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1 GaussView Gaussian の基本的な使い方 Gaussian のインプットファイルは gjf という拡張子を持ち、テキストで書かれた以下のような ファイルである。 一行目には chk ポイントファイルの場所や名前の指定、 2 行目には計算方法や基底関数、求めた いプロパティに関する記述、 6 行目の 0 1 の数字は電荷やスピン多重度、そして各原子の xyz 標の情報(デフォルトではÅ単位)で記述されている。(最後の数値はなくてもよい) これらのインプットを自分で文字を用いて作成するのは、少しわかりにくい。そこで Gaussview というプログラムで、視覚的にインプットファイルを作成し、Gaussian のプログラムを流す機 能を利用する。計算で得られるアウトプットファイルは、 chk ファイルと log ファイルという拡 張子を持つ。chk には分子軌道の情報(基底関数や分子軌道係数など)が含まれており、log ファ イルにはその他の多くの計算結果や情報が含まれている。 Gaussview プログラムでは、chk ファイルを読み込むことで、分子軌道を簡単に可視化するこ とができる。また log ファイルを読み込むことで、いくつかの重要なデータを視覚的に表示する ことができ便利である。

GaussView とGaussian の基本的な使い方 · 1 . GaussView. と. Gaussian の基本的な使い方. Gaussian. のインプットファイルはgjf という拡張子を持ち、テキストで書かれた以下のような

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    GaussView Gaussian Gaussian gjf

    chk 2 6 0 1 xyz ()() GaussviewGaussian chk log chk ()log Gaussview chk log

  • 2

    (H2O) GaussView Gaussian(Windows ) GaussView 6C

    Atom ()

  • 3

    Ctrl+z Shift

  • 4

    HO 2

    Gaussian Calculate Gaussian Calculation Setup

    Job Type Opt+Freq (Optimization

  • 5

    Method ()Keywords Submit...

    Gaussian Save

  • 6

    Gaussian HF/6-31G h2o_hf_6-31g.gjf / Save

    OK

    Gaussian

  • 7

    h2o_hf_6-31g.gjf Gaussian .log OK

    Read Intermediate Geometries

    File Open Gaussian Output Files h2o_hf_6-31g.gjfH2O_HF_6-31G.LOG

  • 8

    Read Intermediate Geometries 1 ( 11 )

    (11 )ResultsSummary...[a.u.][Debye]

  • 9

    11

    (HOH)

  • 10

    (log ) Read Intermediate geometries log ResultsOptimization step Export.jpg

    (log ) ResultsVibrations...Spectrum

  • 11

    (log ) ResultsView File Thermochemistry

  • 12

    atomic charge[Debye](chk ) ResultsCharge Distribution..Atomic Charge Show Numbers Dipole Moment Show Vector

  • 13

    (chk ) linux fchk .chkh2o_hf_6-31g.gjfh2o_hf_6-31g.chk

    chk EditMOs

    Hartree

  • 14

    Visualize 17 Add List:1a-7aUpdate...

    ViewDisplay Format...

  • 15

    Surface Format: Mesh

    FileSave Image File.jpg White Background

  • 16

    Diagram Save Data

  • 17

    NMR log log Keywords log Ctrl+C

    FileNewCreate Molecule Group

  • 18

    CalculateGaussian Calculation Setup...Job Type NMR MethodSubmit...

    log ResultsNMR...NMR Export .jpg

  • 19

    H2O+

    H2O+Charge 1

  • 20

    TDDFT C2v H2O hf/6-31g Gaussian 2 HO TDDFTCalculateGaussian Calculation Setup...Job Type Energy Method Keywords submit log ResultsVIS-UV...ResultsView File f

  • 21

    log C2v

    0 ()(xyz )( A1 0

    C2v E C2 v v A1 1 1 1 1 z A2 1 1 -1 -1 B1 1 -1 1 -1 x B2 1 -1 -1 1 y

  • 22

    R(O-H) 0.958 A(H-O-H) 104.45 1.87 Debye 1597, 3657, 3756 cm-1 12.62 eV

    365 nm 466 nm 500 nm Purple 380~430 Yellow-Green 560~580

    Blue 430~360 Yellow 580~590Blue-Green 460~500 Orange 590~610

    Green 500~560 Red 610~780

    nm