View
35
Download
2
Category
Preview:
DESCRIPTION
ELVÁLASZTÁSTECHNIKA IV. HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIA AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA Dr. Kremmer Tibor EÖTVÖS LORÁND TUDOMÁNY EGYETEM Budapest. HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA HYDROPHOBIC INTERACTION CHROMATOGRAPHY (HIC). TÖRTÉNETI ÁTTEKINTÉS. - PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
ELVÁLASZTÁSTECHNIKA IV.
HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIA
AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA
Dr. Kremmer Tibor
EÖTVÖS LORÁND TUDOMÁNY EGYETEM
Budapest
HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA
HYDROPHOBIC INTERACTIONCHROMATOGRAPHY
(HIC)
1971 Affinitási kromatográfiás tölteteknél spacer alkalmazásakor zavaró másodlagos kölcsönhatásokat figyelnek meg
1972 Shaltiel Hydrophobic Chromatography Spacer-ligandumként, agaróz hordozóra alkilaminokat alkalmaz
1973 Hjerten Hydrophobic Interaction Chromatography Porath Hydrophobic Salting-out Chromatography Kozmotróp sók adagolásával a fehérjék retenciója nő Hoftsee Hydrophobic Adsorption Chromatography A ligandum szénláncának növelése és sűrűségének csökkentése
növeli az eljárás felbontóképességét
1976 Morris HIC (Trends Biochem Sci.)
1980 - HPLC töltetek 5-10 m szemcseméret (analitikai)
20-40 m szemcseméret (preparatív), pórusméret növelése (300Å)
1986 Nem porózus töltetek (1-3 um)
1991 Perfúziós töltetek (200 és 300-500 nm pórus)
TÖRTÉNETI ÁTTEKINTÉS
HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIA (HIC)
spacer
ligandum
matrix
(domain)
protein
HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIA (HIC)
KÜLÖNBÖZŐ LIGANDUMOK HATÁSA A RETENCIÓRA
(Gooding et al. 1984)
OH-Propil → Propil → Benzil → i-Propil → Fenil → Pentil
a retenció növekedése
KÜLÖNBÖZŐ ANIONOK ÉS KATIONOK HATÁSA A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSRA
PO43- ~ SO4
2- ~ CH3COO- ~ Cl- ~ Br- ~ NO3- ~ CIO4
- ~ SCN-
növekvő besózó - csökkenő kisózó hatás
növekvő kaotrop - csökkenő kozmotrop hatás
NH4+ ~ Rb+ ~ K+ ~ Na+ ~ Cs+ ~ Li+ ~ Mg2+ ~ Ca2+ ~ Ba2+
Phenyl-Superose, Pharmacia, Uppsala
HUMÁN SZÉRUM
SAVANYÚ ALFA-1-GLIKOPROTEIN (AGP) ÉS
ALFA-1-ANTITRIPSZIN (AAT)
ELVÁLASZTÁSA ÉS TISZTÍTÁSA HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ
KROMATOGRÁFIÁVAL
Fractogel EMD Propyl oszlop (10x1 cm, 20-40 m)
Eluens A – 20 mM Na-foszfát, pH : 7,2 1,1 M NH4-szulfát
Eluens B - 20 mM Na-foszfát, pH : 7,2
Lineáris gradiens elúció
Áramlási sebesség : 1 mL/perc
Detektálás : 278 nm
(Oláh, Kremmer, Boldizsár, J. Chromatogr. 2000)
(NH4)2SO4
1,5 M
(NH4)2SO4
M
REFERENCIA FEHÉRJÉK ELVÁLASZTÁSA HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIÁVAL
HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA
FEHÉRJÉK OVALBUMINRA VONATKOZTATOTT RELATIV RETENCIÓK
PROTEIN RRT
Cytochrome C 0.59
Myoglobin 0.73
Ribonuclease A 0.76
Haemoglobin 0.91
Albumin (human) 0.94
Ovalbumin 1.00
Trypsinogen 1.02
Transferrin 1.07
Lysozyme 1.08
Albumin (bovine serum) 1.11
a-Chymotrypsinogen A 1.12
Pepsin 1.15
Trypsin inhibitor 1.23
Hydrophobic Interaction Chromatography of Proteins
Column A: Progel-TSK Butyl-NPR, 3.5cm x 4.6mm ID, 2.5μm particles Column B: Progel-TSK Phenyl-SPW, 7.5cm x 7.5mm ID, 10 μm particles Column C: ProgeI-TSK Ether-5PW, 7.5cm x 7.5mm ID, 10 μm particles
Samples: 1. Myoglobin, 2. Ribonuclesae, 3. Lysozyme, 4. -Chymotrypsin, 5. -Chymotrypsinogen
Mobile Phase: A - 0.1M phosphate buffer, pH 7.0 and 2.3 → 0M ammonium sulfate (12 min)B - C = 0,1M phosphate buffer, pH 7.0 and 1.8 → 0M ammonium sulfate (60 min)
Flow rate: 1mL/min; Temp.: 250 C; Detection: UV 280 nm
1 - Kis sókoncentrációk
- ionos kölcsönhatások - stabilizálás
2 - Nagy sókoncentrációk
- speciális kölcsönhatások, kozmotróp sópárok, pl. (NH4)2SO4
- stabilizálás, majd kicsapódás,
hidrofób kölcsönhatások
A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA ALAPJAI A FEHÉRJÉK SZORPCIÓJA ÉS RETENCIÓJA
II. SÓK HATÁSA A FEHÉRJÉK OLDÓDÁSÁRA
HIC - TERVEZÉS
A HIDROFÓB KÜLCSÖNHATÁSÚ (HIC) ÉS FORDÍTOTT FÁZISÚ KROMATOGRÁFIA (RPC)
ÖSSZEHASONLÍTÁSA
Mindkét technikában közös és jellemző:
- Az álló fázis a hordozóra kötött apoláris ligandum.
- A szorpció oka a hidrofób (apolárIs) kölcsönhatás.
- A retenciót döntő módon a hidrofóbicitási viszonyok határozzák meg.
- Mindkét technika alkalmas a fehérjék elválasztására.
A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ (HIC) ÉS A FORDÍTOTT FÁZISÚ KROMATOGRÁFIA (RPC) KÜLÖNBSÉGEI
- A HIC liganduma gyengébben apoláris, kisebb a felületi koncentrációja.
- A HIC esetén sokkal gyengébb a szorpció, a fehérje natív formában (folded) marad, kisebb a denaturáció esélye.
- A RPC esetében az erős szorpció megszüntetheti az eredeti struktúrát (unfolding), itt a retenciót elsősorban az elsődleges szerkezet hidrofób jellege határozza meg.
- A RPC esetében a fehérje spontán kötődik a ligandumhoz. Az elúciót szerves oldószer adagolása okozza. A HIC esetében a fehérje kötődése a tölteten és a retenció mértéke a kozmotróp só adagolásával érhető el. Az elúció a só negatív koncentráció gradiensének eredménye.
- A RPC esetében a hidrofób kölcsönhatásért döntően az álló fázis (ligandum) felelős,
- a HIC esetében az áramló fázis (eluens) a domináns tényező
• A fehérjék fiziológiás körülmények (pH, ionerősség) között harmadlagos ill. negyedleges szerkezettel (folded) rendelkeznek.
• A fehérjék apoláros karakterű aminosav összetevői (Ala, Val, Leu, Tyr, Trp, Phe) a szerkezet belsejébe törekszenek, egy részük azonban a felületre kényszerül (hydrophobic patch). Ez kb. a felület 40%-át képezi, és fontos funkcionális szerepe van a fehérje biológiai aktivitásában.
• Frank és Evans (1945) feltételezték, hogy vizes oldatokban a víz molekulái un. "icebergs" formában fedik a hidrofób felületeket.
• Némethy és Sheraga (1962) szerint két hidrofób anyag vizes oldatban létrejövő kapcsolata során a víz jégszerű struktúrája mintegy feloldódik és dezorganizálódik (entrópia nő – az energia felszabadulás fedezi az asszociáció energiaigényét)
Vizes oldatokban ezek az erők stabilizálják a fehérjék natív szerkezetét. A fehérjék a vizes (fiziológiás) közegben általában jól oldódnak (stabilak) és nem törekszenek hidrofób kapcsolatokra.
A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA ALAPJAI A FEHÉRJÉK SZORPCIÓJA ÉS RETENCIÓJA
I. FEHÉRJÉK "VIZES" KÖZEGBEN
Melander és Horváth (1977) SZOLVOFÓB ELMÉLET- Az oldódás során az oldószer az oldandó anyagot befogadó üreget (cavity)
képez.- Az oldhatóság a határfelületi szabadenergia megváltozásának a függvénye, ami
az oldószer felületi feszültségétől függ.- Az oldat só koncentrációjának (m) növelésével az oldat felületi feszültsége
arányosan változik:
V = Vo + c . R . m R - a víz felületi feszültsége c - a só moláris felületi feszültség
inkrementuma - c korrelációba hozható a sók (anionok) liotróp sorával (Hofmeister l888). - Az elmélet a hidrofób kromatográfiás gyakorlat számára legegyszerűbb
formájában a retenció kifejezésére alkalmas össszefüggést (lnk - m) ad. A kapacitási faktor logaritmusa (lnk) a következő egyenlettel fejezhető ki :
ln k = ln kviz + S. m
az egyenes tengelymetszete (elvileg) a tiszta vízben mérhető kapacitási faktor logaritmusa. - A konkrét mérések az elmélet számos bizonytalanságára hívják fel a figyelmet.
A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA ALAPJAI A FEHÉRJÉK SZORPCIÓJA ÉS RETENCIÓJA
III. SÓK HATÁSA A FEHÉRJÉK OLDÓDÁSÁRA
- Egy egyensúlyi rendszerben lévő oldathoz adott komponens megváltoztatja a fennálló egyensúlyt.
- Az új komponens nem egyforma mértékben lép kölcsönhatásba a már ott lévő komponensekkel (preferentíal interaction), ezt fejezi ki a preferential interaction paraméter (PIP).
- Mérése a szabadentalpia vagyis a kémiai potenciál változásának mérésével lehetséges, ez arányos a felületi feszültség változással.
- Megállapították, hogy a kisózószerek (kozmotróp sók) a fehérjék környezetében negatív PIP értékkel bírnak, vagyis kizáródnak a fehérjék közeléből. Ennek eredménye egy többlet hidratáció, amely a fehérje kémiai potenciálját megnöveli végezetül kicsapódáshoz vezet.
- A só-fehérje kölcsönhatás két ellentétes hatás eredője:
1. kedvezőtlen felületi feszültség változás
2. kedvező só kötődés
A kisózó szerek esetében az első hatás a domináns (egyértékű kationok sói), a besózó szerek esetében a második kompenzálja az elsőt.
PREFERENTIAL INTERACTION ELMÉLETTimasheff (1959) Arakawa és Timasheff (1982)
A ligandum szerkezetének szerepe az albumin kötödésében a hidrofób kölcsönhatású kromatográfiában
AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA
AFFINITY CHROMATOGRAPHY
(AFF)
ALAPELV
Kovalens kötéssel (általában köztes láncon keresztül - spacer, leash, tentacle) hordozó szemcsékre (mátrix) rögzített
különböző funkcionális csoportok (ligandum), amelyek
Az elválasztandó (bio)molekulával specifikus és reverzibilis kölcsönhatásokat képeznek.
Mátrix:
- Poliszacharidok: agaróz (Sepharose, Superose)
cellulóz
- Organikus polimerek:
poliakrilamid
hidroxialkil metakrilát (Spheron)
etilénglikol metakrilát (Fractogel)
- kevert agaróz-poliakrilamid (Ultrogel)
- Silica, "porózus üveg" (SelectiSphere)
AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA
AFFINITÁSI KÖLCSÖNHATÁSOK (IMMOBILIZED LIGAND AFFINITY TECHNIOUES)
IMMUNOAFFINITY (immunosorption)
LECTINS (glycoproteins, oligo-polysaccharides)
HORMONES (receptors/carriers/antihormones)
PROTEINS (enzymes, immunoglobulins)
SUBSTRATES (cofactors, inhibitors, modulators)
NUCLEIC ACID binding ligands (oligo(dT)cellulose)
VÍRUS binding ligands
PHENYL BORONATE binding (cis-diols)
IMMOBILIZED METAL ION binding affinity
DYE-LIGAND binding affinity
- Cibacron Blue F3G-A
- Malachit Green (A/T specific)
- Phenol Red (G/C specific)
With N-linked sugars
Lectin-AAA
Lectin-DSA
Lectin-GNA
Lectin-MAA
Lectin-SNA
Lectin-PHA-L
Specificity for structures
L-Fuc(l-6)GIcNAcl
Galβ(l-4)GlcNAc-
Man (l-3)62 Man-
SA (2-3)Gal
SA (2-6)Gal
Poly-Gal-GlcNAc-
With O-linked sugars
Lectin-ACA
Lectin-PNA
Lectin-ConA
Lectin-RCA-120
Lectin-WGA
SA(2-3)Galβ(l-3)-GalNAc-Ser/Thr
Galβ(l-3) GalNAc-Ser/Thr
FOR AFFINITY INTERACTIONS WITH GLYCOPROTEINS
LECTINS
Product Specificity Applications Eluents
Protein A-Sepharose CL-4B
Fc region of IgG
IgG (many species), IgG subclasses and fragments immuno complexes,
antigens
1 M HAc, pH 3
0,1 M glycyltyrosine, pH 7
Con A-Sepharose-D-glucosyl,
-D-mannosyl residues
Glycoproteins, membrane proteins, glycolipids, polysaccharides
Free sugar (methyl- -D-glucoside); pulse or gradient (0-0.5 M).
Decreased pH (not below 3) Borate buffer (0.1 M, pH 6.5)
Lentil Lectin-Sepharose 4B
Similar to Con A (weaker affinity)
Membrane proteins, glycoproteins
Free sugar (methyl- -D-glucoside); pulse or gradient (0-0.1 M)
Wheat germ Lectin-Sepharose 6MB
N-acetyl-β-D-glucos-aminyl residues
Glycoproteins, polysaccharides, cells (esp. T-lymphocytes)
Free sugar (N-acetyl- β -D-glucos-amine);
pulse or gradient.
Helix pomatia Lectin-Sepharose 6MB
N-acetyl- -D galactos-aminyl residues
cells (esp. T-lymphocytes), glycoproteins
Free sugar (N-acetyl- -D-galactosamine)
Ready-to-use group specific adsorbents
AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA
Sejtmembrán glikoprotein (Na-deoxikolát extraktum) tisztításaL. culinaris lectin-Sepharose 4B oszlopon
FESTÉK LIGANDUM AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIADYE-LIGAND AFFINITY CHROMATOGRAPHY
FUNCTIONAL GROUP: CIBACRON BLUE F3G-A
AFFINITY PACKING MATERIALS:
(Capacities 10 mg albumin per ml gel)
~ Blue Sepharose CL-6B (Pharmacia)
~ Affi-GelR Blue Gel (Bio-Rad)
~ Fractogel TSK AF-Blue (Merck), TOYOPEARL AF Blue HC-650M
COLUMN: 6x0.5cmI.D. (Pharmacia 5/5)
CHROMATOGRAPHIC SYSTEM: FPLC (Pharmacia) with LCC-500 Programmer and UV-1 Monitor (278 nm)
ELUTION:
Equilibrated and eluted with 10 mM phosphate buffer
pH: 5.8 or 6.8
Step gradient elution with 10 mM phosphate buffer
pH:8.0 containing 2 M NaCl
FLOW RATE: 1 ml / min
SAMPLE: 500 μL ~ prepared by Sephadex G-25
Equivalent to 50 μL of original serum
DYE-LIGAND AFFINITY CHROMATOGRAPHY OF HUMAN SERUM PROTEINS
DYE-LIGAND AFFINITY CHROMATOGRAPHY OF HUMAN SERUM PROTEINS
COLUMN: Blue Sepharose CL-6B pH:5,8Human serum samples prepared by Sephadex G-25
FENIL BORONÁT AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA
PSEUDO-URIDIN MEGHATÁROZÁSA HUMÁN VIZELETBEN
PSEUDO-URIDINE DETERMINATIONPRINCIPLE
NUCLEOSIDES (PSEUDO-URIDINE) WITH VICINAL HYDROXYL GROUPS IN THEIR STRUCTURE CAN BE EXTRACTED SELECTIVELY BY AFFINITY CHROMA-TOGRAPHY FROM COMPLEX BIOLOGICAL SAMPLES AND SEPARATED BY REVERSED-PHASE HPLC.
SAMPLE PREPARATION
MICRO-PREPARATIVE BORONATE AFFINITY COLUMN (Affi-Gel 601, Bio-Rad Labs, 5x50 mm) WAS EQULIBRATED WITH 0.25M NH4-ACETATE (pH 8-8).
ONE ml URINE WAS MIXED WITH 0.3 ml 2.5M NH4-ACETATE (pH 9.5) AND
CENTRIFUGED. 500 μL SUPERNATANT WAS APPLIED ON THE AFFINITY
COLUMN AND WASHED WITH 2x4 ml 0.25M NH 4 - ACETATE (pH 8.8).
ELUTION WAS PERFORMED WITH 5 ml 0.1M FORMIC ACID. ELUATE WAS COLLECTED AND FREEZE-DRYED. THE RESIDUE WAS SOLVED IN 250 μL 10mM NH4~PHOSPHATE (pH 5) CONTAINING 2 % METHANOL.
HPLC ANALYSIS
HP 1084B LIQUID CHROMATOGRAPH ISOCRATIC ELUTION WITH 10mM PHOSPHATE BUFFER (pH 5.1) CONTAINING 2% (v/v) METHANOL.,
COLUMN: ODS-HYPERSIL (25x0.46 cm, 5u) TEMP: 35°C. FLOW: 1 ml/min.
DETECTION: 254 nm.
Recommended