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Maciez da Carne em Nelore: Uma Realidade Brasileira
Cláudio Ulhôa MagnaboscoPesquisador EMBRAPA/ANCP/CNPq
Ribeirão Preto – SP2016
TópicosIntrodução Estado da ArteQualidade da Carne do NeloreIniciativas BrasileirasObjetivosMateriais e MétodosResultados
• Descritivas Gerais• Correlações Genéticas• GWAS e Seleção Genômica
Perspectivas FuturasConsiderações Finais
• 2° Maior produtor de carne bovina • Maior rebanho comercial de bovinos (208 milhões de cabeças – FAZ/USDA, 2015)
•Rússia•Egito•Venezuela•Hong Kong
•Estados Unidos•Reino Unido•Itália
80,9% Mercado Interno
19,6% Exportação76,6%
carne in natura 12,7% carne processada
BRASIL
Introdução
> Exportador em Volume $ EUA e Austrália
Carne Brasileira : Considerada Média / Baixa - QUALIDADE
Principal Fator da Depreciação da Carne Brasileira pelos
Compradores Internacionais
FALTA DE MACIEZ
Introdução
• Rebanho bovino: raças de origem zebuína
80% raça Nelore
RusticidadeTardiaCarne qualidade inferior
• Produção extensiva a pasto
Introdução
Animais velhos, com aspectos qualitativos e quantitativos
indesejáveis - Maciez
• Literatura: O Nelore pode apresentar carne macia e tem variabilidade genética, ex:
• Existência de animais capazes de produzir carne de alto padrão de qualidade – Touros que tiveram 40% das progênies classificadas como Choice
– Quality Grade (Sainz et al., 2005)
• Bovinos Nelore Mocho selecionados para maciez da carne apresentaram WBSF por volta de 3,0 kgf
– Castro et al., 2014
Estado da Arte
Estado da Arte
• Principais importações do Nelore ocorreram em 1962
• Formação das linhagens atuais da raça Nelore
• Adaptabilidade da raça proporcionou uma rápidadisseminação no território brasileiro– Adaptação– Rusticidade– Fertilidade
A raça Nelore
Estado da Arte
• 1957 Nelore Mocho – Nasceu o bezerro Caburey OB, desprovido de chifres.
• Ausência de chifres:– facilidade de manejo;– evita machucaduras;– Evita acidentes e danos no couro.
Qualidade da Carne do Nelore
POR QUE???
O Brasil é o maior exportador de carne bovina do mundo!!!
Produz carne de qualidade inferior!!!
Qualidade da Carne do Nelore
Criação de bovinos à pasto
Gramíneas de baixa qualidade
Permanência por mais tempo a pasto
Abate em idades avançadas
Alterações composição
muscularCARNE DE
QUALIDADE INFERIOR
Qualidade da Carne do Nelore
Calpastatina
Colágeno
Tipo de fibra
Característica organoléptica de maior influência na aceitação da carne pelo consumidor
Qualidade da Carne do Nelore
MACIEZ DA CARNE
Qualidade da Carne do NeloreCaracterística multifuncional
Idade Genética Alimentação
MACIEZ DA CARNE
sexoVelocidade de resfriamento
MaturaçãoManejo pré
abate
Alta Influência Ambiental
O QUE FAZER? Ferramentas promissoras:
Biotecnicas Moleculares
- Marcadores moleculares SNP (alta densidade) Estudos de associação genômica ampla (GWAS) Seleção genômica ampla (GWS)
Vantagens aumenta a eficiência de seleção genética diminui o tempo gasto no desenvolvimento de linhagens para carne macia maior acurácia de predição do valor genético
Com a genotipagem o painel de SNPs pode ser utilizados para várias características!
Qualquer característica de interesse econômico com baixa estimativa de herdabilidade de efeito genético aditivo direto
O QUE FAZER?
Estudos de Associação Genômica - GWAS
Identificação de genes associados à maciez de carne especificamente para as
raças zebuínas
• Associação de genes com características complexas• Possível após Sequenciamento do Genoma Bovino (The Bovine Hapmap Consortium, 2009)
• Identificação das regiões cromossômicas que afetam tais características fenotípicas
• Análise de enriquecimento de vias baseada em SNPs - Ontologias Gênicas
– objetivo expandir interpretação GWAS (Mapeamento associativo)
SNPs de um fenótipo são enriquecidos em genes que constituem uma via ou têm regulação em comum, o
que permite um melhor entendimento dos mecanismos biológicos envolvidos
poder do mapeamento associativo
identificação marcadores de efeito pequeno
(Subramanian et al., 2005; Weng et al. 2011)
Seleção Genômica – GS
Baseada no valor genético genômico de
cada animal
Obtido partir da soma dos efeitos estimados de marcadores genéticos
Permite a estimação de valores de características
de interesse logo ao nascimento
acelerando o progresso genético de características que se expressam tardiamente na vida do animal
Pedigree +
Dados Produtivos +
Dados Genômicos
Estimação dos efeitos dos
SNPs
Valor Genômico (GEBV)
Valores genômicos para animais SEM dados
produtivos!
Iniciativas Brasileiras• Marca OB / Guaporé Pecuária – desenvolve trabalhos de seleção do Nelore
Mocho há mais de 60 anos
• 2002: OB - Choice: Estudo de Linhagens da raça Nelore Mocho
Crescimento pré e pós desmama, Precocidade de acabamento, Qualidade de carcaça e da carne
• Sainz et al. (2005) identificaram touros cujos filhos produziram carne com os melhores padrões de qualidade.
Projeto OB-Choice - Variação entre touros na maciez da carne da progênie
Pai WBSF, kg %< 3,91 4.24 71%2 3.72 25%3 3.83 37%4 4.96 71%5 4.23 42%6 4.00 42%7 4.20 53%8 3.80 33%9 4.52 56%
10 3.92 45%11 4.22 53%12 4.26 75%13 4.44 73%14 3.36 25% (Sainz et al., 2005)
Iniciativas Brasileiras• Macroprograma 2 Embrapa – “Caracterização e seleção genética para maciez da
carne em bovinos Nelore Mocho” coordenado pela Embrapa Cerrados
• 2009: MP2: caracterizar, multiplicar e selecionar bovinos Nelore Mocho de elevado potencial genético para a característica de maciez
• Castro et al. (2014) identificaram indivíduos portadores de genes favoráveis a maciez da carne e, observou a alta variação dos valores de WBSF dentro da população em estudo• Média: 3,97 kgf (máximo: 8,84 kgf e mínimo: 1,53 kgf)• Verificou ausência de correlação genética: maciez x carcaça e crescimento
Iniciativas Brasileiras
• Programa de Qualidade Nelore Natural: garantir o padrão de carcaças bovinas, sistemas de cria, sistemas de engorda e reprodutores da raça Nelore
• Bases lançadas em 1999 – Carlos Viacava• Orientações do Prof. Dr. Pedro Felício - Unicamp
• Objetivo: Oferecer ao mercado um produto diferenciado por sua padronização e qualidade controlada.
• Valorização e divulgação da raça Nelore como principal marca de carne no Brasil.
Iniciativas Brasileiras
• Rymer Tullio (Embrapa Pecuária Sudeste): Estratégia de cruzamento e de manejo para melhorar a eficiência de produção e a qualidade da carne bovina no Brasil
• Sarah Bonilha (Instituto de Zootecnia): Eficiência na utilização de alimentos, qualidade de carne e composição da carcaça em animais jovens da raça Nelore
• Lucia Galvão (Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho): Estudo genético quantitativo da qualidade de carcaça e da carne em bovinos da raça Nelore
• Luciana Regitano (Embrapa Pecuária Sudeste): Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore
Objetivo
“Caracterização e seleção genética para maciez da carne em bovinos Nelore Mocho” (2009)
Apresentar os resultados do Projeto de MacroPrograma 2 (MP2) da Embrapa Cerrados:
Interagindo no sentido de atingir os objetivos específicos do projeto estratégico para a cadeia
produtiva de carne no Brasil
Equipe multidisciplinar e interinstitucional
Equipes ExecutorasProjeto executado graças a contribuição inequívoca de:
• Quatro unidades da Embrapa (CPAC, CNPAF, CPPSE e CNPGC),
• Duas Universidades Federais (UFG e UFU),
• Duas Universidades Estaduais (USP e UNESP),
• Uma empresa privada (Guaporé Pecuária – Marca OB),
• Duas Universidade americanas (University of Wisconsin/Madison e University of California/Davis)
• Uma Associação: Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP)
Equipes Executorase sob envolvimento dos profissionais de varias subareas:
Embrapa• Artur Rosa (CPAC)• Cláudio Magnabosco (CPAC)• Eduardo Eifert (CPAC)• Luciana Regitano (CPPSE)• Marcos Fernando Costa (CNPAF)• Renata Nassu (CPPSE)• Rodrigo Fragoso (CPAC)• Rymer Tullio (CPPSE)
Guaporé Pecuária• Ovídio Carlos Brito • Fernando Manicardi• Angelo Nakagawa
UNESP
• Fernando Baldi (UNESP)
University of California
• Roberto D. Sainz (UCDavis)
University of Wisconsin
• Guilherme Rosa (UW-Madison)• Fernando B. Lopes (UW-Madison)
ANCP
• Raysildo Lôbo (ANCP)
UFG• Cristiano Prado (UFG)• Letícia M. de Castro (UFG)• Mariana Mamede (UFG)
UFU
• Carina U. Faria (UFU)
Objetivos Específicos
• Análise genética para maciez de carne e suas relações com as características produtivas em bovinos Nelore Mocho
• Genética quantitativa• Mamede et al. (2016) – in press
• Identificação de SNPs e rotas metabólicas associadas à maciez da carne em bovinos Nelore Mocho
• GWAS e Ontologias Gênicas• Castro et al. (2016) – in press
• Utilização de Diferentes Modelos de Regressão para Seleção Genômica para Maciez da Carne em Bovinos Nelore Mocho, Brasil
• Seleção genômica para maciez da carne• Lopes (2015) e Magnabosco et al. (2016) – in press
Apresentar os resultados de três sub-projetos do MP2, nessa apresentação:
• Histórico base de dados- banco de dados fenotípico: três abates (2005, 2008 e 2012) - Maciez WBSF (Warner-Bratzler shear force),- raça Nelore Mocho, PO, genealogia completa
• Programa OBchoice (Estudos de linhagens/qualidade de carne e carcaça)- Abate 1 (232 Fenótipos WBSF)- Abate 2 (145 Fenótipos WBSF)
• Macroprograma 2 - Embrapa Cerrados (Base população OBChoice)- Abate 3 (83 Fenótipos WBSF)- população desenhada a partir de fenótipos extremos para maciez da carne
Materiais e Métodos
Materiais e Métodos
•Fenotipagem para maciez – força de cisalhamento (460 animais)
•Análises quantitativas (Toda a população: 460 animais – Abates 1, 2 e 3)
•Genotipagem (427 animais)
•Controle de Qualidade (amostras e marcadores moleculares)
•Análises Genômicas (GWAS, GO, GS)
Materiais e Métodos• Três abates (2005, 2008 e 2012) em frigorífico comercial
• Terminação em regime de confinamento
• Os animais abatidos quando atingiam, no mínino, 5 mm de espessura de gordura na costela e/ou peso acima de 500 kg
Idade média de 24 meses
Idade e Acabamento Grande influência na maciez
Materiais e Métodos• Utilizadas amostras do músculo Longissimus dorsi para medição da maciez da
carne por Warner-Bratzler Shear Force
Laboratório de Análises de Carne - Embrapa Pecuária Sudeste
Materiais e MétodosAs análises genético-quantitativas bi-características
• Características Produtivas (P120, P210, P365, P450, AOL, EG, EGP8 e WBSF)
e+pZ+mZ+aZXβ=y 321
- y: vetor de observações de cada uma das variáveis
- X, Z1, Z2 e Z3: matrizes de incidência que associam y aos efeitos fixos, efeitos genéticos aditivos diretos e, exceto para
P450, AOL, EG, EGP8 e WBSF, os efeitos genéticos maternos e efeitos de ambiente permanente, respectivamente,
- β: vetor dos efeitos fixos (grupo de contemporâneos e idade da vaca ao parto (exceto para P450, AOL, EG, EGP8 e WBSF),
e a idade do animal (somente para as características de carcaça) como covariável),
- a: vetor de efeitos genéticos aditivos diretos aleatórios,
- m: vetor de efeitos genéticos aditivos maternos aleatórios,
- p: vetor de efeitos de ambiente permanente maternal aleatórios,
- e é o vetor dos efeitos aleatórios residuais.
(Mamede et al., 2016 – in press)
Materiais e Métodos• Características Reprodutivas (PE365, PE450, P365, P450, EG EGP8, IPP, PAC e STAY)
e+ZaXβ=y
- y: vetor de observações de cada uma das variáveis;
- X: matriz de incidência que associa β com y,
- β: vetor dos efeitos fixos (grupo de contemporâneos para todas as características e idade da vaca ao parto
somente para P365 e P450),
- Z: matriz de incidência dos efeitos genéticos aditivos diretos,
- a: vetor de efeitos genéticos aditivos diretos aleatórios,
- e: vetor dos efeitos aleatórios residuais.
- Características da carcaça: idade do animal como covariavel
- Covariâncias residuais entre WBSF e as características: PAC, IPP e STAY*, foram fixadas em zero
(Mamede et al., 2016 – in press)
Materiais e Métodos
- GIBBS2F90
- 1.000.000 iterações, descarte das 500.000 primeiras, intervalo amostral a cada 50
- Estimativas a posteriori: POSTGIBBSF90
- As estimativas dos parâmetros genéticos foram obtidas como a média a posteriori dos respectivos
componentes de variância.
- Os intervalos de credibilidade das marginais posteriores foram obtidos com 95% de credibilidade.
As análises genético-quantitativas bi-características
• Características Produtivas (P120, P210, P365, P450, AOL, EG, EGP8 e WBSF)
• Características Reprodutivas (PE365, PE450, P365, P450, EG EGP8, IPP, PAC e STAY)
(Mamede et al., 2016 – in press)
Genotipagem: 427 produtos (+ pais e mães)
- BovineHD Beadchip (777k SNPs) (Illumina Inc.)
- Chips GGP-Indicus (77k SNPs) (GeneSeek – Neogen Corp.)
IMPUTAÇÃO DE GENÓTIPOS
Controle de Qualidade – Amostras DNA e Marcadores SNP
Call Rate (eficiência genotipagem): marcadores (90%) e amostras (80%)
Heterozigosidade média (± 3σ)
Desvios das proporções do equilíbrio de Hardy-Weinberg: p < 0,01
Frequência alélica mínima: MAF < 0,01
Verificação estratificação populacional
Materiais e Métodos
(Castro et. al, 2016 – in press)
Estudos de Associação Genômica Ampla (GWAS)
- Método P3D/EMMAx (Zhang et al., 2010; Kang et al., 2008)- Implementado: TASSEL 5.0 (Bradbury et al. 2007) - Modelo misto:
Materiais e Métodos
eZuXy - y : vetor de fenótipos para WBSF (n x 1)- X: matriz de incidência que relaciona β a y- β: vetor de efeitos fixos (sexo, grupo de abate e os marcadores SNP)- Z: matriz incidência dos efeitos aleatórios que associa u com y- u: efeito aleatório (n x 1) do modelo misto- e: vetor (n x 1) de resíduos
u ~N(0, K) e e ~N(0, I)
Assume-se que:
- K: matriz (n x n) de parentesco genômica derivada dos marcadores
- : variância genética aditiva
- é a variância residual e I a matriz identidade (n x n) apropriada
(Castro et. al, 2016 – in press)
Materiais e Métodos
Localizado na sequência genômica do gene
Localizado em 20 kbp - 5’ e 3’ finais (primeiro e último éxon)
capturar regiões reguladoras e funcionais próximas aos genes
Gene Ontology Consortium (GO)
InterPro (IP)
Enciclopédia de genes e genomas de Kyoto (KEGG)
(Ashburner et al., 2000)
(Mulder et al., 2003)
(Kanehisa et al. 2002)
• SNP atribuído ao gene se:
• Gene significamente associado com WBSF: se pelos menos um SNP p-valor < 0,01
• Bancos de dados - definir conjuntos de genes funcionais associados à característica
Materiais e MétodosAnálise de enriquecimento de vias metabólicas – Ontologias gênicas
- SNP-based gene-set enrichment analysis (SNP-GSEA)
(Castro et. al, 2016 – in press)
Seleção Genômica (GS)
Modelos de predição genômica:
Bayesian Ridge Regression
Bayesian Lasso
Bayes A / Bayes B / Bayes Cπ
Modelo estatístico geral:
K
1jjj eazXb1μy
y : vetor n × 1 de características fenotípicas;µ é o intercepto;X: matriz de incidência relacionada aos efeitos fixos em b;K: número de marcadores ajustados; : vetor n × 1 que denota os genótipos dos animais para o marcador j; : efeito do marcador j; e: vetor dos efeitos residuais
Validação cruzada
- Leave-One-Out (LOOCV)- comparar habilidade predição de diferentes
modelos- acurácia de predição: correlação entre valores
genômicos e fenotípicos
Materiais e Métodos
Melhor adequação aos dados > Acc no GEBVs
(Lopes, 2015)
ResultadosFenotipagem maciez – toda a população (Abates 1, 2 e 3)
TABELA 1 - Estatística descritiva da característica de força de cisalhamento (WBSF – Warner-Bratzler shear) do Longissimus dorsi em bovinos da raça Nelore Mocho
Característica N Média (kgf) DP (kgf) CV (%) Valor Mínimo
Valor Máximo
WBSF (kgf) 460 3,88 1,35 34,82 1,07 8,87
N: nº de animais, DP: desvio padrão, CV: coeficiente de variação,
coeficiente de variação (34,82%) relativamente alto
população experimentalmente delineada de forma a manter certo
grau de heterogeneidade
(Magnabosco et al., 2014)
ResultadosFigura 1. Histograma de frequência relativa e percentual acumulativo para WBSF.
limite proposto literatura carne macia: Shackelford et al. (1991) 4,6 kgf; Mackeith et al. (1985) 4,5 kgf; Felicio
(1997) 5 kgf, Boleman et al. (1997) 3,5 kgf
51% - WBSF abaixo de 3,80 kgf: maior parte com WBSF bem próximos aos menores valores limiar
para maciez
(Magnabosco et al., 2014)
Resultados
Características Média Moda Mediana DP IC 2,5% IC 97,5% Genética
P120 x WBSF -0,70 -0,86 -0,80 0,26 -0,95 0,09P210 x WBSF -0,78 -0,96 -0,90 0,23 -0,98 -0,22P365 x WBSF -0,44 -0,70 -0,58 0,43 -0,96 0,55P450 x WBSF -0,22 -0,35 -0,26 0,34 -0,80 0,50AOL x WBSF -0,09 -0,14 -0,10 0,45 -0,94 0,95EG x WBSF -0,12 -0,19 -0,12 0,39 -0,81 0,63
EGP8 x WBSF -0,10 -0,12 -0,11 0,30 -0,68 0,46 Residual
P120 x WBSF -0,12 -0,15 -0,13 0,11 -0,33 0,09P210 x WBSF -0,12 -0,14 -0,13 0,13 -0,33 0,16P365 x WBSF 0,10 0,04 0,05 0,30 -0,32 0,97P450 x WBSF -0,09 -0,05 -0,08 0,15 -0,40 0,18AOL x WBSF -0,06 -0,09 -0,06 0,11 -0,27 0,17EG x WBSF -0,01 0,00 -0,01 0,05 -0,11 0,09
EGP8 x WBSF -0,02 -0,02 -0,02 0,08 -0,16 0,14
Tabela 2. Estimativas de médias posteriores das correlações genéticas e residuais entre as características de crescimento, carcaça e maciez da carne em bovinos Nelore Mocho, machos e fêmeas.
Análises Genético-Quantitativa – toda a população (Abates 1, 2 e 3)
(Mamede et al., 2016 – in press)
ResultadosAnálises de Associação Ampla do Genoma - GWAS
Quantil – Quantil (Q-Q plot) - ajuste do modelo e associações verdadeiras - valores observados distanciam dos esperados com o aumento do nível de significância - desvio generalizado - inflação do teste
FIGURA 2 - Gráfico quantil-quantil (Q-Q plot), da distribuição dos valores observados e esperados para o estudo de associação genômica para maciez da carne em bovinos Nelore Mocho
Modelo ajustado aos dados:valores observados encontram-se próximos a diagonal, distribuídos de modo uniforme
Evidências de associações verdadeiras: valores observados distanciaram-se da distribuição esperada sob a hipótese
nula
(Castro et. al, 2016 – in press)
Cromossomos SNPs Significatovos(p < 0,0001)
2 13 36 17 18 3
10 213 215 116 317 418 319 220 521 525 327 528 2
Tabela 4 - Número de SNPs significativos (p < 0,0001) por cromossomo para a maciez da carne em bovinos da raça Nelore Mocho > nº SNPs associados:
cromossomos 20, 21 e 27
p < 0,0001 46 SNPs Significativos
Explicaram entre 4,15% até 6,64% da variância fenotípica
Não existe um gene de efeito maior por trás da maciez da carne
Vários genes em diferentes loci dentro do genoma de efeito
pequeno
Características Quantitativas Complexas
(Castro et. al, 2016 – in press)
ResultadosEnriquecimento de vias metabólicas baseada em SNPs - – Ontologias gênicas
Geradas listas: 22.365 genes (completa e sem repetição)
1.010 genes significativos
Identificados: 22 termos GO (vias) e 2 temas InterPro (vias)
Com genes significativamente associados à maciez da carne
(Castro et. al, 2016 – in press)
ResultadosTermos GO (vias gene ontology) significativos com genes associados à maciez, destaque para:-Atividade da proteína tirosina-quinase (GO:0004713)-Atividade da proteína serina/treonina quinase (GO:0004674)- Cascata MAPK (GO:0000165)
Ligadas ao crescimento celular
Auxilia na ligação dos fatores de crescimento com seu receptor específico na parede celular
Crescimento Muscular (relacionado a fatores de crescimento) vs. Qualidade da carne – Divergências:
Koohmaraie et al., 2002 – Crescimento Muscular: não causa efeito no processo de maciez
Duclus et al., 2007 - estudo diferentes taxas de crescimento (altas e baixas) evidências de relação da velocidade do desenvolvimento muscular e a maciez
(Silva et al., 2009)
Resultados- Ligante ao íon cálcio (GO:0005509)
Cálcio – grande papel no Sistema Calpaína-Calpastatina
Sistema de maior importância na maciez da carne relacionado degradação das proteínas
miofibrilares
- Processo metabólico lipídico celular (GO:0044255)
Síntese de ácidos graxosconversão do acetil-CoA em malonil-CoA pela atividade
da acetil-CoA carboxilase
enzima está fortemente correlacionada deposição de
gordura nos animais
• Deposição Gordura na Carcaça - Evita encurtamento pelo frio (Cold-Shortening)• Marmoreio – Presença de gordura entre as fibras• Deposição de gordura no tecido muscular – quebra feixes de colágeno do perimísio
(maciez da carne) (Webb e O’Neil, 2008; Wood et al., 2008; Rosato et al., 2010)
(Koohmaraie, 1994; Alves e Mancio, 2007; Geesink et al., 2006; Andrighetto et al., 2006)
ResultadosssGWAS – single-step genomic BLUP
(Peripoli et al., 2016 – in press)
• GWAS: genótipo pais e avós, mesmo sem fenótipo (matriz H)
• Variância calculada a cada janela de 1 Mb
• Resultado: 19 janelas explicaram mais de 1% da variância
• Dentre janelas, genes relacionados à:
• Gene CAST (Calpastatina) encontrado próximo à região de maior variância genética para maciez da carne
• Receptores lipídicos intracelulares e Proteínas ligante ao ácido graxo - OSBPL1A (BTA24) and FABP7 (BTA9)• Regulação crescimento do filamento da actina - CAPZA1 (BTA3)• Marmoreio - TAGLN2 (BTA3)• Ligante ao íon cálcio e fosfolipídio cálcio-dependente - MCTP1 (BTA7)• Codificação da Miosina III - MYO3B (BTA2)
Resultados
Encontrado Genes e SNPs em comum:
- GWAS emmax + genes das vias ontológicas + ssGWAS
Consistência – qualidade fenótipo e genótipo
Análise de Expressão Gênica
Em andamento na Embrapa
Cerrados
(Fragoso, 2016)
Resultados
Figura 4. Estimativa de correlação entre a maciez da carne e o valor genético molecular predito pelos modelos Bayes RR, Bayes LASSO, Bayes A, Bayes B e Bayes Cπ utilizando marcadores amostrados pelo GWAS (p-valor)
todos os modelos apresentarem uma estimativa de correlação positiva
Bayes Bmelhor ajuste do modelo
(Magnabosco et al, 2016 – in press)
GS – Seleção Genômica
Resultados
• GEBVs de 632 animais
- produtos MP2, - pais, mães, avós- Touros consagrados de Centrais- Touros participantes do Nelore Brasil
2.86
3.08
3.30
3.53
3.75
3.97
4.20
4.42
4.64
4.87
5.09
5.31
5.53
0.00
10.00
20.00
30.00
40.00
50.00
60.00
70.00
80.00
90.00
100.00
0.00
0.10
0.20
0.30
0.40
0.50
0.60
0.70
0.80
0.90
1.00
Freqüência % cumulativo
GEBV, WBSF
Freq
üênc
ia
% C
umul
ativ
o
Figura 5. Histograma da frequência relativa e percentagem cumulativa dos valores genômicos (GEBV) para a maciez da carne (WBSF) de bovinos Nelore mocho
(Magnabosco et al, 2016 – in press)
Publicações
ASAS 2013, Indianapolis-USA
J. Anim. Sci. Vol. 91, E-Suppl. 2/J. Dairy Sci. Vol. 96, E-Suppl. 1
WCGALP 2014, Vancouver-Canada
J. Anim. Sci. Vol. 93, Suppl. s3/J. Dairy Sci. Vol. 98, Suppl. 2
ASAS 2015, Orlando-USA
Aceito para publicação
Journal of animal Science - 2016
J. Anim. Sci Accepted Paper, posted 04/28/2016. doi: 10.2527/JAS.2016-0279
Próximos passos:
– GEBVs: Acc variabilidade genética
– SNPs identificados: conhecemos a proporção da variação
Aumentar PopulaçãoAumentar
– Validação os resultados obtidos pelo MP2-Embrapa
MP3“Estudos de associação e seleção genômica em características da carne e da carcaça em
bovinos de corte da raça Nelore”
Estratégias de Pesquisa e Validação
Perspectivas futuras
Análises de expressão gênicaEm andamento
Possibilidade da criação de chip temático para maciez da Carne
Capitalizar toda variação SNPs e genes ligados ao GWAS, às vias ontológicas e ao GS
Parceria Embrapa-Neogen/Geneseek
Em construção o chip personalizado em Lincoln – Nebraska – ( 2º semestre 2016)
Consequente aplicação nos programas de melhoramento genético
Resultado das Análises Genômicas:
• Regiões do Genoma associadas à maciez• Genes e Marcadores Moleculares
associados à Maciez• Marcadores com alta acurácia de seleção
genômica – animais com GEBVs indicados
Captar toda a variação genética das análises Chip Customizados –
Marcadores com alta acurácia para maciez
Seleção Genômica, animais genotipados – Valor genômico para
maciez com alta acurácia
GEBVs (DEPs)
Maciez com alta
acurácia
DEP Genômica para maciez – alta acurácia
Programas de Melhoramento Seleção e utilização de touros
com DEP para maciez
Realidade no Campo – Fazendas
Valorização da carne Nelore macia pelos frigoríficos
Valorização dos corte cárneos Valor agregado real da carcaça - premiação
Perspectivas futuras
Marcadores moleculares permitirão uma seleção mais acurada
DEPs genômicas para maciez da carne : realidade
Seleção para maciez da carne em programas de melhoramento genético
Aumento da competitividade no mercado internacional
Remuneração justa ao produtor de carne de qualidade
Considerações Finais
A seleção para maciez não afetará a seleção para características de carcaça
O Nelore é capaz de produzir carne de qualidade e com maciez
Aumento da competitividade da cadeia produtiva da carne Retorno Real para o produtor
Fazenda Barreiro – Silvânia/GO
Agradecimentos