Workshop - Drupal para BioInformática
José Fernandes
[email protected] - www.josefernandes.pt - twitter.com/introfini - drupal.org/user/42293
Gestor de conteúdos / Framework
Como funciona?
Drupal
PHP
Apache IIS, Nginx, lighttpd, etc
MySQL PostgreSQL, Oracle, SQL
Server, etc
Sistema Operativo
http://opensource.com
http://drupal.org
A comunidade
Mais de 500.000 membros
Mais de 12.000 developers
Membros em mais de 200 países
Traduzido em 88 línguas
http://www.flickr.com/photos/nidhug/4923618478
Comunidade portuguesa
Drupal Portugal: núcleos em Lisboa e no
Norte http://drupal-pt.org
A.D.P. - Associação Drupal Portugal
3.600 membros portugueses registados http://drupal.org/profile/country/Portugal
10 razões para escolher Drupal
1. Comunidade apaixonada e dedicada 2. Desenvolvimento rápido 3. Desenvolvimento flexível 4. Altamente extensível 5. Escalabilidade garantida 6. Construído para ser social 7. Aberto para a sua marca 8. Sem custos de aquisição ou de licenciamento 9. Segue os standards 10. Segurança máxima
Tipos de sites
Comunidades
E-commerce
Institucionais
Conferências
Portais
Páginas pessoais
Jornais online
Aplicações web
Formação online
Intranets
Wikis
Fóruns
Marketing
...
Alguns prémios ganhos
Quem o usa?
http://www.mensa.org
http://www.ebi.ac.uk/
http://brix.crg.es/
http://www.pacbb.net
http://biology.stanford.edu/
http://news.harvard.edu
http://aribi.arizona.edu/
http://www.bioinfo.wsu.edu/
http://bisite.usal.es
http://www.biology.umd.edu/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov
http://www.playboy.de
Quem mais o usa?
Emprego?
http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html
Drupal + Bioinformática
http://www.bioinfo.wsu.edu/node/557
O que vem incluído?
Blogues, livros, comentários, fóruns
Estatísticas de acessos e logins
Pesquisa avançada Sistemas avançados de
performance URL amigáveis Menus multi-nível Suporte multi-site Gestão de utilizadores
Gestão de permissões Gestão de sessões OpenID Gestão de ficheiros e
imagens Feeds RSS Sistema de notificações
para actualizações Perfis de utilizadores Ferramentas de workflow …
E muito mais!
Mais de 12.000 módulos disponíveis
Principais módulos: CCK, Views, Rules, Pathauto,
Commerce, Google Analytics, Devel, Rules, Fivestar, VBO,
Advanced Forum, Organic Groups, XML Sitemap, Features,
Context, Panels, Flag, Feeds
Lista completa: http://drupal.org/project/Modules
Módulos para Bioinformática
Bioinformatic Software Bench http://drupal.org/project/biosoftware_bench
The Bioinformatic Software Bench for Drupal allows for a rapid and secure deployment of bioinformatic software. The BLAST, InterProScan, SSAHA2 and
annot8r software are provided by default and plugins for new software can be readily written.
GMOD Drupal Bioinformatic Server Framework
http://drupal.org/project/gmod_dbsf
Genes4all http://drupal.org/project/genes4all
Genes4all is a package of modules for visualizing bioinformatic information using GMOD, BioPerl and Chado..
Pubmed Integration http://drupal.org/project/pubmed_integration
Entrez Database Import http://drupal.org/project/entrez
Jbrowse http://drupal.org/project/Jbrowse
http://insectacentral.org/bench/blastall
Como saber mais?
Documentação no Drupal.org http://drupal.org/handbook
API para developers http://api.drupal.org
Vídeos com tutoriais http://drupal.org/node/124318
IRC #drupal http://drupal.org/irc
BioInformatics no Groups.Drupal http://groups.drupal.org/bioinformatics
O meu blog http://josefernandes.pt/topicos/drupal
Dezenas de livros
...
Mãos ao trabalho!
Ter a stack (L/W/M)AMP a funcionar
Fazer o download do Drupal
Versão 6 ou 7 ?
Que módulos usar?
Desenvolver o 1º projecto!