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防疫資訊與 Open Data之雲端應用發展
簡報人:莊人祥 (疾管署副署長)
日 期:2015 年 6 月 3 日
多元入口、單一出口
跨系統、跨機關、跨域資訊蒐集
疫情即時揭露,全民共同防疫
疫情統計開放全民查詢,揭露速度較各國優先
化被動為主動,防疫資源在地化
提供地方政府資料集,地方與中央協同作戰效率
打造高效防疫平台
跨域資訊加值,提供機關機器自動對接環境
防疫資訊與 Open Data之雲端應用發展
資料倉儲伺服器
傳染病個案通報系統
衛福部及健保署資料交換
明細資料
統計
彙總資料
CDC防疫資訊系統架構示意
資料擷取轉換下載伺服器 查詢,報表
分析工具
即時疫情監視及預警系統
TB / HIV
追蹤管理系統
院內感染監視管理資訊系統
人口密集機構傳染病監視作
業系統
實驗室自動通報系統
.
.
.
.
.
傳染病統計資料查詢系統
地理資訊系統
SAS分析平台
全國性預防接種資訊管理系
統
AP(.NET) DB(DOT/DOPT)
DB(Epi.Index)
AP
DB(Tuberculosis)
Firewall
Web
service
XML
Firewall
STOP TB
AP(.NET) DB(DOT/DOPT)
DB(Epi.Index)
AP
DB(Tuberculosis)
Firewall
Web
service
XML
Firewall
STOP TB
跨域介接出口
即時疫情監視及預警系統 (RODS 監測系統)
建置目的及價值:
掌握重點監測疾病流行波動變化。
可早期且快速分析各類疾病或症候群之異常情形。
因應特殊疫情狀況可配合調整相對應之疾病診斷碼,
達到防疫監測目的。
資料來源:
全台約170家以上責任醫院每日即時傳送急診病患就
診資料。
常規監測項目:
腸病毒、類流感、腹瀉、紅眼症。
疾病管制署端系統
疾病管制署應用系統
近期跨機關合作案實例 健保資料 ( 健保署 ):
為掌握腸病毒、類流感、急性腹瀉及猩紅熱健保門住診就醫長期趨勢,與健
保署合作將每日就醫歷史統計資料,由2008年往前推移至2005年,並已順利
導入本署倉儲系統。
最小統計區加值應用案 ( 中研院 ):
本署與中央研究院人文社會科學研究中心,合作辦理傳染病於最小統計區之
加值、應用機制及Open Data空間儲存及整合應用案。本案將常規自動轉譯
傳染病地理資訊,藉由最小統計區分級資訊,提升資料應用廣度,並於國網
中心完成上架,供後續應用程式開發(API)介面、指標加值釋出或研究分析使
用。
食物中毒通報資料雙向介接 ( 食藥署 ) :
配合本署食物中毒通報方式,由法傳系統轉移至症狀通報系統,有關現
行與食藥署系統雙向介接檢驗結果部分,已進行系統資料來源轉換及程
式改寫,並於5/25下班後正式上線。
死亡資料勾稽 ( 主動監測及加值 )
緣由:美國122城市肺炎&流感死亡監測系統
資料來源:死亡通報網路系統
即時性:醫療機構應於七日內以網路通報
代表性:~ 80 %
死亡原因:中文文字(醫師自由書寫)共4欄
肺炎及流感死亡即時監測
關鍵字搜尋(肺炎、流感、感冒)
撰寫簡易規則研判主要死因
資料處理及分析:巨量分析平台
監測結果訊息公開
防疫雲發展計畫
電子病歷進行傳染病通報:
早期偵測流行疫情,減少通報人員負擔,避免重複登錄錯誤。
交換檢核邏輯比照現行法傳通報系統,自動通報之效力與現行網站通報相同。
醫院依本署現行法傳通報系統之通報單、疾病附加資訊、疾病送驗單等欄位資訊,製作標準交換格式,採GREEN CDA之XML格式,以web service https方式加密傳送至本署。
實驗室傳染病自動通報:
早期偵測流行疫情及公共衛生突發事件,規劃推動實驗室傳染病自動通報標準交換格式(LOINC),以快速掌握病原體檢驗結果的趨勢變化,提供疫情爆發或流行參考。
以本署公告之防疫資訊交換中心規範之格式與標準進行傳送,批次自動從醫院端將下列資料傳送至本署指定伺服器。
2015年各9家
2014年各20家
2013年啟動
傳染病統計資料查詢系統
提供一般民眾、學術界、醫療服務業及公共衛生部門能以最簡便、直捷的線上查詢方式,獲得所需之最新(前一日)確診台灣法定傳染病統計流行資訊
法定傳染病通報系統資料
傳染病統計資料查詢系統
資料倉儲系統
醫院急診監測資料
健保門診住診資料
傳染病開放資料
感控通報
防疫資料交換
防疫資料交換去識別
傳染病統計資料查詢系統
近70種傳染病的流行趨勢、統計圖表、地理分布等視覺化資訊
呈現流行季重要傳染病波動情形,包括如流感、腹瀉、腸病毒、登革熱等及病毒型別資訊
http://nidss.cdc.gov.tw
http://nidss.cdc.gov.tw/
傳染病統計資料查詢系統
法定傳染病監測
傳染病統計資料查詢系統
急診傳染病監測
傳染病統計資料查詢系統
健保門診與住診監測
協同防疫與行動裝置於疫情管理之應用 中央及地方協同防疫:
為強化中央及地方協同合作機制,推動地方介接倉儲系統法定傳染病及結核
病追蹤管理資料庫,截至6/1已有7縣市介接成功(台北市、新北市、台中市、
高雄市、彰化縣、宜蘭縣、基隆市)、2縣市完成申請,刻正辦理介接(桃園
市、台南市)。
以行動裝置輔助結核病追蹤管理:
6/1起開放各縣市結核病關懷員,以行動裝置進行都治日誌登錄作業,本次
開放不論行動裝置、筆電或桌機均可適用,預期可紓解系統週一之尖峰負荷。
關懷員並可於執行都治任務後,隨即完成日誌登錄及上傳,無需累積至週一
進行,並減少往返管理單位之時間浪費。
縣市協同防疫:資料拋轉介接、譯碼管理
機敏防疫資料使用原則
人員所屬機關 現行權限 研究情境/使用資料庫 使用原則
通則無論研究者是否具備對應之業務權責權限。
凡應用本署防疫資料庫之研究案
1. 研究所需資料如涉個資或資料庫勾稽事宜,必須於送交倫理委員會計畫書中明列,並敘明使用之資料表及欄位理由。
2. 凡研究資料涉及個資者,除應提交倫理委員會通過外,各單位亦應由專人造冊管制。
3. 研究人員完成計畫後,應將研究資料檔於倉儲歸檔,以供查核使用。
署外 無權限本署對外公開防疫資料庫(15項)
1. 使用者依本署防疫資料庫使用程序提出申請。
2. 如超過署對外公開防疫資料庫欄位者,需專簽核示同意後,於本署獨立作業區進行操作,落實資料使用者與資料保管者分開。
署外 無權限除本署對外公開防疫資料庫(15項),並需同步勾稽本署以外機關資料庫
向本署提出申請,經簽核同意後,本署將相關欄位勾稽並由統計處執行加密後(檔案不經由使用者自行傳遞),再由授權使用者於本部協作中心操作中心操作分析。
開放資料
於政府資料開放平臺開放多達162個資料集,包含近70種傳染病統計資料、急診監測、健保門住診、國際疫情及國際旅遊疫情等級建議等資料,目前瀏覽人次近4.5萬,下載次數超過6千次
http://data.gov.tw/taxonomy/term/513
疾管署雲端平台
達成本署、地方及醫院間協同防疫作戰
Office 2013
Power BI
Data Office 2013
Power BI
Data
使用Office 2013及Power BI
製作各式監測報表
疾管署雲端平台架構
Cloud Portal
Monitor
Monitor DB
NIDSS DB
Web Site
Azure SQL
SharePoint
Online
Power BI
SQL Connection
Microsoft Azure
提供虛擬機、Web應用程式、SQL資料庫…等PaaS服務
Office 365
提供Outlook、SharePoint Online、Office Online…等SaaS服務
每日晨會疫情智慧面板
使用Office 2013及Power BI製作每日傳染病監測面板
傳染病監測面板
使用Office 2013及Power BI製作法定傳染病、急診監測與健保門住診監測面板
行動化疫情監測
使用SAS VA(圖形化分析平台)及行動裝置進行傳染病監測
總結
大數據@防疫
決策零時差
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防疫資訊與 Open Data之雲端應用發展