Upload
others
View
2
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
LIETUVOS SVEIKATOS MOKSLŲ UNIVERSITETAS
FARMACIJOS FAKULTETAS
VAISTŲ CHEMIJOS KATEDRA
VYTAUTAS PETREIKIS
2,5-pakeistų-4-tiazolinono darinių sintezė ir
antimikrobinio aktyvumo įvertinimas
Magistro baigiamasis darbas
Darbo vadovas:
Prof. dr. Hiliaras Rodovičius
Konsultantas:
Prof. dr. Alvydas Pavilionis
Kaunas, 2014
2
LIETUVOS SVEIKATOS MOKSLŲ UNIVERSITETAS
FARMACIJOS FAKULTETAS
VAISTŲ CHEMIJOS KATEDRA
TVIRTINU:
Farmacijos fakulteto dekanas Prof. dr. Vitalis Briedis
Data
2,5-pakeistų-4-tiazolinono darinių sintezė ir antimikrobinio
aktyvumo įvertinimas
Magistro baigiamasis darbas
Konsultantas Darbo vadovas
Prof. dr. Alvydas Pavilonis Prof. dr. Hiliaras Rodovičius
Data Data
Recenzentas Darbą atliko
Magistrantas Vytautas Petreikis
Data Data
KAUNAS, 2014
3
Turinys
SANTRAUKA................................................................................................................................ 5
SUMMARY ................................................................................................................................... 6
SANTRUMPOS ............................................................................................................................ 7
SĄVOKOS.................................................................................................................................... 8
PADĖKA....................................................................................................................................... 9
ĮVADAS ...................................................................................................................................... 10
DARBO TIKSLAI IR UŽDAVINIAI............................................................................................... 12
1. LITERATŪROS APŽVALGA ............................................................................................... 13
1.1. Antimikrobinių vaistų poreikis ....................................................................................... 13
1.2. Natūraliais produktais paremtas vaistų kūrimas ........................................................... 14
1.3. Česnako ir jo aktyvių junginių panaudojimas medicinoje.............................................. 17
1.4. Rodaninas ir jo dariniai................................................................................................. 20
1.5. Apibendrinimas............................................................................................................. 21
2. TYRIMO METODIKA........................................................................................................... 22
2.1. Rodanino darinių sintezė.............................................................................................. 22
2.1.1. 5-pakeistų rodanino darinių sintezė .......................................................................... 22
2.1.2. 5-pakeistų-2-alil-rodanino darinių sintezė ................................................................. 22
2.2. Lydymosi temperatūros nustatymas............................................................................. 25
2.3. Junginių strūktūros nustatymas IR spektroskopijos būdu............................................. 26
2.4. Junginių grynumo nustatymas...................................................................................... 26
2.5. Junginių antimikrobinio poveikio tyrimas in silico ......................................................... 27
2.6. Junginių antimikrobinio poveikio tyrimas in vitro........................................................... 28
2.7. Apibendrinimas............................................................................................................. 30
3. REZULTATAI IR JŲ APTARIMAS....................................................................................... 31
3.1. Rodanino junginių sintezė ............................................................................................ 31
3.1.1. 5-pakeistų-rodanino junginių sintezė ........................................................................ 31
3.1.2. 2-alil-5-pakeistų-rodanino junginių sintezė................................................................ 32
3.1.3. 2-propil-5-nitrofurfuril-rodanino (VIP-48) sintezė....................................................... 34
3.2. Junginių strūktūros nustatymas IR spektroskopijos būdu............................................. 35
3.3. Junginių antimikrobinio aktyvumo tyrimas in silico ....................................................... 35
4
3.4. Junginių antimikrobinio aktyvumo tyrimas in vitro......................................................... 37
3.5. Apibendrinimas............................................................................................................. 42
4. IŠVADOS ............................................................................................................................ 43
5. PRAKTINĖS REKOMENDACIJOS...................................................................................... 44
6. LITERATŪROS APŽVALGA ............................................................................................... 45
7. PRIEDAI .............................................................................................................................. 52
5
SANTRAUKA
2,5-pakeistų-4-tiazolinono darinių sintezė ir antimikrobinio aktyvumo įvertinimas. V.
Petreikio magistro baigiamasis darbas/ mokslinis vadovas prof. dr. Hiliaras Rodovičius; Lietuvos
Sveikatos mokslų universiteto, Farmacijos fakulteto, Vaistų chemijos katedra. – Kaunas.
Darbo tikslas. Susintetinti naujus 2,5-pakeistus-4-tiazolinono junginius ir ištirti jų
antimikrobinį aktyvumą.
Darbo uždaviniai:
1. Susintetinti 2,5-pakeistus-4-tiazolinono junginius.
2. Ištirti gautų junginių poveikį tyrimais in silico ir in vitro.
3. Susieti gautų junginių struktūros ryšį su jų aktyvumu.
Metodai. Junginiai buvo sintezuoti mikrobangų metodu. Junginių aktyvumas buvo tiriamas in
silico. Atliktas pirminis mikrobiologinis tyrimas in vitro užnuodytos lekštelės metodu.
Rezultatai. Buvo susintetinti 8-uoni 2,5-pakeisti-4-tiazolinono dariniai. Atlikus tyrimus in
silico, buvo nustatytas preliminarus poveikis S. aureus esančiam baltymui fabI. Atlikus pirminius
tyrimus in vitro buvo pastebėtas trijų junginių su 5-nitrofurano pakaitu (VIP-41), 5-para-
brombenzaldehido pakaitu (VIP-42), 5-dimetilamino (VIP-47) galimas priešmikrobinis poveikis
prieš tirtus mikroorganizmus.
Išvados. Atlikus tyrimus in vitro nustatyta, jog aktyviausi junginiai yra: VIP-41 ir VIP-47.
Rodanino darinių propilo pakaitu 2-oje padėtyje priešmikrobinis aktyvumas mažesnis nei su alilo
pakaitu. Taip pat nustatyta, kad rodanino darinių, su nitrofurolo pakaitu didesniam
antimikrobiniam veikimui reikalinga nitro grupė. Pats alilo pakaitas junginiams reikšmingo
aktyvumo nesuteikia, o svarbesnis aktyvumui aldehido pakaitas 5-oje padėtyje.
6
SUMMARY
Synthesis of 2,5-substituted-4-thiazolinone derivatives and evaluation of
antimicrobial activity. V. Petreikis Master thesis/ Scientific supervisor prof. dr. Hiliaras
Rodovičius, consultant – prof. dr. Alvydas Povilonis; Lithuanian University of Health Sciences,
Faculty of Pharmacy, Department of Drug Chemistry. – Kaunas.
The aim of research. Synthesize new 2,5-substituted-4-thiazolinone derivatives and
evaluate their antimicrobial activity.
Tasks of research:
1. Synthesize new 2,5-substituted-4-thiazolinone derivatives.
2. Evaluate antimicrobial activity of newly synthesized 2,5-substituted-4-thiazolinone
derivatives.
3. Evaluate compounds structure-activity relationship.
Methods. Compounds were synthesized with microwave method. Their activity was
evaluated in silico. Synoptic research in vivo was accomplished by a poisoned plate technique.
Results. 8 2,5-substituted-4-thiazolinone derivatives were synthesized. After in silico
research was evaluated preliminary bactericidic compounds activity against S. aureus, acting on
fabI protein. Synoptic research in vitro has shown antimicrobial activity of three compounds: 5-
nitrofuran substituted (VIP-41), 5-para-brombenzaldehyde substituted (VIP-42), 5-
dimethylaminebenzaldehyde substituted (VIP-47).
Conclusions. Research in vitro has shown that the most active compounds are: VIP-41 and
VIP-47. Evaluated, that 4-thiazolinone derivatives with propyl substituent in a 2-nd position
antimicrobial activity is less than with allyl substituent. For better anctimicrobial activity nitro
group is necessary in 4-thiazolinone derivatives with nitrofurfural substituent. Allyl substituent
does not provide significant antimicrobial activity itself, more important is aldehyde substituent in
5-th position.
7
SANTRUMPOS
BMR - branduolių magnetinio rezonanso spektroskopija
DMSO – dimetilsulfoksidas
ESC – efektyvioji skysčių chromatografija
fabI – už riebiųjų rūgščių sintezę S. aureus bakterijoje atsakingas baltymas
LD50 - dozė, nuo kurios miršta 50% populiacijos narių
MRSA – meticilinui atsparus S. aureus (Methicillin-resistant Staphylococcus aureus)
MSK – minimalioji slopinamoji koncentracija
PBP – peniciliną prijungiantis baltymas (Penicillin-Binding Protein)
PSO – Pasaulio sveikatos organizacija
MS - masių spektrometrija
UV-Vis – ultravioletinės spinduliuotės ir regimosios šviesos spektrofotometrija
µg/ml – mikrogramai mililitre (koncentracijos reiškimo būdas)
mg/l – miligramai litre (koncentracijos reiškimo būdas)
B. cereus – Bacillus cereus
B. subtilis – Bacillus subtilis
C. albicans – Candida albicans
E. coli – Escherichia coli
E. faecalis – Enterococcus faecalis
E. faecium – Enterococcus faecium
H. pylori – Helicobacter pylori
K. pneumoniae – Klebsiella pneumoniae
M. tuberculosis – Mycobacterium tuberculosis
P. aeruginosa – Pseudomonas aeruginosa
P. mirabilis – Proteus mirabilis
S. aureus – Staphylococcus aureus
S. pyogenes – Streptococcus pyogenes
S. pneumoniae – Streptococcus pneumoniae
8
SĄVOKOS
in silico – bandymo metodas, panaudojant sudėtingus kompiuterinius modelius.
in vitro – procesas (bandymas, tyrimas), atliekamas arba stebimas ne organizme, bet dirbtinėje
sistemoje.
Nitrofuranai – antibakterinių vaistinių preparatų grupė, kurių struktūroje yra 5-nitrofurano žiedas.
Rodaninas – cheminis junginys 2-tiokso-1,3-tiazolidin-4-onas.
Softdent – kompiuterinė programa, kurioje fiksuojamas prekių pardavimas iš didmenininko į
vaistines.
9
PADĖKA
Dėkoju darbo vadovui prof. dr. H. Rodovičiui, konsultantui prof. dr. A. Povilioniui už
pagalbą ir konsultacijas vykdant tyrimus ir rašant magistrinį darbą.
Dėkoju prof. habil. dr. E. Tarasevičiui už sudominimą vaistų sinteze ir patarimus
sintezuojant junginius.
Doktorantui L. Šlepikui už pagalbą laboratorijoje, atliekant tyrimus ir rašant magistrinį
darbą.
Doktorantui J. Saliui už pasiūlytą idėją darbo temai ir pagalbą sintezuojant junginius.
L. Akramui už suteiktą galimybę atlikti IR spektroskopijos tyrimus.
Doktorantui M. Marksai už pagalbą tiriant junginių grynumą.
10
ĮVADAS
Temos aktualumas. Antimikrobinių vaistų sukūrimas buvo vienas svarbiausių XX a. pasiekimų
medicinoje. Antimikrobiniai vaistai žymiai sumažino mirtingumą nuo infekcijų, palengvino
infekcijų gydymą [3]. Tačiau bakterijos turi savybę greitai prisitaikyti prie naujų aplinkos sąlygų,
todėl dėl netinkamo antibiotikų vartojimo ir gydytojų neracionalaus antibiotikų išrašymo
pacientams, sparčiai didėja mikroorganizmų atsparumas jiems [31, 76, 2]. Dėl atsparumo didėja
ne tik mirtingumas nuo infekcijų, bet ir patiriami dideli piniginiai nuostoliai. Paskaičiuota, kad
Jungtinėse Amerikos Valstijose nuostoliai siekia nuo 21 mlrd. iki 34 mlrd. dolerių ir apie 1,5 mlrd.
eurų Europoje. [77] Mirštamumas nuo rezistentiškų mikroorganizmų padermių sukeltų infekcijų
yra dvigubai didesnis nei nuo sukeltų ne rezistentiškų mikroorganizmų padermių [76].
Pagal softdent duomenis [75] 2006 metais kiekvienam Lietuvoje gyvenančiam žmogui
vidutiniškai teko po vieną antibiotikų gydymo kursą, o tai yra gana daug. Buvo nustatyta, kad
2005 – 2007 peroralinių rezervinių antibiotikų suvartojimas padidėjo 13 %, palyginus įprastinių-
sumažėjo 15 %. Parenterinių įprastinių antibiotikų suvartojamas kiekis taip pat mažėjo – 17,5 %,
rezervinių didėjo 37,9 % [75]. Tai rodo mažesnį įprastinių antibiotikų veiksmingumą.
Tyrimu Lietuvoje taip pat nustatyta, jog neracionalus antibiotikų vartojimas Lietuvoje
vyksta dideliais mastais ir kas blogiausia, nustatyta, kad gydytojai dažnai neracionaliai parenka
gydymą antibiotikais. Šeimos gydytojai net 9,5 % atvejų paskiria netinkamus antibiotikus. Tik
42,9 % atvejų antibiotikai skiriami pagal tinkamas indikacijas. Dažniausiai netinkami antibiotikai
skiriami gydant šlapimo takų ir akių infekcijas [2].
Norint išvengti mikroorganizmų rezistentiškumo augimo, reikia tinkamai vartoti
antibiotikus. Taip pat gali padėti naujų antimikrobinių vaistų kūrimas.
Daug naujų vaistų yra gaunama ar sintezuojama iš natūralių produktų: iš augalų, gyvūnų,
mikroorganizmų. Augalai jau tūkstančius metų naudojami kaip vaistai. Dažniausiai buvo
naudojamos tinktūros, arbatos, milteliai ar kitos formos, o ne iš augalo išskirtos švarios
medžiagų frakcijos. Medicinai ir technologijoms žengiant pirmyn atsirado galimybės išskirti
junginius iš augalų, ištirti jų cheminę struktūrą ir poveikį.
Pirmoji iš augalo izoliuota medžiaga buvo morfinas - XIX a. pradžioje. Jis buvo išskirtas iš
opiumo, gaunamo iš aguonos. Vaistų paieška natūraliuose produktuose vedė prie kitų vaistinių
11
medžiagų izoliavimo, tokių kaip: kokaino, kodeino, digoksino - visi jie naudojami iki šiol [17].
Vaistų paieška ir gamyba iš natūraliose produktuose esančių medžiagų tęsiasi iki šiol [70].
Vienas iš daugiausiai gydymui naudojamų augalų – česnakas - nuo seno naudojamas
tradicinėje medicinoje. Česnakas pasižymi įvairiu gydomuoju poveikiu [30,57,32], tarp jų ir
antimikrobiniu poveikiu prieš įvairias Gram - teigiamas ir Gram - neigiamas bakterijas ir grybelius
[56].
Rodanino dariniai turi platų antimikrobinį veikimą. Buvo susintetinta ir tirta daug rodanino
darinių. Pastebėtas jų poveikis prieš daug įvairių infekcijų sukėlėjų, nustatytas jų inhibicinis
poveikis biologiniam taikiniam, tokiem kaip: hepatito C viruso NS3 proteazei [59], aldozės
reduktazei [16,27], Beta-laktamazei [28], UDP-N-acetylmuramato/L-alanino lipazei [58],
peniciliną prijungiančiam baltymui [70], katepsinui D [42], ir histidino dekarboksilazei [25].
Pastebėtas rodanino darinių poveikis atspariom S. aureus padermėm [30, 63].
Rodanino junginių sintezė jau daugelį metų vykdoma Lietuvos sveikatos mokslų
universiteto Vaistų chemijos katedroje. Mokslininkai Eduardas Tarasevičius [8], Raimondas
Radžiūnas [7], Vilma Petrikaitė [5] sintetino ir tyrė rodanino junginius.
Teorinė ir praktinė tyrimo reikšmė. Didėjant žmonių sergamumui ir mirštamumui nuo
antibiotikams atsparių mikroorganizmų sukeltų ligų, didėja poreikis naujų antimikrobinių junginių
sintezei. Dėl literatūroje aprašytų rodanino junginių ir česnako ekstraktų antimikrobinių poveikių,
rodanino ir alicino deriniai gali turėti antimikrobinį poveikį.
Temos ryšys su tyrimo metodika ir rezultatais. Pasirinkus tyrimo metodiką buvo susintezuoti
2,5-pakeisti-4-tiazolinono junginiai. Junginių struktūrai patvirtinti buvo nustatyti jų IR spektrai.
Antimikrobiniam poveikiui nustatyti buvo atlikti tyrimai in silico ir in vitro. Rezultatuose aptariami
mikrobiologinių tyrimų rezultatai ir struktūros - aktyvumo ryšys.
Darbo tikslas. Susintetinti naujus 2,5-pakeistus-4-tiazolinono junginius ir ištirti jų antimikrobinį
aktyvumą.
12
DARBO TIKSLAI IR UŽDAVINIAI
Tyrimo kryptis. Vaistų sintezė.
Tyrimo problema. Mikrobų rezistentiškumo antibiotikams didėjimas.
Tyrimo eiga.
1. Mokslinės literatūros apžvalga
2. Susintetinti naujus 2,5-pakeistus-4-tiazolinono junginius.
3. Susintetintų junginių struktūros nustatymas.
4. Susintetintų junginių aktyvumo įvertinimas tyrimais in silico ir in vitro.
5. Gautų rezultatų analizė.
Tyrimo instrumentai. SYBYL-X molekulinio modeliavimo programa (bandomoji versija).
Mikrobiologiniai tyrimai užnuodytos lekštelės standžioje terpėje metodu.
Darbo tikslas. Susintetinti naujus 2,5-pakeistus-4-tiazolinono junginius ir ištirti jų antimikrobinį
aktyvumą.
Darbo uždaviniai
1. Susintetinti 2,5-pakeistus-4-tiazolinono junginius.
2. Ištirti gautų junginių poveikį tyrimais in silico ir in vitro (užnuodytos lėkštelės standžioje
terpėje metodas).
3. Susieti struktūros ryšį su gautų junginių aktyvumu.
13
1. LITERATŪROS APŽVALGA
1.1. Antimikrobinių vaistų poreikis
Antimikrobiniai vaistai – antibiotikai - tai medžiagos žudančios mikroorganizmus, ar
stabdančios jų augimą [74]. Antimikrobiniai vaistai naudojami gydyti bakterijų, grybelių, virusų,
parazitų sukeltas infekcijas. Pirmasis antimikrobinis preparatas buvo išskirtas 1928 metais iš
grybelio Penicillium rubens. Jį išskyręs Aleksandras Flemingas pavadino medžiagą penicilinu
Penicilinas 1942 metais buvo sėkmingai panaudotas streptokoko sukeltai infekcijai gydyti [60].
PSO duomenimis [78] labai opi problema XXI a. tapo bakterijų rezistentiškumas
antimikrobinėms medžiagoms. Bakterijų tapimas rezistentiškomis antibiotikams yra natūralus
fenomenas, kai naudojant antibiotikus įvyksta bakterijos genų mutacija. Rezistentiškumo
atsiradimą pagreitina:
mažai arba jokių antimikrobinio rezistentiškumo priežiūros ir monitoravimo sistemų,
netinkamas antibiotikų vartojimas, įskaitant jų naudojimą gyvulininkystėje,
mažai prevencijos ir kontrolės nuo infekcijų priemonių,
nebaigiamas gydymo antibiotikais kursas,
rezistentiškumas plinta, nes kai kurie mikroorganizmai gali vieni kitiem perduoti
rezistentiškumo bruožus.
Dėl rezistentiškų mikroorganizmų infekcijų:
įprastas gydymas tampa neveiksmingas, dėl ko prailgėja pacientų gyjimas ir padidėja
mirties rizika. Tokių pacientų mirštamumas yra dvigubai dažnesnis,
ilgesnis gyjimas padidina riziką rezistentiškoms infekcijoms plisti,
infekcijos tampa rezistentiškos įprastiems antibiotikams, todėl naudojami kiti, brangesni,
antibiotikai. Taip pat pailgėja žmonių sveikimas, gydymas ligoninėse, dėl to išauga
gydymo kaina – kiekvienam asmeniškai ir valstybei.
joms išplitus taptų pavojinga atlikti chemoterapiją vėžio gydymui, organų transplantaciją,
chirurgines operacijas.
Meticilinui-rezistentiškas Staphylococcus aureus (MRSA) yra viena dažniausiai pasitaikančių
infekcijų, įgautų sveikatos priežiūros įstaigose. MRSA plitimas Europoje dabar stabilizavosi ir
netgi pradėjo mažėti. Šešiose Europos valstybėse pastebėtas ženklus MRSA padermių
mažėjimas (Belgijoje, Prancūzijoje, Vokietijoje, Airijoje, Ispanijoje ir Jungtinėje Karalystėje), ir tik
14
keturiose valstybėse jų skaičius augo (Vengrijoje, Liuksemburge, Lenkijoje ir Rumunijoje). Nors
šie duomenys suteikia optimizmo, MRSA infekcijos vis tiek išlieka gydymo įstaigų prioritetas, nes
MRSA vis tiek sukelia daugiau nei 25% visų infekcijų aštuoniose iš dvidešimt aštuonių tikrintų
šalių, labiausiai pietų ir rytų Europoje [73] (1 pav.).
1 pav. MRSA paplitimas Europoje 2011 metais [73]
1.2. Natūraliais produktais paremtas vaistų kūrimas
Natūralūs produktai, kaip augalai, gyvūnai ir mineralai, yra vaistų gamybos pagrindas
[36, 46]. Istoriškai dauguma naujų vaistų buvo sukurti iš natūralių produktų ar gauti iš medžiagų,
išskirtų iš natūralių produktų [22].
Prieš XX - ajį amžių, neapdirbti ar beveik gryni ekstraktai iš augalų, gyvūnų ar
mineralų buvo vieninteliai galimi vaistai gydyti žmonių ir gyvūnų ligas. Idėja, kad vaistai
organizmuose veikia dėl specifinių sąveikų tarp vaistų molekulių ir biologinių makromolekulių
(dažniausiai baltymų ar nukleorūgščių), o ne tiesiog dėl menamos „gyvenimo galios“, leido
mokslininkams padaryti išvadą, kad augalų ekstraktuose veiksmingi individualūs cheminiai
dariniai. Nuo to prasidėjo nauja farmakologijos era, kai buvo pradėti kurti ir naudoti gryni,
izoliuoti cheminiai dariniai, kurie pakeitė ekstraktus.
15
Klasikinis taip atrasto vaisto pavyzdys yra morfinas, opiumo aktyvusis ingredientas, ir
digoksinas, širdį stimuliuojantis vaistas iš augalo Digitalis lanata. Natūralių produktų paieškos
padeda atrasti naujų veiksmingų struktūrų, kurios vėliau naudojamos kaip modelis, naujų vaistų
kūrimui.
Antibiotikams rezistentiškų mikroorganizmų rūšių plitimas pastūmėjo mokslininkus
ieškoti naujų antimikrobinių medžiagų. Nuo 2000 iki 2008 - ųjų metų buvo užregistruota daugiau
nei 300 natūralių, antimikrobinių savybių turinčių, metabolitų [39]. Tarp jų:
Alkaloidai (pvz.: ksantin-6-onas)
2 pav. Alkaloidas ksantin-6-onas
Acetilenai (pvz.: 6-acetileninės rūgštys)
Kumarinai (pvz.: 7- amino-4-metilkumarinas)
Flavonoidai ir isoflavonoidai (pvz.: apigeninas)
Iridoidai
Lignanai (pvz.: (+)-lyoniresinol-3a-O-b-D-glucopiranozidas)
Makrolidai
Fenoliai (other than flavonoids and lignans) (pvz.: eupomatenoidas-6)
Polipeptidai (pvz.: tripropeptinai)
Chinonai (pvz.: 3,4-Dihidroksi-1-methoxiantrachinon-2-carboksaldehidas)
Steroidiniai saponinai
Terpenoidai (pvz.: seskviterpenas ksantorizolis)
Ksantonai (pvz.: mangostaninas) [52].
Taip pat ir pirmasis antibiotikas penicilinas yra natūralus produktas, išskirtas iš
grybelio Penicillium rubens. Penicilino molekulė buvo chemiškai modifikuojama, norint pagerinti
antibiotiko veikimą, koreguoti poveikio trukmę, stabilumą, sumažinti toksiškumą. Taip sukurta
visa grupė penicilino antibiotikų:
1. Benzilpenicilinai
2. Fenoksipenicilinai
16
Fenoksimetilpenicilinas
3. Izooksazolilpenicilinai (oksacilino grupė)
Oksacilinas
Kloksacilinas
Dikloksacilinas
Flukloksacilinas
4. Aminobenzilpenicilinai
Ampicilinas
Amoksicilinas
5. Karboksipenicilinai
Karbenicilinas
Tikarcilinas
6. Acilaminopenicilinai
Azlocilinas
Mezlocilinas
Piperacilinas
3 pav. Karbenicilinas 4 pav. Ampicilinas
Medžiagų, išskirtų iš natūralių šaltinių, struktūros dažniausiai nustatomos masių
spektrometrijos (MS) ir branduolių magnetinio rezonanso spektroskopijos (NMR) būdais. Kartais,
norint gauti papildomą informaciją, reikalingą patvirtinti nustatytą struktūrą, naudojami kiti
metodai, kaip infraraudonųjų spindulių spektroskopija, UV spektroskopija, radio spindulių
kristalografija.
17
1.3. Česnako ir jo aktyvių junginių panaudojimas medicinoje
Česnakas priklauso česnakinių augalų šeimai Allium. Šiai šeimai priklauso tokie
augalai, kaip svogūnas, poras. Randama įrodymų, kad žmonės česnaką naudoja jau apie 7000
metų, jis kilęs iš centrinės Azijos [24] ir ilgai buvo svarbus Viduržemio regione. Česnaką taip pat
naudojo ir Senovės Egiptiečiai – kulinarijai ir medicinai [66].
Senovėje česnakas buvo naudojamas nuo daug sutrikimų: nuo parazitų, kvėpavimo
problemų, blogo virškinimo, silpnumo [14].
Šiais laikais, norint įrodyti medicininį česnako veikimą, buvo atlikti tyrimai, jais
nustatyta:
nauda kardiovaskuliarinei sistemai [50, 38],
cholesterolio akumuliaciją ant kraujagyslių
sienelių stabdantis poveikis gyvūnams [64] ir
žmonėms [10, 11, 43, 22, 65, 68, 40, 42],
vazodilataciją sukeliančios savybės [13],
trombocitų agregaciją slopinančios savybės [49,
18, 15, 50],
peršalimo prevencijos [39, 48, 44, 55, 45] ir
gydomosios savybės [69, 44],
cukraus kiekį reguliuojančios savybės [11, 47],
priešvėžinės savybės [51].
Taip pat česnakas buvo naudojamas kaip
antibiotikas. Pirmojo ir antrojo pasaulinio karo metais
česnakas buvo naudojamas kaip antiseptikas, norint
išvengti gangrenos [68]. Pastaraisiais metais buvo
buvo atliktas tyrimas, kur burnos skalavimo skystis,
5 pav. Česnakas turintis 2,5% česnako ekstrakto, veikė antimikrobiškai [29].
Česnakas gali būti naudojamas ir kaip vaistas nuo infekcijų, taip pat ir grybelinių ligų, tokių kaip
pienligė [57].
Česnako galvutėse yra nuo 6 iki 14 mg/g bekvapės cheminės medžiagos aliino (S-
alilcysteino sulfoxidas) [37].
18
Sutraiškius česnaką, fermentas aliinazė, kuris paprastai yra kaupiamas atskiruose
ląstelės dariniuose, yra paskleidžiamas ir susimaišo su aliinu. Dėl jų tarpusavio reakcijos
susidaro alicinas (dialiltiosulfonatas, česnakui kvapą suteikianti medžiaga) [34].
Anksčiau buvo manoma, kad alicinas yra aktyvusis česnako ingredientas, bet nustačius,
jog gyvame organizme jo skilimo pusperiodis yra per trumpas reikšmingai paveikti grybelius,
buvo nustatyta, kad tik alicino skilimo produktams būdingos priešgrybelinės savybes in vivo [26].
Taip pat buvo nustatyta, kad kepenyse dialilo disulfidas, vienas iš aktyvių alicino skilimo
produktų, gali būti metabolizuotas atgal į aliciną [67].
6 pav. Aktyvūs česnako komponentai ir jų skilimo produktai [101]
Kaip jau buvo aptarta, alicinas ir/ar jo skilimo produktai yra pagrindiniai biologiškai
aktyvūs česnako ingredientai, veiksmingi prieš bakterijas, virusus, grybelius, parazitus [9]. Jų
veikimas aiškinamas kaip reakcija tarp junginių sulfido molekulių ir mikroorganizmų sulfhidrilinių
(SH) grupių aminorūgštyse ir ląstelių baltymuose [51].
Buvo tiriamas alicino gebėjimas pereiti pro ląstelių membranas. Gauti rezultatai rodė, kad
fosfolipidų dvisluoksnis nesudaro barjero alicino skverbimuisi į ląstelę, taip pat į ląstelę jis
patenka nepakitęs. Buvo padaryta išvada, kad didelis alicino biologinis aktyvumas yra dėl
reakcingumo su mažos ir didelės molekulinės masės tioliais (CSH grupėmis) ir dėl gero
praeinamumo į ląsteles [41].
Buvo tiriamas ir alicino veikimas prieš MRSA bakterijas. Alicino tyrimas prieš 30 MRSA
padermių parodė didelį aktyvumą prieš jas, įskaitant ir kitoms cheminėms antimikrobėms
19
medžiagoms atsparias MRSA padermes. 88 % ištirtų padermių minimali inhibuojanti alicino
koncentracija buvo 16 mg/l, o visų padermių dauginimasis inibuotas pasiekus 32mg/l
koncentraciją. 88 % MRSA padermių minimali baktericidinė alicino dozė buvo 128 mg/l, ir visos
buvo nužudytos pasiekus 256 mg/l. 82 % šių padermių buvo rezistentiškos mupirocinui. Taip pat
šiame tyrime buvo ištirta, jog stabilesni yra vandeniniai alicino dariniai, spėjama dėl vandenilinių
jungčių [20].
Kaip matome lentelėje (1 lentelė), alicinas pasižymi plačiu antimikrobiniu poveikiu.
Daugumoje atvejų LD50 buvo didesnė, nei įprasta šiuolaikiškiem antibiotikam.
1 lentelė. Alicino antibakterinis aktyvumas [76]
Bakterijų padermė Alicino koncentracija
(LD50 µg/ml) Komentaras
Escherichia coli 15 Jautri antibiotikams
Escherichia coli 15 Rezistentiška antibiotikams
Staphylococcus aureus 12 Jautri
Staphylococcus aureus 12 Rezistentiška meticilinui
Streptococcus pyogenes 3 Jautri
Streptococcus β hemolyticus >100 Rezistentiška antibiotikams
Proteus mirabilis 15 Jautri
Proteus mirabilis >30 Rezistentiška antibiotikams
Pseudomonas aeruginosa 15 Jautri cefproziliui
Pseudomonas aeruginosa >100 Rezistentiška antibiotikams
Enterococcus faecalis >100 Rezistentiška antibiotikams
Alicinui ir jo skilimo produktams būdingas S CH2
R radikalas. Alicinas
sudarytas iš dviejų tokių radikalų, o jo skilimo produktuose šis radikalas išlikęs, tik sujungtas su
kitais radikalais. Dėl šio S-alyl radikalo pasikartojimo visose molekulėse galima spręsti, kad jis
yra atsakingas už alicino ir jo skilimo produktų antimikrobinį aktyvumą, nes jis padidina
molekulės lipofiliškumą, taip pagerindamas patekimą į bakterijas, o siera sudaro vandenilinius
ryšius su baltymų SH grupėmis. Prijungus alilo radikalą prie rodanino molekulės susidaro
S CH2SR
R fragmentas, panašus į ajoeno, turintis du sieros atomus. Remiantis
20
šaltiniais alicino dariniai turintys kelis sieros atomus turi stipresnį antimikrobinį veikimą, dėl
stipresnio jungimosi su bakterijų baltymais [21].
1.4. Rodaninas ir jo dariniai
Rodaninas - penkianarė heterociklinė
molekulė, susidedanti iš tiazolo su karbonilo grupe
ant ketvirto anglies atomo - turi platų farmakologinį
veikimo spektrą: antigrybelinį, antivirusinį,
antibakterinį, antinavikinį ir antidiabetinį potencialą
[71]. Rodanino dariniai veikia inhibuojančiai daug
taikinių, kaip hepatito C viruso NS3 proteazę [60],
aldozės reduktazę [16, 27], beta- laktamazę [28],
UDP-N-acetilmuramoil-L-alanino ligazę [59], 8 pav. Rodaninas
antidiabetinius agentus [23], katepsiną D [42], histidino dekarboksilazę [25].
Panašūs į rodaniną fragmentai aptikti beta - laktaminių antibiotikų struktūrose:
9 pav. Aztreonamas 10 pav. Cefeksimas
11 pav. Cefepimas
21
Rodanino molekulės poveikis koreguojamas įvairiais pakaitais. Daugelis aprašytų
rodanino junginių turi pakaitus 5-oje žiedo padėtyje. Į penktąją padėtį pakaitai įvedami vykdant
aldolinę (Knoevenagel‘io) kondensaciją. Jos metu, vykdant reakciją skirtinguose tirpikliuose,
naudojami katalizatoriai: natrio acetatas, amonio acetatas ar kt. Pagal Lietuvoje atliktus
mokslininkų ir studentų tyrimus stipriausiu antimikrobiniu poveikiu pasižymėjo rodanino junginiai
su į 5 padėtį įvestu 5-nitrofuranu [4, 1, 6, 8, 5].
Lietuvoje su rodanino molekule buvo susintetinta daug junginių [4, 1, 6, 8, 5], tačiau
didžiausią pasisekimą turėjo prof. habil. dr. E. Tarasevičiaus susintezuota medžiaga –
nifumezinas, turinti sulfanilamidinį pakaitą 2-oje padėtyje ir nitrofurano 5-oje padėtyje, kuriai
buvo atlikti ikiklinikiniai tyrimai.
12 pav. Nifumezinas
1.5. Apibendrinimas
Pasaulio sveikatos organizacijos duomenimis priešmikrobinių junginių poreikis yra didelis
ir didėjantis dėl mikrobų rezistentiškumo antibiotikams. Dėl to būtina kurti naujus antibiotikus, o
juos lengviau kurti tiriant ir mėgdžiojant gamtoje esančius ir antimikrobiškai veikiančius junginius.
Nuo seno naudojamas ir antimikrobiniu poveikiu pasižymi česnakas. Nustatyta, kad tai
jame esantis alicinas ir jo metabolitai suteikią česnakui antimikrobinį poveikį, taip pat ir didelį
susirūpinimą keliančias atsparias S. aureus bakterijas.
Rodanino antimikrobinis aktyvumas taip pat jau senai žinomas ir tirtas, dėl to tikimąsi, kad
alicino ir rodanino junginiai veiks baktericidiškai.
22
2. TYRIMO METODIKA
2.1. Rodanino darinių sintezė
2.1.1. 5-pakeistų rodanino darinių sintezė
Norint pagaminti 5 pakeistus rodanino darinius, reikia paimti 0,1 mol (13,3 g) rodanino,
0,1 mol norimo aldehido ir amonio acetato (ar natrio acetato, kai naudojamas aldehidas
nitrofurfurolas). Įpilama 15 ml ledinės acto rūgšties. Kaitinama 100°C iki 10 min. Reakcijos su
nitrofurfurolu metu kaitinama 30 min ne didesnėje nei 60°C temperatūroje. Reakcijos eigoje
iškrenta nuosėdos. Tirpalas atšaldomas, nuosėdos filtruojamos pro stiklo filtrą vakumu ir
perplaunamos ledine acto rūgštimi, etanoliu, eteriu. Tuomet gautos nuosėdos kristalizuojamos iš
acetono arba izopropanolio.
Taip gauti junginiai: 2-5-(5-nitrofuran-2-ilmetilen)-1,3-tiazol-4-onas, 2-5-(p-
brombenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas, 2-5-(p-chlorbenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-
onas, 2-5-(furan-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas, 2-5-(4-hidroksi-3metoksi-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-
4-onas, 2-5-(p-nitrobenziliden -2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas, 2-5-(p-dimentilaminobenziliden-2-
ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas.
2.1.2. 5-pakeistų-2-alil-rodanino darinių sintezė
Šiems junginiams gaminti naudojami 5-pakeisti rodanino dariniai. Imama 5 mmol 5-
pakeisto rodanino junginio, pilama 7ml benzeno ir 5 mmol N,N-diizopropiletilamino. Mišinys
šildomas mikrobangų krosnelėje 200W 20 min, kol nuosėdos ištirpsta. Vėliau į mišinį pilama 4 ml
alilbromido tirpalo ir šildoma mikrobangų krosnelėje 400W 20 min, kol susidaro bespalviai
kristalai. Vykdant reakcija su rodanino junginiais, turinčiais nutrofurfurilo pakaitą 5-oje padėtyje,
nuosėdos susidaro mišinį ištraukus iš mikrobangės ir palikus kambario temperatūroje, kitų
reakcijų metu nuosėdos iškrenta vykdant reakciją. Reakcijos mišinys su nuosėdom plaunamas
vandeniu ir filtruojamos pro stiklo filtrą vakumu, plaunama etanoliu ir eteriu. Gautos nuosėdos
kristalinamos, kristalizacija pirmu tirpikliu vyksta su anglimi. 2-prop-2-enilsulfanil-5-(5-nitrofuran-
2-ilmetilen)-1,3-tiazol-4-onas (VIP-41) kristalinta iš etilo acetato ir izopropanolio, gauta 0,49 g; 2-
23
prop-2-enilsulfanil-5-(p-brombenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-42) kristalinta iš
acetonitrilo, izopropanolio, etilo acetato, gauta 0,48 g; 2-prop-2-enilsulfanil-5-(p-chlorbenziliden-
2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-43) kristalinta iš acetonitrilo, etanolio, etiloacetato, gauta
0,43 g; 2-prop-2-enilsulfanil-5-(furan-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-44) kristalinta iš
cikloheksano, gauta 0,27 g; 2-prop-2-enilsulfanil-5-(4-hidroksi-3-metoksibenziliden-2-ilmetilen)-
1,3-thiazol-4-onas (VIP-45) kristalinta iš acetonitrilo, izopropanolio, acetonitrilo, benzeno, gauta
0,323 g; 2-prop-2-enilsulfanil-5-(p-nitrobenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-46)
kristalinta iš izopropanolio gauta 0,85 g; 2-propilsulfanil-5-(p-dimentilaminobenziliden-2-
ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-47) kristalinta iš izopropanolio, gauta 0,61 g. Gautų junginių
tirpalai pasižymi specifiniu, česnaką primenančiu kvapu.
Šiomis reakcijomis gauti šie junginiai: 2-prop-2-enilsulfanil-5-(5-nitrofuran-2-ilmetilen)-1,3-
tiazol-4-onas (VIP-41), 2-prop-2-enilsulfanil-5-(p-brombenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas
(VIP-42), 2-prop-2-enilsulfanil-5-(p-chlorbenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-43), 2-
prop-2-enilsulfanil-5-(furan-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-44), 2-prop-2-enilsulfanil-5-(4-
hidroksi-3-metoksibenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-45), 2-prop-2-enilsulfanil-5-(p-
nitrobenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-46), 2-propilsulfanil-5-(p-
dimentilaminobenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-47).
Reakcijos eiga ir rezultatai tikrinami plonasluoksnės chromatografijos būdu, sistema
acetonas:toluenas (4:1), matomas gelsvai fluorescuojantis taškas. Gautiems VIP-41-47
junginiams nustatyti UV ir IR spektrai.
2 lentelė. 5-pakeisti-2-alil-rodanino junginiai
Jung.
Nr R
Išeiga (%)/
reakcijos
laikas (min.)
Lyd. Temp.
°C
Mol. Formulė
(Mr)
Grynumas
pagal ESC %
VIP-41
56/70 141-144 C11H8N2O4S2
296 79,56
24
VIP-42
90/50 156-158 C13H10BrNOS2
340 99,05
VIP-43
78/50 137-138 C13H10BrNOS2
295 98,76
VIP-44
62/50 77-78 C11H9N2O2S2
251 99,45
VIP-45
84/50 141-142 C14H13NO3S2
307 98,52
VIP-46
77/50 135-137
C13H10N2O3S2
306
60,05
VIP-47
81/50 128-130 C16H17NOS2
303 99,31
2.1.3. 5-nitrofurfuril-2-propil-rodanino (VIP-48) sintezė
Šiam junginiui gaminti naudojamas 2-5-(5-nitrofuran-2-ilmetilen)-1,3-tiazol-4-onas. Imama
5 mmol 5-pakeisto-rodanino junginio, pilama 7ml benzeno ir 5 mmol N,N-diizopropiletilamino.
Mišinys šildomas mikrobangų krosnelėje 200W 10 min, kol nuosėdos ištirpsta. Vėliau į mišinį
pilama 4 ml propiliodidas tirpalo ir šildoma mikrobangų krosnelėje 400W 10 min, kol susidaro
bespalviai kristalai. Nuosėdos susidaro ištraukus iš mikrobangės ir palikus kambario
temperatūroje. Reakcijos mišinys su nuosėdomis plaunamas vandeniu ir filtruojamos pro stiklo
filtrą vakumu, plaunama etanoliu ir eteriu. Gautos nuosėdos kristalinamos iš izopropanolio su
anglimi ir etilo acetato.
25
Reakcijos eiga ir rezultatai tikrinami plonasluoksnės chromatografijos būdu, sistema
acetonas:toluenas (4:1). Junginiui nustatyti UV ir IR spektrai.
3 lentelė. 5-nitrofurfuril-2-propil-rodaninas
Jung.
Nr R
Išeiga
(%)/
reakcijos
laikas
(min.)
Lyd. Temp. °C Mol. Formulė
(Mr)
Grynumas
pagal ESC
VIP-48
56/30 146-148 C11H10N2O4S2
298 100
2.2. Lydymosi temperatūros nustatymas
Susintetintų junginių lydymosi temperatūra nustatoma Koflerio lydymosi temperatūros
nustatymo aparatu. Jis susideda iš mikroskopo, kaitinimo elemento, termometro.
Ant objektinio stiklelio uždedamas mažas kiekis medžiagos ir ant viršaus uždedamas kitas
objektinis stiklelis. Medžiaga sutrinama tarp abiejų stiklelių. Vėliau objektiniai stikleliai dedami
ant kaitinimo elemento ir pro mikroskopą stebimi junginio struktūros pokyčiai.
Lydymosi pradžia laikoma pirmo lašelio atsiradimas, o pabaiga – kai visas junginys virsta
skysčiu ir nebėra kristaliukų.
Junginių lydymosi temperatūros pateikiamos antroje ir trečioje lentelėse.
26
2.3. Junginių strūktūros nustatymas IR spektroskopijos būdu
Junginių spektrai buvo užrašyti Perken Elmer Spektrum – 100 spektrometru naudojant
ATR (angl. Attenuated total reflection) priedą, užnešant mažą tiriamo junginio kiekį ant cinko
selenido kristalo.
Tirtų junginių IR spektrai pateikiami 1 priede.
2.4. Junginių grynumo nustatymas
Junginių grynumas nustatomas efektyviosios skysčių chromatografijos (ESC) metodu.
Analizei buvo naudojamas Waters 2695 chromatografas (Waters Corporation, Milford, USA) bei
fotodiodų matricos detektorius Waters 996 PDA (Waters Corporation, Milford, USA). Kolonėlė
junginių atskyrimui C 18 4,6x250 mm, 5 µm ACE kolonėlė, kuri buvo laikoma išoriniame
termostate, 25°C temperatūroje. Prieš atliekant analizę buvo paruošiami tiriamųjų medžiagų
tirpalai tirpinant 1 mg medžiagos 10 ml acetonitrile. Chromatografijai buvo naudojama 10 µl
tirpalo. Mobiliosios fazės greitis 1,2 ml/min. Buvo naudota tokia gradiento sistema: tirpalas A –
0,1% trifluoracto rūgštis vandenyje, tirpalas B – acetonitrilas; 0 min. – 80% A ir 20% B, 15 min. –
20% A ir 80 % B, 20 min. – 10% A ir 90% B, 21 min. – 80% A ir 20% B. Veikliųjų junginių
detekcija atlikta 200-600nm bangų intervale. Rezultatai pateikiami antroje ir trečioje lentelėse.
4 lentelė. Junginių UV-vis pikai
Junginys UV-vis pikai
VIP-1 244; 299; 407
VIP-2 268; 311; 371
VIP-3 267; 311; 370
VIP-4 281; 317; 399
VIP-5 200; 286; 407
VIP-6 316; 375
VIP-7 231; 318; 412
VIP-8 293; 469
27
2.5. Junginių antimikrobinio poveikio tyrimas in silico
Junginių antimikrobiniui poveikiui in silico nustatyti buvo naudojama speciali kompiuterinė
programa TRIPOS SYBYL-X (bandomoji versija).
TRIPOS SYBYL-X yra molekulinio modeliavimo programa. Ji sukurta norint palengvinti ir
pagreitinti aktyvių junginių paiešką vaistų paieškoje. Molekulinis modeliavimas apima daugeli
teorinius ir skaičiavimo metodus, naudojamus modeliuoti ar imituoti molekulės elgseną. Viena iš
svarbiausių molekulinio modeliavimo savybių, tai, kad molekulinės sistemos yra atomistiniame
lygyje. Molekulinio modeliavimo metu skaičiavimai gali būti atliekami dideliam kiekiui medžiagų
vienu metu. Molekulinis modeliavimas suteikia galimybę ištirti gyvame organizme vykstančius
reiškinius: baltymų susilankstymą, fermentų katalizę, konformacinius pokyčius, baltymų
stabilumą, atpažinimo procesus DNR ir membranose.
Atlikus molekulinį modeliavimą programa matematiniais metodais suskaičiuoją apytikrį
rezultatą, kuris parodo intramolekulinių, ne kovalentinių, jungčių, tokių kaip vandenilinės jungtys,
sąveikos stiprumą tarp pasirinktos molekulės ir tiriamos medžiagos atomų. Kuo rezultatas
didesnis, tuo junginio sąveika su mikroorganizmo baltymais stipresnė, ir tiriamasis junginys
galimai aktyvesnis. Taip pat matuojami atstumai tarp tiriamojo junginio vandenilinį ryšį
sudarančios molekulės ir baltyme esančio NADH+ vandenilio atomų. Atstumas matuojamas
Angstremais (Å).
Eiga. Visų pirma internetinėje duomenų bazėje [http://pdb.org] surandama jau
iškristalizuota 4BNF baltymo struktūra. Tuomet baltymas paruošiamas darbui. Pirmiausia iš
baltymo polimerinės struktūros išskiriamas jo monomeras. Iš baltymo turi būti pašalinama
kristalografijos būdu nustatyta triklozano molekulė, kuri išsaugojama atskirai vėlesniems
palyginimams. Baltymas yra paruoštas, kai jis rodomas kaip monomeras, nebeturintis prijungtos
triklozano molekulės.
Paruošus baltymą atliekamas jo validavimas, norint patikrinti programos ir kompiuterinės
informacijos tikslumą. Validavimo metu tyrimam išsaugotą triklozano molekulę bandoma prijungti
prie baltymo, taip pat, kaip ji buvo prisitvirtinusi prieš ją pašalinant iš monomero struktūros.
Validavimo metu keičiami molekuliniai ir programos parametrai, priklausomai nuo to, į kokius
parametrus norėtume, kad programa atsižvelgtų, kaip: tiriamų junginių molekulių vidinį judėjimą,
išsilanktymą prisijungimo metu, 20 faktorių prisijungimo būdų ir kt. Suradus tinkamus parametrus
jie išsaugomi tirti kitus junginius (17 pav.).
Tiriant junginius būtina stebėti ar jis jungiasi prie monomero aktyviojo centro.
28
In silico tyrimo rezultatai pateikiami penktoje lentelėje.
5 lentelė. Tyrimo in silico rezultatai
Junginys Rezultatas Vandenilinių ryšių
skaičius
VIP-41 5,96 2
VIP-42 5,17 3
VIP-43 5,44 2
VIP-44 6,34 4
VIP-45 4,87 4
VIP-46 5,01 2
VIP-47 6,28 4
VIP-48 5,39 1
2.6. Junginių antimikrobinio poveikio tyrimas in vitro
Susintetinti junginiai buvo tiriami mikrobiologiškai in vitro. Aktyvumas buvo tiriamas prieš
šias bakterijų ir grybelių kultūras:
1. Staphylococcus aureus ATCC 25923
2. Staphylococcus epidermidis ATCC 12228
3. Enterococcus faecalis ATCC 29212
4. Escherichia coli ATCC 25922
5. Klebsiella pneumoniae ATCC 33499
6. Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853
7. Proteus mirabilis ATCC 12459
8. Bacillus cereus ATCC 8035
9. Bacillus subtillis ATCC 6633
10. Candida albicans ATCC 60193
Bakterijų ir grybelių pasirinkimą lėmė jų skirtingi struktūriniai ypatumai: gramteigiamos
bakterijos: S. aureus, Staphylococcus epidermidis; gramneigiama E. coli, sudarančios sporas
B. subtilis ir B. cereus, sudaranti kapsulę K. pneumoniae, šliaužianti P. Mirabilis. Taip pat jie
29
dažnai pasirenkami kaip standartiniai mikrobai priešmikrobiniams tyrimams. P. aeruginosa yra
atspari daugeliui antimikrobinių vaistų, o E. faecalis – vienas dažniausių hospitalinių infekcijų
sukėlėjų, be to, jis labai jautrus nitrofurantoino poveikiui [103], todėl naudinga nustatyti, ar
susintetinti nauji nitrofurano dariniai yra aktyvūs prieš šias bakterijas. C. albicans – vienas iš
dažniausiai grybelines infekcijas sukeliančių bakterijų, dėl to dažnai naudojamas kaip
standartinis grybelis tyrimams.
Bakteriostatinės (fungistatinės) junginių koncentracijos nustatytos serijinio skiedimo
būdu standžioje terpėje (Mueller-Hinton broth II, BBL, Cockeysville, JAV).
Etaloninių mikroorganizmų kultūrų paruošimas. Etaloninės bakterijų ir grybelio
C. albicans kultūros buvo auginamos 1 parą prieš tyrimą, termostate, 5 ml mėgintuvėliuose ant
nuožulnaus Miulerio-Hintono agaro. Termostate kultūros laikomos ~24 valandas 35°C. Mikrobų
suspensija gaminama iš išaugintų mikrobų kultūrų fiziologiniame natrio chlorido (0,9 %) tirpale,
standartizuojama McFarland standartiniu indikatoriumi, kuris matuoja mėgintuvėlyje esančios
suspensijos drumstumą. Mikrobų suspensija laikoma standartizuota, kai indikatoriaus reikšmė
lygi 0,5 (tai reiškia, kad 1 ml mikrobų suspensijos yra 1,5 × 108 mikrobų ląstelių).
Tiriamųjų junginių paruošimas mikrobiologiniam tyrimui. Tiriamiamieji junginiai
tirpinami dimetilsulfokside (DMSO), kadangi jų tirpumas vandenyje prastas. Buvo paruošti 1000
µg/ml koncentracijos tirpalai. DMSO taip pat būdingas priešmikrobinis veikimas, todėl kartu buvo
atliekamas kontrolinis tyrimas. Vėliau tiriamųjų junginių tirpalai buvo perkelti į Petri lėkšteles,
kartu dedamas agaras ir sumaišoma sterilia kilpele, taip paruošiami 500 µg/ml koncentracijos
tirpalai. Standartizuotos mikrobų kultūrų suspensijos kilpele po 0,1 ml buvo sėjamos ant
sustingusios standžios terpės su atitinkama junginių koncentracija. Pasėtai mikrobų kultūrų
suspensijai išdžiūvus, Petri lėkštelės dedamos į termokamerą parai laiko.
Kontrolei ant standžiosios Miulerio–Hintono terpės buvo sėjamos etalonines bakterijų ir
grybelio C. albicans kultūros be tiriamosios medžiagos. Kitą dieną vertinamas mikrobų augimas
ir lyginamas su kontrole.
Tirtų junginių minimalios baktericidinės koncentracijos (MSK) pateiktos šeštoje lentelėje.
30
6 lentelė. Antimikrobinio aktyvumo tyrimų rezultatai esant 500 µg/ml koncentracijai
Junginys MSK, µg/ml
S.
au
reu
s A
TC
C 2
59
23
S.
ep
ide
rmid
is
AT
CC
12
22
8
E.
fae
ca
lis A
TC
C 2
92
12
E.
co
li A
TC
C 2
59
22
K.
pn
eu
mo
nia
e A
TC
C
33
49
9 3
P.
ae
rug
ino
sa A
TC
C 2
785
P.
mir
ab
ilis
AT
CC
12
45
9
B.
ce
reu
s A
TC
C 8
03
5
B.s
su
bti
lis
A
TC
C 6
63
3
C.
alb
ica
ns
AT
CC
60
19
3
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
VIP-41 500 500 500 500 500 >500 >500 500 >500 500
VIP-42 >500 >500 >500 >500 >500 >500 500 >500 >500 >500
VIP-43 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500
VIP-44 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500
VIP-45 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500
VIP-46 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500
VIP-47 500 500 500 500 500 500 500 500 500 500
VIP-48 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500 >500
2.7. Apibendrinimas
Šiame skyriuje pateikiami junginių sintezės aprašymai, junginiams atliktų tyrimų
aprašymai ir rezultatai, kaip: lydymosi temperatūros nustatymas, UV ir IR spektrų nustatymas,
grynumo įvertinimas, junginių priešmikrobinis aktyvumo nustatymas in silico ir in vitro.
31
3. REZULTATAI IR JŲ APTARIMAS
3.1. Rodanino darinių sintezė
2-alil-rodanino junginiai buvo sintetinami dėl panašios struktūros česnako junginiui aliinui
ir iš jo išskirtam junginiui alicinui. Česnako junginiai yra nuo seno naudojami, nuo įvairių infekcijų
ir jų aktyvumas yra ištirtas įvairiais tyrimais. Tad manyta, kad rodaninas dar labiau pastiprins
aliino veiksmingumą. Įdomu, kad rodanino alilo junginiai turi česnakui būdingą kvapą.
Prieš pradedant sintezę buvo atlikta jau susintetintų junginių duomenų bazių analizė. Buvo rasta
nedaug susintetintų S-alil rodanino darinių su pakaitais 5 – oje padėtyje, bet nei vienam jų
nebuvo atlikti priešmikrobiniai tyrimai.
Elektroninėje duomenų bazėje rastas vienas jau susintezuotas junginys – VIP–44, tačiau
jam nebuvo atlikta panašių tyrimų.
Pagal turimus duomenis galima palyginti skirtingų aldehidų pakaitų 5 – oje rodanino žiedo
padėtyje antimikrobinį poveikį. Taip pat remiantis jau atliktais magistriniais darbais su panašiais
aldehidais, įvertinti alicino darinio 2 – oje rodanino žiedo padėtyje poveikį mikroorganizmams.
3.1.1. 5-pakeistų-rodanino darinių sintezė
Rodanino-5-pakeistiems junginiams buvo naudojamas jau pagamintas rodaninas. Jis
buvo kristalintas iš butanolio tirpalo. Reakcija buvo vykdoma atliekant Knoevangel‘io
kondensaciją. Šiuo metodu į 5 – ają rodanino žiedo padėtį buvo jungiami aldehidai. Šiai reakcijai
kaip katalizatorius buvo naudojamas amonio acetatas ar natrio acetatas (vykdant reakciją su
nitrofurfurolu). Lietuvoje atliktų tyrimų duomenimis, reakcijos su amonio acetatu vykdavo geriau,
jų išeiga geresnė [80].
Kaip reakcijos tirpiklis buvo naudojama acto rūgštis. Iš pradžių acto rūgštyje, kaitinant, yra
ištirpinami rodaninas ir aldehidas, o vėliau įdedamas katalizatorius. Maišant iškrenta nuosėdos.
Reakcija su nitrofurfurolu vyksta apie 10 minučių, taip pat iškrentant nuosėdoms. Gautos
medžiagos kristalizuojamos acetonu.
32
13 pav. 5-pakeistų-rodanino junginių sintezė
3.1.2. 2-alil-5-pakeistų-rodanino darinių sintezė
Norint gauti 2-alil-5-pakeistus-rodanino junginius vykdoma rodanino-5-pakeistų junginių
alkilizacija. Ji susideda iš dviejų etapų. Pirmasis žingsnis yra rodanino druskų formavimas.
Rodanino-5-acetilo junginiai alkilinami naudojant N,N-diisopropiletilaminą ir nepolinį tirpiklį –
benzeną. Mišinys maišomas, kol susidaro rodanino. Vėliau vykdoma alkilizacija, naudojant
alilbromidą. Reakcijos laikas yra gana ilgas, nes negalima šildyti reakcijos mišinio.
Eksperimentiškai matoma, jog šildant reakcijos mišinį susidaro daugiau šalutinio produkto –
rodanino-N-alilo. Norint pagreitinti reakciją buvo naudojama mikrobangų krosnelė. Tai žymiai
pagreitino reakcijos laiką, o reakcijos mišinys likdavo neįkaitęs. Reakcijos metu susidarydavo
permatomi amonio druskos kristalai, o reakcijos eigai sekti buvo naudojama plonasluoksnė
aliuminio plokštelių chromatografija (PLC), naudojant tirpiklių sistemą toluenas:acetonas (4:1).
Įvykus reakcijai ant aliuminio plokštelės buvo matomi geltonai fluorescuojantys 2-alil-rodanino-
33
5-acetilo dariniai ir melsvi N-alil-rodanino-5-acetilo junginiai. Norint išgryninti 2-alil-rodanino-5-
acetilo darinius buvo atliekama kristalizacija. Pirmoji kristalizaciją buvo vykdoma su anglimi,
vykdant karštą filtraciją iš skirtingų tirpiklių. Buvo matomas akivaizdus kristalų šviesėjimas.
Vėliau, dėl skirtingų susidariusių junginių tirpumų, kristalizacijai buvo pasirenkami skirtinngi
tirpikliai. Remiantis PLC rezultatais medžiagos buvo kristalinamos nuo 1 iki 4 kartų, skirtingais
tirpikliais. Taip gaunami: Šiomis reakcijomis gauti šie junginiai: 2-prop-2-enilsulfanil-5-(5-
nitrofuran-2-ilmetilen)-1,3-tiazol-4-onas (VIP-41), 2-prop-2-enilsulfanil-5-(p-brombenziliden-2-
ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-42), 2-prop-2-enilsulfanil-5-(p-chlorbenziliden-2-ilmetilen)-1,3-
thiazol-4-onas (VIP-43), 2-prop-2-enilsulfanil-5-(furan-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-44), 2-
prop-2-enilsulfanil-5-(4-hidroksi-3-metoksibenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-45), 2-
prop-2-enilsulfanil-5-(p-nitrobenziliden -2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-46), 2-propilsulfanil-
5-(p-dimentilaminobenziliden-2-ilmetilen)-1,3-thiazol-4-onas (VIP-47).
S
NH
S
O
R
S
N
S
O
R CH2
BrCH2
N
CH3 CH3
CH3
CH3 CH3
14 pav. 5-pakeistų-rodanino junginių alkilizacija
34
15 pav. 2-alil-5-vanilin-rodanino kristalai
3.1.3. 2-propil-5-nitrofurfuril-rodanino (VIP-48) sintezė
Šiai sintezei naudojamas jau pagamintas 5-nitrofurfuril-rodaninas. 2-propil-5-pakeisti
rodanino dariniai sintetinami panašiai, kaip ir 2-alil-5-pakeisti-rodanino junginiai, tik vietoj
alilbromido naudojamas propil-jodidas. Gautas 2-propil-5-nitrofurfulil-rodaninas kristalinamas iš
izopropanolio, naudojant anglį, ir iš etilo acetato.
35
S
NH
S
O
R
S
N
S
O
R CH3
ICH3
N
CH3 CH3
CH3
CH3 CH3
16 pav. 2-propil-5-nitrofurfuril-rodanino junginių sintezė
3.2. Junginių struktūros nustatymas IR spektroskopijos būdu
Junginių strūktūra buvo nustatyta IR spektroskopijos būdu. Spektrai buvo analizuojami
pasinaudojant internete rastomis lentelėmis, su organinių junginių funkcinių grupių IR
absorbcijos dažniais [105, 106]. Rezultatai pateikiami septintoje lentelėje.
7 lentelė. Junginių strūktūros nustatymas IR spektroskopijos būdu
Junginys Dažnis Grupė
1705 Keto VIP-41
1475, 1340 Nitro 1690 Keto
VIP-42 660 Br 1690 Keto
VIP-43 751 Cl
VIP-44 1680 Keto VIP-45 1665 Keto
1700 Keto VIP-46
1510, 1340 Nitro VIP-47 1660 Keto VIP-48 1665 Keto
3.3. Junginių antimikrobinio aktyvumo tyrimas in silico
Junginių tyrimui in silico reikėjo pasirinkti taikinį. Juo pasirinkau bakterijoje S. aureus
esanti baltymą 4BNF. Taikiniu pasirinkau S. aureus, dėl šios bakterijos infekcijų gausėjimo ir
rezistentiškumo antibiotikams didėjimo [73], Susintezuotų junginių priešmikrobinis tyrimas in
36
silico atliktas panaudojant kompiuterinio modeliavimo programą “SYBYL-X”. Gauti rezultatai
buvo lyginami su triklozano junginio molekulinio modeliavimo rezultatais. Triklozano aktyvumas
prieš skirtingas MRSA padermes svyruoja MSK (minimali slopinati koncentracija) nuo 0,12 mg/l
iki 4 mg/l ir MBK (minimali baktericidinė koncetracija) nuo 0,25 mg/l iki 32 mg/l [19]. Jo
molekulinio modeliavimo rezultatas 3,99, o atstumas tarp vendenilinius ryšius sudarančių
molekulių – 2,88 Å.
17 pav. 2-alil-5-vanilin-rodanino molekulė prisijungusi prie 4BNF baltymo
Iš rezultatų matome, kad visų gautų junginių molekulinio modeliavimo rezultatai,
jungiantis su 4BNF baltymu, yra geresni nei lyginamojo triklozano.
Tik vieno junginio (VIP-45) rezultatas yra mažesnis nei 5, keturių junginių rezultatas yra
lygus, arba didesnis nei 5, ir dviejų junginių aktyvumas didesnis nei 6. Pats didžiausias
rezultatas nustatytas junginio 5-furfuril-2-alil-rodanino (VIP-44) (16 pav.).
Pastebėta, kad vieni iš aktyviausių junginių yra su furano žiedais. Remiantis LSMU atliktais
tyrimais, junginiai su nitrofurfurolo pakaitu turi didžiausią aktyvumą prieš S. aureus [1, 4, 6], todėl
stebina, kad furano junginio su nitro grupe 5-oje padėtyje rezultatas mažesnis, nei tiesiog su
furano grupe. Junginio VIP-41, kurio antroje padėtyje yra propeno radikalas, rezultatas didesnis
nei junginio VIP-48 su propano radikalu.
Taip pat iš visų rodanino junginių su benzeno pakaitu 5-oje padėtyje, pats aktyviausias
para padėtyje, turintis dimetilamino pakaitą.
37
18 pav. Junginių molekulinio modeliavimo sąveikos su 4BNF baltymu rezultatas
3.4. Junginių antimikrobinio aktyvumo tyrimas in vitro
Norint įvertinti junginio antimikrobinio aktyvumo rezultatų teisingumą in silico, buvo
atliktas pirminis antimikrobinis tyrimas in vitro užnuodytos lėkštelės standžioje terpėje metodu
prieš S. aureus. Taip norint praplėsti tyrimą buvo atliktas tyrimas in vitro ir prieš kitas bakterijų
padermes.
Mikroorganizmai pasirinkti dėl jų skirtingų struktūrinių ypatumų. Bakterijos
Staphylococcus aureus (gramteigiama), Staphylococcus epidermidis (gramteigiama), E. coli
(gramneigiama), B. subtilis ir B. cereus (sudarančios sporas), K. pneumoniae (sudaranti
kapsulę), P. mirabilis (šliaužianti). P. aeruginosa atspari daugumai antimikrobinių vaistų, o
E. faecalis – vienas dažniausių hospitalinių infekcijų sukėlėjų [17]. C. albicans – vienas
pagrindiniu grybelinių infekcijų sukėlėjų.
Junginiai tyrimui buvo tirpinami DMSO, nes jie turi būti visai ištirpę ir nesikristalizuoti
maišant su vandeniniu agaro tirpalu, o DMSO yra itin geras tirpiklis. Tačiau DMSO pasižymi
0
1
2
3
4
5
6
7
VIP-41
VIP-42
VIP-43
VIP-44
VIP-45
VIP-46
VIP-47
VIP-48
Triklozanas
38
antimikrobinėmis savybėmis, todėl buvo daromas kontrolinis mėginys nustatyti, ar junginių
tirpinimui naudojamas DMSO tūris pasižymi antimikrobiniu aktyvumu. Gauta, kad 5 % DMSO
tirpalas įtakos mikroorganizmų augimai neturi.
19 pav. Kontrolinis antimikrobinio tyrimo in vitro mėginys
Atlikus ažvalginį tyrimą gauti rezultatai, jog tik trys susintezuoti junginiai turi antimikrobinį
veikimą (VIP-41;VIP-42; VIP-47). VIP-41 antimikrobiškai veikia septynias iš dešimties
mikroorganizmų padermes (B. cerius, C. albicans, S. aureus, S. epidermidis, E. faecalis, E. coli,
K. Pneumonine). VIP-42 veikia tik vienintelę P. Mirabilis. Daugiausiai mikroorganizmų veikia
junginys VIP-47, 5-oje rodanino padėtyje turintis p-dimetilaminobenzaldehido pakaitą, jis
pasižymi priešmikrobiniu veikimu prieš visų bakterijų ir grybelio C. albicans kultūras.
39
20 pav. 2-alil-rodanino su dimedilamino benzaldehido pakaitu 5-oje padėtyje antimikrobinio tyrimo in vitro rezultatai
8 lentelė. Pirminio mikrobiologinio tyrimo rezultatai esant 500 µg/ml tiriamojo junginio
koncentracijai
Junginys
S.
au
reu
s A
TC
C 2
59
23
S.
ep
ide
rmid
is
AT
CC
12
22
8
E.
fae
ca
lis A
TC
C 2
92
12
E.
co
li A
TC
C 2
59
22
K.
pn
eu
mo
nia
e A
TC
C
33
49
9 3
P.
ae
rug
ino
sa A
TC
C 2
785
P.
mir
ab
ilis
AT
CC
12
45
9
B.
ce
reu
s A
TC
C 8
03
5
B.s
su
bti
lis
A
TC
C 6
63
3
C.
alb
ica
ns
AT
CC
60
19
3
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
VIP-41 + + + + + - - + - + VIP-42 - - - - - - + - - - VIP-43 - - - - - - - - - - VIP-44 - - - - - - - - - - VIP-45 - - - - - - - - - - VIP-46 - - - - - - - - - - VIP-47 + + + + + + + + + + VIP-48
- - - - - - - - - -
40
Tyrimo in silico rezultatai ne visai atitiko tyrimo in vitro rezultatus. Daugumos junginių
kurių molekulinio modeliavimo rezultatas buvo didesnis už triklozano, S. aureus baktericidiškai
veikianti koncentracija buvo didesnė nei 500 µg/ml, o triklozano nuo 0,25 mg/l iki 32 mg/l. Du
junginiai (VIP-41, VIP-47), kurių molekulinio modeliavimo rezultatai buvo didžiausi taip pat,
vieninteliai iš visų junginių, pasižymėjo ir didesniu nei 500 µg/ml aktyvumu prieš S. aureus.
Nors VIP-44 su furano pakaitu 5-oje rodanino molekulės padėtyje rezultatai in silico
žadėjo didesnį aktyvumą nei junginiui VIP-41 su nitro grupe 5-oje furano padėtyje, tačiau tyrimai
in vitro parodė atvirkščius rezultatus.
Sintezuojant junginius, iškėliau hipotezę, jog antimikrobinis aktyvumas stipresnis, jei
pakaitas 2-oje rodanino molekulės padėtyje turės dvigubą jungtį, kaip alicino molekulėje (17
pav.). Norint patikrinti šią hipotezę, buvo susintezuotas junginys su vienguba jungtimi pakaite
(18 pav.).
S
N
S
O
O
N+
O-
O
CH2
21 pav. 2-alil-5-nitrofurfuril-rodaninas
S
N
S
O
O
N+
O-
O
CH3
22 pav. 2-propil-nitrofurfuril-rodaninas
Šią hipotezę patvirtino ir tyrimai in silico ir in vitro. VIP-41 molekulinio modeliavimo
rezultatas 5,96, o VIP-48 5,39. Tiesa, skirtumas nėra labai didelis. Atlikus apžvalginius
antimikrobinius tyrimus in vitro, matoma, kad junginys VIP-41 (17 pav.) veikia net 7 bakterijų
padermes esant 500 µg/ml, o VIP-48 (18 pav.) esant tokiai koncentracijai neveikia nei vienos.
Tad aktyvumas tikrai priklauso nuo dvigubo ryšio 2-alil-5-nitrofurfurol-rodanine.
41
22 pav. 2-alil-rodanino su nitrofurfurilo pakaitu 5-oje padėtyje antimikrobinio
tyrimo in vitro rezultatai
23 pav. 2-propil-rodanino su nitrofurfurilo pakaitu 5-oje padėtyje antimikrobinio
tyrimo in vitro rezultatai
Kita hipotezė buvo, kad junginių su nitrofurfurilo pakaitu aktyvumas didesnis nei junginio
VIP-44, kurio furfurolo žiedo 5-oje padėtyje nėra nitro grupės. Kaip jau nurodyta anksčiau,
junginys VIP-41 esant 500 µg/ml koncentracijai veikia net 7 bakterijų padermes, o VIP-44 (19
pav.) esant šiai koncentracijai neveikia nei vienos. Tai patvirtina šią hipotezę.
24 pav. 2-alil-rodanino su furfurilo pakaitu 5-oje padėtyje antimikrobinio
tyrimo in vitro rezultatai
42
S
N
S
O
O CH2
25 pav. 2-alil-5-furfuril-rodaninas
Taip pat įsprendžiant iš tyrimo rezultatų, kad 2-alil-rodanino junginiai su para-brom ar
para-chlor benzaldehidų pakaitais 5-oje padėtyje yra mažiau aktyvūs nei su nitrofurfurilo pakaitu,
galima teigti, kad alilo pakaitas pats nesuteikia rodaninui aktyvumo, o suteikia pakaitas 5-oje
padėtyje - nitrofurfurilas.
3.5. Apibendrinimas
Buvo tirti gautų junginių antimikrobiniai aktyvumai in silico ir in vitro. Gauti rezultatai in
silico nėra visai tikslūs, palyginus su in vitro. Patys aktyviausi junginiai nustatyti VIP-41 ir VIP-47.
Tai taip pat įrodo rodanino darinio su dvigubuoju ryšiu 2-oje rodanino molekulės padėtyje
esančiame pakaite didesnis antimikrobinis aktyvumas nei identiško su propilo pakaitu.
Buvo pastebėtas ir rodaninio darinio su nitrofurfurolo pakaitu 5-oje padetyje didesnis
antimikrobinis aktyvumas nei rodanino darinio su furfurolu. Tai įrodo nitro grupės svarbą.
Reikalingi detalesni VIP-41, VIP-42, VIP-43 junginių tyrimai.
43
4. IŠVADOS
1. Tyrimui susintetinti 8 nauji 4-tiazolinono dariniai: 7 su alilo pakaitu 2-oje padėtyje ir
skirtingais aldehidais 5-oje padėtyje; taip pat vienas lyginamasis junginys su propilo
pakaitu 2-oje padėtyje ir nitrofurfurilo 5-oje.
2. Atliktas tyrimas in silico programa SYBYL-X ir pirminis tyrimas in vitro užnuodytos
lėkštelės standžioje terpėje metodu. Vieni aktyviausų in silico nustatyti junginiai VIP-41 ir
VIP-47 taip pat buvo vieninteliai aktyvūs prieš S. aureus ir in vitro.
3. Geram 2,5-pakeistų-4-tiazolinono junginių antimikrobiniam veikimui būtinas dvigubas
ryšys 2-oje molekulės padėtyje esančiame pakaite. Taip pat junginių aktyvumas didėja į
penktoje rodanino molekulės padėtyje esančio furfurolo 5-tą padėtį įvedus nitro grupę.
Pats alilo pakaitas junginiams reikšmingo aktyvumo nesuteikia, o svarbesnis aktyvumui
aldehido pakaitas 5-oje padėtyje.
44
5. PRAKTINĖS REKOMENDACIJOS
Susintezavus 4-tiazolinono darinius su alilo pakaitu, atlikus jų antimikrobinius tyrimus in
silico ir apžvalginius tyrimus in vitro, pastebėtas jų antimikrobinis potencialas. Dėl šių rezultatų
rekomenduojamas detalesnis nustatytų aktyvių junginių tyrimas in vitro.
45
6. LITERATŪROS SĄRAŠAS
1. Kelmelytė E. 3-amino rodanino 3-, 5-, 3, 5-pakeistų darinių sintezė ir jų antibakterinio bei
priešgrybelinio aktyvumo įvertinimas.Kaunas 2013 [magistro darbas].
2. Mačiulaitis R., Petrikaitė V., Aukštakalnienė A., Janušonis T. Antimikrobinių vaistų
vartojimo įvertinimas ir palyginimas su jų racionalaus vartojimo rekomendacijomis.
Medicina (Kaunas) 2006; 42(12); 999-1005.
3. Mačiulaitis R., Miciulevičiūtė J., Stirbienė I. Racionalus antimikrobinių vaistų vartojimas.
Vilnius, 2004.
4. Pelakauskas V. Rodanino-3-acto ir 3-propano rūgščių darinių sintezė ir jų antibakterinio
bei priešgrybelinio aktyvumo įvertinimas. Kaunas 2013 [magistro darbas].
5. Petrikaitė V. 2,5-pakeistų tiazolidinono darinių sintezė ir jų priešgrybelinio bei
antibakterinio aktyvumo įvertinimas. Kaunas, 2007 [daktaro disertacija].
6. Remeikis L. Naujų 3, 5-pakeistų 3-amino-2-tiokso-4-tiazolidinono darinių su
cikloheksanono ir ciklopentanono pakaitais sintezė ir antibakterinio ir priešgrybelinio
aktyvumo tyrimas. Kaunas 2013 [magistro darbas].
7. Radžiūnas R. Синтез и изучение биологической активности производных
тиазолинона-4 на основе аминогуанидинов. Харьков, 1988 [daktaro disertacijos
santrauka].
8. Tarasevičius E. Синтез, свойства и биологическая активность 2-
амино(гидразино-аминогуанидино)-4-оксотиазолинов с ароматическими и
гетероциклическими заместителями. Москва, 1990 [habilituoto daktaro disertacijos
santrauka].
9. Ankri S, Mirelman D. Antimicrobial properties of allicin from garlic. Microbes Infect
1999;2:125–9.
10. Ashraf R., Aamir K., Shaikh A. R., Ahmed T. Effects of garlic on dyslipidemia in patients
with type 2 diabetes mellitus. J Ayub Med Coll Abbottabad 2005;17:60-4.
11. Ashraf R., Khan R. A., Ashraf I. Garlic (Allium sativum) supplementation with standard
antidiabetic agent provides better diabetic control in type 2 diabetes patients. Pakistan
journal of pharmaceutical sciences, 2011;24:565-70.
12. Balunas M. J., Kinghorn A. D. Drug discovery from medicinal plants.Life
sciences, 2005;78:431-44.
46
13. Benavides G. A., Squadrito G. L., Mills R. W., Patel H. D., Isbell T. S., Patel R. P., Kraus
D. W. Hydrogen sulfide mediates the vasoactivity of garlic. Proceedings of the National
Academy of Sciences 2007;104:17977-82.
14. Block E. Garlic Other Alliums. RSC publishing 2010 p. 245-95.
15. Borrelli F., Capasso R., Izzo A. A. Garlic (Allium sativum L.): adverse effects and drug
interactions in humans. Molecular nutrition & food research, 2007;51:1386-97.
16. Bruno G., Costantino L., Curinga C., Maccari R., Monforte F., Nicolo F., Vigorita M. G.
Synthesis and aldose reductase inhibitory activity of 5-arylidene-2, 4-
thiazolidinediones. Bioorganic & medicinal chemistry, 2002;10:1077-84.
17. Butler M.S. The role of natural product chemistry in drug discovery. Journal of Natural
Products. 2004;67:214–53.
18. Chan K, Yin M, Chao W. Effect of diallyl trisulfide-rich garlic oil on blood coagulation and
plasma activity of anticoagulation factors in rats. Food Chem Toxicol 2007;45:502–7.
19. Ciusa M. L., Furi L., Knight D., Decorosi F., Fondi M., Raggi C., Oggioni M. R. A novel
resistance mechanism to triclosan that suggests horizontal gene transfer and
demonstrates a potential selective pressure for reduced biocide susceptibility in clinical
strains of< i> Staphylococcus aureus</i>. International journal of antimicrobial
agents, 2012;40:210-20.
20. Cutler RR., Wilson P. Antibacterial activity of a new, stable, aqueous extract of allicin
against methicillan-resistant Staphylococcus aureus. British Journal of Biomedical
Science 2004;61:71–4.
21. Davis S. R. An overview of the antifungal properties of allicin and its breakdown products
– the possibility of a safe and effective antifungal prophylactic Mycoses 2005;48:95-100
22. Durak I., Kavutcu M., Aytaç B., Avcı A., Devrim E., Özbek H., Öztürk H. S. Effects of
garlic extract consumption on blood lipid and oxidant/antioxidant parameters in humans
with high blood cholesterol. The Journal of nutritional biochemistry 2004;15:373-77.
23. Eidi A., Eidi M., Esmaeili E. Antidiabetic effect of garlic (< i> Allium sativum</i> L.) in
normal and streptozotocin-induced diabetic rats. Phytomedicine 2006;13.9:624-629.
24. Ensminger, AH. Foods & nutrition encyclopedia. Vol. 1. CRC Press 1994. p. 750
25. Free, C. A., Majchrowicz, E., & Hess, S. M. Mechanism of inhibition of histidine
decarboxylase by rhodanines. Biochemical pharmacology 1971;20:1421-28.
47
26. Freeman F., Kodera Y. Garlic chemistry: stability of S-(2-propenyl)-2-propene-1-
sulfinothionate (allicin) in blood, solvents, and simulated physiological fluids. J Agric Food
Chem 1995;43:2332–8.
27. Fujishima H., Tsubota K.. Improvement of corneal fluorescein staining in post cataract
surgery of diabetic patients by an oral aldose reductase inhibitor, ONO-2235. British
journal of ophthalmology, 2002;86:860-3.
28. Grant E. B., Guiadeen D., Baum E. Z., Foleno B. D., Jin H., Montenegro D. A., Hlasta D.
J. The synthesis and SAR of rhodanines as novel class C β-lactamase
inhibitors. Bioorganic & medicinal chemistry letters, 2000;10:2179-82.
29. Groppo F., Ramacciato J., Motta R., Ferraresi P., Sartoratto A. Antimicrobial activity of
garlic against oral streptococci. Int. J. Dent. Hyg. 2007;5:109–15.
30. Hardej D., Ashby Jr C. R., Khadtare N. S., Kulkarni S. S., Singh, S. Talele, T. T. The
synthesis of phenylalanine-derived C5-substituted rhodanines and their activity against
selected methicillin-resistant< i> Staphylococcus aureus</i>(MRSA) strains. European
journal of medicinal chemistry 2010;45:5827-32
31. Hashemi S., Nasrollah A., Rajab M. Irrational antibiotic prescribing: a local issue or global
concern? Excli Journal 2013;12:384-95
32. Imai J., Ide N., Nagae S., Moriguchi T., Matsuura H., Itakura Y. Antioxidant and radical
scavenging effects of aged garlic extract and its constituents. Planta medica 1994;60.05:
417-20.
33. Kendler B. S. Garlic (< i> Allium sativum</i>) and onion (< i> Allium cepa</i>): A review of
their relationship to cardiovascular disease. Preventive medicine, 1987;16:670-85.
34. Ko J. A., Lee Y. L., Jeong H. J., Park H. J. Preparation of encapsulated alliinase in
alginate microparticles. Biotechnology letters 2012;34:515-8.
35. Kyung K. H., Lee Y. C. Antimicrobial activities of sulfur compounds derived from S-alk
(en) yl-L-cysteine sulfoxides in Allium and Brassica. Food Reviews International
2001;17:183-98.
36. Lahlou M. Screening of Natural Products for Drug Discovery. Expert Opinion on Drug
Discovery 2007;2:697-705.
37. Lawson LD. Garlic: a review of its medicinal effects and indicated active compounds.
Phytomedicines of Europe: Chemistry and Biological Activity, ACS Symposium
1998;691:176–209.
48
38. Lau B. H. Suppression of LDL oxidation by garlic compounds is a possible mechanism of
cardiovascular health benefit. The Journal of nutrition 2006;136:765-8.
39. Lissiman E., Bhasale A. L., Cohen M. Garlic for the common cold. Cochrane Database
Systematic Reviews 2012;3.
40. Mahmoodi M., Islami M. R., Asadi K. G., Khaksari M., Sahebghadam L. A., Hajizadeh M.
R., Mirzaee M. R. Study of the effects of raw garlic consumption on the level of lipids and
other blood biochemical factors in hyperlipidemic individuals. Pakistan journal of
pharmaceutical sciences 2006;19.4:295-8.
41. Miron T, Rabinkov A, Mirelman D, Wilchek M, Weiner L. The mode of action of allicin: its
ready permeability through phospholipid membranes may contribute to its biological
activity.Biochim Biophys Acta 2000;1463:20–30.
42. Momose Y., Meguro K., Ikeda H., Hatanaka C., Oi S., Sohda T. Studies on antidiabetic
agents. X. Synthesis and biological activities of pioglitazone and related
compounds. Chemical & pharmaceutical bulletin 1991;39:1440-5.
43. Mottaghitalab M.; Taraz Z. Garlic powder as blood serum and egg yolk cholesterol
lowering agent. Journal of Poultry Science. 2004;41:50-57.
44. Nahas R., Balla A. Complementary and alternative medicine for prevention and treatment
of the common cold. Canadian Family Physician 2011;57:31-6.
45. Nantz M. P., Rowe C. A., Muller C. E., Creasy R. A., Stanilka J. M., Percival S. S.
Supplementation with aged garlic extract improves both NK and γδ-T cell function and
reduces the severity of cold and flu symptoms: A randomized, double-blind, placebo-
controlled nutrition intervention. Clinical Nutrition 2012;31:337-44.
46. Patwardhan B., Vaidya A. D. B., Chorghade M. Ayurveda and Natural Products Drug
Discovery. Current Science 2004;86:789-99.
47. Phil R. A. M., Khan R. A., Ashraf I. Effects of garlic on blood glucose levels and HbA1c in
patients with type 2 diabetes mellitus. Journal of Medicinal Plants Research, 2011;5:
2922-8.
48. Pittler, M. H., & Ernst, E. Clinical effectiveness of garlic (Allium sativum). Molecular
nutrition & food research 2007;51:1382-5.
49. Rahman K. Effects of garlic on platelet biochemistry and physiology. Mol Nutr Food
Res 2007;51:1335-44.
49
50. Rahman K., Lowe G. M. Garlic and cardiovascular disease: a critical review. The Journal
of nutrition 2006;136:736-40.
51. Ross Z., O’Gara E., Hill D., Sleightholme H., Maslin D. Antimicrobial properties of garlic
oil against human enteric bacteria: evaluation of methodologies and com-parisons with
garlic oil sulfides and garlic powder. Appl Environ Microbiology 2001;67:475–80.
52. Saleem M., Nazir M., Ali M. S., Hussain H., Lee Y. S., Riaza N., Jabbara A. Antimicrobial
natural products: an update on future antibiotic drug candidates. Natural product reports,
2010, 27.2:238-54.
53. Schou C. Garlic: A Taste for Health. Ethnobotanical Leaflets, 2011;2000:10.
54. Shamseer L., Charrois T. L., Vohra S. Complementary, Holistic, and Integrative Medicine
Garlic. Pediatrics in Review 2006;27:77-80.
55. Sheela C. G., K. T. Augusti. Antidiabetic effects of S-allyl cysteine sulphoxide isolated
from garlic Allium sativum Linn. Indian journal of experimental biology 1992;30.6:523-6.
56. Shuford J, Steckelberg J, Patel R. Effects of fresh garlic extract on Candida albicans
biofilms. Antimicrob. Agents Chemotherapy 2005;49:473.
57. Silagy C., Neil A. Garlic as a lipid lowering agent--a meta-analysis. Journal of the Royal
College of Physicians of London 1993;28.1:39-45.
58. Sim M. M., Ng S. B., Buss A. D., Crasta S. C., Goh K. L., Lee S. K. Benzylidene
Rhodanines as Novel Inhibitors of UDP-< i> N</i>-Acetylmuramate/l-Alanine
Ligase. Bioorganic & medicinal chemistry letters 2002;12:697-9.
59. Sing, W. T., Lee, C. L., Yeo, S. L., Lim, S. P., & Sim, M. M. Arylalkylidene rhodanine with
bulky and hydrophobic functional group as selective HCV NS3 protease
inhibitor. Bioorganic & medicinal chemistry letters, 2001;11:91-4.
60. Singh, S. B., & Barrett, J. F. Empirical antibacterial drug discovery—foundation in natural
products. Biochemical pharmacology, 2006;71:1006-15.
61. Sobenin I., Andrianova I., Sereda E., Borodina L., Karagodin V., Orekhov A. The effects
of time-released garlic powder tablets on acute respiratory in children. Medical and Health
Science Journal 2011;9:31-7
62. Solheim M, Aakra A, Snipen LG et al. Comaparative genomics of entrococcus faecalis
from healthy norewegian infants. BMC Genomics 2009;10:194.
63. Song MX, Zheng CJ, Deng XQ, Wang Q, Hou SP, Liu TT at al. Synthesis and
bioactivity evaluation of rhodanine derivatives as potential anti-bacterial agents. Eur J
Med Chem 2012;54:403-12.
50
64. Sovová M, Sova P. Pharmaceutical importance of Allium sativum L. 5. Hypolipemic
effects in vitro and in vivo.Ceska Slov Farm 2004;53:117–23.
65. Tanamai J., Veeramanomai S., Indrakosas N. The efficacy of cholesterol-lowering action
and side effects of garlic enteric coated tablets in man. JOURNAL-MEDICAL
ASSOCIATION OF THAILAND 2004;87:1156-61.
66. Tattelman E. Health effects of garlic. American family physician 2005;72
67. Teyssier C, Guenot L, Suschetet M, Siess MH. Metabolism of diallyl disulfide by human
liver microsomal cytochromes P 450 and flavin-containing monooxygenases. Drug Metab
Dispos 1999;27:835–41.
68. Thomson M., Al-Qattan K. K., Bordia T., Ali M. Including garlic in the diet may help lower
blood glucose, cholesterol, and triglycerides. The Journal of nutrition 2006;136:800-2.
69. Weber N. Andersen D. North J., Murray, B, Lawson L., Hughes B. In vitro virucidal effects
of Allium sativum (garlic) extract and compounds. Planta medica 1992;58:417–23.
70. Zervosen A., Lu W. P., Chen Z., White R. E., Demuth T. P., Frère J. M. Interactions
between penicillin-binding proteins (PBPs) and two novel classes of PBP inhibitors,
arylalkylidene rhodanines and arylalkylidene iminothiazolidin-4-ones. Antimicrobial agents
and chemotherapy 2004;48:961-9.
71. Zvarec O, Polyak SW, Tieu W, Kuan K, Dai H, Pedersen DS at al. 5-
Benzylidenerhodanine and 5-benzylidene-2-4-thiazolidinedione based antibacterials. Eur
J Med Chem 2012;22:2720-2.
72. AllergyNet. Prieiga per Internetą: http://www.allallergy.net/
73. ECDC. Annual epidemiological report Reporting on 2011 surveillance data and 2012
epidemic intelligence data. Prieiga per Internetą:
http://ecdc.europa.eu/en/publications/publications/annual-epidemiological-report-2013.pdf
74. Merriam-Webster Online Dictionary. Prieiga per Internetą: http://www.merriam-
webster.com/dictionary/antimicrobial
75. Prieiga per Internetą:
http://www.softdent.lt/publikacijos.aspx?load=5_lt.htm&meniuID=1&AspxAutoDetectCooki
eSupport=1
76. World Health Organization. Antimicrobial resistance. 2013, Fact sheet Vol. 194. Prieiga
per Internetą: http://www.who.int/en/
77. Sumpradit N., Chongtrakul P., Anuwong K., Pumtong S., Kongsomboom K., Butdeemee
P at al. Antibiotics smart use: a workable modelį for promoting the rational use of
51
medicines in Thailand. Bulletin of the World Health Organization. 2012;90:905-13 [cite
2013-04-28] Prieiga per Internetą: http://www.who.int/bulletin/volumes/90/12/12-
105445/en/
52
7. PRIEDAI
1 Priedas. Susintezuotų junginių chromatogramos, UV-vis ir IR spektrai
VIP-48
13,5
06
16,8
44
AU
0,00
0,20
0,40
0,60
0,80
Minutes
2,00 4,00 6,00 8,00 10,00 12,00 14,00 16,00 18,00 20,00
Retention Time Area % Area
1 13,506 37169 0,69
2 16,844 5346364 99,31
16,845 Peak 2
293,6
469,2
AU
0,00
0,10
0,20
0,30
0,40
0,50
0,60
0,70
0,80
0,90
nm
200,00 250,00 300,00 350,00 400,00 450,00 500,00 550,00
53
VIP-47
11,7
54
AU
0,00
0,20
0,40
0,60
Minutes
2,00 4,00 6,00 8,00 10,00 12,00 14,00 16,00 18,00 20,00
Retention Time Area % Area
1 11,754 3222646 100,00
54
11,753 Peak 1
231,2
318,5
412,6
AU
0,00
0,10
0,20
0,30
0,40
0,50
0,60
nm
200,00 250,00 300,00 350,00 400,00 450,00 500,00 550,00
55
VIP-46
12,4
77
12,9
58 1
6,2
07
18,3
91
AU
0,00
0,05
0,10
0,15
0,20
Minutes
2,00 4,00 6,00 8,00 10,00 12,00 14,00 16,00 18,00 20,00
Retention Time Area % Area
1 12,477 528326 28,20
2 12,958 100891 5,38
3 16,207 1125065 60,05
4 18,391 119349 6,37
16,203 Peak 3
228,8 277,1
316,1
375,4
462,0 520,0546,7
AU
0,00
0,02
0,04
0,06
0,08
0,10
0,12
0,14
0,16
0,18
0,20
nm
200,00 250,00 300,00 350,00 400,00 450,00 500,00 550,00
56
VIP-45
9,2
77
12,6
42
AU
0,00
0,20
0,40
0,60
Minutes
2,00 4,00 6,00 8,00 10,00 12,00 14,00 16,00 18,00 20,00
Retention Time Area % Area 1 9,277 50786 1,48 2 12,642 3389263 98,52
57
12,643 Peak 2
200,8
286,5
407,8
AU
0,00
0,10
0,20
0,30
0,40
0,50
0,60
nm
200,00 250,00 300,00 350,00 400,00 450,00 500,00 550,00
58
VIP-44
10,5
22
14,1
94
AU
0,00
0,50
1,00
1,50
Minutes
2,00 4,00 6,00 8,00 10,00 12,00 14,00 16,00 18,00 20,00
Retention Time Area % Area
1 10,522 54860 0,55
2 14,194 9852085 99,45
14,195 Peak 2
281,8317,3
399,4
AU
0,00
0,20
0,40
0,60
0,80
1,00
1,20
1,40
1,60
1,80
nm
200,00 250,00 300,00 350,00 400,00 450,00 500,00 550,00
59
VIP-43
15,5
17
18,9
12
AU
0,00
0,10
0,20
0,30
Minutes
2,00 4,00 6,00 8,00 10,00 12,00 14,00 16,00 18,00 20,00
Retention Time Area % Area
1 15,517 24367 1,24
2 18,912 1939834 98,76
60
18,912 Peak 2
267,7
311,4
370,6
AU
0,00
0,05
0,10
0,15
0,20
0,25
0,30
nm
200,00 250,00 300,00 350,00 400,00 450,00 500,00 550,00
61
VIP-42
16,0
56
19,4
53
AU
0,00
0,05
0,10
Minutes
2,00 4,00 6,00 8,00 10,00 12,00 14,00 16,00 18,00 20,00
Retention Time Area % Area
1 16,056 8538 0,95 2 19,453 890124 99,05
19,484 Extracted
268,8
311,4
371,8
455,9 488,6 531,0557,7584,4
AU
0,000
0,010
0,020
0,030
0,040
0,050
0,060
0,070
0,080
0,090
0,100
0,110
nm
200,00 250,00 300,00 350,00 400,00 450,00 500,00 550,00
62
VIP-41
10,4
63
10,9
57
11,8
07
14,2
54
15,0
90
16,4
59AU
0,00
0,10
0,20
0,30
0,40
Minutes
2,00 4,00 6,00 8,00 10,00 12,00 14,00 16,00 18,00 20,00
Retention Time Area % Area 1 10,463 61231 2,38 2 10,957 34725 1,35 3 11,807 15199 0,59 4 14,254 2043565 79,56 5 15,090 366782 14,28 6 16,459 47156 1,84
63
14,257 Peak 4
244,1
299,6
407,8
551,6
AU
0,00
0,05
0,10
0,15
0,20
0,25
0,30
0,35
nm
200,00 250,00 300,00 350,00 400,00 450,00 500,00 550,00