Estructura secundaria

• Las estructuras secundarias son uniones de cadenas polipeptidicas que se pueden plegar en estructuras regulares.

• En 1951 Linus Pauling y Robert Corey propusieron las siguientes estructuras periódicas:

• Hélice alfa• Hoja beta• Giro beta• Bucle omega

• Estas estructuras están debidas a una forma regular de los puentes hidrogeno entre los grupos NH2 y COOH de los aminoácidos próximos.

Hélices alfa

• Es una estructura en forma de cilindro, se estabiliza por puentes de hidrogeno entre los grupos NH2 y COOH de la cadena principal, salvo los aminoácidos cercanos al final de una hélice alfa.

• El sentido de giro de una hélice puede ser dextrógiro(en sentido a las agujas del reloj) o levógiro (en sentido contrario).

• Las hélices dextrógiras son las mas favorables energéticamente porque hay menos choques estéricos entre las cadenas y el esqueleto.

• El contenido de hélices alfa en proteínas oscila entre el 25 y 100%.

Hojas beta

• Esta formada por 2 o mas cadenas polipeptidicas, llamadas hebras beta, son extendidas unidas por puentes de hidrogeno.

• La cadenas laterales de aminoácidos contiguos apuntan en direcciones opuestas.

• Las cadenas adyacentes pueden ser anti paralela o paralela.• En el ordenamiento paralelo, el esquema de puentes de

hidrogeno es ligeramente mas complicado por la posición de los grupos NH2 y COOH.

• En diagramas esquemáticos, las hebras beta se representan por flechas apuntando hacia el COOH terminal.

Giros beta y bucles omega

• La mayor parte de las proteínas tienen formas que requieren cambios en la dirección de sus cadenas polipeptidicas.

• Este cambio se debe al elemento estructural llamado giro inverso o giro beta.

• Estructuras mas elaboradas son responsables para las inversiones de la cadena que son los bucles omega.

• Los bucles no tienen estructuras periódicas regulares, son a menudo rígidas y bien definidas.

• Giro beta Bucle omega