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Zotero perfectionnement
URFIST de Strasbourg
Université de Strasbourg
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg2
1 Rappels sur l’alimentation de la base Zotero
1.1 Utilisation d’identifiants bibliographiques
1.2 Utilisation de PDF
1.3 Importation de fichiers
1.4 Flux RSS
2 Gestion de la base
2.1 Mots clés
2.1 Recherche avancée et collections dynamiques
3 Utilitaires pour Zotero
2.2 Zutilo
2.3 Zotfile
4 Sauvegarde de la base Zotero
4.1 Export de fichiers
4.2 Le dossier Zotero
4.3 Synchronisation et compte en ligne
Sommaire
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Ajouter des références dans Zotero
•Sites ou bases
•Utilisation d’identifiants bibliographiques
•À partir de PDF
•Importation de fichiers
•Flux RSS
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
En saisissant directement l’identifiant d’un document• ISBN pour un livre• DOI pour un article
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Alimentation de la base Zotero
Utilisation d’identifiants bibliographiques
En créant la référence à partir du fichier PDF
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Alimentation de la base Zotero
• dépend de la qualité des métadonnées du PDF• Fonctionne en général avec les articles de revues et les documents provenant de
bases de données• Méthode :
• faire glisser le fichier PDF dans la bibliothèque Zotero (partie centrale)• le sélectionner et choisir dans le menu contextuel (clic droit) : « Récupérer
les métadonnées du PDF » pour créer la référence bibliographique. Le fichier PDF est joint automatiquement à la réféférence ainsi créée.
Nouveauté 2019
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Alimentation de la base Zotero
Zotero a signé un partenariat avec RetractionWatch et réalisé une intégration technique entre l'outil de gestion bibliographique d'un côté, et la base de données des rétractations scientifiques de l'autre.Concrétement, quand vous ouvrez votre Zotero, il se connecte à RetractionWatch et, si une référence dans vos bibliographies a été rétractée, il vous en avertit.Pour l’instant, limité aux documents avec un DOI ou un PMID
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg8
Alimentation de la base Zotero
En important un fichier de données bibliographiques
Fichier produit par autre application (EndNote, Mendeley etc.)• Format RIS• Mais aussi format BibTeX• Menu Fichier/ importer• Une collection portant le même nom que le fichier
d’import est créée dans Zotero
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Importer dans Zotero
Choisir le fichier à importer : ici, un fichier au format RIS
Une collection portant le nom du fichier est créée dans la base Zotero. Elle contient les données bibliographiques, et les fichiers joints si l’option a été choisie au moment de l’export.
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Alimentation de la base Zotero
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg10
Alimentation de la base Zotero
À partir d’un flux RSS
Nouveauté de Zotero 5Permet de suivre l’actualité d’une revue ou d’un site
• derniers billets parus sur un blog• derniers articles d’une revue• Nouvelles réponses à une requête enregistrée dans
une base de données• s’abonner à un flux RSS en copiant l’url du flux dans
Zotero.
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg11
Alimentation de la base Zotero
À partir d’un flux RSSs’abonner à un flux RSS en copiant l’url du flux dans Zotero.
Exemple d’une recherche dans le moteur BASE
Copier l’url obtenue en cliquant sur ce bouton …
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg12
Alimentation de la base Zotero
À partir d’un flux RSSs’abonner à un flux RSS en copiant l’url du flux dans Zotero.
Exemple d’une recherche dans le moteur BASE
Dans la boite de dialogue
Paramètres du flux…
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Alimentation de la base Zotero
À partir d’un flux RSS
Le flux est créé dans Zotero
Liste des résultatsLes éléments non-lus apparaissent en
grasIl s’agit d’une liste de lecture : les
éléments ne sont pas encore intégrés dans la base Zotero
Détail d’un élément de la liste
Ajout de l’élément à une collection
de la base Zotero
˃ Supprimer un document de la collection A ne le supprime pas de la collection B.
Supprimer un document d’une collection ne le supprime pas de la bibliothèque
Supprimer un document d’une collection A ne le supprime pas de la collection B
On peut choisir de supprimer
Une collection mais pas les documents qu’elle contient
une collection avec les documents qu’elle contient
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La bibliothèque est le répertoire racine : elle contient tous les documents importés dans la base Zotero
Une collection est une vue particulière de certains documents de la bibliothèque
Un document peut apparaître dans plusieurs collections, mais il existe en un seul exemplaire dans la bibliothèque
Organisation de la base :
Rappel: Utilisation des collections
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La bibliothèque est le répertoire racine : elle contient tous les documents importés dans la base Zotero
Une collection est une vue particulière de certains documents de la bibliothèque
Un document peut apparaître dans plusieurs collections, mais il existe en un seul exemplaire dans la bibliothèque
Organisation de la base :
Rappel: Utilisation des collections
˃ Supprimer un document de la collection A ne le supprime pas de la collection B.
Supprimer le document de la bibliothèque le supprime dans toutes les collections où il était auparavant
˃ Supprimer un document de la collection A ne le supprime pas de la collection B.
En savoir plus sur l’utilisation des mots-clés et des collections :
FLAMERIE, Frédérique, « Comment organiser sa bibliothèque ? », Zotero francophone, 2015, [En ligne : http://zotero.hypotheses.org/756
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg17
Le volet des marqueurs
Organisation de la base
Utilisation de la couleur pour les mots clés
Déplier/replier le volet des marqueurs
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg18
Utilisation de la couleur pour les mots clésOrganisation de la base
Clic-droit sur le mot-clé
• Possibilité d’attribuer jusqu’à 6 couleurs à des mots-clés
• Des chiffres sont associés à ces couleurs pour les attribuer à la volée dans une liste en utilisant le pavé numérique du clavier
• Permet de faire ressortir certains documents (ex : à lire / lu) dans une liste
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg19
Organisation de la base
Exemple d’utilisation de la couleur pour les mots clés
Les documents lus apparaissent avec un marqueur rouge dans la colonne centrale
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg20
Organisation de la base
Recherche simple
˃ Supprimer un document de la collection A ne le supprime pas de la collection B.
Tous les champs de la notice + mots-clés˃ Supprimer un document de la collection A ne le supprime pas de la collection B.
Tous les champs de la notice + mots-clés+ les mots des PDF si ceux-ci sont indexés
˃ Supprimer un document de la collection A ne le supprime pas de la collection B.
Tiré de Aide en ligne Zotero : https://www.zotero.org/support/fr/finding_and_sorting21
Organisation de la base
Recherche avancée
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg22
Organisation de la base
Collections dynamiques˃ Supprimer un document de la collection A ne le supprime pas de la collection B.
Enregistrer une recherche à partir de la recherche avancée
crée une nouvelle collection
. ˃ Supprimer un document de la collection A ne le supprime pas de la collection B.
dans l’arborescence de gauche. Cette collection comprend toutes les références qui correspondent au résultat de la recherche. Cette collection s’actualise à chaque fois qu’une référence ajoutée correspond aux critères de recherche utilisés.
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Utilitaires pour Zotero
•Installer une extension
•Exemples
Zutilo
Zotfile
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Utilitaires pour Zotero
Installer les Utilitaires pour Zotero
Avec la nouvelle version de Zotero, l’installation directe depuis le navigateur n’est plus
possible. Il faut l'installer manuellement :
1. Pour Zutilo: aller sur la page https://github.com/willsALMANJ/Zutilo/releases
Pour Zotfile : http://zotfile.com/
2. Choisir la version la plus récente du fichier .xpi
3. clic droit et « Enregistrer sous… » pour télécharger le fichier
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Installer des extensions pour Zotero2. Dans Zotero, menu Outils / Extensions
Dans la fenêtre qui s’ouvre , dans l'angle supérieur droit, Cliquez sur le bouton
Choisir « install add-on from file » et choisissez le fichier.xpi que vous venez de télécharger
Redémarrer Zotero pour terminer l’installation
Utilitaires pour Zotero
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Utilitaires pour Zotero
ZutiloExtension de Zotero qui ajoute les fonctions suivantes :
Copier / coller les marqueurs (Mots-clés):
on peut copier les marqueurs( mots-clés) des références sélectionnées vers le bloc-notes et
les coller dans le bloc-notes ; on peut aussi les coller dans une autre référence de la
collection (clic droit -> paste tags from clipboard)
Copier les créateurs (auteurs):
on peut copier les auteurs( mots-clés) des références sélectionnées vers le bloc-notes et les
coller dans le bloc
Afficher / modifier le chemin des pièces jointes :
par un clic droit sur une référence, on voit le chemin actuel par défaut du fichier attaché à la
référence (répertoire storage de Zotero)
Associer les éléments :
sélectionner les références à connecter entre elles, clic droit -> relate selected items ; la
référence connectée se retrouve en cliquant dans l’onglet « connexe »
Plus d’informations :
https://github.com/willsALMANJ/Zutilo/blob/master/docs/COMMANDS.md
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Utilitaires pour Zotero
ZutiloElément supplémentaire dans le clic-droit après installation de Zutilo
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Utilitaires pour Zotero
ZotfileFonctions:
• attacher à une référence les fichiers récemment téléchargés dans un dossier
Téléchargement ou dans tout autre dossier spécifié
• renommer et de gérer les attachements Zotero
• Spécifier les règles de nommage des fichiers
• synchroniser les PDF entre l’ordinateur et la tablette (ipad ou android) et de les
rapatrier sur zotero
• extraire les annotations des PDF pour les transformer en notes rattachées à une
référence
• Extrait les sommaires des PDF (seulement si PDF structuré avec signets)
Plus d’informations : https://zotero.hypotheses.org/2838
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
ZotfileElément supplémentaire dans le menu contextuel (clic-droit) après installation de Zotfile
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Utilitaires pour Zotero
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
ZotfileExemple de copie de texte surligné d’un PDF dans la partie « Notes » de l’enregistrement dans Zotero
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Utilitaires pour Zotero
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
SauvegarderSynchroniser
•exports
•Support externe
•Synchronisation
Serveur Zotero
Serveur WebDAV
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Sauvegarde de la base
Différence entre sauvegarde et synchronisation• La sauvegarde
• a pour but copier des données sur un support (disque dur externe, clé USB, etc.) ou sur un emplacement (serveur) autre que celui d’origine dans le but de pouvoir les restaurer.
• Le flux de sauvegarde ne va que dans un sens.
• Source Destination
• La synchronisation
• consiste à rendre identiques les contenus de la source et de la destination pour les rendre disponibles sur plusieurs emplacements.
• la synchronisation fonctionne dans les deux sens. Source Destination
• Une fois la première synchronisation effectuée, tout changement (suppression ou modification) effectué sur un fichier d'un côté sera systématiquement répercuté de l'autre.
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Sauvegarde de la base
Plusieurs options
• Exporter la base Zotero dans un fichier. • export partiel possible (une ou plusieurs collections)• avec ou sans les pièces jointes
• Enregistrer le dossier Zotero sur un support de sauvegarde• Pas de sauvegarde partielle : toute la base est enregistrée• avec les paramétrages personnalisés (styles téléchargés, style de citation par
défaut etc.)
• Synchroniser sa base sur un compte en ligne créé sur le site Zotero• Permet de récupérer sa base bibliographique à partir de n’importe quel poste
relié à internet • Pas de synchronisation partielle : toute la base est synchronisée• avec ou sans les pièces jointes• les paramétrages personnalisés ne sont pas synchronisés
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Exporter la base Zotero
On peut exporter une collection ou toute la bibliothèque Zotero
Formats d’export disponibles permettent les échanges de données entre logiciels notamment : • RIS : format reconnu par tous les
logiciels de gestion bibliographique
• BibTeX et BibLaTeX: permettent d’utiliser les données pour les citations dans LaTeX
• Zotero RDF : échange de données avec une autre base Zotero Par défaut, on n’exporte que les
références bibliographiques. Cocher cette case pour exporter aussi les fichiers attachés
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Sauvegarde de la base
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Sauvegarde de la base
Enregistrer le dossier Zotero : accéder au dossier 1
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Le chemin du dossier Zotero•Pour Windows : C:\Users\<Nom-d’utilisateur>\Zotero •Pour Mac : Users\<Nom-d’utilisateur>\Zotero
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Le dossier ZoteroLe dossier Zotero contient tous les éléments de votre base Zotero : données bibliographiques et fichiers attachés, mais aussi les éléments de personnalisation : styles téléchargés, préférences d’affichage, styles de citation par défaut etc .
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Sauvegarde de la base
Fichiers attachés : PDF,copies écran etc.
Fichiers de styles CSL
Données bibliographiques
Dossier à sauvegarder
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg40
Synchronisation – créer le compte en ligne
Synchronisation – Compte en ligne
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg41
Sauvegarde de la bibliothèque Zotero et des pièces jointes sur un compte en ligne (gratuit)
300 Mo maximum pour le compte gratuit. Au delà, seules les références bibliographiques sont enregistrées.
Synchronisation automatique (par défaut) ou sur demande
Synchronisation
Synchronisation – Compte en ligne
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg42
Synchronisation avec un compte Zotero – paramétrage
Identifiant et mot de passe définis lors de la création du compte en ligne. Evite d’avoir à les saisir à chaque demande de synchronisation
Quand cette option est décochée, la synchronisation ne sa fait que sur demande, en cliquant sur
Synchronisation – Compte en ligne
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg43
Une fois le compte en ligne créé et les identifiants saisis dans Zotero, divers paramétrages sont disponibles :
• choisirla bibliothèque que l’on souhaite synchroniser (si on est abonné à plusieurs bibliothèques).
On peut pas faire de sélection dans les collections : toutes les collections de la
bibliothèque sont synchronisées
• possibilité de télécharger les fichiers attachés sur demande seulement : menu préférences : Synchronisation/“à la demande”
Économise de la place et/ou du temps quand on ne travaille pas sur son poste et qu’on a beaucoup de fichiers attachés.Les fichiers attachés sont téléchargés uniquement quand on clique pour les ouvrir
Synchronisation avec un compte Zotero – paramétrage
Synchronisation – Compte en ligne
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg44
Synchronisation avec un compte Zotero – paramétrage
Synchronisation – Compte en ligne
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg45
Le cercle bleu plein indique que la pièce jointe est déjà disponible sur le poste
Sinon, le cercle n’est pas rempli : la pièce jointe sera téléchargée quand on demandera son ouverture
Synchronisation à la demande
Synchronisation – Compte en ligne
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg46
WebDAV est une extension du protocole HTTP (le protocole du web), qui détermine le transfert et le management des fichiers.
Certains services de stockage en ligne utilisant ce protocole et vous proposent un stockage supérieur à 300 MoListe indicative sur le site Zotero : https://www.zotero.org/support/kb/webdav_services
Webdav ne peut être utilisé pour l'instant avec les bibliothèques de groupe.
En savoir plus sur la synchronisation : https://paris-sorbonne.libguides.com/zotero_sync/sync
Synchronisation avec un compte WebDav
Synchronisation – Compte en ligne
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg47
• Si vous avez les informations sur votre propre compte WebDAV, renseignez l’URL fournie par le service, votre nom d’utilisateur et votre mot de passe dans l’onglet des Préférences de Synchronisation. Validez votre saisie par OK
• Assurez-vous que vous avez bien précisé si vous utilisez ou non WebDAV sécurisé (https) ou non (http). Si vous l’ignorez, vous pouvez essayer les deux, mais le fournisseur doit pouvoir vous donner cette information.
• Ouvrez à nouveau le panneau de synchronisation dans les préférences : votre nom d’utilisateur et votre mot de passe crypté doivent apparaître.
• Cliquez sur “Vérifier le Serveur”. Zotero vérifie le compte avant que la synchronisation soit utilisée. Une fois la vérification terminée, vous êtes prêt à synchroniser les fichiers.
Synchronisation avec un compte Webdav– paramétrage
Synchronisation – Compte en ligne
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg50
Travail en groupe dans ZoteroBibliographie partagée
Le compte en ligne permet aussi de créer une bibliothèque partagée avec d’autres personnes (bibliothèque de groupe). Plusieurs personnes peuvent ainsi s’échanger des références dans le cadre d’une bibliographie collaborative.
Distinguer : • Le statut de la bibliothèque en ligne : personnelle /publique (visible par tous)
La bibliothèque peut être celle d’un individu ou d’un groupe
• Le statut du groupe : participation privée (accès réservé) ou publique (ouverte à ceux qui le souhaitent, en fonction des autorisations données par le créateur du groupe)
• Le statut des membres du groupe : propriétaire (créateur), administrateur (droit d’ajouter/modifier des données), membre (consultation seulement)
• Les paramètres et statuts sont gérés par le propriétaire du groupe
La bibliothèque partagée est stockée sur l’espace personnel (300 Mo par défaut) du propriétaire du groupe
Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Groupes dans ZoteroBibliographie partagée
Groupe Privé Public
Participation Participation restreinte Participation ouverte
Page du groupe visible uniquement par les membres et les invités par tout le monde
Cherchable par moteur de Zotero Non Oui
Devenir membre Sur invitation de l’administrateur du groupe 1. Sur invitation de l’administrateur
2. Demande d’invitation à
l’administrateur
Immédiat, cliquer sur
Lecture de la bibliothèque du groupe (références visibles) Uniquement par les membres Selon paramétrage de l’administrateur :
1. Visible par tous sur le web (références uniquement - pas de
partage de fichiers)
2. Visible uniquement par les membres du groupe
3. Visible uniquement par les administrateurs
Edition de la bibliothèque du groupe
(ajouter/supprimer/modifier des références)
Selon paramétrage de l’administrateur :
1. Tous les membres du groupe
2. uniquement les administrateurs
Editer les fichiers joints Uniquement si groupe privé, selon paramétrage
de l’administrateur :
1. Tous les membres
2. Uniquement les administrateurs
Les fichiers joints ne sont pas autorisés dans les bibliothèques visibles sur
le web
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Informations complémentaires
BIBLIOGUIDES Zotero notamment :
• ZEGHOUD Noreddine, « BiblioGuides: Zotero : gérer sa
bibliographie et ses pdf: Gérer ses PDF et ses pièces
jointes », 22 novembre 2017, consulté le 27
novembre 2017, URL : http://paris-
sorbonne.libguides.com/zotero-gerer-sa-biblio-et-
ses-pdf/gerer-ses-pdf-et-ses-pj .
• ZEGHOUD Noreddine, « BiblioGuides: Zotero :
bibliographie en ligne et bibliographie nomade:
Introduction », Portail documentaire Sorbonne
Universités - Biblioguides, 10 novembre 2017,
consulté le 27 novembre 2017, URL : http://paris-
sorbonne.libguides.com/zotero_sync
• Un exemple de bibliographie collaborative :
HEIMBURGER Franziska. « Bibliographie collaborative
de la Grande Guerre avec Zotero » in La Boite à
outils des historiens [En ligne], 23 janvier 2013.
Disponible sur : http://www.boiteaoutils.info/2013/01/bibliographie-
collaborative-de-la.html (Consulté le 21 février 2013)
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Zotero perfectionnement URFIST de Strasbourg
Merci de votre attention
http://urfist.unistra.fr
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