kutatok.orgkutatok.org/abettt/wp-content/uploads/2016/10/tantargyleirasok.pdf · Ismeretkörök/tantárgyi programok, tantárgyleírások Az ismeretkör: Általános természettudományi

Ismeretkörök/tantárgyi programok, tantárgyleírások

Az ismeretkör: Általános természettudományi ismeretek

Kredittartománya(max. 12 kr.): 6 kr

Tantárgyai: 1) Biometria, biostatisztika, kísérlettervezés

2) Differenciálegyenletek

3) Bioinformatika

(1.) Tantárgy neve: Biometria, biostatisztika, kísérlettervezés Kreditértéke: 2

A tantárgy besorolása: kötelező

A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”: 70% (kredit%)

A tanóra típusa: gyak. és óraszáma: 28 az adott félévben,

(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: )

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: témabeszámolószakirodalom alapján

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): gyj.

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: félév során önálló feladatokmegoldása

A tantárgy tantervi helye (hányadik félév): 1. tavaszi

Előtanulmányi feltételek: -

Tantárgy-leírás: az elsajátítandó ismeretanyag tömör, ugyanakkor informáló leírása

A tantárgy célja megtanítani a biológiai rendszerekből származó mérési adatok matematikai statisztikai kezelésének alapjait és legfontosabb módszereit, valamint megismertetni a kísérlettervezés módszertanát.

Az előadás fő témakörei:

Varianciaanalízis (ANOVA)

- egy faktor szerinti osztályozás, páronkénti összehasonlítások (kontrasztok)- több faktor szerinti osztályozás: keresztosztályozás és hierarchikus osztályozás, rögzített és

véletlen faktorok- az elemzés feltételei és ellenőrzésük

Nemparaméretes módszerek

- rangokon alapuló statisztikai próbák (Mann-Whitney próba, Wilcoxon próba, Kruskal-Wallis próba)

- rangkorreláció- binomiális eloszláson alapuló próbák- 2*2 táblák elemzése

1

Kísérlettervezés

- 2p típusú teljes faktoros tervek és részfaktortervek- másodfokú tervek, kompozíciós tervek

A 2-5 legfontosabb kötelező, illetve ajánlott irodalom (jegyzet, tankönyv) felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN)

Kemény Sándor, Deák András, Lakné Komka Kinga, Kunovszki Péter: Kísérletek tervezése és értékelése, Typotex, Budapest, 2017 (ISBN: 978-963-2799-12-4)

Vargha András: Matematikai statisztika – Pszichológiai, nyelvészeti és biológiai alkalmazásokkal, PólyaKiadó, Budapest, 2015 (ISBN 9789638580955)

Azoknak az előírt szakmai kompetenciáknak, kompetencia-elemeknek (tudás, képesség stb., KKK 8.pont) a felsorolása, amelyek kialakításához a tantárgy jellemzően, érdemben hozzájárul

a) tudása

- átfogó ismeretek megszerzése a biológiai természetű adatok statisztikai kezelésében, valamint a gyakran használt módszerek alkalmazásában és azok korlátaiban

b) képességei

- képes a konkrét kutatási vagy ipari feladatnak megfelelő kísérleti tervet készíteni, majd a kiértékelésére alkalmas módszert megválasztani és szakmailag helyesen alkalmazni

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Lakné Dr. Komka Kinga egyetemi adjunktus,PhD.

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. fokozat):

Dr. Kemény Sándor, professor emeritus, DSc

(2.) Tantárgy neve: Differenciálegyenletek Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”: 70%(kredit%)

A tanóra típusa: ea. / szem. / gyak. / konz.és óraszáma: 28gyak. az adott félévben,

(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: …………………)

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: egyéni feladatok,esettanulmányok

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): gyj,

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok:

A tantárgy tantervi helye (hányadik félév): 1. őszi

Előtanulmányi feltételek (ha vannak):


A tantárgy célja megismertetni a hallgatókat a differenciálegyenletek elméletével és gyakorlatával. A

2

tantárgy a(z elsősorban: közönséges) differenciálegyenletek témakörének azokat a fogalmait és módszereit oktatja, amelyek a biotechnológus képzés számára a legfontosabbak. A tárgy számos alkalommal mutat rá a matematikai modellalkotás fogalmi tisztasága, a mérnöki intuíció, és a számítógépi gyakorlat közötti kapcsolatok fontosságára és természetes voltára. A tárgyra jellemző, hogy a standard anyagon belül nagyszámú alkalmazás bemutatására kerül sor, így a tárgy előkészíti a biokémia (enzimkinetika, fermentációk, anyagcserefolyamatok, farmakokinetika) és biológia modelljeinek tárgyalását. Az előadások és egyéni feladatok során a hallgatók elsajátítják a téma ismereteit.


Tóth J., Simon L. P.: Differenciálegyenletek. Bevezetés az elméletbe és alkalmazásaiba, TYPOTEX Könyvkiadó, Budapest, 2005.Farkas, M.: Dynamical models in biology (Academic Press, 2001)Kythe, P. K., Puri, P., Schaferkoffer, M. R.: Partial differential equations and Mathematica, CRC Press, Boca Raton etc. 1995.

Azoknak az előírt szakmai kompetenciáknak, kompetencia-elemeknek(tudás, képesség stb., KKK 8.pont) a felsorolása, amelyek kialakításához a tantárgy jellemzően, érdemben hozzájárul

a) tudása-Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges alkalmazott matematika ismeretekkel- Átfogó ismeretek megszerzése az adott területen, tájékozottság a fejlődési lehetőségekről és irányokról, a korábbi ismerek integrálása az interdiszciplináris szakmai tárgykörökbe

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Karátson János egyetemi tanár,DSc

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak) (név, beosztás, tud. fokozat):

(3.) Tantárgy neve: Bioinformatika Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”70% (kredit%)

A tanóra típusa: gyak. és óraszáma: 28 az adott félévben(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: angolAz adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Tömbösítettgyakorlat számítógépteremben (1 hét)

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): gyjAz ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: Értékelés az önállóan használt módszerekés azok által kapott eredmények értelmezését leírását tartalmazó beszámoló alapján


Előtanulmányi feltételek:


Alapvető bioinformatika adatbázisok és módszerek ismerete, használata, és a kinyerhető információk értelmezése: Gén és fehérje adatbázisok, Szekvencia illesztés és keresés, Evolúciós vizsgálatok, Motívumkeresés, Fehérje térszerkezeti adatbázisok, Szerkezetek megjelenítése,

3

Térszerkezeti predikciók, dokkolás, Fehérje tervezés, Fehérje-fehérje kölcsönhatási adatbázisok, Fehérje domének és fehérje rendezetlenség. Moduláris fehérjék felépítése, fehérje módosítások, Betegséghez köthető variációkra vonatkozó adatok és azok értelmezése


– A gyakorlatok anyaga elérhető pdf formátumban a bevezető előadások anyagával együtt.

Azoknak az előírt szakmai kompetenciáknak, kompetencia-elemeknek(tudás, képesség stb.,KKK 8. pont) a felsorolása, amelyek kialakításához a tantárgy jellemzően, érdembenhozzájárul

a) tudása- Ismeri a biotechnológia műveléséhez szükséges alapvető bioinformatikai eszközöket, adatbázisokat és koncepciókat

b) képességei- Képes egy adott vagy adott génhez tartozó adatok kinyerésére különböző adatbázisokból- Képes különböző bioinformatikai eszközök megfelelő használatára- Képes a bioinformatikai eszközökkel kapott eredmények kritikus kiértékelésére

c) attitűdje- Törekszik a fenti ismeretek birtokában kutatási témák felvetésére, kivitelezésére

d) autonómiája és felelőssége- Önállóan munkvégzésre képes a bioinformatikai eszközök felhasználása terén

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Nyitray László, egyetemi tanár, DSc


Dosztányi Zsuzsanna, tudományos főmunkatárs, PhD

Ari Eszter, egyetemi tanársegéd, PhD

4

Az ismeretkör: Bölcsészettudományi, társadalomtudományi, jogi ésközgazdaságtudományi ismeretek

Kredittartománya (max. 12 kr.):5 kr

Tantárgyai: 1) K+F és laboratóriumi management, 2) Vállalatgazdaságtan,

3) Bioetika, biobiztonság

(1.) Tantárgy neve: K+F és laboratóriumi management Kreditértéke: 2



A tanóra típusa: ea. és óraszáma: 28 az adott félévben,


A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): koll.

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok:


Előtanulmányi feltételek : -


A tantárgy célja, hogy a hallgatók megismerkedjenek az orvosi (piros) biotechnológia fő folyamataival,gyógyszerek fejlesztésének lépéseivel. A gyógyszeripar mindennapi minőségügyi kihívásairól,feladatairól, elvárásairól szerezzenek szerteágazó, és az összefüggésekre fókuszáló ismereteket. Kiemeltcélja a GMP-látásmód és készségek átadása (a törvények száraz ismertetése helyett), ilyen téren azönálló fejlődőképesség megalapozása gyakorlati kérdések alapján. A tantárgy további célja, hogy ahallgatók képet kapjanak az iparág speciális elvárásairól és felkészítse őket biotech vállalatoknál valóelhelyezkedésre, illetve biotech vállalkozások indítására.


1. Weise, M., Bielsky M-C., De Smet K., Ehmann F., Ekman, N., Narayanan G., Heim, H-K., Heinonen E., Ho K., Trope, R., Vleminckx c., Wadhwa M., Schneider C. K., (2011): Biosimilars– why terminolgy matters. Nature biotechnology, (29) 690-693, (DOI: doi:10.1038/nbt.1936

2. Jameel F., Hershenson S., Khan M. A., Martin-Moe S. (2015): Quality by Design for Biopharmaceutical Drug Product Develpoment. Biomedicine, ISSN 2210-7371.

3. US FDA Guidance for Industry; Q7A GMP Guidance for API

4. Annex 15 to EU Guide to GMP: Qualification and Validation

Azoknak az előírt szakmai kompetenciáknak, kompetencia-elemeknek (tudás, képesség stb., KKK 8.

5

pont) a felsorolása, amelyek kialakításához a tantárgy jellemzően, érdemben hozzájárul

b) tudása

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel: vállalat gazdaságtani és menedzser ismeretek területen

- Ismeri a tudományos igényű kísérlettervezés és -kivitelezés módszereit, valamint a kísérleti eredmények kiértékelésének és diszkussziójának eszközrendszerét

- Tudományos problémafelvetés, illetve kutatási szemlélet ismerete

- Interdiszciplináris koncepcióalkotás és módszerfejlesztés ismerete

- Tájékozott a biotechnológiai tevékenységek közvélemény általi megítélésével kapcsolatban. Tájékozott a diszciplína aktuális legfontosabb globális és magyarországi fejlődési irányait illetően.

c) képességei

- Képes más szakemberekkel együtt dolgozni, szakmai együttműködést létesíteni

- Képes a biotechnológia területén a közvélemény-formálókkal, valamint a politikai és gazdasági döntéshozókkal való együttműködésre.

- Képes innovatív és minőségorientált gondolkodásra és tevékenységek végzésére

- Képes tudományos problémák felismerésére, kísérletek tervezésére, innovatív gondolkodásra, valamint interdiszciplináris koncepcióalkotásra

- Képesek kísérleteket tudományos igénnyel tervezni és kivitelezni, valamint azokat megfelelően kiértékelni és diszkutálni

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Salgó András, egyetemi tanár, DSc


Domonkos Dávid, tudományos főmunkatárs (Richter), PhD

(2.) Tantárgy neve: Vállalkozásgazdaságtan Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”: 100(kredit%)

A tanóra típusa: ea. / szem. / gyak. / konz. és óraszáma: 28eaaz adott félévben,


Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők:témabeszámolószakirodalom alapján

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): kollokvium

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok):


6

Előtanulmányi feltételek (ha vannak): -


A tantárgy célja megismertetni a hallgatókat a szervezetek és a menedzsment feladatának ésműködésének alapelveivel. Átfogó képet kíván kialakítani a vállalat egyes működési területeiről és azokegymással való kapcsolatáról. A tantárgyban kiemelt szerepet kapnak a minőségmenedzsment feladatai,azok szektorspecifikus kérdései. A hallgatók megismerkednek a minőségmenedzsment rendszerekfejlesztésének aktuális kérdéseivel és módszereivel. Áttekintést kapnak a minőségfejlesztéshezalkalmazott minőségfilozófiákról és ezek megvalósítását támogató legfontosabb minőségmenedzsment-módszerekről.


Kövesi J. (szerk.): Menedzsment és vállalkozás-gazdaságtan – Üzleti tudományi ismeretek. Typotex Kiadó, 2015. 978-963-2798-27-1

Kövesi J., Topár J. (szerk.): A minőségmenedzsment alapjai. Typotex Kiadó, 2006. 978-963-2797-00-7

Azoknak az előírtszakmai kompetenciáknak, kompetencia-elemeknek(tudás, képesség stb., KKK 8.pont) a felsorolása, amelyek kialakításához a tantárgy jellemzően, érdemben hozzájárul

a) tudásaA tantárgy minőségmenedzsment, vállalatgazdaságtani és menedzsment ismeretekkel vértezi fel ahallgatókat, amivel támogatja a multidiszciplináris probléma-megközelítés és problémamegoldáselsajátítását.

b) képességeiA tantárgy során megismert menedzsmenteszközök komplex fejlesztési tevékenységekkezdeményezésére, elvégzésére, illetve koordinálására, vezetésére teszik képessé a hallgatókat. Amegszerzett tudás pedig a más szakterületeken dolgozó szakemberekkel, gazdasági döntéshozókkalvaló szakmai együttműködés képességét fejleszti.

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Kövesi János egyetemi tanár, Dr. habil, CSc


Erdei János mesteroktató

(3.) Tantárgy neve: Bioetika, biobiztonság Kreditértéke: 1



A tanóra típusa: ea. és óraszáma: 14 az adott félévben

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők:

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): Koll. (háromfokozatú skálán)

7



Előtanulmányi feltételek :


A bioetika jelentősége a biológiai tudomány számára. Az etika biológiai és biotechnológiai vonatkozásai. A Humán Genom Projekt etikai vonatkozásai. Genetikai információkezelés. A ’geneticizáció’ veszélye. Génterápia. Génmódosítás, klónozás (testisejt sejtmag átültetés), embrionális őssejtek. Terápiás klónozás, kutatási klónozás. Az állatkísérletek célja és tudományos értelme. Okozati analóg modellek, hipotetikus analóg modellek. A kísérletek tárgyának tiszteletben tartása (humán és nem humán). Az állatkísérletek törvényi szabályozása. Alapelvek: helyettesítés, csökkentés, finomítás. Engedélyek, etikai vizsgálat. Génmódosítás, klónozás (testisejt sejtmag átültetés), embrionális őssejtek. Tapasztalatok a génmanipulált növények első generációjáról a termelők, a fogyasztók és a növények szempontjából. Mertoni tudományos normák. A tudományos kutatás társadalmi vonatkozásai. A biokutató elengedhetetlen személyes kvalitásai. A biokutató foglalkozási, oktatási és társadalmi felelősségei.


Lőw Péter: Bevezetés a bioetikába (http://ttomc.elte.hu/kiadvany/bevezetes-bioetikaba)

Ben Mepham: Bioethics - An Introduction for the Biosciences, Second Edition, Oxford University Press, 2008, ISBN: 9780199214303

Azoknak az előírt szakmai kompetenciáknak, kompetencia-elemeknek(tudás, képesség stb.,KKK 8. pont) a felsorolása, amelyek kialakításához a tantárgy jellemzően, érdembenhozzájárul

a) tudása

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit: elsősorban a genetikailag módosított szervezetek előállítása és felhasználásának környezeti kockázata területen.

-Tisztában van a biotechnológiai tevékenységek jogi, etikai, közgazdasági, minőségbiztosítási és biztonsági, valamint az élelmiszerlánc-biztonsági környezetének a szabályozásával.

b) képességei

- Munkáját a biotechnológiai tevékenységekre vonatkozó hatályos jogi, etikai, közgazdasági, minőségbiztosítási és biztonsági szabályoknak megfelelően végzi.

c) autonómiája és felelőssége

- Felelősségteljesen gondolkodik, felvállalja döntéseit, megalapozott ismeretekkel rendelkezik ahhoz, hogy önálló munkavégzésre legyen alkalmas. Példamutatóan formál és nyilvánít véleményt szakmai kérdésekről.

8

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Lőw Péter, egyetemi docens, PhD


Domokos Dávid, tudományos főmunkatárs (Richter), PhD

9

Az ismeretkör: Biológiai ismeretek

Kredittartománya:16 kr.

Tantárgyai: 1) Glikobiológia, 2) Sejtszintű biológiai szabályozásEA, 3) Sejtszintű biológiai szabályozásGY4) Bioanalitika 5) Bioanalitika és spektroszkópia gyakorlat,6)Fehérjetudomány, 7) Kémiai biológia

(1.) Tantárgy neve: Glikobiológia Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”80% (kredit%)


(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: …)

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: témabeszámolószakirodalom alapján.


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: egyéni feladatok, esettanulmányok




A tantárgy célja megismertetni a hallgatókat a cukorbiológia alapjaival és az élettani folyamatokban a cukor-alapú anyagok szerepeivel. A cukrok funkcióit és szerkezeti jellemzőit tárgyalni fogjuk a molekuláris alapokról kiindulva sejtszinten és a teljes szervezetek szintjén is. A tematika magában foglalja a következőket: Szerkezeti alapok, fehérje glikánok és glikolipidek. Glikánkötő fehérjék, a cukorkód. Cukrok szerepe a fejlődésben, sejtszintű jelátvitelben, fehérje transzportban. Extracelluláris glukánok. Cukrok szerepe egyes betegségekben. Terápiás stratégiák a glikobiológiában. A glikobiológia vizsgálati módszerei.


A. Varki és mtsai: Essentials of Glycobiology, 2nd Edition

Cold Spring Harbor (NY): Cold Spring Harbor Laboratory Press; 2009.

ISBN-13: 9780879697709

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1908/

M. Taylor and K. Drickamer: Introduction to Glycobiology, 3rd Edition

Oxford University Press, 2011

ISBN-13: 978-0199569113

ISBN-10: 0199569118

10

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1908/

Azoknak az előírt szakmai kompetenciáknak, kompetencia-elemeknek(tudás, képesség stb., KKK8.pont) a felsorolása, amelyek kialakításához a tantárgy jellemzően, érdemben hozzájárul

a) tudása

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit biokémia területen

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): G. Vértessy Beáta, egyetemi tanár, DSc

(2.) Tantárgy neve: Sejtszintű biológiai szabályozás Kreditértéke: 2






Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok : egyéni feladatok, esettanulmányok




A tantárgy célja megismertetni a hallgatókat az evolúció során az élő szervezetekben kifejlődött szabályozási mechanizmusokkal, a vírusoktól / prokariótáktól a többsejtű eukariótákon keresztül az emlős élőlényekig. Az előadások és egyéni feladatok során a hallgatók egyrészt elsajátítják a téma ismereteit, másrészt saját probléma-megoldási javaslatokat dolgoznak ki egyes szabályozási kérdésekre.A tematika magában foglalja a következőket: Az élő rendszerekben megvalósuló főbb szabályozási mechanizmusok molekuláris szintű megismertetése, a szerkezeti biológiától az enzimműködésen át a sejtes folyamatokig. A szabályozási mechanizmusok összefüggései, többszintű szabályozások megértetése. A kurrens szakirodalom fényében a főbb paradigma váltások bemutatása. Biotechnológiai alkalmazások és orvosbiológiai relevanciák feltárása. Szabályozási koncepciók a produkcióbiológiában és a fenntartható fejlődésben.


B. Alberts és mtsai: MolecularBiology of theCell, 4th EditionNew York: Garland Science; 2002.ISBN-10: 0-8153-3218-1, ISBN-10: 0-8153-4072-9 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21054/ G. H. Perdew és mtsai: Regulation of Gene Expression: MolecularMechanismsHumana Press 2007ISBN: 978-1-58829-265-0


11

a) tudása- átfogó ismeretek megszerzése az adott területen, tájékozottság a fejlődési lehetőségekről és irányokról, a korábbi ismerek integrálása az interdiszciplináris szakmai tárgykörökbe.

b) képességeiaz összefüggések felismerése és értő alkalmazása a területen felmerülő kérdések megválaszolásában, a problémák megoldásában

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): G.Vértessy Beáta egyetemi tanár, DSc


Szarka András habilitált egyetemi docens, PhD

Poppe László egyetemi tanár, DScOláh Julianna tudományos munkatárs, PhD

(3.) Tantárgy neve: Sejtszintű biológiai szabályozás gyakorlat Kreditértéke: 2




Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: problémamegoldásadott technológiai kérdésekre

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): gyj.Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: kutatás-fejlesztési projektektervezése




A tantárgy célja konkrét gyakorlatok ismertetése révén megismertetni a hallgatókat az evolúció során az élő szervezetekben kifejlődött szabályozási mechanizmusokkal, a vírusoktól / prokariótáktól a többsejtű eukariótákon keresztül az emlős élőlényekig. Az előadások és egyéni feladatok során a hallgatók egyrészt elsajátítják a téma ismereteit, másrészt saját probléma-megoldási javaslatokat dolgoznak ki egyes szabályozási kérdésekre.A tematika magában foglalja a következőket: Az élő rendszerekben megvalósuló főbb szabályozási mechanizmusok molekuláris szintű megismertetése, a szerkezeti biológiától az enzimműködésen át a sejtes folyamatokig. A szabályozási mechanizmusok összefüggései, többszintű szabályozások megértetése. A kurrens szakirodalom fényében a főbb paradigma váltások bemutatása. Biotechnológiai alkalmazások és orvosbiológiai relevanciák feltárása. Mindezen tárgykörökhöz kis létszámú gyakorlati oktatásra fog sor kerülni, ahol a hallgatók adott irodalmi feldolgozás után konkrét kísérletes problémát oldanak meg.


B. Alberts és mtsai: Molecular Biology of the Cell, 4th Edition

12

New York: Garland Science; 2002.ISBN-10: 0-8153-3218-1, ISBN-10: 0-8153-4072-9 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21054/ G. H. Perdew és mtsai: Regulation of Gene Expression: Molecular Mechanisms Humana Press 2007ISBN: 978-1-58829-265-0


a) tudása- átfogó ismeretek megszerzése az adott területen, tájékozottság a fejlődési lehetőségekről és irányokról, a korábbi ismerek integrálása az interdiszciplináris szakmai tárgykörökbe…….




Szarka András, habilitált egyetemi docens, PhD

Poppe László, egyetemi tanár, DSc

Oláh Julianna, tudományos munkatárs, PhD

(4.) Tantárgy neve: Bioanalitika Kreditértéke: 2




nyelve: magyar/angol

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Esszéírás önállóirodalmazás alapján egy a hallgató által választott bionalitikai témakörben.


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: Az értékelésben az esszé 25%-os, avizsga 75%-os súllyal kerül beszámításra.




Tárgyalandó témakörök: Az analitikai módszerek jellemzésére használt alapfogalmak áttekintése, A biomolekulák analitikai vizsgálatának speciális jellemzői, Kromatográfia (gázkromatográfia, normál és fordított fázisú folyadékkromatográfia, HILIC, ioncserélő és méretkizárásos kromatográfia, gél- és

13

affinitáskromatográfia), Spektroszkópiai módszerek (ultraibolya-látható, fluoreszcens spektroszkópia), Elektroforézis (gélelektroforézis, kapilláris elektroforézis), Centrifugálás (analitikai ultracentrifuga), Tömegspektrometria (ionizációs módszerek, analizátorok, tandem tömegspektrometria, peptidszekvenálás, LC-MS kapcsolás), Bioszenzorok, Az NMR spektroszkópia analitikai alkalmazásai (eredetvizsgálat, gyógyszeranalitika, tisztaságvizsgálat, toxikológia, metabolomika, automatizálás ,PCA analízis, multidimenzionális és multinukleáris módszerek), Termikus analízis, Immunanalitikai módszerek. A fehérje adszorpció szerepe a bioanalitikai eljárásokban, Validálás és minőségbiztosítás


Bioanalytical Chemistry 2nd Edition Szerzők: Andreas Manz. Petra S Dittrich, Nicole Pamme, Dimitri Iossifidis World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd. Singapore, 2015, ISBN: 978-1-78326-672-2

Bioanalytical Chemistry, 2nd Edition Szerzők: Susan R. Mikkelsen, Eduardo Cortón Wiley, 2004, ISBN: 978-1-118-30254-5

Elválasztástechnikai módszerek elmélete és gyakorlataSzerzők: Kremmer Tibor és Torkos KornélAkadémiai Kiadó, 2010, ISBN: 978 963 05 8952 9

Molekuláris biológiai technikákSzerző: Wunderlich LíviusTypotex Kiadó, 2014, ISBN: 978-963-279-172-2

P.J. Hore. Mágneses magrezonancia, Nemzeti Tankönyvkiadó, Budapest, 2004; (Szilágyi László fordításában)


a) tudása

-Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (mezőgazdasági biotechnológia: bioanalitika).

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (mezőgazdasági biotechnológia: bioanalitika).

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr. Szalai István, egyetemi docens, DSc

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. Fokozat):

Vácziné Dr. Schlosser Gitta, tudományos munkatárs, PhD

Dr. Bodor Andrea, egyetemi adjunktus, PhD

Dr. Eke Zsuzsanna, egyetemi adjunktus, PhD

Zsigrainé Dr. Vasanits Anikó, egyetemi adjunktus, PhD

Dr. Kiss Éva, egyetemi tanár, DSc

14

Dr. Tóvári József, osztályvezető, PhD (vendégelőadó)

(5.) Tantárgy neve: Bioanalitika és biospektroszkópia gyakorlat Kreditértéke: 4



A tanóra típusa: gyak. / konz. és óraszáma: 42az adott félévben,


Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: A kurzus végén egyválasztott módszer és alkalmazásának bemutatása kiselőadás formájában.

A számonkérés módja: koll.

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: Az értékelésben az önálló előadás25%-os, a jegyzőkönyvek 75%-os súllyal kerül beszámításra.


Előtanulmányi feltételek :-


A gyakorlat témakörei: Bioanalitika a hatósági elvárások (pl. ICH előírások) tükrében: módszerek a fizikai-kémiai jellemzők (szerkezet) meghatározására, tisztaságvizsgálat, szennyezők (melléktermékek) meghatározása, mennyiségi meghatározásra használatos módszerek, validálás és minőségbiztosítás; Spektroszkópiai módszerek; Tömegspektrometria alapjai és kapcsolt technikák (LC-MS); Folyadékkromatográfia alapjai (RP-HPLC, HILIC és Ionkromatográfia); Gél- és Affinitás kromatográfiás tisztítások; Folyadékromatográfiás mintázat; Komplex bioanalitikai feladatmegoldás (kismolekulás szennyezőktől a biomolekuláris hataóanyagig) HPLC-MS technikával, Gélelektroforézis; Centrifugálás; NMR spektroszkópia; Immunanalitikai módszerek


15

Bioanalytical Chemistry 2nd Edition Szerzők: Andreas Manz. Petra S Dittrich, Nicole Pamme, Dimitri Iossifidis World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd. Singapore, 2015, ISBN: 978-1-78326-672-2

Bioanalytical Chemistry, 2nd Edition Szerzők: Susan R. Mikkelsen, Eduardo Cortón Wiley, 2004, ISBN: 978-1-118-30254-5

Elválasztástechnikai módszerek elmélete és gyakorlataSzerzők: Kremmer Tibor és Torkos KornélAkadémiai Kiadó, 2010, ISBN: 978 963 05 8952 9

Molekuláris biológiai technikákSzerző: Wunderlich LíviusTypotex Kiadó, 2014, ISBN: 978-963-279-172-2

P.J. Hore. Mágneses magrezonancia, Nemzeti Tankönyvkiadó, Budapest, 2004; (Szilágyi László fordításában)

Azoknak az előírt szakmai kompetenciáknak, kompetencia-elemeknek(tudás, képesség stb., KKK8.pont) a felsorolása, amelyek kialakításához a tantárgy jellemzően, érdemben hozzájárul

a) tudása

-Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (mezőgazdasági biotechnológia: bioanalitika).

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (mezőgazdasági biotechnológia: bioanalitika).

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr. Szalai István, egyetemi docens, DSc

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. Fokozat):

Dr. Perczel András, egyetemi tanár, DSc

Vácziné Dr. Schlosser Gitta, tudományos munkatárs, PhD

Dr. Bodor Andrea, egyetemi adjunktus, PhD

Dr. Eke Zsuzsanna, egyetemi adjunktus, PhD

Zsigrainé Dr. Vasanits Anikó, egyetemi adjunktus, PhD

Dr. Kiss Éva, egyetemi tanár, DSc

Dr. Tóvári József, osztályvezető, PhD (vendégelőadó)

(6.) Tantárgy neve: Fehérjetudomány Kreditértéke: 2


16


A tanóra típusa: ea . , óraszáma: 28 az adott félévben,

(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: igény esetén angol)


A számonkérés módja: koll.

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: --


Előtanulmányi feltételek :--


Aminosavak és peptidek fizikai-kémiai tulajdonságai.

A fehérjeszerkezet szintjei, dinamikája és meghatározása.

Fehérjék anyagvizsgálati módszerei.

Fehérjék kémiai módosítása, immobilizációja.

Molekuláris mozgások követése fluoreszcencia-jelekkel.

Fehérjék kölcsönhatásainak vizsgálata: standard, biofizikai és in vivo vizsgálati módszerek.

Proteomika, tömegspektroszkópiai technikák.

Nagy áteresztőképességű módszerek a fehérjék vizsgálatában.

Fehérjehálózatok működési logikája.

XXI. századi enzimológia: kinetikai mechanizmusvizsgálat és egyedimolekula-technikák.

Természetes és irányított fehérjeevolúció.

A fehérjék mint gyógyszercélpontok.


David Whitford: Proteins: Structure and Function,. ISBN: 978-0-471-49894-0. Wiley, 2005.

Thomas E. Creighton: Proteins: Structures and Molecular Properties 2nd Edition. ISBN-13: 978-0716770305.

Előadások diasorai (480 oldal).


a) tudása

- Biotechnológia történetének ismerete

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit főleg biokémia és sejtbiológia területen.

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel: anyagvizsgálati módszerek

17

bioinformatika és kémiai biológia területen

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére, főleg a gyógyszer-biotechnológia területén

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Kovács Mihály, egyetemi tanár, DSc


Dosztányi Zsuzsanna, tud. főmts., PhD

Reményi Attila, tud. főmts., PhD

(7.) Tantárgy neve: Kémiai biológia Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti és gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”: 90% (kredit%)

A tanóra típusa: ea. óraszáma: 28 az adott félévben,

(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve:magyar/ angol)







1. Aminosavak, peptidek és fehérjék: az aminosavak kémia szerkezete, izoelektromos pontja, kiralitás,relatív konfiguráció meghatározása, aminosavak kémiai szintézise (pl. Strecker-szintézis, Knoppszintézis, transzaminális, reszolválás), Schotten-Baumann acilezés, peptidkötés kialakítása,aminosavszekvencia meghatározás, ninhidrin, dinitrofluorbenzol (DNFB), Edman-módszer, PTH-aminosavak, enzimatikus lebontás. Peptidek kémiai szintézise, N- és C-terminális védőcsoportok (pl.Boc-, Z-, Fmoc-), kapcsolási stratégiák (pl. DCC, aktív észter, savazid, szilárd fázisú peptidszintézis).Peptidkonformáció, torziószög, az amidcsoport elektronszerkezet és térszerkezete, Ramachandran-diagram. Másodlagos szerkezeti elemek, -szalag, -redőzött réteg, -hélix, 310-hélix, PPII-hélix, -kanyarok, globuláris fehérjék, filrilláris fehérjék, olajcsepp modell, proteázok működésének atomi szintűleírása,…

2. Szénhidrátok: biológiailag fontos monoszacharidok (nyíltláncú és gyűrűs szerkezete), 1C, C1konformációs egyensúlyok, a mutarotáció jelensége sztereokémiai sajátságok, oxidált és redukált

18

cukrok,..Diszacharidok (pl. cellobióz, maltóz, genciobióz),..Oligo- és poli szacharidok, glikoprotein,proteoglikán,…

3. Nukleinsavkémia: Nukleinsavak típusai, nukleotidok, nukleozidok, D-ribóz, 2-dezoxi-D-ribóz,pirimidinbázisok, purinbázisok, szilárdfázisú oligonukleotid szintézis, A-T, G-C H-hidas szerkezetek,bázis és cukor védőcsoportok, a didezoxi szekvenálási módszer, DNS polimerázok, rekombináns DNStechnológia,; kettős hélix, B-hélix (Watson-Crick hélix),

4. Lipidek: Triacil-glicerin, foszfolipid, foszfatidsav, szfingomielin, ceramid, szfingozin, cerebrozid,gangliozid, kolin, lecitin, kefalin, glikolipid, liposzóma, sejtmembrán, geranial, neral, -ciklocitrilidén,-ciklocitrilidén, -jonon, -jonon, limonén, mentol, -pinén, borneol kámfor, izopentenil-pirofoszfát,3,3-dimetilallil-pirofoszfát, szeszkviterpének biológiai hatásai, azulén, feromon, fitol, karotinoid, -karotin, -karotin, retinol (A-ritamin), koleszterin, kolesztán, koprosztán, koproszterin, epesav, szterinek,ergoszterin, D-vitaminok, taurin, szteroidok csoportosítása, digoszgenin, tesztoszteron, androszteron,ösztrogének, gesztagén, progeszteron, 3-hidroxi-5-androsztén-17-on,.. Membránfehérjék (integrális,perifériális), membrán-horgonyok, fluid-mozaik modell, laterális diffúzió, periferiális diffúzió,sejtmembránok szerkezete, receptorközvetített endocitózis, membránfúzió, membránpumpák,membráncsatornák, másodlagos transzporterek, ioncsatornák, ligandumfüggő csatornák, feszültségfüggőcsatornák, aktív transzport, passzív transzport, jelátvitel, membránreceptorok, másodlagos (intracellulárishírvivők), hét-transzmembrán-hélix (7 TM) receptorok, G-fehérjék

5. Egyéb fontos természetes szénvegyületek: Alkaloid, nikotin, tropánváz, atropin, -feniletil-amin,efedrin, adrenalin, papaverin, morfin, koffein, teobromin, terfillin. Flavon, flavonol, flavanon, cianidin.Heteroauxin. Porfinváz, hem, hemin, protoporfirin IX. Vitamin, B1-, B2-, B3-, B5- és B6-vitamin. C-vitamin. A-vitamin, D-vitaminok, Folsav, SAM, biotin. Kofaktor (l. nukleotid koenzimek), TPP, biotin.Fém kofaktorok. C1-donorok (FH4 származékok, S-adenozil-metionin (SAM), C2-donorok (hidroxietil-TPP, lipoamid, Ac-CoA), CO2 donor (biotin). Antibiotikum, penicillinek, klóramfenikol (klorocid)


Kajtár Márton: Változatok 4-elemre (ELTE Eötvös, Budapest, 2009; ISBN: 9789632841137)


a) tudása

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit a kémiai biológia területén

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel (kémiai biológia)

b) képességei- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére, főleg a gyógyszer-biotechnológia területén

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): dr. Perczel András,egyetemi tanár, DSc


Láng András, tudományos munkatárs, PhD

19

Az ismeretkör: Biotechnológiai ismeretek

Kredittartománya22 kr.

Tantárgyai: 1) Bioreaktorok és a mérnöki gyakorlat I, 2) Bioreaktorok és a mérnökigyakorlat II, 3) Fenntarható környezet toxikológia, ökotoxikológia, 4) Gyógyszer és orvosi biotechnológia EA 5) Gyógyszer és orvosi biotechnológia GY6) Gyógyszeripari mikrobiológia, 7) Környezeti és mezőgazdasági biotechnológia, 8)Géntechnológia és rekombináns fehérjék EA, 9)Géntechnológia és rekombináns fehérjék GY

(1.) Tantárgy neve: Bioreaktorok és a mérnöki gyakorlat I Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”13: 80% (kredit%)

A tanóra típusa: ea. és óraszáma: 28 óraaz adott félévben,


Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők : témabeszámolószakirodalom alapján






A biomérnöki alapképzés Biomérnöki Műveletek és Folymatok c. tantárgy enzimes és mikrobiális alapfolyamatainak és műveleteinek ismétlése és kibővítése strukturális modellekkel, majd bioreaktrok típusai, felépítése, műszerezése, integrálása üzemekbe és technológiákba. Tervezési, lépték növelési és csökkentési számítások, esettanulmányok. Emlős és rovar sejt reaktorok.


Nielsen J.,Villadsen J.: Bioreaction Engineering Principles, Plenum Press NY.London 1994BK Lydersen, NA D’Elia, KL Nelson: Bioprocess Engineering, JWiley and Sons NY.1994.


a) tudása

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (orvosi biotechnológia és mezőgazdasági biotechnológia: fermentációs technológia)

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel alkalmazott matematika területen

20



b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (orvosi biotechnológia és mezőgazdasági biotechnológia: fermentációs technológia):

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Németh Áron egyetemi adjunktus, PhD


Barta Zsolt egyetemi adjunktus, PhD

(2.) Tantárgy neve: Bioreaktorok és a mérnöki gyakorlat gyakorlat II Kreditértéke: 3




Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők :

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): gyj

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok : -




A biomérnöki alapképzés Biomérnöki Műveletek és Folymatok c. tantárgy enzimes és mikrobiális alapfolyamatainak és műveleteinek ismétlése és kibővítése strukturális modellekkel, majd bioreaktrok típusai, felépítése, műszerezése, integrálása üzemekbe és technológiákba. Tervezési, lépték növelési és csökkentési számítások, esettanulmányok. Emlős és rovar sejt reaktorok.

A laborgyakorlaton in silico és in vitro kísérletezés is folyik a mikrobiális és szövettenyésztéses bioreaktorok fenti ismeretanyagának elmélyítésére.


Nielsen J.,Villadsen J.: Bioreaction Engineering Principles, Plenum Press NY.London 1994BK Lydersen, NA D’Elia, KL Nelson: Bioprocess Engineering, JWiley and Sons NY.1994.

21


a) tudása

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (orvosi biotechnológia és mezőgazdasági biotechnológia: fermentációs technológia)

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel alkalmazott matematika területen



b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (orvosi biotechnológia és mezőgazdasági biotechnológia: fermentációs technológia):

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Németh Áron, egyetemi adjunktus, PhD.


Barta Zsolt, egyetemi adjunktus, PhD

(3.) Tantárgy neve: Fenntartható környezet, toxikológia, ökotoxikológia Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”13: 80% (kredit %)

A tanóra típusa: ea. és óraszáma: 28 az adott félévben,(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: …………………)Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: témabeszámolószakirodalom alapján, esettanulmányok, tematikus prezentációk

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): koll.(évközi beszámoló)Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: tematikus adatlap kidolgozása




A fenntartható környezet aktuális kérdéseit, a környezettoxikológia elvi alapjait és gyakorlatát ismertetia tantárgy, valamint áttekinti alkalmazását a környezeti kockázatmenedzsmentben, a kockázatfelmérésben, a kockázatkezelésben és a környezetvédelmi döntésekben.

A toxikológia, ökotoxikológia a modern, kockázat-alapú környezetmenedzsment eszköztárának egyiklegfontosabb eleme, ami a vegyi anyagoknak az ökológiai rendszerek szerkezetére és funkciójáragyakorolt káros hatását vizsgálja a molekuláris szinttől, az egyed és a közösség szintjén keresztül a teljesökoszisztémáig.

22

- A vegyi anyagok és a környezet kölcsönhatásának vizsgálata, toxikus anyagok hatása és a hatás mérése, környezettoxikológiai módszerek osztályozása, jellemzői, alkalmazása. Környezeti kockázatfelmérés és humán egészségkockázat felmérés metodikája.


- Gruiz K., Horváth B., Molnár M.: Környezettoxikológia, Műegyetemi Kiadó, Budapest, 2001.ISBN 963 420 676 x

- Calow, P. (ed): Handbook of Ecotoxicology, Blackwell, London, 2009. ISBN 9780632049332

- Gruiz K., Meggyes T., Fenyvesi É. (ed) Environmental Toxicology. Engineering Tools for Environmental Risk Management 2. Leiden: CRC Press/Balkema, 2015. ISBN:978-1-138-00155-8


c) tudása

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel a produkció biológia és fenntartható fejlődés és a toxikológia és ökotoxikológia területeken.

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Molnár Mónika, egyetemi adjunktus PhD


Feigl Viktória, egyetemi adjunktus PhD

(4.) Tantárgy neve: Gyógyszer és orvosi biotechnológia Kreditértéke: 2




(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve:



Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok : ---




23

A modern biológiai gyógyszerfejlesztés és gyártás bemutatása esettanulmányokon keresztül. Rekombináns fehérjék gyártása különböző gazdaszervezetekkel. Hormonfehérjék, véralvadási faktorokgyártása, upstream-downstream.

Gyógyszeralapanyagok biotechnológiai módszerekkel történő előállítása.

Monoklonális antitestek fejlesztése, gyártása és alkalmazása.

Modern tumorterápiás eszközök.

Vakcinagyártás: inaktivált és alegység vakcinák.

Diagnosztikumok fejlesztése és gyártása.

Génterápia

Szövet és szervregeneráció.


Materi, W., Gombos, Z., Wishart, D.: Proteins: Hormones, Enzymes and Monoclonal Antibodies – Background; in: Handbook of Pharmaceutical Biotechnology, S.C. Gad (ed.) Chapter 6.1, pp 774-822, John Wiley (2007)


a) tudása

-Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (orvosi biotechnológia)

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit

- Tisztában van a biotechnológiai tevékenységek jogi, etikai, közgazdasági, minőségbiztosítási és biztonsági, valamint az élelmiszerlánc-biztonsági környezetének a szabályozásával.

- Tájékozott a biotechnológiai tevékenységek közvélemény általi megítélésével kapcsolatban.

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére: (orvosi biotechnológia)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Pécs Miklós, docens, kandidátus/PhD


Németh Áron, adjunktus, PhD

(5.) Tantárgy neve: Gyógyszer és orvosi biotechnológia gyakorlat Kreditértéke: 3

24



A tanóra típusa: laborgyakorlat és óraszáma: 28 az adott félévben,


Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): gyakorlati jegy





A modern biológiai gyógyszerfejlesztés és gyártás bemutatása esettanulmányokon keresztül. Rekombináns fehérjék gyártása különböző gazdaszervezetekkel.

Rekombináns E. coli fermentáció.

Emlős sejtek szaporítása, fehérje expresszió.


Materi, W., Gombos, Z., Wishart, D.: Proteins: Hormones, Enzymes and Monoclonal Antibodies – Background; in: Handbook of Pharmaceutical Biotechnology, S.C. Gad (ed.) Chapter 6.1, pp 774-822, John Wiley (2007)


a) tudása

-Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (orvosi biotechnológia)


b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére: (orvosi biotechnológia).



Barta Zsolt, adjunktus, PhD

25

(6.) Tantárgy neve: Gyógyszeripari mikrobiológia Kreditértéke: 3


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”: 70% (kredit %)

A tanóra típusa: ea. + gyak. és óraszáma: 14ea + 28gyak az adott félévben,

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők : −


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: −


Előtanulmányi feltételek : −


A Gyógyszeripari mikrobiológia c. kötelező tárgy a hallgatók által már a BSc képzésben megismert mikrobiológiai, élettani és biokémiai tanulmányokra szorosan épít. Ismerteti a fertőző betegségek terápiájának és megelőzésének elvi és gyakorlati alapjait, azok alkalmazását a történeti kezdetektől napjainkig. Ehhez kapcsolódóan tárgyalja a mikroorganizmusok alkalmazását az antibiotikumok, valamint az aktív és passzív vakcinák ipari szintű alkalmazásában. A tárgy megismerteti a hallgatókkal amikroorganizmusok egyéb gyógyszeripari célú felhasználásának lehetőségeit. Ennek gyakorlati példáit bemutatja a vitaminok, aminosavak, szteroidok területén éppúgy, mint a rekombináns mikrobákkal előállított gyógyászati célú fehérjék kapcsán.

A tárgy laborgyakorlata során kumulált projekt feladatokat kell végrehajtani az alábbi témakörökből: vakcina előállítás (fermentáció és inaktiválás); gyógyszeripari rekombináns fehérje expresszió és tisztítás; antibiotikum termelő törzs fejlesztése; szteroid konverziós törzsek izolálása.


Jacquelyn G. Black: Microbiology. 8th ed. John Wiley & Sons, Inc., Hoboken NJ, USA, 2013

Németh Áron: Ipari mikrobiológia. 2. kiadás. Typotex Kiadó, Budapest, 2012


a) tudása

- Tájékozott a biotechnológiai tevékenységek közvélemény általi megítélésével kapcsolatban. Tájékozott a diszciplína aktuális legfontosabb globális és magyarországi fejlődési irányait illetően.

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére: (gyógyszer és orvosi biotechnológia).

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Sveiczer Ákos, egyetemi docens, PhD

26


Németh Áron, egyetemi adjunktus, PhD

Medgyes-Horváth Anna, tudományos segédmunkatárs, PhD

(7.) Tantárgy neve: Környezeti és mezőgazdasági biotechnológia Kreditértéke: 2







Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok :




Gyógyszeripari és vegyipari szennyvizek és szennyezőanyagok, valamint mikroszennyezők (pl. hormonhatású anyagok, gyulladáscsökkentők) minősítése, biodegradálhatósága, életciklusa, toxicitása. Aszennyezések hatása a vízi ökoszisztémákra. Gyógyszeripari és vegyipari szennyezések valamint mikroszennyezők és xenobiotikumok eliminációja biotechnológiai módszerekkel. Talajok és vizek kármentesítése biotechnológiai módszerekkel. Különböző környezeti erőforrások biotechnológiai hasznosítása. Ipari szennyvíztisztítási problémák, esettanulmányok. Fontosabb ipari szennyezők hatása a növényekre, mezőgazdasági és környezeti biztonsági aspektusok. Abiotikus stressz a növényélettanban, növényi biotechnológiában. A modern biotechnológia eszközeinek alkalmazása az élelmiszer biotechnológiában.


Grady Jr, C.L., Daigger, G.T., Love, N.G. and Filipe, C.D., 2011. Biological wastewater treatment. CRCpress.

Virkutyte, J., Varma, R.S. and Jegatheesan, V., 2010. Treatment of micropollutants in water and wastewater. IWA Publishing.

David Clark,Nanette PazdernikBiotechnology 1st EditionAcademic Cell Update Edition 2010, ISBN 10:

27

0123850630


a) tudása

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (környezet-biotechnológia, mezőgazdasági biotechnológia: élelmiszer biotechnológia)


- Tisztában van a biotechnológiai tevékenységek jogi, etikai, közgazdasági, minőségbiztosítási és biztonsági, valamint az élelmiszerlánc-biztonsági környezetének a szabályozásával.

- Tájékozott a biotechnológiai tevékenységek közvélemény általi megítélésével kapcsolatban. Tájékozotta diszciplína aktuális legfontosabb globális és magyarországi fejlődési irányait illetően.

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (környezet-biotechnológia, mezőgazdasági biotechnológia: élelmiszer biotechnológia)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr. Tardy Gábor Márk, egyetemi adjunktus,PhD


Dr. Szarka András, egyetemi docens, PhD, habil.

(8.) Tantárgy neve: Géntechnológia és rekombináns fehérjék Kreditértéke: 2



A tanóra típusa: ea.és óraszáma: 28 az adott félévben,

(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve:angol)


A számonkérés módja: koll. / gyj. / egyéb: koll.




28


A géntechnológia kialakulása, jelentősége. Alaptechnikák: DNS módosító enzimek, hibridizációs módszerek, nukleinsav próbák, oligonukleotidok tervezése és előállítása. Vektor-gazda rendszerek. Génbeviteli eljárások. DNS szekvenálás: láncterminációs és új-generációs módszerek. Genom projektek.Polimeráz láncreakió és alkalmazása. In vitro mutagenezis módszerek. Rekombináns fehérjék előállítási lehetőségei: in vitro, prokarióta és eukarióta rendszerek. Génkiütés, géncsendesítés, genomszerkesztés. Transzgenikus élőlények előállítása és felhasználása.


Nyitray László (szerk): Géntechnológia és fehérjemérnökség. ELTE, 2013; Digitális tankönyvtár (http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop412A/2011-0073_gentechnologia/adatok.html).

Nyitray László és Pál Gábor: A biokémia és molekuláris biológia alapjai. ELTE, 2013; Digitális tankönyvtár (http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop412A/2011-0073_biokemia_molekularis_biologia_alapjai/adatok.html)

T.A. Brown: Gene Cloning and DNA Analysis. An introduction. Wiley-Blackwell, Sixth Edition, 2010; ISBN: 9781405181730


a) tudása

- Biotechnológia történetének ismerete

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (orvosi biotechnológia)

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit főleg genetika és genetikailag módosított szervezetek előállítása és felhasználásának környezeti kockázata területen.

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (orvosi biotechnológia)



Málnási Csizmadia András, kutatóprofesszor, DSc

Gyimesi Máté, tud főmunkatárs, PhD

Varga Máté, adjunktus, PhD

(9.) Tantárgy neve: Géntechnológia és rekombináns fehérjék gyakorlat Kreditértéke: 3

29

http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop412A/2011-0073_biokemia_molekularis_biologia_alapjai/adatok.html


http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop412A/2011-0073_gentechnologia/adatok.html





Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Tömbösített gyakorlat(1 hét). A végén egy választott módszer és alkalmazásának bemutatása kiselőadás formájában.

A számonkérés módja: koll. / gyj. / egyéb: gyj.

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: jegyzőkönyv és kiselőadás értékelése




Rekomináns DNS módszerek ismertetése, alkalmazása. Molekuláris klónozás: rekombináns DNS konstrukciók tervezése és elkészítése (restrikciós endonukleáz emésztés, DNS izolálás, ligálás, transzformálás kompetens gazdasejtbe, klónszelekció). A rekombinás DNS ellenőrzése restrikciós térképezéssel. In vitro mutagenezis PCR segítségével. Rekombináns GFP/mCherry konstrukciók előállítása és túltermeltetés E. coli rendszerben: szubklónozás expressziós vektorba, transzformálás, indukció, sejtfeltárás, izolálás, a rekombináns fluoreszcens fehérjék tesztelése.



Nyitray László és Pál Gábor: A biokémia és molekuláris biológia alapjai. ELTE, 2013; Digitális tankönyvtár (http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop412A/2011-0073_biokemia_molekularis_biologia_alapjai/adatok.html)


a) tudása


- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit főleg genetika területen.

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (orvosi biotechnológia)

30






Málnási Csizmadia András, kutatóprofesszor, DSc

Kovács Mihály, egyetemi tanár, DSc

Pál Gábor, egyetemi docens, PhD

Gyimesi Máté, tudományos főmunkatárs, PhD

Molnár Tamás, egyetemi tanársegéd, PhD

31

Az ismeretkör: Gyógyszer-biotechnológia specializáció

Kredittartománya: 35 kr.

Tantárgyai: 1) Gyógyszerkémia, 2) Biospektroszkópia, tömegspektrometria, 3) Fehérjék fizikai vizsgálata,4) Fehérjetisztítás és kromatográfia gyakorlat,5) Immunbiotechnológia EA, 6) Immunbiotechnológia GY, 7) In vitro sejttechnológia, 8) Biotechnológiai projektgyakorlat I, 9) Biotechnológiai projektgyakorlat II 10) Bioenergia, 11) Biotermékek izolálása, 12) Fehérjék életútja a géntől a biotranszformációig, 13) Sejtciklus szabályozás, 14) Transzgénikus élőlények: GMO-k, génterápia, 15) Biopolimerek, 16) Kolloidok a biotechnológiában, 17) Biokatalízis biotechnológusoknak EA, 18) Biokatalízis biotechnológusoknak GY, 19) A gyógyszerfejlesztés fázisai, 20) Alapkutatástól a célzott daganatterápiáig, 21) Biokonjugátumok: szintézis, jellemzés, alkalmazás, 22) Bionanotechnológia EA, 23)Bionanotechnológia GY, 24) Fénymikroszkópos technikák, 25) Környezeti mikrobiológia EA, 26) Környezeti mikrobiológia és biotechnológia GY, 27) A fehérjekrisztallográfia módszerei EA, 28) A fehérjekrisztallográfia módszerei GY, 29) Növényi biotechnológia EA, 30) Növényi biotechnológia GY, 31) Rendszerbiológia és „omika” tudományok, 32) Természetes eredetű hatóanyagok EA, 33) Természetes eredetű hatóanyagok GY, 34) Tumorbiológia

(1.) Tantárgy neve: Gyógyszerkémia Kreditértéke: 2





Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: témabeszámolószakirodalom alapján ………………………..






A tárgy célja, hogy a hallgatók megismerjék a legfontosabb gyógyszerek hatásmechanizmusát, ahatóanyagcsoportok tipikus képviselőit és így képesek legyenek a gyógyszerkutatáshoz- és fejlesztésheznélkülözhetetlen, farmakológusokkal, vegyészekkel, vegyészmérnökökkel, orvosokkal összehangoltkutató- és fejlesztőmunka elvégzésére. A tárgy fő témakörei: kolinerg szerek, adrenerg receptorok ésgyógyszereik, a dopaminerg receptorokon, a szerotoninerg receptorokon ható gyógyszerek,hallucinogének, hisztamin receptorain ható agonisták, antagonisták, gyomorsav termelés, GABA (-amino-vajsav) és receptorain ható szerek, neurotranszmitter aminosavak receptorain és a purinergreceptorokon ható gyógyszerek, gyógyszerhatás hormonokon és receptoraikon, a renin-angiotenzin-aldoszteron rendszer és gyógyszerei, prosztanoidok: arachidonsav ciklus, prosztaglandinok,prosztaciklinek, tromboxánok, leukotriének és a gyulladás gyógyszerezése, ópiát-fájdalomcsillapítók,

32

enkefalinok, endorfinok, gyógyszerhatás membránokon: általános érzéstelenítők, helyi érzéstelenítő,sejtfal szintézis inhibitorok , enzimek mint a gyógyszerhatás célpontjai, vízhajtók, a fólsav ciklus ésenzimjeinek bénítása, különböző hatásmechanizmusú baktériumellenes szerek, gyógyszerhatás DNS-en,sejtmagra ható vegyületek, tumor ellenes hatóanyagok, immunrendszer működése, immunstimulálók,immunszupresszánsok, vírus ellenes szerek, a vér és véralvadás (a vérképzésre ható szerek, véralvadás,fibrinolitikumok), pszichotróp szerek, anxiolitikumok, szedatohipnotikumok, antipszihotikumok,antidepresszánsok és antimániás szerek és neuroprotektív gyógyszerek.


A farmakológia alapjai (szerk.: Gyires K., Fürst Zs.), Medicina Könyvkiadó, Budapest, 2011.

Thomas, G.: Fundamentals of Medicinal Chemistry, Wiley, Chicester, 2004.

Saunders, J.: Top Drugs Top Synthetic Routes, Oxford Univ. Press, Oxford, 2000.


a) tudása


b) képességei


Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Faigl Ferenc, egyetemi tanár, DSc


(2.) Tantárgy neve: Biospektroszkópia, tömegspektrometria Kreditértéke: 2




(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: angol)



Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok):



33


Az NMR az egyik leghatékonyabb módszer biomolekulák megfigyelésére. Ez a könyv egy teljes NMR-es kutatási segítség a bioorvoslás területén és nemcsak hátteret nyújt és gyakorlati tanácsokat ad ehhez, hanem az NMR-es jövőre nézve előretekintést is ad a rendszerbiológiába. Témák: Bevezetés a 2D- és a 3D-NMR-be és a helyzete a mechanisztikus rendszer biológiában, a biomolekulák szerkezete: fundamentumok, fehérjék szerkezeti jellemzői, nukleinsavak szerkezeti jellemzői, mit tudhatunk meg abiomolekulák szerkezetéről és dinamikájáról NMR-rel, fehérjék NMR-res vizsgálata, nukleinsavak NMR-es vizsgálata, stb.


NMR of Biomolecules: Towards Mechanistic Systems Biology (ed by Ivano Bertini,Kathleen S. McGreevy and Giacomo Parigi) ISBN: 978-3-527-32850-5


a) tudása

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (mezőgazdasági biotechnológia: bioanalitika)

b) képességei

-A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (mezőgazdasági biotechnológia: bioanalitika)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): dr. Perczel András, egyetemi tanár, DSc

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. fokozat):dr. Láng András tud. munkatárs, PhDVácziné dr. Schlosser Gitta tud. munkatárs, PhD

(3.) Tantárgy neve: Fehérjék fizikai vizsgálata Kreditértéke: 3


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”:70%(kredit%)

A tanóra típusa: ea.+ gyak. és óraszáma: 14ea +28 gyaz adott félévben,


Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Az ismeretanyag egyrésze otthoni feladatként elsajátítandó; a gyakorlatok tömbösítve, 3 nap

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): gyj.Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok:


34

http://eu.wiley.com/WileyCDA/Section/id-302479.html?query=Kathleen+S.+McGreevy

http://eu.wiley.com/WileyCDA/Section/id-302479.html?query=Kathleen+S.+McGreevy

http://eu.wiley.com/WileyCDA/Section/id-302479.html?query=Giacomo+Parigi



Az előadások keretében a hallgatók megismerkedhetnek a fehérjék szerkezetét, konformációs stabilitását, és kölcsönhatásait vizsgáló in vitro módszerek elméleti alapjaival (az atomi felbontású módszerek kivételével): fehérjék másodlagos és harmadlagos szerkezetének vizsgálata, cirkuláris dikroizmus-, infravörös- és fluoreszcencia spektroszkópia, fehérjék stabilitásának termodinamikai háttere, fehérjék hődenaturációjának és kémiai denaturálószerrel szembeni stabilitásának vizsgálata spektroszkópiai és kalorimetriai módszerekkel, fehérje-ligandum, fehérje-fehérje kölcsönhatások vizsgálatának elmélete, kölcsönhatási modellek, izotermális titrációs kalorimetria, felszíni plazmon rezonancia, kristály mikromérleg, termoforézis módszere, példafeladatok és számítások.

A gyakorlat keretében megismerkedhetnek néhány alapvető, a fehérjék szerkezetét, stabilitását és kölcsönhatásait vizsgáló módszerrel. Megismerik a műszerek felépítését, beállítási paramétereit, a kísérletek megtervezését. Elsajátítják a mérések kivitelezését, az eredményeket kiértékelik és diszkuttálják. A módszerek a következők:

CD - Cirkuláris dikroizmus spektroszkópia (fehérjék másodlagos és harmadlagos szerkezete, fehérjék szerkezeti stabilitása)

FTIR – infravörös spektroszkópia (fehérjék másodlagos szerkezete) DSC - Differenciális pásztázó kalorimetria (fehérjék szerkezeti stabilitása) ITC - Izotermális titráló kalorimetria (fehérje-ligandum kölcsönhatás) SPR - Felszíni plazmon rezonancia (fehérje-ligandum kölcsönhatás) MST - Termoforézis (Microscale thermophoresis - fehérje-ligandum kölcsönhatás) QCR - Kristály mikromérleg (fehérje-ligandum kölcsönhatás).


- Lehninger Principles of Biochemistry. W. H. Freeman; English, ISBN-13: 978-0716771081- Thomas E. Creighton. Proteins: Structures and Molecular Properties.W. H. Freeman; ISBN-13:

978-0716770305 - Bevezetés a biokémiába gyakorlati jegyzet. Budapest: Eötvös Loránd Tudományegyetem, 2013.

201 p.- Greenfield NJ. Nature Protocols. 2006;1(6) - Freyre and Lewis, Isothermal Titration Calorimetry: Experimental Design, Data Analysis, and

Probing Macromolecule/Ligand Binding and Kinetic Interactions. METHODS IN CELL BIOLOGY (2008), VOL. 84, CH. 4, DOI: 10.1016/S0091-679X(07)84004-0


d) tudása

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel anyagvizsgálati módszerek területén

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Kardos József, adjunktus, PhD

35


Závodszky Péter, emeritus prof, DSc

Hajdú István, tudományos munkatárs, PhD

36

(4.) Tantárgy neve: Fehérjetisztítás és kromatográfia gyakorlat Kreditértéke: 2




(Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: tömbösítve, 3 nap


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: jegyzőkönyv és írásbeli kérdésekértékelése




A három gyakorlat a három leggyakrabban alkalmazott fehérjetisztítási módszer bemutatását tervezi legalább két az iparban is használatos kromatográfiás készüléken dolgozva. Az 1. módszer az affinitási kromatográfia lesz. Itt szóba jöhet polihisztidin taggel ellátott fehérjék tisztítása, vagy antitestek tisztítása protein A kromatográfia segítségével. A 2. az ioncsere kromatográfia lesz, mint a legjobban skálázható általános fehérjetisztítási módszer. A 3. analitikai, vagy preparatív gélpermeációs kromatográfia lesz például fehérjék aggregációjának vizsgálata, ill. aggregátumok eltávolítása céljából. A gyakorlat közben elbeszélgetünk a kromatográfiás módszerek elméletéről is. Az értékelés során a jegyzőkönyv mellett néhány elméleti kérdés is szerepel majd.



a) tudása

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit a biokémia területén

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Pál Gábor, egy docens, PhD


Dobó József, tudományos főmunkatárs, PhD

Kardos József, adjunktus, PhD

37

(5.) Tantárgy neve: Immunbiotechnológia Kreditértéke: 2




(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve:magyar/angol)







Az ellenanyagok kialakulásának genetikai alapjai, az ellenanyagok szerkezete, az egyes ellenanyag izotípusok és funkcióik. Az IgG típusú ellenanyagok fontosabb aminosav motívumai és szénhidrát oldallánca a struktúra-funkció szempontjából. A monoklonális ellenanyagok fejlesztésének lehetőségei (fúzió-hibridóma, fág-könyvtár, egy-sejt PCR, stb). A monoklonális ellenanyagok alkalmazása a kutatásban, diagnosztikában és a terápiában. A terápiás monoklonális ellenanyagok típusai és hatásmechanizmusai: extracelluláris ligand blokkoló ellenanyagok; célsejt felszíni receptorokat célzó ellenanyagok; a célsejt szignalizációjában részt vevő receptorokat, ion-csatornákat szabályozó ellenanyagok; a célsejtet elpusztító ellenanyagok; az immunsejtek ellenőrzőpont (checkpoint) gátlók (inhibitorok) szerepe a tumor és autoimmun betegek kezelésében. A terápiás ellenanyagok immunogenitása és hatása a terápiára. Az állati eredetű ellenanyagok "humanizálása" (kiméra-, humanizált- ellenanyagok); humán ellenanyagokat termelő traszgénikus állatok; terápiás ellenanyagok fejlesztése humán sejtekből. Bioszimiláris ellenanyagok. A terápiás ellenanyagok antigén kötési képességének és effektor funkcióinak módosítása a hatékonyság fokozása érdekében: az IgG Fc régiójának módosítása annak érdekében, hogy az antitest kötődése az Fcgamma és neonatalis Fc receptorhoz, ill. a komplement C1 komponenséhez módosuljon. Ellenanyag fragmentumok különböző formái és előállításuk. A bivalens monoklonális ellenanyagok létrehozása és alkalmazási területei. Az antitest-gyógyszer konjugátumok (antibody drug conjugate; ADC) létrehozása és alkalmazási területei.


kötelező: (1) elérhető tankönyv: Erdei Anna-Sármay Gabriella-Prechl József (szerk): Immunológia (on-line ingyenesen elérhető: http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop425/2011_0001_524_Immunologia/adatok.html)

(2) a tankönyvi ábrákra épülő előadás vázlat, ami on-line elérhető: immunológia.elte.hu)

(3) Kacskovics Imre: Fehérje gyógyszerek fejlesztése (Perczel-Nyitray: 1001 arcú fehérjék c. könyv – megjelenés alatt)


a) tudása

38


b) képességei

-A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (orvosi biotechnológia)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr. Kacskovics Imre, tanszékvezető egyetemitanár, DSc.


(6.) Tantárgy neve: Immunbiotechnológia gyakorlat Kreditértéke: 3

A tantárgy besorolása: kötelező / választható

A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”: 100% GY (kredit%)



Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Tömbösített gyakorlat(5 napon keresztül)


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: jegyzőkönyvek, dolgozatírás és otthoniprojektfeladat írás alapján

A tantárgy tantervi helye (hányadik félév): 1. tavaszi félév



Antigén és ellenanyag kapcsolódásának kimutatása másodlagos reakciók alapján (ELISA, Western blot, immuncitokémia). Az IgG típusú ellenanyagok effektor funkciójának elemzése: (1) komplement függő citotoxicitás (CDC) elemzése tumorsejt és sejtspecifikus IgG alkalmazásával, az elpusztult célsejtek számának kvantitatív meghatározása áramlási citofluoriméterben (az elpusztult sejteket propidium jodiddal jelöljük meg; (2) az IgG, ill. antigén-IgG immunkomplex (IC) és a különböző Fcgamma receptorok kapcsolódásának kvantitatív elemzése áramlási citofluoriméterrel; (3) ellenanyag-függő sejtközvetített citotoxicitás (ADCC) elemzése áramlási citofluoriméterrel; (4) ellenanyag-függő sejtközvetített fagocitózis (ADCP) elemzése áramlási citofluoriméterrel; (5) az FcRn-IgG kapcsolódásának kvantitatív elemzése az IgG hámsejteken keresztüli transzport vizsgálatával (Transwellrendszer).

A 2-5 legfontosabb kötelező, illetve ajánlott irodalom (jegyzet, tankönyv) felsorolása bibliográfiai

39

adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN)

kötelező: (1) elérhető tankönyv: Immunológiai módszerek (Medicina, 2006. Szerk.: Erdei Anna, ISBN 963 242 892 7


a) tudása


b) képességei


Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr. Kacskovics Imre, tanszékvezető egyetemitanár, DSc.

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak): Dr. Iliás Attila, tudományosfőmunkatárs, PhD

(7.) Tantárgy neve: In vitro sejttechnológia Kreditértéke: 3



A tanóra típusa: ea. + gyak. és óraszáma: 14ea +28gy az adott félévben,

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Az ismeretanyag egyrésze otthoni feladatként elsajátítandó






Emlős sejtvonalak in vitro fenntartása: passzálás, klónozás, krioprezerváció. A steril munkakörnyezet feltételeinek ismertetése. Primer, szekunder tenyészetek készítése, sejtvonalak alapítása. Halhatatlan sejtvonalak létrehozása. Sejtszeparálás és –jellemzés technológiái. Rekombináns plazmidok emlős sejtvonalba történő transzfektálása, a termelt fluoreszcens fehérjék mikroszkópos ellenőrzése.Életképességi és toxicitási vizsgálatok. Az in vitro szövet- és sejttenyésztés kutatásban és iparban történő alkalmazásának ismertetése.


Freshney, R., I.: Culture of Animal Cells: A Manual of Basic Technique and Specialized Applications,

40

7th Edition ISBN: 978-1-118-87365-6

Mather JP, Barnes D: Animal Cell Culture Methods. Academic Press, ISBN: 0-12-480040-8


a) tudása


- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit a sejtbiológia területén

b) képességei


Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr Schlett Katalin, egyetemi docens, PhD


Dr. Tárnok Krisztián, adjunktus, PhD

Bencsik Norbert, tanársegéd

(8.) Tantárgy neve:Biotechnológiai projekt gyakorlat I Kreditértéke: 4



A tanóra típusa: gyak.és óraszáma: 42az adott félévben,

Az adott ismeret átadásában alkalmazandótovábbi (sajátos) módok, jellemzők:Projektfeladat elvégzésetömbösített gyakorlaton, 5 fős csoportokban (5 nap).

A számonkérés módja: gyj

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: Beszámoló a projektfeladatból (részben angolnyelven)




Molekuláris biológiai és bioanalitikai szakmai gyakorlat. A gyakorlat során bioszimiláris gyógyszer előállítását „kisléptékű” folyamatait végzik a hallgatók, beleértve a minták analitikai elemzését is. Rekombináns gyógyszerfehérje előállítására alkalmas DNS konstrukciók előállítása, sejtkultúrában történő expressziója, a fehérje tisztítása. A fehérje hatóanyagot tartalmazó minták vizsgálata,

41

mintaelőkészítés. A minták minőségi és mennyiségi jellemzőinek kiértékelése. Fiziko-kémiai tulajdonságok mérése. Biológiai aktivitás és hatásosság mérése. Poszttranszlációs mintázat mérése. Szennyezések azonosítása. Kapott eredmények kiértékelése, dokumentálása.



a) tudása- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (mezőgazdasági biotechnológia: fermentációs technológia és bioanalitika)-Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit(főleg biokémia és sejtbiológia területén)- Az gyógyszer- (illetve orvosi-) biotechnológia területén bővebb speciális ismeretekkel rendelkezik.- Tudományos problémafelvetés, illetve kutatási szemlélet ismerete- Ismeri a tudományos igényű kísérlettervezés és -kivitelezés módszereit, valamint a kísérleti eredmények kiértékelésének és diszkussziójának eszközrendszerét- Ismeri az interdiszciplináris koncepcióalkotást és módszerfejlesztést.- Tájékozott a biotechnológiai tevékenységek közvélemény általi megítélésével kapcsolatban.- Tájékozott a diszciplína aktuális legfontosabb globális és magyarországi fejlődési irányait illetően

b) képességei- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (mezőgazdasági biotechnológia: fermentációs technológia és bioanalitika)- Képes más szakemberekkel együtt dolgozni, szakmai együttműködést létesíteni- Képes a más szakterületeken dolgozó szakemberekkel való szakmai együttműködésre, és a biotechnológiai alapkutatást végzőkkel, a technológia felhasználókkal való szakmai együttműködésre.Képes a biotechnológia területén a közvélemény-formálókkal, valamint a politikai és gazdasági döntéshozókkal való együttműködésre..

- Munkáját a biotechnológiai tevékenységekre vonatkozó hatályos jogi, etikai, közgazdasági, Képes innovatív és minőségorientált gondolkodásra és tevékenységek végzésére.

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Nyitray László egyetemi tanár, DSc


Domonkos Dávid, főosztályvezető, PhD

Molnár Tamás tanársegéd, PhD

Porrogi Pálma tanársegéd, PhD

(9.) Tantárgy neve:Biotechnológiai projekt gyakorlat II Kreditértéke: 4



42

A tanóra típusa: gyak. és óraszáma: 42az adott félévben,

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Projektfeladatelvégzése tömbösített gyakorlaton, 5 fős csoportokban (5 nap).

A számonkérés módja: gyj

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: Beszámoló a projektfeladatból (részben angolnyelven)




Fermentációs és bioanalitikai szakmai gyakorlat. A gyakorlat során bioszimiláris gyógyszer előállítását „nagyléptékű” upstream és downstream folyamatait végzik a hallgatók, beleértve a minták analitikai elemzését is. Rekombináns gyógyszerfehérje előállítására fermentációs texhnológiával. A fehérje hatóanyagot tartalmazó minták feltárása, a gyógyszerfehérjék kromatográfiás tisztítása. A minták minőségi és mennyiségi jellemzőinek kiértékelése. Fiziko-kémiai tulajdonságok mérése. Biológiai aktivitás és hatásosság mérése. Poszttranszlációs mintázat mérése. Szennyezések azonosítása. Kapott eredmények kiértékelése, dokumentálása.



a) tudása- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (mezőgazdasági biotechnológia: fermentációs technológia és bioanalitika)-Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit(főleg biokémia és sejtbiológia területén)- Az gyógyszer- (illetve orvosi-) biotechnológia területén bővebb speciális ismeretekkel rendelkezik.- Tudományos problémafelvetés, illetve kutatási szemlélet ismerete- Ismeri a tudományos igényű kísérlettervezés és -kivitelezés módszereit, valamint a kísérleti eredmények kiértékelésének és diszkussziójának eszközrendszerét- Ismeri az interdiszciplináris koncepcióalkotást és módszerfejlesztést.- Tájékozott a biotechnológiai tevékenységek közvélemény általi megítélésével kapcsolatban.- Tájékozott a diszciplína aktuális legfontosabb globális és magyarországi fejlődési irányait illetően

b) képességei- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (mezőgazdasági biotechnológia: fermentációs technológia és bioanalitika)- Képes más szakemberekkel együtt dolgozni, szakmai együttműködést létesíteni- Képes a más szakterületeken dolgozó szakemberekkel való szakmai együttműködésre, és a biotechnológiai alapkutatást végzőkkel, a technológia felhasználókkal való szakmai együttműködésre.Képes a biotechnológia területén a közvélemény-formálókkal, valamint a politikai és gazdasági döntéshozókkal való együttműködésre..

- Munkáját a biotechnológiai tevékenységekre vonatkozó hatályos jogi, etikai, közgazdasági, Képes

43

innovatív és minőségorientált gondolkodásra és tevékenységek végzésére.

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Szarka András egyetemi docens, PhD


Domonkos Dávid, főosztályvezető, PhD

(10.) Tantárgy neve: Bioenergia Kreditértéke: 2

A tantárgy besorolása: kötelezően választható



(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: -

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők : -


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok : -




A környezetvédelem, a fosszilis eredetű nyersanyagok jövőbeli hiánya és az energiabiztonság együttesena megújuló, megújítható nyersanyag és energiaforrások fokozott felhasználása felé fordítja a kutatók és fejlesztők figyelmét. A tantárgy áttekintést ad a megújuló, megújítható nyersanyag és energiaforrásokról, azok felhasználási lehetőségeiről a vegyipar és az üzemanyag előállítás területén. A lehetőségek és az alkalmazható technológiák mellett kitér a jelen állapot ismertetésére is Magyarországon, az Európai Unióban és a többi földrészen. Nyersanyagok tekintetében tárgyalja a termesztett biomassza, a mezőgazdasági és ipari melléktermékek és hulladékok felhasználási lehetőségeit is.


Előadásfóliák


a) tudása

44

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (bioenergia biotechnológia)

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (bioenergia biotechnológia)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr. Barta Zsolt, adjunktus/tud. mts, PhD


(11.) Tantárgy neve: Biotermékek izolálása Kreditértéke: 2




(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: -----

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők ----






A tárgy célja, hogy a hallgatók megismerkedjenek a fermentációs és más biológiai iparok ipari léptékben is alkalmazható elválasztás-technikai módszereivel (downstream processing), amelyeket a biológiai iparokban széleskörűen alkalmaznak a végtermék izolálására. A tárgy általános, műveleti jellegű, nem elsősorban konkrét technológiákat ismertet.

A tárgyalt témakörök: Sejtek elválasztása, sejtfeltárás, membránműveletek, kicsapás és kristályosítás, adszorpció és kromatográfia, zárványtestek feldolgozása.


Pécs Miklós: Fermentációs feldolgozási műveletek, Typotex Kiadó, 2011, ISBN: 978-963-279-472-3


45

c) tudása

- -Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (környezet biotechnológia és mezőgazdasági biotechnológia: élelmiszer biotechnológia)

d) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére: (környezet biotechnológia és mezőgazdasági biotechnológia: élelmiszer biotechnológia).


Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. fokozat):---

(12.) Tantárgy neve: Fehérjék életútja a géntől a biotranszformációig Kreditértéke: 2

A tantárgy besorolása:kötelezően választható










A tantárgy keretei között ismertetésre kerül a gének átírásának szabályozása, a transzláció alapvető problémái, mind a citoplazmatikus, mind organelláris (mitokondrium, kloroplaszt) szinten. Részletesen ismertetésre kerül a fehérjék érésének (foldingjának) folyamata: endoplazmás retikuliumban, Golgi apparátusban, mitokondriumban, kloroplasztban zajló folyamatok. Tárgyalásra kerül a rekombináns DNS technikával bevitt fehérjék jelentette plusz folding terhelés: endoplazmás retikulum túltöltés, és stressz, ennek megoldási lehetőségei: sérült fehérjeválasz (UPR). Részletesen tárgyalásra kerülnek a kompartimentum specifikus dajkafehérjék, szerepük. Végezetül a fehérjéket, fehérjeszerkezetet ért sérülések, a sérült fehérjék eltávolítása, proteolízise. A proteolízist megelőző a foldinghibás fehérjék egyenkénti felismerése, megjelölése, majd eltávolításuk: proteaszóma, mikro- és makroautofágia. Biofarmáciai oldalon foglalkozni kivánunk a kis és nagymolekulás készítmények felszívódásával, transzportjával, illetve lebontásával, valamint a lebontó rendszerek polimorfizmusából fakadó gyakorlati

46

vonatkozásokkal.


Lehninger Principles of Biochemistry David L. Nelson (University of Wisconsin-Madison), Michael M. Cox (University of Wisconsin-Madison) ISBN-10: 1-4641-2611-9; ISBN-13: 978-1-4641-2611-6

Szarka A, Lőrincz T (2014) The role of ascorbate in protein folding Protoplasma251:(3) pp. 489-497.

Szarka A, Bánhegyi G (2011) Oxidative folding: recent developments BioMolConcepts 2: 379-390.

Szarka András, Bánhegyi Gábor; Szarka András (ed.) Pathobiochemistry (Hung)Budapest: Typotex Kiadó, 2014. 78 p. (ISBN:978-963-279-178-4)


a) tudása

Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (mezőgazdasági biotechnológia)

b) képessége

A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére: (mezőgazdasági biotechnológia)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Szarka András, egyetemi docens, PhD


(13.) Tantárgy neve: Sejtciklus szabályozás Kreditértéke: 2




(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve:−)

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők : −


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok : −

47


Előtanulmányi feltételek : −


A Sejtciklus szabályozás c. kötelezően választható tárgy keretében a hallgatók az eukarióta sejtek mitózisos ciklusának fiziológiai és molekuláris biológiai folyamataival ismerkednek meg. Megtanulják annak a fehérjehálózatnak (központi kontrollrendszer) a működését, amelynek révén ún. ciklinfüggő kinázok regulálják a sejtciklus eseményeinek szigorú összehangolását. A ciklinfüggő kinázok regulációján keresztül betekintést nyernek olyan pozitív és negatív visszacsatolási hurkok működésébe is, amelyek léte elengedhetetlen a sejtciklus ellenőrzési pontjainál. A tárgy ismerteti a sejtciklus-kutatásokban alkalmazott fontosabb modellorganizmusokat és szinkronizálási eljárásokat. A sejtfelszíni receptorok működése kapcsán tárgyaljuk azokat a molekuláris folyamatokat, amelyek révén a növekedési faktorok kiváltják szövetes szervezetekben a sejtek osztódását. Ehhez kapcsolódóan a hallgatók betekintést nyernek az őssejtek viselkedésébe, illetve azok terápiás alkalmazási lehetőségeibe is. Végezetül a tantárgy a baktériumok sejciklusának szabályszerűségeit ismerteti, összehasonlítva azokat az eukariótákéval.


Alberts, B., Bray, D., Hopkin, K., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. (2014): Essential Cell Biology. 4th ed. Garland Science, New York - London.

Morgan, D.O. (2007): The Cell Cycle. Principles of Control. New Science Press Ltd, London.

Fisher, E. (2004): A funkcionális sejttan alapjai. 3. kiadás. Dialóg Campus Kiadó, Budapest-Pécs.


a) tudása

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit: (sejtbiológia)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Sveiczer Ákos, egyetemi docens, PhD


Medgyes-Horváth Anna, tudományos segédmunkatárs, PhD

(14.) Tantárgy neve: Transzgénikus élőlények: GMO-k, génterápia Kreditértéke: 2




Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők : témabeszámoló

48

szakirodalom alapján


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: egyéni feladatok, esettanulmányok




A tantárgy célja megismertetni a hallgatókat az transzgénikus élőlények előállításának és felhasználásának módszereivel, továbbá az ezen témákhoz kapcsolódó jogi szabályozásokkal és etikai kérdésekkel. Az előadások és egyéni feladatok során a hallgatók egyrészt elsajátítják a téma ismereteit, másrészt saját probléma-megoldási javaslatokat dolgoznak ki egyes transzgénikus transzfromációkkal kapcsolatos kérdésekre.

A tematika magában foglalja a következőket: Növényi és állati géntranszformációk. Transzformációs módszerek összehasonlító elemzése: előnyök, hátrányok. Transzgénikus élőlények felhasználása a kutatásban és a gazdaságban. Genomszerkesztési technológiák: molekuláris alapok és biotechnológiai alkalmazások


S. Parekh: The GMO Handbook: Genetically Modified Animals, Microbes, and Plants in Biotechnology

Springer Verlag, 2004, ISBN 978-1-59259-801-4

T. Yamamoto: Targeted Genome Editing Using Site-Specific Nucleases

Springer Verlag, 2015

ISBN 978-4-431-55227-7


a) tudása

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (gyógyszer biotechnológia)

b) képessége

A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére: (mezőgazdasági biotechnológia)



Mészáros Klára, címzetes egyetemi docens, tudományos főmunkatárs, MTA AgrártudományiKutatóközpont, PhD

49

(15.) Tantárgy neve: Biopolimerek Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”: 100 % (kredit%)



A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): koll.Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: előadás a feldolgozott szakirodalomtémakörében

A tantárgy tantervi helye (hányadik félév): 2.őszi



Biopolimereknek nevezzük azokat a polimereket, amelyeket vagy biológiai rendszerek (pl. mikroorganizmusok, magasabb rendű növényi vagy állat szervezetek) hoznak létre, vagy biológiai építőkövekből (pl. aminosavak, cukrok, természetes zsírok, olajok) kémiai úton állítunk elő. A tárgy megismerteti a hallgatókat a legjelentősebb biopolimerekkel, a biopolimerek kémiai szerkezetével, tulajdonságaival és legfontosabb alkalmazási területeivel.A tárgy legfontosabb témakörei: Növényi és állati eredetű poliszacharidok; Polifenolok, Poliamidok; Kémiai és mikrobiális poliészterek; Poliolok és poliuretánok; Biopolimerek feldolgozása és alkalmazása


1. Mohanty, A.K., Misra., M., Drzal, L.T. eds.: Natural fibers, Biopolymers, and Biocomposites, CRC,Taylor & Francis, Boca Raton, FL (2005)

2. Chiellini, E:, Gil, H., Braunegg, G., Buchert, J., Gatenholm, P., v.d. Zee, M. eds.: BiorelatedPolymers, Sustainable Polymer Science and Technology, Kluwer Academic/Plenum Publishers,New York (2001)

3. Yu, L. ed.: Biodegradable Polymer Blends and Composites from Renewable Resources, Wiley,Hoboken, New Jersey (2009)

4. Auras, R., Lim, L-T., Selke, S.E.M., Tsuji, H. eds.: Poly(lactic acid) Synthesis, Structures,Properties, Processing, and Applications, Wiley, Hoboken, New Jersey (2010)

5. Ek, M., Gellerstedt, G., Henriksson, G. eds.: Wood Chemistry and Biotechnology, de Gruyter,Berlin (2009)


a) tudása- átfogó ismeretek megszerzése az adott területen, tájékozottság a fejlődési lehetőségekről és irányokról, a korábbi ismerek integrálása az interdiszciplináris szakmai tárgykörökbe…….


Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Csiszár Emília, habilitált egyetemi docens, CSc

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. fokozat): -

50

(16.) Tantárgy neve: Kolloidok a biotechnológiában Kreditértéke: 2




(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: )

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők:témabeszámolószakirodalom alapján


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: egyéni feladatok, évközi beszámoló

A tantárgy tantervi helye (hányadik félév):2. tavaszi



A tantárgy célja megismertetni a hallgatókkal a kolloidkémia szerepét a biotechnológiában. Az előadások és a hallgatói témabeszámolók eredményeképpen a hallgatók képesek lesznek a biotechnológiai gyakorlatban jelentkező problémák, illetve fejlesztési feladatok megoldására a kolloidkémia sajátos eszközeivel.A tárgy tematikája magában foglalja a következőket: Kolloidkémiai alapismeretek. Diszperziók és gélek. Biokompatibilis felületek. Polielektrolitok. Biológiai jelentőségű felületaktív anyagok. Mágneses és nemesfém kolloidok. Fénymoduláló nanorészecskék. Nyomjelző nanorészecskék és molekulák. Nanoszerkezetű anyagok. Hatóanyag tárolás és leadás. Nanoanyagok terápiás célú felhasználása.


Monzer Fanun: Colloids in Biotechnology, CRC Press, Taylor and Francis Group, 2010, ISBN 9781439830802

Hórvölgyi Zoltán: A nanotechnológia kolloidkémiai alapjai, Typotex Kiadó, 2011, Budapest

Jeremy J. Ramsden: Nanotechnology: An introduction, 2016, ISBN: 978-0-323-39311-9, Amsterdam


a) tudása- átfogó ismeretek megszerzése az adott területen, tájékozottság a fejlődési lehetőségekről és irányokról, a korábbi ismerek integrálása az interdiszciplináris szakmai tárgykörökbe


Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr. Hórvölgyi Zoltán, egyetemi tanár, DSc

51


(17.) Tantárgy neve: Biokatalízis biotechnológusoknak Kreditértéke: 2




(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: angol - opcionális)

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: témabeszámolószakirodalom alapján: egyéni irodalmazási feladat + prezentáció


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: félévközi ZH + egyéni feladat +prezentáció




A tantárgy feladata a vegyipar (gyógyszer-, növényvédőszer-, finomkémiai, kozmetikai és élelmiszeriparstb.) jövendő vegyész és biológus mérnökeinek magas szintű, alaptudományi képzése, különöstekintettel a kutatás-fejlesztésben (K+F-ben) rájuk váró kémiai problémák biotechnológiai eszközökkeltörténő megoldási készség fejlesztésére.

Biotranszformációk és biokatalízisFolyamatok jellemző előnyei és hátrányai - Enzimek osztályozása és nevezéktana - Koenzimek -Enzimkinetika - Fehérjék szerkezete és enzim-működés alapjai - Körülmények hatása azenzimaktivitásra - Mikroorganizmusokkal végzett transzformációk jellemzői - Enzim- és sejtrögzítés

Új biokatalizátorok fejlesztése Génsebészeti módszerek - Biokatalizátorok termeltetése rekombináns szervezetekkel - Enzimműködésgenetikai módosításának új módszerei: "site directed mutagenesis, gene shuffling, directed evolution,metabolic engineering, random DNA cloning" - Katalítikus antitestek - Nagy áteresztőképpességűtesztmódszerek – De novo enzimtervezés

Biokatalítikus folyamatok szelektivitásának típusai

Enyhe reakciókörülmények - Kemoszelektivitás - Regioszelektivitás - Diasztereomer szelektivitás -Diasztereotóp szelektivitás - Enantiomer szelektivitás - Enantiotóp szelektivitás - Több szelektivitásegyidejű megnyilvánulása

Biotranszformációk ipari alkalmazása

Ipari enzim és sejtrögzítés - Bioreaktorok - Ipari léptékben megvalósított szelektív biotranszformációk


Poppe, L., Novák, L.: Selective Biocatalysis: A Synthetic Approach, Verlag Chemie: Weinheim-New York: 1992. (ISBN 3-527-28372-2)

52

Faber, K.: Biotransformations in Organic Chemistry. A Textbook. 6th ed, Springer: Berlin, 2011. (ISBN 978-3-642-17392-9)

Poppe, L., Nógrádi, M. (Eds.): Stereochemistry and Stereoselective Synthesis: An Introduction, Wiley-VCH: Weinheim, 2016. (ISBN 978-3-527-33901-3)


a) tudásaátfogó ismeretek megszerzése az adott területen, tájékozottság a fejlődési lehetőségekről és irányokról, akorábbi ismerek integrálása az interdiszciplináris szakmai tárgykörökbeb) képességeiaz összefüggések felismerése, a biotechnológia értő alkalmazása a szintetikus és analítikai területen felmerülő kérdések megválaszolásában, a problémák megoldásában

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Poppe László egyetemi tanár DSc


(18.) Tantárgy neve: Biokatalízis biotechnológusoknak gyakorlat Kreditértéke: 3




(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: angol - opcionális)

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők : -


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: félévközi ZH + irodalmazási feladat




A tantárgy feladata a vegyipar (gyógyszer-, növényvédőszer-, finomkémiai, kozmetikai és élelmiszeriparstb.) jövendő vegyész és biológus mérnökeinek magas szintű gyakorlati képzése, különös tekintettel akutatás-fejlesztésben (K+F-ben) rájuk váró kémiai problémák biotechnológiai eszközökkel történőmegoldási készség fejlesztésére. Forma: 6 x 4 óra gyakorlat

1) Rekombináns enzim tisztítás (Fémion affinitás tisztítás)- Lipáz (Geotrichum stearothermophilus)- Fenilalanin ammónia-liáz

2) Enzim- és sejtrögzítés- Lipáz enzim rögzítése szilárd hordozóra, rögzítés jellemzése- Ketoreduktáz aktivitású egész sejtek rögzítése

3) Biotranszformációk hidrolázokkal - Oktil acetát előállítás lipázzal- Biodízel gyártás trigliceridből bioetanollal

53

4) Biotranszformációk egész sejtes ketoreduktáz rendszerekkel - Acetecetészter bioredukciója

5) Biotranszformációk fenilalanin ammónia liázokkal I- Fahéjsav előállítása L-fenilalaninból (UV), enzimkinetika- Reakció tisztított enzimmel és egész sejtes biokatalizátorral

6) Biotranszformációk fenilalanin ammónia liázokkal II- L-fenilalanin előállítása fahéjsavból: aszimmetrikus szintézis - Reakció tisztított enzimmel és egész sejtes biokatalizátorral


Illanes, A.: Enzyme Biocatalysis: Principles and Applications, Springer: Dordrecht: 2008. (ISBN 978-1-4020-8360-0), részletek

Bommarius, A. S.; Riebel B. R.:Biocatalysis: Fundamentals and Applications, Wiley-VCH: Weinheim: 2004. (ISBN: 3-527-30344-8), részletek


c) tudásaGyakorlati ismeretek és készségek megszerzése az adott területen, tájékozottság a fejlődési lehetőségekről és irányokról, a korábbi ismerek integrálása az interdiszciplináris gyakorlati és elméleti anyagbad) képességeia biotechnológia gyakorlati alkalmazása a szintetikus eljárások biotechnológiai eszközökkel történő megoldására

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Poppe László, egyetemi tanár, DSc


Dr. Weiser Diána, tud. munkatárs, PhD

(19.) Tantárgy neve: A gyógyszerfejlesztés fázisai Kreditértéke: 1


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”: 100% elméleti (kredit%)


(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: magyar/angol)


54



A tantárgy tantervi helye (hányadik félév): 2. (tavaszi félév)



A gyógyszerfejlesztés első lépése az úgynevezett célmolekulák keresése, amely a kutatási központok folyamatos tevékenysége, amelyet az ún. vezérmolekula keresése és az optimalizálás követ. A következőlépés az 1-2 évig tartó preklinikai értékelés, ennek során feltérképezik, hogy az adott szervrendszerre milyen hatással van a molekula, ebből milyen gyógyszer fejleszthető. A fejlesztések során az állatok védelméről és kíméletéről szóló törvényben foglaltak szerint külön gondot fordítanak az állatok tartására, és a kísérletek elvégzésének módjára, hogy a kísérletek a lehető legkevesebb fájdalommal és kellemetlenséggel járjanak az állatok számára. Amennyiben a készítmény tovább fejleszthető, elkezdődhet a humán klinikai vizsgálat, amely – különböző fázisokban – jellemzően 5-8 évig tart (forrás: magyosz.hu).


ajánlott: pl. Raymond G. Hill, Humphrey P. Rang: Drug Discovery & Development (Technology in transition). Second Edition. Churchill Livingstone Elsevier. 2013. ISBN 978-0-7020-4299-7


a) tudása

- Tisztában van a biotechnológiai tevékenységek jogi, etikai, közgazdasági, minőségbiztosítási és biztonsági, valamint az élelmiszerlánc-biztonsági környezetének a szabályozásával

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr. Kacskovics Imre, egyetemi tanár, DSc

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. fokozat): Dr. DomonkosDávid, főosztályvezető, PhD

(20.) Tantárgy neve: Alapkutatástól a célzott daganatterápiáig Kreditértéke: 2



A tanóra típusa: ea.és óraszáma: 28 az adott félévben,

Nyelve: magyar/angol

55

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Az ismeretanyag egyrésze otthoni feladatként elsajátítandó


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: az előadássorozat végén tesztet írnak ahallgatók




Bevezetés a jelátviteli folyamatokba, protein domének szerepe a jelátvitelben, inozitol foszfolipidekkel működő jelpályák leírása, növekedési faktorok jelpályái, inzulin jelátvitele, a sejtciklus szabályozása, restrikciós pontok, daganatok kialakulásának molekuláris alapjai, programozott sejthalál, célzott daganatterápia, írásbeli tesztvizsga


1, Ádám Veronika (szerk.), Orvosi Biokémia, Medicina, 2006, ISBN: 9789632429021

2, Mandl József, Mahovich Raymund (szerk.), Orvosi Pathobiokémia, Medicina, ISBN: 9789632260631

3, Gomperts, Kramer, Tatham, Signal Transduction, Elsevier, 2009, ISBN: 9780123694416


a) tudása

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (Orvosi biotechnológia).

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (Orvosi biotechnológia).

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Buday László, intézet igazgató (MTA TTK), DSc


(21.) Tantárgy neve: Biokonjugátumok: szintézis, jellemzés, alkalmazás Kreditértéke: 2

A tantárgy besorolása:kötelezően választható


56

A tanóra típusa: ea. és óraszáma: 28 óra az adott félévben,

(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve:angol)

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Hallgatói prezentációk.


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: Hallgatói prezentációk értékelése, vita,megbeszélés




A biokonjugátumok fontos és egyre növekvő szerepet játszanak a biomolekuláris tudományokban, a gyógyszerkutatásban, a biotechnológiai iparban. Biokonjugátumok szintézise: funkciós csoportok, kapcsolási technikák, speciális szempontok. Tisztítás: módszerek és gyakorlat. Analitika: alkalmazható módszerek, elemzés, előnyök, hátrányok. A szerkezetvizsgálat különleges nehézségei és a megoldás lehetőségei. Felhasználás: esettanulmányok, biokonjugátumok a gyógyszerkutatásban, a diagnosztikum fejlesztésben, az elválasztástechnikában, a biokémia, a biofizika, az immunológia, a sejtbiológia, az orvosbiológia (hatásmechanizmus kutatás), valamint a farmakológia (hatóanyagok célbajuttatása, "controlled release") terén.


G. T. Hermanson: Bioconjugate techniques, Elsevier, 3rd edition, 2013

M. Aslam, A. Dent: Bioconjugation Protein coupling, Macmillan Reference Ltd., 1998

S. S. Wong: Chemistry of protein conjugation and cross-linking, CRC Press, 1999

C. M. Niemeyer: Bioconjugation Protocols: Strategies and Methods, Springer, 2004

R. Narain (Ed.): Chemistry of Bioconjugates: Synthesis, Characterization, and Biomedical Applications,Wiley, 2014


a) tudása

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel a kémiai biológia területén


b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (orvosi biotechnológia).

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr. Hudecz Ferenc, egyetemi tanár, DSc


57

(22.) Tantárgy neve: Bionanotechnológia Kreditértéke: 2



A tanóra típusa: ea. és óraszáma: ea 28 az adott félévben,(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve: …………………)







A tantárgy célja megismertetni a biológiai rendszerekben előforduló, illetve biológiai eredetű anyagokra jellemző kolloidkémiai, nanoszerkezeti tulajdonságokat, és alapot nyújtani a bionanorendszerek kísérletitanulmányozását célzó gyakorlathoz. Az előadás fő témakörei: Biopolimerek kémiai és fizikai jellemzése. Önrendeződés és szerveződés biológiai rendszerekben. A nanorendszerek típusai, kialakulásuk és szerkezeti leírásuk. Az amfipatikus jelleg és következményei. Határfelületi kölcsönhatások, adszorpció, nem specifikus és specifikus kötődés. Gyógyszerhordozó nanorendszerek jellemzői, típusai és az alkalmazást befolyásoló tényezők. Biokompatibilis nanorészecskék a diagnosztikában és képalkotásban.


W. Norde: Colloids and Interfaces in Life Sciences and Bionanotechnology, sec. ed. CRC Press, Boca Raton 2011 ISBN 978-1-4398-1718-6

G. Ma, Z. Su: Microspheres and Microcapsules in Biotechnology Design, Preparation and ApplicationsPan Stanford Publ. Singapore 2013 ISBN 978-981-4316-47-7


a) tudása

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (gyógyszer-biotechnológia)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Kiss Éva egyetemi tanár DSc

58


Mészáros Róbert egyetemi tanár DScVarga Imre egyetemi docens PhD

(23.) Tantárgy neve: Bionanotechnológia gyakorlat Kreditértéke: 3



A tanóra típusa: gyak. és óraszáma: gyak. 28 óra az adott félévben,




Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: jegyzőkönyvek értékelése




A gyakorlat keretében a hallgatók megismerkednek a biomakromolekulák, és egyéb biológiai szempontból fontos nanorészecskék stabilitásának és önszerveződésének jellemzésére széleskörűen használt módszerekkel: dinamikus és sztatikus fényszóródásmérés, elektroforetikus mobilitás mérés, lipid monorétegek, birétegek és vezikulumok alakalmazási módjai, Langmuir-Blodgett filmek, Atomi erő mikroszkópia, Felületi plazmon rezonancia (SPR) mérések, aszimmetrikus áramlási tér (AFFF) szeparáció.


Wujing Xian: A Laboratory Course in Biomaterials, CRC Press, New York, 2009ISBN 978-1-4200-7582-3

Dr. Gérrard Eddy Jai Poinern: A Laboratory Course in Nanoscience and Nanotechnology, CRC Press, Boca Raton, 2015ISBN 978-1-4822-3104-5


a) tudása


59

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Varga Imre, habilitált docens, PhD.


Mészáros Róbert, egyetemi tanár,DScKiss Éva, egyetemi tanár,DSc

(24.) Tantárgy neve: Fénymikroszkópos technikák Kreditértéke: 2



A tanóra típusa: ea. és óraszáma:, 28 óra az adott félévben,


Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: 6 alkalommalelőadás,2x4 órás demonstrációs gyakorlat tömbösítve

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): koll. (írásbeli vizsga)





A fénymikroszkóp általános felépítése, kontrasztfokozó technikák ismertetése. A fluoreszcencia alapelvei, fluoreszcens festékek és molekulák sajátságainak ismertetése. Az optikai szeletelés módjai. Élő sejtes vizsgálatok, kvantitatív mikroszkópia. Molekuláris interakciók, transzportfolyamatok mikroszkópos megjelenítése. Szuperrezolúciós mikroszkópia. Gyakorlati demonstráció a fényút helyes beállítására, az objektívek és a mikroszkóp helyes használatára. Optikai rétegfelvételek készítése konfokális mikroszkópokkal. Élő sejtes vizsgálatok: Ca imaging, fluoreszcens molekulák intracelluláris transzportja, spektrális detektálás.


Handbook of biological confocal microscopy. Edited by J. B. Pawley. Springer. ISBN 978-1-4757-5350-9.Basic confocal microscopy. Edited by Robert L. Proce and W. Gray Jerome. Springer. ISBN 978-0-387-78174-7online tutorial oldalakelőadás jegyzet pdf-ben


e) tudása

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit a sejtbiológia területén

60

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dr Schlett Katalin, docens, PhD


Dr. Tárnok Krisztián, adjunktus, PhD

Bencsik Norbert, tanársegéd

(25.) Tantárgy neve: Környezeti mikrobiológia és biotechnológia Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”: 90% elméleti (kredit%)

A tanóra típusa: ea. és óraszáma:28 óra az adott félévben,




Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: A kollokvium a hallgató általánosfelkészültségét ellenőrző számítógépes teszttel kezdődik, amelynek eredménye alapján (megfelelt/nemfelelt meg) vehet részt a szóbeli vizsgán




Az élőlények környezet-állapot változtató anyagcsere folyamatai és egyéb aktivitásai: energetikai anyagcsere, elsődleges és másodlagos anyagcsere termékek, kooxidáció (kometabolizmus), bioakkumuláció. Környezetszennyező anyagok, mint szubsztrátok.Alapvető környezeti biotechnológiák:biostimuláció, bioaugmentáció, immobilizált enzim- és sejttechnikák. Oltóanyagok, GMO kibocsátás.Növekedési görbe, lebontás kinetikája. Toxikus hatások. Szuszpendált sejtek és biofilmek.A komposztálás mikrobiológiája és biotechnológiája. A szennyvíz- és szennyvíziszap- kezelés mikrobiológiája és biotechnológiája. „Alternatív” eljárások.Víz-, talaj-, és légszennyeződések mikrobiológiája. Hulladékkezelés és remediáció. Környezet-terhelés és öntisztulás. A mikrobiológiai környezeti analitika alapvető módszerei. Környezeti kockázatbecslés. Jogi szabályozás.


61

Márialigeti Károly (Szerk.): Bevezetés a prokarióták világába. ©2013 Eötvös Loránd Tudományegyetem. http://elte.prompt.hu/sites/default/files/tananyagok/BevProkariotakVilagaba/book.pdf

Erika M. Tóth and Károly Márialigeti (Eds.): Practical Microbiology. Department of Microbiology, Institute of Biology, Faculty of Science, Eötvös Loránd University,Budapest, ©2013. http://ttktamop.elte.hu/sites/ttktamop.elte.hu/files/tananyagok/practical_microbiology.pdf

Borsodi Andrea és Márialigeti Károly: MIRE KÉPESEK A BAKTÉRIUMOK? A prokarióták világáról tanároknak. ©2015 Eötvös Loránd Tudományegyetem.http://pedagoguskepzes.elte.hu/images/anyagok/i3/9_A_prokariotak_vilagarol_tanaroknak.pdf

Kurt O. Konhauser: Introduction to GeomicrobiologyISBN: 978-0-632-05454-1, ©2006, Wiley-Blackwell

Michael T. Madigan, John M. Martinko, Kelly S. Bender, Daniel H. Buckley, David A. Stahl, Thomas Brock: Brock Biology of Microorganisms, 14th EditionISBN-10: 0-321-89739-0, ISBN-13: 978-0-321-89739-8, © 2015, Pearson


a) tudása

- Biotechnológia történetének ismerete- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (környezet biotechnológia)- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel a produkció biológia és fenntartható fejlődés illetve a toxikológia és ökotoxikológia területén

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésérekörnyezet biotechnológia területén

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Márialigeti Károly, egyetemi tanár, az DSc

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. fokozat): Romsics Csaba,tudományos segédmunkatárs

(26.) Tantárgy neve: Környezeti mikrobiológia és biotechnológiagyakorlat

Kreditértéke: 3




(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve:)

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők:tömbösítve

62


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: a gyakorlatok során jegyzőkönyvet kellkészteni; a gyakorlati jegyet az órai munka, a jegyzőkönyv, valamint a gyakorlat befejeztével írandózárthelyi eredményeinek átlagából számítjuk




A mikrobiológiai mintavételezés alapvető jellemzői, levegő mintavétel, vízmintavétel, üledék- és talajmintavétel, növények és állatok mikrobiotájának mintázása. Talaj mikrobiális aktivitások vizsgálata (CO2, metán termelés mérése, enzimaktivitások, Biométer palack, OxiTop); Speciális bontó aktivitású dúsító tenyészetek készítése, törzstenyészetek. Biomassza és csíraszám becslési eljárások (foszfolipid-foszfát, hígítás-szélesztés, MPN módszer, sejtszámlálás), anaerob tenyésztés, Winogradsky-oszlop vizsgálata; Környezeti paraméterek meghatározása vízmintákból, gyorsdiagnosztikai eljárások; Nitrogén körforgalomban résztvevő mikroorganizmusok vizsgálata; Növény-asszociált baktériumok vizsgálata; Mikrobiológiai és környezeti változók együttes elemzése (PAST program); Környezettechnológiai üzem meglátogatása.


Márialigeti Károly (Szerk.): Bevezetés a prokarióták világába. ©2013 Eötvös Loránd Tudományegyetem. http://elte.prompt.hu/sites/default/files/tananyagok/BevProkariotakVilagaba/book.pdf

Erika M. Tóth and Károly Márialigeti (Eds.): Practical Microbiology. Department of Microbiology, Institute of Biology, Faculty of Science, Eötvös Loránd University,Budapest, ©2013. http://ttktamop.elte.hu/sites/ttktamop.elte.hu/files/tananyagok/practical_microbiology.pdf

Borsodi Andrea és Márialigeti Károly: MIRE KÉPESEK A BAKTÉRIUMOK? A prokarióták világáról tanároknak. ©2015 Eötvös Loránd Tudományegyetem.http://pedagoguskepzes.elte.hu/images/anyagok/i3/9_A_prokariotak_vilagarol_tanaroknak.pdf

Kurt O. Konhauser: Introduction to GeomicrobiologyISBN: 978-0-632-05454-1, ©2006, Wiley-Blackwell

Michael T. Madigan, John M. Martinko, Kelly S. Bender, Daniel H. Buckley, David A. Stahl, Thomas Brock: Brock Biology of Microorganisms, 14th EditionISBN-10: 0-321-89739-0, ISBN-13: 978-0-321-89739-8, © 2015, Pearson


a) tudása

- Biotechnológia történetének ismerete- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (környezet biotechnológia)- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel a produkció biológia és fenntartható fejlődés illetve a toxikológia és ökotoxikológia területén

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésérekörnyezet biotechnológia területén

63

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Márialigeti Károly, egyetemi tanár, az DSc

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. fokozat): Romsics Csaba,tudományos segédmunkatárs

(27.) Tantárgy neve: A fehérjekrisztallográfia módszerei Kreditértéke: 2





Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: A félév végéig egy, amódszerhez kapcsolódó szakcikk feldolgozása és bemutatása kiselőadás formájában.

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): koll. (háromfokozatú skála)

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: .




A röntgendiffrakció elméleti alapjai, a módszer lehetőségei és korlátai. A szerkezet-meghatározás során alkalmazott alapfogalmak és függvények (a diffrakció feltétele, szerkezeti tényező, kristályszimmetriák, a diffrakciós mintázat szimmetriái, fázisprobléma, felbontás). A szerkezet-meghatározás lépései: kristályosítás; adatgyűjtés, hagyományos és korszerű sugárforrások; a fázisprobléma megoldása; modellépítés, elektronsűrűségi térképek értelmezése; szerkezetfinomítás. Az atomi szintű fehérjeszerkezet értékelése és értelmezése. Speciális problémák és új irányzatok fehérjekrisztallográfiában: szerkezeti genomika, nagy molekulakomplexek vizsgálata, membránfehérjék,időfelbontásos krisztallográfia, SSX, SFX mérések. Kitekintés: más diffrakción alapuló módszerek.


Bényei Attila, Harmat Veronika: "Röntgendiffrakciós szerkezetvizsgálat" Debreceni Egyetem 2013, Digitális tankönyvtár, (http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop412A/2011_0025_vegy_1) Gale Rhodes: "Crystallography Made Crystal Clear. A Guide for Users of Macromolecular Models" 3rd edition, Academic Press (2006) ISBN: 978-0-12-587073-3


a) tudása

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel az anyagvizsgálati módszerek területén

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Harmat Veronika, adjunktus, PhD

64

http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop412A/2011_0025_vegy_1


Karancsiné Menyhárd Dóra, tudományos főmunkatárs, PhD

(28.) Tantárgy neve: A fehérjekrisztallográfia módszerei gyakorlat Kreditértéke: 3



A tanóra típusa: gyak.. és óraszáma: 28 az adott félévben,(ha nem (csak) magyarul oktatják a tárgyat, akkor a nyelve:magyar/angol)Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Tömbösítettlaboratóriumi gyakorlat.

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): gyj.Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: A gyakorlatok során készített jegyzőkönyvek ésaz eredmények összefoglalójának értékelése.




A fehérjekrisztallográfiai szerkezetmegoldás lépései. Fehérjekristályosítás. A fehérjekristályok tesztelése, röntgendiffrakciós adatgyűjtés, mérési stratégiák. Adatredukció. A fázisprobléma megoldása (molekuláris helyettesítés). Modellépítés: különböző felbontású elektronsűrűségi térképek értelmezése. szerkezetfinomítás, finomítási stratégiák értékelése. A szerkezet validálása, PDB adatbázis.


Bényei Attila, Harmat Veronika: "Röntgendiffrakciós szerkezetvizsgálat" Debreceni Egyetem 2013, Digitális tankönyvtár, (http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop412A/2011_0025_vegy_1) Gale Rhodes: "Crystallography Made Crystal Clear. A Guide for Users of Macromolecular Models" 3rd edition, Academic Press (2006) ISBN: 978-0-12-587073-3


a) tudása

-Ismeri a biológiai makromolekulák (fehérjék, nukleinsavak és komplexeik) röntgendiffrakciós szerkezetvizsgálatának kurrens módszereit és a legleterjedtebben alkalmazott gyakorlati módszereket, eszközöket és szoftvereket.

b) képességei

-Képes a röntgen-krisztallográfiai tudását kísérlet-tervezésben és a kutatás során felmerülő gyakorlati problémák megoldásában felhasználni. -Képes a krisztallográfia és más szerkezetvizsgáló módszerek eredményeit kritikusan értékelni, értelmezni és a kutatásban alkalmazni.

c) attitűdje-Törekszik az atomi szintű fehérje-szerkezetkutatás legújabb eredményeinek folyamatos megismerésére és alkalmazására kutatási témáinak művelése során.

65

http://www.tankonyvtar.hu/hu/tartalom/tamop412A/2011_0025_vegy_1

d) autonómiája és felelőssége-Felelősen betartja és betartatja mind a fehérje-előállítás és fehérje kristályosítás során végzett,mind a röntgensugárzással végzett tevékenységekre vonatkozó jogi, etikai, minőségbiztosítási és biztonsági előírásokat.-Rendelkezik fehérje szerkezet-funkció összefüggések feltárásához szükséges kritikai megközelítésmód képességével és szakmai tájékozottsággal, valamint a több tudományterület eredményeinek ötvözéséhez szükséges együttműködési képességgel.

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Harmat Veronika, adjunktus, PhD

Tantárgy oktatásába bevont oktató(k), ha van(nak)(név, beosztás, tud. fokozat):Karancsiné Menyhárd Dóra, tud fmts, PhD

(29.) Tantárgy neve: Növényi biotechnológia Kreditértéke: 2





Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Az ismeretanyagrészben otthoni feladatként sajátítandó el.






A biotechnológia módszerek növényeken történő alkalmazásának lehetőségeit, eredményeit tárgyaljuk az előadássorozat keretében, elsősorban elméleti megközelítésben, de kitekintünk az iparban (agrár, gyógyszer, élelmiszer) való alkalmazási lehetőségekre is. Ismertetjük a növényi sejtkultúra, a szövettenyésztés elméleti és gyakorlati alapjait, felhasználhatóságukat ipari alapanyagok előállítására. Az előadás sorozat felöleli a növény genetikai állományának módosítására szolgáló módszerek elméleti és gyakorlati alapjainak részletes ismertetését. A tananyag célja továbbá a géntechnológia növénynemesítésben való alkalmazásának ismertetése, a növényi genomprogramok eredményeinek felhasználása a hagyományos, a TILLING és a géntechnológiai módszerekkel történő nemesítésben. Foglalkozik a tárgy a funkcionális élelmiszerek biotechnológiai úton való előállításával, valamint a molekuláris mezőgazdaság (molecular farming) alkalmazásának lehetőségeivel is. Fontos része az előadás sorozatnak a növényi biotechnológia módszertanának és alkalmazási lehetőségeinek ismertetése a ’biopharmaceutical’ ipar szolgálatában.

A 2-5 legfontosabb kötelező, illetve ajánlott irodalom (jegyzet, tankönyv) felsorolása bibliográfiai

66

adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN)

Dudits Dénes, Heszky László Növényi biotechnológia és géntechnológia. Agroinform Kiadó Bp. 2000

Loyola-Vargas V.M., Ochoa-Alejo N. Plant Cell Culture Protocols. Humana Press, 2012

Wang A., Ma S. Molecular Farming in Plants. Springer 2012


a) tudása

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (mezőgazdasági biotechnológia: élelmiszer biotechnológia)

- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit főleg a genetikailag módosított szervezetek előállítása és felhasználásának környezeti kockázata területen

- Rendelkezik a munkavégzéshez szükséges szakmai ismeretekkel (produkció biológia és fenntartható fejlődés)

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (mezőgazdasági biotechnológia: élelmiszer biotechnológia)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Tamás László, egyetemi docens, Ph.D.


(30.) Tantárgy neve: Növényi biotechnológia gyakorlat Kreditértéke: 3





Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: jegyzőkönyv készítése






Növényi szövettenyésztés, regeneráció egysejtkultúra előállítása, fehérje izolálása transzgénikus egysejtkultúrából, növénytranszformálás agrobaktérium módszerrel (mag sterilezés, csiráztatás, explant

67

preparálás, innokulálás baktériummal, szelekció), transzgénikus növények ellenőrzése DNS, mRNS és fehérje oldalról.


Loyola-Vargas V.M., Ochoa-Alejo N. Plant Cell Culture Protocols. Humana Press, 2012Research methods in plant biology (elektronikus tankönyv)


a) tudása

- Biotechnológia egyes részterületeinek elméleti és gyakorlati ismerete (mezőgazdasági biotechnológia: élelmiszer biotechnológia)- Ismeri az új, alapvetően molekuláris biológiai szemléletű biotechnológia kialakulását és fejlődését lehetővé tevő diszciplínák legújabb eredményeit főleg a genetikailag módosított szervezetek előállítása és felhasználásának környezeti kockázata területen

b) képességei

- A biotechnológia területéhez kapcsolódó valamennyi részterületen (különösen a fermentáció és bioanalitika területén) képes kutatási tevékenységek végzésére, kezdeményezésére, vezetésére (mezőgazdasági biotechnológia: élelmiszer biotechnológia)

Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Tamás László, egyetemi docens, Ph.D.


(31.) Tantárgy neve: Rendszerbiológia és "omika" tudományok Kreditértéke: 2




nyelve:magyar/angol

Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők.: Egyes témákat ahallgatók otthoni feladatként dolgoznak fel. Választott témából a hallgatók kiselőadást tartanak a félévvégén.

A számonkérés módja: koll. / gyj. / egyéb: koll.

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: írásbeli teszt,




68

Hipotézis-alapú vs. high-throughput molekuláris biológia. Alapvető gráftulajdonságok: összefüggőség, folyamok, vágások. Fontos csúcsok keresése. Fehérje-fehérje interakciós hálózatok, mint gráfok. Metabolikus hálózatok és analízisük: ábrázolás és következtetések, fluxus megoszlások és következményeik, modularitás és jellemzői. Hálózatok hálózata: az élőlény, mint hálózatok összessége. A valós, skálamentes hálózatok kialakulását befolyásoló tényezők – modellek és értelmezések. A hálózatok ellenőrizhetőségének feltételei. A hálózatok fraktálos természete és következménye. Rendszer ingadozások: a véletlen zaj jellemzői, forrásai és szerepe biológiai rendszerekben. Génexpressziós és jelátveteli hálózatok; működési alapelvek; modellezés; chemotaxis; fehérje szint szabályozása; hogyan történik a sejtben a döntéshozatal. Élő rendszerek újratervezése. Minimális genomok előállítása. A proteomika mint gondolkozásmód és kísérleti stratégia. A proteomika centrális szerepe a rendszerbiológiában. Betegségek rendszerbiológiai megközelítése. Orvosi ontológiák kialakítása. Egyénre szabott orvoslás. Biomarkerek azonosítása és felhasználása. Rendszerbiológiai megközelítés a farmakológiai kutatásban. High-throughput technikák alkalmazása a gyógyszerkutatásban. Neuronális kapcsolatrendszerek feltérképezésére alkalmas képalkotó technikák: connectomics.



Ludányi Andrea (szerk): A fehérjekutatás modern módszertana. Medicina Könyvkiadó, Budapest, 2011.


a) tudása


Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Dobolyi Árpád, docens, PhD, DSc


Nyitray László, egyetemi tanár, PhD, DSc

Venekei István, docens, PhD

Dosztányi Zsuzsa, tudományos főmunkatárs, PhD

Kékesi Adrienna Katalin, docens, PhD

(32.) Tantárgy neve: Természetes eredetű hatóanyagok Kreditértéke: 2


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”:100% (kredit%)

69



(Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők): Egyes témákat ahallgatók otthoni feladatként dolgoznak fel.


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok: -




Természetes hatóanyagok fő típusai és előfordulásuk különböző élőlénycsoportokban (növény, gomba, állat, prokarióta). A növényi, gomba és prokarióta másodlagos anyagcsere jelentősége a hatóanyagok képzésében. Drogformák. Bioaktivitás vizsgálatának lehetőségei. Fő hatóanyagok a szénhidrátok, savak,zsírosolajok, fenoloidok, alkaloidok és egyéb nitrogén-tartalmú vegyületek, terpenoidok csoportjaiban; természetes eredetű antibiotikumok, antifungális szerek; különböző toxinok és mérgező vegyületek: legfontosabb növényi, állati, gomba és mikrobiális példák. Etnobotanikai kitekintés.


Ajánlott:

Szőke Éva (szerk.), Kéry Ágnes (szerk.), Lemberkovics Éva (szerk.): Farmakognózia + CD; Semmelweis Kiadó és Multimédia Stúdió (2009) ISBN: 9789639879515

Csupor Dezső, Szendrei Kálmán: Gyógynövénytár (2., bővített, javított kiadás); Medicina Könyvkiadó Zrt. Budapest (2012) ISBN: 978-963-226-378-6


a) tudása


Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Kovács M. Gábor, egyetemi docens, Ph.D., dr.habil.


Boldizsár Imre, egyetemi adjunktus, Ph.D.

(33.) Tantárgy neve: Természetes eredetű hatóanyagok gyakorlat Kreditértéke: 3

70


A tantárgy elméleti vagy gyakorlati jellegének mértéke, „képzési karaktere”:100% GY (kredit%)


(Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők : Tömbösített gyakorlat(4 nap). Egy választott hatóanyag(csoport) és alkalmazásának bemutatása kiselőadás formájában.


Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további (sajátos) módok : jegyzőkönyv és kiselőadás értékelése




Természetes eredetű hatóanyag-források minőségi ellenőrzésének megismerése; mikroszkópos diagnosztikai módszerek használata; főbb drogformák és ezek vizsgálati/azonosítási lehetőségei; hatóanyagok citokémiai módszerekkel történő detektálása; nagyobb természetes hatóanyagcsoportok vizsgálata: kivonatok előállítása; az elkészített kivonatok összes hatóanyagtartalmának és összetételénekmeghatározása: kromatográfiás módszerek (vékonyréteg- és nagyhatékonyságú folyadékkromatográfia) gyakorlati felhasználása a természetes hatóanyagok azonosításban és mennyiségi meghatározásban.


Ajánlott:

Szőke Éva (szerk.), Kéry Ágnes (szerk.), Lemberkovics Éva (szerk.): Farmakognózia + CD; Semmelweis Kiadó és Multimédia Stúdió (2009) ISBN: 9789639879515

Csupor Dezső, Szendrei Kálmán: Gyógynövénytár (2., bővített, javított kiadás); Medicina Könyvkiadó Zrt. Budapest (2012) ISBN: 978-963-226-378-6


a) tudása


Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Boldizsár Imre, egyetemi adjunktus, Ph.D.


Kovács M. Gábor, egyetemi docens, Ph.D., dr. habil.

71

(34.) Tantárgy neve: Tumorbiológia Kreditértéke: 2





Az adott ismeret átadásában alkalmazandó további (sajátos) módok, jellemzők: Előadások diáielektronikus formában elérhetőek.

A számonkérés módja (koll. / gyj. / egyéb): koll. (C típus)

Az ismeretellenőrzésben alkalmazandó további módok: 2 db évközi zárthelyi




A tumorok kialakulását kísérő genetikai és sejtbiológiai változások részletes megismerése, tumorok osztályozása, a lehetséges kiváltó okok taglalása, a tumor progresszió és áttétképződés biológiájának elsajátítása. A terápiás lehetőségek ismertetése néhány kiválasztott példán keresztül.


Kopper L, Jeney A. (2002) Onkológia a géntől a betegágyig, Medicina könyvkiadó, ISBN: 963242739R.A. Weinberg (2013) The Biology of Cancer, Garland Science Publishing, ISBN: 9780815342205


a) tudása


b) képességei


Tantárgy felelőse (név, beosztás, tud. fokozat): Juhász Gábor, egyetemi tanár, DSc


Hegedűs Krisztina, tudományos munkatárs, PhD

72

Documents

kutatok.orgkutatok.org/abettt/wp-content/uploads/2016/10/tantargyleirasok.pdf · Ismeretkörök/tantárgyi programok, tantárgyleírások Az ismeretkör: Általános természettudományi