Tomáš Polák

Tomáš Polák

Prezentace

1. Základní informace o fungování BBM

2. Představení aplikace BBM

3. Dosažené výsledky

Základní informace• BBM vznikla jako pracoviště spolupracující na realizaci projektu

„Projekt BBMRI_CZ v rámci budování české části velké distribuované výzkumné infrastruktury pan-evropského významu: vytvoření a provoz sítě bank biologického materiálu pro biomedicínský výzkum“ s cílem vybudovat českou část pan-evropské sítě bank biologického materiálu pro biomedicínský výzkum (Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure).

• Sběr vzorků biologických materiálů a jejich uchovávání• Uchovávání dat o vzorcích• Výzkum

– Objasnění mechanismu vzniku chorob– Objasnění vlivu podílu genetických faktorů a vlivu životního stylu i

vnějšího prostředí na dané onemocnění

Historie

10 / 2011Vznik BBM

09 / 2011 – 06/2012

Vybudování zázemí BBM

03 / 2012Souhlas etické

komise VFN

10 / 2012Zahájení prací na aplikaci

BBM

01 / 2013Spuštění provozu

BBM

BBM mapa

Odběr vzorků – ve spolupráci s pracovišti VFN

Gynekologicko-porodnická klinika I. Chirurgická klinika Stomatologická klinika Urologická klinika

Onkologická klinika Oční klinikaIV. Interní klinika – gastroenterologie a

hepatologie

I. Interní klinika – hematologie

Radiodiagnostická klinika

Dermatovenerologická klinika

Odběr vzorků - typy

Tkáň Krev Moč

Odběr vzorků - aplikace

Zpracování vzorků - pracoviště

Ústav lékařské biochemie a laboratorní

diagnostiky (ÚLBLD)

Ústav patologie (Hlavův ústav)

ÚLBLD

• 1. LF UK v Praze, Na Bojišti 3, 128 00 Praha • Administrativní sídlo• Vzorky sérum, plasma, plná krev, dna, moč• Pro úschovu mrazáky

ÚLBLD

Ústav Patologie

• 1. LF UK v Praze, Studničkova 2, 128 00 Praha 2• Vzorky tkáně a tkáně v RNA lateru• Pro úschovu mrazáky a Dewarovy nádoby• Rekonstrukce laboratoří BBM v roce 2011

Ústav patologie

Aplikace BBM

• Modul pro přidávání vzorků pro kliniky• Import export MSSQL databáze• MSSQL databáze Banky biologického materiálu• Webová aplikace Banky biologického

materiálu

Schéma aplikace BBM

Schéma datové komunikace

Moduly aplikace

Centrum aplikace

Sérový modul

Bioptický modul

Tkáňový modul

DNA modul

Mrazáky

Boxy

Skupiny uživatelů

Správci Etici Klinici UP Klinici ULBLD

Technici UP

Technici ULBLD

Klinici VFN

Odebráno vzorků

Tkáň Krev Moč0

102030405060708090

57

85

27

Počty odebraných vzorků

Řada 1

Počet alikvotů

Tkáň Tkáň Later

Plná krev

Sérum Plasma DNA Moč0

50100150200250300350400450500

250

11781

464

314

142 130

Počet alikvotů

Řada 1

Podporováno projektem LM2010004

Dotazy

Děkuji za pozornost