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CITOGENETICA 1

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CITOGENETICA 1

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  • Qu es la Citogentica?

    Una parte de la Gentica

    que se encarga del estudio

    de los cromosomas

    humanos.

    Finalidad de identificar las

    alteraciones cromosmicas

    numricas y estructurales.

  • Clasificacin Operacional de la Cromatina:

    EUCROMATINA: Transcripcionalmente activaFibras de 11nm y 30nm, incluso DNA

    desnudo.

    Genes estructurales, ribosmicos,

    secuencias reguladoras , etc.)

    HETEROCROMATINA: Transcripionalmente inactivaFibras de 30nm densamente

    empaquetadas.

    Centrmeros, telmeros, regiones

    unin membrana nuclear.

  • EUCROMATINA: Cromatina laxa, menos condensada que vuelve al

    estado disperso.

    HETEROCROMATINA:

    El 10% del material cromosmico en la mayora

    de las clulas permanece en

    forma condensada durante la

    interfase.

    Esta cromatina condensada se observa se observa en la

    periferia del ncleo.

    H. CONSTITUTIVA:

    Permanece en estado condensado en todas las clulas y en todo

    momento, por lo tanto representa el

    ADN permanentemente silencioso.

    El ADN consta principalmente de secuencias altamente repetitivas y al

    parecer est desprovisto de genes

    que codifican protenas.

    H. FACULTATIVA:

    Es una cromatina especficamente inactivada durante ciertas fases de la

    vida de un organismo.

    Inactivacin del cromosoma X.

  • Cromatina Nuclear

    La Heterocromatina Facultativa

  • EUCROMATINA HETEROCROMATINA

    DIFERENCIAS

    GENICAS

    MAYOR CANTIDAD DE

    GENES ACTIVOS

    NO PRESENTAN GENES

    DIFERENCIAS

    CITOLOGICAS

    MENOR GRADO DE

    EMPAQUETAMIENTO

    MAYOR GRADO DE

    EMPAQUETAMIENTO

    ALOCICLIA NO PRESENTA SI PRESENTA (puede estar

    ms o menos intensamente

    teida dependiendo del CC.)

    REPLICACION

    del ADN

    REPLICACION

    TEMPRANA

    REPLICACION TARDIA

  • El ADN en los cromosomas

    metafsicos debe

    acortarse unas 10.000

    veces por un sistema

    empaquetamiento

    muy eficiente.

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

    Nucleosoma: El menor nivel

    de organizacin de los

    Cromosomas.

    El empaquetamiento ordenado

    del ADN eucariota depende de

    Histonas.

    A principios de 1970 se

    descubri que el tratamiento

    de la cromatina con Nucleasas

    daban lugar a fragmentos de

    200 pb de longitud.

    1974: Roger Kornberg, de la

    Univ. Harvard, sugiri que el

    ADN y las histonas se organi-

    zaban en unidades repetitivas

    llamadas nucleosomas.

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

    EL NUCLEOSOMA: es la subunidad fundamental de DNA e

    histonas en los cromosomas en

    interfase, o cromatina.

    Un nucleosoma presenta alrededor

    de 146 pb de DNA enroscados dos

    veces alrededor de un octmero de

    histonas.

    El octmero de histonas forma un

    cilindro de 11 nm de dimetro y 6

    nm de altura.

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

    . Las histonas son protenas conuna alta proporcin de carga

    positiva (lisina y arginina), lo

    que les permite unirse con

    firmeza a las cargas negativas de

    la doble cadena del DNA.

    . Desde el punto de vista evolutivo

    la conservacin de las histonas es

    muy significativa.

    . Hay una relacin espacial en

    particular estrecha entre el DNA y

    las histonas en las regiones ricas en

    A+T de los surcos menores. All, la

    doble hlice del DNA se dobla con

    ms facilidad.

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

    . Composicin Proteca:

    1.- Histonas: H1 , H2A , H2b , H3 , H4

    .- Las Histonas se encuentran en una relacin de peso con el DNA de 1/1

    .- Las Histonas deben su basicidad al alto contenido de arginina y lisina (10-

    20%) .

    .- As: H3 y H4 : Muy ricas en arginina

    H2A y H2B : Moderadamente ricas en lisina

    .- H2A , H2B , H3 y H4 : protenas globulares

    .- H1 adquiere formas de acuerdo a la especie

    2.- Protenas no Histnicas:

    2.1.- Protenas estructurales : HMG , LMG , Ubiquitinas

    2.2.- Protenas enzimticas

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

    Las partes ms hidrofbicas,

    partes no cargadas de las

    histonas, ocupan el centro del

    nucleosoma y por lo tanto

    promueven su agregacin en

    un ncleo apretado.

    La interaccin entre histonas

    y ADN es principalmente

    estructural y relativamente

    independiente de la secuencia

    de nucletidos.

    .

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

    Las microfotografas electr-

    nicas demuestran que la

    cromatina nuclear presenta

    numerosos puntos pequeos

    de unos 30 nm de dimetro

    que representan a las Fibras

    de 30 nm.

    La estructura del filamento

    de 30 nm incrementa la rela-

    cin de empaquetamiento del

    ADN unas 6 veces ms.

    Modelo de Solenoide explica

    la forma de plegarse la fibra

    de 10 nm para formar la fibra

    de cromatina de 30 nm

  • El mantenimiento de los filamentos de 30 nm depende de la interaccin entre

    molculas de H1 de los nucleosomas vecinos

  • Cromosomas Eucariticos Los nucleosomas se pliegan sobre s mismos para formar una estructura

    densamente empaquetada con forma de solenoide que tiene 30nm de

    grosor.

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

    El siguiente nivel de

    empaquetamiento es el

    Modelo propuesto por

    Marsdem y Lammli.

    Ocurre cuando los filamentos de cromatina de 30nm se organizan en

    una serie de asas amplias

    superenrrolladas.

    Se estima que cada asa contiene

    entre 10 a 150 Kb de ADN.

    Las asas de ADN pueden actuar para dividir el genoma en

    dominios que contengan un solo

    gen o un pequeo conjunto de

    genes enlazados expresados por un

    mecanismo regulador comn

  • Cromosomas Eucariticos La fibra de 30 nm constituida por los nucleosomas empaquetados se

    pliega formando bucles sobre un armazn de protenas no histonas

    dando lugar a la fibra de cromatina (300 nm).

  • Cromosomas Eucariticos

    La fibra de cromatina sufre un enrollamiento helicoidal para

    formar la estructura que se

    observa en metafase: la

    cromtida (700 nm)

  • ..

    .

    Un cromosoma presenta una sola molcula de DNA muy larga, que contiene una serie de genes. Est plegado y enrollado en una forma compleja. El ordenamiento espacial est asegurado por los nucleosomas

    En la cromatina de loscromosomas en mitosis no se produce la transcripcin. La sntesis de ARN se interrumpe cuando se establece la condensacin del cromosoma.

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

    Cromosoma metafsico (microscopio

    electrnico de transmisin)

    . Los cromosomas mitticos repre-

    sentan la etapa ltima del empaque-

    tamiento de la cromatina.

    . Un cromosoma mittico de 1 micra

    de longitud tpicamente contiene

    casi 1 cm de ADN.

    Cromosoma Metafsico (microscopio electrnico de barrido)

  • . Los cromosomas se ven como estructuras separadas slo durante la mitosis. En la interfase nopueden diferenciarse dentro de la cromatina. En los cromosomas metafsicos el empaquetamiento

    del DNA es alrededor de 10,000 veces ms denso que en la interfase

  • Cromosomas EucariticosLos cromosomas tienen dos funciones biolgicas fundamentales:

    Perpetuar el material hereditario durante el desarrollo de un individuo, a travs

    de la mitosis celular

    Redistribuir el material hereditario entre generaciones sucesivas, a travs de la

    meiosis celular

    Las funciones de los cromosomas dependen de tres clases de elementos del DNA:

    Los centrmeros

    Los telmeros

    Los orgenes de replicacin

  • Cromosomas Humanos

    ELEMENTOS BASICOS DEL CROMOSOMA

    1. Centrmeros

    2. Telmeros

    3. Origenes de Replicacin

    .- El centrmero y los Telmeroscontienen DNA con secuencias

    repetitivas, conservadas evolutiva-

    mente porque son importantes

    para la estabilidad del cromosoma.

    .- En las bandas G claras el DNA

    forma bucles en los que se ubican

    los genes codificadores de

    protenas.

  • Cromosomas Humanos

    . Un modelo tridimensional de un segmento de un cromosoma

    en interfase muestra que en la

    regin del centrmero la

    heterocromatina constitutiva

    (banda C) est plegada con gran

    firmeza.

    . En las bandas G clara la

    eucromatina est empaquetada

    en forma relativamente laxa, y en

    las oscuras, de alguna forma est

    plegada con ms fuerza.

  • PROBLEMA DE LA REPLICACIN EN EL

    EXTREMO DE DNA LINEAL

    Replicacin(5->3) Remocin

    de Primer

    En el extremo 5 una brecha

    remanente que no puede ser

    cerrado, por ausencia del primer .

    Rellenado de los gaps

    Los cromosomas de los eucariotas son lineales. Cada extremo est sellado medianteuna regin especial, EL TELOMERO..

    El DNA slo se sintetiza en direccin 5 a 3 en la hebra molde que va de 3 a 5 la sntesis es en forma retrasada. Por este motivo a unos 8-12 bases en el extremo de la hebra retrasada la DNA pol no puede sintetizarlas por el cebador. Entonces en cada divisin celular en los extremos telomricos se perdern estos 8-12 nucletidos. Para compensar est perdida en algunos organismos participa la TELOMERASA.

  • Cromosomas Humanos

    El DNA de los TELOMEROS presenta secuencias en tndem

    ricas en G:

    Invertebrados: 5TTAGGG3

    Levaduras: 5TGTGGG3

    Protozoos: 5TTGGGG3.

    Los extremos salientes de las

    hebras G son importantes para

    la proteccin de los telmeros

    mediante la formacin de un

    bucle de DNA de cadena doble

    (dplex)

  • Cromosomas Humanos

    .

    TELOMEROSEstructuras especializadas que forman los extremos de los

    cromosomas eucariotas

    El ADN telomrico son regiones no codificantes

    Repetidos (TTAGGG)n en tandem: -10Kb en clulas somticas

    - 20Kb en clulas placenta

    La longitud de las repeticiones est relacionada con el envejecimiento y

    dao celular.

    Un Telmero normal, no solo es estable, sino que Ancla ese extremo

    al armazn nuclear.

  • Cromosomas Humanos

    ESTRUCTURA DE LOS

    TELOMEROS:

    Una de las cadenas de ADN tiene una extensin mayor que la otra en 12pb

    Se producen uniones tipo Hoogsteenformando un bucle cerrado.

    La cadena sobreextendida es rica en G y va en direccin 5- 3 hacia el

    extremo del Telmero (forma el extremo

    3 del ADN cromosmico)

  • FORMACION DEL BUCLE del DNA de Cadena Doble (bucle-t) en el Telmero de mamferos:Griffith y Col (1999) demostraron que la cadena doble del DNA telomrico forma un bucle-t para evitar de este modo el problema de los extremos pegajosos.

    La formacin del bucle est mediada por las dos protenas relacionadas TRF1 y TRF2 que se unen a las repeticiones de los telmeros de los mamferos, y el bucle se ancla mediante la insercin del extremo saliente de la hebra G dentro de un segmento proximal del dplex del DNA telomrico.

    Representacin esquemtica de

    los telmeros putativo T-loop.

    Estructura de las protenas de

    unon especficas de telmeros.

  • FUNCION DE LOS TELOMEROS

    1. Mantenimiento de la estabilidad cromosmica formando estructuras

    que evitan la fusin de cromosomas o la actuacin de mecanismos

    degradativos, evitando as la muerte celular y la prdida de genes

    importantes para la vida de la clula.

    2. Su importancia en la mitosis. La longitud de los telmeros es uno de los

    parmetros que determinan el nmero de divisiones de una clula y

    por tanto la duracin de su vida.

    3. Sirven como un reloj mittico.

    4. Su importancia en la meiosis ya que facilitan el reconocimiento de

    cromosomas homlogos. Intervienen en el apareamiento de los

    cromosomas homlogos y el entrecruzamiento durante la profase en la

    Meiosis I.

    5. La activacin o desactivacin de la telomerasa influye en el desarrollo

    y el envejecimiento de los tejidos de un organismo.

    6. La telomerasa juega un importante papel en alteraciones fisiolgicas

    como el desarrollo de carcinognesis o la infeccin por el VIH.

    Cromosomas Humanos

  • Cromosomas Humanos

    TELOMERASA

    Enzima ribonuclecacompleja mayor 300 Kd.

    2 Subunidades:

    Subunidad cataltica o Tert(Telomerase reverse

    transcriptase).

    Una molcula de ARN o Terc(Telomerase ARN component)

    de alrededor de 500

    nucletidos, poseen secuencias

    (AAUCCC) compleementaria al

    ADN extremo del Telmero.

  • Cromosomas Humanos

    FUNCION DE LOS TELOMEROS

  • ACORTAMIENTO DE LOS TELOMEROS

    Cuando una lnea celular no tiene una telomerasa activa, los telmeros se van acortando de unos 50 a 200 pares de bases en cada

    divisin. Si el acortamiento alcanza un nivel crtico se induce la

    senescencia de las clulas de esa lnea celular..

    Los telmeros se pueden considerar como estructuras dinmicas que actan a modo de reloj celular. Su longitud est en relacin con

    el tiempo de vida y depende de varios factores como la velocidad de

    degradacin de los telmeros y la velocidad y el tiempo de actuacin

    de la telomerasa en cada cromosoma.

  • Las secuencias del telmero presentan

    alrededor de 250 a 1500 repeticiones ricas

    en G (unos 9 Kb), que estn muy

    conservadas entre las diferentes especies.

    Los telmeros y la telomerasa son factores

    centrales en la biologa del cncer, en las

    clulas madre, en el envejecimiento y en

    la disqueratosis congnita. La relacin

    inicial entre la telomerasa y el cncer se

    estableci cuando se observ que en la

    mayora de los tumores humanos se sobre-

    expresaba la enzima, cosa que no ocurra

    en los tejidos sanos y en los cultivos de

    clulas normales.

  • TelmerosCentrmero

    p

    q

  • CENTRMERO Regiones especializadas de

    cromatina

    Descubierto fortuitamente en 1985, con sueros de pacientes

    de escleroderma,

    reaccionaban con protenas

    centromricas: CENP:A,B y C

    (Earnshaw & Rothfield, 1985)

    CENP-A , descubierta como variante de H3 encontrado

    exclusivamente en el

    centrmero. Homlogos en

    todos los eucariotas: Funcin

    conservada.

    CENP-B:Pr- que se une muchas veces a una

    secuencia simple repetitiva en

    el DNA centromrico(DNA alfa

    satlite). Acta como dmero.

    ESTRUCTURA SECUNDARIA DE CENP-A

    EN EL NUCLEOSOMA

  • Cromosomas Humanos

    CENTROMERO

    Constriccin Primaria

    El ADN alfoide es el principal componente de todos los centromeros de los cromosomas humanos

    ADN alfoide: Repeticiones en tandem de 171 pb.

    Caja de CENP-B: secuencia de 17 pb que se une especficamente al CENP-B

    Estn ntimamente asociados a las Cromtides hermanas y los cinetocros.

  • Cromosomas Humanos

    Los centrmeros humanos son secuencias ricas en repeticiones de DNA,

    conocido como alfa satlite, las cuales estn basados en monmeros de 171

    pb organizados en tndem, con una longitud variable de 0,2 5 Mb.

  • PROTEINAS CENTROMERICAS

    El ADN en la regin centromrica est asociaddo con protenas especficas. Estas protenas han podido estudiarse gracias a los Acs contra ellas en

    enfermos con Esclerodermia tipo CREST, lograndose aislar y purificar al

    menos 6 protenas centromricas o CENPs

  • La estructura de los centrmeros es compleja pero

    al menos 3 componentes son

    esenciales para un

    centrmero funcional:

    Una cantidad umbral de ADN alfoide

    La protena CENP-B que se asocia al anterior; y

    La CENP-C que es propia del cinetocoro funcional.

  • La regin centromrica

    comprende:

    El centrmero propiamente dicho o constriccin primaria, y

    que esta asociada ntimamente a

    las cromtides hermanas ; y

    Los Cinetocoros que son elementos cupuliformes que se

    observan en la mitosis y en los

    cuales se insertan los

    microtbulos.

  • Cromosomas Humanos

    CINETOCORO

    Acta como sitio de fijacin del cromosoma a

    los microtbulos del huso

    mittico.

    Sitio donde residen algunas protenas motoras.

    Desempean un papel clave en el movimiento de

    los cromosomas durante la

    mitosis.

  • EL CINETOCORO

    Es un complejo proteico del cromosoma que captura y colabora con el transporte de cromosomas

    Se forma en el centrmero, presenta una capa interna y otra externa incrustadas en una corona fibrosa

    Las cromtides hermanas de un cromosoma en metafase se transportan hacia cada polo unidas a microtbulos de los cinetocros.

    Los microtbulosque se extienden desde el centrosoma al cinetocoro se denominan microtubulos del cinetocoro y los microtubulos que conectan los

    dos polos de la clula se llaman microtubulos polares

  • Cinetocoro.

    Acta como sito de fijacin de los cromosomas

    al microtbulo del huso mittico.

    En los mamferos es una placa

    trilaminar de 0.3 m de

    dimetro y de 0.1 m de

    espesor. Una de sus caras est

    estrechamente unida al DNA

    centromrico, la otra mira

    hacia uno de los polos del huso

    divisional y los microtbulos

    se insertan en ella por una de

    sus extremidades.

    Desempea un papel clave en

    el movimiento de los

    cromosomas durante la

    mitosis.

    Dominio cinetocorico

    Dominio central Dominio de apareamiento

    INCEPs, CLIPs

    CENP-C, CENP-D, CENP-E, Quinosina

    CENP-A, CENP-B

    Diagrama representativo de un centrmero de mamferos

  • Funcin de los cinetocorosAtraparUnin de los extremos de los microtbulos a los cromosomas, generan fuerza para mover a los cromosomas a lo largo de los microtbulos y

    regulan la separacin de los cromosomas y su translocacin a los polos.

  • FUNCION

    CINETOCORO

    Anclaje a los microtbulosdel huso: aneuplodia

    Verificacin de esos anclajesDeteccin y correccin de errores: checkpoint de mitosis

    Generacin de fuerzas: motores moleculares

    Anclaje de los cromosomas a los

    microtbulos del huso mittico

  • CAPTURA DE MICROTUBULOS (MTs)Los microtbulos que localizan un cinetocoro se estabilizan, mientras que aquellos que no lo encuentran se despolimeriza rpidamente.

    Como los cromosomas presentan 2 cinetocoros asociados, cuando uno de ellos se engancha a los MTs generado por uno de los polos celulares, el

    cinetocoro de la cromatide hermana queda expuesta hacia el otro polo

  • Verificacin de los anclajes al huso

    Esquema de las diferentes configuraciones de anclaje de los

    cromosomas al huso mittico.

  • ORIGENES DE REPLICACION (OR)

    Slo 1/10 parte son usados para constituir los Replicones o unidades de replicacin del ADN.

    Genoma Humano (46 Xs) hay alrededor de 20,000 replicones con una longitud promedio de 150 Kb de ADN cada uno, y con una velocidad de la horquilla de replicacin de alrededor de 1 Kb por minuto.

    Los replicones slo actan durante el momento preciso del ciclo celular (inicio de fase S).

    Las bandas R se replican antes que las bandas G y stas antes que las bandas C.

    Todo segmento de ADN estable de un organismo debe poseer un OR.

    OR en levaduras

  • Elementos caractersticos del cromosoma (metafsico)

  • Organizacin Molecular de los Cromosomas Humanos

  • TERRITORIOS CROMOSMICOS

    Existen dos modelos: Modelo del Territorio

    Cromosmico (by Carl Rabl,1885) El DNA de cada cromosoma ocupa un volumen definido en el ncleo y sobrelapa con sus vecinos inmediatos(Fig.A).

    Modelo de Espagueti: la fibra de DNA de mltiples cromosomas serpentea a travs del ncleo en una manera aleatoria, son por lo tanto se entremezclados y enredados con cada otro (Fig.B).

    Cmo lucen los cromosomas en el ncleo de una clula cuando no est

    en divisin celular (e.g. neurona)?

  • Los cromosomas

    eucariticos estn

    ordenados y confinados

    a regiones concretas

    dentro del ncleo

    celular que se

    denominan territorios

    cromosmicos.

    Esta organizacin

    espacial puede tener

    implicaciones en la

    regulacin funcional y

    la estabilidad del genoma.

  • TERRITORIOS CROMOSMICOS

    Durante la interfase, los cromosomas existen como territorios cromosmicos Los territorios cromosmicos estn definido como una porcin nuclear tomado por ADN de un cromosoma determinado, el cual tiene un volumen de 2-3

    m de dimetro.

    El ADN que se encuentra en los territorios estn relativamente abiertos, lo que permite que algunos factores de transcripcin funcionen. Los lmites de los

    territorios cromosmicos no son fijos, de sta manera se puede observar una

    sobreposicin entre territorios vecinos.

  • La organizacin jerrquica es importante para la regulacingentica.

    La alteracin de sta organizacin cromosmica puede causar enfermedad.

  • Las acetilaciones disminuyen la carga positiva de la histona y esto hace

    que se liberan la estructura de la cromatina y la hacen pasible a ser

    transcripta (activacin). Por el contrario la desacetilacion son

    compactadoras (silenciadoras) de la actividad trancriptiva del ADN.

  • LOS FACTORES EPIGENETICOS:

  • ROLES DE LA EPIGENTICA

    La epigentica participa en:

    Desarrollo embrionario

    Diferenciacin tisular

    Imprinting gnico

    Inactivacin del cromosoma X

    Represin de DNA parsito (transposones)

    Papel menor en la regulacin gnica (islas CpG normalmente no metiladas), pero importante en patologa .

  • MODIFICACIONES

    ADN HISTONAS

    ACETILACION FOSFORILACION

    UBIQUITINACION METILACION

    METILACION

    ADP -

    RIBOSILACION

  • Esta investigacin tendr un gran

    impacto en nuestra sociedad

    postgenmica y mostrar que somos

    ms que la suma de nuestros genes.

    EL FUTURO DE LA EPIGENTICA