i piridoksalfosfat, dezaminacija

serina i treonina, transport dušika do jetre1

P28 Ciklus mokraćne kiseline 1P29 Oksidacijska fosforilacija 1

Kolokvij 3P30 Dobivanje ATP-a 1P31 Biosinteza purina i pirimidina 1P32 Nukleinske kiseline; gradivni elementi, primarna

struktura, vodikove veze, dvostruka zavojnica1

P33 Tetrahidrofolna kiselina, razgradnja purinskih i pirimidinskih nukleotida i izlučivanje metabolita

1

P34 DNA i RNA 1P35 Regulacija izražavanja gena 1P36 Molekularnobiološke metode u biokemiji 1P37 Metode probira aktivnih molekula u farmaceutskoj

industriji1

Kolokvij 4Vrsta TEMA Broj sati

nastaveS1 Uvod u biokemiju i inicijalni test provjere

stečenog znanja iz biologije i organske kemije3

S2 Aminokiseline, peptidi, proteini - struktura, Aminokiseline, peptidi, proteini - metabolizam

22

S3 Vitamini i koenzimi 2

12

Page 13: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciP-predavanjaS-seminariVE -Eksperimentalne vježbe

Sadržaj predmeta:

A. Predavanja:

Uvod u biokemiju Stanica i stanične struktureAminokiseline ProteiniStrukture proteina Razgradnja proteina, proteolitički enzimiMetode proteinske kemijeVitaminiKoenzimiEnzimi i enzimska kataliza Enzimska kinetika, inhibicija enzimskog djelovanjaUgljikohidrati, Glikoliza i glukoneogeneza,Metabolizam glikogenaAktivirani šećeriCiklus pentozafosfataOksidacijska dekarboksilacijaCiklus limunske kiselineMasti, beta oksidacija masnih kiselina,Sinteza masnih kiselinaŽućne kiseline Eikozanoidi i prostaglandini Steroidi i steroidni hormoniRazgradnja aminokiselina i promet dušika u organizmuCiklus mokraćne kiseline, transaminacija i oksidativna fosforilacijaDobivanje ATP-aNukleinske kiseline, biosinteza purina i pirimidina, tetrahidrofolna kiselinaDNA i RNA, ribosomi, regulacija ekspresije genaMolekularno biološke metode u biokemijiMetode probira aktivnih molekula u farmaceutskoj industriji

B. Seminari - auditorne vježbeUvod u biokemiju provjera stečenog znanja iz biologije i organske kemijeAminokiseline, peptidi, proteinske strukture, izolacija AKVitamini i koenzimi, Enzimi i enzimska kinetikaUgljikohidratiMetabolizam mastiEnergijom bogati spojevi, Respiratorni lanac i termogeneza, antioksidansiMetode molekularne biologieMetode proteinske kemijePrijenos signala u stanici i stanični ciklusProgramirana stanična smrt - Apoptoza

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 13

Page 14: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciHormoni i receptoriSteroidni hormoni i hormonska regulacija metabolizma.

C. Vježbe-eksperimentalne vježbe

Analitičke metodeOsnove fotometriranja; fotometrijsko određivanje anorganskog fosfata; određivanje kiselinski labilnog i anorganskog fosfata; Enzimska kataliza dobivanjekreatinin fosfata iz kreatinina i ATP-a.Proteini;Obaranje proteina u nativnom stanju; obaranje kazeina u izoelektričnoj točci; Taloženje bjelančevina uz istovremenu ireverzibilnu denaturaciju; kvantitativno određivanje proteina putem određivanja prisutnosti peptidne veze. Razdvajanje proteina na osnovi njihovog različitog naboja. Određivanje izoelektrične točke proteina.Enzimi i njihova svojstva;ovisnost enzimske reakcije o pH vrijednosti, ovisnost enzimske reakcije o temperaturi, ireverzibilna denaturacija proteina.Proteinska biosinteza i nukleinske kiseline; –izolacija nukleinskih kiselina, kvantitativno određivanje nukleinskih kiselina.Metabolizam uljikohidrata; – model djelovanja dehidrogenaza; kromatografsko određivanje aktivnosti heksokinaze.Metabolizam masti; –Enzimska razgradnja triglicerida lipazom; određivanja nastanka masnih kiselina nakon hidrolize triglicerida inkubiranih s lipazom, kvalitativno i kvantitativno određivanje ketonskih tijela kao produkt oksidacije masnih kiselina u mitohondriju.

Pristup učenju i poučavanju u predmetu:

1. Znanje Studenti trebaju savladati i znati osnovnu biokemijsku terminologiju, strukturu osnovnih kemijskih spojeva i molekula važnih za život i opstanak stanice. Studenti moraju naučiti, shvatiti, znati objasniti osnovne biokemijske procese koji se zbivaju u stanici. Studenti moraju znati objasniti međusobnu povezanost pojednih ciklusa i njihov energetski učinak te značenje za metabolizam i zdravlje stanice. Studenti moraju zanti principe osnovnih biokemijskih metoda.

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 14

Page 15: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci2. Razumijevanje

Studenti trebaju razumijeti biokemijske zakonitosti stanice, principe i važnost biokemijskih ciklusa te ulogu pojedinih biokemijskih procesa u životu stanice i samog organizma kao što je to opisano u predhodnom članku.

3. VještineStudenti moraju biti sposobni pratiti postupke u pripremljenom obliku, sigurno i kooperabilno provesti eksperimente, rukovati aparaturom za provođenje eksperimenata, uočiti i registrirati promjene, izvesti mjerenja, interpretirati eksperimentalne podatke i procijeniti točnost eksperimentalnih rezultata uz objašnjenje njihovog značenja.

4. Sposobnost Studenti trebaju moći prevesti dobivene informacije u govorni, grafički i matematički oblik, jasno napisati koncept i teoriju izrađenog pokusa, izvjestiti o eksperimentalnim postupcima i rezultatima na sažet, točan i razumljiv način. U tu svrhu studenti trebaju koristiti stečena znanja iz biokemije.

5. Stavovi Student treba prepoznati molekularnu biokemijsku osnovu života, njenu važnost i napredak u biokemiji kao znanstvenoj grani. Studenti trebaju prepoznati utjecaj biokemijskih procesa na život, razvoj bolesti ili zdravlja. Razumjeti važnost biokemije u razvoju zdravstva i farmaceutske industrije te raspon biokemijske stručnosti i način rada biokemičara.

Način izvođenja nastave

Nastava se odvija u turnusu od 02.02.2015 - 27.03.2015. u obliku predavanja, seminara i eksperimentalnih vježbi. Predviđeno vrijeme trajanja nastave je ukupno 8 tjedana.

Obaveze studenata/studenticaStudenti su dužni redovito izvršavati obveze koje se odnose na pohađanje nastave, laboratorijski rad i kontinuiranu provjeru znanja.

Vrednovanje obveza studenata/studenticaTijekom kolegija biokemija student/studentica može ukupno prikupiti 100 bodova prema tablici 1.

Laboratorijski rad, kontinuirana provjera znanja i seminari pridonose 70 od maksimalnih 100 bodova. Student/ica bodove stjeće uspješnim polaganjem kolokvija u sklopu kontinuirane provjere znanja, pripremom seminarskog rada u pisanom obliku i njegove prezentacije.

Redovito pohađanje nastave. Nastava iz kolegija biokemije sastoji se od 40 sati predavanja, 40 sati laboratorijskih vježbi, 40 sati seminara. Student može samo iz opravdanih razloga izostati najviše do 30% ukupne nastave (predavanja, laboratorijske vježbe, seminari). Pohađanje nastave je obavezno. Ako student/ica izostane s više od 30% ukupne nastave bilo OPRAVDANO ILI NEOPRAVDANO isti/a ne može dalje nastaviti praćenje kolegija Biokemija, odnosno gubi mogućnost izlaska na završni ispit. Time je skupio/la nula bodova i ocijenjen/a ocjenom FX. Izostanak s praktične nastave (vježbe) student/ica ne može nadoknađivati ponavljanjem pokusa u praktikumu. Ako je izostanak opravdan i potvrđen valjanom dokumentacijom student/ica može u dogovoru s nastavnikom nadoknaditi propuštene vježbe dodatnim seminarskim radom. Temu seminarskog rada dogovara s nastavnikom kod slijedećeg dolaska na nastavu nakon izostanka. Na ovaj način mogu se nadoknaditi maksimalno dvije vežbe iz programa ovog kolegija.

Laboratorijski rad - laboratorijske vježbe pridonose na kolegiju biokemija najviše 10 bodova, u to ulazi, način i izrada same vježbe, točnost rezultata i objašnjenje dobivenih

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 15

Page 16: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijecirezultata. Za svaku vježbu, student/ica je dužan/a pripremiti se za izvođenje praktične nastave iz preporučene i pripremljene literature. Ocjena pripremljenosti za praktične vježbe koja će se provesti kratkom pismenom provjerom studentu/ici pridonosi maksimalno 10 bodova. U slučaju da student ili studentica pokažu na testu da nisu dovoljno pripremljeni za izvođenje predviđenih praktičnih vježbi neće im biti dozvoljeno izvođenje istih, te će ne prisustvovanje vježbama morati nadoknaditi seminarskim radom i kolokvijem kod voditelja nastave iz kolegija biokemija. Izostanak s eksperimentalnih vježbi neće se tolerirati, odnosno, neće biti mogućnosti nadoknade eksperimentalnih vježbi naknadnim ponavljanjem pokusa u laboratoriju studentskog praktikuma. Izostanak s vježbi može se nadoknaditi seminarskim radom kako je navedenu u gornjem odlomku ovoga teksta. Ukupan broj bodova koji student/ica može ostvariti na praktičnom radu u laboratoriju je 20 bodova.

Tijekom održavanja predavanja i seminara provoditi će se i kontinuirana provjera znanja provedene nastave ukupno četiri kolokvija. Svaki kolokvij donosi 10 bodova. Svaki student će moći na kontinuiranoj provjeri znanja prikupiti najviše 40 bodova.

Ukoliko student ne prikupi bodove tijekom provođenja kontinuirane provjere znanja, imati će mogućnost popravka nakon obavljene ukupne nastave kolegija testovima za seminarsko gradivo koje student/ica nije uspješno apsolvirala – popravak uključuje prethodno ocjenjene testove ocjenom F i Fx i ne mogu se pisati popravci testova ako su predhodni testovi kontinuirane provjere znanja bili pozitivno ocijenjeni.

Ukoliko student ni tada ne prikupi dovoljan broj bodova, popravak će se održati u rujnu.

Aktivno sudjelovanje koja uključuje obradu i pripremu seminara u obliku pismenog seminarskog rada i "power point" prezentacije te izlaganjem obrađene teme studentu/ici pridonosi maksimalno 10 bodova.

Kriterij ocjenjivanja na kolegiju biokemija sukladan je kriterijima ocjenjivanja diplomskog studija: A (5) – 80-100%, B (4) – 70-79,99%, C (3) – 60-69,99%, D (2) – 50 -59,99%, E (2) – 40-49,99%, F i FX – (1) ispod 49,99% bodova.

Završni ispit pridonosi najviše 30 bodova. Završni ispit polaže se usmeno. Usmeni završni ispit sastoji se od 6 pitanja koja se pojedinačno boduju svaki s pet (5) bodova.

Kriterij bodovanja završnog ispita:

- 15,00 - 17,97 bodova - odgovor koji zadovoljava najniži kriterij poznavanja ispitne materije;

- 17,98 - 20,97 bodova – ispodprosječno poznavanje ispitne materije;

- 20,98 - 23,97 bodova – prosječno poznavanje ispitne materije;

- 23,98 - 26,97 bodova – iznadprosječno poznavanje ispitne materije s malim pogreškama;

- 26,98 - 30,00 – iznadprosječno poznavanje ispitne materije

Jedno od pitanja odnositi će se na eksperimentalnu vježbu izrađenu u okviru kolegija.

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 16

Page 17: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciTablica 1. Potrebne aktivnosti bodovanja kolegija BIL202 Biokemija

Vrsta aktivnosti

Ishodi učenja Specifična aktivnost studenta

Metoda procjenjivanja

Bodovanje (maksimalni broj bodova)

Seminarski radovi

stjecanje vještine pisanja i izlaganja znanstvenog rada

usmeno izlaganje, interaktivno učenje

pripremljenost seminara i vještina izlaganja

10 BODOVA

Kontinuirana provjera pripremljenosti za vježbe

Pismena provjera pripremljenosti studenta/ice za izvođenje vježbi

prethodna pripremljenost za izvođenje vježbi,

10 BODOVA

Laboratorijski rad

sigurno i djelotvorno rukovati uzorcima,

provesti analizu prema protokolu,

prikazati rezultate analize,

analizirati rezultate

Izvođenje eksperimenata prema zadanom protokolu

samostalnost izvođenja,

točnost rezultata, završetak vježbe i

predaja izvješća u zadanom vremenu

10 BODOVAPrema složenosti vježbe moguće je po vježbi i provjeri pripremljenosti za vježbe skupiti maksimalno 3 boda

Kontinuirana provjera znanja

objektivno mjerenje znanja provodi se zadacima ispravljanja

4 Kolokvija:1.P1-P12; S1-S42.P13-P19; S5-S63.P20-P30; S7-S104.P31-P37;S10-S15

40 BODOVASvaki test donosi maksimalno 10 bodova i sadrži do 50 pitanja ili zadataka.Potrebno je riješiti minimalno 50% testa ili skupiti 5 bodova po testu.

Završni ispit Usmenouključuje sadržaj predavanja, seminara i vježbi

6 pitanja svaki točan i potpun odgovor donosi 5 bodova

Završni ispit 30 BODOVAUkupno 100 BODOVA

DODATNE INFORMACIJE O PREDMETU

Pohađanje nastave:Nastava iz kolegija biokemije će se održati u turnusu od 02.02. - 27.3.2015. prema navedenom rasporedu.KAŠNJENJA STUDENTA, KAO I ULASCI ILI IZLASCI TIJEKOM NASTAVE SE NE TOLERIRAJU I NE DOPUŠTAJU! STUDENTI MORAJU ISKLJUČITI MOBITELE U VREMENU ODRŽAVANJA NASTAVE!

Na laboratorijskim vježbama studenti trebaju nositi zaštitnu odjeću (bijela kuta), a sa sobom donijeti flomaster za pisanje po staklu, krpu, špatulu, kalkulator i obavezno Upute za vježbe.

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 17

Page 18: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci

Tjedan Datum Predavanja Seminari Laboratorijske vježbe

Testovi i međuispiti

Nastavnik/suradnik/Predavaonica

1 .

(08.

-12

.02.

201

6.)

Ponedjeljak08.02.

P1(08:15-09:00)

P-O-30

S1 GI -GII(09:15-13:00)S1 GIII-GIV

P-O-268(13:15-17:00)

Prof.dr.sc.R.Antolović

Utorak09.02

P2, P3,(08:15-10:00)

Prof.dr.sc.R.Antolović

Srijeda10.02.

P4, P5(08:15-10:00)

P-O-30

S1 GI -GII(10:15-11:00)S1 GIII-GIV(11:15-12:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Četvrtak11.02.

P6, P7(08:15-10:00)

P-O-30

S2 GI - GII(10:15-14:00)

P-O-30S2 GIII - GIV(14:15-18:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Petak12.02.

P8, P9(08:15-10:00)

P-O-30

S2 GI - GII(10:15-12:00)

P-O-30S2 GIII-GIV(12:15-14:50)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

2.(1

5. -1

9. 0

2. 2

016.

)

Ponedjeljak15.02

P10, P11, P12 (08:15-11:00)

P-O-30

S3 GI - GII(12:15-14:00)

P-O-268S3 GIII-GIV(14:15-16:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Utorak16.02.

P13(08:15-09:00)

P-O-30

S4 GI - GIV(09:15-13:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Srijeda17.02.

P14, P15(8:15-10:00)

P-O-30

S4 GI - GIV(10:15-14:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Četvrtak18.02.

VE1, VE2/ GI -GII

(09:15-13:00)GIII-GIV

14:00-19:00Praktikum

O-264, O-265

Prof.dr.sc.R.Antolović

Petak19.02.

S5 GI - GIV(08:15-12:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

3.(2

2. -2

6 .0

2. 2

016.

)

Ponedjeljak22.02.

P16, P17(10:15-12:00)

P-O-30 P18

(12:15-13:00)P-O-30

P19(13:15-14:00)

P-O-30

Kolokvij I(08:15- 09:30)P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Utorak23.02.

VE3/ GI-II(08:15-12:00)O-264, O-265

VE3/ GIII-GIV(13:00-18:00)

O-265

Prof.dr.sc.R.Antolović

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 18

Page 19: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciSrijeda24.02.

VE4/ G I-II(09:15 -13:00)

GIII-IV14:00-19:00

O-264, O-265

Prof.dr.sc.R.Antolović

Četvrtak25.02.

P20(08:15-09:00)

P-O-30 P21

(09:15-10:00)P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Petak26.02.

VE5/ GI-II(09:15 -13:00)

GIII-IV14:00-19:00

O-264, O-265

Prof.dr.sc. R. Antolović

4.(2

9.02

. -.0

4. 0

3. 2

016.

)

Ponedjeljak29.02.

S6 GI -GII(10:15-12:00)

P-O-30S6 GIII - IV(12:15-14:30)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Utorak01.03.

P22, P23(10:15-12:00)

P-O-30

S7 GI - GIV(12:15 -16:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Srijeda02.03.

VE6/ GIII-IV(08:15-13:00)VE6/ GI-II

(14:00-19:00)O-264, O-265

Prof.dr.sc.R.Antolović

Četvrtak03.03.

P24, P25(10:15-12:00)

P-O-30

S7 GI - GIV(12:15-14:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Petak 04.03

Kolokvij II(10:00- 12:00)P-O-30

5.(0

7-11

. 03.

201

6.)

Ponedjeljak07.03.

P26, P27,(10:15-12:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Utorak08.03.

VE7/ GIII-IV(08:15-13:00)VE7/ GI-II

(14:00.19:00)O-264, O-265

Prof.dr.sc.R.Antolović

Doc.dr.sc.M.Jovanović

Srijeda09.03.

VE8/ GIII-IV(08:15-13:00)VE6/ GI-II

(14:00-19:00)O-264, O-265

Prof.dr.sc.R.Antolović

Četvrtak10.03.

P28 -P29(10:15-11:45)

P30- P31(12:15-14:00)

P-O-30

Prof.dr.sc. R. AntolovićDoc.dr.sc. Mirela Sedić

Petak11.03.

S8 GI - GIV(010:00-14:00)

P-O-3O

6.14

.-17

.03.

Ponedjeljak14.03.

Kolokvij III(08:00- 09:30)

P-O-30

S9 GIII - GIV(10:15-14:00)

P-O-30S9 GI-II

(14:15-16:00)P-O-268

Prof.dr.sc.R.Antolović

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 19

Page 20: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci

2016

.)

Utorak15.03.

VE 9 / GIII-IV(09:45-13:00)

GI-II(14:00-19:00)O-264, O-265

Prof.dr.sc.R.Antolović

Prof.dr.sc. S. Kraljević Pavelić

Srijeda16.03.

P32(10:15-11:00)

P-O-30P33

(11:15-12:00)P-O-30

Prof.dr. sc. Sandra Kraljević Pavelić

Dr.sc. Mirela Sedić

Četvrtak17.03.

P34(08:15 -09:00)

P-O-30 S10 GI - GIV(09:15-13:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.Sandra Kraljević-Pavelić

Petak18.03.

S11 GIII –GIV(09:15-11:00)

S11 GI-II(11:15-13:00)

P-O-268

Prof.dr.sc.R.Antolović

7.(2

0. -

24. 0

3. 2

016.

)

Ponedjeljak21.03

VE10 / GI-IV(08:15-17:00)O-264, O-265

Doc.dr.sc. M. Sedić

Utorak22.03.

P 35,36(12:00-14:00)

P-O-30

S12 GI - GIV(14:15-16:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Srijeda23.03.

P 37(12:00-13:00)

P-O-30

S13 GIII - IV(09:15-12:00)

P-O-268S13 GI-II

(13:15-16:00)P-O-268

Prof.dr.sc.R.Antolović

Četvrtak24.03.

S14-15 GI - GIV(12:15-16:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

Petak25.03.

Kolokvij IV(12: -14:00)

P-O-30

Prof.dr.sc.R.Antolović

8.(2

6. 0

3.- 0

1. 0

4.

2016

)

Utorak29. 03. 2016.09:00-11:00

Ispravak kolokvija I-IVP-O-268

Prof.dr.sc.R.Antolović

Četvrtak31.03.2016.9.00-15,00

1. ISPITNI ROK – USMENI ISPITP-O-268

Prof.dr.sc. R. Antolović

Petak 01.04.2016.

1. ISPITNI ROK – USMENI ISPITP-O-268

Prof.dr.sc. R. Antolović

a) Predavanja i seminari se održavaju u predavaoni Odjela za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci (prizemlje) P-O-30, ili u P-O-268 prema rasporedu danom u tablici iznad. Prema potrebama održavanja nastavae na drugim kolegijima moguće je da u tijeku kolegija biokemija dođe do promjena održavanja seminara ili predavanja u predavaonama navedenim u rasporedu o čemu će studenti biti pravovremeno obaviješteni.

b) Praktične vježbe se održavaju u laboratorijama i praktikumima Odjela za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci, drugi kat O-264 i O-265.

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 20

Page 21: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciPismeni radovi

UPUTE ZA PISANJE SEMINARSKOG RADA

Seminarski rad predaje se u elektronskom i tiskanom obliku, a piše se u obliku ESEJA prema niže navedenim uputama i rad se ne može predati kao prijevod orginalnog rada ili radova koji se obrađuju.

NASLOV rada treba biti kratak i jasan, iz njega mora biti vidljiva problematika rada. Treba izbjegavati kratice i strane riječi ako postoje hrvatske istoznačnice. Imena vrsta pisati korektno kosim slovima (italic), a uz ime vrste navesti i ime autora koji je tu vrstu prvi odredio.

Format: A4 (210x297 mm). Korice: ispisuje se naziv sveučilišta, fakulteta i odsjeka, ime i prezime studenta, smjer, naslov

rada, vrsta rada (Seminarski rad), mjesto i godina (Prilog 1). SADRŽAJ je kazalo pojedinih naslova s navođenjem stranica. Preporučuje se decimalna

numeracija poglavlja i odlomaka u poglavljima (npr. 1.1 1.2 …). Numeracija stranica započinje na stranici UVODA rada; numeriraju se sve stranice, tj. kako stranice s tekstom, tako i stranice sa slikama (grafikoni, sheme, fotografije) i tablicama, ukoliko već nisu uklopljeni u tekst.

UVOD ukratko sadrži osnovne podatke o tematici seminarskog rada. RAZRADA tematike seminarskog rada – sadrži definicije, kemijske strukture, sheme

metaboličkih puteva, slike, grafikone potrebne za razradu tematike. ZAKLJUČAK – ukratko se navodi na osnovu obrađene tematike. LITERATURA – sadrži popis svih izvornika koji se spominju u radu. Svaki citat u tekstu mora

biti zastupljen u popisu literature i obratno. Literaturni podaci moraju sadržavati: imena autora, godinu objavljivanja rada, naslov rada, naziv časopisa, broj volumena i stranice koje rad obuhvaća. Bibliografske reference se navode abecednim redom uzevši u obzir početno slovo prezimena prvoga autora. Interpunkcija u popisu literature mora biti ujednačena.

Po "Harwardskome" sustavu u tekstu rada navodi se prezime autora te godina u kojoj je rad objavljen, na primjer: (Stearns 1992). Kada su dva autora, treba navesti oba, npr.: (Cerny i Herbert 1999), a ako je više autora, navodi se prvi autor te dopisuje i suradnici (Boreri sur. 1989). Ako su imena autora dio rečenice, u zagradu se piše samo godina npr. Gaines i Elbrächter (1987) su utvrdili da ...

PRIMJERI CITIRANJARad u časopisu (odabrani način citiranja mora se sustavno koristiti kroz cijelo poglavlje): BorerR.A., LehnerC.F., EppenbergerH.M., NiggE.A. (1989): Major nucleolar proteinsshuttle between

nucleus and cytoplasm. Cell56: 379-390. iliBorerR.A., LehnerC.F., EppenbergerH.M., NiggE.A. 1989. Major nucleolar proteins shuttle between

nucleus and cytoplasm. Cell 56, 379-390.

Cerny, M., Herbert, P.D.N. (1999): Intercontinental allozyme differentiation among four holartik Daphnia species. Limnol. Oceanogr. 44: 1381-1387.

Knjiga:Stearns S.C. (1992): The evolution of life histories. Oxford University Press, Oxford.

Poglavlje u knjizi:Gaines G., Elbrächter M. (1987): Heterotrophic nutrition. U: Taylor, F.J.R. (ur.) The biology of the

dinoflagellates. Oxford, Blackwell Scientific Publications, str. 224-268.

Ukoliko su u radu uporabljene kratice, na posebnoj stranici treba navesti njihov popis i objašnjenje. Takva stranica treba biti smještena prije Uvoda na početku rada.

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 21

Page 22: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci

Prilog 1.

Sveučilište u RijeciOdjel za biotehnologiju

Ime i prezime, studij

Naslov rada

Seminarski rad

Rijeka, 20xx-. godina

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 22

Page 23: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciAkademska čestitost

Podrazumjeva se da će nastavnik poštivati Etički kodeks Sveučilišta u Rijeci, a studenti Etički kodeks za studente/studentice Sveučilišta u Rijeci.

Kontaktiranje s nastavnicima

Nastavnik je svakodnevno dostupan putem e-mail ([email protected]) za sva pitanja koja se tiču nastave.

Informiranje o predmetu

Informiranje o predmetu studenti dobivaju putem sustava učenja na daljinu (e-learning) i direktnom kontaktu s predmetnim nastavnikom.

Očekivane opće kompetencije pri upisu studenata/studentica pri upisu predmeta

Smatra se da se studenti koriste računalnim programima (Word, Excel). Također se smatra da studenti razumiju i mogu se služiti u svom radu s barem jednim svjetskim jezikom (engleski/njemački/talijanski/francuski/španjolski/ruski). Težište je na engleskom i njemačkom jeziku zbog dostupne literature. Obzirom na položeni razredbeni ispit, smatra se da studenti mogu pratiti nastavu predmeta biokemija.

UPUTE STUDENTIMAStudentima se na početku predavanja daje lozinka kolegija. Kada se studenti budu "spojili" na sustav trebaju pronaći kolegij i kliknuti na njega.Sustav će ih tražiti lozinku za upis na kolegij (lozinku koju je postavio nastavnik i koju su studenti dobili na predavanju)Nakon toga nastavnik će vidjeti popis studenata na kolegiju.Ukoliko se studenti nisu nikada spajali na MudRi, njihovi podaci nisu zabilježeni u sustavu te ih nije moguće vidjeti sve dok se ne prijave u sustav.

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 23

Page 24: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciPrilog. Tjedni rasporedBIOTEHNOLOGIJA I ISTRAŽIVANJE LIJEKOVA – 4. SEMESTAR

Tjedan 1. 08. - 12. veljače 2016.Vrijeme Ponedjeljak

08.02.Utorak09.02.

Srijeda10.02.

Četvrtak11.02.

Petak12.02.

Subota13.02.

8 P1(08,15-09,00)P-O-30

P2, P3(08,15-10,00)P-O-30

P4, P5(08,15-10,00)P-O-30

P6-P7(8,15-10,00)P-O-30

P8, P9(8,15-10,00)P-O-30

9 S1 GI - GII(09,15-13,00)P-O-30

10 S1 GI - GII(10,15-11,00)P-O-30

S2 GI - GII(10,15-14,00)P-O-30

S2 GI - GIV(10,15-14,00)P-O-30

11 S1 GIII (13,15-17,00)P-O-30

S1 GIII(11,15-12,00)P-O-30

12 S2 GII(12,15-14,00)P-O-30

1314151617

Tjedan 2. 15.- 19. veljače 2016.Vrijeme Ponedjeljak

15.02.Utorak16.02.

Srijeda17.02.

Četvrtak18.02.

Petak19.02.

Subota20.02.

8 P10, P11, P12(08:15-11:00)P-O-30

P13 (08:15-09,00)P-O-30

P14, P15(8:15-10:00)P-O-30

VE1-2GI-IIO-264, O-265(09:15-13:00)

GIII-IV(14:00-19:00)O-264, O-265

S5 GI - GIV(08:15 - 12:00)P-O-30

9 S4 GI - GIV(09:15-13:00)P-O-30

10 S4 GI - GIV(10:15-14:00)P-O-30

1112 S3 GI - GII

(12:15-14:00)P-O-30S3 GIII (12:15-14:00)P-O-30

13

141516

Tjedan 3. 22.- 26. veljače 2016.Vrijeme Ponedjeljak

22.02.Utorak23.02.

Srijeda24.02.

Četvrtak25.02.

Petak26.02.

Subota27.02.

8 KOLOKVIJ - I(8,15-09,30)P-O-30

VE3(09:15-13:00)G I-IIO-264, O-265

VE3GIII-IV(14:00-19:00)O-264, O-265

VE4 GI-II(09:15-14:00)O-264, O-265

VE4GIII-IV(14:00-19:00)O-264, O-265

P20(08:15-09:00)P-O-30

9 P21(09:15-10:00)P-O-30

VE5 GI-II(09:15-13:00)O-264, O-26

GIII-IV(14:00-19:00)O-264, O-265

10 P16 – P17(10:00-12:00)P-O-30

111213 P18 - P19

(12:15-14:00)P-O-30

1415161718

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 24

Page 25: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci

Tjedan 4. 29. veljače – 04. ožujka 2016.Vrijeme Ponedjeljak

29.02.Utorak01.03.

Srijeda02.03.

Četvrtak03.03.

Petak04.03.

Subota05.03.

8 VE6(08:15 – 13:00)GIII-IVO-264, O-265

GI-II(14:00-19:00)O-264, O-265

910 S6 GI - GIV

(10:15-14:30)P-O-30

P22, P23(10:15-12:00)P-O-30

P24, P25(10:15-12:00)P-O-30

KOLOKVIJ - II(10:00-12:00)P-O-30

11

12 S7 GI - GII(12:15-16:00)P-O-30S7 GIII - GIV(14:15-16:00)P-O-268

13 S7 GI - GIV(12:15-16:00)P-O-30

1415

161718Tjedan 5. 07.-11. ožujka 2016.

Vrijeme Ponedjeljak07.03.

Utorak08.03.

Srijeda09.03.

Četvrtak10.03.

Petak11.03.

Subota12.03.

8 VE7(10:15-13:00)GIII- IVO-264, O-265

GI-II(14:00-19:00)O-264, O-265

VE8(08:15-13:00)GIII-IVO-264, O-265

GI-II(14:00-19:00)O-264, O-265

910 P26, P27,

(10:15-12:00)P-O-30

P28, P29(10:15-12:00)P-O-30

S8 GI - GIV(08:30-12:00)P-O-30

11

12 P30, P31(12:15-14:00)P-O-3013

141516171819

Tjedan 6. 14.- 18. ožujka 2016.Vrijeme Ponedjeljak

14.03.Utorak15.03

Srijeda16.03.

Četvrtak17.03.

Petak18.03.

Subota19.03.

8 KOLOKVIJ - III(08:00 - 09:30

VE9(08:45 – 13:00)G III-IVO-264, O-265

G I-II(14:00-19:00)O-264, O-265

P34, (08:15 –09:00)P-O-30

S11 GI-II (09:15 - 11:00)S11 G III-IV(11:15 - 13:00)P-O-30

9 S10 GI - GIV(09:15 -13:00)P-O-30

10 S9 GI - GIV(10:15-14:00)P-O-30

P32, P33(10:15 – 12:00)P-O-3011

121314151617

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 25

Page 26: Sveučilište u Rijeci - biotech.uniri.hr 2015/BIL_202_Biokemija_2015-16...  · Web viewBiokemija - Syllabus. Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje

Odjel za biotehnologiju Sveučilište u RijeciTjedan 7. 21. - 25. ožujka 2016.Vrijeme Ponedjeljak

21. 03.Utorak22.03

Srijeda23.03

Četvrtak24.03.

Petak25.03.

8 VE10

(08:15 - 14:00)

GI-IVO-264, O-265

9 S13 GI - GII(09:15-12:00)P-O-268

101112 P35

(12:15-13:00)P-O-30

P37 (15:15-16:00)P-O-30

S14 GI - GIV(08:15-12:00)P-O-30

KOLOKVIJ - IV(11:30 - 13:00)P-O-30

13 P36(13:15-14:00)P-O-30

S13 GIII - GIV(13:15-15:00)P-O-268

14 S12 GI - GIV(14:15-17,00)P-O-30

15161718

Tjedan 8. 27. ožujka – 01. Travnja 2016.29. ožujka 2016. UTORAK- popravak kolokvija I-IV od 09:00 do 12:00 P-O-3031. ožujka 2016. ČETVRTAK - 1. Ispitni rok –USMENI ISPIT od 09:00 do 17:00 P-O-26801. travnja 2016. PETAK - 1. Ispitni rok –USMENI ISPIT od 09:00 do 17:00 P-O-268

2.ispitni rok – USMENI ISPIT prema dogovoru sa studentima u drugoj polovici travnja 2016.

Legenda: P – predavanja S – seminari VE – eksperimentalne laboratorijske vježbe

Predavanja i seminari se održavaju u predavaonici Odjela biotehnologije na Kampusu u Rijeci (P-030).Laboratorijske vježbe se održavaju u laboratorijima Odjela za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci. Prve vježbe počinju u petak 07.02.2014. u 08:15 sati i održavati će se u 4 grupe, nastava iz vježbi nastavlja se u mjesecu veljači i ožujku prema danom rasporedu nastave iz biokemije za akademsku godinu 2013/2014.

Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2015/16. 26