41
ELVÁLASZTÁSTECHNIKA IV. HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIA AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA Dr. Kremmer Tibor EÖTVÖS LORÁND TUDOMÁNY EGYETEM Budapest

ELVÁLASZTÁSTECHNIKA IV

  • Upload
    kami

  • View
    34

  • Download
    2

Embed Size (px)

DESCRIPTION

ELVÁLASZTÁSTECHNIKA IV. HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIA AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA Dr. Kremmer Tibor EÖTVÖS LORÁND TUDOMÁNY EGYETEM Budapest. HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA HYDROPHOBIC INTERACTION CHROMATOGRAPHY (HIC). TÖRTÉNETI ÁTTEKINTÉS. - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

ELVÁLASZTÁSTECHNIKA IV.

HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIA

AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA

Dr. Kremmer Tibor

EÖTVÖS LORÁND TUDOMÁNY EGYETEM

Budapest

Page 2: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA

HYDROPHOBIC INTERACTIONCHROMATOGRAPHY

(HIC)

Page 3: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

1971 Affinitási kromatográfiás tölteteknél spacer alkalmazásakor zavaró másodlagos kölcsönhatásokat figyelnek meg

1972  Shaltiel Hydrophobic Chromatography Spacer-ligandumként, agaróz hordozóra alkilaminokat alkalmaz

1973 Hjerten Hydrophobic Interaction Chromatography Porath Hydrophobic Salting-out Chromatography Kozmotróp sók adagolásával a fehérjék retenciója nő Hoftsee Hydrophobic Adsorption Chromatography A ligandum szénláncának növelése és sűrűségének csökkentése

növeli az eljárás felbontóképességét

1976 Morris HIC (Trends Biochem Sci.)

1980 - HPLC töltetek 5-10 m szemcseméret (analitikai)

20-40 m szemcseméret (preparatív), pórusméret növelése (300Å)

1986 Nem porózus töltetek (1-3 um)

1991 Perfúziós töltetek (200 és 300-500 nm pórus)

TÖRTÉNETI ÁTTEKINTÉS

Page 4: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIA (HIC)

spacer

ligandum

matrix

(domain)

protein

Page 5: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 6: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIA (HIC)

KÜLÖNBÖZŐ LIGANDUMOK HATÁSA A RETENCIÓRA

(Gooding et al. 1984)

OH-Propil → Propil → Benzil → i-Propil → Fenil → Pentil

a retenció növekedése

Page 7: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

KÜLÖNBÖZŐ ANIONOK ÉS KATIONOK HATÁSA A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSRA

PO43- ~ SO4

2- ~ CH3COO- ~ Cl- ~ Br- ~ NO3- ~ CIO4

- ~ SCN-

növekvő besózó - csökkenő kisózó hatás

növekvő kaotrop - csökkenő kozmotrop hatás

NH4+ ~ Rb+ ~ K+ ~ Na+ ~ Cs+ ~ Li+ ~ Mg2+ ~ Ca2+ ~ Ba2+

Phenyl-Superose, Pharmacia, Uppsala

Page 8: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

HUMÁN SZÉRUM

SAVANYÚ ALFA-1-GLIKOPROTEIN (AGP) ÉS

ALFA-1-ANTITRIPSZIN (AAT)

ELVÁLASZTÁSA ÉS TISZTÍTÁSA HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ

KROMATOGRÁFIÁVAL

Fractogel EMD Propyl oszlop (10x1 cm, 20-40 m)

Eluens A – 20 mM Na-foszfát, pH : 7,2 1,1 M NH4-szulfát

Eluens B - 20 mM Na-foszfát, pH : 7,2

Lineáris gradiens elúció

Áramlási sebesség : 1 mL/perc

Detektálás : 278 nm

(Oláh, Kremmer, Boldizsár, J. Chromatogr. 2000)

(NH4)2SO4

1,5 M

Page 9: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

(NH4)2SO4

M

REFERENCIA FEHÉRJÉK ELVÁLASZTÁSA HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ FOLYADÉKKROMATOGRÁFIÁVAL

Page 10: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA

FEHÉRJÉK OVALBUMINRA VONATKOZTATOTT RELATIV RETENCIÓK

PROTEIN RRT

Cytochrome C 0.59

Myoglobin 0.73

Ribonuclease A 0.76

Haemoglobin 0.91

Albumin (human) 0.94

Ovalbumin 1.00

Trypsinogen 1.02

Transferrin 1.07

Lysozyme 1.08

Albumin (bovine serum) 1.11

a-Chymotrypsinogen A 1.12

Pepsin 1.15

Trypsin inhibitor 1.23

Page 11: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

Hydrophobic Interaction Chromatography of Proteins

Column A: Progel-TSK Butyl-NPR, 3.5cm x 4.6mm ID, 2.5μm particles Column B: Progel-TSK Phenyl-SPW, 7.5cm x 7.5mm ID, 10 μm particles Column C: ProgeI-TSK Ether-5PW, 7.5cm x 7.5mm ID, 10 μm particles

Samples: 1.  Myoglobin, 2. Ribonuclesae, 3. Lysozyme, 4. -Chymotrypsin, 5.  -Chymotrypsinogen

Mobile Phase: A - 0.1M phosphate buffer, pH 7.0 and 2.3 → 0M ammonium sulfate (12 min)B - C = 0,1M phosphate buffer, pH 7.0 and 1.8 → 0M ammonium sulfate (60 min)

Flow rate: 1mL/min; Temp.: 250 C; Detection: UV 280 nm

Page 12: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

1 - Kis sókoncentrációk

- ionos kölcsönhatások - stabilizálás

2 - Nagy sókoncentrációk

- speciális kölcsönhatások, kozmotróp sópárok, pl. (NH4)2SO4

- stabilizálás, majd kicsapódás,

hidrofób kölcsönhatások

A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA ALAPJAI A FEHÉRJÉK SZORPCIÓJA ÉS RETENCIÓJA

II. SÓK HATÁSA A FEHÉRJÉK OLDÓDÁSÁRA

Page 13: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

HIC - TERVEZÉS

Page 14: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

A HIDROFÓB KÜLCSÖNHATÁSÚ (HIC) ÉS FORDÍTOTT FÁZISÚ KROMATOGRÁFIA (RPC)

ÖSSZEHASONLÍTÁSA

Mindkét technikában közös és jellemző:

- Az álló fázis a hordozóra kötött apoláris ligandum.

- A szorpció oka a hidrofób (apolárIs) kölcsönhatás.

- A retenciót döntő módon a hidrofóbicitási viszonyok határozzák meg.

- Mindkét technika alkalmas a fehérjék elválasztására.

Page 15: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ (HIC) ÉS A FORDÍTOTT FÁZISÚ KROMATOGRÁFIA (RPC) KÜLÖNBSÉGEI

- A HIC liganduma gyengébben apoláris, kisebb a felületi koncentrációja.

- A HIC esetén sokkal gyengébb a szorpció, a fehérje natív formában (folded) marad, kisebb a denaturáció esélye.

- A RPC esetében az erős szorpció megszüntetheti az eredeti struktúrát (unfolding), itt a retenciót elsősorban az elsődleges szerkezet hidrofób jellege határozza meg.

- A RPC esetében a fehérje spontán kötődik a ligandumhoz. Az elúciót szerves oldószer adagolása okozza. A HIC esetében a fehérje kötődése a tölteten és a retenció mértéke a kozmotróp só adagolásával érhető el. Az elúció a só negatív koncentráció gradiensének eredménye.

- A RPC esetében a hidrofób kölcsönhatásért döntően az álló fázis (ligandum) felelős,

- a HIC esetében az áramló fázis (eluens) a domináns tényező

Page 16: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

• A fehérjék fiziológiás körülmények (pH, ionerősség) között harmadlagos ill. negyedleges szerkezettel (folded) rendelkeznek.

• A fehérjék apoláros karakterű aminosav összetevői (Ala, Val, Leu, Tyr, Trp, Phe) a szerkezet belsejébe törekszenek, egy részük azonban a felületre kényszerül (hydrophobic patch). Ez kb. a felület 40%-át képezi, és fontos funkcionális szerepe van a fehérje biológiai aktivitásában.

• Frank és Evans (1945) feltételezték, hogy vizes oldatokban a víz molekulái un. "icebergs" formában fedik a hidrofób felületeket.

• Némethy és Sheraga (1962) szerint két hidrofób anyag vizes oldatban létrejövő kapcsolata során a víz jégszerű struktúrája mintegy feloldódik és dezorganizálódik (entrópia nő – az energia felszabadulás fedezi az asszociáció energiaigényét)

Vizes oldatokban ezek az erők stabilizálják a fehérjék natív szerkezetét. A fehérjék a vizes (fiziológiás) közegben általában jól oldódnak (stabilak) és nem törekszenek hidrofób kapcsolatokra.

A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA ALAPJAI A FEHÉRJÉK SZORPCIÓJA ÉS RETENCIÓJA

I. FEHÉRJÉK "VIZES" KÖZEGBEN

Page 17: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

Melander és Horváth (1977) SZOLVOFÓB ELMÉLET- Az oldódás során az oldószer az oldandó anyagot befogadó üreget (cavity)

képez.- Az oldhatóság a határfelületi szabadenergia megváltozásának a függvénye, ami

az oldószer felületi feszültségétől függ.- Az oldat só koncentrációjának (m) növelésével az oldat felületi feszültsége

arányosan változik:

V = Vo + c . R . m R - a víz felületi feszültsége c - a só moláris felületi feszültség

inkrementuma - c korrelációba hozható a sók (anionok) liotróp sorával (Hofmeister l888). - Az elmélet a hidrofób kromatográfiás gyakorlat számára legegyszerűbb

formájában a retenció kifejezésére alkalmas össszefüggést (lnk - m) ad. A kapacitási faktor logaritmusa (lnk) a következő egyenlettel fejezhető ki :

ln k = ln kviz + S. m

az egyenes tengelymetszete (elvileg) a tiszta vízben mérhető kapacitási faktor logaritmusa. - A konkrét mérések az elmélet számos bizonytalanságára hívják fel a figyelmet.

A HIDROFÓB KÖLCSÖNHATÁSÚ KROMATOGRÁFIA ALAPJAI A FEHÉRJÉK SZORPCIÓJA ÉS RETENCIÓJA

III. SÓK HATÁSA A FEHÉRJÉK OLDÓDÁSÁRA

Page 18: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

-  Egy egyensúlyi rendszerben lévő oldathoz adott komponens megváltoztatja a fennálló egyensúlyt.

-  Az új komponens nem egyforma mértékben lép kölcsönhatásba a már ott lévő komponensekkel (preferentíal interaction), ezt fejezi ki a preferential interaction paraméter (PIP).

-  Mérése a szabadentalpia vagyis a kémiai potenciál változásának mérésével lehetséges, ez arányos a felületi feszültség változással.

-  Megállapították, hogy a kisózószerek (kozmotróp sók) a fehérjék környezetében negatív PIP értékkel bírnak, vagyis kizáródnak a fehérjék közeléből. Ennek eredménye egy többlet hidratáció, amely a fehérje kémiai potenciálját megnöveli végezetül kicsapódáshoz vezet.

-  A só-fehérje kölcsönhatás két ellentétes hatás eredője:

1. kedvezőtlen felületi feszültség változás

2. kedvező só kötődés

A kisózó szerek esetében az első hatás a domináns (egyértékű kationok sói), a besózó szerek esetében a második kompenzálja az elsőt.

PREFERENTIAL INTERACTION ELMÉLETTimasheff (1959) Arakawa és Timasheff (1982)

Page 19: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

A ligandum szerkezetének szerepe az albumin kötödésében a hidrofób kölcsönhatású kromatográfiában

Page 20: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 21: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 22: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 23: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA

AFFINITY CHROMATOGRAPHY

(AFF)

Page 24: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 25: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

ALAPELV

Kovalens kötéssel (általában köztes láncon keresztül - spacer, leash, tentacle) hordozó szemcsékre (mátrix) rögzített

különböző funkcionális csoportok (ligandum), amelyek

Az elválasztandó (bio)molekulával specifikus és reverzibilis kölcsönhatásokat képeznek.

Mátrix:

- Poliszacharidok: agaróz                     (Sepharose, Superose)

cellulóz

- Organikus polimerek:

poliakrilamid

hidroxialkil metakrilát (Spheron)

etilénglikol metakrilát (Fractogel)

- kevert agaróz-poliakrilamid        (Ultrogel)

- Silica, "porózus üveg"                (SelectiSphere)

AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA

Page 26: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

AFFINITÁSI KÖLCSÖNHATÁSOK (IMMOBILIZED LIGAND AFFINITY TECHNIOUES)

IMMUNOAFFINITY (immunosorption)

LECTINS (glycoproteins, oligo-polysaccharides)

HORMONES (receptors/carriers/antihormones)

PROTEINS (enzymes, immunoglobulins)

SUBSTRATES (cofactors, inhibitors, modulators)

NUCLEIC ACID binding ligands (oligo(dT)cellulose)

VÍRUS binding ligands

PHENYL BORONATE binding (cis-diols)

IMMOBILIZED METAL ION binding affinity

DYE-LIGAND binding affinity

- Cibacron Blue F3G-A

- Malachit Green (A/T specific)

- Phenol Red (G/C specific)

Page 27: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 28: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

With N-linked sugars

Lectin-AAA

Lectin-DSA

Lectin-GNA

Lectin-MAA

Lectin-SNA

Lectin-PHA-L

Specificity for structures

L-Fuc(l-6)GIcNAcl

Galβ(l-4)GlcNAc-

Man (l-3)62 Man-

SA (2-3)Gal

SA (2-6)Gal

Poly-Gal-GlcNAc-

With O-linked sugars

Lectin-ACA

Lectin-PNA

Lectin-ConA

Lectin-RCA-120

Lectin-WGA

SA(2-3)Galβ(l-3)-GalNAc-Ser/Thr

Galβ(l-3) GalNAc-Ser/Thr

FOR AFFINITY INTERACTIONS WITH GLYCOPROTEINS

LECTINS

Page 29: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

Product Specificity Applications Eluents

Protein A-Sepharose CL-4B

Fc region of IgG

IgG (many species), IgG subclasses and fragments immuno complexes,

antigens

1 M HAc, pH 3

0,1 M glycyltyrosine, pH 7

Con A-Sepharose-D-glucosyl,

-D-mannosyl residues

Glycoproteins, membrane proteins, glycolipids, polysaccharides

Free sugar (methyl- -D-glucoside); pulse or gradient (0-0.5 M).

Decreased pH (not below 3) Borate buffer (0.1 M, pH 6.5)

Lentil Lectin-Sepharose 4B

Similar to Con A (weaker affinity)

Membrane proteins, glycoproteins

Free sugar (methyl- -D-glucoside); pulse or gradient (0-0.1 M)

Wheat germ Lectin-Sepharose 6MB

N-acetyl-β-D-glucos-aminyl residues

Glycoproteins, polysaccharides, cells (esp. T-lymphocytes)

Free sugar (N-acetyl- β -D-glucos-amine);

pulse or gradient.

Helix pomatia Lectin-Sepharose 6MB

N-acetyl- -D galactos-aminyl residues

cells (esp. T-lymphocytes), glycoproteins

Free sugar (N-acetyl- -D-galactosamine)

Ready-to-use group specific adsorbents

AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA

Page 30: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

Sejtmembrán glikoprotein (Na-deoxikolát extraktum) tisztításaL. culinaris lectin-Sepharose 4B oszlopon

Page 31: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

FESTÉK LIGANDUM AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIADYE-LIGAND AFFINITY CHROMATOGRAPHY

Page 32: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

FUNCTIONAL GROUP: CIBACRON BLUE F3G-A

AFFINITY PACKING MATERIALS:

(Capacities 10 mg albumin per ml gel)

~ Blue Sepharose CL-6B (Pharmacia)

~ Affi-GelR Blue Gel           (Bio-Rad)

~ Fractogel TSK AF-Blue (Merck), TOYOPEARL AF Blue HC-650M

COLUMN: 6x0.5cmI.D. (Pharmacia 5/5)

CHROMATOGRAPHIC SYSTEM: FPLC (Pharmacia) with LCC-500 Programmer and UV-1 Monitor (278 nm)

ELUTION:

Equilibrated and eluted with 10 mM phosphate buffer

pH: 5.8 or 6.8

Step gradient elution with 10 mM phosphate buffer

pH:8.0 containing 2 M NaCl

FLOW RATE: 1 ml / min

SAMPLE: 500 μL ~ prepared by Sephadex G-25

Equivalent to 50 μL of original serum

DYE-LIGAND AFFINITY CHROMATOGRAPHY OF HUMAN SERUM PROTEINS

Page 33: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 34: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 35: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

DYE-LIGAND AFFINITY CHROMATOGRAPHY OF HUMAN SERUM PROTEINS

COLUMN: Blue Sepharose CL-6B pH:5,8Human serum samples prepared by Sephadex G-25

Page 36: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 37: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

FENIL BORONÁT AFFINITÁSI KROMATOGRÁFIA

Page 38: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

PSEUDO-URIDIN MEGHATÁROZÁSA HUMÁN VIZELETBEN

Page 39: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV

PSEUDO-URIDINE DETERMINATIONPRINCIPLE

NUCLEOSIDES (PSEUDO-URIDINE) WITH VICINAL HYDROXYL GROUPS IN THEIR STRUCTURE CAN BE EXTRACTED SELECTIVELY BY AFFINITY CHROMA-TOGRAPHY FROM COMPLEX BIOLOGICAL SAMPLES AND SEPARATED BY REVERSED-PHASE HPLC.

SAMPLE PREPARATION

MICRO-PREPARATIVE BORONATE AFFINITY COLUMN (Affi-Gel 601, Bio-Rad Labs, 5x50 mm) WAS EQULIBRATED WITH 0.25M NH4-ACETATE (pH 8-8).

ONE ml URINE WAS MIXED WITH 0.3 ml 2.5M NH4-ACETATE (pH 9.5) AND

CENTRIFUGED. 500 μL SUPERNATANT WAS APPLIED ON THE AFFINITY

COLUMN AND WASHED WITH 2x4 ml 0.25M NH 4 - ACETATE (pH 8.8).

ELUTION WAS PERFORMED WITH 5 ml 0.1M FORMIC ACID. ELUATE WAS COLLECTED AND FREEZE-DRYED. THE RESIDUE WAS SOLVED IN 250 μL 10mM NH4~PHOSPHATE (pH 5) CONTAINING 2 % METHANOL.

HPLC ANALYSIS

HP 1084B LIQUID CHROMATOGRAPH ISOCRATIC ELUTION WITH 10mM PHOSPHATE BUFFER (pH 5.1) CONTAINING 2% (v/v) METHANOL.,

COLUMN: ODS-HYPERSIL (25x0.46 cm, 5u) TEMP: 35°C. FLOW: 1 ml/min.

DETECTION: 254 nm.

Page 40: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV
Page 41: ELVÁLASZTÁSTECHNIKA  IV