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BIOMOLÉCULAS EN 3D Pilar Rico Martínez. Grupo B (G7).

Biomoléculas en 3 d

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  • 1. BIOMOLCULAS EN 3DPilar Rico Martnez. Grupo B (G7).

2. Estructura de las protenas Una protena es un polipptido formado por ms de cincuentaaminocidos. Su organizacin viene determinada por cuatro nivelesestructurales: estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria. La estructura primaria es la secuencia de aminocidos de la protena.Indica que aminocidos la constituyen y en qu orden. La estructura secundaria es la disposicin de la cadena deaminocidos en el espacio. Se conocen tres tipos: -hlice, hlice decolgeno y conformacin-. La estructura terciaria es la disposicin que adopta en el espacio laestructura secundaria cuando se dobla sobre s misma. La estructura cuaternaria es la que presentan las protenas formadaspor dos o ms cadenas polipeptdicas con estructura terciaria,idnticas o no. 3. Extremos N y C terminal En todas las protenas se considera comoextremo inicial aquel que presenta elaminocido con el grupo amino libre (extremoN-inicial), y como extremo final aquel quetiene un aminocido en el grupo carboxilolibre (extremo C-terminal). La secuencia deaminocidos de una protena se expresaenumerando los aminocidos desde elextremo N-inicial hasta el extremo C-terminal. 4. Extremo N-inicialExtremo N 5. Extremo C-terminalExtremo C 6. Enlace peptdicoLa unin entre aminocidosse realiza mediante un enlacequmico denominado enlacepeptdico, y da lugar acadenas que reciben elnombre de pptidos.Este enlace covalente seestable entre el grupocarboxilo de un aminocido yelgrupoamino delsiguiente, con la formacin deuna molcula agua.La disposicin en el espaciode estos enlaces hace que lostomos del grupo carboxilo ydel amino se siten en elmismo plano. 7. Cadena-En la cadena-, la cadena deaminocidos no forma unahlice, sino una cadenadistendida en forma de zigzagdebido a la ausencia deenlaces de hidrgeno entreaminocidos prximos.Si la conformacin- serepliega se pueden establecerenlaces de hidrgeno entresegmentos, antes distantes,gracias al plegamiento. Estadisposicin puede dar lugar auna lmina en zigzag muyestable, denominada -lminaplegada. 8. -hliceLa estructura en -hlice seforma al enrollarse laestructuraprimariahelicoidalmente sobre smisma con un giro dextrogiro.Esto se debe a la formacinespontnea de enlaces dehidrgeno entre el oxgenodel CO- de un aminocido yel hidrgeno del NH- delcuarto aminocido siguiente.Esta formacin espontneahace que todos los oxgenosdel CO- quedan orientadosen el mismo sentido y loshidrgenos del NH- quedanorientados en el sentidocontrario. 9. Distribucin de cargasLa distribucin de las cargas elctricas de una protena dependede varios factores: Los grupos funcionales cidos y bsicos presentes en las cadenas lateralesde los aminocidos, al disociarse en agua, confieren a las protenas cargaspositivas y negativas. La carga elctrica de una protena depende del grado de disociacin desus grupos funcionales cidos y bsicos, lo que depende del pH. No existe una direccionalidad, los grupos cargados van a interaccionar conla misma fuerza, independientemente de su orientacin relativa. Dependencia de la distancia, la energa de interaccin disminuyelinealmente al separar las cargas, haya o no apantallamiento. 10. Superficie molecular ydistribucin de cargas enla protena de cadena-Estaprimera protenapresenta cuatro cargas entoda su superficie molecular,de las cuales dos ellas estnrepresentadas en rojo (cargaspositivas) y las otras dos enazul (cargas negativas).La zona representada en colorrojo es una zona de una grandensidad electrnica,mientras que la azul poseeuna baja densidad.La superficie molecular sermayor en est protena alpresentar una conformacindistendida de cadena- 11. Superficie molecular ydistribucin de cargas enla protena hlice-La segunda protena presentaen un extremo un cargapositiva, con una grandensidad electrnica y, en elotro extremo, una carganegativa,condensidadelectrnica baja.La superficie molecular deesta protena es mucho mscompacta que el caso anteriorya que al tratarse de unestructura en hlice-, laestructura primaria de lacadena se enrolla sobre smisma. 12. ADNEl cido desoxirribonucleico(ADN) est formado por doscadenasdenucletidosenrolladas formando unadoble hlice. Cada cadenaest formada por un polmerode desoxirribonucletidos deadenina, guanina, citosina ytimina.El ADN presenta diferentesrangosdecomplejidadestructural, y se puedendistinguirtres nivelesestructurales:estructuraprimaria,secundariayterciaria. 13. ARNEl cido ribonucleico (ARN)est formado por nucletidosde ribosa y cuatro de lasbases nitrogenadas: adenina,guanina, citosina y uracilo. Nohay timina, como en el ADN.Estos ribonucleicos se unenmediante enlaces fosfodisteren sentido 5 3, igual que enel ADN.Existen varios tipos de ARNdiferentes: ARN mensajero,ARN de transferencia, ARNribosmico, ARN nucleolar,ARN de interferencia y ARNpequeo nucleolar.