83
5/26/2018 Curs3Stomato-slidepdf.com http://slidepdf.com/reader/full/curs-3-stomato 1/83 11 STRUCTURA GENELOR

Curs 3 Stomato

Embed Size (px)

Citation preview

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    1/8311

    STRUCTURA

    GENELOR

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    2/83

    2

    1. GENA - UNITATE DE STRUCTUR AMATERIALULUI GENETIC

    GENA = un segment de cromozom,

    precis delimitat,

    continuu (indivizibil),ocup o poziie fix,

    numit locus*

    determin un anumit caracter---------------------------

    * Plural = loci

    U.M.F IAI

    Cromozom

    locusCARACTER

    X

    GENA X

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    3/83

    3

    GENACromozom

    Culoarea ochilor(ochinegri)

    M 1 M 2

    Variant / alelnormal

    Variant / alelanormal

    OCHI ALBATRI ALBINISM OCULAR

    CARACTERmutaie 1 mutaie 2

    PROTEIN

    U.M.F IAI

    Gene alele O gen normal poate

    suferi o mutaie *ceproduce o variantagenei numit alel.

    ALELAeste o formalternativ a genei.- ocup acelai locus,- influeneaz acelaicaracter*

    GENE ALELE. POLIALELIE

    PolialelieO gen (A) mai multe mutaiidiferite alele multiple(A1, A2, A3),cu efecte fenotipice (N sau An)

    limitate la acelai caracter.

    LocusulABO :aleleA1, A2, B i O

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    4/83

    4

    GENE ALELE. POLIALELIE

    Un caracter (fenotip) va fi determinat

    de o pereche de gene alele(genotip*)situate n aceeai poziie (locus) pecromozomii omologi.

    Genele alele segregn meioz: gameii (haploizi) sunt puri genetic

    (posed o singur alel);

    Genele alele situte pe o pereche de crz.omologi (ex., Dd) segereg (n meioz)independentde genele alele situate pe

    alt pereche (ex., Mm) formndu-segamei cu combinaii genice diferite.

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    5/83

    5

    HOMOZIGOT. HETEROZIGOT. HEMIZIGOT

    Genele alele (N sau A), ce ocup loci omologi, pot fi : identice (NN sau AA) HOMOZIGOT

    diferite (Na sau An) HETEROZIGOT( A1A2 ) HETEROZIGOI COMPUI

    La brbaii XY o gen autozomal de pe X nu are echivalentpe Y genotip HEMIZIGOT(XaY)

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    6/83

    6

    DOMINANT. RECESIV. CODOMINANT

    La heterozigoi, genele alele diferite

    se pot manifesta fenotipicdiferit,n funcie de "fora" lor de expresie. Gena i caracterul care se

    manifestla heterozigoisuntnumite dominante.

    Na caracter NAn caracter A

    Gena (a sau n) care NU semanifestla heterozigoisenumete recesiv;

    ea se exprim numai lahomozigoi(aasau nn).

    Dac ambele gene alelesemanifest fenotipic la heterozigoi codominante

    U.M.F IAI

    GenotipFenotipA1A1 A1A1A2 A1

    A1o A1B B BB o BA1B A1B

    A2B A2B

    Ex., Genele ABO[(A1>A2)=B]>0

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    7/83

    7

    2. FENOMENELE DE NLNUIRE GENIC (LINKAGE) I

    NCRUCIARE CROMOZOMIAL (CROSSING-OVER) Un cromozom = mai multe gene

    nealele

    - situate n loci distinci- dispuse liniar("n monom")- determin caractere

    Prezena a dou sau mai mul tegenedist inc te peacelai cromozomsenumete SINTENIE.

    U.M.F IAI

    A

    B

    C

    D

    E

    cromozom

    gene

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    8/83

    8

    a).NLNUIREA GENIC (LINKAGE)Genele nealele,

    - situate foarteaproapeuna de altapeacelaicromozom,- nu segreg(nu se separ) n meioz i- setransmitmpreun(n bloc)de laprinila descendeni.

    Acest fenomen se numeteNLNUIREGENIC("linkage")

    Fenomenul de nlnuire se refer laLOCI i nu la alele.Ex., locusul D (pentru o boal genetic)este nlnuit cu un locus marker(ce arevariantele alelice M i m);

    n unele familii alela Deste nlnuit cu

    alela Miar n altele Dcu m.

    U.M.F IAI

    D

    M

    D

    m

    D

    M

    D

    m

    gamei

    meioz

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    9/83

    9

    NLNUIREA GENIC (LINKAGE)

    Genele dintr-o regiune cromozomialcare se transmitmpreun formeaz un grup de nlnuire sau un

    HAPLOTIP.

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    10/83

    10

    DEZECHILIBRUL DE NLNUIRE

    Uneori o gen boal(B) se asociaz maifrecvent cu o anumit alela locusuluimarker = asociere alelic preferenialsau dezechilibru de nlnuire

    Ex.: 85% dintre bolnavii cu hemocromatozereditar(HE) din Europa au o mutaieunic(n codonul 282 din gena HFE) carese asociaz cu alela HLA A3

    Explicaie: cei mai muli bolnavi cu HEprovin dintr-un strmo comun(efect defondator)care a avut gena mutantasociat cu HLA A3

    Hemocromatoza ereditar Boal ereditar (AR)

    frecvent, 1:400

    Absorbie crescut de fierce produce acumulareexcesiv de fiern ficat(ciroz), cord(insuficiencardiac), pancreas(diabet), piele

    (pigmentaie bronzat),glande endocrine. Gena HFE pe cromozomul

    6p lng gena HLA A

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    11/83

    11

    APLICAII PRACTICE A FENOMENULUI DE NLNUIRE GENIC

    Diagnosticul (prenatal sau presimptomatic) alunor boli geneticeprin studiul t ransmiter i iunei gene marker, uor deidentificat, nlnuitcu gena mutant(gena boal)

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    12/83

    12

    Diagnosticul prenatal al unor boli genetice: identificarea mutaiei (aa) la ft posibil dar

    presupune cunoaterea prealabil a mutaiei la copilulbolnav; laborioas i scump

    studiu l transm iter i i uneigene marker, uor de

    identificat, nlnuitcu gena mutant(gena boal)

    gena pentru enzima 21 hidroxilaz(CYP21B) este localizatpe cromozomul 6pi se transmite strns nlnuit cu gena B

    a complexului HLA (gen marker cu mai multe alele)

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    13/83

    Transmiterea genei mutante pentru 21-hidroxilaz

    ntr-o familie i diagnosticul molecular al bolii(transmis AR) se pot stabili prin analiza geneimarker HLA-B,cu care gena mutant este strns

    nlnuit.

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    14/83

    14

    Valoarea diagnostic a nlnuirilor genice dintre unlocus boali un locus markera nceput s fie largutilizat dup 1980 prin folosirea markerilor ADN

    polimorfici.

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    15/83

    15

    b).NCRUCIARE CROMOZOMIAL (CROSSING-OVER)

    nlnuirea genic NU este unfenomen absolut numaigenele si tu ate foarte aproapeuna de alta se transmit totdeauna

    mpreun,nlnuite.

    Genele si tuate la distanunade alta, pe acelai cromozom potfi separateprin fenomenul de

    ncruciare cromozomial saucrossing-over(n profazameiozei primare).

    U.M.F IAI

    D

    M

    d

    m

    D

    M

    d

    mGamei

    recombinani

    Profazameioz I

    CO

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    16/83

    16

    NCRUCIARE CROMOZOMIAL (CROSSING-OVER)

    MECANISM CO:

    - sinapsa(gen la gen) acromozomilor omologi (n zigoten);

    -ncruciareacromatidelor (chiasm);- ruperealor la locul de contact + schimb EGALde gene

    - rezult o nou dispoziiea genelorparentale= RECOMBINARE GENIC

    OMOLOAG. Recombinarea genic omoloag SURS

    IMPORTANT DE VARIABILITATE.

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    17/83

    17

    CARACTERISTICILE CO:

    Recombinrile genice omologe,produse n meioz prin CO, suntfenomene aleatorii iimpreviz ib i le;

    frecvena de producere a COntredou gene/ loci este direct

    proporional cudistana fizicdin tre ele; aplicaii ncartografiereagenic.

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    18/83

    18

    CO INEGAL:

    mperechere greita unor secveneasemntoaredar neomolage, situatepe cromosomii omologi prin CO schimbul inegalde segmente deleii i duplicaiigenice.

    RECOMBINARE OMOLOAG NEALELICBOLI GENOMICE.

    U.M.F IAI

    IMPORTANA CUNOATERII CO

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    19/83

    19

    B. CONCEPIA ACTUAL DESPRESTRUCTURA GENEI

    GENA = un ansamblu liniar de secvenenucleotidice de ADN necesar pentru a produceun produs funcional: un polipeptid sau o

    molecul de ARNGena este o unitate de transcripie.Genele :

    segmente de ADN,

    imprecis del im i tate

    divizibile = structur discontinuocup un locus distinct

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    20/83

    1. ANATOMIA UNEI GENE CARE CODIFICPROTEINE

    prezint o regiune central, transcrisintegral n ARNmesagerprecursor, numit "cadrul de lectur" alinformaiei genetice necesar pentru sinteza proteinei;

    flancat de dou pri laterale, ne transcrise, cu rolul

    de a reglaexpresia genei

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    21/83

    ANATOMIA UNEI GENE CARE CODIFIC PROTEINEU.M.F IAI

    1.1.REGIUNEA CENTRAL

    transcrisintegral n ARNmesagerprecursor (ORF*);alternanade secvene

    codante = exoni inecodante = intronincepe cu:

    -situsul de iniiere altranscripiei(SIR sau

    INR) i-regiunea netrasnlat5UTRce conine icodonul iniiator ATG

    5-CCAGCCATG-3

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    22/83

    22

    EXONII

    secvene transcrisen pre ARNm i

    pstraten ARNmmatur.

    Regiuni codantept

    anumite pti dinprotein = domenii.

    U.M.F IAI

    REGIUNEA CENTRAL A GENEI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    23/83

    23

    U.M.F IAI

    INTRONII(secvene intercalante=IVS)

    Secvene necodante Transcrise iniial n preARNm i

    apoi decupate precis indeprtatedin ARNm matur,alctuit numai din asamblareaexonilor (matisare)

    ncep cu 5 GT i sfresc cuAG 3semnale pentrudecuparea precis*.

    Rol puin cunoscut probabil nmatisarea alternativ(seleciaanumitor exoni)

    REGIUNEA CENTRAL A GENEI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    24/83

    24

    Regiunea central setermincu o secven3UTRnecodantce

    conine: Unul din codonii stop (TAA;

    TAG, TGA) Situsul de terminareal

    transcripiei (AATAAA)

    Situsul de poliadenilarelocul de desprindereamoleculei de ARNm sintetizati adugare unui segmentpoliadenilic (rol n stabilitateai transportul ei din nucleu)

    U.M.F IAI

    REGIUNEA CENTRAL A GENEI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    25/83

    1.2. REGIUNILELATERALE

    Flancheazregiunea

    central (ORF)

    Netranscrise

    Rol dereglare atranscripiei

    U.M.F IAI ANATOMIA UNEI GENE CARE CODIFICPROTEINE

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    26/83

    a). Regiunea lateral 5'

    (n amontede ORF) 3 situsuri:

    PROMOTOR Situs de specificitate tisular Situs de modulare a activitii genice

    Servete la: iniierea transcripiei

    (fixarea ARN polimerazei) reglarea anumitor genen anumite

    esuturi (specificitate tisular), n anumitestadii de dezvoltare (specificitate

    temporal) sau la anumite semnale /stimulidin mediu(ex. hormoni)

    Reglarea intensitii transcripiei

    U.M.F IAI ANATOMIA UNEI GENE CARE CODIFICPROTEINE

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    27/83

    27

    REGIUNEA LATERAL5

    PROMOTORULconine mai multe

    elemente saumodulepe care seataeaz proteine reglatoare(trans-activatoare) numite factori detranscripie(TF II);

    TFse fixeaz la miezul promotorului(TATA; CAAT; GC) i are rolul sfixeze, s poziioneze i sactiveze ARN polimeraza II,astfelca transcripia s nceap exact la

    SIT, cu primul nucleotid (+1)

    Ali TF regleaz specificitateatisular, rspunsul la semnaleiintensitateatranscripiei

    U.M.F IAI

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    28/83

    28

    b. REGIUNEA LATERAL 3

    U.M.F IAI

    Regiunea lateral 3' - situat n avalde cadrul delectur al genei.

    o secven netranscris, imprecis delimitat icunoscut,

    rol structural i funcional.n aceast regiune se gsesc secvene semnalcare

    afecteazprocesarea, stabilitatea i durata de via a

    ARNm.

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    29/83

    29

    U.M.F IAI

    2. TIPURI DE GENE

    2.1. Gene comune i genespecifice

    Gene comune - ubicuitare(housekeeping genes)

    Se exprimn toate celulele. Codificproteine

    indispensabile funciilor celularefundamentale.

    Trasncripie continu, la nivelsczut.

    Gene specifice: Expresie limitat spaial

    (anumite esuturi / celule) sautemporal(anumite stadii)

    Codificproteine specifice

    2.2. Gene unice i familii de gene Majoritatea genelor sunt unice,

    puine sunt duplicate Unele copiiale genelor unice

    sunt nefuncionale(gene

    trunchiate; fragmente de gene;pseudogene) Familii de gene:

    Au o structur identic Produc proteine asemntoare Au o origine comun(prin

    duplicaia unei gene ancestrale

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    30/83

    30

    U.M.F IAI

    Pn n 1970 genele erau entiti materiale inaccesibile analizeidirecte:

    dimensiuni foarte mici imposibilitatea obinerii uneicantiti suficiente de material pentru

    studiu.

    Dup 1970 s-au descoperit: enzimele de restricie, veritabile "bisturie" genetice, cu ajutorul crora

    a devenit posibil secionarea ADN i izolarea genelor*.

    tehnici de amplificareunui fragment specific de ADN = clonareagenelor (celular sau acelular PCR)**.

    tehnici de analiz i secveniere*

    C. METODE DE CLONARE I ANALIZ A GENELOR

    (TEHNOLOGIA ADN)

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    31/83

    31

    U.M.F IAI

    TEHNOLOGIA ADN

    a ianugurat era ingineriei

    moleculare cu multiple iimportante aplicaii practice:

    analiza structurii, cartografieriilu funciei genelor;

    elucidarea patogenieibolilorgenetice i dobndite (infecii,cancere);

    diagnosticulbolilor:preimplantator, prenatal,presimptomatic;

    biosinteza unor moleculeterapeutice(insulin, hormon decretere, eritropoietin etc)

    tratamentul bolilor genetice i

    terapia genic

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    32/83

    32

    U.M.F IAI

    1. CLONAREA ADN

    Clonarea ADN este amplificarea selectiv a uneigene sau fragment de ADNprin multiple runde dereplicarecare vor produce un numr mare de copiia

    fragmentului respectiv, ce vor permit analiza structurii ifuncieisale.

    2 tipuri majore de clonare: Celular,in vivo, utilizeaz mecanismu l natural de repl icare

    a unor fragmente de ADNobinute prin diferite metode iintroduse cu ajutorul unor vectori (plasmide, bacteriofagi,cromozomi artificiali) n celule gazd (bacterii, levuri)

    Acelular, in vi t ro ,folosind o reacie de plomerizare n lan(PCR)

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    33/83

    33

    U.M.F IAI

    1.1. OBINEREA UNOR GENE SAUFRAGMENTE DE ADN

    Trei metode:

    (1).Secionarea ADNgenomic, cu ajutorulenzimelor de restricie;

    Enzimele de restricie(Pr.Nobel, 1978)recunosc i taieADN la nivelul unor secvenenucleotidice specifice(situsuri de restricie)producnd fragmente de ADNcu capete adezive.

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    34/83

    34

    U.M.F IAI

    OBINEREA UNOR GENE SAU FRAGMENTE DE ADN

    (2).Obinerea de ADNcomplementar uneimolecule de ARNm,cu

    ajutorul t ranscr iptazeiinverse

    Transcriptaza invers(Pr.

    Nobel, 1975)sintetizeaz ocaten de ADNc pe baza uneimolecule de ARNm extras dincelule.

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    35/83

    35

    U.M.F IAI

    OBINEREA UNOR GENE SAU FRAGMENTE DE ADN

    (3).Sinteza artificial (chimic)a unor fragm ente de ADN

    prin polmerizarea dezoxiribo-

    nucleotidelorntr-o ordinedeterminat anterior(de ex.,pe baza secvenei deaminoacizi i codului genetic).

    Fragmentele de ADN vor fiutilizate ca sonde sau amorse nalte tehnici.

    U M F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    36/83

    36

    U.M.F IAI

    Clonarea ADN in vivoutilizeazmecanismul natural de replicareal ADN n celulea unor segmentede ADN introduse n celule cuajutorul unor vectori

    form area ADN recom binant,prin ataarea in v i t ro afragmentelor de ADN uman la" un vector sau repl icon "capabil de replicareindependent;

    transferareamoleculelor deADN recombinant n celulegazd,n care vectorulrecombinant se replicindependentde cromosomulcelulei gazd;

    ampli f icareasau producerea declone celulare multiple.

    izolarea clonelor d e ADN

    recombinant.

    1.2. CLONAREA ADN N CELULE

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    37/83

    37

    U.M.F IAI

    Folosete tehnica "polymerasechain react ion" (PCR)(Mullis iSmith; Premiul Nobel, 1993)

    se poate ampl i f ica select ivosecven scurt de ADN sau ARN.

    Amplificarea se realizeaz pe bazaprincipiuluiextens iei unei amors e("primer").

    PCR este o reacie n landeoarececatenele de ADN nou sintetizate

    vor aciona ca matriepentrusinteza ADN n ciclurile urmtoare.

    Amplificarea este considerabil(demiliarde de ori) i rapid(n ctevaore), fiind integral automatizat.

    1.3. CLONAREA ACELULAR A ADN (metoda PCR)

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    38/83

    38

    U.M.F IAI

    2. METODE DE ANALIZ A ACIZILOR NUCLEICI

    n medicina practic analiza direct a geneisau

    produselor sale este folosit pentru:

    studiul patologiei moleculare;

    diagnosticul genotipicprenatal sau presimptomatic al

    unor boli, chiar i atunci cnd gena i efectele ei nu suntcunoscute sau nu sunt evidente; recunoaterea unei infecii virale.

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    39/83

    39

    METODE DE ANALIZ A ACIZILOR NUCLEICI:PRINCIPII

    Pentru a identifica o gen este necesar osond genotipicadecvat care s permit: fie recunoaterea genei (sonde directe) fie recunoaterea unor markeri genotipici (secvene

    necodante) situai n vecintatea genei (sondeindirecte).

    Aceast recunoatere se realizeaz peprincipiul hibridizrii moleculare a acizilornucleici.

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    40/83

    40

    METODE DE ANALIZ A ACIZILOR NUCLEICI:PRINCIPII

    Hibridizarea molecular se bazeaz pe capacitatea unorsonde monocatenare de acid nucleic de a forma, pebaz de complementaritate, molecule bicatenarecu osecven de acid nucleic int(monocatenar).

    Fragment ADN:...T T A T A C G G T C A T C G T C G C A T G C T A G

    A T* G C C A*G T ASond oligonucleotidic marcat

    Pentru a identificai izola hibridul molecular sonda estemarcatcu un trasor radioactiv (32P) sau cu un compusfluorescent.

    U.M.F IAI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    41/83

    41

    METODE DE ANALIZ A ACIZILOR NUCLEICI:TEHNICI

    a).Analiza ADN genomic uman

    prin metoda de transfer

    Southern

    b). Analiza cu sonde oligo-nucleotidice specifice unei

    alele (ASO) (dot blot).

    c). Analiza ARNm prin Northern

    blot.d). Analiza proteinelor prin

    Western blot.

    e) Secvenierea unor gene

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    42/83

    1/6/2012 421

    FUNCIA

    GENEI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    43/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 43

    A. CONCEPIA CLASICREFERITOARE LA FUNCIA GENEI.

    B. CONCEPIA ACTUALREFERITOARE LA FUNCIA GENEI.

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    44/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 44

    A. CONCEPTIA CLASICREFERITOARE LA FUNCTIA GENEI

    1. Generaliti

    2. Poligenia

    3. Pleio trop ia

    4. Interaciunile genice

    5. Eterogenitatea genetic

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    45/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 45

    A.1. GENERALITATI Relaia "o gen un caracter

    Excepii de la regula "o gen un caracter: Pol igenie;

    Pleiotropie;

    Interaciuni genice; Eterogenitatea genetic

    O GEN UN CARACTER FENOTIPIC

    BOAL FUNCTIE GENIC

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    46/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 46

    A.2. POLIGENIA

    unele caractere sun t determinate pr in

    aciunea conjugat a mai mul tor perech i degene alele, care ocup loci diferii;

    f iecare pereche de gene are efectecantitative mici i aditive

    abaterea de la regula "o gen uncaracter" este aparent, deoarece fiecaregen determin o parte din caracter

    MAI MULTEGENE

    UN CARACTERFENOTIPIC

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    47/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 47

    A.2. POLIGENIA

    distribuia caracterului n populaieco respunde unei cu rbe de t ip

    Gaussian(distribuie continu);

    genele imp l icate acioneaz

    independent, iar exp resia lor esteinfluenat de factori de mediucaractere mu lt i facto r iale

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    48/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 48

    Caractere poligenice normale: talia,

    tensiunea arterial, culoarea pielii,

    inteligena,

    dermatoglifele

    A.2. POLIGENIA

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    49/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 49

    Caractere poligenice anormale: bolile comune ale adultuluiulcerele

    gastrice i duodenale, astmul bronic,schizofrenia, diabetul zaharat malformaiile congenitale izolatepiciorul

    strmb congenital, luxaia congenital de

    old, anomaliile congenitale cardiace izolate unele forme de cancer

    A.2. POLIGENIA

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    50/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 50

    efecte fenotipice multipledeterminate deo singur gen mutant(dominant) sau

    o pereche de gene mutante (recesive);

    dou tipuri de pleiotropie:

    pleiotropie relaional pleiotropie nerelaional

    A.3. PLEIOTROPIA

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    51/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 51

    Pleiotropie relaional corelaie patogenicmutaia genic

    efectele fenotipice;

    exemple: sindromul Marfan, osteogenesis imperfecta,

    fibroza chistic albinismul

    A.3. PLEIOTROPIA

    Sindromul Marfan

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    52/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 52

    Sindromul MarfanInc iden1/10.000 de nou-nscuiTip de transm iteredominant autosomalGeneticmutaiagenei fibrilineiPatogenie prezena unei fibriline anormale determin modificri ale esutuluiconjunctiv din sistemul osteoarticular, pereii vasculari i ligamentul suspensor alcristalinului.Diagno st ic c l in ic se bazeaz pe evidenierea a trei categorii de semne isimptome:

    -ocularemiopie, ectopie cristalinian;

    -scheletice membre lungi i subiri (dolicostenomelie) deformri sternale(pectus excavatum sau carinatum) scolioz, degete lungi i subiri(arahnodactilie) ihipermobilitate articular(luxaiifrecvente);-cardiovasculareregurgitaiea sngelui din ventricolul n atriul stng datoritprolapsului de valv mitral i dilataii ale peretelui aortic (anevrisme) careinduc o insuficienventricularstng.

    Diagnost ic paracl inic radiografii scheletice, ecografie cardiac, aortografie,examene oculare.Prognost ic risc crescut de moarte subitprin ruptura peretelui aortic i risc demoarte prin insuficiencardiac.Tratament corectarea deficitelor de vedere, evitarea eforturilor fizice mari,medicaie-blocantpentru a reduce foracontracieicardiace.

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    53/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 53

    Pleiotropie nerelaional Nu exist corelaie patogenicmutaia

    genic efectele fenotipice; exemplu: sindromul Moon - Bardet B iedl :

    polidactilie obezitate, surditate, hipogonadism, retinit pigmentar retard mintal

    A.3. PLEIOTROPIA

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    54/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 54

    Interaciuni alelice;

    Interaciuni non-alelice;

    Interaciuni cu mediul.

    A.4. INTERACTIUNI GENICE

    A 4 AC G C

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    55/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 55

    Interaciuni alelice; Dominan-recesivitate.

    A1>0 sau B > 0

    A.4. INTERACTIUNI GENICE

    A1> 0

    Genotip Fenotip

    Antigen Anticorpi Grup

    sanguinA1A1

    A10A1 i anti-H A1

    00 H i 0

    A 4 INTERACTIUNI GENICE

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    56/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 56

    Interaciuni alelice; Codominan.

    A1 = B

    A.4. INTERACTIUNI GENICE

    A1= B

    Genotip Fenotip

    Antigen Anticorpi Grup sanguinA1A1 A1 i anti-H A1

    A1B A1i B anti-H A1B

    BB B i anti-H B

    A 4 INTERACTIUNI GENICE

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    57/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 57

    Interaciuni alelice; Semidominan.

    G > g

    A.4. INTERACTIUNI GENICE

    G > g

    Genotip Fenotip

    GG Gusttor Percepe gustul amar al feniltiocarbamidei la concentraii

    infimeGg Gusttor Percepe gustul amar al feniltiocarbamidei la concentraii

    mari

    gg Negusttor Percepe feniltiocarbamida ca o substaninsipid

    A 4 INTERACTIUNI GENICE

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    58/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 58

    Interaciuni non-alelice; epistazie.

    Expresia fenotipic a unei perechi de gene alelepoate fi influenatde aciunea altor perechi degene alele, care ocup loci diferii de pe acelaicromosom sau de pe cromosomi diferii;

    lanuri metabolice > enzime (gene diferite)

    caracter fenotipic: mutaia oricrei gene caracter anormal

    A.4. INTERACTIUNI GENICE

    A 4 INTERACTIUNI GENICE

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    59/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 59

    Interaciuni cu mediul

    Modificarea aciunii unor gene de ctrefactori de mediu. Expresivitate variabil

    Penetran incomplet

    A.4. INTERACTIUNI GENICE

    A 4 INTERACTIUNI GENICE

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    60/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 60

    Interaciuni cu mediul

    Expresivitate variabil manifestarea variabila aceleiaiboli la indivizi afectai

    din aceeaifamilie sau din familii diferite;

    expresivitatea variabilpoate interesa: spectrul de semne manifeste,

    severitatea afeciunii, vrsta de debut a bolii

    A.4. INTERACTIUNI GENICE

    EXPRESIVITATE VARIABIL ANTICIPAIE

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    61/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 61

    Boal HUNTINGTON

    EXPRESIVITATE VARIABIL -ANTICIPAIE

    mutaia genei huntingtinei amplificarea secveneI trinucleotidice CAG;

    > 40 repetiii boalamplificare n spermatogenez severitate + debut

    degradare cortical progresiv

    pierderea progresiv a controlului micrilor musculare, tulburri de vorbire,

    modificri comportamentale demen exitus

    PENETRAN INCOMPLET

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    62/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 62

    PENETRAN INCOMPLET

    Penetran - complet toi heterozigoii= bolnavi p =1;

    Penetran incomplet unii heterozigoi = sntoi p < 1

    Exemple de boli cu penetran incomplet:exostoza multipl p = 60%,

    otoscleroza p = 50%,

    retinoblastomul p= 80%

    osteogenesis imperfecta p = 90%.

    Penetrana - noiune cantitativevideniat n bolile dominante

    raportul nmulit cu 100 dintrenumrul de indivizi caremanifest boala i numrul depurttori ai genei mutante A

    100An+AA

    B=p

    A 5 ETEROGENITATEA GENETIC

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    63/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 63

    fenotipuri identice(asemntore) mutaiigenicediferite

    Tipuri: eterogenitate de locus sau nonalelic, eterogenitate alelic eterogenitate clinic;

    A.5. ETEROGENITATEA GENETIC

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    64/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 64

    Eterogenitatea delocus

    fenotipuri identice(asemntore)

    mutaii diferite ngene diferite

    A.5. ETEROGENITATEA

    GENETIC

    Boal Caracteristici clinice Loci

    Retinitpigmentar Retinopatie progresiv cu pierdereavederii

    20 de

    loci

    Osteogenesis

    imperfectaFracturi la traumatisme minore,

    surditate, sclere albastre7, 17

    Boala Charcot-

    Marie-ToothNeuropatieperiferic 1, 5, 8,

    11, 17,

    X

    Boala Alzheimer Demensenilprogresiv 1, 14,19, 21

    Melanomul familial Tumori maligne derivate dinmelanocite

    1, 9

    Hemofilia Tulburri de coagulare, sngerrimasive, hemoragii interne i

    intraarticulare

    X

    Cancerul colorectal

    nonpolipozic

    ereditar

    Cancer colorectal cu transmitere

    dominant autosomal2p, 2q,

    3, 7

    Cancer de sn

    dominant autosomalDebut precoce al cancerului de sn i

    ovarian13, 17

    Scleroza tuberoas Crize comiiale,angiofibroame faciale,macule tegumentare hipopigmentate,

    retard mental

    9, 16

    Boala polichistic

    renala adultuluiChiti diseminai n ambii rinichi

    insuficienerenale cronice4, 16

    A 5 ETEROGENITATEA GENETIC

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    65/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 65

    Eterogenitatea alelic mutaii genice diferite n aceeai gen boli

    diferite

    exemplu mutaiin gena distrofinei: Distrofia muscularDuchenne;

    Distrofia muscularBecker

    A.5. ETEROGENITATEA GENETIC

    DISTROFIA DUCHENNE DISTROFIA BECKER

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    66/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 66

    I nciden22/100.000 nou-nscuibiei; I nciden3,8/100.000biei;

    Transmitererecesiv legat de cromosomul X; Transmitererecesiv legat de cromosomul X;

    Genetic deleia genei distrofinei (localizat Xp21)

    determinabsenasintezei distrofinei

    Geneticmutaiagenei distrofinei determinsinteza

    unei proteine anormale;Patogenie absena distrofinei determin: leziuni

    membranare ale fibrei musculare ianomalii alejonciunii

    sinaptice; fibrele musculare sunt nlocuite cu esut

    conjunctiv;

    Patogenie prezena distrofinei anormale are efecte

    mai reduse asupra fibrei musculare dect absena

    completa proteinei;

    Diagnosticul cli nicsebazeazpe:

    -apariia de slbiciune muscular la nivelul membrelor

    inferioare, asociatcu probleme de mers (urcatul scrilor)igreutila ridicatul de pe scaun, ncepnd cu vrsta de 3

    ani;

    -paralizie a membrelor inferioare ncepnd cu vrsta de 10

    12 ani;

    -deces la 20 de ani prin insuficien respiratorie sau

    cardiac;

    Diagnosticul cli nic:

    -apariia tardiv (dup 20-25 de ani) a slbiciunii

    musculare la nivelul membrelor inferioare;-paralizia membrelor inferioare poate fi absent sau

    apare tardiv;

    -rareori decesul se produce prin insuficien

    respiratorie sau cardiac;

    Diagnostic paraclinicnivel crescut de 50-100 de ori alcreatininei serice, absena distrofinei n muchi,

    identificarea mutaiei prin tehnici de analiz a ADN-ului;

    Diagnostic paracli nic nivel crescut al creatinineiserice, prezena unei cantiti reduse de distrofin n

    muchi,identificarea mutaieiprin tehnici de analiza

    ADN-ului;

    Prognosticdeces la 20-25 de ani; Prognosticdeces la 50-60 de ani;

    Tratamentnu exist tratament. Tratamentnu exist tratament.

    A 5 ETEROGENITATEA GENETIC

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    67/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 67

    Eterogenitatea clinic mutaii genice diferite n aceeai gen

    manifestriclinice de severitate diferit

    exemplu mutaiin gena -L-iduronidazei: Sindrom Hurler;

    Sindrom Scheie

    A.5. ETEROGENITATEA GENETIC

    A 5 ETEROGENITATEA GENIC

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    68/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 68

    Importana fenomenului de eterogenitate

    Tratament de ex. hemofilia A i B(eterogenitate delocus) diagnostic terapie corect: Hemofilie A - tratament substitutiv cu factor de coagulare VIII; Hemofilie Btratament substitutiv cu factor de coagulare IX.

    Prognostic boli cu eterogenitate alelicsau clinic diagnostic corect estimare evoluie: distrofie muscular Duchenne deces la 20-25 ani; distrofie muscular Becker deces dup 50-60 ani.

    Sfat genetic boli cu eterogenitate de locus diagnostic

    corect calculare risc de recuren: forme dominant autosomale - risc 50%; forme recesiv autosomalrisc 25% forme recesive legate de Xrisc 25% (50% din bieibolnavi)

    A.5. ETEROGENITATEA GENIC

    B CONCEPTIA ACTUAL REFERITOARE LA FUNCTIA GENEI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    69/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 69

    B. CONCEPTIAACTUALREFERITOARE LA FUNCTIA GENEI1. Genele controleazsin teza pro teinelor

    2. Relaiao genprotein

    3. Complexitatea relaiei o gen oprotein

    4. Interaciunile gen ice n concepiaactual

    B 1 GENELE CONTROLEAZ SINTEZA PROTEINELOR

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    70/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 70

    B.1. GENELE CONTROLEAZ SINTEZA PROTEINELOR Genetica clasic:O genun caracter feno t ip ic

    Desc ifrarea ero ri lor nscutede metabo l ism :

    O geno proteinO genun po l ipept id

    Introducerea tehnic i lor de geneticmolecular:

    O genun produs funcional

    B 1 GENELE CONTROLEAZ SINTEZA PROTEINELOR

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    71/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 71

    B.1. GENELE CONTROLEAZ SINTEZA PROTEINELORGENA ESTE SEGMENTUL DE

    ADN CARE CONINE

    INFORMAIA GENETICNECESAR SINTEZEI UNUIPRODUS FUNCIONAL.

    Genele care codific proteine suntconsiderate gene structu rale

    B 2 RELAIA O GEN PROTEIN

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    72/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 72

    B.2. RELAIA O GEN PROTEINA fost descifrat pe baza studiuluiefectelor mutaiilor

    Exemplu: drepanoci toza (sicklemia,

    anem ia cu hematii n formde secer)

    B 2 RELAIA O GEN PROTEIN

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    73/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 73

    B.2. RELAIA O GEN PROTEINDREPANOCITOZA

    Transmitere recesiv autosomal.

    Incidena bolii - 1/4001/600de nou -nscui la populaiile originare din Africa,bazinul mediteranean, Orientul mijlociu iIndia.

    Incidena crescut avantaj select iv alheterozigoilor Na = imun itate natural lamalarie.

    B 2 RELAIA O GEN PROTEIN

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    74/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 74

    B.2. RELAIA O GEN PROTEINDREPANOCITOZA

    se manifest la homozigoiii aa

    anemie hemolitic sever.durer ila diverse n ivelu ri (mini, pic ioare,

    abdomen splin, mezenter, ficat, pancreas)micro infarcte obstrucia capilarelor.

    hemoliza cronicsp lenomegal ie pierdereafunciei imune a splinei suscept ib i l i tate lainfecii bacteriene cauza principal de deces.

    B 2 RELAIA O GEN PROTEIN

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    75/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 75

    B.2. RELAIA O GEN PROTEINDREPANOCITOZA

    Mecanism patogenic:

    1949 - Paulingn sicklemie hemoglobina S(migrareelectroforetic diferit de HbA).

    1956 - Ingram - HbS - catena a globinei (poziia 6)valin acid glutamic

    HbS afinitate N pt. O2n condiii normale de oxigenare n hipoxie(microcirculaia capilar) 50% afinitate

    O2 solubilitate Hb precipitarebastonaehematii n secer

    B 2 RELAIA O GEN PROTEIN

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    76/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 76

    B.2. RELAIA O GEN PROTEINDREPANOCITOZA

    Mecanism patogenic:

    Hematii n secer lezarea membranei eritrocitare

    (capilare) + blocarea microcirculaiei(microtrombusuri). Lezarea membranei distrugerea hematiilor anemie

    hemolitic microtrombozele dureri cronicen diverse organe

    1975 - secvenierea genei -globinei. sicklemie - mutaie punctiform = substituia adeninei cu

    timina codon 6 lan -globin GAGGTG acid glutamic valin

    B 2 RELAIA O GEN PROTEIN

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    77/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 77

    B.2. RELAIA O GEN PROTEINDREPANOCITOZA

    concluzi i : genele= secvene de nucleotide informaia genetic

    pentru asamblarea specific a aminoacizilor. Mutaiile geniceschimbarea secvenei de nucleotide

    sinteza de proteine anormale boal molecular gena are trei categorii de efecte: efectul primarla nivel molecularn sicklemie substituia

    acidului glutamic cu valina n poziia 6 a -globinei, cu apariiaHbS;

    efectul secundarla nivel celularn sicklemie modificarea

    formei hematiei (din disc biconcav n secer) efectul teriarla nivel de organ sau organism (semne i

    simptome)n sicklemie: anemie hemolitic cronic, dureri detip infarctic, infecii recurente.

    B 3 COMPLEXITATEA RELAIEI O GEN O POLIPEPTID

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    78/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 78

    B.3. COMPLEXITATEA RELAIEI O GEN O POLIPEPTID Relaia o gen mai multe polipeptide

    st ructura d iscont inua genei (exon i + intron i) preARNm matisare difereniat peptide

    diferi te.exemplu: matisarea difereniat a preARNmgenei calc i ton inei:

    tiroid matisare exoni 2 + 3 + 4 calcitonin; hipotalamusmatisare exoni 2 + 3 + 5 CGRP

    (calcitonin gene-related peptide)

    rearanjarea exonilor unei gene pro teine cu

    funcii noi

    B 3 COMPLEXITATEA RELAIEI O GEN O POLIPEPTID

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    79/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 79

    B.3. COMPLEXITATEA RELAIEI O GEN O POLIPEPTID Relaia > gene o protein

    proteine po l icatenare = fiecare lan peptidic informaa genetic> gene d ifer i te.exemplu: hemoglobina = 2 lanuri + 2 lanuri + 4

    grupri hem: Lan gena cromosom 16; Lan gena cromosom 11.

    exemplu: im unog lobul ine = 2 lanuri H + 2 lanuri L: Lan H familia genelor lanului H cromosom 14q32237 de

    alele pt. 4 domenii proteice; Lan L 2 familii de gene L:

    Cromosomul 2p13106 alele pentru 3 domenii ale lanului L; Cromosomul 22q11106 alele pentru 3 domenii ale lanului L

    EXCEPII DE LA REGULA O GEN O PROTEIN

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    80/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 80

    O GEN UN PRODUSFUNCIONAL

    UNITATE TRANSCRIPIONAL IDE MUTAIE

    > tipuri de ARNm sintetizate princlivarea unitii transcripionale

    FOLOSIREA DE PROMOTORIALTERNATIVI

    ISOFORME(distrofine diferite n creier, cerebel imuchi

    CLIVAJ POSTRANSLAIONAL

    POLIPEPTIDE NRUDITEFUNCIONAL

    MATISARE ALTERNATIV

    calcitonin/ CRP

    POLIADENILARE ALTERNATIV

    TRANSLAII REPETATEALE ACELEIAI

    MOLECULE DE ARNm

    B 4 INTERACTIUNILE GENICE N CONCEPTIA ACTUALA

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    81/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 81

    B.4. INTERACTIUNILE GENICE N CONCEPTIA ACTUALAInteraciuni alelice

    la nivel molecular toate genele sunt

    manifeste feno t ip ic.

    mutaiile genice pot genera mai multecatego ri i de aciuni:

    gene amorfe;

    gene hipom orfe;

    gene izom orfe

    B.4. INTERACTIUNILE GENICE N CONCEPTIA ACTUALA

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    82/83

    1/6/2012 Genetica Medicala Iasi 82

    B.4. INTERACTIUNILE GENICE N CONCEPTIA ACTUALAInteraciuni nealelice

    epistaziaeste rezultatul aciuniiseriate a maimultor enzime, codif icate de gene difer i te, lanive lu l unui lanm etabol ic.

    exemplu: sinteza ant igenelor AB0 estecondiionatde interveniaa 3 enzime: H-secretaza transformsubstanap recursoare nantigen H; n absenaH-sec retazei substanaprecursoare rmne

    nemodificatabsenaantigenelor A-transferaza transformant igenu l H n an tig en A ; B-transferaza transformant igenu l H n an tig en B ;

    n absenaA -transferazei sau B-transferazei antigenul Hrmnenemod i f icat ;

    FUNCIA GENEI

  • 5/26/2018 Curs 3 Stomato

    83/83

    TEORIA CLASIC

    BOAL GEN

    O GEN UN CARACTEREXCEPII

    MAI MULTE GENE UNCARACTER

    POLIGENIE

    O GEN MAI MULTECARACTERE

    PLEIOTROPIE RELAIONAL NERELAIONAL

    TEORIA ACTUAL

    GEN BOAL

    O GEN UN PRODUS FUNCIONAL PROTEIN ARN

    SECVEN SECVENNUCLEOTIDIC DE AMINOACIZI

    MODIFICAREA SECVENEI NUCLEOTIDICE

    MODIFICAREA SECVENEI DE AMINOACIZI(EFECT PRIMAR)

    PROTEIN ANORMAL

    (EFECT SECUNDAR)

    ANOMALII ORGANICE SAU ALE ORGANISMULUI(EFECT TERIAR)

    EXEMPLU: SICKLEMIA