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Edaphobase - Online-Informationssystem zu Taxonomie und Ökologie von Bodenorganismen
Dr. Ulrich Burkhardt, Senckenberg Museum Görlitz
U. Burkhardt, SMNG Edaphobase Online-Informationssystem Bodentiere ZIB Herbsttagung Berlin14.-16.10.2013
� Für die meisten Bodentier-Arten kaum Werte bekannt für:
• ökologische Toleranzen
• Habitatpräferenzen
• Zoogeographische Verbreitung
• Arealverschiebung (Klimawandel und climate envelopes)
• Phylogeographie
� Vergleichswerte nicht vorhanden
� Recherchen nur mit großem Aufwand möglich
Bodenzoologie: große Defizite bzgl. Datenverfügbarkeit
Edaphobase: noch eine Biodiversitätsdatenbank ?!
U. Burkhardt, SMNG Edaphobase Online-Informationssystem Bodentiere ZIB Herbsttagung Berlin14.-16.10.2013
���� Bodentiere (kaum) aufgenommen in:
•Bundes-Bodenschutzgesetz 1998
•Nationale Biodiversitätsstrategie
•European Soil Protection Framework
•Monitoringprogramme (FFH, BDF)
Konsequenz der unzureichenden Datenverfügbarkeit
Edaphobase: noch eine Biodiversitätsdatenbank ?!
U. Burkhardt, SMNG Edaphobase Online-Informationssystem Bodentiere ZIB Herbsttagung Berlin14.-16.10.2013
Gegenwärtige Daten-Situation:
� Zerstreut in Literatur, unveröffentlichte Berichte, nur in AG…
� Genaue Projektdaten z. T. nicht aufbewahrt
� Daten nur punktuell verfügbar
� meiste Daten stehen nicht (mehr) zur Verfügung
Bodenzoologische Forschung in Deutschland:
� intensiv seit mindestens 50-60 Jahren
� mehrere bodenzoologische Arbeitsgruppen
� Vielzahl an Tiergruppen und Regionen bearbeitet
� Unmengen an Daten erhoben
U. Burkhardt, SMNG Edaphobase Online-Informationssystem Bodentiere ZIB Herbsttagung Berlin14.-16.10.2013
Durch Verknüpfung von:
� bodenzoologischen Daten
&
� Fundort- + Habitatdaten
Geographische KoordinatenBiotoptypBodenwerte
(z.B. pH, Humusform, [C], [N] usw.)
Ziele von Edaphobase:
Aufhebung der unzureichenden DatenverfügbarkeitErhöhung des Informationsgehalts
U. Burkhardt, SMNG Edaphobase Online-Informationssystem Bodentiere ZIB Herbsttagung Berlin14.-16.10.2013
Verknüpfung aller Daten für Deutschlandaus:
� Literatur� Sammlungen� Projekten� Berichten � „Grauer Literatur“
Datenerfassung
notwendig = große Datenbasis
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� Nematoda
Edaphobase Überblick: Bearbeitete Taxa
� Lumbricidae
� Collembola
� Oribatida
� Gamasina
� Enchytraeidae
� Diplopoda
� Chilopoda
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• Allgemeine Information
• Vegetation
• Wetter/ Klima
• Boden
Quelle
Beobachtung
Aufsammlungsbeschreibung Taxonbeschreibung
Taxon
Fundortbeschreibung
Fundort
• Sammelmethode
• Extraktionsmethode
• diverse Details
• Quantitäten
• Morphologie
• Biologie
Literatur Sammlungen
• Name
• Systematik
• Synonyme
• Name
• Koordinaten
• Region
Projektdaten
Metadaten
• Person (Author, …)
• Jahr
• Titel/ Name/ Nummer
Edaphobase: Vereinfachtes Datenmodell
U. Burkhardt EB2-Workshop Nutzerstudien – Edaphobase-Funktionalitäten 09.10.2013
Das Informationssystem – 198 Parameter
• 28x Aufsammeln• 1x Allgemein• 19x Sammeln• 8x Extraktion
• 79x Fundort • 14x Allgemein• 27x Boden• 10x Vegetation• 14x Wetter• 14x Klima
• 67x Objekt• 5x Allgemein
• 13x Quantität
• 10x Präparat
• 13x Biologie
• 25x Morphologie
• 3x Labor
• 10x Bestimmung
• 12x Quellspezifika
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EAV-Konzept für einfache Parameter-Ergänzung
Körperlänge Antennenlänge Beinzahl Segmentzahl
2.2 0.84
1.7 0.87
11 65
20 51
27.2 124
29.3 129
ID Entity Attribute Value
1 Morphology Body length 2.2
1 Morphology Antenna length 0.84
2 Morphology Body length 1.7
2 Morphology Antenna length 0.87
3 Morphology Body length 11
„Klassisches“ Modell(oben)
EAV-Konzept (rechts)
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− Quelle (Referenz, Autoren, Aufbewahrungsort)− Fundort (wiederfindbar, Unschärfebereich)− Funddatum (mindestens jahrgenau)− Beprobungstechniken (Fang, Extraktion, Bestimmung, Lagerung, Beprobungsziel, Probenumfang)− Artname− Individuenzahl
Der minimale Datensatz: wer, was, wo, wann, wie
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Client(Dateneingabe)
Portal(Datenabfrage)
Edaphobase Überblick
http://portal.edaphobase.org
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Überblick: Datenmodule
• „Personen“ i. w. S.• Georeferenzen• Quelldaten:
• Literaturdaten
• Daten aus Sammlung & Proben
• Rohdaten
• Taxonomie
• Abfragemodul
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Auswahllisten – Personen, Institute, Projekte,…
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Georeferenzierung: Ortssuche
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Georeferenzierung: Fundpunkterstellung
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Auswahllisten - Taxonomiebäume
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Auswahllisten - Schnellauswahl
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Auswahllisten - Synonyme
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Auswahllisten - Attributverknüpfung
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Dropdown-Menüs - Auswahllisten
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Edaphobase Datenbestand
460.000 Datensätze (Okt. 2013)
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Auswahllisten im Ausgabeportal
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Elemente der Datenqualität
Zum Filtern der Datensätze vor Auswertung
• Beprobungsziel (Scope)
• Beprobungshäufigkeit (Einzelprobe/Jahresmittel?)
• Vorhandensein von Metadaten
• Bestimmungsqualität und Nachprüfbarkeit (Belege)
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Freitext und Standardisierung
Originaltext in Anmerkungsfeldern abrufbar
Standardisierung in Auswahlfeldern:
− KA5 der AG Boden 2005 (Bodendaten)
− ISO 23611 (Probenahme)
− Riecken et al. 2003 (Biotoptypenliste)
− Meyen et al. 1953-62 (Naturräumliche Gliederung)
− weitere, speziell für Edaphobase erstellte Listen
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Datenrechte: gestaffelte Ausgabe
• Anonyme Nutzer (nur Fundpunktraster, Tabelle gesperrt)
•Registrierte Nutzer (Tabellenzugriff, Fundpunkte)
•Detaillierte Dateneinsicht nur nach Rücksprache mit
Tiergruppenverantwortlichem
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Nächste Schritte
• Modularisierung: EDIT (Taxonomie), BExIS (Rohdaten)
• Einbindung externer Daten: DWD (Klima), UBA (Boden), BfN
(Landnutzung)
• Modellierung (species response curves, Referenzwerte)
• Thematisches Netzwerk Bodentiere (GBIF-D)
• Anpassung an Nutzerbedarf (Anwenderstudien, Live-System,
Import-/Exportmodule)
Vielen Dank für Ihre Aufmerksamkeit !
FKZ 01LI1301A
www.edaphobase.org