Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
Załącznik nr 6
SYLABUSY DO PRZEDMIOTÓW FAKULTATYWNYCH
1. Błonowe białka transportujące w komórkach roślinnych
2. Membrane transport proteins in plant cells
3. WNB, IBE, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów II
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr letni
10. wykład 15 godz., seminarium 15 godz.
11. dr hab. Małgorzata Janicka, dr hab. Katarzyna Kabała
12. Wymagania wstępne: podstawowa wiedza z fizjologii roślin i biologii molekularnej
roślin
13. Cele przedmiotu: poznanie budowy, mechanizmu działania oraz roli białek
funkcjonujących jako transportery w błonach komórek roślinnych
14.
Zakładane efekty kształcenia:
Student zna przebieg procesu sortowania białek do
poszczególnych kompartymentów komórek roślinnych i
otaczających je błon (mitochondria, chloroplasty, ER,
peroksysomy, tonoplast, plazmolema). Umie zdefiniować typy
białek błonowych. Rozumie, w jaki sposób funkcjonują w
błonach bierne i aktywne transportery. Zna ich strukturę,
mechanizmy regulacji i funkcje, jakie pełnią w komórkach
roślinnych. Rozróżnia szlaki importu białek do różnych
kompartymentów komórkowych. Na podstawie
charakterystycznych elementów strukturalnych i domen
regulatorowych identyfikuje poszczególne klasy białek
transportowych.
Student swobodnie wykorzystuje światową literaturę naukową
dotycząca białek błonowych, na jej podstawie przygotowuje
prezentację na zadany temat.
Student jest świadomy różnorodności białek występujących w
błonach komórek roślinnych i ich istotnego znaczenia dla
prawidłowego funkcjonowania organizmów roślinnych. Umie
przeanalizować zdobytą wiedzę i wykorzystać ją w zrozumieniu
metabolizmu komórkowego.
K_W02
K_U02
K_U08
K_K01
15.
Treści programowe: Sortowanie i transport białek do poszczególnych błon i
kompartymentów komórki roślinnej (mitochondria, chloroplasty, peroksysomy,
ER, tonoplast, plazmolema). ATPazy typu P – ich różnorodność w świecie roślin.
Mitochondrialne i chloroplastowe ATPazy typu F. Wakuolarne pompy protonowe
komórek roślinnych – V-ATPazy i V-PPazy. Pierwotne i wtórne transportery metali
ciężkich. Białka uczestniczące w transporcie składników mineralnych. Białka
kanałowe. Akwaporyny i ich znaczenie dla roślin.
16.
Zalecana literatura:
Wojtaszek P., Woźny A., Ratajczak L. Biologia komórki roślinnej. 2006. Rozdział
4. Sortowanie i transport białek, 135-201, PWN; Buchanan B., Gruissem W.,
Jones R.L. Biochemistry and molecular biology of plants. 2000. Rozdział 3.
Membrane transport, 110-157, Rozdział 4. Protein sorting and vesicle traffic,
160-201; Janicka-Russak M. 2011. Plant plasma membrane H+-ATPase in
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
adaptation of plants to abiotic stresses, w: Abiotic stress response in plants -
physiological, biochemical and genetic perspectives, Shanker A.K. i
Venkateswarlu B. (Eds), InTech, 197-218; Kabała K. 2011. Struktura i regulacja
roślinnych wakuolarnych H+-ATPaz. Postępy Biologii Komórki 38: 517-532;
Kabała K., Kłobus G. 2005. Plant Ca2+-ATPases. Acta Physiologiae Plantarum 27:
559-574; Wdowikowska A., Kłobus G. 2011. Roślinne ATPazy typu P. Postępy
Biochemii, 57: 85-91; Migocka M., Nowojska E., Kłobus G. 2007. Wtórne
transportery metali ciężkich u roślin. Postępy Biochemii 53: 272-279; Migocka M.
2006. Rola pierwotnych pomp metalowych (P1B-ATPaz) w utrzymywaniu
homeostazy metali ciężkich w komórkach roślinnych. Postępy Biologii Komórki
33: 657-666; Papierniak A., Migocka M. 2009. Charakterystyka roślinnych
antyporterów kationowo/protonowych typu CAX. Postępy Biologii Komórki 36:
601-616
17.
Forma zaliczenia
wykład: zaliczenie w formie testu (K_W02, K_U02)
seminarium: prezentacja (K_U02, K_U08), aktywność na zajęciach (K_K01)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład:
- seminarium:
15
15
Praca własna studenta:
- czytanie wskazanej literatury:
- przygotowanie do testu:
- przygotowanie prezentacji:
10
10
10
Suma godzin 60
Liczba punktów ECTS 2
1. Choroby cywilizacyjne
2. Diseases of affluence
3. WNB, Katedra Fizjologii i Neurobiologii Molekularnej
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów: II
8. Rok studiów: I lub II
9. Semestr: zimowy
10. Wykład: 15 godz., konwersatorium 15 godz.
11. dr Piotr Mamczur
12. Wymagania wstępne: podstawowa wiedza z fizjologii zwierząt oraz biologii
komórki
13.
Cele przedmiotu: Zapoznanie studenta ze zmianami fizjologicznymi
towarzyszącymi chorobom cywilizacyjnym i neurodegeneracyjnym; zapoznanie
studenta z molekularnym podłożem wybranych jednostek chorobowych człowieka,
takich jak: cukrzyca, otyłość, alkoholizm, astma, alergie, choroba wieńcowa,
nowotwór, depresja i inne zaburzenia psychiczne; zaznajomienie studenta z
podstawowymi problemami w leczeniu chorób układów sercowo-naczyniowego i
oddechowego; określenie znaczenia profilaktyki w leczeniu; nakreślenie
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
współczesnych trendów w leczeniu wybranych chorób; nabycie przez studentów
umiejętności wyszukiwania i prezentowania informacji.
14.
Zakładane efekty kształcenia:
Student potrafi wymienić jednostki chorobowe występujące w
krajach wysoko rozwiniętych i związane ze zmianami
cywilizacyjnymi; potrafi określić podłoże molekularne
wybranych chorób cywilizacyjnych i opisać towarzyszące im
zmiany fizjologiczne. Student potrafi nakreśli trendy w
leczeniu wybranych jednostek chorobowych człowieka; potrafi
określić znaczenie profilaktyki; rozumie wyzwania stojące
przed współczesną medycyną i biologią molekularną.
Potrafi przygotować (sam oraz w zespole) i zaprezentować
omawiany temat z zakresu zagadnień ujętych w programie
przedmiotu; potrafi samodzielnie zdobywać wiedzę z literatury
specjalistycznej w języku polskim i angielskim. Potrafi
aktywnie uczestniczyć w dyskusjach naukowych.
K_W02
K_W03
K_U02
K_U08
K_K01
15.
Treści programowe:
Molekularne podłoże chorób cywilizacyjnych: otyłość, cukrzyca, nowotwory,
alkoholizm, podagra, cellulit, nadcisnienie tętnicze i choroba wieńcowa; choroby
neurodegeneracyjne i psychiczne; choroby tarczycy; astma, alergie i procesy
zapalne. Podstawy molekularne wybranych jednostek chorobowych układów
sercowo-naczyniowego oraz oddechowego. Choroby metaboliczne. Komórki
macierzyste. Starzenie organizmu. Znaczenie profilaktyki w leczeniu. Terapie
genetyczne, hormonoterapie.
16.
Zalecana literatura:
„Fizjologia człowieka – podręcznik dla studentów medycyny” Stanisław J.
Konturek (red.), Elsevier Urban & Partner (2007 lub 2013), (wybrane rozdziały);
„Wprowadzenie do fizjologii Klinicznej” Stanisław Kozłowski i Krystyna Nazar
(red.), Wydawnictwo Lekarskie PZWL (1999), (wybrane rozdziały); „Fizjologia
krwi – wybrane zagadnienia” Zbigniew Dąbrowski (red.), Wydawnictwo naukowe
PWN (1998), (wybrane rozdziały); Stres metaboliczny w chorobach
neurodegeneracyjnych i psychicznych, Zbigniew Srebro, Henryk Lach,
Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego (wybrane rozdziały)
17.
Forma zaliczenia:
Wykład: zaliczenie w formie testu (K_W02, K_W03)
konwersatorium: ocena prezentacji (K_U02, K_U 08; K_K01); ciągłe ocenianie
aktywności na zajęciach (K_W02, K_W03)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład:
- konwersatorium:
15
15
Praca własna studenta:
- przygotowanie do zajęć:
- czytanie wskazanej literatury:
- przygotowanie do zaliczenia:
10
5
15
Suma godzin 60
Liczba punktów ECTS 2
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
1. Dylematy i granice biologii molekularnej
2. Dilemmas of molecular biology
3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów II
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr zimowy
10. Konwersatorium 30 godz.
11. dr Donata Wawrzycka
12. Wymagania wstępne: zaawansowana wiedza z genetyki i biologii molekularnej
13. Cele przedmiotu: zrozumienie problemów współczesnej biologii molekularnej
14.
Zakładane efekty kształcenia:
Student rozumie problemy etyczne i metodyczne biologii
molekularnej.
Student potrafi wskazać na pozytywne i negatywne efekty
manipulacji genetycznych. Student potrafi określić
zastosowanie metod biologii molekularnej w przemyśle,
medycynie farmaceutyce.
Student wykorzystuje biegle literaturę naukową w zakresie
biologii molekularnej w języku ojczystym i angielskim; zbiera i
interpretuje dane empiryczne, na podstawie wyników formułuje
właściwe i kreatywne wnioski.
Student analizuje zdobytą wiedzę z zakresu nauk biologicznych
odczuwając potrzebę jej stałego pogłębiania;
K_W07
K_W10
K_U02
K_U07
K_K01
15.
Treści programowe:
Metody i techniki biologii molekularnej wykorzystywane w przemyśle i medycynie.
Wybór organizmu do badań. Problemy etyczne badań ssaków. Pozytywne i
negatywne skutki sekwencjonowania genomów. Pozytywne i negatywne aspekty
tworzenia organizmów transgenicznych. Problem antybiotykooporności jako
wynik horyzontalnego transferu genów. Klonowanie organizmów. Terapie
genowe. Zapłodnienie in vitro. Pózne rodzicielstwo i starzenie się społeczeństwa.
Diagnostyka prenatalna badań wad genetycznych. Szczepienia; Szanse rozwoju
technik genetycznych. Eugenika.
16.
Zalecana literatura:
„Podstawy biologii komórki”- wybrane rozdziały, Alberts i in., PWN 2009.
„Molecular Biology of the Cell” – wybrane rozdziały, 5th Ed, Alberts I wsp.,
Garland Science, 2008.
17. Forma zaliczenia:
Konwersatorium: prezentacja ( K_W07, K_W10, K_U02; K_U07, K_K01)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- konwersatorium:
30
Praca własna studenta:
- przygotowanie do zajęć:
- czytanie wskazanej literatury:
10
5
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
- przygotowanie prezentacji: 10
Suma godzin 55
Liczba punktów ECTS 2
1. Genetyka mitochondriów
2. Mitochondrial genetics
3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalne
7. Poziom studiów II
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr letni
10. Wykład 15 godz.
11. dr Ewa Maciaszczyk-Dziubińska
12. Wymagania wstępne: podstawowy zakres wiedzy z biochemii, genetyki i
biologii komórki
13. Cele przedmiotu: poznanie budowy, zasad funkcjonowania, dziedziczenia,
ewolucji genomów mitochondrialnych
14.
Zakładane efekty kształcenia:
Student opisuje budowę i zasady funkcjonowania
genomów mitochondrialnych wybranych
organizmów. Rozumie rolę interakcji pomiędzy
genomem mitochondrialnym a jądrowym w
funkcjonowaniu komórki. Rozróżnia i opisuje
rodzaje mutacji w mtDNA. Zna molekularne
podłoża chorób mitochondrialnych u człowieka.
Dostrzega związki pomiędzy genomem
mitochondrialnym a ewolucją organizmów. Zna
metody i techniki badania genomu
mitochondrialnego.
Student korzysta ze specjalistycznej literatury
naukowej z zakresu biologii i genetyki
mitochondriów; uczy się samodzielnie
wyznaczonych przez prowadzącego zagadnień
korzystając z różnych źródeł.
Student rozumie potrzebę stałego pozyskiwania i
uzupełniania wiedzy z zakresu genetyki
mitochondriów z uwzględnieniem najnowszej
literatury naukowej w celu poszerzenia i
pogłębienia wiedzy i podnoszenia swoich
kwalifikacji zawodowych.
K_W02
K_W03
K_W06
K_W07
K_U02
K_K01
15.
Treści programowe: Budowa genomów mitochondrialnych. Dziedziczenie
mitochondrialnego DNA. Ekspresja genomu mitochondrialnego: replikacja,
transkrypcja, translacja. Współdziałanie genomu jądrowego i
mitochondrialnego. Badanie cech kodowanych przez mtDNA. Choroby
mitochondrialne. Pochodzenie i ewolucja genomu mitochondrialnego. mtDNA
a ewolucja człowieka.
16.
Zalecana literatura: „Genetyka medyczna. Podręcznik dla studentów” Drewa
G. Elsevier Health Sciences Poland, 2012; „Genomy” Brown T. A.
Wydawnictwo Naukowe PWN, 2013
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
17.
Forma zaliczenia
wykład: zaliczenie w formie testu ( K_W02, K_W03, K_W06, K_W07, K_U02,
K_K01)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na
zrealizowanie aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów) z nauczycielem:
- wykład: 15
Praca własna studenta:
- czytanie wskazanej literatury:
- przygotowanie do zaliczenia:
5
10
Suma godzin 30
Liczba punktów ECTS 1
1. Genotoksykologia
2. Genotoxicology
3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów II
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr letni
10. Wykład: 15 godz., konwersatorium: 10 godz.
11. prof. Robert Wysocki
12. Wymagania wstępne: podstawowy zakres wiedzy z biochemii kwasów
nukleinowych i genetyki molekularnej
13. Cele przedmiotu: zrozumienie mechanizmów genotoksycznego działania
czynników fizycznych i chemicznych i ich roli w kancerogenezie
14.
Zakładane efekty kształcenia:
Student nazywa i klasyfikuje czynniki genotoksyczne
oraz typy uszkodzeń DNA. Zna metody wykrywania
różnych typów uszkodzeń DNA oraz wie jak można
oznaczyć genotoksyczność substancji. Opisuje
mechanizmy mutagenezy oraz reparacji DNA.
Opisuje procesy przyczyniające się do powstawania
nowotworów. Zna molekularne podłoże zwiększające
wrażliwość na czynniki genotoksyczne. Opisuje
mechanizmy działania genotoksycznych leków
antynowotworowych.
Biegle wykorzystuje specjalistyczną literaturę
naukową z zakresu genetoksykologii w języku
polskim i angielskim. Krytycznie analizuje i
selekcjonuje informacje w przygotowaniu opracowań
naukowych z zakresu genotoksykologii. Wygłasza
referaty i przygotowuje prezentacje przy użyciu
nowoczesnych technik multimedialnych.
Rozumie potrzebę stałego pozyskiwania i
uzupełniania wiedzy z zakresu genetoksykologii z
wykorzystaniem najnowszej literatury naukowej w
K_W02
K_W03
K_W07
K_U02
K_U03
K_U08
K_K01
K_K05
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
celu poszerzenia i pogłębienia wiedzy i podnoszenia
swoich kwalifikacji zawodowyc.
15.
Treści programowe:
Klasyfikacja czynników genotoksycznych. Klasyfikacja uszkodzeń DNA.
Mechanizmy mutagenezy. Mechanizmy reparacji DNA. Metody wykrywania
różnych typów uszkodzeń DNA. Testy na genotoksyczność substancji.
Mechanizmy kancerogenezy. Chemoterapia w oparciu o związki
genotoksyczne.
16.
Zalecana literatura:
Molecular, Clinical and Environmental Toxicology, Volume 1: Molecular
Toxicology, Series: Experientia Supplementum, Vol. 99, Luch, Andreas (Ed.),
2009, Birkhäuser Basel; Genotoxicity and DNA Repair. A Practical Approach,
Series: Methods in Pharmacology and Toxicology Sierra, L. María, Gaivão,
Isabel (Eds.), 2014, Humana Press; Toksykologia współczesna. Witold
Seńczuk, 2012, PZWL
17.
Forma zaliczenia:
wykład: zaliczenie w formie testu (K_W02, K_W03, K_K05)
konwersatorium: zaliczenie na podstawie prezentacji (K_W05, K_W10,
K_U02, K_U03, K_U08, K_K01, K_K05) i aktywności na zajęciach ( K_W07,
K_K01, K_K05)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta
Średnia liczba godzin
na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład
- konwersatorium:
15
10
Praca własna studenta:
- przygotowanie do zajęć
- czytanie wskazanej literatury:
- przygotowanie do testu:
5
10
10
Suma godzin 50
Liczba punktów ECTS 2
1. Hormonalna regulacja życia człowieka: od narodzin do starości
2. Hormonal regulation of human life: from birth to senescence
3. WNB, Katedra Fizjologii i Neurobiologii Molekularnej
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów: II
8. Rok studiów: I lub II
9. Semestr: letni
10. wykład 10 godz.; konwersatorium 10 godz.
11. dr Piotr Mamczur
12. Wymagania wstępne: podstawowa wiedza z fizjologii zwierząt oraz biologii
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
komórki
13.
Cele przedmiotu: Zdobycie poszerzonej wiedzy dotyczącej procesów
hormonalnych sterujących wzrostem, rozwojem, dojrzewaniem i procesem
starzenia się organizmu ludzkiego. Również: poznanie hormonalnej regulacji
zapłodnienia i utrzymania ciąży.
14.
Zakładane efekty kształcenia:
Student ma pogłębioną wiedzę dotyczącą funkcjonowania układu
endokrynnego człowieka. Rozumie związki między
nieprawidłowościami w wydzielaniu danych hormonów a
zaburzeniami wzrostu i rozwoju człowieka. Zna mechanizmy
hormonalne regulujące dojrzewanie płciowe, popęd płciowy i
funkcje rozrodcze człowieka. Ma wiedzę na temat zmian
hormonalnych związanych z procesem starzenia się organizmu.
K_W01
K_W02
15.
Treści programowe:
Budowa i działanie osi podwzgórze-przysadka; zmiany hormonalne związane z
okresem dojrzewania; „dojrzewanie mózgu”; hormonalne aspekty reakcji
seksualnych człowieka; regulacja hormonalna zapłodnienia, utrzymania ciąży i
porodu; andropauza i menopauza; zmiany hormonalne związane z procesem
starzenia się; stres a układ endokrynny; wpływ substancji egzogennych o
aktywności hormonalnej na procesy życiowe człowieka; patologie układu
endokrynnego
16.
Zalecana literatura:
„Fizjologia człowieka – podręcznik dla studentów medycyny” Stanisław J.
Konturek (red.), Elsevier Urban & Partner (2007 lub 2013), (wybrane
rozdziały); „Wprowadzenie do fizjologii Klinicznej” Stanisław Kozłowski i
Krystyna Nazar (red.), Wydawnictwo Lekarskie PZWL (1999), (wybrane
rozdziały)
17.
Forma zaliczenia:
wykład: zaliczenie w formie testu (K_W01, K_W02);
konwersatorium: zaliczenie na podstawie aktywności na zajęciach (K_W01,
K_W02)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład: (obecność obowiązkowa dla osób,
które wybrały przedmiot)
- konwersatorium:
10
10
Praca własna studenta:
- czytanie wskazanej literatury:
- przygotowanie do zaliczenia:
15
15
Suma godzin 50
Liczba punktów ECTS 2
1. Modelowanie procesów rozwojowych u roślin
2. Modelling plant development
3. WNB: IBE, Zakład Biologii Rozwoju Roślin
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów: II
8. Rok studiów: II
9. Semestr: letni
10. Wykład 15 godz.
11. Prof. dr hab. Beata Zagórska-Marek
12. Wymagania wstępne: Zaliczony przedmiot Genetyczno-molekularne podstawy
rozwoju roślin
13. Cele przedmiotu: Poznanie zalet stosowania współczesnych metod modelowania
zjawisk rozwojowych u roślin przy użyciu programów komputerowych
14.
Zakładane efekty kształcenia
Student zna przykłady zastosowania technik komputerowych
do symulacji procesów związanych z tworzeniem
modularnego planu budowy ciała rośliny i jej reakcjami
fizjologicznymi. Zna i rozumie regulacyjną rolę mechanizmu
dyfuzji reakcji Turinga w tworzeniu okresowych wzorów
organogenezy, pigmentacji, czy różnicowania tkanek
heterogennych. Zna i rozumie przyczyny plastyczności
fenotypowej u roślin.
Student posługuje się prostymi programami komputerowymi
pozwalającymi na symulacje zjawisk rozwojowych u roślin,
analizuje efekty symulacji i wyciąga wnioski z porównania
zjawisk wirtualnych z realnymi.
Student jest aktywny, spostrzegawczy i krytyczny, zdolny do
logicznego myślenia, umiejący podjąć aktywną dyskusję,
zachowujący dyscyplinę w posługiwaniu się sprzętem
komputerowym
K_W01
K_W05
K_W06
K_U05
K_K01
15.
Treści programowe:
Model Turinga dyfuzji reakcji na przykładzie nitki sinicowej Anabaena; Model
Meinhardta periodycznych wzorów pigmentacji; Model modularnej (fraktalnej)
budowy ciała rośliny – L-systemy, rośliny wirtualne, reiteracje w budowie pędu,
liścia i kwiatu; Model geometryczny ontogenetycznych zmian wzorów ulistnienia –
symulacje komputerowe dyslokacji w parakrystalicznych sieciach filotaktycznych
(Helianthus, Magnolia); Modele zjawisk fizjologicznych: akropetalnego i
bazypetalnego zakwitania pędu (Prusinkiewicz); hormonalnej aktywacji rozwoju
pędów bocznych u Arabidopsis (Prusinkiewicz, Leyser)
16.
Zalecana literatura:
Wybrane zagadnienia z następujących podręczników i artykuły: Prusinkiewicz
P., Lindenmayer A. Algorithmic Beauty of Plants. Springer-Verlag. 1990.
Meinhardt H. Algorithmic Beauty of Sea Shells. Springer-Verlag. 2003.
Prusinkiewicz P., Crawford S., Smith R., Ljung K., Bennett T., Ongaro V.,
Leyser O. 2009. Control of bud activation by an auxin transport switch. PNAS
106: 17431. Zagórska-Marek B., Szpak. 2008. Virtual phyllotaxis and real
plant model cases. FPB 35:1025.
17.
Forma zaliczenia:
Wykład – zaliczenie w formie odpowiedzi ustnej (K_W01; K_W05; K_W06;
K_U05; K_K01)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć z nauczycielem:
- wykład:
15
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
Praca własna studenta, np.:
- czytanie wskazanej literatury:
- przygotowanie do zaliczenia:
5
10
Suma godzin 30
Liczba punktów ECTS 1
1. Modyfikacje genetyczne roślin dla celów biofortyfikacji i fitoremediacji
2. Genetic modification of plants for the purpose of phytoremediation and
biofotification
3. WNB, IBE, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów: II
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr: zimowy
10. Seminarium: 30 godz.
11. dr Magdalena Migocka
12. Wymagania wstępne: student powinien posiadać podstawowy zakres wiadomości
z biologii roślin, biochemii i genetyki.
13.
Cele przedmiotu: poznanie aktualnych zagadnień związanych z fitoremediacją
(wykorzystaniem roślin do oczyszczania gleb zanieczyszczonych metalami) i
biofortyfikacją (modyfikacją roślin w celu zwiększenia ich wartości odżywczej dla
zwierząt i człowieka).
14.
Zakładane efekty kształcenia:
Student umie zdefiniować pojęcia fitoremediacja i
biofortyfikacja. Student zna zagrożenia związane z
zanieczyszczeniami gleb metalami ciężkimi oraz
konsekwencje niedoboru mikroelementów takich jak Zn i
Fe w mineralnym żywieniu roślin oraz diecie zwierząt i
człowieka. Student zna gatunki i biologię życia naturalnych
hiperakumulatorów metali ciężkich.
Student zna molekularne podstawy hiperakumulacji metali
w roślinach. Student zna złożone mechanizmy regulujące
poziom metali w komórkach roślinnych. Student
klasyfikuje rodziny białek zaangażowanych w dystrybucję
metali w komórkach i tkankach roślinnych.
Student umie wyszukać geny i białka związane z
odpowiedzią roślin na niedobór lub nadmiar metali w
bazach internetowych. Student umie rozpoznać domeny i
motywy aminokwasowe związane z wiązaniem i
transportem metali przez błony komórkowe. Student umie
porównać homologiczne białka z różnych roślin i wyciągnąć
wnioski na podstawie otrzymanych wyników.
Student prezentuje wybrane zagadnienia dotyczące
metalotionein i fitochelatyn oraz wybranych rodzin
transporterów metali u roślin.
Student umie pracować w zespole i krytycznie analizować
dostępne informacje dotyczące tematu.
K_W01
K_W02
K_W03
K_U05
K_U06
K_U08
K_K02
K_K04
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
15.
Treści programowe:
Fitoremediacja i biofortyfikacja, wyjaśnienie pojęć i konsekwencji wynikających z
zaburzenia równowagi metali ciężkich w środowisku i diecie żywych organizmów.
Cele i założenia projektu Copenhagen Consensus w zakresie problemu niedoboru
cynku na świecie. Lista naturalnie występujących hiperakumulatorów metali
ciężkich i metaloidów; szczegółowe omówienie biologii modelowych
hiperakumulatorów o istotnym znaczeniu dla fitoremediacji: Arabidopsis halleri,
Thlaspi goesigense, Brassica juncea, Pteris vittata, Stylosanthes hamata.
Molekularne podstawy naturalnej hiperakumulacji i hipertolerancji na metale
ciężkie. Potencjalne wykorzystanie białek i peptydów zaangażowanych w
pobieranie metali do komórek roślinnych i ich organelli oraz ochronę komórek
przed nadmiarem metali w cytoplazmie (białka ZIP, Nramp, HMA, CDF, CAX,
metalotioneiny, fitochelatyny) w modyfikacji genetycznej roślin dla celów
biofortyfikacji i fitoremediacji. Duplikacje genów i elementów regulatorowych w
promotorach jako mechanizm zwiększający odporność roślin na metale ciężkie.
Cechy idealnego roślinnego hiperakumulatora. „Green technology”, aktualne
projekty badań nad otrzymaniem i zastosowaniem hiperakumulatorów do
oczyszczania gleb skażonych metalami ciężkimi.
16.
Zalecana literatura:
Jonathan Shaw. Heavy metal tolerance in plants. Evolutionary aspects. CRC
Press, 1989
Sergey Shabala. Plant stress physiology, CABI, 2012
Najnowsze publikacje przeglądowe i oryginalne prace naukowe dotyczące tematu
dostępne w czasopismach naukowych.
Internetowe bazy genów, genomów i białek
17.
Forma zaliczenia:
Seminarium – prezentacja (K_W02, K_W03, K_U08, K_K04), projekt (K_U05,
K_U06, K_K02), test (K_W01, K_W02, K_W03)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem - seminarium:
30
Praca własna studenta, np.:
- przygotowanie do zajęć:
- czytanie wskazanej literatury:
- opracowanie wyników:
- przygotowanie prezentacji:
5
10
5
10
Suma godzin 60
Liczba punktów ECTS 2
1. Molekularne podstawy adaptacji roślin
2. Molecular basis of plant stress physiology
3. WNB, IBE, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów II
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr letni
10. wykład 15 godz.; laboratorium 30 godz.
11. Prof. dr hab. Grażyna Kłobus, dr Ewa Młodzińska, dr Magdalena Migocka
12. Wymagania wstępne: wiedza z zakresu biologii komórki, genetyki i fizjologii roślin
13. Cele przedmiotu: uzyskanie wiedzy o zaburzeniach metabolicznych i
specyficznych procesach naprawczych zachodzących w organizmach roślinnych
poddanych działaniu środowiskowych czynników stresogennych
14. Zakładane efekty kształcenia:
Student definiuje pojęcie stresu fizjologicznego, identyfikuje
specyficzne deformacje metaboliczne w kontekście działania
stresogennych czynników środowiskowych; zna mechanizmy
percepcji bodźców zewnętrznych i ścieżki sygnałowe, rozróżnia i
charakteryzuje procesy adaptacji i aklimacji; rozumie molekularne
podstawy tych zjawisk.
Student potrafi wykorzystać specjalistyczny sprzęt pomiarowy do
określenia natężenia podstawowych procesów fizjologicznych;
umie przeprowadzać eksperymenty, interpretować uzyskane
wyniki i wyciągać właściwe wnioski; postrzega związki i zależności
przyrodnicze
Student jest kreatywny i dostrzega związek pomiędzy warunkami
środowiskowymi a aktywnością procesów fizjologiczne i wzrostem
roślin; jest także zdolny do pracy w zespole z zachowaniem
podstawowych zasad bezpieczeństwa pracy w laboratorium i
chętny do pozyskiwania i uzupełniania wiedzy przyrodniczej.
K_W02
K_W06
K_W07
K_U01
K_U04
K_U05
K_K01
K_K05
15. Treści programowe:
Definicja stresu fizjologicznego; klasyfikacja czynników stresogennych i
zaburzenia metaboliczne; percepcja czynników fizycznych (natężenie światła,
temperatura) i chemicznych (woda, NaCl, metale ciężkie); specyficzne ścieżki
przekazywania sygnału ze szczególnym uwzględnieniem roli wapnia oraz kinaz
białkowych typu CDPKs i SnRKs; modyfikacje czynników transkrypcyjnych i
aktywacja specyficznych genów jako podstawowe mechanizmy adaptacyjne
(model regulonu); rola ABA w adaptacji roślin do stresów suszy, NaCl i chłodu;
posttranslacyjne mechanizmy adaptacyjne.
16. Zalecana literatura:
Abiotic Stress Adaptation in Plants. Pareek A, Sopory S.K., Bohnert H.J. (ed.).
2010, Plant Abiotic Stress. Jenks M.A., Hasegawa P.M (ed.)., 2005, Bleckwell
Publishing; Genes for Plant Abiotic Stress. Jones R.L., 2000, Wiley-Blackwell.
Biochemistry and Molecular Biology of Plants, Buchanan B.B. i in. 2000, pp.1158-
1174
17. Forma zaliczenia
wykład: zaliczenie w formie testu (K_W02, K_W06, K_W07)
laboratorium: zaliczenie na podstawie pracy pisemnej (K_U05, K_K05) i
aktywności na zajęciach (K_U01, K_U04, K_K01)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład:
- laboratorium:
15
30
Praca własna studenta:
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
- czytanie wskazanej literatury:
- przygotowanie do zajęć:
- opracowanie wyników:
- przygotowanie do zaliczenia:
10
5
10
20
Suma godzin 90
Liczba punktów ECTS 3
1. Molekularne podstawy układów symbiotycznych roślin i
mikroorganizmów
2. Molecular basis of plant and microorganism symbiotic systems
3. WNB, IBE, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów: II
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr letni
10. Seminarium 30 godz.
11. dr Małgorzata Reda, dr Magdalena Migocka
12. Wymagania wstępne: student powinien posiadać podstawowy zakres wiadomości
z biologii roślin i mikroorganizmów, biochemii i genetyki.
13. Cele przedmiotu: poznanie podstaw powstawania i funkcjonowania na poziomie
molekularnym układów symbiotycznych między bakteriami wiążącymi azot i
roślinami wyższymi
14. Zakładane efekty kształcenia:
Student wymienia rodzaje bakterii wiążących azot
atmosferyczny. Student zna podstawowe informacje na temat
infekcji i powstawania bakteroidów oraz rozumie rolę rośliny i
bakterii w tym procesie. Student zna i klasyfikuje bakteryjne
białka nod, roślinne noduliny, rozumie ich znaczenie. Student
zna budowę i funkcjonowanie kompleksu nitrogenazy,
rozumie mechanizm asymilacji N2 przez bakterie.
Student zna mechanizmy funkcjonowania układu
symbiotycznego między bakteriami wiążącymi N2 a roślinami
wyższymi, rozumie ich znaczenie dla obu komponentów tych
układów.
Student prezentuje wybrane zagadnienia dotyczące rodzin
bakteryjnych białek nod, roślinnych nodulin oraz kompleksu
nitrogenazy na podstawie najnowszej literatury, dokonuje
wnikliwej analizy prac oryginalnych i przeglądowych,
formułuje wnioski, które dyskutuje z grupą.
Student sprawnie posługuje się dostępnymi narzędziami
stosowanymi w badaniach nad genami i białkami: wynajduje i
operuje sekwencjami z bazy białek roślinnych organizmów
modelowych, wynajduje homologiczne geny w genomach
innych roślin i zestawia kompletne rodziny kodowanych przez
nie białek, poznaje metody analizy funkcji genów kodujących
białka regulujące powstawanie i funkcjonowanie układów
symbiotycznych bakteria-roślina wyższa.
K_W01
K_W02
K_U05
K_U06
K_U08
K_K02
K_K05
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
Student jest kreatywny, chętny do dyskusji prezentowanych
faktów naukowych. Student jest otwarty na poznawanie
nowych metod analizy danych, aktywnie realizuje powierzone
zadania.
15. Treści programowe:
Mikroorganizmy redukujące azot atmosferyczny (wolnożyjące beztlenowe i
tlenowe, fotosyntetyzujące, cyjanobakterie i bakterie symbiotyczne). Proces
infekcji i tworzenia bakteroidu, znaczenie specyficznych substancji wytwarzanych
przez rośliny w tym procesie. Rola bakteryjnych białek nod, ich klasyfikacja
strukturalna i funkcjonalna. Udział roślinnych białek nodulin w funkcjonowaniu
bakteroidów i procesie asymilacji N2. Identyfikacja genów kodujących noduliny.
Wyszukiwanie genów ENOD i LNOD w zsekwencjonowanych genomach roślin
modelowych, przeszukiwanie baz danych, analizy strukturalne i filogenetyczne
analizowanych genów i białek. Molekularne podstawy wiązania azotu
atmosferycznego przez bakterie, budowa i funkcjonowanie kompleksu
nitrogenazy, geny nif. Molekularne mechanizmy regulacji aktywności
nitrogenazy.
16. Zalecana literatura:
Taiz L., Zeiger E. Plant Physiology. Sinauer Associates, Inc. Wydanie piąte.
Kopcewicz J., LewakS. Fizjologia roślin, Wydawnictwo Naukowe PWN 2005
Najnowsze publikacje przeglądowe i oryginalne prace naukowe dotyczące tematu
dostępne w czasopismach naukowych.
Internetowe bazy genów, genomów i białek
17. Forma zaliczenia:
Seminarium – zaliczenie na podstawie pracy pisemnej (K_U05, K_U06: K_K02) i
prezentacja (K_W01, K_W02, K_U08, K_K05)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
seminarium:
30
Praca własna studenta, np.:
- przygotowanie do zajęć:
- czytanie wskazanej literatury:
- opracowanie wyników:
- przygotowanie prezentacji:
5
10
5
10
Suma godzin 60
Liczba punktów ECTS 2
1. Naprawa DNA i rekombinacja
2. DNA Repair and recombination
3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów II
8. Rok studiów II
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
9. Semestr letni
10. Wykład 15 godz., laboratorium 20 godz.
11. prof. dr hab. Robert Wysocki,
12. Wymagania wstępne: zaawansowana wiedza z genetyki, biochemii i biologii
molekularnej
13. Cele przedmiotu: zapoznanie studentów z mechanizmami jakie komórki stosują,
aby utrzymać integralność chromosomów, w tym z systemami naprawy
uszkodzeń DNA, których zaburzenia są przyczyną nowotworów u ludzi
14. Zakładane efekty kształcenia:
Student ma pogłębioną wiedzę z genetyki w zakresie rodzajów
uszkodzeń DNA i mechanizmów reparacji DNA na poziomie
molekularnym, ze szczególnym uwzględnieniem naprawy pęknięć DNA
oraz replikacyjnych uszkodzeń DNA na drodze rekombinacji. Student
zna metody wykrywania mutagennego działania czynników fizycznych
i chemicznych oraz różne techniki badawcze z wykorzystaniem
rekombinacji DNA. Student zna zasady bezpieczeństwa w pracy z
czynnikami mutagennymi i kancerogennymi.
Student umie przeprowadzać testy wykrywające mutagenne działanie
różnych czynników fizycznych i chemicznych. Student potrafi
zaplanować i przeprowadzić eksperymenty z zakresu naprawy DNA
oraz przeanalizować uzyskane wyniki i wyciągnąć na ich podstawie
wnioski.
Student potrafi pracować w zespole podczas planowania i
przeprowadzania eksperymentów naukowych. Podczas wykonywania
eksperymentów zachowuje czystość i porządek podczas pracy, dba o
wykorzystywaną w pracy aparaturę badawczą.
K_W03
K_W09
K_W11
K_U01
K_U04
K_U06
K_K02
K_K03
15. Treści programowe:
Rodzaje mutagenów. Rodzaje uszkodzeń DNA. Biologiczne metody wykrywania
mutagenów. Rodzaje naprawy uszkodzeń DNA. Rekombinacja homologiczna.
Naprawa widełek replikacyjnych. Niestabilność genomów a nowotwory.
Rekombinacja DNA jako technika manipulacji genetycznych.
16. Zalecana literatura:
„Genome Stability”, James H. Haber, Garland Science; wybrane rozdziały:
„Biochemia”, J.M. Berg, L. Stryer, J. L. Tymoczko, PWN 2011; „Molecular Biology
of the Cell”, 5th Ed, Alberts i wsp., Garland Science, 2008; “Podstawy biologii
molekularnej”, L.A. Allison, WUW, 2009.
17. Forma zaliczenia:
wykład: zaliczenie na podstawie testu (K_W03; K_W09; K_U04; K_U06)
laboratorium: zaliczenie na podstawie pracy pisemnej: (K_W09; K_U04; K_U06);
testu (K_W03; K_W09; K_W11; K_U04; K_U06) oraz oceny aktywności na
zajęciach (K_W09; K_W11; K_U01, K_U04; K_U06; K_K02; K_K03);
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład:
- laboratorium:
15
20
Praca własna studenta:
- przygotowanie do zajęć:
- czytanie wskazanej literatury:
- przygotowanie do zaliczenia
10
10
15
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
Suma godzin 70
Liczba punktów ECTS 3
1. Organizmy modelowe w eksperymentalnej biologii rozwoju zwierząt
2. Model organisms in animal experimental developmental biology
3. WNB, IBE, Zakład Biologii Rozwoju Zwierząt
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów II
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr letni
10. Wykład 15 godz.
11. dr hab. prof. Małgorzata Daczewska, dr hab. Bożena Simiczyjew, dr Izabela
Jędrzejowska, dr Marta Mazurkiewicz-Kania, dr Arnold Garbiec, dr Magda
Dubińska-Magiera, dr Marta Migocka-Patrzałek
12. Wymagania wstępne: Podstawowa wiedza z biologii rozwoju zwierząt
13. Cele przedmiotu: uzyskanie wiedzy na temat wykorzystania organizmów
modelowych do poznania procesów zachodzących podczas rozwoju zwierząt
14. Zakładane efekty kształcenia
Student zna proces tworzenia gron komórek płciowych i
różnicowania komórek w gronie oraz transportu substancji i
organelli pomiędzy komórkami grona; morfogenezę tkanki
nabłonkowej i mechanizmy migracji komórek nabłonka; zna
przebieg i mechanizmy różnych typów śmierci komórkowej;
wczesny rozwój zarodkowy w aspekcie specyfikacji komórek;
powstawanie osi ciała i wzoru budowy modelowych gatunków
bezkręgowców i kręgowców; mechanizmy organogenezy w
systemach modelowych
Student potrafi wykorzystać uzyskaną wiedzę w analizie
porównawczej tych procesów u organizmów nie modelowych.
K_W01
15. Treści programowe: tworzenie gron komórek płciowych w gametogenezie;
morfogeneza tkanki nabłonkowej; mechanizmy migracji komórek nabłonka;
mechanizmy śmierci komórkowej; specyfikacja komórek we wczesnych etapach
rozwoju zarodkowego, powstawanie osi ciała i wzoru budowy modelowych
gatunków bezkręgowców i kręgowców; mechanizmy organogenezy
16. Zalecana literatura: Developmental Biology S.F. Gilbert, Sinauer Associates, Inc.;
Krótkie Wykłady Biologia Rozwoju R.M. Twyman, Warszawa PWN, oryginalne
publikacje naukowe
17. Forma zaliczenia
wykład: zaliczenie na podstawie testu (K_W01); warunkiem uzyskania zaliczenia
jest obecność na 5 wykładach;
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład:
15
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
Praca własna studenta, np.:
- przygotowanie do testu:
15
Suma godzin 30
Liczba punktów ECTS 1
1. Polarny transport auksyn w rozwoju roślin
2. Polar auxin transport in plant development
3. WNB: IBE, Zakład Biologii Rozwoju Roślin
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów: II
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr: letni
10. Wykład 15 godz.
11. dr Alicja Banasiak
12. Wymagania wstępne: podstawowa wiedza z zakresu fizjologii i biologii rozwoju
roślin
13. Cele przedmiotu: poznanie i zrozumienie roli polarnego transportu auksyny w
regulacji procesów rozwojowych i morfogenetycznych u roślin
14. Zakładane efekty kształcenia:
Student rozumie rolę auksyn w regulacji procesów
rozwojowych i morfogenetycznych u roślin. Zna
drogi transportu auksyny i ich wpływ na procesy
rozwojowe. Charakteryzuje różne szlaki transportu
auksyny, potrafi opisać ich związek z
powstawaniem wzorów komórkowych podczas
embriogenezy i waskularyzacji tkanek. Wyjaśnia
powiązanie dystrybucji auksyny z regulacją
genetyczną morfogenezy.
Student jest otwarty na wiedzę, zdolny do
logicznego myślenia.
K_W01
K_W03
K_U02
K_K01
15. Treści programowe:
Drogi i sposoby transportu auksyny. Procesy rozwojowe zależne od auksyn.
Wpływ PAT na organogenezę (model koncepcyjny i modele komputerowe). Udział
auksyn w tworzeniu wzorów komórkowych podczas embriogenezy. Auksynowa
regulacja tworzenia tkanki przewodzącej na różnych poziomach jej organizacji,
np. aktywacja kambium, rozwój użyłkowania liścia jako model do badań wpływu
auksyny na rozwój systemu przewodzącego. Rola auksyn i ich polarnego
transportu w dominacji wierzchołkowej.
16. Zalecana literatura (podręczniki):
Wybrane zagadnienia z podręczników: Steeves TA and Sussex IM. 1989. Patterns
in Plant Development. Cambridge Univ. Press.
Lindsey K. 2004. Polarity in plants. Blackwell Publishing.; Evert, R.F. Esau’s Plant
Anatomy. Meristems, Cells, and Tissues of the Plant Body – Their Structure,
Function, and Development. John Wiley & Sons. Inc., Hoboken, New Jersey, USA,
2006.; Hejnowicz Z. Anatomia i histogeneza roślin naczyniowych. PWN. 2002.;
Prace oryginalne.
17. Forma zaliczenia
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
Wykład: zaliczenie na podstawie testu (K_W01, K_W03, K_U02, K_K01)
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład:
15
Praca własna studenta, np.:
- przygotowanie do testu:
10
Suma godzin 25
Liczba punktów ECTS 1
1. Presenting your research
2. Presenting your research
3. WNB, IBE, Zakład Biologii Rozwoju Roślin
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów II
8. Rok studiów II
9. Semestr letni
10. Seminarium: 25 godz.
11. Dr A. Dołzbłasz, dr E. Gola, dr K. Sokołowska
12. Wymagania wstępne: dobra znajomość języka angielskiego
13. Cele przedmiotu: prezentacja tematyki, wyników i technik badawczych z
własnych badań prowadzonych w ramach pracy dyplomowej w języku angielskim
14. Zakładane efekty kształcenia:
Student stosuje terminologię z tematyki związanej ze swoją
pracą dyplomową. Student potrafi przygotować naukową
prezentację w j. angielskim, gdzie przedstawia przegląd
literaturowy do swojej pracy dyplomowej, wyniki
dotychczasowych badań i wnioski. Student jest kreatywny,
aktywnie realizuje powierzone zadania.
K_U02
K_U03
K_U08
K_K05
15. Treści programowe:
Tematyka będzie zależna od wybranych przez studentów tematów badawczych i
miejsc realizacji pracy dyplomowej.
16. Zalecana literatura:
Najnowsze publikacje przeglądowe i oryginalne prace naukowe w języku
angielskim. Słowniki języka angielskiego.
17. Forma zaliczenia:
Seminarium: zaliczenie na podstawie prezentacji (K_U02, K_U03, K_U08, K_K05)
i aktywności na zajęciach (K_U02, K_U03, K_U08, K_K05)
18. Język wykładowy: angielski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
- seminarium 25
Praca własna studenta, np.:
- przygotowanie prezentacji:
- czytanie literatury:
15
10
Suma godzin 50
Liczba punktów ECTS 2
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
1. Protein-protein interactions: detection, analysis and implications
2. Protein-protein interactions: detection, analysis and implications
3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów II
8. Rok studiów I lub II
9. Semestr letni
10. Wykład: 15 godz. Konwersatorium: 15 godz.
11. dr Ewa Błaszczak;
12. Wymagania wstępne: podstawowy zakres wiedzy z genetyki, biochemii i biologii
komórki
13. Cele przedmiotu: zrozumienie podstawowych zagadnień w zakresie tematyki
odziaływań białko-białko, detekcji i technik analiz odziaływań białkowych oraz ich
potencjalnego zastosowania.
14. Zakładane efekty kształcenia:
Student zna typy interakcji między białkami w komórce oraz rozumie
sposoby i podstawowe mechanizmy tych oddziaływań. Student wie jak
znaleźć informacje dotyczące interakcji białkowych w bazach danych
oraz potrafi wymienić podstawowe narzędzia bioinformatyczne
niezbędne do przewidywania potencjalnych interakcji między
określonymi białkami. Student zna techniki służące do wykrywania
i analizy oddziaływań białko-białko, zarówno in vitro jak również in vivo
u różnych organizmów modelowych oraz rozumie podstawowy
mechanizm ich działania. Student wie, jakie znaczenie ma badanie
interakcji białko-białko i jakie zastosowanie praktyczne może mieć
wiedza na ten temat.
Student korzysta samodzielnie z baz danych oraz posługuje się
narzędziami bioinformatycznymi.
Student analizuje zdobytą wiedzę z zakresu technik wykrywania
interakcji białko-białko; wykazuje chęć jej pogłębiania; jest otwarty na
dyskusje i aktywnie uczestniczy w pracy zespołowej.
K_W01
K_W03
K_W05
K_W08
K_U02
K_U05
K_U07
K_K01
K_K02
15. Treści programowe:
Typy i sposoby oddziaływań białko-białko. Bazy danych interakcji białkowych i
przewidywanie nowych oddziaływań. Sieci interakcji białkowych i ich porównywanie
między gatunkami. Techniki analiz interakcji białkowych in vitro. Techniki analiz
interakcji białkowych in vivo. Praktyczne zastosowanie wiedzy w zakresie odziaływań
białkowych: interakcje białko-białko a projektowanie leków.
16. Zalecana literatura:
Alberts B., et al. "Molecular Biology of the Cell. New York: Garland Science; 2002." 5th
Edition (2010) wybrane rozdziały; Williamson M.P. & Sutcliffe M.J. (2010), Protein–
protein interactions. Biochemical Society Transactions, 38(4), 875-878; Nooren I.M. &
Thornton J.M. (2003), Diversity of protein–protein interactions. The EMBO
Journal, 22(14), 3486-3492; Oughtred R. et al., (2016), Use of the BioGRID Database
for Analysis of Yeast Protein and Genetic Interactions. Cold Spring Harbor Protocols.
Corbi-Verge C. & Kim P.M. (2016), Motif mediated protein-protein interactions as drug
targets. Cell Communication and Signaling, 14(1).
17. Forma zaliczenia
Wykład: zaliczenie na podstawie testu ( K_W01,K_W03, K_W05, K_W08, K_K01,
Konwersatorium: zaliczenie na podstawie prezentacji (K_W01,K_W03, K_W05,
K_W08, K_U02, K_U05, K_U07, K_K01, K_K02)
18. Język wykładowy: angielski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie aktywności
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
1. Techniki histologiczne w medycynie
2. Histological techniques in medicine
3. WNB, IBE, Zakład Biologii Rozwoju Zwierząt
4. Zgodny z USOS
5. Fakultatywny
6. Genetyka i biologia eksperymentalna
7. Poziom studiów: II
8. Rok studiów: I lub II
9. Semestr zimowy
10. Wykład 15 godz., ćwiczenia 15 godz.
11. dr hab. prof. Małgorzata Daczewska, dr hab. Bożena Simiczyjew, dr Izabela
Jędrzejowska, dr Marta Mazurkiewicz-Kania, dr Arnold Garbiec, dr Magda
Dubińska-Magiera, dr Marta Migocka-Patrzałek
12. Wymagania wstępne: Podstawowa wiedza z histologii i cytologii zwierząt oraz
technik mikroskopowych
13. Cele przedmiotu: Uzyskanie wiedzy o zastosowaniu technik histologicznych w
medycynie.
14. Zakładane efekty kształcenia:
Student ma poszerzoną wiedzę z zakresu
stosowania technik histologicznych i interpretacji
wyników barwień histologicznych w medycynie.
Student ma pogłębioną wiedzę pozwalającą
dostrzec złożone związki zależności genetyki i
biologii eksperymentalnej z medycyną.
Student posiada umiejętność biegłego korzystania
z literatury naukowej w języku polskim i
angielskim.
Student dostrzega problemy i przestrzega zasad,
również etycznych, w wykonywaniu zawodu. Jest
zdolny do krytycznej oceny przedstawionych
wyników badań.
K_W01
K_W04
K_W06
K_U02
K_K04
15. Treści programowe:
Zastosowanie, zasady, cele, korzyści i ograniczenia stosowania technik
histologicznych oraz interpretacja wyników w aspekcie medycznym. Problemy,
także etyczne, spotykane w histologicznej diagnostyce medycznej.
16. Zalecana literatura:
„Podstawy technik mikroskopowych” J. Litwin , M. Gajda, WUJ, 2011; „Histologia”
W. Sawicki, J. Malejczyk, wyd.6, PZWL, 2012; „Ćwiczenia z histologii zwierząt” J.
Kuryszko, J. P. Madej, V. Kapuśniak, Wyd. Uniw. Przyrodniczy we Wrocławiu,
2012; „Immunocytochemia” M. Zabel, PWN 1999, prace naukowe wskazane
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład:
- konwersatorium:
15
15
Praca własna studenta:
- czytanie wskazanej literatury oraz
praca z bazami danych
- przygotowanie prezentacji
15
15
Suma godzin 60
Liczba punktów ECTS 2
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia
Genetyka i biologia eksperymentalna
Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych
przez prowadzącego.
17. Forma zaliczenia:
wykład: zaliczenie na podstawie testu (K_W01, K_W04, K_W06, K_U02, K_K04);
warunkiem zaliczenia jest obecność na 5 wykładach.
ćwiczenia: zaliczenie na podstawie testu (K_W01, K_W04, K_W06) i obecności na
zajęciach.
18. Język wykładowy: polski
19. Obciążenie pracą studenta
Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie
aktywności
Godziny zajęć (wg planu studiów)
z nauczycielem:
- wykład:
- ćwiczenia:
15
15
Praca własna studenta, np.:
- czytanie wskazanej literatury:
- przygotowanie do testu:
10
10
Suma godzin 50
Liczba punktów ECTS 2