47
Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant eines de genòmica FEHM (Freshwater Ecology Hidrology and Management) Assignatura: Treball de Final de Grau Estudiant: Oriol Serra Vilarasau Universitat: Universitat de Barcelona Tutors: Cesc Múrria i Farnós Data de presentació: 03/09/2019 Grau: Ciències Ambientals ID:16563562

Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

  • Upload
    others

  • View
    2

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant eines de genòmica

FEHM (Freshwater Ecology Hidrology and Management)

Assignatura: Treball de Final de Grau

Estudiant: Oriol Serra Vilarasau

Universitat: Universitat de Barcelona

Tutors: Cesc Múrria i Farnós

Data de presentació: 03/09/2019

Grau: Ciències Ambientals

ID:16563562

Page 2: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

2

ABSTRACT

Metabarcoding, how to assess biodiversity using genomics tools

Diatoms have been traditionally used as a well-known bioindicator group referring to freshwater quality assessments and environmental changes. Heretofore the taxonomic sorting has been based on the classification through the optic microscope.

These methods are time-consuming and require from a well-qualified expert able to classify the diatoms properly. Moreover, similar taxa are likely to be misclassified while sorting them.

State-of-the-art science tools, such the genomic technology, has allowed to identify and sequencing rapidly the compositions of a large number of organisms in a single PCR. Amongst these new methods, there is the “metabarcoding”. This technique is based on massive amplification and sequenciation of DNA barcode gen fragment.

However such technique requires a reliable complete barcode reference library and yet, it has not been done for diatoms.

In this study we have compiled all the DNA barcode information available referring to diatoms from the Iberian Peninsula,and assessed which is the coverage of several genes that are pontential candidates to be designated as DNA barcodes for diatoms assure whether it can be reliable.

The information assembled from a public repositories was mainly focused on the enzyme ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcl), the 18S ribosomal RNA 18S and Citocrome oxidase subunit 1 (cox 1). The analyses of the gathered data and its assessment allowed us to understand which of the genes was the more suitable for metabarcoding.

The final dataset contains sequences information for 237 species and the rbcl gene, whereas 246 species have available data for 18S rRNA both out of 1187 species. Unfortunately, the cox 1 gene, which is commonly used in metabarcoding of metazoan, covered only the 2% of the species.

Overall, we have created a library for the 20% of the total taxonomical composition in the Iberian Peninsula for the rbcl gene and for the 21% for 18s rRNA.

Disclosing this requirement of information (approximately ~80%) for the diatoms, is clear that a barcode reference library has to be sequenced in order to improve the upcoming biomonitoring techniques.

In order to increase the coverage of DNA barcodes for the Iberian diatoms, I sampled benthonic diatoms in the Sant Llorenç NP and I have tried to isolated and cultivated species in the laboratory for finally sequencing the three candidate genes for increasing the coverage of the new Iberian DNA barcode reference library for diatoms.

Thus, contributing and inviting the new generations of scientists to deepen on the novel and promising approach to biodiversity.

Page 3: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

3

Keywords: metabarcoding, bioindicator, freshwater quality, environmental changes, DNA barcode, Rubisco, 18s rRNA.

Page 4: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

4

LLISTA DE CONTINGUT

Abreviatures....................................................................................................................5

Introducció....................................................................................................................6-8

Objectius......................................................................................................................8-9

Material i mètodes......................................................................................................9-12

Resultats..................................................................................................................12-21

Discussió..................................................................................................................22-23

Conclusions..............................................................................................................23-24

Bibliografia................................................................................................................24-26

Annex 1....................................................................................................................27-45

Annex 2....................................................................................................................46-47

Page 5: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

5

LLISTA D’ABREVIATURES

18S rRNA: 18S ribosomal RNA

Rbcl: Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase

Cox1: Citocrome oxidase subunit 1

Bp: Base pair (parell de bases)

Page 6: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

6

INTRODUCCIÓ

Les diatomees són micro-algues unicel·lulars, del grup de les Bacil·larofícies, que es poden trobar tant en aigua dolça com en aigua salada, (Round et al.,1990). Són àmpliament utilitzades en treballs i estudis de monitoratge com a bioindicador de la qualitat ecològica de sistemes aquàtics, ja que són abundants, diverses i alguns grups són molt sensibles i d’altres molt tolerants a la contaminació. La característica morfològica més significativa d’aquest grup és que els individus estan constituïts per dues valves silicatades i un cinturó que les uneix, el rafe (estria sense deposició siliacatada). El conjunt de les dues valves i el rafe s’anomena frústul (Fig.1).(Round et al., 1990).

Figura.1 Planothidium lacustres sp.nov. SEM vista. (A) Imatge exterior de la valva. (B) Imatge interior

de la valva on (A) indica el rafe. Fotografia de Blanco et al., 2013

Fins ara els mètodes morfològics per a la classificació taxonòmica de les diatomees s’han basat en l’ordenació segons la morfologia del frústul a partir de la observació de centenars d’individus al microscopi òptic. Aquests mètodes requereixen molt d’esforç i ,temps d’aprenentatge per entendre i adquirir el coneixement per ser un expert qualificat en la identificació taxonòmica de totes les espècies i, posteriorment, aplicar-los en treballs de qualitat ecològica. A més a més, tàxons molt similars també són un contratemps a l’hora de fer la identificació ja que es pot arribar a una identificació errònia de la espècie, (Keck et al.,2017)

A la Península Ibèrica hi ha una gran quantitat d’espècies de diatomees àmpliament distribuïdes en la majoria d’ambients aquàtics. Aquesta diversitat cobreix una àmplia línia evolutiva que va des de les diatomees centrals fins a les birrafídies contenint espècies tant d’aigua dolça com d’aigua salada. La classificació taxonòmica més recent de les diatomees compren quatre grans grups: (1) Coscinodiscophyceae o centrals radiades les quals presenten simetria radiada amb estructura circular de la valva; (2) Mediophyceae o centrals polars les quals presenten la valva disposada en referència a un, dos o tres punts centrals de manera que les valves poden adoptar diferents morfologies; (3) Fragilariophyceae o pennals sense rafe en les quals el frústul és pennat i no presenta rafe i (4) les Bacillariophyceae o pennals amb rafe les quals el seu frústul és pennat i presenten rafe, amb generalment forma ovalada i estries transversals(Fig.2). Dins d’aquest grup trobem els subgrups de les Eunotials, Bacilarials, Naviculals, Cymbelals, Surirellals i Thalassiofilals entre d’altres (Sila., 2016).

Page 7: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

7

Figura 2. Classificació filogenètica de les diatomees segons Silar., 2016

Les noves tecnologies moleculars, i especialment unes eines concretes de genòmica, permeten seqüenciar i posteriorment identificar la composició de molts organismes d’una comunitat molt ràpidament. Entre aquests diferents nous mètodes trobem el que s’anomena el “metabarcoding” (Taberlet et al., 2012). Aquest mètode es basa en la amplificació massiva d’un fragment d’un gen anomenat DNA barcode és a dir, el codi de barres genètic, i que permet determinar la composició de tota una comunitat en una sola reacció de PCR (Polymerase Chain Reaction). El metabarcoding aprofita les dades acumulades dels projectes basats en el DNA barcoding que és un mètode que implica (1) extreure el DNA d’un individu determinat taxonòmicament, (2) amplificar i seqüenciar el DNA barcode i (3) atribuir el fragment del DNA barcode a l’espècie concreta (Tautz et al., 2003). El fragment utilitzat com a DNA barcode és propi per a cada llinatge i ha de complir que sigui poc variable entre els individus de la mateixa espècie, però molt variable entre diferents espècies. La tasca més important per la bona aplicació del DNA barcoding és trobar un bon gen candidat per ser DNA barcode. Pels animals, aquest gen ja està ben establert i és un fragment de 658 bp del gen mitocondrial Citocrom Oxidasa C subunitat I (cox1) (Hebert et al.,2003). A mesura que més individus i espècies es van seqüenciant, es va ampliant la llibreria de referència de DNA barcodes i, actualment, per llinatges molt seqüenciats, ja permet determinar a quina espècie pertany un individu només seqüenciant el seu DNA barcode. Per contra, en els llinatges que tenen poques espècies seqüenciades permet assignar la seqüència a nivell taxonòmics inferiors com gèneres o famílies. Per tant, per augmentar l’eficiència per assignar el nom de l’espècie a les seqüències de DNA es requereix d’una llibreria de DNA barcodes complerta amb la identificació taxonòmica de les espècies ja recopilades i, a més, aquesta s’ha d’anar actualitzant a mesura que les noves espècies es van identificant i seqüenciant (Múrria et al., en premsa).

Actualment, hi ha dos grans repositoris mundials on es van acumulant aquestes dades, per un costat el Genbank (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/) i per l’ altre el Barcode fo Life Data System (http://boldsystems.org/). Malgrat la gran utilitat dels mètodes de DNA barcoding per fer inventaris globals de biodiversitat, aquesta tècnica és veu limitada per la seva dependència a les PCRs per a només un únic individu utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims avenços en les tecnologies de seqüenciació massiva , com la NGS ( Next-Generation Sequencing) permeten obtenir mil·lions de seqüències de DNA barcodes en una única reacció de PCR, el que s’anomena metabarcoding, i implica una millora exponencial si es compara amb el mètode Sanger tradicional usat en el

Page 8: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

8

DNA barcoding (Hajibabaei et al., 2011, Taberlet et al., 2012). Mica en mica, el metabarcoding està reemplaçant en DNA barcoding i l’ ús del metabarcoding és especialment esperançador en el monitoratge de la diversitat per fer estudis de qualitat ecològica (Múrria et al., en premsa)

Recentment, Vasselon et al., (2017) han aplicat tècniques de metabarcoding a la xarxa de rius tropicals de l’illa de Mayotte (regió francesa entre Moçambic i Madagascar). L’objectiu del treball va ser comparar la resolució taxonòmica fent servir eines moleculars i morfològiques per així crear un inventari per descriure la composició de les comunitats de diatomees i determinar l’estat ecològic. Totes les mostres obtingudes es van sotmetre a una anàlisi tant morfològica com molecular, amplificant per PCR la seqüència de DNA del gen rbcl (Ribulose bisphosfate carboxylase large chain del cloroplast) obtenint com a resultat una correlació positiva i significativa entre les dues tècniques. No obstant això, es va concretar que un 82% de les espècies identificades morfològicament no estaven seqüenciades i, per tant, no es disposava d’una seqüència de referència de DNAbarcode. Tot i la falta d’informació , l’avaluació de la qualitat ecològica duta a terme tant morfològica com molecularment ha permès una estimació fiable de l’estat ecològic de la majoria de la xarxa de rius de la Illa de Mayotte (Vasselon et., al.2017).

Altres autors com Zimmermann et. al., (2016) sosténen que hi ha una necessitat de desenvolupar una base de dades més complerta pel que fa referència a les diatomees, i així facilitar la tasca de biomonitorització per a les pròximes generacions Malgrat un individu és suficient per extreure el DNA i fer-ne una amplificació i seqüenciar-lo, es necessiten més individus de la mateixa espècie per a fer-ne la identificació morfològica. És a dir, per a cada espècie calen uns quants individus en una mostra que es divideixen dos parts, una part serveix per a la identificació morfològica i l’altra per extreure el DNA. Per tant, la metodologia per obtenir DNA barcodes assignats a una espècie taxonòmica implica:(i) aïllar un individu d’una comunitat de diatomees, (ii) cultivar-lo en un medi de cultiu estèril per aconseguir més individus de la mateixa espècie, (iii) aïllar més individus de la segona colònia repetidament per aconseguir amb molta seguretat tenir una població d’una sola espècie, (iv) dividir la colònia final monoespecífica en dues parts que s’utilitzaran per extreure el DNA i seqüenciar els DNA barcodes i, l’altre per identificar l’ espècie en el mocroscopi després d’ eliminar la matèria orgànica. D’ aquesta segona fracció, es tractaran les mostres per a obtenir una suspensió de frústuls nets. Aquests es classificaran al microscopi òptic amb ajuda de monografies específiques i es prepararà una submostra per a ser observada en microscopia electrònica de rastreig i obtenir-ne les imatges que s’ assignaran a la població de les espècies seqüenciades.

OBJECTIUS

Un dels objectius de la recerca és introduir el metabarcoding de diatomees en l’estudi de la biodiversitat i la determinació de l’estat ecològic de les aigües continentals. Però per a utilitzar aquestes tècniques es requereix disposar d’una llibrera de referència amb tots els DNA barcodes que s’han seqüenciat fins al moment.

Page 9: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

9

Després d’una cerca extensiva de bibliografia referent a les diatomees, s’ha vist que manca una llibreria de referència per a DNA barcodes de diatomees a la Península Ibèrica per a poder aplicar les tècniques de metabarcoding adequadament. Per això específicament, en aquest projecte de final de grau es pretén:

(1) recopilar les seqüències de DNA dels tres gens àmpliament utilitzats en DNA barcoding de diatomees i que actualment estan disponibles en biblioteques digitals (GenBank: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/),

(2) crear la primera llibreria de referència Ibèrica de potencials DNA barcodes de diatomees que contingui totes les seqüències del gen rbcl que codifica per la proteïna Rubisco(ribulosa-1,5-bisfosfat carboxilasa/oxigenasa), de la subunitat 18S del DNA ribosòmic i del gen mitocondrial cox 1 (Citocrom oxidasa subunitat 1) de totes les diatomees presents a la Península Ibèrica,

(3) comparar quins dels tres gens té més potencialitat per a ser utilitzat com a DNA barcode en futurs estudis de biodiversitat utilitzant metabarcoding,

(4) aïllar i cultivar diatomees per a seqüenciar els potencials DNA barcodes (rbcl/ 18S/ cox1) d’algunes de les espècies que encara no ha estat seqüenciades en funció dels resultats obtinguts en l’ objectiu específic 2.

MATERIAL I MÈTODES

Cerca de seqüències de DNA per les espècies ibèriques de diatomees i

elaboració de la llibreria de referència

He creat una llistat complerta amb totes les especies de diatomees disponibles a la Península Ibèrica a partir del llibre Diatom Monographs (Aboal et al., 2003). Per a crear la llista de DNA barcode s’ha utilitzat informació de la base de dades GenBank ( www.ncbi.nlm.nih.gov/genbanck/). Per a cada espècie he descarregat tres seqüències, una per a rbcl, per al gen 18S RNA i el cox1.Tots els DNA barcodes seleccionant tenen una llargada d’entre 1000 i 1500 bp i s’han descarregat en format “.FASTA”, que

és el format més àmpliament utilitzat en projectes de seqüenciació. S’ha de tenir en compte que s’ha utilitzat un inventari de diatomees amb 16 anys d’antiguitat i que al llarg d’aquest temps es poden haver descrit noves espècies. Tot i així, això no pot ser un problema perquè l’objectiu del projecte és quantificar l’informació que hi ha actualment disponible de DNA barcodes a la Península Ibèrica, i no el de fer un estudi intensiu d’espècies.

Filogènia de diatomees i tractament de dades

Malauradament les seqüències compilades pel gen cox1 no han estat suficients per fer un arbre filogenètic (mirar als Resultats). Com a conseqüencia, aquesta secció dels mètodes només s’ha aplicat als gens rbcl i 18S.

Per al tractament de dades i la creació de l’arbre filogenètic he ajuntat tots els DNA barcodes per separar per cadascun dels gens en fitxers “.TXT”. En aquests fitxers

Page 10: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

10

s’han afegit els outgroups1 relacionats amb l’ingroup per tal de tenir un punt de referència i poder arrelar l’arbre filogenètic. Com ha espècies outgroup n’he triat dues: Bolidomonas mediterranea i Triparma aff.berrucosa del grup d’algues unicel·lulars Bolidophyceae.

Els fitxers de dades amb les seqüències separades per gens s’han alineat amb l’alineador “MAFFT” (Kuraku et al., 2013). A més, ha servit per a comprovar que totes eren de la mateixa secció del gen.

Per a editar les seqüències he utilitzat el programa “BIOEDIT”. Aquest és un editor que permet editar diferents seqüències de DNA barcode a la vegada, manipular-les i analitzar-les. Amb aquest programa he pogut comprovar els fragments on hi havia més informació, ajustar les seqüències i editar bases i gaps que poguessin produir algun inconvenient per construir l’arbre filogenètic (Hall ,1999).

Amb Bioedit, s’ha obtingut un altre cop un arxiu “.FASTA”, que s’ha transformat a format “.PHYLIP” per fer l’arbre filogenètic.

Per a la conversió de l’arxiu “.FASTA” a “.PHYLIP” he utilitzat un programa creat amb llenguatge de programació “.PERL”(https://www.perl.org/). Un cop descarregat “PERL” des de la terminal de l’ordinador he introduït les instruccions (pipelines) per a obtenir l’arxiu en format“.PHYLIP”.

Amb el nou arxiu “.PHYLIP” he utilitzat el programa “MESQUITE”

(http://www.mesquiteproject.org), el qual m’ha permès identificar en quina posició (1,2 ó 3) començava el codó i així poder córrer un anàlisi filogenètica més acurat i, en conseqüència, un arbre filogenètic més suportat estadísticament (Maddison & Maddison 2018). L’arxiu proporcionat per aquest programa és un arxiu en format “.NEXUS” el qual s’utilitza més endavant per ajustar alguns aspectes de la inferència filogenètica. Un cop coneguda la posició que ocupa la primera base de les seqüències alineades puc començar a construir l’arbre filogenètic. Tot aquest procés s’ha fet en paral·lel per als dos gens per separat com també amb els dos gens concatenats. La concatenació dels gens s’ha fet a la terminal de l’ordinador i amb uns codis específics (aquí he hagut d’utilitzar l’arxiu “.NEXUS” per a saber quina posició d’inici tenien els codons per tal de concatenar correctament els dos arxius).

Un cop he obtingut els arxius definitius, he utilitzat el servidor “CIPRES” (https://www.phylo.org/) que permet fer inferències de relacions filogèniques. Els arbres filogenètics han estat inferits utilitzat l’eina RAxML 7.0.4. Els resultats d’aquestes anàlisis arriben en format “.TRE” el qual ens permetrà fer la visualització de l’arbre filogenètic utilitzant el programa “FIGTREE” (Miller et al., 2010).

A més de visualitzar els arbres filogenètics, el programa “FIGTREE” permet modificar, ajustar i editar l’arbre filogenètic de manera ràpida. A partir d’aquí s’han ajustat i modificat el tres arbres finals (rbcl, 18S i els dos gens concatenats) (Drummond et al., 2007).

1 Outgroup: “és el grup evolutiu més proper que serveix de grup de referència per a determiner relacion evolutives

de l’ingroup” (Grimaldi, David et al.,2005)

Page 11: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

11

Recollida de mostres i preparació del medi de cultiu

La recollida de mostres es va realitza el dia 13 de Juny de 2019 al Parc Natural de Sant Llorenç del Munt i Serra del l’Obac, que està situat aproximadament a 40 km al nord de Barcelona. Un cop a la zona vam recórrer tres rius diferents per a la recollida de mostres i poder assegurar el màxim de representativitat possible a la hora d’observar i separar els individus. Els punts de mostreig escollits han estat les rieres Talamanca, la Vall d’Horta (riu Ripoll) i Rellinars (Fig.3)

Figura 3 Punts de recollida de mostres: 1.Talamanca, 2. Vall d'Horta i 3.Rellinars

Per a la recollida de mostres, s’han utilitzat pots estèrils per a dipositar la mostra, un marcador per escriure als pots la data i lloc de la recollida, i unes pinces per a recollir el biofilm dels rius. El protocol de mostreig va ser buscar àrees en les que el riu encara no estava del tot sec i recollir de la llera material viu amb les pinces. Aquest bio-film contenia les diatomees que després han estat separades al laboratori.

A més, es va recollir 5 litres d’aigua del riu, per a preparar posteriorment el medi de cultiu i rehidratar les mostres quan aquestes estaven seques.

El medi de cultiu utilitzat ha estat l’f/2 Guillard (Ryther,1962). El mode de preparació de la solució stock és el següent:

- Afegir 55 ml de solució líquida de silicat de sodi al 40% i completar fins a 1000 ml (sol.stock 30g/L). Afegir 1 litre de la solució stock per cada 1 litre de cultiu.

- Solució stock 1: pesar 51,5 g de Nitrat de sodi ( NaNO3) + dihidrogenfosfat de potassi (KH2PO4). Dissoldre en aigua destil·lada i completar fins a 1000ml.

- Solució stock 2: pesar 15,0 g de sulfat de magnesi ( MgSO4·7H2O). Dissoldre en aigua destil·lada i completar fins a 1000ml

- Solució stock 3: pesar 5,0 g de clorur de calci (CaCl2·2H2O). Dissoldre en aigua destil·lada i completar fins a 1000ml.

- Solució stock 4: pesar 1,45 g oligoelements i vitamines. Agitar el pot, dissoldre en aigua destil·lada i completar fins a 1000ml

De cada solució stock s’afegeixen 10ml per litre d’aigua i la mescla es va autoclavar a 1210C durant 15 minuts.

Page 12: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

12

Creixement de cultius

La producció del cultiu de diatomees requereix primerament del la separació dels individus un a un al microscopi invertit (model IMT-2). Per això s’ha fet ús de plaques de petri, d’una vareta i una pipeta (Lewin & Lewin,1967) per a separar cada individu que seguidament s’ha dipositat en una placa de petri amb el medi de cultiu. Per a evitar contaminació, el cultiu s’ha realitzat dins d’una campana de flux laminar al costat d’un cremador Bunsen a més les plaques de petri han estat esterilitzades amb llum ultraviolada. Un cop l’individu es dipositat a la placa de petri s’hi afegeix el medi de cultiu.

El creixement dels cultius s’hi afegeix dues bombetes amb llum ultraviolada i un temporitzador per regular el cicle de llum i foscor (12:12).

RESULTATS

Llibreria de referència

S’ha cercat un llistat de referència taxonòmica amb un total de 1187 espècies extretes del volum Diatom monograph (Aboal et al., 2003) amb el qual s’han buscat les seqüències dels possibles DNA barcodes.

Pel gen rbcl la quantitat de DNA barcodes disponibles per a les diatomees és del 20%, 237 espècies sobre 1187 totals (Fig. 4A). La quantitat de DNA barcodes disponibles pel gen 18S és del 21%, 246 espècies sobre 1187 totals (Fig. 4B). Finalment la quantitat de DNA barcodes a disposició pel gen cox1 és de tant sols 28 espècies sobre el total de 1187, és a dir, un 2% (Fig. 4C).

La cobertura de DNA barcodes és diferent per a cada llinatge dins les diatomees. Per exemple, s’ha trobat que per les Classes de diatomees Bacilariophyceae (88% del total de les espècies) hi ha un 19,1% (200/1046) d’informació pel gen rbcl i un 19,69% (206/1046) pel gen 18S, per Coscinodiscophyceae (2% del total de les espècies) s’ha trobat que tant per rbcl com per 18S hi ha un 35% (12/34) d’informació, per Fragilariophiceae s’ha trobat el 100% (1/1) d’informació pels dos gens i per Mediophyceae, s’ha trobat un 49,1% (30/61) d’informació pel gen rbcl i un 47,54% (29/61) pel gen 18S.

Durant el procés de creació de la llibreria de DNA barcodes e referència s’han eliminat les seqüències que no coincidien amb la part del gen que generalment estava seqüenciada, és a dir, els fragments de gen que no solapaven amb el fragment majoritari. En el següent llistat hi ha les espècies que s’han eliminat:

Page 13: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

13

- 18S: Cyclotella bodanica, Cyclotella distinguenda , Surirella linearis helvetica

,Ortohoseira roeseana, Cyclotella striata, Staurosirella pinnata, Navicula

phyllepta, Fistulifera pelliculosa, Leptocylindrus danicus.

- Rbcl: Gomphonema truncatum, Pinnularia acuminata, Scoliopleura peisonis,

Licmophora abbreviata, Orthoseira roeseana, Leptocylindrus danicus

Per a cada gen i espècie, s‘han descarregat el codi Genbank, la ID de l’espècie (taxid) i el nom de l’espècie. A l’annex 1 es pot trobar la taula resultant amb tota aquesta informació.

Seqüències trobades per a cada gen

Seqüències que no s’han trobat

Figura 4. Proporció d’espècies taxonòmiques del llistat de la Península Ibèrica seqüenciades pels gens

(A) rbcl, (B) 18S i (C) cox1. La porció marcada en color blau representen les espècies amb DNA barcode

seqüenciant, mentre que en color vermell estan marcades les espècies que no tenen seqüències a la

base de dades.

Arbre filogenètic

Un cop obtinguda tota la informació, s’han generat tres arbres filogenètics, un per 18S i un per a rbcl (Fig. 5 i Fig. 6), i un altre amb els dos gens concatenats que no es mostra en aquest projecte, descartant el gen cox1 degut a la manca d’informació.

Si observem l’arbre filogenètic pel gen 18S podem veure que a nivell taxonòmic de Classes, les diatomees centrals d’aigua dolça, centrals marines, Arrafídies i Birrafídies, estan ben distribuïdes a excepció de les diatomees Monorrafídies que estan separades en dos blocs. Per altra banda tenint en compte el nivell taxonòmic d’ Ordre podem observar que dins de les diatomees Birrafídies, els Ordres de les Naviculals estan distribuïdes en tres blocs i les Thalassiofisals estan distribuïes en dos blocs.

Així mateix a l’arbre filogenètic referent al gen rbcl podem observar que a nivell taxonòmic de Classes, les diatomees centrals d’aigua dolç estan distribuïdes en dos blocs, les centrals marines estan separades en dos blocs i les Arrafídies estan també separades en dos bloc. També la Classe de diatomees Monorrafídies està separada en dos blocs. Si observem la Classe de diatomees Birrafídies, podem veure que l’Ordre de les diatomees Naviculals està separat en dos blocs, i que les diatomees Thalassiofisals estan separades també en dos blocs.

Page 14: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

14

En els dos arbres filogenètics podem veure que al nivell d’Ordre són bastant consistents, aquest és el cas dels tres ordres monofilètics2 Cimbelals, Bacil·larials i Surirellials (en color groc, lila i granat a la Fig. 5 i lila, negre i taronja Fig. 6)., mentre que d’altres Ordres com les Thalassiofilals i Naviculals que formen part dels grups parafilètics3. Els dos arbres tenen una bona estructura i organització si prenem com a referència els quatre grans grups centrals radials, centrals polars, arrafídes sense i amb rafe

Amb tot, en els arbres el grup de les diatomees Arrafídies estan separades en dos Clades la qual cosa no és el que s’esperava. També trobem algunes espècies desplaçades de lloc com Achnathes brevipes, Achnanthes sp i Achnanthidium

coarctatum.

Tant mateix en els dos arbres filogenètics els Ordres de diatomees Naviculal i Thalasiofissals formen tres i dos blocs diferents respectivament.

2 Grup monofilètic: “tots els seus integrants comparteixen un avantpassat comú, i tots els

descendents d'aquest queden inclosos en el grup” (Hening et al., 1999).

3 Grup parafilètic: “consisteix en un grup on es troben tots els descendents d’un ancestre

comú excepte un o més grups monofilètics”(Hening et al., 1999).

Page 15: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

15

Secció A Gen 18S

Page 16: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

16

Secció B – Gen

18S

Page 17: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

17

Secció C– Gen 18S

Figura 5. Les seccions A,B I C senyalades a la part superior dels respectius full a l’esquerra,

mostren l’arbre filogenètic creat a partir dels DNA barcodes del gen 18S.

Page 18: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

18

Secció A- Gen

rbcl

Page 19: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

19

Secció B- Gen

rbcl

Page 20: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

20

Ara bé, visualitzant els de DNA barcodes he pogut veure que el gen 18S té molts forats (“gaps” en anglès) és a dir en alguns llinatges s’han perdut els fragments (deleccions) o en altres llinatges han desaparegut (insercions) (Fig.7). En comparació al gen 18S, el gen rbcl, no presenta gaps i està conservat dins les diatomees i, per tant podria ser més bon candidat per al DNA barcode. A més , si es comparen els dos arbres filogenètics es pot entreveure que aquest gen té un fort poder discriminant entre espècies properes (Fig. 6). Malauradament en aquest projecte no puc aportar suficients evidències per afirmar la idoneïtat d’un d’ aquests dos gens com a DNA barcodes

Secció C- Gen

rbcl

Figura 6. Les seccions A,B i C senyalades a la part superior dels respectius fulls a

l’esquerra, mostren l’arbre filogenètic creat a partir dels DNA barcodes del gen rbcl

Page 21: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

21

Figura 7. La imatge A mostra les seqüències pel gen rbcl on no hi veiem gaps. La imatge B mostra les

seqüències pel gen 18S on hi podem veure la pèrdua d’informació al GAP. Hall et al,. (1999).

Cultius de diatomees

S’han aconseguit separar 10 individus amb relativa facilitat i aquests es van intentar multiplicar al medi de cultiu, però el seu creixement en el medi de cultiu no ha progressat com s’esperava. Poden ser diversos els motius perquè no hagi funcionat el cultiu. L’únic que he detectat és la contaminació de fongs, que es va reduir quan vaig afegir un antifúngic al medi. Actualment estic pensant i fent experiments per trobar altres factors que afectin negativament al creixement de diatomees com puguin ser la temperatura del medi de cultiu, el tipus de llum utilitzats en la càmera de flux laminar ó les característiques del medi de cultiu. Malgrat tot l’esforç ,encara no he pogut aconseguir fer créixer diatomees en medi de cultiu per posteriorment identificar-les i extreure’n el DNA per seqüenciar els DNA barcodes i, per tant, no hem pogut aconseguir tots els objectius establerts.

Page 22: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

22

DISCUSSIÓ

Per a la gran majoria del grup de les diatomees de la Península Ibèrica, la disponibilitat d’informació de DNA barcodes és escassa i limitada ( 21% pel gen 18S, 20% pel gen rbcl i el 2%per cox1). Tot i que hi ha una falta d’informació dels DNA barcodes aproximadament del 80% de les espècies, en general la informació actual cobreix tots els grans grups i, per tant, el metabarcoding podria assignar les diatomees als grups més importants (Annex 1). Comparat amb altres fílums, les diatomees tenen una cobertura de DNA barcodes baixa. Per exemple, en el cas dels peixos de rius, la cobertura actual pel DNA barcode cox1 arriba al 100%, mentre que pels macroinvertebrats aquàtics (crustacis, mol·lusc i artròpodes) aquesta arriba al 35%, tot i que és variable entre Ordres (Múrria et al., en premsa). En grups terrestres àmpliament estudiats com puguin ser les papallones, la cobertura actual és propera al 100% (Dincă et al., 2015). Malgrat que el cox1 es va designar com a DNA barcode pels Metazoa, amb les dades actuals al GenBank el gen cox1 no s’ha utilitzat per a fer filogènies de diatomees i, per tant, actualment no es disposa d’informació suficient per assignar a espècies amb tècniques de metabarcoding. Amb tot, els DNA barcode també s’han afegit a l’Annex 1. Per tant, si en un futur es creu que el cox1 és un bon candidat per a ser DNA barcode per a diatomees s’ha de crear una llibreria de referència per aquest gen.

Els arbres filogenètics (Fig. 5 i Fig. 6) mostren una tipologia filogenètica robusta en tant que els grans grups filogenètics estan distribuït de la manera que s’esperaria. A més si ens fixem en els ordres (Naviculals, Bacil·larials, Cymblelas, Eunotilas) aparentment també tenen una distribució coherent amb la taxonomia morfològica. Ara bé, si fem un anàlisi més profund i observem les espècies una a una trobarem que n’hi han que no estan situades on correspon, com per exemple Achnathes brevipes, Achnanthes sp i Achnanthidium coarctatum. Per tant, observant els dos arbres filogenètics i veient que no hi ha grans diferències entre aquests, puc veure que 18S i rbcl són bons gens per estudiar la sistemàtica de les diatomees. Però, no puc afirmar que hi ha hagi un gen més adequat que un altre per a ser utilitzat com a DNA barcode en projectes de metabarcoding.

El gen cox1, del que també he buscat seqüències per a diatomees, seria un dels candidats per a diatomees ja que aparentment té un gran poder discriminant (Andújar et al., 2018), ara bé, la informació disponible és molt escassa per a diatomees (2%). Per aquest motiu estandaritzar el cultiu de diatomees és crític per extreure DNA i amplificar el gen cox1 i preparar una llibreria de referència per a aquest. Com a exemple, he agafat dades empíriques de metabarcoding de comunitats de diatomees del riu Llobregat (Múrria et al., en preparació) i he mirat la millor assignació a nivell d’espècie (best score ID) per a cadascuna de les seqüències obtingudes (Fig. 8). El nivell acceptable de fiabilitat en l’assignació d’espècies és del 0.95. En la figura 8 es pot veure que, en general, aquest valor oscil·la entre el 0.8 i 0.9 en el millor dels casos, per tant, només es pot aconseguir una assignació fiable a nivell taxonòmic de gènere o família. Aquest resultat que suggereix la necessitat d’una major cobertura de DNA barcodes per una assignació acceptable al nivell taxonòmic d’espècie.

Page 23: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

23

Figura 8. Best ID del gen cox1 a les mostres del riu Llobregat, mostrant la poca fiabilitat d' aquest gen

en referència a les diatomees sobre el valor fiable del 95% (en blau a la figura).

L’aïllament de individus és assequible a curt termini i a través del microscopi invertit es pot realitzar sense cap problema. Ara bé les diatomees són algues unicel·lulars molt sensibles als canvis ambientals i cada espècie té una sensibilitat diferent. Per això no és senzill arribar a crear un cultiu pur ja que el creixement de les diatomees depèn de molts factors com la llum, salinitat o temperatura (Vasselon et al., 2017). Per això es requereix un esforç i una quantitat de temps bastant més llarg que el que he pogut destinar per a realitzat aquest projecte. El pròxim pas a realitzar per a seguir completant la llibreria de referència de DNA barcodes de diatomees és estandaritzar el protocol per a fer cultius de diatomees d’aigües continentals.

CONCLUSIONS

La llibreria de referència ha estat creada amb èxit per als gens rbcl i 18S, on també s’han inclòs els DNA barcodes de cox1. Aquesta cerca d’informació ha mostrat que falta d’ informació per aquest gens i la dependència dels mètodes de DNA barcoding en una bona llibreria de referència, deixant entreveure que els següents passos a realitzar per a millorar l’assignació taxonòmica d’aquestes tècniques s’haurien de centrar en augmentar el nombre d’espècies seqüenciades.

La llibreria de referència presentada en aquests projecte ha de servir com a iniciativa per a incrementar el potencial d’ aquestes eines i com a primera llibreria de referència per a diatomees que s’ha creat a nivell ibèric. Amb aquest resultat, pretenc incitar a la comunitat científica i experts a adreçar aquesta manca d’informació. Cal remarcar també que per a la creació d’una bona llibreria de referència cal experts taxònoms per assegurar la veracitat taxonòmica d’aquesta.

Per un altre costat, els arbres filogenètics generats, mostren una alta consistència en els dos gens, per tant els dos gens podrien ser considerat com a vàlids a l’hora de fer filogènies en futurs treballs de sistemàtica. Per a poder discernir amb més seguretat quin gen és el millor candidat per a ser utilitzat en tècniques de metabarcoding s’hauria de disposar de més cobertura, sobretot pel gen cox1.Un cop es disposi d’una major cobertura d’espècies amb seqüències, s’haurien de dissenyar primers específics per a diatomees que amplifiquessin un fragment d’unes 300 bp per a tots els llinatges(la

Page 24: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

24

longitud de 300bp és la màxima que es pot amplificar amb metabarcoding). Només utilitzant aquest fragment, s’hauria de mirar si té capacitat per diferenciar espècies properes construint de nou els arbres filogenètics i comparant el suport als nodes per als diferents candidats,s’escolliria aquell fragment que estigués més suportat. Finalment, s’ haurien d’ amplificar algunes espècies de diatomees per comprovar que els primers dissenyat funcionen bé pel metabarcoding. Aquesta informació ens permetria suggerir quin dels tres gens i quin fragment d’aquest és el més idoni per ser el DNA barcodes de les diatomees. Veient els gaps que hi ha en el 18S, intuïtivament puc suggerir el rbcl ó el cox1 com a futurs DNA barcodes de diatomees, el temps dirà si tinc raó.

BIBLIOGRAFIA

- Aboal, M., Alvarez-Cobelas, M.,Cambra, J, & and Ector, L. (2003). Floristic list

of non marine diatoms (Bacillariophyceae) of Iberian Peninsula, Balearic Islands, and Canary Islands. Updated taxonomy and bibliography In: A.Witkowski (ed.) Diatom Monographs. A.R.G. Gantner Verlag K.G., 4, 639 pp.

- Andújar, C., Arribas, P., Yu, D. W., Vogler, A. P., & Emerson, B. C. (2018). Why the COI barcode should be the community DNA metabarcode for the Metazoa. Molecular Ecology, 27, 3968-3975

- Blanco, S., Álvarez-Blanco, I., Cejudo-Figueiras, C., Espejo, J. M. R., Barrera, C. B., Bécares, E., & Artigas, R. C. (2013). The diatom flora in temporary ponds of Doñana National Park (southwest Spain): five new taxa. Nordic Journal of

Botany, 31, 489–499.

- Christine J., & Schmidt, B.(2005). Métodos y Herramientas Analíticas en la Evaluación de la Biomasa Microalgal 1: 2-3

Dincă, V., Montagud, S., Talavera, G., Hernández-Roldán, J., Munguira, M. L.,García-Barros, E., Hebert, P. D. N.,&Vila, R. (2015). DNA barcode reference library for Iberian butterflies enables a continental-scale preview of potential cryptic diversity. Scientific Reports, 5, 12395

- Keck, F., Vasselon, V., Tapolczai, K., Rimet, F., & Bouchez, A. (2017). Freshwater biomonitoring in the Information Age. Frontiers in Ecology and the

Environment, 15, 266-274.

- Grimaldi, D., & Engel, M. S. (2005). Evolution of the Insects. Cambridge Evolution Series.

- Guillard, R.L. & Ryther, J.H. 1962. Studies on marine planktonic diatoms I. Cyclotella nana Husted and Detonula confervaceae (Cleve) Gran. Canadian Journal of Microbiology, 8, 229-239.

Page 25: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

25

- Hajibabaei, M.; Shokralla, S.; Zhou, X.; Singer, G. & Baird, D.J. (2011). Environmental barcoding: A next-generation sequencing approach for biomonitoring applications using river benthos. PLoS One, 6, e17497

- Hall , T.A. (1999). “BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT”. Nucleics. Acids Symposyum Series 41, 95-98.

- Hebert, P. D. N, Ratnasingham, S., & de Waard, J. R. (2003). Barcoding animal life: cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species. Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences, 270, S96-S99.

- Hennig, W., Davis, D. (Translator), Zangerl, R. (Translator) (1999) [1966]. Phylogenetic Systematics (Illinois Reissue ed.). Board of Trustees of the University of Illinois. pp. 72–77.

- Kuraku, Zmasek, Nishimura, Katoh (2013) Nucleic Acids Research 41:W22-W28 aLeaves facilitates on-demand exploration of metazoan gene family trees on MAFFT sequence alignment server with enhanced interactivity.

- Múrria, C.; Väisänen, L.O.S, Somma, S., Wangensteen, O.S, Arnedo, M.A, & Prat, N. En premsa. Towards an Iberian DNA barcode reference library of freshwater macroinvertebrates and fishes. Limnetica

- LEWIN, J., & LEWIN, R. A. (1967). Culture and Nutrition of Some Apochlorotic Diatoms of the Genus Nitzschia. Journal of General Microbiology, 46, 361–367.

- Silar, P. (2016), Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes. 2016, 978-2-9555841-0-1.

- Round, F.E., Crawford, R.M., & Mann, D.G. (1990). The diatoms. Biology and morphology of the genera. Cambridge University Press, Cambridge. 747 pp.

- Taberlet, P., Coissac, E.,Pompanon, F.,Brochmann, C., & Willerslev, E. (2012). Towards next-generation biodiversity assessment using DNA metabarcoding. Molecular Ecology, 21, 2045–2050

- Tautz, D., Arctander, P., Minelli, A., Thomas, R. H., & Vogler, A. P. (2003). A plea for DNA taxonomy. Trends in ecology & evolution, 18, 70-74.

- Vasselon,V., Rimet, F., Tapolczai, K., & Bouchez, A. (2017) Assessing ecological status with diatoms DNA metabarcoding: Scaling-up on a WFD monitoring network (Mayotte island, France). Ecological Indicators, 82, 1-12.

- Zimmermann,J., Abarca,N., Enke,N. et al. (2016). Taxonomic reference libraries for environmental barcoding: a best practice example from diatom research. PLoS One, 9, 1–24.

Page 26: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

26

- Zimmermann, J., Glöckner, G., Jahn, R., Enke, N., & Gemeinholzer, B. (2014). Metabarcoding vs. morphological identification to assess diatom diversity in environmental studies. Molecular Ecology Resources, 15, 526–542.

- - Zhou X., Frandsen, P.B,Holzenthal, R.W. et al. (2016). The Trichoptera barcode

initiative: a strategy for generating a species-leve Tree of Life. Philosophical Transaction of the Royal Society B, 371, 20160025

Page 27: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

27

AN

NE

X 1 – Llibreria de referència que conté tots els D

NA

barcodes de 18S, rb

cl

cercats

Phylum Class Order Family Genus Species Author Taxid rbcl 18S cox 1

Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Chaetocerotales Acanthocerataceae Acanthoceras Acanthoceras zachariasii Simonsen 1979

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes brevipes var. intermedia Cleve 1895

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes sp 2126166 MH064055 KT943602

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes brevipes C.a.Agardh 1824 265541 FJ002137 AY485476

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes elata Gandhi 1960 leuduger-fortmorel

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes inflata Kützing

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes longipes Agardh 555751 FJ002143

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes parvula Kützing 1844

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes sphacelata Carter 1970

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes subhudsonis Hustedt 1921

Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Achnanthaceae Achnanthes Achnanthes tuma Carter 1970

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium affine Grunow

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium catenatum Lange-bertalot 2018691 KY799133 KY863463

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium coarctatum W.smith 1003012 HQ912458 HQ912594

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium exiguum Czarnecki 1994

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium exilis Kützing

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium fulla Carter

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium granum Hohn & hellermann

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium jackii Rabenhorst

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium krantzii Lange-bertalot 1577073 KJ658379 KJ658397

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium kryophila Petersen

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium macrocephalum Aboal 2003

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium thermale Rabenhorst

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium trinodis Amott ex ralfs

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium minutissimun Kützing 431333 KJ658386 KY863464

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium pyrenaicum Hustedt 1667326 KY799135 KY863466

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium subatomus Hustedt

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Achnanthidium Achnanthidium subsalsum J.b.Petersen 2003

Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Coscinodiscales Hemidiscaceae Actinocyclus Actinocyclus ehrenbergi Ralfs in pritchard

Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Coscinodiscales Hemidiscaceae Actinocyclus Actinocyclus normanii Hustedt 1957

Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Coscinodiscales Hemidiscaceae Actinocyclus Actinocyclus roperi Brébission

Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Coscinodiscales Hemidiscaceae Actinocyclus Actinotychus undulatus Bailey

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Anomoeoneidaceae Adlafia Adlafia aquaductae Krasske

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Anomoeoneidaceae Adlafia Adlafia minuscula Bertalot in Lange-Bertalot

Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Anomoeoneidaceae Adlafia Adlafia minuscula var muralis Bertalot in Lange-Bertalot

Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Amphipleura Amphipleura pellucida Kützing 1334924 KC309549 KC309477

Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Amphipleura Amphipleura lindeheimeri Grunow 1862

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora acutiuscula Kützing

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora angusta Cleve 1895

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora arcus Gregory 1854 1242268 AB754834

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora arenaria Donkin 1858

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora arenicola Cleve 1895

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora binodis Gregory 1857

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora borealis Kützing

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora cingulata Cleve 1878

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora coffeaeformis Kützing 1884 265554 KY766953

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora coffeaeformis var aponina Kützing

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora commutata Kützing 1242270 KX120550 AB754836

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora decussata Grunow 1867

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora exilissima Giffen 1966

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora graeffeana Hendey 1973 1242269 KJ463460 AB754835

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora grevilleana Gregory 1857

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora hyalina Kützing 1487557 KJ463462 KJ463431

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora hybrida Grunow on van heurck

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora inariensis Krammer 1980

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora libyca Ehrenberg 1840 431329 AM710425 AM501959

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora lineolata Ehrenberg 1843 1487560 KJ463465 KJ463435

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora macilenta Gregory 1857

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora margalefii var lacustris Aboal 2003 2306010 MG027480 MG027315

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora mexicana A.schimdt

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora micrometra Goffen 1967

Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora montana Krasske 1932 97221 KC736590 AJ243061

Page 28: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

28

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora normannii Rabenhorst 1864 431327 AM710424 AM501958

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora oligotraphenta Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora ostrearia Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora ostrearia var lineata Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora ovalis Kützing 538918 KJ463467 KC954576

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora pediculus Kützing 431328 HQ912403 KT072994

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora proteus Gregory 1857 216710 KJ463469 KC222324

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora staurophora Juhlin-dannfeldt 1882

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora subcapitata Hustedt 1959

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora subholsatica Krammer 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora tenerrima Aleem hustedt 1951

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiophysales Catenulaceae Amphora Amphora veneta Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Anomoeoneidaceae Anomoeoneis Anomoeoneis sphaerophora Krammer 1985 216734 KJ011795 KJ011612

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Anomoeoneidaceae Anomoeoneis Anomoeoneis sphaerophora f. sculpta Krammer 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Anomoeoneidaceae Anomoeoneis Anomoeoneis sphaerophora var. güntheri O.müller 1899

Stramenopiles Bacillariophyta Fragilariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Ardissonea Ardissonea baculus Gregory 1857 449131 AB430664 AM746973

Stramenopiles Bacillariophyta Astartiella Astartiella bhausiensis Witkowski 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Asterionella Asterionella formosa Hassall 1855 210441 HQ912497 HQ912633 NC_032029

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Asterionella Asterionella formosa var acaroides Lemmermann 1906

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira alpigena Krammer 1990 285081 AY569578

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira ambigua Simonsen 1979 49234 AY569606 AY569583

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira crenulata Twaites 1848 285084 AY569589

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira distans Simonsen 1979 49235 X85403

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira distans var. nivalis Haworth 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira granulata Simonsen 1979 285082 HQ912470 LC143217

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira granulata f. curavata Krammer lange-bertalot 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira granulata var. angustissima Simonsen 1979 555748 FJ002130 AY485493

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira islandica Simonsen 1979 202470 AF522284 AY569572

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira islandica var helvetica O.Müller 1906

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira italica Simonsen 1979

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira italica var tenuissima Simonsen 1979

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira lirata Hartley 1986

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira pfaffiana Krammer 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira subarctica Haworth 1990 202472 AY569594 AY569576

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Aulacoseirales Aulacoseiraceae Aulacoseira Aulacoseira subarctica f.recta Krammer 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Bacillaria Bacillaria paradoxa Gmelin 1791

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Bacillaria Bacilliaria paradoxa var tumidula De toni 1892

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Chaetocerotales Chaetocerotaceae Bacteriastrum Bacteriastrum delicatulum Cleve 1897

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Chaetocerotales Chaetocerotaceae Bacteriastrum Bacteriastrum hyalinum Lauder 1864 426671 MG972355

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Berkeleyaceae Berkeleya Berkeleya fragilis Greville 1827

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Berkeleyaceae Berkeleya Berkeleya micans Grunow in van heurek 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Berkeleyaceae Berkeleya Berkeleya rutilans Cleve 1894 1003020 KY320284 HQ912637

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Biddulphiales Biddulphiaceae Biddulphia Biddulphia aurita Brébisson,Godey 1838

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Biddulphiales Biddulphiaceae Biddulphia Biddulphia pulchella Gray 1821

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Biddulphiales Biddulphiaceae Biddulphia Biddulphia subaequa Ralfs in prtichard 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiracea Brachysira Brachysira brebissonii Ross in hartley 1986

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiracea Brachysira Brachysira neoexilis Lange-bertalot 1994

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiracea Brachysira Brachysira procera Lange-bertalot 1994

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiracea Brachysira Brachysira serians Round mann 1981

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiracea Brachysira Brachysira serinas var thermalis Ubierna-león sánchez castillo 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiracea Brachysira Brachysira vitrea Ross in hartey 1986

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiracea Brachysira Brachysira zellensis Rund mann 1981

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiracea Brachysira Brachysira aponina Kützing 1836

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis aerophila Bock 1963

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis alpestris Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis alpestris var grunowi Meister 1912

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis amphisbaena Cleve 1894 431324 KM084983 AM501954

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis amphisbaena f.subsalina Van der wergg huls 1957

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis bacillum Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis fontinalis Lange-bertalot 1996 1652770 KM350018 KM350114

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis hyalina Hustedt 1938

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis latiuscula Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis lauta Carter bailey-watts 1981 431339 AM710506 AM502039

Page 29: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

29

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis lepidula Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis leptosoma Krammer 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis molaris Krammer 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis obtusa Clever 1896

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis oregonica Ehrenberg 1966

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis permagna Cleve 1896

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis schroederi Hustedt 1922

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis schumanniana Grunow 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis schumanniana var biconstricta Grunow 1984

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis silicula Cleve 1896 1089216 JN418663 JN418593

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis silicuta var gibberula Cleve 1932

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis silicuta var minuta Cleve 1984

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis silicuta var peisonis Krammer 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis silicuta var truncatula Grunow 1984

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis subsalina Hendey

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis tenuis Krammer 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis thermalis Krammer 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis undulata Krammer 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Caloneis Caloneis ventricola Grunow 1885

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Campylodiscus Campylodiscus bicostatus W.smith 1854

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Campylodiscus Campylodiscus clypeus Hustedt 1930 1003025 KX120584 KX120700

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Campylodiscus Campylodiscus echeneis Ehrenberg 1949205 KX120590 KX120705

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Campylodiscus Campylodiscus hibernicus Ehrenberg 1845 1289051 JX032962

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Campylodiscus Campylodiscus noricus Ehrenberg 1841

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Cavinulaceae Cavinula Cavinula cocconeiformis Mann stickel 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Cavinulaceae Cavinula Cavinula jaernefeltii Mann stickel 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Cavinulaceae Cavinula Cavinula lapidosa Lange-bertalot et metxeltin 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Cavinulaceae Cavinula Cavinula pseudoscutiformis Hustedt 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Cavinulaceae Cavinula Cavinula scutelloides W.smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Cavinulaceae Cavinula Cavinula variostriata Mann stickel 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Hemiaulales Hemiaulaceae Cerataulina Cerataulina pelagica Peragallo 1896 1003031 HQ912533 HQ912669

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Eupodiscales Eupodiscaceae Cerataulus Cerataulus smithii Ralf in richard 1844 1003033 KC309561 KC309489

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Chaetocerotales Chaetocerotaceae Chaetoceros Chaetoceros ceratosporum Ostenfield 1910

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Chaetocerotales Chaetocerotaceae Chaetoceros Chaetoceros gracilis Schütt 1895 184592 AY604697 KY399775

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Chaetocerotales Chaetocerotaceae Chaetoceros Chaetoceros muelleri Lemmermann 1898 265525 HQ656825 KX609787

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Chaetocerotales Chaetocerotaceae Chaetoceros Chaetoceros simplex Ostenfeld 1901

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Chaetocerotales Chaetocerotaceae Chaetoceros Chaetoceros wighamii Brightwell 1856 1764972 KT860958

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Chamaepinnularia Chamaepinnularia clamans Ostenfeld 1901

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Chamaepinnularia Chamaepinnularia evanida Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Chamaepinnularia Chamaepinnularia mediocris Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Chamaepinnularia Chamaepinnularia soehrensis Lange-bertalot krammer 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Chamaepinnularia Chamaepinnularia soehrensis var muscicola Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis disculus Cleve 1882

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis neothumensis Krammer 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis pediculus Ehrenberg 1838 431340 KM084977 KY650805

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis placentula Ehrenberg 1838 431341 HQ912456 KT072968

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis placentula var euglypta Grunow 1884 1752161 KT072907

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis placentula var klinoraphis Geitler 1927

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis placentula var lineata Van heurek 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis placentula var pseudolineata Geitler 1927

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis scutellum Herenberg 1838

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Cocconeidaceae Cocconeis Cocconeis stauroneiformis Okuno 1957 515474 AB430694 AB430614

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Coscinodiscales Coscinodiscaceae Coscinodiscus Coscinodiscus marginatus Ehrenberg

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Coscinodiscales Coscinodiscaceae Coscinodiscus Coscinodiscus nitidus Gregory 1857

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Coscinodiscales Coscinodiscaceae Coscinodiscus Coscinodiscus radiatus Ehrenberg 1839 33642 KC309602 KP942833

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Cosmioneidaceae Cosmioneis Cosmioneis lundstroemii Mann in round 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Cosmioneidaceae Cosmioneis Cosmioneis pusilla Mann in round 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Cosmioneidaceae Cosmioneis Cosmioneis pusilla var incognita Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Craticula Craticula accomoda Mann in round 1990 1436134 KF959638 KF959652

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Craticula Craticula ambigua Reichardt 1997 993525 MH231744

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Craticula Craticula cuspidata Mann in round 1990 431343 MH231745 AM502000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Craticula Craticula citrus Reichardt 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Craticula Craticula halophila Grunow mann in round 1990

Page 30: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

30

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Craticula Craticula halophiloides Lange-bertalot 2001

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Craticula Craticula minusculoides Lange-bertalot 2001

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Craticula Craticula molesta Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Craticula Craticula molestiformis Lange-bertlot 2000 431345 AM710443 JQ610158.2

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ctenophora Ctenophora pulchella Williams round 1986 1003039 HQ912475 HQ912611

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ctenophora Ctenophora pulchella var lanceolada Abola

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cylophorales Cylophoraceae Cyclophora Cyclophora tenuis Castracane 1878 216820 HQ912524 HQ912660

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclostephanos Cyclostephanos dubius Theriot 1988 1003040 KC284710 KC284714

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclostephanos Cyclostephanos invisitatus Theriot stoermer 1987 382379 DQ514827 DQ514899

Stramenopiles Bacillariophyta Cyclophora novaezeelandiae Theriot 1988

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella alvarniensis Abola 1992

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella antiqua W.smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella atomus Hustedt 1937 382360 DQ514779 DQ514858

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella bodanica Grunow 1878 382361 DQ514829 DQ514901

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella caspia Grunow 1878

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella catenata Bachmann 1911

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella chaetoceras Lemmermann

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella comensis Grunow 1882

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella comta Kützing 1849

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella costei Druart straub 1988 1752160 KT072901 KT072952

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella cryptica Reimann lewis guillard 1963 29204 KM816806 AY485499

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella distinguenda Hustedt 1927 382362 DQ514780 DQ514859

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella glabriuscula Hakansson 1988

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella glomerata Bachmann 1911

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella hispanica Kiss, hegewald 2002

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella kuetzingiana Thwaites 1848

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella maduanae Germin 1981

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella meneghiniana Kützing 1844 29205 KM675698 HM805030

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella ocellata Ralfs in pritchard 1861 385410 DQ514832 DQ514904

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella pseudostelligera Hustedt 1939 259834 KP137423 KP137419

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella radiosa Lemmermann 1900

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella rossii Hakansson 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella stelligera var pseudostelligera Haworth 1986

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella stelligera var tenuis Hustedt 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella stelligera Cleve and grunow 1882

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella striata Grunow 1880 382364 DQ514771 KT390097

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella striata var radiosa Tempère peragallo 1907

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella superba Fricke 1900

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Cyclotella Cyclotella tripartita Hakansson 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Cylindrotheca Cylindrotheca gracilis Grunow in van heurek 1882 2014783 KY320374

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Cymatopleura Cymatopleura elliptica W.smith 303462 KX120603 AJ867030

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Cymatopleura Cymatopleura solea W.smith 538921 KX120779 KX120605

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Cymatopleura Cymatopleura solea var apiculata W.smith

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Cymatosirales Cymatosiraceae Cymatosira Cymatosira belgica Grunow 1862 49246 KC309563 EF192986

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella affinis Kutzing 1844 431346 KJ011796 AM502018

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella amphicephala Naegeli in kützing 1849

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella angustata W.smith cleve 1849

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella aspera Ehrenberg 431347 KJ011797 KJ011616

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella cistula Kirchner 1878 930063 KJ011801 KJ011619

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella cistula var gibbosa Brun 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella cuspidata Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella cymbiformis C.a.agardh 1830 216745 AJ535156

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella cymbiformis var nonpunctata Fontell 1917

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella delicatula Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella ehrenbergii Kützing 1849

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella heteropleura Ehrenberg

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella hustedtii Krasske 1923

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella incerta Grunow cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella laevis Naegali 1849

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella lanceolata Kirchner 1878 487518 KJ011806 KJ011623

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella lata Grunow 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella leptoceros Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella monticola Hustedt 1949

Page 31: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

31

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella naviculiformis Auerswald 1894 487668 KJ011815 KJ011632

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella obtusisucula Grunow 1875

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella parva W.smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella reinhardtii Grunow 1874

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella rupicola Grunow 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella similis Krassek 1932

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella simonsenii Krammer 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella subaequalis Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella tumida Brèbisson 1880 882190 KJ011812 JN790274 KU052351

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella tumidula Grunow 1875

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella turgida Gregory 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Cymbella Cymbella turgidula Grunow 1875

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Rhizosoleniales Rhizosoleniaceae Dactyliosolen Dactyliosolen fragilissimus Bergo

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula elegans Kutzing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula eximia Krammer1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula kuetzingii Grunow 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula subtilis Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula tenuis Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula tenuis var crassula Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula tenuis var. frigida Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula tenuis var inflata W.smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula thermalis Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Denticula Denticula valida Pedicino

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Diadesmis Diadesmis biceps Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Diadesmis Diadesmis brekkaenisi Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Diadesmis Diadesmis contenta Grunow ex van heurek 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Diadesmis Diadesmis contenta var parellala Abola 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Diadesmis Diadesmis gallica var perpusilla Grunow 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Diadesmis Diadesmis gallica Simith 1857

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Diadesmis Diadesmis laevissima Mann 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Diatoma Diatoma anceps Kirchner 1878

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Diatoma Diatoma ehrenbergii Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Diatoma Diatoma hyemalis Roth 196633 FM164376

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Diatoma Diatoma hyemalis var quadratum Kützing 1950

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Diatoma Diatoma mesodon Ehrenberg 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Diatoma Diatmoa moniliformis Kützing 1833

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Diatoma Diatoma tenuis C.A Agardh 1812 426639 HQ828190.2 AM497731

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Diatoma Diatoma vulgare Bery de saint vicent 1824

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Anomoeoneidaceae Dickieia Dickieia soodensis Krasske 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Anomoeoneidaceae Dickieia Dickieia subinflata M schmidt 1899

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Didymosphenia Didymosphenia geminata M. schmidt 1115533 KJ011820 JN680079 NC032171

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis bomboides A.schmidt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis campylodisus Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis didyma Ehrenberg 1854

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis elliptica Kützing 1891

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis elliptica var. ladogensis Cleve 1891

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis fusca Hustedt 1937

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis gorjanovici Pantocsek 1937

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis interrupta Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis litoralis Donkin 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis marginestriata Hustedt 1922

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis minuta Petersen 1928

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis nitescens Gregory, Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis oblongella Naegeli 1922

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis oculata Brébisson 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis ovalis Hilse cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis parma Cleve 1891

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis petersenii Hustedt 1937

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis pseudovalis Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis puella Schumann celve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis smithii Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis smithii var pumila Grunow 1937

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis smithii var recta M.Peragallo 1911

Page 32: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

32

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis smithii var rhombica Cleve eule 1902

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis vetula A.schmidt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diploneidaceae Diploneis Diploneis weissflogii A.schmidt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Lithidesmiales Lithodesmiaceae Ditylum Ditylum bightwellii West 1883 49249 KC309566 KU561210

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Paralilales Radialiplicataceae Ellerbeckia Ellerbeckia arenaria Moore 1988

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema auerswaldii Rabenhorst

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonerna brehmii Hustedt

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema caespitosum Kützing 431353 KU052337 AM502035

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonerna gracile Rabenhorst 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema lacustre C. A. Agardh

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema latens Krasske

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema meslanum Cholnoky

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema minutum Hilsen 431330 KJ011823 KJ011639

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema perpusillum Cleve

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema prostratum Berkeley 1574439 KJ011827 KJ011644

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema reichardtii Krarnmer

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonema Encyonema silesiacum Bleisch in Rabenhorst 1074426 KF959648 JN790277

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonopsis Encyonopsis aequalis W. smith 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonopsis Encyonopsis cesatii Krammer 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonopsis Encyonopsis falaisensis Krammer 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonopsis Encyonopsis grunowii Krammer 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonopsis Encyonopsis microcephala Grunow 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Encyonopsis Encyonopsis moseri Krammer 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Etomoneidaceae Entomoneis Entomoneis alata Ehrenberg 1845

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Etomoneidaceae Entomoneis Entomoneis costata Hustedt 1975

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Etomoneidaceae Entomoneis Entomoneis ornata Bailey 1975 1003048 HQ912397.0 KY054952.0

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Etomoneidaceae Entomoneis Entomoneis paludosa Reimer 1975 650509 KX120575 KY320340

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Etomoneidaceae Entomoneis Entomoneis paludosa var duplex Makarova & Achmetova 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhizosoleniales Rhopalodiaceae Epithemia Epithemia adnata Brébison 1838

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhizosoleniales Rhopalodiaceae Epithemia Epithemia adnata var porcellus Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhizosoleniales Rhopalodiaceae Epithemia Epithemia adnata var saxonica Patrick 1975

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhizosoleniales Rhopalodiaceae Epithemia Epithemia argus Kützing 1844 1003049 HQ912394 HQ912408

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhizosoleniales Rhopalodiaceae Epithemia Epithemia argus var alpestris W.smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhizosoleniales Rhopalodiaceae Epithemia Epithemia goeppertiana Hilse 1860

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhizosoleniales Rhopalodiaceae Epithemia Epithemia sorex Hustedt 1922 718187 HQ912395 HQ912409

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhizosoleniales Rhopalodiaceae Epithemia Epithemia turgida Kützing 1844 718188 HQ912396 KX120681

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhizosoleniales Rhopalodiaceae Epithemia Epithemia turgida var granulata Brun 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Eucocconeis Eucocconeis minuta var alpestris Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Eucocconeis Eucocconeis austriaca Bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Eucocconeis Eucocconeis flexella Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Eucocconeis Eucocconeis laevis Lange -bertalot 1999 1754005 KY054962

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Eucocconeis Eucocconeis molesta Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Eucocconeis Eucocconeis quadratarea Lange bertaot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia arcus Ehrenberg 1837

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia arcus var bidens Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia arcus var fallax Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia bidens Ehrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia bidentula W.smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia bilunaris Mills 1934 303395 HQ912463 AJ866995

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia bilunaris var mucophila Lange bertalot 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia bilunaris var capitata Abola 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia bilunaris var linearis Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia denticulada Rabenhorst 1864

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia diodon Ehrenberg 1837

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia exgracilis A. Berg ex Cleve-Euler

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia exigua Brebisson ex Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia exigua var bidens Hustedt 1932

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia faba Ehrenberg 1838

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia faba var. densestriata Oestrup 1910

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia fidelensis Zimmermann 1915

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia flexuosa Brébisson Kützing 1849

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia formica Ehrenberg 1843 196639 AM710428 AM502040

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia glacialis Meister 1912 1003052 HQ912450 HQ912586

Page 33: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

33

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia groenlandica Grunow NorpelSeh. & Lange-Bertalot

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia hexaglyphis Ehrenberg 1854

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia implicata Norpel, Lange-Bertalot & Alles 1991 431354 AM710468 AM502001

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia incisa Gregory 1854

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia intermedia Norpel & Lange-Bertalot 1998

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia lapponica Grunow ex Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia minor Kützing 286093 AY571744 LC037441

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotía monodon Ehrenberg 1854

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia monodon var bidens Hustedt 1932

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia muscicola Krasske 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia naegelii Migula 1458866 NC_037987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia nymanniana Grunow in Heurek 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia paludosa Grunow 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia paludosa var trinacria Norpel 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia papilio Ehrenberg Hustedt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia parallela Ehrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia pectinalis Rabenhorst 196638 HQ912500 HQ912636

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia pectinalis var rostrata Grunow 1981

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia pectinalis var ventralis Husted 1911

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia pectinoides Zimmermann 1915

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia praerupta Ehrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia praerupta var simplex Manguin in bourrelly 1941

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia pseudopectinails Hustedt 1924

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia rhomboidea Hustedt 1950

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia septentrionalis Hustedt 1897

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia serra Ehrenberg 1837

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia serra var diadema Patrick 1958

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia subarcuatoides Lange bertalot 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia sudetica O.müller 1898

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia tenella Schmidt 1913

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia triodon Ehrenberg 1837

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Euntoliales Eunotiaceae Eunotia Eunotia veneris De toni 1892

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia cryptolyra Brockmann 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia forcipata Greville 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia helensis Schulz 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia insociabilis Krasske 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia maceria Schimanski 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia monoculata Hustedt 1990 1003053 HQ912460

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia naumannil Hustedt 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fullacia omissa Hustedt 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia pygmaea Kützing 1990 1003054 HQ912469 KX257362

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia subhamulata Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Fallacia Fallacia tenera Hustedt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Fistulifera Fistulifera pelliculosa Lange-bertalot 1997 913975 HQ337547 KU948216 HQ317074

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria berolinensis Lange-Bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria canariensis Lange-Bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria capucina Desmazieres 1823 185980 KC736594 KT072981

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragllaria capucina f. radians Lange Bertalot 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria capucina amphicepha Lange-Bertalot 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria capucina rumpens Lange-Bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria capucina var mesolepta Rabenhorst 1864 1043707 FR873245

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria capucina var vaucheriae Lange-Bertalot 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilarla crotonensis Kitton 1869

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria danica Kützing 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria famelica Lange bertalont 1980 1003135 HQ912452 HQ912588

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria gracilis Oestrup 1910

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria montana Lange bertalot 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria nanana Bertalot 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria parasitica var subconstricta Grunow in Van Heurck 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria tenera W.smith 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilaria Fragilaria toxoneides Lange bertalot 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilariforma Fragilariforma bicapitata Mayer 1988

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilariforma Fragilariforma constricta Ehrenberg1988

Page 34: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

34

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilariforma Fragilariforma virescens Ralfs 1988 216617 HQ912492 HQ912628

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilariforma Fragilariforma virescens var capitata Oestrup 1994

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilariforma Fragilariform virescens var elliptica Hustedt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Fragilariforma Fragilarifoma virescens var mesolepta Rabenshorst 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia amosseana Lange-bertalot 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia amphipleuroides Cleve 1934

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustulia Frustulia spicula Amossé 1932

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia crassinervia Brébisson 1996 1264783 HF562235 HF562290 HF562259

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia creuzburgensis Krasske 1957

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia erifuga Lange-bertalot 1996 1264785 HF562245 HF562295

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia rhombides Ehrenberg de toni 1891

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia saxonica f. capitata Mayer 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia saxonica f undulata Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia saxonica Rabenhorst 1853 1264784 HF562262

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia vulgaris De Toni 1891 1264784 HF562254 HF562293 HF562256

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Amphipleuraceae Frustuila Frustulia vulgaris f parva Cleve-Eu 1952 431358 HF562253 AM502038

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Geissleria Geissleria decussis Lange Bertalot & Metzelin 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Geissleria Geissleria ignota Lange- BE & Metzelin 1996 1574443 KJ011830 KJ011647

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Geissleria Geissleria paludosa Lange Bertalot & Metzelin 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Geissleria Geissleria schoenfeldii Larnge Bertalot & Metzeltin 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Geissleria Geissleria similis Lange-Bertalot & Metzeltin

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Cymbellaceae Gomphocymbella Gomphocymbella ancyli Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphoneis Gomphoneis clevei Fricke 1902

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphoneis Gomphoneis herculeana Ehrenberg 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema acuminatum Ehrenberg 1832 431359 KJ011853 JN790280

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema acuminatum var elongata W.smith 1864

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema affine Kützing 1844 1752172 KJ011834 KT072970

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema angustatum Kützing 1864 1574444 KJ011835 KJ011652

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema angustatum var linearis Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema augur var turris Bertalot 1985 1223575 KT072908 KT072958

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema angustum C.a.Agardh 1831

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema brebissonii Kützing 1849 1574445 KJ011836 KJ011653

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema calcifugum Lange-bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema capitatum Ehrenberg 1838 286101 AY571751

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema clavatum Ehrenberg 1832 1223577 KF959643

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema clevei Fricke 1902 1223578 JQ354682 KT072959 JQ354710

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema coronatum Ehrenberg 1840

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema duplipunctatum Lange bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema exiguum var minutissimun Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema exilissimum Lange- bertalot 1996 1223579 JQ354665 KT072955

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema gracile Eherenberg 1838 1133656 KJ011839 KJ011656

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema grasmueckii Lange-bertalot 1899

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema hebridense Gregory 1854

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema helveticum Brun 1859

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema insinge Gregory 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema italicum Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema lanceolatum C.a agardh 1830

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema longiceps var.sublcavata Eherenberg 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema minutum C.a.agardh 1831

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema olivaceum Eherenberg 1838

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema olivaceum var calcareum Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema pala Reichardt 2001

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema parallelistriatum Lange bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema parvulius Lange bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema parvulum Kützing 1849 97227 JQ354691 JN790286 JQ354724

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema parvulum var parvulum f. saprophilum Lange bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema productum Lange bertalot 1993 431365 AM710460 AM501993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema parvulum var subelliptica Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema rhombicum Fricke 1905

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema subtile Ehrenberg

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema tergestinum F ricke 1905

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema truncatum Ehrenberg 431325 AM710509 AM501956

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Gomphonema Gomphonema ventricosum Gregory

Page 35: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

35

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Rhoicospheniaceae Gomphosphenía Gomphosphenia grovei A. Schmi Lange-Bertalot 1995

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhabdonematales Grammatophoraceae Grammatophora Grammatophora angulosa Ehrent 1841

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhabdonematales Grammatophoraceae Grammatophora Grammatophora marina Lyngby Kützing 232512 AB430677 AY216906

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhabdonematales Grammatophoraceae Grammatophora Grammatophora marina var adrii Grunow 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Grunowia Grunowia solgensis Cleve-Euler

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Grunowia Grunowia tabellaria Grunow 1864

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Rhizosoleniales Rhizosoleniaceae Guinardia Guinardia delicatula Cleve 216802 HQ912515 HQ912651

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma acuminatum Kützing Rabenhorst 1003055 KM999104 KM999008

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma acuminatum var brebissoni Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma acuminatum var curta Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma acuminatum var gallica Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma attenuatum Kützing rabenhorst 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma balticum Ehrenberg rabenhorst 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma distortum W.smith 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma eximium Boyer 1927

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma fasciola Ehrenberg 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma macrum W.smith 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma nodiferum Reimer 1966

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma obscurum W.smith 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma peisonis Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma scalproides Cleve 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma spencerii Baley ex quekett 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma spencerii var curvula Grunow1966

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma strigilis W.smith 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma tenuissimum W.smith 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma tenuissimum var hyperborea Cleve 1894 1056093 JN162786

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Gyrosigma Gyrosigma wansbeckii Donkin 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Unariaceae Hannaea Hannaea arcus Patrick 1966

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia amphioxys Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia amphioxys var capitata Muller 1909 186034 KM116089

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia amphioxys var maior Grunow in Van Heurck 1880-1885

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia amphioxys var vivax Grunow 1880 1003059 HQ912390 HQ912404

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia distinctepunctata Hustedt Schrnidt 1921

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia elongata Grunow 1880 1561707 KM999114 KM116084

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia fenestrata Hustedt 1949

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia marina Cleve1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia spectabilis Hustedt 1959 1561709 KM116101

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia virgata var capitellata A.schmidt 1922

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Hantzschia Hantzschia vivax Grunow 1877

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Haslea Haslea spicula Lange bertalot 1997 1051714 HM805034

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Hippodonta Hippodonta hungarica Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Hippodonta Hippodonta capitata Lange bertalot 1996 431368 AM710432 AM501966

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Hippodonta Hippodonta costulata Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Hyalodiscaceae Hyalodiscus Hyalodiscus laevis Ehrenberg 1870

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Hyalodiscaceae Hyalodiscus Hyalodiscus whitneyi Ehrenberg 1870

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Unariaceae Hyalosynedra Hyalosynedra laevigata var angustata Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Karayevia Karayevia clevei Grunow 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Karayevia Karayevia oblongella Abola 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Kobayasiella Kobayasiella subtilissima Lange bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Kolbesia Kolbesia gessneri Hustedt 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Kolbesia Kolbesia ploenensis Hustedt 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Kolbesia Kolbesia suchlandtii Hustedt 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Lemnicola Lemnicola hungarica Grunow 1997 1003069 HQ912490 KJ658407

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyceae Chaetocerotales Leptocylindraceae Leptocylindrus Leptocylindrus danicus Cleve 163516 KC969776 KC894150 KJ671734

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora abbreviata C. A. agarh 1831 297518 KP125883 AY633761

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora debilis G Van Heurck 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora flabellata Carmich Agardh 1831 297516 AY633757

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora gigantea Mereschlo 1901

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora gracilis var anglica Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora grandis Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora hyalina Kützing 1867

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora nubecula Kützing 1878

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora oedipus Kützing e Van Heurck

Page 36: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

36

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora proboscidea Meresc 1901

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmophora Licmophora remulus Grunow 1880 1158051 JN975263 KT321975

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Licmophoraceae Licmosphenia Licmosphenia schmidtii Mereschkowsky 1902

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Luticola Luticola binodis Hustedt 2001

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Luticola Luticola cohnii Hilse Mann 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Luticola Luticola goeppertiana Man in round 1990 2018692 AM710433 AM501967

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Luticola Luticoa mutica Kützing 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Luticola Luticola mutica f.lanceolata Kützing 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Luticola Luticola nivalis Ehrenberg 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Luticola Luticola saxophila Bock ex hustedt 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Diadesmidaceae Luticola Luticola ventricosa Kutzing 1990 2018692 KY863486 KY863469

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Lyrellales Lyrellaceae Lyrella Lyrella hennedyi W.smith 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Lyrellales Lyrellaceae Lyrella Lyrella lyra Ehrenberg karayeva 1978

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Martyana Martyana atomus Hustedt 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Martyana Martyana martyi Héribaud 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia angulata Lewis 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia aquilegiae Grunow 1893

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia baltica Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia braunii Grunow 1863

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia crucicua Grunow 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia elliptica C.A Agardh 1893

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia elliptica f.oblonga Abola 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia elliptica var dansei Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia ignorata Hustedt 1959

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia lacustris Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastoglia ovalis A.schmidt 1933

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia ovulum Hustedt 1933

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastoglia paradoxa Grunow 1878

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia pisciculus Cleve 1893

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia pumila Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia pusilla Cleve

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia pusilla var linearis Oestrup 1910

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia recta Hustedt 1942

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia robusta Hustedt 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia schmidtii Heiden 1928

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia smithii Thwaites 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia smithii var amphicepala Grunow 1878

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Mastogloiales Mastogliaceae Mastogloia Mastogloia varians Hustedt 1933

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Mayamaea Mayamaea asellus Weinhold 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Mayamaea Mayamaea agrestis Hustedt 2001

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Mayamaea Mayamaea atomus Lange bertalot 1997 431391 AM710434 KF417670

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Mayamaea Mayamaea atomus var permitis Lange Bertalot 1997 1302819 JN418670 JN418600

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculales incertae sedis Mayamaea Mayamaea excelsa Krasske 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Melosiraceae Melosira Melosira dubia kützing 1844 515480 AB430661 AB430588

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Melosiraceae Melosira Melosira lineata Dillwyn 1824

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Melosiraceae Melosira Melosira lineata var subangularis Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Melosiraceae Melosira Melosira moniliformis Agardh 1824 1648476 KM592936 KM592935

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Melosiraceae Melosira Melosira moniliformis var octogonalis Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Melosiraceae Melosira Melosira nummuloides Agardh 1824 35125 HQ912430 HQ912566

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Melosiraceae Melosira Melosira varians C.a Agardh 49256 KC309611 KT072969

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Meridion Meridion circulare Greville 1831

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Meridion Meridion circulare var constricta Ralfs 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Muelleria Muelleria gibbula Cleve 1997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Muelleria Muelleria islandica Lange bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicella Navicella pusilla W.smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula absolua Hustedt 1950

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula abunda Hustedt 1955

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula ammophila Grunow 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula anglica Ralfs 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula anglica var minuta Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula angusta Grunow 1860

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula antiqua Grunow 1878

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula aquaedurae Lange bertalot 1993

Page 37: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

37

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula arenaria Donkin 1861 355634 KU561174

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula armata Carter 1964

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula arvensiformis Carter 1970

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula arvensis Hustedt 1937

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula bacilloides Hustedt 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula bipustulata Mann 1873

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula bottnica Grunow1879

Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula brehmii Hustedt 1927

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula brockmannii Hustedt 1934

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula canariana Lange bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicul cancellata Donkin 1872

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula capitatoradiata Germain 1981 431397 KT072920 KT072982

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula cari Ehrenberg 1836 431399 AM710457 KY054972

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula cariocincta Lange bertalot 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicua catalanogermanica Lange bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula caterva Hohn 1963

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula cincta Ehrenberg 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula clementis Grunow 1882

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula concentrica Carter 1981

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula cryptocephala Kützing 138538 KC736601 HQ317071

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula cryptotenella Lange-bertalot 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula delicatula Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula detenta Hustedt 1943

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula dicephala Ehernberg 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula dicephala var neglecta Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula difficillima Hustedt 1950

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula digitoradiata Gregory 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula digitulus Hustedt 1943

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula dilucida Hustedt 1939

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula diluviana Krasske 1933

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicua duerremburgiana Hustedt 1934

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula enigmatica Germain 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula erifuga Lange bertalot 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula exigua Gregory 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula exilis Kützing 1884

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula expecta Van landingham 1975

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula festival Kresske 1925

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula fluens Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicul gastrum Ehrenberg 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula glomus J.R.Carte 1981

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula gottlandica Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula grasmueckii Lange-bertlot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula gregaria Donkin 1861 355633 KY320297 HM805037

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula hedini Oestrup 1922

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula heimansii Kooyman 1982

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula henriquesii Zimmermann 1917

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula hustedtii Krasske 1923

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula impexa Hustedt 1961

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula integra W.smith 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula kotschyi Grunow 1860

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula lanceolta C.a agardh 1838 265549 FJ002148 AY485484

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula lanceolata var tenella Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula laterostrata Hustedt 1925

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula lepidissima Cleve 1953

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula limosa Kutzing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula longicephala Hustedt 1944

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula lundii Reichardt 1991

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula lusitanca Zimmermann 1917

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula macaronesica Lange-bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula margalithii Lange-bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula medioconvexa Hustedt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula meniscus Schumann

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula menisculus Schumman

Page 38: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

38

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula microcari Lange-bertalot

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula microdigitoradiata Lange-bertalot 2267616 MG968534

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula minima Grunow 1880 97222 HM449712 HM449704

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula modica Hustedt 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula mollis W.smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula mucicola Hustedt 1933

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula normalodies Cholnoky 1968

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula notha Wallace 1960

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula oblonga Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula ordinaria Hustedt 1950

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula palpebralis Brébisson 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula paucivistriata Patrick 1959

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula pavillardii Hustedt 1939

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula pennata A.schmidt 1876

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula peregrina Ehrenberg 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicua phyllepta Kützing 1844 265527 EU938320 DQ235783

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula praeterita Hustedt 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula pseudoarvensis Hustedt 1942

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula pseudobryophila Hustedt 1942

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula pseudolanceolata Lange-bertalot 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula pseudonivalis Bock 1970

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula pusio Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula radiosa Kützing 1844 431563 KM084955 AM502027

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula radiosafallax Lange-bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula ramosissima C.a agardh 1895 265559 KY320302 KY320363 NC_031848

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula recens Lange-bertalot 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Nevicula reichardtiana Bertalot lange 1989

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula reinhardtii Grunow 1877 431564 AM710442 KU561136

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula rhynchocephala Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula rhynchotella Lange bertalot 1993 1560736 KM084952 KM084887

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula rostellata Kutzing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula rotaeana Rabenhorst 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula rotesta Carter 1970

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula rotunda Hustedt 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula salinarum f.capitata Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula salinarum Grunow 1880 2014770 KY320303 KY320364

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula salinarum var minima Grunow 1927 2014785 KY320304 KY320365

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula salinicola Hustedt 1939 63141 KY320305 KY320366

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula schmassmanii Hustedt 1933

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula schroeterii Meister 1933

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Naviucla scolipleuroides Quit 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula secura Patrick 1959

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula seminulodies Hustedt 1936

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula severascens Cholnoky 1960

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula slesvicensis Grunow 1880 1560742 KM084942

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula stankovicii Hustedt 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula striolata Grunow 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula subadnat Hustedt 1942

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula subrotundata Hustedt 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula subvasta Carter 1970

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula subminuscula M. Manguin 1941 97223 KT072935 AJ867026

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula submuralis Hustedt 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula subrotundata Hustedt 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula subrhynchocephala Hustedt 1935

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula symmetrica Patrick 1944

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula tenelloides Hustedt 1937

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula tridentula Krasske 1923

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula tripunctata Bory 1822 431568 KM084986 MF992125

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula tripunctata var schizonemoides Patrick 1959

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Naviucla trivialis Lange bertalot 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula upsaliensis M.peragallo 1903

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula veneta Kützing 1844 138539 AM710441 AM501975

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula vilaplani Lange-bertalot 2000

Page 39: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

39

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula viridula var rostellata Kützing 1838 1752179 KT072916 KT072966

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula visitanda Carter 1970

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula vitrea Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula vulpina Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Navicula Navicula difficilimoides Hustedt 1957

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium affine Pfitzer 1871 432551 HQ912447 HQ912583

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium affine var longiceps Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium alpinum Hustedt 1943

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium ampliatum Ehrenberg krammer 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium apiculatum Reimer 1959

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium binodis Ehrenberg

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium bisulcatum Lagersted 1894 1003081 HQ912455 HQ912591

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium carteri Krammer 1975

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium dubium Ehrenberg

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium dubium var constricta Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium hercynicum Mayer 1914

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium ehrenberg Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Neidium Neidium productum W.smith 1894 1003082 HQ912446 HQ912582

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Neosynedra Neosynedra provinicialis Grunow 1986

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitszchia pura Hustedt 1954

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia acicularioides Hustedt 1959

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia acicularis Kützing 1853 303399 KX889095 AJ867000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia acidoclinata Lange- Bertalot 1976 1302829 KC736602 KT072971 KC736648

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia agnita Hustedt 1957

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia alpina Hustedt 1943

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia amphibia f. frauendeldii Grunow 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia amphibia Grunow 1862 304200 HF675118 AJ867277

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzscihla amphibioides Hustedt 1942

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia amplectens Hustedt 1957

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia angustatula Lange-Bertalot 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia archibaldii Lange-bertalot 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia aurariae Cholnoky 1966 1880613 KT943663 KT943639

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia austriaca Hustedt 1959

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia bergii Cleve-euler 1953 2014773 KY320318 KY320379

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia brevissima Grunow 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia bryophila Hustedt 1943

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia capitellata Hustedt 1922 483532 FN557031 KU561195

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia clasuii Hantzsch 1860

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia costerium Ehrenberg 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitszchia communis Rabenhorst 1860

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitszchia cummutata Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitszchia delicatissima Cleve 1897

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia desertorum Hustedt 1949

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia dissipata Kützing Grunow 1862 303402 KY320332 KF417684

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia dissipata var media Van Heurck 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia draveillensis Coste & Ricard 1980 1261641 KC736605 JQ610160.2

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia dubia W. Srnith 1853 2014774 KY320320 KY320381

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia elegantula Grunow in Van Heurck 1881 1034830 KY054977

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia epithemoides Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia epithemoides var disputata Lang -Bertalot 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia fasciculata Grunow in Van Hcurck 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia filiformis W. Smith 1896 303398 HQ912453 AJ866999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia filidormis var conforta Richter 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia flexa Schumann 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia fonticola Grunow 1879 303406 HF675068 AJ867022

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia frustulum var perpusilla Rabenhorst 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia fruticosa Hustedt 1957

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia gandersheimiensis Kresske 1927

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia gessneri Hustedt 1953

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia graciliformis Lange-bertalot 1978

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia gracilis Hanzsch 1860

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia hantzschiana Rabenhorst 860 1753982 KT072967

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia harderi Hustedt 1949

Page 40: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

40

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschía heufleriana Grunow 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia homburgiensis Lange-Bertalot 1978

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia hybrida Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia inconspicua Grunow 1862 303405 KC736607 AJ867021 KC736649

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia intermedia Hantzsch 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia lacunarum Hustedt 1922

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia lacuum Lange-bertalot 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia lancelotata var minor Van haurek 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia lanceolata W.smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia lesbia Cholnoky 1963

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia liebertruthii Rabenhorst

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia linearis C. A. Agardh 1853 303401 KT072917 AJ867013

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia linearis var subtilis Hustedt 1923

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia linearis var tenuis Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia littorea var parva Grunow 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia longissima Ralfs ex Pritchard 309721 MH064112 KJ671700 KJ671736

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia lorenziana Grunow 1880 1302830 KC736608 KC736637

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia macaronesica Lange- Bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia microcephala Grunow ir & Moller 1878,50 1051713 HM805042

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia nana Grunow 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia obtusa W. Smith 1853 908985 KY054985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia ovalis Arnott ex Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia palea Kützing 303400 KJ729150 AJ867010 KJ542433

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia palea f debilis Krammer 1988

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia palea f. major Krammer 1988

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia palea var tenuirostris Gronow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia paleacea Grunow 1881 303396 KX889092 AJ866996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia paleaformis Hustedt 1950 2014777 KY320322 AJ866997

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia parvula W.smith 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia perindistrincta Cholnoky 1960

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia perminuta M.peragallo 1903

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia pseudofonticola Hustedt 1942

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia pumila Hustedt 1954

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia pusilla Lange-bertalot 1976 270628 KY320329 AJ867016

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia recta Rabenhorst 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia reversa W.smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia rosenstockii Lange-bertalot 1980

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia rostellata Hustedt 1922

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia scalaris Ehrenberg 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia scalpelliformis Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia serpenticula Cholnoky 1968

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia sigma Kützing 1853 304202 KY320337 AJ867279

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia sigma var rigida Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia sigma var rigidula Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia sigmaformis Hustedt 1955 2014778 KY320325 KY320386

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia sigmoidea W.smith 1853 686323 FN557033 FR873262

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia sociabilis Hustedt 1957

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia solita Hustedt 1957

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia subacicularis Hustedt 1922

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia subcapitellata Hustedt 1909

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia sublinearis Hustdt 1921

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia suchlandtii Hustedt 1943

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia supralitorea Lange-bertalot 1979 303403 AJ867019

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia tenerifa Lange-bertalot 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia terrestris Hustedt 1934

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia thermalis var intermedia Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia thermaloides Hustedt 1955

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia tropica Hustedt 1949

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia tubicola Grunow 1880 1259757 JX905670

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia umbonata Lange Bertalot 1978

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia valdecostata Lange-Bertaot & Simonsen 1978

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia valdestriata Aleem & Hustedt 1951 1880615 KT943664 KT943640

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia vermicularis Hantzsch in Rabenhorst 1860

Page 41: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

41

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia vidovichii Grunow 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia vitrea Norrnan 1861 304203 AJ867280

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillariaceae Nitzschia Nitzschia impexiformis Lange-bertalot

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiraceae Nupela Nupela lapidosa Krasske 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Brachysiraceae Nupela Nupela silvahereynia Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Opephora Opephora olsenii Moller 1950

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Melosirales Orthoseiraceae Orthoseíra Orthoseíra roeseana Rabenhorst 1876 2320516 MH485376 MH485375

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Berkeleyaceae Parlíbellus Parlibellus crucicula W. Smith 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Berkeleyaceae Parlíbellus Parlibellus cruciculoides Brockn Witkowski Lange-Bertaot

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Berkeleyaceae Parlíbellus Parlíbellus protracta Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Berkeleyaceae Parlíbellus Parlibellus protractus var elliptica Gallik

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Eunotiales Peroniaceae Peronia Peronia erinacea Brébisson & Kitton 1868

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Lyrellales Lyrellaceae Petroneis Petroneis marina Ralfs 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Pínnuavís Pinnuavis armoricana Witkowski, Lange-Bertalot 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Pinnuvis Pinnuavis elegans W.Smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia acoricola Hustedt 1934

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia acrosphaeria Rabenhorst 1853 431571 JN418672 AM743094 KC736652

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia acuminata W.smith 1853 1089217 MH707953 JN418597

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia aestuarii Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia alpina W.smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia angusta var rostrata Krammer 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia appendiculata C.a agardth 1895 445246 AM743095

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia biceps Gregory 1856 445247 AM743096

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia borealis Ehrenberg 1843 1089218 MH707991 JN418592

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia borealis var retangularis Carlson 1913

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia brandelii Cleve 1891

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia brauniana Grunow mills 1934 445248 AM743097

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia brebissonii Kützing 445249 HQ912468 HQ912604

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia cardinalis W. Smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia cuneola Reichardt 1981

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia divergens W. Smith 1853 1043711 KM350034 FR873263

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia divergentissima Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularía episcopalis Cleve 1891

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia esox Ebrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia finlandica Cleve-Euler 1955

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia gentilis Cleve 1881 445250 AM743099

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia gibba Ehrenberg 1843 445251 AM743100

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia gibba f. subundulata Mayer ex Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia gibba var mesogongyla Hustedt 1930

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia gibbiformis Kramrner 1992

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularla gigas Ehrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia globiceps Gregory 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Piunularia insociabilis Krasske 1939

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia integra W. Smith 185

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia intermedia Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia interruptiformis Krammer 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia karelica Cleve 1891 1652772 KM350026 KM350124

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia krookii Cleve 1891

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia lata Rabenhorst 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pínnularia legumen Ehrenberg

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia lundii Hustedti 1954

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia macilenta Ehrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia maior Kützing 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularía mayeri Krarmmer 1992 445252 AM743102

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia mesolepta Smith 1853 431576 AM710491 AM502024

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia microstauron Ehrenben Cleve 1891 431577 AM710450 AM501984

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia microstauron var ambigua Meister 1912

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia molaris Grunow Krarru 1985

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia neglecta Mayer Berg

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia neomajor var cuneata Krammer 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pínnularla nobilis Ehrenberg Ehre 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularía obscura Krasske 1932

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia obscuriformis Krammer

Page 42: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

42

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia polyoca W.smith 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia rabenhorstii Krammer 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia semicruciata A.schmidt 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia stomatophora Cleve 1891 1652776 KM350022 KM350117

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia subcapitata var constricta Hustedt 1937

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia subcapitata Gregory 1856 431579 AM710445 AM501979

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia subinterrupta Krammer 1992

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia subsolaris Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia sudetica Hse 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia superdivergentissima Germain 1976

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia tabellaria Ehrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia viridis Ehrenberg 1843 431582 KM350021 AM502023

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia viridis var commutata Cleve 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia viridoides Krammer

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pinnulariaceae Pinnularia Pinnularia elginensis Gregory

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Placoneis Placoneis ignorata Lange-bertalot 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Placoneis Placoneis gastrum Ehrenberg 1844 1574457 KJ011670

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Placoneis Placoneis placentula Ehrenberg 1995

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Placoneis Placoneis placentula var lanceolata Grunow Aboal

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Placoneis Placoneis placentula var rostrata Andresen, Stoerrner & Kreis 2000

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Placoneis Placoneis pseudanglica Lange- Bertalot

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium conspicuum A. Mayer

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium daui Lange-Bertalot & Genkal 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium delicatulum Round & Bukhtiyarova 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium distinctum Lange bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium dubium Lange- bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium ellipticum Lange-bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium engelbrechtii Cholnoky 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium frequentissimum Lange-bertalot 1999 1530226 KJ658392 KY650785

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium hauckianum Buktiyarova 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium haynaldii Lange bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium lanceolatum Lange-bertalot 1999 216798 KJ658393 KY650780

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium lanceolatum f.ventricosum Bukhtiyarova 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium oestrupii Bukhtiyarova 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium peragallii Bukhtiyarova 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothdium pericavum Lange bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium rostratum LangeBertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Planothidium Planothidium septentrionalis Oestrup

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pleurosigmataceae Pleurosígma Pleurosigma angulatum W. Smith 1852

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pleurosigmataceae Pleurosígma Pleurosigma angulatum var aestuarii Van Heurck 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pleurosigmataceae Pleurosígma Pleurosigma delicatulum W. Smith 1852

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pleurosigmataceae Pleurosígma Pleurosigma elongatum W. Smith 1852 1048731 HQ685847

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pleurosigmataceae Pleurosígma Pleurosigma formosum W. Smith 1852

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pleurosigmataceae Pleurosígma Pleurosigma intermedium var normanii Pritehard 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pleurosigmataceae Pleurosígma Pleurosigma intermedium W.smith 1853 197753 AY485489

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pleurosigmataceae Pleurosígma Pleurosigma rigidum W.smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Pleurosigmataceae Pleurosígma Pleurosigma salinarum Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Eupodiscale Eupodiscaceae Pleurosira Pleurosira laevis Ehrenberg 1982 210609 HQ912449 HQ912585

Stramenopiles Bacillariophyta Proschkinia Proschkinia bulnheimii Karayeva 1978

Stramenopiles Bacillariophyta Proschkinia Proschkinia hyalosirella Hustedt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium altaicum Bukhtiyarova 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium bioretii Bukhtiyarova & Round 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium curtissimum J Cartel

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium daonese Bertalot 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium helveticum Bukhtiyarova & Round

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium hustedtii Krasske

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium lacus-vulcanis Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium marginulatum Grunow 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium montanum Krasske

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium perpusillum Oestrup 1999

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium pseudoswazi Carter 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium rossii Hustedt 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium sacculum Carter 1996

Page 43: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

43

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium semiapertum Hustedt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Psammothidium Psammothidium subatomoides Hustedt 1996 1797000 KR709276

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Pseudostaurosira Pseudostaurosira brevistriata Grunow 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Pseudostaurosira Pseudostaurosira pseudoconstruens Williams 1987 426658 KU851883 MF093080

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Pseudostaurosira Pseudostaurosira robusta Round 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Reimeria Reimeria sinuata Gregory 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Gomphonemataceae Reimeria Reimeria uniseriata Guerrero 1993

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Rhizosoleniales Rhizosoleniaceae Rhizosolenia Rhizosolenia longiseta Zacharias 1893

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Rhizosoleniales Rhizosoleniaceae Rhizosolenia Rhizosolenia stolterfothii H. Peragallo 1888

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Rhoiscospheniaceae Rhoicosphenia Rhoicosphenia abbreviata C. A. Agardh Lange-Bertalot 1980 1574460 KJ011855 KJ011673

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Rhoiscospheniaceae Rhoicosphenia Rhoicosphenia marina A. Schmidt 1874

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia constricta W. Smith Krammer 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia gibba O. Muller 1895 245179 KX120556 KX120675

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia gibba var minuta Krarnmer 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia gibba var paralella H. Peragallo

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia gibba var ventricosa H. Peragallo & M. Peragallo 1897-1908

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia gibberula (Ehrenberg) O. Muller 1899

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia giberula var minuta Mills 1934

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia gibberula var producta O.müller 1899

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia gibberula var vanheurecki O.Müller

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia musculus O.Múller 1899

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia operculata C. A. Agardh 1979,

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Rhopalodiales Rhopalodiaceae Rhopalodia Rhopalodia rupestris W.Smith Krammer 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Rossithidium Rossithidium Iinearis W. Smith

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Rossithidium Rossithidium nodosum Cleve Aboal

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Rossithidium Rossithidium petersenii Round & Bukhtiyarova 1996 1797044 KR709275

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cocconeidales Achnanthidiaceae Rossithidium Rossithidium pusillum Round & Bukhtiyarova 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Scoliopleura Scoliopleura peisonis Grunow 1003108 HQ912473 HQ912609

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Neidiaceae Scoliopleura Scoliopleura tumida Rabenhorst 1864

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora americana Ehrenberg 1989

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora bacillum Ehrenberg 1990 286094 EF143284 EF151980 FJ042925

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora disjunta Hustedt

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora gregoriana Lange-BertaJot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora joubaudii Germain

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora laevissima Kützing 1989 221717 EF143313 EF151981 AB971666

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora mutata Lange-Bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora nyassensis O. Müller 1989

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora parapupula Lange-Bertalot 1998

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora pupula Mereschkowsky 1902 216741 EF143318 EF151984 FJ042923

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora pupula var rostrata Lange-bertalot 1998

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora pupula var elliptica Hustedt 1995

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora seminulum Grunow 1989 1302831 KC736613 KT072976 KC736653.1

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora stroemii Hustedt 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora vitabunda Hustedt 1989

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Sellaphoraceae Sellaphora Sellaphora costatum Cleve 1878

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiosirales Skeletonemataceae Skeletonema Skeletonema costatum Cleve 1878 2843 AF015569 JN676163 LC222537

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassiosirales Skeletonemataceae Skeletonema Skeletonema potamos Weer 1976 1429247 KJ081746 KF621298 LC192733

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Stauroforma Stauroforma exiguiformis Flower jones 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis acuta W.smith 1853 1003109 HQ912443 HQ912579

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis anceps Ehrenberg 1943 431585 AM710475 KU561218

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis anceps f.gracilis Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis anceps var birostris Cleve 1894

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis anceps var linearis Ehrenberg 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis dilatata Ehrenberg 1841

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis kriegerii Patrick 1945

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis lauenburgiana Hustet 1950

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis legumen Ehrenberg 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis neohyalina Lange-bertalot 1996

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis obtusa Lagerstedt 1873

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis phoenicenteron Ehrenberg 1843 431588 KM084992 FR873264

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis productum Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis prominula Grunow 1950

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis pseudosubobtusoides Gerrnain 1980

Page 44: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

44

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis smithii Grunow 1860 1133660 JQ003573

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis smithii var incisa Pantoc ek 1952

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Stauroneidaceae Stauroneis Stauroneis thermicola Petersen 1946

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Naviculales Naviculaceae Stauronella Stauronella amphoroides Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Animoeoneidaceae Staurophora Staurophora amphyoxis Gregory 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Animoeoneidaceae Staurophora Staurophora salina W.smith 1903

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Animoeoneidaceae Staurophora Staurophora wislouchii Mann in round 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Animoeoneidaceae Staurophora Staurophora construens Ehrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Cymbellales Animoeoneidaceae Staurophora Staurophora construens f subsalina Bukhtiyarova 1995

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Staurosira Staurosira construens f venter Ehrenberg Bukhtiyarova 1995

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Staurosira Staurosira construens var binodis Ehrenberg Hamilton . 1992,9

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Staurosirella Staurosirella leptostauron Williams & Round 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Staurosirella Staurosirella leptostauron var dubia Bukhtiyarova 1995

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Staurosirella Staurosirella pinnata Williams & Round 1987 455043 HQ912484 HQ912620

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Staurosiraceae Staurosirella Staurosirella pinnata var intercedens Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Stenopterobia Stenopterobia anceps Van heurck 1896

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Stenopterobia Stenopterobia curvula W.smith 1987 1003112 HQ912402 HQ912416

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Stenopterobia Stenopterobia delicatissima Brébisson ex Van Heurck 1896

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Stephanodíscus Stephanodíscus alpinus Hustedt in Pestalozzi

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Stephanodíscus Stephanodiscus binderanus Krieger 1927 382368 DQ514824 DQ514896

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Stephanodíscus Stephanodiscus hantschii f. tenuis Hustedt

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Stephanodíscus Stephanodiscus hantzschii Grunow Cleve & Grunow 1880 29207 AB831882 DQ514914

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Stephanodíscus Stephanodiscus minutulus Móller 1878 222884 DQ514844 DQ514916

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Stephanodíscus Stephanodiscus neoastraea Hákans Hickel 1986 196595 DQ514834 DQ514906

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Stephanodíscus Stephanodiscus parvus Stoermer 1984 382369 KT072902 KT072953

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Stephanodiscales Stephanodiscaceae Stephanodíscus Stephanodiscus rotula Hendey 1964

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Striatellaceae Striatella Striatella unipunctata Agardh 1832 210618 JX419384 JX419383

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella angusta Kützing 1844 303409 KX120624 AJ867028

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella angustata Kutzing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella bifrons Ehrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella bifrostrata Hustedt 1912

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella biseriata Brébisson 1836 1289063 JX033009 KX120768

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella biseriata var subacuminata Meister 1912

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella bohemica Maly 1895

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella brebissonii Krammer 1987 1951155 KX120621 KX120739

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella brebissonii var kuetzingii Lange-bertalot 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella brebissonii var punctata Krammer 1987

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella brightwellii var baltica Krammer 1977

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella carpronii Brebisson 1869

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Striatellales Surirellaceae Surirella Surirella constricta W.smith 1851

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella crumena Brebisson 1849

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella elegans Ehrenberg 1843

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella fastuosa Ehrenberg 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella gracilis Grunow 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella linearis var constricta Ehrenberg 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella linearis var helvetica Meister 1912 1289100 JX032972

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella linearis W.smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella minuta Brebisson 1849 1003121 KX120610 KX120726

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella ovalis Brebisson 1838 1289103 KX120615 KX120732

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella ovulum Hustedt 1942

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella peisonis Panctocsek 1942

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella pseudolinearis Krasske 1939

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella roba Leclercq 1983

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella robusta Ehrenberg 1841

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella spiralis Kützing 1884 1289104 JX032964

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella splendida Ehrenberg 1844 1003126 HQ912401 KX120762

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella striatula Turpin 1828 1951397 KX120639 KX120759

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella subsalsa W.smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella tenera Gragory 1856 1289105 JX033012 KX120772

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella tenera var nervosa A.schmidt 1874

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Surirellales Surirellaceae Surirella Surirella turgida W.smith 1875

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Synedra Synedra actinastroides Lemmermann 1900

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Synedra Synedra baculus Gregory 1857

Page 45: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

45

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Synedra Synedra baltica Ehrenberg

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Synedra Synedra filiformis Grunow 1880

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Synedra Synedra filiformis var capitata Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Synedra Synedra filiformis var exilis Cleve 1939

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Synedra Synedra filiformis var major Cleve 1941

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Synedra Synedra fulgens var mediterranea Grunow 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Fragilariales Fragilariaceae Synedra Synedra hartii Holnoky 1963

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Tabellaria Tabellaria fenestrata Kützing 1844

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Tabellaria Tabellaria flocculosa Kützing 1844 426662 HQ912448 HQ912584

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Tabularia Tabularia affinis var acuminata Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Tabularia Tabularia fasciculata C.A.Agardh 426663 JN162827 JX437450

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Tabularia Tabularia grandis Mereschkowsky

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Terpsinoe Terpsinoe musica Ehrenberg1843 1003137 HQ912546 HQ912682

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Tabellariales Tabellariaceae Tetracyclus Tetracyclus rupestris Grunow 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassionematales Thalassionemataceae Thalassionema Thalassionema mediterranea Pavillard 1916

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassionematales Thalassionemataceae Thalassionema Thalassionema nitzschiodies Grunow 1881

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Thalassionematales Thalassionemataceae Thalassionema Thalassionema bramaputrae Ehrenberg 1981

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Thalassionematales Thalassionemataceae Thalassiosira Thalassiosira decipiens Jorgensen 1905 1366658 KC985735

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Thalassionematales Thalassionemataceae Thalassiosira Thalassiosira hyperborea Lange Bertalot 1989

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Thalassionematales Thalassionemataceae Thalassiosira Thalassiosira pseudonana Heimdal 1970 35128 HQ912419 KU900218 DQ186202

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Thalassionematales Thalassionemataceae Thalassiosira Thalassiosira weissflogii Fryxell 1977 1577725 KY751728 KU341748

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Eupodiscale Parodontellaceae Trieres Trieres mobiliensis Grunow 1880 655800 KC309574 MG835772

Stramenopiles Bacillariophyta Mediophyaceae Toxariales Toxariaceae Toxarium Toxarium undulatum W. Smith 1853 210620 HQ912518 HQ912654 NC037988

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella acuminata W. Smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella acuta Cleve 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella angustata var acuta Bukhtiyarova 1995

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella angustata W. Smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella apiculata Gregory 1857 1003145 HQ912464 KY320397

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella balatonis Pantocsek 190

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella calida Grunow 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella coarctata Grunow 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella compressa Bailey Poulin 1991 913974 HQ337573

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella debilis Amott in O'Meara 1873

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella gracilis var subsalina O'Meara Aboal

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella gracilis W. Smith 1853

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella granulata Grunow 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella hungarica Frenguelli 192

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella hungarica var linearis Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella levidensis W. Smith 1856

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella littoralis Grunow 1990

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella navicularis Ralfs in Pritchard 1861

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariales Bacillareaceae Tryblionella Tryblionella victoriae Grunow 1862

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria acus Kützing 1436140 KF959645 KF959659

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria biceps Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria capitata Compere 2001

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria ulna Compere 426669 KC736614 KF417689

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria oxyrhynchus Kutzing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria ulna var aequalis Aboal 2003

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria ulna var amphirhynchus Aboal

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria ulna var notata Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria ulna var splendens Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria ulna var subaequalis Kützing

Stramenopiles Bacillariophyta Bacillariophyceae Licmophorales Ulnariaceae Ulnaria Ulnaria var spathulifera Grunow

Stramenopiles Bacillariophyta Coscinodiscophyceae Rhizosoleniales Rhizosoleniaceae Urosoleia Urosolenia eriensis H. L. Smith 1990 1003149 HQ912441 HQ912577

Page 46: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

46

ANNEX 2 – Arbres filogenètics pels gens 18S i rbcl

Annex 2.A Arbre filogenètic pel gen 18S

Page 47: Metabarcoding, com inventariar la biodiversitat utilitzant ... · utilitzant la tecnologia de Sanger tradicional i per la manca de llibreries de referència complertes. Els últims

47

Annex 2.B Arbre filogenètic pel gen rbcl