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Lecture explaining the Bouchout Declaration with principles in French
Citation preview
for Open Biodiversity Knowledge Management
Donat AgostiPlazi
OpenData Week, Montpellier, July 12, 2014
Bouchout Declaration
Biodiversity CrisisX
New scientific tools
Hardisty, Nature 502, 171 (2013)
BUT: predictive ecology has substantial data needs
Harfoot, BIH2013, Rome, 2013
The big question
What is the future of the biological world?
Imagine if we could:
…Predict community level dynamics of ecosystems atscales from local to global, based on the ecology andbiology of all individual organisms
Decentralized biodiversity infrastructure
Plants3,400 Herbaria worldwide10,000 Associate curators and specialists350,000,000 specimens in collections 180,000,000 specimens digitized2,000,000,000 specimens including animals
Source: gbif.org; http://sciweb.nybg.org/science2/IndexHerbariorum.asp
One collection’s view of the world
Nationaal Herbarium Nederland collection on GBIF
Source: http://www.gbif.org/dataset/7b33b040-f762-11e1-a439-00145eb45e9a
200,000,000+ printed pages1,900,000 species described20,000,000+ species treatments 17,000 new species per year
Biodiversity libraries
BUT: The data are hidden
Incomplete digitization Publications are not semantically
enhancedCollections are incompleteData is not linkedMost data are not open
Names as information tags in life sciences
Names
Characteristics
Publications
GenesCollections
Specimens
Distribution
Coordination and Policy Development in Preparation for a European Open Biodiversity Knowledge Management
System
Supported by the European Commission through its FP7 research funding programme
(pro-)iBiosphere
iBiosphere
Biodiversity Knowledge Management System
Create digital objects + Identifiers and resolvers
+ Open Access+ Legislation
+ Adequate infrastructure+ Sustainable and permanent infrastructure
+ Reliable services for partners in research projects and society
Seamless Global Virtual Research Knowledge Management System(European Open Biodiversity Knowledge Management System)
Biodiversity Knowledge Management System
Why another declaration?
free of charge online access to EU-funded research…
essential for Europe's ability to enhance its economic performance and improve the capacity to compete through knowledge
http://ec.europa.eu/digital-agenda/en/open-access-scientific-information
Access to digital data sets resulting from federally funded research….
will accelerate scientific breakthroughs and innovation, promote entrepreneurship, and enhance economic growth and job creation.
http://www.whitehouse.gov/blog/2013/02/22/expanding-public-access-results-federally-funded-research
http://www.nature.com/news/2011/110511/full/news.2011.281.html
800 billion USD have been generated by the human genome project
After all, there is a Budapest Declaration, a Berlin Declaration, a Bethesda Declaration…
… but additional messages:Direct access to digital content
… but additional messages:Direct access to digital contentRe-acting: The biodiversity community is re-acting together to novel environmental, scientific and societal challenges
… but additional messages:Direct access to digital contentRe-acting: The biodiversity community is re-acting together to novel environ-mental, scientific and societal challengesThird leg: digital content as commitment
… but additional messages:Direct access to digital contentRe-acting: The biodiversity community is re-acting together to novel environ-mental, scientific and societal challengesThird leg: digital content as commitmentCatalyst for discussions
Bouchout Declaration
Bouchout Declaration
http://bouchoutdeclaration.org
Launched: June 12, 2014
Bouchout Declaration
signatories
Bouchout Declaration
(75)
(147)
Bouchout Declaration
Bouchout Declaration
But: Gestion Collaborative du Libre Accès aux Connaissances sur la Biodiversité (Open Biodiversity Knowledge Management)
En tant que signataires, nous encourageons une approche globale de la Gestion Collaborative du Libre Accès aux Connaissances sur la Biodiversité, basée sur les principes fondamentaux suivants :
Bouchout Declaration
Open Access
Utilisation libre et ouverte des ressources numériques sur la biodiversité et des services d’accès associés
Bouchout Declaration
LicensesLicences ou clauses de renonciation qui accordent ou permettent à tous les utilisateurs un droit libre, irrévocable et international de copier, utiliser, diffuser, transmettre et rendre public le travail effectué, ainsi que d’exploiter le travail réalisé et de faire des travaux dérivés, sous réserve d’une attribution conforme aux pratiques communautaires, tout en reconnaissant que les fournisseurs pourront développer des produits commerciaux avec des licences plus restrictives.
Bouchout Declaration
Licenses ctd.
Data and research results are not copyrighted and thus no license should be addedIf possible, publications should be created as Open Access works
Bouchout Declaration
Policy
Elaboration de politiques qui favoriseront un accès libre et ouvert aux données sur la biodiversité
Bouchout Declaration
Attribution
Suivi de l’utilisation des identifiants dans les liens et les citations pour garantir que les sources et les fournisseurs de données se voient attribuer la reconnaissance de leurs contributions
Bouchout Declaration
Infrastructure
Mise en place d’infrastructure, normes et protocoles communs pour améliorer l’accès aux données ouvertes et leur utilisation
Bouchout Declaration
Registers
Registres de contenus et de services pour permettre la découverte, l’accès et l’utilisation des données en libre accès
Bouchout Declaration
Persistent Identifiers
Identifiants permanents pour les objets de données et les objets physiques tels que les spécimens, les images et les traitements taxonomiques avec des mécanismes standard pour diriger les utilisateurs directement vers les contenus et les données
Bouchout Declaration
Linked Open Data
Liaison des données utilisant des vocabulaires communs, à la fois au sein et au-delà de la biodiversité, qui permettent la participation à une infrastructure en nuage des Données Liées en Libre Accès
Bouchout Declaration
Development
Dialogue pour préciser le concept, les priorités et les exigences techniques de la Gestion en Libre Accès des Connaissances sur la Biodiversité
Bouchout Declaration
Business
Gestion durable et en Libre Accès des Connaissances sur la Biodiversité attentive aux aspects scientifiques, sociologiques, juridiques et financiers
Sign now!
Et vous?bouchout@plazi.org
bouchoutdeclaration.org
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