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Laboratoire Commun de Microbiologie
Laboratoire Commun de Microbiologie LCM-UCAD/IRD/ISRA, Centre de Recherche ISRA/IRD de Bel-Air, BP. 1386, CP. 18524
Dakar-Sénégal
Unité de Microbiologie:
Créée en 2004 du laboratoire de biologie des sols de l’IRD
Implantée au centre de recherche ISRA/IRD à Bel air
Rattachée à l’UMR113/LSTM IRD-CIRAD-UM2-INRA
Renforcée par l’UMR232/DIADE/IRD-UM2 en 2010
Regroupe des chercheurs et enseignants-chercheurs de l’UCAD, de l’IRD et de l’ISRA
Structurée en une équipe de recherche
Laboratoire Commun de Microbiologie
Objectif principal:Développer des recherches sur la diversité et le fonctionnement des symbioses fixatrices d’azote et mycorhiziennes en vue de leur utilisation pour améliorer la productivité végétale et la fertilité des sols.
Objectifs spécifiques:Caractériser la diversité des microorganismes symbiotiques (rhizobiums et champignons mycorhiziens) Etudier les mécanismes d’adaptation des symbioses végétales aux contraintes édaphiques (salinité, sécheresse) Evaluer l’impact des communautés microbiennes symbiotiques sur la régénération naturelle des peuplements forestiers et sur la revégétalisation des sols salésEtudier l’impact des essences introduites sur la structure et les fonctions des communautés microbiennes natives Utiliser les symbioses pour améliorer la productivité végétale et la fertilité des sols.
Objectifs scientifiques
EctomycorhizesNodule
s
Mycorhizes à
arbuscules
Plantes étudiées: niébé, arachide, Acacia, Coccoloba, Casuarina, Eucalyptus, Gilbertiodendron, Jatropha, Graminées fourragères
rhizobiums, Frankia
Champignons
Production scientifique(Publication, brevet)
Communautés symbiotiques
Microflore
Sol
2
Structure du solMacro-éléments (N, P)Stress abiotiques
3
1
Communautés végétales Mise en place et adaptation des symbioses
Régénération, productivité et durabilité des
écosystèmes naturels ou anthropisés
FORMATION ET VALORISATION
Formation(Master, thèse)
Transfert de technologie
(Producteur, PME champignons comestibles)
Végétation
54
Caractéristiques physico-chimiques
Communautés non symbiotiques
AXES DE RECHERCHE
Axe 1: Analyse de la structure et de la diversité fonctionnelle des communautés de symbiotes microbiens
Axe 2: Interactions entre flore non symbiotique et flore symbiotique du sol
Axe 3: Interactions entre les caractéristiques physico-chimiques du sol et les communautés de symbiotes fongiques et bactériens
Axe 4: Interactions entre la couverture végétale et la structure et la diversité fonctionnelle des communautés mycorhiziennes et rhizobiennes des sols
Axe 5: Impact de la diversité des symbiotes fongiques et bactériens sur l’adaptation des plantes aux stress abiotiques, la productivité et la durabilité des écosystèmes naturels ou anthropisés
AXES DE RECHERCHE
Microbiologie (hottes, étuves etc.) Plateforme en microscopie (optique, loupe bino…) Biologie moléculaire (amplificateur ADN, électrophorèse,
lecteur de gel...) Conservation de souches (congélateurs -20°C, -80°C) Chambres de culture, serres, dispositifs expérimentaux en
milieu paysan, en forêt
OUTILS
Forte implication du LCM dans les formations de l’UCAD:
Coordination du Master Biotechnologies végétale et microbienne, et de la Licence Professionnelle en Agronomie
Enseignements dans les Masters Biotechnologies végétale et microbienne, Ecologie et Agroforesterie, Biomathématique-Bioinformatique, Phytopharmacie et protection des végétaux, Master International de Biotechnologies tropicales
Laboratoire d’accueil (Master 2 et thèse) de l’école doctorale « Sciences de la Vie, de la Santé et de l’Environnement »
De nouveaux modules d’enseignement en génomique dans le Master Modélisation des Plantes et Bio-informatique et en écophysiologie végétale dans le Master Ecologie et Agroforesterie
FORMATION
VALORISATION
Transfert de la technique de l’inoculation auprès des producteurs
Publications et brevets
Projet sur la production de champignons comestibles
RESSOURCES FINANCIERES
Frais structurels pris en charge par l’IRD
Parts chercheurs UMR LSTM et UMR DIADE
Projets en cours: SOLAO ANR (2008-2012), Chaire Croisée IRD/UCAD (2010-2013), 2 FIRST (2010-2012), AUF (2011-2013), FIRST (2012-2014), IFS (2012-2014)
Projets soumis : CORAF
Projets en préparation : LMI, UA, PPR-FTH, FNRAA
PARTENARIAT
Collaborations nationales : ITA, ISE, ANCAR, CNCR, CERAAS, ENSA, ROPPA, Départements de Biologie Végétale, Biologie Animale, Chimie et Biochimie ; Ecole Supérieure Polytechnique, Faculté de Médecine, Université Gaston Berger, Université de Ziguinchor, Université de Thiès, Ministère de l’Enseignement Supérieur et la Recherche Scientifique, Ministère de l’Agriculture, Ministère de l’Environnement et de la Protection de la Nature.
Collaborations internationales et régionales : Université des Antilles et de la Guyane, Université Montpellier 2, Michigan State University, Université Laval, Université d’Oran, Université Mohamed V, Université Mohamed Premier Oujda MAROC, Université Abdou Moumouni de NIAMEY (NIGER), Université d'Abomey Calavi au Bénin, Université de Bamako, Université de Nouakchott, INERA (Burkina Faso), Université de Cotonou, de Nouackchott, Université d’Alger, Université de Tananarivo, Université Cadi Ayyad (Faculté des Sciences Semlalia), KEFRI (Kenya), TSBF (Kenya), AUF, CIRAD INRA, INERA, IRAG, CILSS, UNESCO, FAO, UEMOA, AIEA (Autriche), LMI-Maroc, UMRDIA-PC, SupAgro/UM2/INRA/IRD, UMR LSTM IRD/CIRAD/SupAgro/UM2/INRA, UR SeqBio IRD, UMR CBGP INRA/IRD, Montpellier SupAgro, INRA de Dijon et INRA de Bordeaux.
SECRETARIATA. Konté
GESTION & LOGISTIQUEF. do Rego
RESPONSABLES QUALITESM. Cissoko, M. Da Sylva
CHERCHEURS PERMANENTS (14)UCAD : A. Diédhiou, T. Diop, D. Diouf, A. Kane, I. Ndoye, M. Thiao, R. Samba, S. Sylla, A. DioufIRD: A. Champion, L. Laplaze, A. BâISRA: S. Fall, D. Fall
CHERCHEURS CONTRACTUELS (3)IRD: A. Thomas (postdoc), T. Wade, N. Diagne REPRESENTANT PERSONNEL (1) ET ETUDIANT (1)
INGENIEURS & TECHNICIENS (9)IRD: J. Bakhoum, M. Cissoko, F. Do Rego, M. Faye, C. Ndiaye, P. Tendeng, A. CrabosISRA: M. Da Sylva, O. Touré
DOCTORANTS (12)N. Bakhoum, A. Dieng, M. Ngning, F. Ndoye, G. Sène, S. Sène, A. Soumaré, M. Ebenye, F. Diouf, C. Ouattara, I. Diop, F. Fall, H. Prodjinoto, I. Diedhiou
CONSEIL DE LABORATOIRE
DIRECTEUR A. Bâ
ASSEMBLEE DE LABORATOIRE
CONSEIL DE GESTION B.S. Toguebaye (UCAD), S. Fall (ISRA), G. De Noni (IRD)
Merci de votre attention