11
BIP The MUSC Clinical Data Warehouse (CDW) use for Research Jihad Obeid, MD Jean Craig, PhD

The$MUSC$Clinical$Data$Warehouse$ (CDW · PDF fileBIP$ The$MUSC$Clinical$Data$Warehouse$ (CDW)$use$for$Research$ Jihad&Obeid,&MD& Jean&Craig,&PhD&

  • Upload
    vuphuc

  • View
    225

  • Download
    5

Embed Size (px)

Citation preview

BIP  

The  MUSC  Clinical  Data  Warehouse  (CDW)  use  for  Research  

Jihad  Obeid,  MD  Jean  Craig,  PhD  

BIP  

Outline  

•  Defini6on  of  terms:  – EDW  – CDW  (MUSC/HSSC)  – Biobank  – Biobank  data  mart  

•  Focus  on  CDW  for  Research  – About  the  project  – Demo  

BIP  

Enterprise  Data  Warehouse  (EDW)  hLp://musc.edu/projects/edw    

BIP  

Enterprise  Data  Warehouse  (EDW)  

BIP  

Clinical  Data  Warehouse  (CDW)  

•  MUSC  EDW  – Used  for  quality  measures  and  improvement  – CDW  is  the  subset  of  EDW  used  for  research  (CDW-­‐R)  

•  Health  Sciences  South  Carolina  (HSSC)  CDW  –  Includes  MUSC  EMR  data  only  – Two  op6ons:  MUSC  data  alone  or  HSSC  hospitals  (aggregated)  

BIP  

MUSC  self-­‐service  (MicroStrategy)  

BIP  

HSSC  self-­‐service  (i2b2)  –  coming  soon  i2b2  (Informa6cs  for  Integra6ng  Biology  and  the  Bedside)  www.i2b2.org    

BIP  

CDW  (local+state)  vs.  Biobank       EDW   HSSC  CDW   Bio  Bank/  Data  Mart  

Source  of  data        

MUSC   MUSC    EMR  +  HSSC  partners  

MUSC  (+  HSSC  partners?)  

What  type  of  data  is  available?      

Clinical  +  other   Clinical   Clinical  +  Biospecimen  

Coming  soon   HR/Payroll,  Surgical,  and  Pa6ent  Charges/  Reimbursement  

Rollout  for  MUSC  then  other  HSSC  partners  

(S6ll  in  planning)  

Is  there  idenDfiable  data?  *  

Yes  (but  not  for  self-­‐service)  

Yes  (but  not  for  self-­‐service)  

No  

Database  plaForm       Sybase  IQ/Emergis   Oracle/Recombinant   Oracle  /caTissue  

Self-­‐service  data  (DUA  required)    

Aggregate  numbers  (no  iden6fiers)  

Aggregate  numbers  (no  iden6fiers)  

De-­‐iden6fied  records  +  biospecimens    

Self-­‐service  interface   Microstrategy  (BI)   i2b2   i2b2  

Status     In  produc6on   Under  development   In  planning  

*IRB  approval  required  for  brokered  access  to  data  –  see  schema6c  

BIP  

The  CDW-­‐R  Overview  

CDW  

MicroStrategy  Repor6ng  tool  (Restricted  

View)  

IRB  approval  

Aim  1:  Access  to  aggregate  data  (no  iden6fiable  informa6on)  

Self-­‐service  

Aim  2:  Access  for  IRB  approved  protocols  -­‐  

Brokered  access  

Researchers  

Results  

Honest  Broker  

Data  Request  Cmte  

DUA  

aggregate  data  (no  iden6fiable  informa6on)  

BIP  

More  Informa6on  hLps://sctr.musc.edu/index.php/cdw    

BIP  

Collabora6ve  Effort  •  Office  of  the  Associate  Provost  for  

Research  –  LoreLa  Lynch-­‐Reichert  –  Stephen  M.  Lanier,  PhD    

•  SCTR  (CTSA  grant  #  UL1  RR029882)  –  Jean  Craig,  PhD  –  Jihad  Obeid,  MD  –  Amanda  Zimmerman  

•  Enterprise  Analy6cs  Team  &  Hospital  Administra6on  –  Nestor  Esnaola,  MD  –  Pat  Wagstaff  –  Amy  Wilson,  PhD  –  Stuart  Smith  –  Patrick  Cawley,  MD  –  Casey  Liddy  

•  OCIO  Informa6on  Services  –  Jeff  Burdick  –  Crystal  Smith  –  Larry  Gale  –  Christopher  Hafer  –  Mitchelle  Morrison  –  Mike  Coffman  –  John  Imholz  –  Dan  Furlong  –  Frank  Clark,  Ph.D.  

•  Data  Request  CommiLee  –  Mike  Wheeler  –  Patrick  Mauldin,  PhD  –  Jihad  Obeid,  MD