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本日の予定 • Sagace
– アクセス解析 – 分生のブースタイトル決め – 新規ファセット項目“学会”追加の是非について – 新規ファセット分類(医薬品)に追加するデータベースについて
– 日本国外のDBの追加について – Sagace独自に追加するDBについて
• 医薬基盤研内のデータのRDF化 – 進捗報告・相談
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新規ファセット項目 “学会”追加の是非について
• ターゲットとなるユースケース – 大学・研究機関の研究者,製薬会社の医薬情報担当者
• モチベーション – 学会発表する研究者や,学会に出展する製薬企業の担当者が,過去の学会情報を検索して情報を得たい。
– 論文にはなっていないが,学会で発表された事項を調べたい。
新規ファセット項目 “学会”追加の是非について
• インデックス済みのDB追加候補 – 学会名鑑
• 未インデックスのDB追加候補 – 国際医学会議一覧表 – 日本医学会 Onlineライブラリーシンポジウム – 日本医学会 Onlineライブラリーフォーラム – 一般財団法人 国際医学情報センター 学会情報データベース – UMIN-学会集会の一覧 – 日経メディカルオンラインー学会カレンダー
• 懸念事項 – 独自のインデックスを作る必要がありそう。ただ,医薬系に絞ってしまえば,こちらで対応可能である。
新規ファセット分類(医薬品)に追加するデータベースについて • 実際の結果をみてから判断したほうがよいのでは? – 内部版のみファセット分類と項目変更 – メンバーの意見を伺う(特に今週1週間) – 適宜修正,更新
日本国外のDB追加について • NBDCでインデックス済みの英語DB – Gene(Entrez Gene Human) – Gene(Entrez Gene Mouse) – UniProt(The Universal Protein Resource) – Gene Wiki Wikiproject(MCB)
進捗報告 • JSON-LDクローラーの作成 • 実験医学の原稿の作成 – Sagace – Google等の検索Tips(http://bit.ly/1upkuE3)
• 分子生物学会のブース要旨,トーゴーの日ポスター要旨の作成
• 新規追加対象DBの調査 – 小児医療のリンク集 – バイオバンク
医薬基盤研内のデータのRDF化 • アプリケーション実装に向けて,疾患モデル小動物研究室の研究員の方々とMTG – 外部のDB連携より,基盤研内部のデータを参照できる方が,エンドユーザーには良いのでは?とのご提案
– 内部全てのDBをRDFにするにはコストがかかる – RDFを使用してのデータベース統合としての利点を示すにはそれだけでは不十分?
目的・意識すること • RDFとSPARQLによるデータベース統合の意義を示す – 外部DBのSPARQLエンドポイントから実験動物に関連する情報の取得
– 基盤研内部のDBのRDF化と実験動物に関連する情報の取得
• 実際に研究に役立つアプリケーション • 恒久的に更新される体制