Upload
others
View
9
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Citric acid cycle
Acetyl CoA formation
Reaction occurs in mitochondria
์์ธํธ๊ธฐ: CH3COOH(์์ธํธ์ฐ)์์ ํ์ด๋๋ก์๊ธฐ(-OH)๋ฅผ ๋ผ์ด๋ธ ๊ฒ
CH3CO-S-CoA
์์ฝ๋ฐํจ์ ๋น์ท = ์์ธํธ์๋ฐํ๋ ๊ทธ๋ฌ๋ ์ฐํ๋ฐ์์ ์๋
= ์ฐํ๋ฐ์
์กฐํจ์ A [ๅฉ้ ต็ด -, coenzyme A]
์ฝ์์์ A๋ผ๊ณ ๋ ํ๋ค. ํํ์ C21H36N7O16P3S. ๋ถ์๋ 767.4์ด๋ค. ๋ณดํต Co A, Co ASH๋ผ๊ณ ์ฝ๊ธฐํ๋ค. ์๋ฌผ๊ณ์ ๋๋ฆฌ ์กด์ฌํ๋ฉฐ, ์์ค๊ธฐ ์ ์ดํจ์๋ก ์๋ ค์ ธ ์๊ณ ๊ทธ ์ ๋์ฒด์ ๋ฐ์ํ์ ๋งค์ฐ ๋ค์ํ๋ค. 1951๋ F. ๋ฆฌ๋จ์ ์ํด ์์ธํธ๊ธฐ๊ฐ ๊ฒฐํฉํ ์์ธํธ Co A๊ฐ ํจ๋ชจ๋ก๋ถํฐ ์ ์ ๋์ด ์ด๊ฒ์ Co A ๋์ SH๊ธฐ์ ์์ธํธ๊ธฐ๊ฐ ์ธ์ด์ค์์คํฐ๊ฒฐํฉํ ๊ฒ์์ด ๋ฐํ์ก๋ค.
์์ธํธ์กฐํจ์ A [-ๅฉ้ ต็ด -, acetyl-coenzyme A]
์กฐํจ์ A(CoA)์ SH๊ธฐ์ ์์ธํธ๊ธฐ๊ฐ ์ธ์ด์ค์์คํฐ๊ฒฐํฉ์ ํ ํํฉ๋ฌผ์ด๋ฉฐ ํฌ๋๋น์ด๋ ์ง๋ฐฉ์ฐ์ด ์ดํ๋์ฌ(็ฐๅไปฃ่ฌ)ํ๋ ํฉ๋ฅ์ ์ ์์นํ ์ค์ํ ํํฉ๋ฌผ์ด๋ค. ์ฌ๋ฌ ๊ฐ์ง ์ํํ๋ฐ์์ ๊ด์ฌํ๊ณ ์๋ค.
Series of 8 reactions
Start here
์ฐํ๋ฐ์
์ฐํ๋ฐ์
์ฅ์ด๋ก์์ธํธ์ฐ [ oxaloacetic acid ]
OAA๋ก ์ฝ๊ธฐ. C4H4O5. ๋ถ์๋ 132.07. ํ์์๊ฐ 4์ธ 2์นด๋ฅด๋ณธ์ฐ. ์ํธ๋ฅด์ฐํ๋ก์ ์ผ์์ผ๋ก ์ฌ๋ฌ ๊ฐ์ง ์ญํ ์ ๋งก๊ณ ์๋ค. ์๋ฅผ ๋ค๋ฉด ๋น, ์๋ฏธ๋ ธ์ฐ, ์ง๋ฐฉ์ฐ์ ๊ณตํต ๋ถํด์ฐ๋ฌผ์ธ ์์ธํธCoA๋ ์ฅ์ด๋ก ์์ธํธ์ฐ๊ณผ ์ถํฉํ์ฌ ์ํธ๋ฅด์ฐ ํ๋ก์ ๋ค์ด๊ฐ ์์ ํ ์ฐํํ๋ค. ์ด ๊ฒฝ์ฐ ์ฅ์ด๋ก์์ธํธ์ฐ์ ์์ธํธCoA ์ฐํ๋ฅผ ์ํ ์ด๋งค์ ์ญํ ์ ํ๊ณ ์๋ค
ํจ์์ค์๋ ์กฐํจ์(Coenzyme)์ด๋ผ๋ ๊ฒ์ด ์์ฃ . ์ฆ, ์ฃผํจ์์ ํจ๊ป ์์ฉํ๋ ๋ณด์กฐ์์ฉ์ ํ๊ตฌ์. ํจ์์ ๋ฌ๋ฆฌ ์กฐํจ์๋ ๋จ๋ฐฑ์ง์ ์๋๋๋ค. ๊ทธ ์ฑ๋ถ ์ค ์ผ๋ถ๋ ATP์ ์ ์ฌํ๊ณ , ์ฌ๋ฌ ๊ฐ์ง ๋ฐ์์ ๊ด์ฌํฉ๋๋ค. ์ด๋ค์ ์ฃผ๋ ๊ธฐ๋ฅ์ [ATP ํฉ์ฑ ๋ฐ์์ ์ฐธ์ฌ]ํ๋ ๊ฒ์ ๋๋ค. ์กฐํจ์์ค ๊ฐ์ฅ ์ผ๋ฐ์ ์ธ ๊ฒ์ด NAD(nicotinamide adenine dinucleotide)์ NADP(nicotiamide adenine dinucleotide phosphate)์ด๋ฉฐ, ๊ทธ ๋ค์์ผ๋ก๋ FAD(flavin ademine dinucleotide)๊ฐ ์์ง์. ์ฌ๊ธฐ์ NADP๋ ๊ดํฉ์ฑ์๋ง ์์ฉํ๊ณ , NAD๋ ์ธํฌํธํก์์๋ง ์์ฉํ๋ฉฐ, FAD๋ ๊ดํฉ์ฑ๊ณผ ์ธํฌํธํก์ ๋ชจ๋ ์ฌ์ฉ๋์ง์. NAD์ NADP์ ์ฐจ์ด์ ์ ์ธ์ฐ๊ธฐ๋ฅผ ํ๋๋ ๊ฐ์ง๊ณ ์๋ ๊ฒ์ด์ฃ . ATP์ ๊ฐ์ด NAD, NADP๋ชจ๋ ์ง์ ์ผ๊ธฐ์ธ ์๋ฐ๋, ๋ฆฌ๋ณด์ค์ค, ์ธ์ฐ๊ธฐ๋ก ๊ตฌ์ฑ๋์ด ์์ต๋๋ค. ๊ทธ๋ฌ๋ ์ด๋ค์ ๋์ฝํด์ฐ(nicotinic acid)์ด๋ผ๋ ํํฉ๋ฌผ์ ๊ฐ์ง๊ณ ์์ง์. ์ด๋ค NAD, NADP, FAD์ ์กฐํจ์๋ ๊ธฐ๋ฅ์ ์ ์ฌํ๊ณ , ๊ธฐ์ง์ ์ฐํ(oxidation)์ ํ์(reduction)์ ๊ด์ฌํ๋ ํจ์์ ํจ๊ป ์์ฉํ์ง์.
NAD+, NADH ?
์ด๋ฌํ ์กฐํจ์๋ ์ ์(๊ทธ๋ฆฌ๊ณ ์์ฑ์ H+)๋ฅผ ์ผ์์ ์ผ๋ก ์์ฉํ์๋ค๊ฐ ๋ค๋ฅธ ๋ถ์๋ก ๋ด ๋ณด๋ด๊ฒ ๋์ง์. ์ด๋ฐ ๊ณผ์ ์ ํตํด ์กฐํจ์๋ ์ ์๊ณต์ฌ์ฒด์ ์์ฉ์ฒด์ ์๋์ง ์ํ๋ฅผ ๋ณํ์ํค๊ธฐ ๋๋ฌธ์ ์ ์์ด๋ฐ์(electron carrier)๋ก ์๊ฐํ๊ณ ์์ฃ . ์ฐํ๋ NAD, NADP๋ ์ธํฌ์ ์ ์์ ์ธ pH์์ ์์ ํ๋ฅผ ๋ ๋ฏ๋ก ์ผ๋ฐ์ ์ผ๋ก NAD+, NADP+๋ก ํ์๋๋ฉฐ, ๋ณดํต ๋ ๊ฐ์ ์ ์๋ฅผ ๋ฐ์ ์์๋๋ฐ, ๊ทธ ์ค ํ๋๋ ์ฃผ์์์ ์์ฑ์(H+)๋ฅผ ๋์ด๋น๊ธฐ๊ณ ๋๋จธ์ง ํ๋๋ ์์ ํ๋ฅผ ์คํ์ํค๋ ์ผ์ ํ๊ฒ ๋ฉ๋๋ค. ๋๋ฌธ์ [ํ์ํ]์ ๋ณดํต NADH์ NADPH๋ก ํ์ํฉ๋๋ค. ์ดํด๋์ฃ ? ^^
๋ํ ์ด๋ค ๋ ์กฐํจ์๊ฐ ํ์๋ ๋ ๊ตฌ์ฌ์ ์์ฑ์(๋๊ฐ์ ์ ์์ ํจ๊ป)๋ฅผ ๋์ด๋น๊ธฐ๊ธฐ ๋๋ฌธ์ ์ด๋ค ์ฌ๋์ ํ์ํ์ NADH + H+ ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ NADPH+ + H+๋ก ํ์ํ๊ธฐ๋ ํ์ง์. ์ด๋ ๊ฒ ํํํจ์ผ๋ก์จ ์ 2์ ์์ฑ์๊ฐ ์ฃผ์์ ์์์ ์๋ ค์ฃผ๋ ค๋ ๊ฒ์ด๊ตฌ์. ๊ทธ๋ ๋ค๋ฉด FAD๋ ์ด๋จ๊น์? FAD๋ NAD๋ NADP์๋ ๋ฌ๋ฆฌ ๋ ๊ฐ์ ์ ์์ ์์ฑ์๋ฅผ ์ฆ์ ๋ฐ์๋ค์ด๊ธฐ ๋๋ฌธ์(2๊ฐ์ ์์ ์์์ ๊ฐ์), FAD์ ํ์ํ์ FADH2๋ก ํ์๋์ง์... ์ด๋ค์ ์์ ๋งํ ๊ฒ๊ณผ ๊ฐ์ด ๊ดํฉ์ฑ์ด๋ ์ธํฌํธํก์์ ์๋์ง์ธ ATP๋ฅผ ์์ฑํ๋๋ฐ ๊ด์ฌํ๊ฒ ๋๊ณ ์ ์ฌ์ฉ๋๋ ๊ณณ์ ๋ค๋ฅธ ๋ถ์ด ์ฌ๋ฆฐ ๊ฒ๋ ์์ผ๋๊น ์ฐธ๊ณ ํ๋ฉด ๋ ๊ฒ ๊ฐ๋ค์....
NAD+ โ NADH์ 2 ์ ์ ์ฐํ ํ์ ๋ฐ์์ ๋ค์๊ณผ ๊ฐ๋ค. NAD+ + ํ์ ๋ฌผ์ง (2e- + 2H+ ) โ NADH + H+ + ์ฐํ๋ฌผ์ง
NAD+ ์์ฒด๊ฐ ์ ์๊ฐ ํ ๊ฐ ๋ถ์กฑํ์ํ
NAD+ โ NADH์ 2 ์ ์ ์ฐํ ํ์ ๋ฐ์์ ๋ค์๊ณผ ๊ฐ๋ค. NAD+ + ํ์ ๋ฌผ์ง (2e- + 2H+ ) โ NADH + H+ + ์ฐํ๋ฌผ์ง
์ํธ๋ก์ฐ์ผ [ citrate ]
tricarboxylic acid๋ก ๋ง์ ๊ณผ์ผ์ ์กด์ฌํ๋ฉฐ TCA cycle์์ ์ค์ํ ์ค๊ฐ๋์ฌ์ฐ๋ฌผ์.
ํ์ด๋๋ก์๊ธฐ๋ฅผ ๊ฐ์ง๋ ์นด๋ณต์ค์ฐ์ ํ๋๋ก ๋ง์ ์๋ฌผ์ ์จ๋ ๊ณผ์ฆ ์์ ์ ๋ฆฌ์ํ์ ์ฐ์ผ๋ก ํจ์ ๋์ด ์๋ค. ์ํ์ ์ฒจ๊ฐํ๊ฑฐ๋, ๋ถ์์์ฝ ๋๋ ํ์ก์๊ณ ์ ์ง์ ๋ก ์ฌ์ฉ๋๋ค
๊ตฌ์ฐ์ฐ(ๆธๆซ้ ธ)์ด๋ผ๊ณ ๋ ํ๋ค. ๊ตฌ์ฐ์ด๋ ์ํธ๋ก citron์ ํ์๋ช ์ด๋ฉฐ, ์ํธ๋ก ์ ๋น๋กฏํ์ฌ ๋ ๋ชฌ์ด๋ ๋ ์ต์ ๊ด๊ทค ๋ฑ ๊ฐ๊ทค๋ฅ์ ๊ณผ์ผ์ ํนํ ๋ง์ด ํจ์ ๋์ด ์๋ ๋ฐ์์ ์ฐ์ ํ๋ค. ์์ด๋ช ์ธ citric acid์ citric๋ ๊ฐ๊ทค๋ฅ๋ฅผ ๋ปํ๋ ๊ทธ๋ฆฌ์ค์ด์ธ citrus์์ ์ ๋ํ ๊ฒ์ด๋ค. ํํ์ C6H8O7. ๋ฌผยท์ํ์ฌ์ ์ ๋ น๋๋ค
์ ๊ถ๊ธํด์ ์ฌ์ญ๋๋ค ์ํธ๋ฅด์ฐ ํ๋ก ์ฒซ๋ฒ์งธ ๋จ๊ณ์์ ์์ธํธ COA์ ์ฅ์ด๋ก ์์ธํธ์ฐ์ด ๊ฒฐํฉํ์ฌ ์ํธ๋ฅด์ฐ์ ํ์ฑํ์๋์ ๊ทผ๋ฐ ์์ฑ๋ฌผ ์ํธ๋ฅด์ฐ์ ๋ณด๋ฉด ์ฐ์๊ฐ ํ๋ ์ถ๊ฐ ๋์๋๋ฐ ์ด๊ฑด ์ด๋ป๊ฒ ์์ฑ๋๊ฑด์ง ๊ถ๊ธํ๋ค์ CoA๊ฐ ๋น ์ง๋ฉด์ ๋ค์ด์จ ์ฐ์๋ ์ด๋์ ๋๊ฑด์ง ๊ถ๊ธํ๋ค์ ์ํ์ผํ ๊ธ๋ฃจํ๋ฅด์ฐ์์ ์์ ์ฐ CoA, ์์ ์ฐ์ผ๋ก ๋์ด๊ฐ๋ ๊ณผ์ ์์๋ ๋ง์ฐฌ๊ฐ์ง๋ก ์กฐํจ์A๊ฐ ๋น ์ง๋ฉด์ ์ฐ์๊ฐ ํ๋ ๋ ๋ถ๋ค์
๋ฉ์ฒญํ๊ฒ ์๋๋ผ ์ ์ฐพ์ผ์ จ์ต๋๋ค. ์ง๋ฌธํ๊ธฐ ๋ฏผ๋งํ ๊ฒ์ ์๋๋๋ค. ์ ๊ณต๋ํ์๋ค์กฐ์ฐจ ๋์ถฉ ์ธ์ฐ๊ธฐ์์ผ๋ก๋ง ๊ณต๋ถํ๋ฉด ๊ทธ๋ฅ ๋์ถฉ ๋์ด๊ฐ๋ ๋ถ๋ถ์ ์ ๋ณด์ จ์ต๋๋ค. CoA์ ์ฐ๊ฒฐ๋ ๋ถ๋ถ์ ๊ณ ์๋์ง ๊ฒฐํฉ์ธ๋ฐ, ์ด ๋ถ๋ถ์ ๋ณธ์ฒด์ธ citrate๋ ํน์ Pi๊ณผ succinate์๊ฒ ์ ๋ฌํด์ผํ๊ณ , ๊ทธ๋ ๋ค๊ณ ๋ค์ ์๋์ง๋ฅผ ์ฑ์ฐ๋ ค๋ฉด ์๋์ง์ ์๋น๋ฅผ ํด์ผํ๊ณ , ๊ทธ๋ ๋ค๊ณ ์ง์ฉ์ฑ์ธ ํํ์์๋ฅผ ๋ง๋ค๋ฉด ์ธํฌ๋ง์ ํต๊ณผํ๊ธฐ ์ฌ์ดํํ๊ฐ ๋๋ ์ด๋ด๋๋ ๋จ์ํ CoA์ ๊ณ ์๋์ง ๊ฒฐํฉ์ ์๋ ์๋์ง๋ง ์ ๋ฌํ๊ณ ๊ทน์ฑ๋ถ์๋ก ๋ง๋ค๊ธฐ์ํด์ ์ฃผ๋ณ์ ํํ ๋ถ์๋ฅผ ์ด์ฉํฉ๋๋ค. ๋ฐ๋ก ๋ฌผ์ด์ฃ . ๋จ, succinate CoA-> succinate๋ก์ ๋ฐ์์๋ ๋ฌผ๋์ ์ Pi๊ฐ ์ด ์ญํ ์ ํฉ๋๋ค. ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ proton์ ์ด ๋ฐ์์ ์ ๋ํ๋ enzyme์ histidine์ด proton shuttle๋ก ์์ฉํ๋ฉด์ ์ ๊ณตํฉ๋๋ค. ๊ฒฐ๋ก ์ 1. citrate์ ์ฒจ๊ฐ๋ ์ฐ์๋ ๋ฌผ์์ ์ ๋ํ๊ฒ 2. succinate์ ์ฒจ๊ฐ๋ ์ฐ์๋ Pi์์ ์ ๋๋๊ฒ
Reaction occurs in mitochondria
Summary
Starting with acetyl coA 1) lost 2 CO2 2) produced a) 3 NADH + 3H+
b) 1 FADH2
c) made 1 GTP (ATP) by SLP
Glyoxylate cycle
A) Pathway in some plants and microorganisms & invertebrates. Especially studied in germination of seeds high in TAG
Glyoxylate cycle
Glyoxylate cycle
- Role and function: net conversion of Acetyl coA to OAA in germinating seeds in plant โ OAA is converted to glucose (gluconeogenesis) - Sites: glyoxysome - Two enzymes: malate synthase, isociterate lyase
์๋ฌผ์์ ์ด ํ๋ก์ ํจ์๋ ๊ธ๋ฆฌ์ฅ์์์ด๋ผ๊ณ ๋ถ๋ฆฌ๋ ์ธํฌ ๋ด์ ์๊ณผ๋ฆฝ์ ์กด์ฌํ๋ค. ์ด ๊ณผ๋ฆฝ์ ์ง๋ฐฉ์ฐ์ ๋น์ง๋ก ์ ํ์ํฌ ์ ์๋ ์๋ฌผ์ธํฌ์๋ง ์กด์ฌํ๋ฉฐ, ์นดํ๋ผ์์ ์ ํจ์ ๋์ด ๋ง์ ํ๋ฅด์ฅ์์๊ณผ ๊ด๋ จ์ด ์๋ ๊ฒ์ผ๋ก ๋ณด์ธ๋ค.