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スーパーコンピュータ講習会

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スーパーコンピュータ講習会. 全体構成 ファイアーウオール経由での使用方法 ディスクの構成 バッチキュー 運用、その他. senri saho. SX50. SX51. SX53. SX55. SX54. SX52. SX56. SX57. 全体構成. front03. CMC. RCNP. ILE. 全体構成 (1ノード). 10 G F. 10 G F. 10 G F. 10 G F. 10 G F. 10 G F. 10 G F. 10 G F. 10 G F. 10 G F. 10 G F. 10 G F. - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: スーパーコンピュータ講習会

スーパーコンピュータ講習会• 全体構成• ファイアーウオール経由での使用方法• ディスクの構成• バッチキュー• 運用、その他

Page 2: スーパーコンピュータ講習会

全体構成

SX50

SX51SX53

SX55

SX54

SX52

SX56

SX57

front03 senrisaho

RCNP

CMC

ILE

Page 3: スーパーコンピュータ講習会

全体構成(1ノード)

10GF

128 GB

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

Page 4: スーパーコンピュータ講習会

全体構成(SX5ノード間)

SX50

SX51

SX53

SX55

SX54

SX52

SX56

SX57

IXS

HIPPI

GbE

GbE

Page 5: スーパーコンピュータ講習会

ファイアーウオール経由での使用方法

外部からは ssh のみのアクセスslogin と scp

2つのルートRCNPルート

senri.rcnp.osaka-u.ac.jpsaho.rcnp.osaka-u.ac.jp

CMCルートlogin.hpc.cmc.osaka-u.ac.jpftp.hpc.cmc.osaka-u.ac.jp

Page 6: スーパーコンピュータ講習会

ファイアーウオール経由での使用方法(ログイン)

SX54

SX57

front03

senrisaho

loginサーバ

slogin slogin

slogin/telnet

メニューで振分け

Page 7: スーパーコンピュータ講習会

ファイアーウオール経由での使用方法(ファイル転送)

SX57

senrisahoftpサーバ

s cp

nfs

SX5 n

s cp

nfs

% scp senri.rcnp.osaka-u.ac.jp:/home.super/rcnp1001/test.dat .% scp ftp.hpc.cmc.osaka-u.ac.jp:/sx/rcnp/home/rcnp1001/test.dat .

Page 8: スーパーコンピュータ講習会

ディスクの構成disk total quota on IBM/sx/rcnp/home 1TB 5GB /home.super/sx/rcnp/work 2TB none /work.super/sxshort/rcnp 8TB none/sx/rcnp/data 3TB none /data.super/sx/rcnp/data2 5.5TB none /data2.super

home と work はRCNPユーザー専用sxshort は他センターのユーザーと共用IBM 機の /home と /work の利用

Page 9: スーパーコンピュータ講習会

バッチキュー(シングル、rcnpノード

(sx57))キュー最大 メモリー   割当     CPU時間  標準 / 最大 CP

U数

RS 5 分 2~16GB   2RM 2 時間 2~ 8GB  14RL 8 時間 2~16GB  14

但し、RSはインタラクティブと共用

Page 10: スーパーコンピュータ講習会

バッチキュー(パラレル用、cmcノード)

キュー  CPU時間   メモリー 割当 標準 /最大  標準 /最大 CPU数

P4  20~720時間 5~ 60GB  4P8 40 ~1440時間 10~ 90GB  8P16 160時間~無制限15~120GB 16mpi32 160時間~無制限40~120GB 32mpi64 160時間~無制限40~120GB 64

cmcユーザー向けの会話型(SX5)とP1キューは使用しない

Page 11: スーパーコンピュータ講習会

バッチキュー(走り方1)

10GF

128 GB

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

10GF

P4 P4P8 P16

Page 12: スーパーコンピュータ講習会

バッチキュー(走り方2)

SX50

SX51

SX53

SX55

SX54

SX52

SX56

SX57

IXS

mpi32mpi64

mpi32

Page 13: スーパーコンピュータ講習会

バッチキュー(フェアシェアスケジューリングとER

S)過去に消費した資源の量が多いほど、新たな資源割当の優先度を下げる資源は、CPU時間、メモリ、ジョブ待時間などユーザー単位、グループ単位などで制御可能半減期がある ― 現在 1 週間資源が余っている時は利用できるが実績には反映されるCMC:ILE:RCNP=2:1:1RCNPの中は各ユーザーが平等

Page 14: スーパーコンピュータ講習会

バッチキュー(ギャングスケジューリング)

パラレルに走行するスレッドを同期させる経過時間の短縮同期の効率化

Page 15: スーパーコンピュータ講習会

バッチキュー(状況表示)

ジョブキューの状況を見る/usr/bin/jobr但し、RCNP以外のユーザーの詳細情報は見られない

Page 16: スーパーコンピュータ講習会

運用コンサルティング

ヘルプデスクシステムhttp://helpdesk.center.osaka-u.ac.jp/ cmcの事務で受け付け内容により、 cmc 事務、NEC,cmc教官、 rcnpに転送される日本語のみデータベースシステム

メイルでの相談受付[email protected]

Page 17: スーパーコンピュータ講習会

その他tcshあります

/usr/local/bin/tcsh非サポート