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ADN ESTRUCTURA CROMOSOMAS Y GENOMAS

ADN ESTRUCTURA CROMOSOMAS Y GENOMASdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/07ADN_19289.pdf · Rosalind Franklin y Maurice Wilkins. Estructura del ADN James Watson y Francis Crick, 1953

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ADN

ESTRUCTURA

CROMOSOMAS Y GENOMAS

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Los cromosomas son los

portadores de los elementos

hereditarios

Los cromosomas están

compuestos de ADN y

proteínas

Cada cromosoma está

formado por una molécula de

ADN

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El ADN como principio transformante

Frederick Griffith,

1928

Streptococcus pneumoniae

Cepa R inocua Cepa S letal

S: cubierta de polisacáridos PRESENTE R: cubierta de polisacáridos AUSENTE

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Oswald Avery, Colin MacLeod, and Maclyn McCarty, 1943.

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El ADN molécula de la herencia

La naturaleza hereditaria de cada organismo está definida por su genoma, el cuál consiste de largas secuencias de ácidos nucleicos que proporcionan la información necesaria para construir al organismo.

Estructura, organización y propiedades

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Las bases nitrogenadas

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DESOXIRIBONUCLEÓTIDOS

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Nucleósido Nucleótido

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Reglas de Chargaff

•La cantidad de adenina es la misma que la de timina: A=T

•La cantidad de guanina equivale a la de citosina: G=C

•La cantidad de bases púricas es la misma que las bases pirimídicas:

A+G=T+C

Pero la cantidad de A+T G+C

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Estructura del ADN

James Watson y Francis Crick, 1953.

Modelo de la doble hélice del ADN

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Surco

mayor

Surco

menor

Surco

menor

Surco

mayor

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3’ hidroxilo

5’ fosfato

5’ GATC... 3’

ADN

Enlace fosfodiester

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Complementariedad:

A T G C

Bases nitrogenadas: interior

Fosfatos: exterior

Cadenas anti-paralelas

Extremo 5’: PO4

Extremo 3’: OH

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La estructura del ADN permite responder dos preguntas claves en la

Genética:

1. ¿Cómo se puede determinar la información de una función

biológica en una forma química?

2. ¿Cómo se puede copiar la información a generaciones sucesivas?

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ADN lineal y circular Doble hélice (procariontes y eucariontes) Cadena sencilla (algunos virus)

Circular

Lineal

Superenrollado

Secuencias unicas

(genes); secuencias

repetidas (no codificantes)

Bacteria

Virus (algunos)

Plásmidos

Mitocondria

Cloroplastos Superenrollado

Nuclear de Eucariontes

Virus (algunos)

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ADN de bacteria (4.2 x 106 pb)

• 1 cromosoma

• DNA circular doble cadena

• sin envoltura de membrana

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Superenrollamiento del ADN

Bacteria

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Organización del cromosoma bacteriano

DNA super-

enrollado

Proteínas que

unen al DNA

Bacteria

en división

Bacteria

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Topoisomerasas Enzimas que regulan la tensión en la molécula de ADN

Tipo I: Cortan una de las cadenas de DNA

No requieren ATP

Introducen incrementos de 1 en Lk

Tipo II: Cortan ambas cadenas de DNA

Requieren ATP

Introducen incrementos de 2 en Lk

Girasa (superenrollamiento negativo en procariontes)

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Formas topológicas del DNA circular

cerrado (topoisómeros)

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Propiedades del ADN

El contenido de GC influye en las

propiedades del ADN, especialmente

sobre la temperatura de

desnaturalización y alineamiento

% GC Tm

Desnaturalización y

Re-naturalización

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Source Lysis Methods

Bacteria

Lysozyme - degrades

polysaccharide cell walls

SDS - detergent for cell

membranes

Freeze/Thaw several times

French Press

Organelles

Osmotic

Sonication

Detergent

Animal Cells

Osmotic

Sonication

Detergent

Plant Cells

Several enzymes to break

down cell walls

Mechanical grinding

Purificación de ADN

1. Concentrar células 2. Romper células 3. Eliminar proteínas

4. Precipitar ADN

• Etanol

• Isopropanol

• Butanol

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A260 / A280 Quality

Ratio < 1.8 Contains protein

contamination

1.8 < Ratio < 1.9 no contamination

Ratio > 2 DNA may contain RNA

Absorbance peak or

shoulder at 270 nm Phenol contamination

Nucleic Acid Form NA Concentration at

1 A260

Double -stranded DNA 50 µg/ml

Single-stranded DNA 37 µg/ml

RNA 40 µg/ml

Concentración y calidad del ADN

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Separación y visualización de fragmentos de ADN

Bromuro de etidio:

Agente intercalante entre las bases nitrogenadas que fluoresce a la luz UV

Gel de Agarosa 0.8% - 2.5%

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Bibliografía:

Alberts “Molecular Biology of the Cell” 4ª o 5ª Ed. (2002, 2008)

Lehninger “Principles of Biochemistry” 3ª, 4ª o 5ª Ed. (2000, 2004, 2008)

Lodish “Molecular Cell Biology” 4ª, 5ª o 6ª Ed. (1999, 2003, 2007)