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Taverna – WMS
Discente:Raffael Bechara Rameh
UFJF/PGMC Mestrado - 1/2016Prof. Dr. Ciro Barros
Taverna – WMS
Introdução Conceitual
● Workflow
– Sequência de passos necessários para se automatizar processos (científicos), de acordo com regras definidas
– Envolve geralmente interação/comunicação entre pessoas ou grupos (participantes):
● Envolvidos diretos:– interagem entre si durante
a execução do processo ● Interessados nos resultados
● Experiência in silico
– Experimentação através da simulaçao computacional
● WMS: Workflow Management System
– Conjunto de ferramentas para design e execução de workflows científicos com objetivo de auxiliar experiências in silico
Taverna – WMS
Taverna - WMS● Disponível para download em:
– http://www.taverna.org.uk/● Disponível nas seguintes edições:
– Workbench (desktop designer/player)
– Server (cloud infrastructure)
– Player (interface web para execução no Server)
– Command Line
– Online
Taverna – WMS - Screenshot
Painel de Serviços: recursos p/ acesso a WebServices, DBMS, manipulação e transformaçao de dados (xml, text,...), criptografia, interaçao com usuário, etc..
Workflow Explorer: mostra a estrutura hierárquica do workflow em que estamos trabalhando
Diagrama de Workflow
Taverna – WMS - Tutorial
Taverna – WMS - Tutorial
Taverna – WMS - Tutorial
Taverna – WMS - Tutorial
Taverna – WMS - Tutorial
Taverna – WMS - Tutorial
Taverna – WMS
myExperiment● Repositório de experimentos
● Torna possível o compartilhamento de experimentos entre as pessoas
● Possibilita acesso a diversos workflows e pacotes desenvolvidos pela comunidade
● Permite a localização de outros usuários e grupos da comunidade
Taverna – WMS
● WfMC– Workflow Management Coalition
– http://www.wfmc.org/
Referências
● Taverna– Site Oficial
– http://www.taverna.org.uk/
● MyExperiment– Repositório de Workflows
– http://www.myexperiment.org/
Taverna – WMS - Perguntas
1)Qual a relação entre WMS e Taverna?
2)Cite dois tipos de serviços suportados pelo Taverna.
3)O que é um WebService?
4)Defina o myExperiment.
5)Quais os benefícios de uma comunidade de experimentos científicos na internet?
Taverna – WMS
Obrigado!