Upload
constantinos-athanasiou
View
119
Download
1
Embed Size (px)
Citation preview
Αθανασίου Γ. Κωνσταντίνος
Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών “Πληροφορική και Τηλεματική”
Τμήμα Πληροφορικής και Τηλεματικής
Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο
Σύγχρονες Αρχιτεκτονικές ΥπολογιστικώνΣυστημάτων
09/01/20131Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο
Εργασία για το Ακαδημαϊκό Έτος 2013-14
Vincent A. Fusaro, Prasad Patil, Eric Gafni, Dennis P. Wall, Peter J.
Tonellato
Biomedical Cloud Computing With
Amazon Web Services
09/01/20132Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο
Εργασία για το Ακαδημαϊκό Έτος 2013-14
Περιεχόμενα
ΕισαγωγήAmazon Web Services
Ασφάλεια στο Cloud
Πρωτότυπο & ΑνάπτυξηΚλιμακωτή ανάπτυξη υπολογιστικού περιβάλλοντοςΠερίπτωση Μελέτης: Δημιουργία ολόκληρου γονιδιώματος στο υπολογιστικό πλαίσιοΕπίλογος
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο3
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Εισαγωγή
Βιοϊατρική τεχνολογία
Εναλλακτική προσέγγιση
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο4
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Εισαγωγή
ΣκοπόςCloud στη βιοϊατρική
Ανάπτυξη έργων
Κόστος έργων
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο5
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Εισαγωγή
Πάροχοι επί πληρωμή-commercial
AWS, Rackspace, GoGrid
Ανοιχτοί-Open Source
Eucalyptus, Nimbus
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο6
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Εισαγωγή
Luis M. Vaquero (ερευνητής βιοϊατρικής)
"cloud is a large pool of easily usable
and accessible virtualized resources.
These resources can be dynamically
re-configured to adjust to variable load,
allowing for optimum resource
utilization"09/01/2013
Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο7
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Εισαγωγή
Εργαλείο προσφοράς περιοδικής υπολογιστικής ισχύς
Ελκυστική εναλλακτική
Εικονική τεχνολογία
Οικονομική επιλογή
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο8
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Amazon Web Services
Μνήμη, ισχύ, χώρο, δικτύωση
IaaSΕυεληξία στο σχεδιασμό έργων ad hoc
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο9
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Amazon Web Services
Elastic Computer Cloud (EC2)
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο10
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Amazon Web Services
Elastic Block Storage (EBS)
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο11
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Amazon Web Services
Simple Storage Service (S3)
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο12
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Amazon Web Services
Buckets
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο13
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Ασφάλεια στο Cloud
Με χρήση ζεύγους δημοσίου/ιδιωτικού κλειδιού
Με χρήση ασφαλούς σύνδεσης
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο14
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Ασφάλεια στο Cloud
Δημιουργία λογαριασμών με περιορισμένες δυνατότητες
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο15
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Ασφάλεια στο Cloud
Έλεγχος πρόσβασης με χρήση τοιχωμάτων προστασίας – firewalls
Επιπλεόν ασφάλεια
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο16
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Πρωτότυπο & Ανάπτυξη
Υλικό
Δεδομένα
Χρόνο απόκρισης
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο17
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Κλιμακωτή ανάπτυξη υπολογιστικού περιβάλλοντος
Συνδυασμός προγραμμάτων - cloudΣύμπλεγμα (cluster)StarCluster
Boto
Condor
Hadoop
AWS Elastic Map Reduce (EMR)
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο18
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Περίπτωση Μελέτης: Δημιουργία ολόκληρου γονιδιώματος στο υπολογιστικό πλαίσιο
Μέγεθος ~4 δισ. Ζεύγη γονιδίωνMAQΜέγεθος δεδομένων 370 GBΧαρτογράφηση σε 303 φακέλουςΧρόνος υπολογισμού εκτός cloud για φάκελο4-12 ώρες Έως και 24 ώρες
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο19
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Περίπτωση Μελέτης: Δημιουργία ολόκληρου γονιδιώματος στο υπολογιστικό πλαίσιο - $ 3.85
InstanceMAQ (10 h, 800 MB 1 εκατμ. ζεύγη)7 GB Κόστος $ 0.68 /h
400 GB EBSΜικρή ποσότητα δεδομένωνΜέτριαΟλόκληρο γονιδίωμα
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο20
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Περίπτωση Μελέτης: Δημιουργία ολόκληρου γονιδιώματος στο υπολογιστικό πλαίσιο - $ 49.60
Cluster των 2 instancesSun Grid Engine, OpenMPIΡυθμίσεις ασφαλείας
Παροχή IDΕγκατάσταση MAQΑντίγραφο ΑσφαλείαςΖεύγη κλειδιώνΕγκατάσταση StarCluster
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο21
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Περίπτωση Μελέτης: Δημιουργία ολόκληρου γονιδιώματος στο υπολογιστικό πλαίσιο - $ 320.10
38 instances 38*8 = 304 CPU cluster
Επικοινωνία με το EBS – 370 GB.
Sun Grid Engine – 10 h
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο22
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Περίπτωση Μελέτης: Δημιουργία ολόκληρου γονιδιώματος στο υπολογιστικό πλαίσιο
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο23
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών
Επίλογος
Cloud στη βιοϊατρική
Γρήγορες και οικονομικές λύσεις
09/01/2013Τμήμα Πληροφορικής & Τηλεματικής, Χαροκόπειο Πανεπιστήμιο24
Βιοϊατρική στο Cloud με χρήση Amazon Web υπηρεσιών