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Module 2

NSG 5592: Analyse statistique en sciences infirmières

Introduction au logiciel SPSS

Module 2 d

2

Composantes de cette présentation

Structure de base d’un programme SPSS Exécution d’un programme SPSS Exemple Outils d’aide à la programmation

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1. Structure de base d’un programme SPSS

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Tout programme de traitement de données (comme en SPSS) repose sur la structure suivante:

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Intrant (=Input) Extrant (=Output)Traitement

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Cette structure se trouve dans les 2 types d’étapes possibles

(1): Étapes de création d’un fichier de données

Données originales (questionnaires

remplis)

ou sous forme de fichier SPSS

Fichier de données SPSS

Étapes SPSS de création ou de

transformation d’un fichier SPSS

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(2): Étapes de production de résultats

Fichier de données SPSS

Résultats des analyses

Analyses de données:

production de statistiques,

production de graphiques

Par conséquent, tout programme SPSS est constitué d’énoncés qui correspondent à une de ces deux opérations: création et modification d’un fichier de données

SPSS production de résultats d’analyses statistiques.

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2. Exemple utilisé

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Données sur les transplantations cardiaques de Stanford Référence: Miller et Halpern (1982): Regression

with censored data, Biometrika 69, 521-531, Référence mentionnée dans: Andrews et Herzberg

(1985) Data – A collection of problems from many fields for the student and research worker, Springer-Verlag

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Les données originales comprennent: Numéro du patient Nb de jours de survie État (vivant ou mort) Âge à la transplantation Score de « mismatch » (dissimilarité entre le

donneur et le receveur)

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Pour les besoins de l’exemple, nous ajoutons d’autres variables: Nom du patient Nb d’années de survie Une variable indicatrice selon l’âge à la

transplantation (supérieur à 50 ans ou non)

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3. Exécution d’un programme SPSS

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Cliquer ici la 1e fois

Cliquer ici les fois suivantes, en choisissant le fichier

approprié

Pour construire un programme SPSS, deux méthodes sont possibles: Utilisation des menus méthode décrite dans

l’exemple Écriture d’énoncés

Il est possible de construire un programme à partir des menus, et d’obtenir les énoncés générés.

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Gestion de

fichiers

Analyses statistiques

Définition des variables

GraphiquesTransformation des variables

Les rangées correspondent aux

observations (patients, …)

Les colonnes correspondent aux

variables

(1) Étapes de création et modification d’un fichier de données SPSS

(1a) Création d’un fichier de données SPSS

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Double-cliquer cette cellule pages suivantes

Commande Define Variables pages

suivantesOU

21

(1) Nom de

la variable (max

8 caractères)

(2) Type de

la variable

(3) Valeurs

manquantes

(4) Étiquettes

(5) Niveau de

mesure(6)

22

(2) Type de

la variable

(4) Étiquettes

(3) Valeurs

manquantes

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(5) Niveau de

mesure:

choisir « Nominal »

pour cette variable

(6): Cliquer OK

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Nous continuons la définition des autres variables:

SurvtimeÉtiquette = Survival Time, Days

Niveau de mesure = « Scale »

Status Étiquette = Status (État)

Niveau de mesure = « Nominal »

Étiquettes des valeurs: 0 Alive, 1 Dead

AgetransÉtiquette = Age at transplant

Niveau de mesure = « Scale »

Mismatch Étiquette =Mismatch score

Niveau de mesure = « Scale »

Nom Niveau de mesure = « Nominal »

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Vérifions si les variables ont été définies correctement

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1e manière de vérifier: Commande File Info page

suivante

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28

2e manière de vérifier: Commande Variables

pages suivantes

29

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Le > indique qu’il s’agit d’une

variable alphanumérique (sinon la variable est numérique)

32

Nous sommes maintenant prêts à entrer les données

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etc…

La valeur entrée est 1, mais la valeur affichée est Dead

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Pour sauver les données: Commande Save As page

suivante

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Le fichier SPSS est créé. Il s’appelle Exemple 1.Sav

(1) Étapes de création et modification d’un fichier de données SPSS

(1b) Transformation d’un fichier de données SPSS

Ajout d’observations Ajout de variables

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Commande Compute page suivante

39

Cette commande permet de faire des calculs numériques (sur des

variables numériques)

(Contenu partiel du LOG – dans l’Output):

COMPUTE NbAnnees = survtime / 12 .VARIABLE LABELS NbAnnees "Nb d'années de survie".

IF (survtime > 12) Sup1an = 1 .

COUNT Agesup50 = agetrans (50 thru Highest) .

RECODE agetrans (Lowest thru 50=1) (51 thru Highest=2) INTO agecat .VARIABLE LABELS agecat 'Age catégorique'.EXECUTE .

FORMATS agecat (F1).VARIABLE LEVEL agecat (ORDINAL).VALUE LABELS agecat 1.00000000000000 "50 ans ou moins" 2.00000000000000 "Plus de 50 ans".EXECUTE .

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Transform, Compute

Transform, Compute

Transform, Count

Transform, Recode, Into

Different Variables

Double-clic OU

Data, Define Variables

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(2) Étapes d’analyse des données

(2a) Analyses statistiques Production de statistiques descriptives Calcul de significativité statistique

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(2a) Analyses statistiques – Principes d’analyse statistique

Une seule variable ou plusieurs variables moyenne globale moyenne par groupe

Niveau de mesure nominal, ordinal variables numériques ou

alphanumériques qui définissent les groupes (ex: état)

intervalle, ratio variables numériques qui correspondent à des mesures (ex: âge, survie)

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(2a) Analyses statistiques – Principes d’analyse statistique

Analyse descriptive ou inférentielle Analyse descriptive: moyennes, tableaux de

fréquences, tableaux de contingence, etc… Analyse inférentielle: tests t, tests Khi-carré,

régression, etc…

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Commandes Reports et Descriptive Statistics

Les commandes portent le nom indiqué ci-contre

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Un exemple de statistique descriptive: Commandes Descriptive Statistics >

Descriptive pages suivantes

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Liste des variables disponibles

Liste des variables à analyser

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Résultats de l’analyse

Les énoncés générés par cette commande sont transcrits juste

au-dessus des résultats

50

Il est possible de conserver le fichier de résultats:

Commande File > Save As

(2) Étapes d’analyse des données

(2b) Graphiques

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Graphique

Les énoncés générés par cette commande sont transcrits juste

au-dessus des résultats

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GRAPH

/SCATTERPLOT(BIVAR)=mismatch WITH survtime

/MISSING=LISTWISE .

Mismatch score

3.02.52.01.51.0.50.0-.5

Su

rviv

al T

ime

, D

ays

4000

3000

2000

1000

0

-1000

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Il est possible de changer de manière interactive les caractéristiques de ce graphique (symboles, couleur, etc…)

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Il est possible d’exporter le graphique selon un format spécifique

4. Outils d’aide à la programmation

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(1) Avec option appropriée, génération automatique des énoncés générés avec les menus (les énoncés sont générés dans la fenêtre OUTPUT, intercalés entre les résultats)

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Commande Options pages suivantes

60

Important: Cette commande permet de conserver dans la fenêtre OUTPUT les énoncés générés par

SPSS

(2) Avec option appropriée, possibilité de générer les énoncés dans la fenêtre SYNTAX et de les exécuter (Menu Run)

(3) Sauvegarde de la session SPSS: fenêtre de l’éditeur de données (Untitled), fenêtre de syntaxe (Syntax1), fenêtre des résultats (Ouput1)

(4) Menu d’aide61

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Il n’est pas nécessaire de changer ces options, mais c’est plus pratique, en particulier la 2e, qui permet d’ouvrir une fenêtre de

syntaxe

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>Journalling (re)started at 29-OCT-2006 17:33:42 by release 9.0>of SPSS for Windows.RENAME VARIABLES (var00001=PatNum).FORMATS PatNum (F8).MISSING VALUES PatNum ().VARIABLE LABELS PatNum "Patient Number".VARIABLE LEVEL PatNum (NOMINAL).FORMATS SurvTime (F8).VARIABLE LABELS SurvTime "Survival Time, Days".FORMATS Status (F1).VARIABLE LABELS Status "Status".VALUE LABELS Status .000000000000000 "Alive" 1.00000000000000 "Dead" .VARIABLE LEVEL Status (NOMINAL).VARIABLE WIDTH Status(1).FORMATS AgeTrans (F3).VARIABLE LABELS AgeTrans "Age at transplant".VARIABLE WIDTH AgeTrans(3).FORMATS Mismatch (F8.2).MISSING VALUES Mismatch ("9.99").VARIABLE LABELS Mismatch "Mismatch score".VARIABLE WIDTH status(2).VARIABLE WIDTH status(4).SAVE OUTFILE='C:\Dossiers Philippe\Cours SPSS\Exemple1.sav' /COMPRESSED.

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(3) Sauvegarde de la session SPSS: fenêtre de l’éditeur de données (Untitled), fenêtre de syntaxe (Syntax1), fenêtre des résultats (Ouput1)

(4) Menu d’aide

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Objectif 4: Discuter sur le travail de la semaine et clarifier expectatives Nouvelle tâche (due le 1 février) Lire diaporama Bloc 3 – On le reprendra le 1 février au besoin

Projet final Ordinateur à apporter Lectures: (écart type – chi deux)

Triola: Chapitres 3 à 5 Polit : Chapitres 3 à 5

Plan du troisième cours (fin)