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Concepción Campos Asensio Octubre 2016 BibliotecariaHospital Universitario de Getafe
PubMed
Iniciación Avanzado
Qué es PubMed
Historia
Acceso
Búsqueda sencilla:Mapeo automáticoFiltrosOperadores booleanos
Visualización de los resultados
Manejo de los resultados
Búsqueda avanzada Personalización
Pantalla de búsqueda avanzada
Búsqueda booleana con etiquetas de campos
Búsqueda con descriptores MeSH
Configuración de una cuenta
personal en PubMed
Definición de filtros para los resultados
Salvar los resultadosde mis búsquedas
Salvar estrategias yCreación de alertas
•La mayor base de datos mundial de ciencias de la salud, producida por la NLM
•Indiza 5.642 revistas de ámbito mundial (30.000 revistas editadas en todo el mundo) en 40 idiomas (91% en inglés)
•La cobertura temática de ciencias de la salud, especialmente de biomedicina, abarcando los campos de la medicina, enfermería, odontología, veterinaria, sistemas de salud, ciencias preclínicas, salud pública,…
•Recoge unos 22,5 millones de referencias bibliográficas, desde 1946 hasta el presente
•83% con resumen escrito por los autores de los artículos
•Los artículos son indizados con el tesauro MeSH
• PubMed es un motor de búsqueda de libre acceso a la base de datos MEDLINE • PubMed (25 millones de citas) ofrece servicios añadidos para optimizar las búsquedas
como:Artículos de revistas del repositorio de PMC con acceso al texto completo de artículos No solo citas de artículos… ahora también incluye referencias de libros y sus capítulos de libros de NCBI BookshelfOpciones de búsqueda:
Avanzada Filtros metodológicos (“Clinical Queries” y “Special Queries”)Artículos relacionados o información en “Discovery Ads”Buscador de citas (“Single Citation Matcher”)
Personalización con MyNCBI que permite:Salvar búsquedasGuardar resultadosRecibir actualizaciones automática de las búsquedas por correo electrónico Personalizar preferencias creando filtros propiosIdentificar suscripciones y enlazar al texto completoGestionar la actividad reciente
• Es la plataforma de acceso a MEDLINE más utilizada pero no la única
25(22,5
Ejemplo otitis pág. 1 y 50
1.8 millones de citas,la mayoría sin resumen, publicadas con anterioridad a1965
Hay artículos de revistas que se indizan selectivamente (p. ej.: geología)
Se les asigna la etiqueta [PubMed]
Out-of-scope articles
PMC
Books & Documents
Ventana deVentana de búsqueda básicabúsqueda básica
141414
Clinical Queries:Clinical Queries: Buscador especializado que tiene incorporados filtros metodológicos: Buscador especializado que tiene incorporados filtros metodológicos: - Clinical Study CategoryClinical Study Category- Systematic ReviewsSystematic Reviews- Medical GeneticsMedical Genetics
Pantalla Advanced Search Builder
OTROS RECURSOS / More ResourcesOTROS RECURSOS / More ResourcesMESH Database: permite buscar por descriptores/ palabras clave (MESH) que la base de datos ha asignado a los referencias.
Journal Database: incluye todas las revistas indizadas en PubMed, y se pueden localizar por: título, abreviatura, ISSN, especialidades…
• Acrónimo de Medical Subject Headings (MeSH)• Vocabulario controlado de términos biomédicos que describen el
contenido de cada artículo que se ingresa en la base de datos Medline
• Es una característica distintiva de MEDLINE• Aproximadamente 27.500 términos médicos• Revisados anualmente• Organizados de manera polijerárquica• Major/minor terms• 1 referencia bibliográfica = 12 términos del Tesauro
MeSH Browser disponible en: http://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html
Coletti MH, Bleich HL. Medical subject headings used to search the biomedical literature. J Am Med Inform Assoc. 2001 Jul-Aug;8(4):317-23. Erratum in: J Am Med Inform Assoc 2001 Nov-Dec;8(6):597. PubMed PMID: 11418538; PubMed Central PMCID: PMC130076.
Estructura jerárquica de más general a específico:
Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy
: ATM, Filtros y operadores booleanos
1 Identificar los conceptos claves de nuestra búsqueda
2 Escribir nuestros términos o conceptos claves (en inglés) en la ventana de búsqueda.
3 Pinchar en botón Search
4 Borrar
Auto-Suggest: Podemos seleccionar entre las sugerencias que nos ofrece
¿?
BÚSQUEDA BÁSICA
Colon cancer
Localiza cualquier término/s presente/s en las referencias
(título, resumen, materia… y mapea)
BÚSQUEDA BÁSICA
Colon cancer
PubMed automaticamente comprueba lo que hemos escrito frente a varios índices en el orden siguiente:
Temática (MeSH)Revista Autor
Si lo encuentra, nos buscará por el término del MeSH y en texto libreSi no lo encuentra lo divide en partes y vuelve a intentar el mapeo de cada parteCualquier término que no pueda ser encontrado, lo buscará en ALL FIELDS
272727
FOETUS
Estrategia de búsqueda con mapeo del término
Lo que hemos escrito en la ventana de búsqueda
Cuando encuentra una correspondencia temática
30PubMed for Trainers
¡Se detiene el proceso!
Revised 2015/09
Automatic Term Mapping
Si PubMed no encuentra una correspondencia en los MeSH, buscará por:
TemáticaRevistaAutor
31PubMed for Trainers Revised 2015/09
32PubMed for Trainers
¡El proceso se detiene!Revised 2015/09
Si PubMed no encuentra correspondencia en la lista de revistas, busca por:
TemáticaRevistaAutor
33PubMed for Trainers Revised 2015/09
Automatic Term Mapping
34PubMed for Trainers
¡El proceso se detiene!Revised 2015/09
353535
Colon cancer
363636
Search details: Nos muestra la verdadera estrategia de búsqueda
373737
Estrategia de búsqueda con mapeo del término
Lo que hemos escrito en la ventana de búsqueda
383838
Mapeo automático de términos
Colon cancer
Introducir la palabra o palabras dentro de la ventana de búsqueda y pulsar el botón SEARCH o la tecla ENTER
Recupera los registros en los que encuentra correspondencia con el término
Vamos a intentar esta búsqueda:Ejemplo
Buscar artículos sobre la indigestión y el dolor abdominal
Conceptos claves son:indigestionabdominal pain
PARTE CENTRAL:Referencias obtenidas se muestran de 20 en 20, en
formato Summary y ordenadas empezando por las citas más recientes introducidas en PubMed
Similar ArticlesLas referencias tienen el enlace “Similar Articles”
Es un algoritmo de búsqueda en el que PubMed compara palabras del Title y Abstract de cada cita, así como los encabezamientos MeSH asignados.Los resultados se muestra en orden de relevancia y no por fecha
494949
Results by year
PMC Images Search
505050
Hay muchas razones para refinar nuestra estrategia. Si queremos:
Excluir idiomas que no entendemosBuscamos artículos que han sido publicados en cierto periodo de tiempoRecuperar artículos referentes a una población específica Buscar sólo estudios de investigación clínica, ensayos clínicos, revisiones,…
Es posible aplicar más de un filtro
Sólo los filtros más populares aparecen por defecto. Si queremos ver mas:Show additional filters
Tipos de filtros
Article Type Text availability PubMed Commons Publication Dates Species (Humans or Animals) Languages Sex Subjects Journals categories Ages Search Field
Usando operadores BooleanosAND, OR, NOT
stress AND depressiondepression OR sadness OR unhappy depression NOT manic
salmonella mayonnaise
Intersección: Selecciona solo los documentos que contienen los términos indicados
42Salmonella
AND Mayonnaise
199Mayonnaise 70.169Salmonella
ResultadosTérmino
Unión: Selecciona los documentos que contienen alguno o todos los términos indicados
Football OR hockey OR soccer
Exclusión: Excluye los documentos que contienen el término indicado.
Arthritis NOT letter
En PubMed el operador AND es el que aplica por defecto
Se procesan de izquierda a derecha
Los operadores booleanos se escriben en mayúsculas
salmonella AND hamburger OR eggs
salmonella AND (hamburger OR eggs)
Neurol*NeurologyNeurologíaNeurologicNeuroléptico, etc…
Ejemplo: buscar brain cancer y brain cancer*
ASTERISCO * Permite recuperar todos los términos que poseen la misma raíz
El uso del asterisco deshace el mapeo automático del término
707070
History
717171
727272
737373
Página de resultados
747474
Filtros
Discovery Adds
Las citas se muestran en formato Summary, 20 por página y ordenadas
de más recientesintroducidas en PubMed
Seleccionamos el formato Abstract
Formato Abstract
Entramos en el PubMed personalizado del Hospital de Getafe
Visualizamos la referencia en formato Abstract
Pinchamos sobre el icono “Localizar en mi Biblioteca”
Acceso al texto completo desde MEDLINE/PubMed
Acceso al texto completo desde MEDLINE/PubMed1era. situación: Aparece el texto completo del artículo
Pinchando sobre el icono PDF, veremos el artículo en este
formato
Pinchamos sobre el icono “Localizar en mi Biblioteca”
PubMed Hospital de Getafe: Visualización en formato “Abstract”
Acceso al texto completo desde Acceso al texto completo desde MEDLINE/PubMedMEDLINE/PubMed2da. Situación: No disponemos del acceso 2da. Situación: No disponemos del acceso al formato electrónicoal formato electrónico
25617399
Acceso al texto completo desde MEDLINE/PubMed
3ra. Situación: Ya ha sido solicitado 3ra. Situación: Ya ha sido solicitado previamente por otro usuariopreviamente por otro usuario
878787
Cortar-pegar la referencia en formato Vancouver
888888
• File:File: Permite guardar las referencias como archivo.Permite guardar las referencias como archivo.• E-mailE-mail: : Permite enviar por correo-e las referencias.Permite enviar por correo-e las referencias.• ClipboardClipboard: Portapapeles temporal donde vamos enviando las referencias : Portapapeles temporal donde vamos enviando las referencias
para luego gestionarlas de forma conjunta. El número máximo que se puede para luego gestionarlas de forma conjunta. El número máximo que se puede guardar es de 500 referencias.guardar es de 500 referencias.
• Opciones avanzadas: Opciones avanzadas: Collections Collections que Permite guardar las referencias en que Permite guardar las referencias en MyNCBI y MyNCBI y My Bibliography (necesario tener cuenta personal en MyNCBI)My Bibliography (necesario tener cuenta personal en MyNCBI)..
• Opción no disponible: Opción no disponible: OrderOrder
898989
Clipboard
909090
Clipboard
919191
Clipboard
Menú desplegable “Send to”
Preguntas…