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Dr. Eduardo Terranova DMTVDr. Eduardo Terranova DMTV
Asesor en Transferencia Tecnológica
13/12/2016 1www.eduardo-terranova.com
Breves conceptos sobre la GTTEl mundo productivo tiene características de
complejidad sin precedentes.
Nunca como en la actualidad, se han combinado de manera tan profunda, universos que en otros tiempos manera tan profunda, universos que en otros tiempos eran independientes e inconexos.
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La producción agrícola ganadera, moderna, así como la industria alimentaria y agroindustria en general, requieren de sofisticados sistemas de control y análisis en sus procesos productivos y de biotransformación.en sus procesos productivos y de biotransformación.
Estos procesos son extensos, complejos y sobre todo polifacéticos, pues abarcan factores como: naturaleza, biología de los organismos involucrados y tecnologías de transformación para los productos finales.
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Estos sectores cada vez mas interrelacionados tienen sus requerimientos propios de control de eficiencia y eficacia.
Se requiere conocer componentes biológicos, Se requiere conocer componentes biológicos, características precisas de los componentes químicos.
Es necesario detectar presencia de agentes biológicos contaminantes, adulterantes y factores que afectan la calidad de los productos o materias primas. Sin mencionar factores de inocuidad y bioseguridad exigidos en forma creciente en el mundo
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Ciclo de trabajo tipo y tecnologías
involucradas Elegiremos como ejemplo, el principal rubro de
producción y exportación del Uruguay para hacer el seguimiento de la cadena tecnológica involucrada directa o indirectamente.directa o indirectamente.
Producción carne bovina:
Ciclo completo incluyendo productos de exportación.
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Producción GanaderaPara ser sintéticos, comenzaremos a considerar los
procesos productivos a partir de las unidades ganaderas puestas en campo productivo. Esto implica que obviaremos los segmentos anteriores que implican que obviaremos los segmentos anteriores que implican la selección, producción de gametos y embriones , actividad de cabañas y sus tecnologías implicadas. Estas serán tratadas en otra instancia
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Controles de factores que requieren Tecnologías
tecnologías específicas , sin considerar sanidad
animal
Control de calidad de suelos y pasturas: análisis de nutrientes en ambos medios.
Control de praderas y raciones suplementarias en Control de praderas y raciones suplementarias en sistemas de producción intensiva
Controles de suelos, silos y ensilajes: Micotoxinas
Controles de Pesticidas en suelos agua y forrajes
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Tecnologías correspondientes Tecnologías de análisis elemental: espectrofotometría de
absorción atómica (AA), espectrofotometría de plasma acoplado (ICP), cromatografía liquida de alta eficiencia (HPLC), cromatografía iónica (IC), espectrometría de masas (LC-MSMS; qTOF) y espectrometría de masas (LC-MSMS; qTOF) y Cromatografía Preparativa.
Análisis genético automático (secuenciación, genotipado STR y SNP) y PCR cuantitativa en tiempo real (OGMs)
Secuenciación Masiva de Nueva Generación (NGS), como gran capítulo de desarrollo tecnológico mas reciente.
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Al enunciar tecnologías, estamos mencionado de hecho, diferentes laboratorios especializados expertos en cada una de ellas.
En efecto así ocurre. Existen diversos laboratorios En efecto así ocurre. Existen diversos laboratorios diseminados por el territorio que realizan análisis concretos y especificos.
Resulta obvio que no encontraremos éstos equipamientos en un establecimiento ganadero.
13/12/2016 9www.eduardo-terranova.com
¿Como definimos transferencia de
tecnología?“La transferencia de tecnología es el proceso en el que
se transfieren habilidades, conocimiento, tecnologías, métodos de fabricación, muestras de fabricación e instalaciones entre los gobiernos o las universidades y instalaciones entre los gobiernos o las universidades y otras instituciones.
Su objetivo es asegurar que los avances científicos y tecnológicos sean accesibles a un mayor número de usuarios que puedan desarrollar y explotar aún más esas tecnologías en nuevos productos, procesos, aplicaciones, materiales o servicios.1”
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¿Cómo definimos el concepto de
gestión?“Del latín gestĭo, el concepto de gestión hace referencia
a la acción y a la consecuencia de administrar algo. Al respecto, hay que decir que gestionar es llevar a cabo diligencias que hacen posible la realización de cabo diligencias que hacen posible la realización de una acción específica.”
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Nuestra concepción de GTT
comprendeDetectar
necesidad en campo
identificar productores
de
aplicar la solución a
de conocimiento
y solución
convocar a los generadores
de la solución
Tomar la solución
solución a nivel de campo
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En éste círculo virtuoso, es necesario tener una visión global y holística del contexto pero a su vez las necesidades a conformar observando las demandas y características externas (mercados, demandas y características externas (mercados, gobiernos, agencias).
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Resultados de la GTT
vínculo biunívoco con
academia
Conocimiento de campo y
objetivación de necesidades tecnológicas
Producto mejorado a adaptable a condicionantes del mercado
capacidad de aplicación de
solución al campo
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Áreas de experiencia en aplicación de GTT.
� Sanidad y producción animal� Sanidad y producción vegetal� Microbiología agraria e industrial� Selección asistida por marcadores genéticos (animal y vegetal)� Caracterización de componentes y diseño de fórmulas alimentarias infantiles en
lácteos.� Ambientalismo: detección de contaminación química y biológica de suelos y � Ambientalismo: detección de contaminación química y biológica de suelos y
aguas: Pesticidas y biota oportunista (algas cianofitas y producción de Micro cistinas)
� Seguridad alimentaria (E. coli O157 H7, STECS, …)� Residuos en alimentos (carnes: pesticidas, disruptores endocrinológicos,
hormonas, antibióticos)� Farmacocinética: Biodisponibilidad y bioequivalencia en específicos
veterinarios.� Control de drogas de abuso: anabólicos, dopaje en animales de deporte y cabaña.� Medicina Veterinaria: desarrollo y puesta a punto de técnicas de diagnóstico
molecular.
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Aplicaciones en Genómica y ProteómicaAplicaciones en Genómica y Proteómica
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Natch CS---Sansure Patented Fully
Automated Nucleic Acid Extraction System
� Extremely workflow optimization
� Unexpected operation reliability
� Unimaginable cost effectiveness
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4Parameter of Natch CS
respiratory swabs etc
Name and Type Natch CS/S12A
Sample supportedSerum、Plasma、Swab、Urine、Faeces、CSF、 FFPE、cell、
Througput 48 Smaples/Batch(Megnetic beads);96 Smaples/Batch(One tube)
Comsumable Sopported All size blood tubes,1.5/2.0ml centerifuge tubes
Extraction Volume 1 mL-3 mL
Pipting Volume 10-1000μL
Oprating Temperature 20℃-95℃Oprating Temperature 20℃-95℃
Performance of Pipetting 1μL:CV≤4.0%;Above 50μL:CV≤0.4%
Extraction Methodology Megnetic beads、One tube、Unified Extraction Platform
Extraction Time Megnetic beads:48 Smaples/90min;One tube:96 Smaples/30min
Barcode Scanner Yes
Communication USB,RS232,LIS
Size 1200*1600*700mm
VDD Power 220V(-10%+10%),50/60Hz
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5
Natch CS--Megnetic beads+One tube
• 48 samples throughput ≤90 min for mag kits
• 96 samples throughput ≤30 min for fast kits
• Original blood collection tubes for extraction
• Room temperature chemical lysis for 10 min
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6
Natch CS +Unified Extraction platform
• Unified extraction platform for different type of samples
• One stop workstation from DNA/RNA extraction to PCR set up
• 14 PCR thermocyclers' validation with Natch CS13/12/2016 20www.eduardo-terranova.com
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Natch CS--Standardization Layout of PCR Laboratory
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Natch CS--Larger Piping Volume
Piping Volume :Piping Volume :
10-1000μL
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9
Natch CS--Self Elevating Magnetic Grate
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Natch CS--Humanized Design
Air gapPortable Tips
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11
Natch CS--Humanized
Dismountable Design
Design
Visual Operation window
No. 1 compact system ever in history to save your space!
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Natch CS --A Perfect Partner of Molecular diagnostic laboratory
Every Molecular diagnostic laboratory deserve a Natch CS!
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PCR Y qPCR
� PCR: Técnicas e instrumentación para detección de micro organismos, factores de expresión y detección de eventos genéticos de orden cualitativo.
� qPCR: PCR Cuantitativa en Tiempo Real: contamos � qPCR: PCR Cuantitativa en Tiempo Real: contamos con numerosos kits comerciales de diagnóstico para un amplio portafolios de patologías y estudios genéticos aplicados al área médica . Esto incluye plataformas instrumentales, reactivos, consumibles comerciales validados y kits de reactivos personalizados para estudios de expresión génica, polimorfismos SNPs, Oncología, entre otros.
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Secuenciación y análisis genéticoDefinimos y diferenciamos ambos términos como
entidades separadas.
- Secuenciación: Técnicas destinadas a determinar las secuencias nucleotídicas de un fragmento o la secuencias nucleotídicas de un fragmento o la totalidad de un genoma (Métodos de Sanger o pirosecuenciación, o secuenciación masiva –NGS_)
- Análisis de Fragmentos: análisis de fragmentos de deADN genómico que se comportan como unidad genética y analítica a los efectos de su estudio automatizado. (Microsatélites, AFLP)
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Secuenciación Masiva de Nueva
Generación (NGS)� Se trata de la tecnología mas nueva e innovadora per se
Por estar en constante actualización y generando nuevos campos de aplicación en la totalidad del espectro de la genómica. genómica.
De la evolución competitiva de las grandes compañías surgió el liderazgo internacional de ILLUMINA.
Liderazgo que se soporta en el constante y racional proceso de creación de métodos aplicados y adecuados a las condiciones reales de cada sector.
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Areas de Aplicación NGS
Tecnología ILLUMINA
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Areas de Aplicación� Ciencias Básicas
� · Genómica aplicada:
� o perinatología y Screening prenatal de enfermedades cromosómicasenfermedades cromosómicas
� o Enfermedades Raras
� · Transplantes de órganos y Tejidos: Genotipado HLA.
� · Oncología y Genómica Médica
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� Agricultura :
� Patología y producción animal
Patología y producción Vegetal� Patología y producción Vegetal
� Genómica Microbiana
� Aplicaciones Forenses
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Concepto de Ciclo de Trabajo � Muestras a procesar
� Muestras de diferente naturaleza: Muestras biológicas sangre, suero, plasma, líquidos biológicos, biopsias líquidas, tejidos y órganos, etc.
� Problemas a resolver: � métodos analíticos específicos para cada tipo de muestra
� Soluciones a aportar� Elección del método óptimo para análisis
� Medios y herramientas� Selección de la/s tecnología/s disponible/s
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Tecnología para la Preparción de
Muestras� Tecnología de Análisis Automático de Fragmentos por
electroforesis Capilar: Advanced Analytical,
Fragment Analyzer :
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Mejorando el flujo de trabajo mediante las
siguientes prestaciones:
1. Producción de Librerías para NGS
2. Análisis de fragmentos de de DNA Genómico hasta 40,000 pb
3. Fragmentos de DNA de hasta 20,000 pb3. Fragmentos de DNA de hasta 20,000 pb
4. Procesamiento de RNA total, RNA Mensajero, cDNAy microRNA
5. Análisis de Genética Reversa (TILLiNG), Detección de Mutaciones
6. SSR, Genotipado y Análisis de Fragmentos de PCR
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Fragment Analyzer
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Data Analysis Software
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Tecnología actualizada
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Medios y HerramientasIdentificación, de los tipos de instrumentación adecuada y su
integración óptima en base a la aplicación general del núcleo tecnológico.
Determinación de flujo de personal y materiales en planta.Determinación de flujo de personal y materiales en planta.
� Fase Preparativa: métodos, equipos e insumos para extracción / Purificación de Acidos Nucleicos. PreAmplificación
� Fase de Procesamiento, Post Amplificación: Instrumentación y materiales,. Métodos y técnicas.
� Fase de derivatización a estudios pormenorizados: Secuenciación Sanger o PPS o NGS
� Interpretación de resultados y elaboración de informes
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CICLO DE TRABAJO
Corte/ fijaciónj.Microsc. Proces. ImagenImag. Molec. RESULTADOSP-
INFORME
PCR-RTPCRSEQ./ NGS RESULTADO
Extracción, Separación, Análisis
Purific.
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Curva de AprendizajeNuestra propuesta contempla una transferencia total de
tecnología, que incluye Hardware, software, métodos y bibliotecas puestos a punto, así como entrenamiento especializado con seguimiento para asegurar que el especializado con seguimiento para asegurar que el equipo técnico del laboratorio esté produciendo resultados con parámetros de GLP en un período de 3 a 6 meses.
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13/12/2016 42www.eduardo-terranova.com