THE POSSIBILITIES OF INTERNET INFRASTRUCTURE’S USING … · туальные лаборатории, интернет-конференции и открытый доступ к

Since 1999 ISSN 2226-7425

The journal of scientific articles “Health & education millennium”, 2013, tom 15 № [1-4]

~ 364 ~

Издание зарегистрировано в Федеральной службе по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых комму-никаций (Роскомнадзор). Свидетельство о регистрации СМИ ПИ № ФС77-49390

Журнал представлен в НАУЧНОЙ ЭЛЕКТРОННОЙ БИБЛИОТЕКЕ - головном исполнителе проекта по созданию

Российского индекса научного цитирования (РИНЦ).

Yuzhaninova E.R., Bibartseva E.V.

THE POSSIBILITIES OF INTERNET INFRASTRUCTURE’S USING

FOR BIOCHEMISTRESEARCH ACTIVITIES

Orenburg State University, department of Philosophy,

Department of Biochemistry and Molecular Biology, Orenburg

Abstract. The world computerization of science has been reflected in the work of the bio-

chemistry scientists in the most favorable way: it attached special features of activity; it

formed a necessary and normal state of scientific research. The paper examines the using

potential of such elements in the scientific Internet infrastructure by biochemists as virtual

research networks, virtual laboratories, online conferences and open access to the data-

bases.

Keywords: the Internet researching infrastructure, virtual research environment, virtual

lab, internet conference, biochemistry.

Южанинова Е.Р., Бибарцева Е.В.

ВОЗМОЖНОСТИ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ИНФРАСТРУКТУРЫ ИН-

ТЕРНЕТА В НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКОЙ ДЕЯТЕЛЬНО-

СТИ БИОХИМИКА

Оренбургский государственный университет, кафедра философии, кафедра биохи-

мии и молекулярной биологии, г. Оренбург

Аннотация. Всемирная компьютеризация науки отразилась на работе ученого-био-

химика самым благоприятным образом: придала особые черты его деятельности,

сформировала непременное, вполне нормальное состояние научного исследования.

В статье анализируется потенциал использования биохимиком таких элементов

научной инфраструктуры интернета, как виртуальные исследовательские сети, вир-

туальные лаборатории, интернет-конференции и открытый доступ к базам данных.

Ключевые слова: научно-исследовательская инфраструктура интернета, виртуаль-

ная исследовательская среда, виртуальная лаборатория, интернет-конференция, био-

химия.

Мир за истекшее столетие видел не

одну научную, техническую и культур-

ную революцию. Развёртывание потен-

циала науки и техники имеет порази-

тельное и глубокое по своим послед-

ствиям значение, воздействуя на все сто-

роны жизни человека. Микроэлектрон-

ная революция увеличивает мощь чело-

веческого интеллекта, позволяя прони-

кать в такие тайны мироздания, о кото-

рых человечество не подозревало ещё

совсем недавно. Особое влияние на

сферу научного знания оказывает такое

явление цивилизационного уровня, как

интернет. В ХХI веке одним из базовых

условий продуктивности работы в сфере

Since 1999 ISSN 2226-7425


~ 365 ~




образования и науки является быстрый

поиск нужной информации и развитая

система научной коммуникации, по-

этому эффективность современного

научно-исследовательского поиска нахо-

дится в прямой зависимости от двух фак-

торов: уровня информационной куль-

туры и доступности информационных

ресурсов.

Диапазон получаемой из интернета

информации достаточно широк, однако

пользователи системы сталкиваются с

рядом проблем, связанных с тем, что эта

сеть является огромной и нечётко орга-

низованной. И как показывают опросы,

информированность российских учёных

о спектре возможностей интернета для

их профессиональной деятельности

весьма низкая. Хотя сегодняшних моло-

дых ученых можно назвать поколением

Facebook, но только один из семи науч-

ных сотрудников в своей исследователь-

ской работе активно использует возмож-

ности интернета. Для получения дей-

ственных результатов явно не доста-

точно одних только пользовательских

навыков, здесь нужны более глубокие

знания поисковых технологий. Ситуация

осложняется тем, что значительная часть

наиболее ценной информации является

платной и, в силу этого, недоступна для

пользователей. Немаловажной пробле-

мой для отечественных учёных является

языковой барьер, поскольку большие

возможности по использованию интер-

нет-технологий представлены именно на

англоязычных сайтах.

Изучению динамики современной

науки под влиянием информационно-

коммуникационных технологий посвя-

тили свои работы М. Нентвич, Д. Реутен,

А. Сзалай, Дж. Грей [1,2,3]. Несмотря на

многообразие подходов этих учёных к

изучению информатизации научного

процесса, общим в его анализе является

обоснование необходимости сотрудни-

чества ученых, совместное использова-

ние данных и информации, а также виде-

ние больших перспектив последнего

этапа развития науки, на котором она,

благодаря интернету и другим ИКТ, пе-

рерастает в «кибернауку».

По мере технологического вопло-

щения в реальность основных идей о

способах изучения и обработки научных

данных посредством новых технологий,

возникают философские вопросы: какие

виды исследований (проблемно-ориен-

тированные или информационно-ориен-

тированные) преобладают, каков статус

«знания» в каждой модели, каковы кри-

терии «истины» сетевого знания, каким

образом изменяются продукты научной

деятельности и прогнозируется процесс

развития каждой модели? С этими во-

просами сталкивается в той или иной

форме каждый ученый, так как любая

научная деятельность связана с научно-

исследовательской инфраструктурой ин-

тернет, то есть с теми условиями, кото-

рые обязательны для коллективного ис-

пользования распределенных вычисли-

тельных, технических ресурсов и ин-

струментов, включающих в себя сово-

купность индивидуальных, совместных,

национальных и глобальных технологи-

ческих инициатив.

Научно-исследовательская инфра-

структура интернета представлена сле-

дующими элементами: научные само-

презентации ученых, научные интернет-

блоги, самоархивирование и формы, за-

висимые от методов интернет-исследо-

вания (интернет-эксперименты, интер-

нет-обследования, интернет-опросы, се-

тевой анализ и т. д.). В данной статье мы

сосредоточимся на рассмотрении тех

возможностей интернет-науки, которые

доступны российским биохимикам.

Since 1999 ISSN 2226-7425


~ 366 ~




Общенациональные сети можно

рассматривать как важный способ разви-

тия научных институтов, для формиро-

вания которых необходимо найти ре-

сурсы для объединения в сеть отече-

ственных университетов друг с другом, а

затем и с зарубежными университетами.

Например, сканирование электронным

микроскопом – инструментом, использу-

ющим элементарные частицы (элек-

троны) для получения изображения, – яв-

ляется слишком дорогим инструментом

для каждого отдельного университета.

Но при подключении этих микроскопов

к высокоэффективной сети пользователи

получают возможность управлять мик-

роскопом на расстоянии и исследовать

образцы с помощью качественного циф-

рового изображения.

В интернете создаются исследова-

тельские сети, которые обеспечивают со-

трудничество ученых, открытый доступ

к исследовательским инструментам и

сервисам, базам данных, а также способ-

ствуют апробации и внедрению новых

технологических стандартов и сетевой

инфраструктуры на базе интернета. Со-

здатель международного NanoScience

сообщества Андраш Пастернак отме-

чает, что в Восточной Европе молодые

ученые чаще используют он-лайн ин-

струменты и сети. Особенно развиты

сети для тех, кто занимается нанотехно-

логиями, разработчики не обошли вни-

манием и биологов, химиков, медиков

[4,5]. Однако до сих пор не создана ана-

логичная русскоязычная социальная

научная сеть или портал, которые пред-

лагали бы большой спектр возможно-

стей.

Важное направление применения

сетевых технологий в науке — организа-

ция работы виртуальных исследователь-

ских лабораторий, которые позволяют

привлекать ученых из разных стран мира

для проведения исследований непосред-

ственно в своих лабораториях с последу-

ющим обменом информацией через ком-

пьютерную сеть.

Весьма ценным для работы биохи-

мика помимо вышеназванных ресурсов

является многоотраслевой портал

Wolfram Demonstrations Project [6]. Цель

проекта – наглядная демонстрация кон-

цепций современной науки и техники.

Wolfram претендует на роль единой

платформы, позволяющей создать объ-

единенный каталог онлайновых интерак-

тивных лабораторий. Проведение вирту-

альных опытов в этой среде способ-

ствует более глубокому пониманию де-

монстрируемых процессов и явлений.

Каталог Wolfram Demonstrations Project

насчитывает более 7 тыс. виртуальных

лабораторий.

Многие научно-исследовательские

проекты, использующие интернет-тех-

нологии, направлены на создание вирту-

альной исследовательской среды (ВИС).

Цель создания виртуальных исследова-

тельских сред заключается в организа-

ции системы поддержки исследователей

во всех отраслях науки, которая позво-

ляет управлять всем комплексом задач,

составляющих исследование.

Ещё одна возможность интенсифи-

цировать научную деятельность посред-

ством интернета – проведение интернет-

конференций, которые пользуются боль-

шой популярностью у отечественных

биохимиков. Это разновидность онлайн-

конференции, которая является дискус-

сионной интернет-площадкой, на кото-

рой в определенное время размещаются

выступления участников. Характерными

признаками сетевых конференций явля-

ются: дистантность, особая конвенцио-

нальность и наличие фиксированных

правил общения, тематические подраз-

деления. Для исследователей в области

Since 1999 ISSN 2226-7425


~ 367 ~




биологической химии в 2012 г. на базе

кафедры биохимии Казанского (При-

волжского) федерального университета

проводилась III Международная научная

онлайн конференция «Актуальные про-

блемы биохимии и бионанотехнологий».

Конференция продолжала серию очных

конференций «Постгеномная эра в био-

логии» и проводилась в виртуальном

формате, дистанционно, с использова-

нием технологии виртуальных миров

Pax Grid. Организаторы располагались в

Казани, а участники через интернет под-

ключались к виртуальной площадке кон-

ференции. В её рамках были проведены

пленарные доклады, стендовые сессии,

круглый стол на тему «Микроскопиче-

ские грибы в современной биотехноло-

гии», дистанционный семинар по обра-

ботке экспериментальных данных. По

итогам конференции был издан сборник

трудов, а лучшие работы были рекомен-

дованы к публикации в «Ученых запис-

ках Казанского Университета».

Большим потенциалом обладает

ещё один элемент инфраструктуры ин-

тернета - «открытый доступ к исследова-

ниям». Национальные и глобальные ини-

циативы касаются построения открытых

хранилищ цифровых данных и информа-

ции для науки, организации «открытого

доступа» к результатам научных иссле-

дований в интернете (E-infrastructure,

Cyberinfrastructure, e-framework). В рам-

ках этой идеи в Оренбургском государ-

ственном университете открыт тестовый

доступ к журналу визуализированных

экспериментов — JoVE (Journal of

Visualized Experiments) [7]. JoVE индек-

сируется в крупнейших поисковых си-

стемах (в том числе Pubmed и Medline), в

редакторскую коллегию журнала входит

более 450 специалистов из лучших уни-

верситетов и научно-исследовательских

коллективов мира.

Рассматривая возможности ис-

пользования интернета в научно-иссле-

довательских практиках биохимика, хо-

телось бы напомнить, что это такое

направление в науке, где необходимы

знания микроорганизмов, ботаники и

физиологии растений, медицинской и

физиологической химии. Результаты их

работы важны в сфере технической и

промышленной биологии, витаминоло-

гии, гистохимии и генетике. Учитывая

специфику такой многогранной науки,

научно-исследовательская инфраструк-

тура интернет «встраивается» в обеспе-

чение современного производства зна-

ний как среда исследования (ВИС, вир-

туальные лаборатории, организации) и

как движущая сила исследований. Одной

из задач научной деятельности биохи-

мика – это создание технологий, способ-

ных успешно развиваться в будущем.

Всемирная компьютеризация

науки отразилась на работе ученого-био-

химика самым благоприятным образом:

придала особые черты деятельности,

сформировала непременное, настоящее,

вполне нормальное состояние научного

исследования. Для любого ученого, в

том числе и занимающегося поиском в

области химии, биохимии, важен обмен

информацией с коллегами, а интернет-

технологии ликвидируют препятствия,

обеспечивают доступ к различным дан-

ным. Цифровые технологии эффективно

распространяют результаты исследова-

ний, монографии, патенты, научные ста-

тьи и обзоры, тезисы докладов в матери-

алах конференций, съездов, симпозиу-

мов (в т.ч. зарубежных), стендовые до-

клады совещаний и конференций раз-

личного уровня, защиты диссертаций и

другие источники научной информации.

Внедрение интернета с его огром-

ными возможностями в работу биохи-

мика просто необходимо, ведь химия

Since 1999 ISSN 2226-7425


~ 368 ~




преобразует большие объемы данных, к

которым должен быть доступ, для этого

обязательно использование современ-

ных информационных инструментов, ко-

торые позволяют осуществлять хране-

ние, поиск, визуализацию и высокий

уровень анализа сведений.

Помимо вышеназванных ресурсов

сети учёный-биохимик может использо-

вать следующие возможности интер-

нета: посредством виртуальных мастер-

ских, виртуальных тренажеров воз-

можно освоение новых методик исследо-

вания, анализа, идентификации соедине-

ний, освоение принципов работы на но-

вых приборах. Интернет даёт возмож-

ность эффективно решать проблему ди-

станционного повышения квалификации

ученого. Также возможно быстрое, свое-

временное оповещение о выездных тео-

ретических и практических семинарах,

авторских научных курсах в научных

центрах. Всё выше перечисленное значи-

тельно повышает качество научной дея-

тельности.

Таким образом, возникновение,

становление и развитие научно-исследо-

вательской инфраструктуры интернета

заставляет мировое научное сообщество

пересмотреть сущность инфраструктуры

и модель производства научного знания.

Научная деятельность биохимика, вы-

строенная на основе использования но-

вых информационных технологий, от-

крывает широкую перспективу для реа-

лизации научных идей, что в свою оче-

редь требует качественных знаний по ис-

пользованию информационно-коммуни-

кационных технологий.

ЛИТЕРАТУРА

1. Nentwich M. Cyberscience: research in

the age of the Internet. Vienna: Austrian

Academy of Sciences Press, 2003.

2. Rhoten D. The Dawn of Networked

Science.// The Chronicle of Higher Educa-

tion. 07/09/2007 / http://chroni-

cle.com/weekly/v54/i02/02b01201.htm.

3. Szalay A., Gray J. 2020 Compu-

ting: Science in an exponential world // Na-

ture. 23 March 2006.

4. http://www.researchgate.net.

5. http://www.mendeley.com.

6. http://demonstrations.wolfram.com/.

7. Journal of Visualized Experiments

(http://www.jove.com).

http://chronicle.com/weekly/v54/i02/02b01201.htm

http://chronicle.com/weekly/v54/i02/02b01201.htm

http://www.researchgate.net/

http://www.mendeley.com/

http://demonstrations.wolfram.com/

http://www.jove.com/

Documents

THE POSSIBILITIES OF INTERNET INFRASTRUCTURE’S USING … · туальные лаборатории, интернет-конференции и открытый доступ к