NADH:FMN-oxidoreductase

from Vibrio Fischeri

Выполнила Кириллова МарияФБ0801с

1http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1VFR

Aliivibrio fischeriBacteria;Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales;Vibrionaceae;Aliivibrio.

2

NADH:FMN-оксидоредуктаза катализирует реакцию:

NADH + FMN → NAD+ FMNH2

Является гомодимером, и каждый мономер связывается с FMN как с кофактором

EC 1.6.8.1

3

4

FMNNADPH

FMNH2NADP+

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?Dopt=s&uid=96435

NAD(P)H\:FMN OXIDOREDUCTASE

flavin mononucleotide

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?Dopt=s&uid=96436

217 аминокислотных остатков:48% спирали (14 спиралей; 106 остатков)16% β-листов(8 нитей; 35 остатков)

7http://www.rcsb.org/pdb/explore/remediatedSequence.do?structureId=1VFR&params.annotationsStr=DSSP%2CSCOP&params.showJmol=false

FMN

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=444243http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=444243 8

FMNComputed Properties:

• Molecular Formula C17H21N4O9P+

• Molecular Weight 457.351741 [g/mol]

• H-Bond Donor 7• H-Bond Acceptor 10• Heavy Atom Count 31• Formal Charge 1• Covalently-Bonded Unit Count 1

9

10http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1VFR

NADPH

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=5886

11

http://www.brenda-enzymes.org/Mol/Mol.php4?n=14331

NADPH• Computed Properties:

• Molecular Weight 744.412943 [g/mol]• Molecular Formula C21H29N7O17P3+

H-Bond Donor 9• H-Bond Acceptor 17• Heavy Atom Count 48• Formal Charge 1 • Covalently-Bonded Unit Count 1•

12

Где изучают ЯпонияСШАРоссияКитайВеликобритан

ияФинляндия

13

• Houston • Tokyo • Yokohama• Kyoto • Shizuoka, Japan • Krasnoyarsk • Moscow, Russia • Zhongxing • Athens, USA • London • Turku • College Station

14http://gopubmed.org/web/gopubmed/1?WEB01418s2w7gmm65IiIxI0

Кто изучает Zenno S Saigo K Tu S Tanokura M Inouye S Lei B Jeffers C Koike H Sasaki H Koike H Hirayama S Karatani H Izuta T Maruhashi K Ishii Y Konishi J Suzuki M Van Hoek A Vetrova E Kudryasheva N Visser A

Wang H Yu Y Tang C Nichols J Danilov V Mazhul' M Zavil'gel'skiĭ G Zarubina A Iudina Nohmi T Watanabe M Nishino T Takio K Sofuni T Kobori T Murphy M Adman E Weng S Lin J Chao Y Lee J

Petushkov V Li W Parry R Nakamura H Kanoh H Rabin B Harbron S Eggelte H Benson S Ståhlberg T Lavi J Raunio R Baldwin T Daubner S Astorga A Leisman G Hjertén S Brolin S DeLuca M Jablonski E

15

Где об этом пишут Biochemistry-us J Bacteriol Photoch Photobio Sci Arch Biochem Biophys Biochem Bioph Res Co J Biolumin Chemilumin J Biosci Bioeng Luminescence Mikrobiologiia J Biol Chem J Mol Biol Eur J Biochem J Biochem J Struct Biol Febs Lett P Natl Acad Sci Usa Mol Cell Biochem

16

Используемые базы данных

http://www.rcsb.org/pdbhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed http://www.gopubmed.org

17