Klinik Örneklerdeki RNA’in korunması,

Patojenlerin inaktivasyonu ve Soğuk

zincire ihtiyaç olmadan taşınabilmesi

için geliştirilmiş özgün moleküler taşıma

ortamı (PrimeStoreMTM)

L.T. Daum and G.W. Fischer

Longhorn Vaccines and Diagnostics, San Antonio 78208, TX, USA.

Longhorn-VandD@sbc.global.net

Prof. Dr. Bülbin SunarReeder

GEREKÇE

Mikrop RNA ve DNA’larının

izolasyonunda ilk ve önemli basamak,

örnekleri nükleik asitleri bozulmadan

testlerin yapılacağı laboratuvara

ulaştırabilmektir.

PrimeStoreMTM bu işlemleri

kolaylaştırmak maksadıyla geliştirilmiş

bir moleküler taşıma mediumu olup,

klinik örnekleri infeksiyon tehlikesi ve

soğuk zincire ihtiyaç olmadan taşıma

imkanı sağlar.

PrimeStoreMTM’i diğer

taşıma ortamlarından

ayıran önemli özellikler

nelerdir?

Virus ve bakteri örnekleri

ortama konur konmaz canlılığını

kaybettikleri için Enfeksiyonun

yayılma tehlikesi ortadan

kalkmaktadır.

PrimeStore Kills Microbes

Initial 4-log dilutions of PrimeStore MTM + viruses were required prior to inoculation into tissue culture lines due to PrimeStore MTM lysis of the MDCK tissue culture cells. Therefore, only a minimum 4-log TCID50/mL reduction was observable.

PrimestoreMTM ortamına

RNA (RNA-IPC) kontrol molekülü

ilave edilerek nükleik asitlerin

pozitif kalite kontroluna imkan

sağlanmıştır. Bütün nükleik asit

testlerinde gerçek-zamanlı-RT-

PCR kullanılmıştır.

0

5

10

15

20

25

30

35

40

Positive Control

PrimeStore MTM

Copan UTM

BD UTM

Remel M4RT

Cyc

le T

hre

sho

ld (

CT)

PrimeStore MTM is Ideal for NAT Compared to

Commercial Transport Media†

5-7 Cycle Threshold (CT) values lower; 10-100X more sensitive

during real-time RT-PCR

†Copan UTM is Copan Universal Transport Medium (Copan Diagnostics, Murreta, CA); BD UTM is Becton Dickinson Universal

Transport Medium (Beckin Dickinson, Sparks, MD); PrimeStore MTM is PrimeStore Molecular Transport Medium (Longhorn

Vaccines & Diagnostics, San Antonio, TX). Remel M4RT is Remel MicroTest M4RT Multi-Microbe Media (REMEL, Lenexa, KS).

Taşıma ve saklama süresince

soğuk zincire ihtiyaç

duyulmaz. Örnek çalışması

sonunda artıklar normal

olarak çöphe atılabilir.

PrimeStore MTM Preserves Influenza RNA

@ 37˚C for 14 days

0

5

10

15

20

25

30

35

40

0 2 7 14

Cyl

ce T

hre

sho

ld (

CT)

Days @ 37 °C

PrimeStore MTM

VTM

PrimeStoreMTM Nükleik asitleri taşıma ve saklama

süresince enzimatik degregasyondan korur

PrimeStoreMTM Stabilizes IPC and viral RNA at Ambient Temperature for 30 days

0

5

10

15

20

25

30

35

40

10e5 10e4 10e3 10e2 10e1

Copan UTM

PrimeStore MTM

Cyc

le T

hre

shold

(CT)

Virus Concentration (TCID50/mL)

PrimeStore MTM vs. Copan UTM Across an Influenza

Viral Dilution

At lower dilutions

(102 to 101

TCID50/mL), influen

za virus was not

detected in 25%

(1/4) and 50% (2/4)

of the replicates

tested compared to

PrimeStore MTM.

Medium’dan nükleik asitlerin

izolasyonu bilinen metotlarda

hiç bir değişiklige ihtiyaç

duyulmadan kolayca

yapılabilmektedir.

0

5

10

15

20

25

30

35

40

10^3 TCID50/mL 10^1 TCID50/mL ssRNA IPC

Cyc

le T

hre

sho

ld (

CT)

Ambion RNAqueous-Micro

Qiagen Viral Mini

Invitrogen ChargeSwitch

Ambion MagMax

PrimeStoreMTM is compatible with

Commercial Extraction Kits

PrimeStoreMTM’u Özetlersek

• Viral örnekleri toplama ve taşıma ortamıdır

• RNA/DNA’rı nükleazlardan korur

• Piyasadaki nükleik asit isolasyon kitleriyle kolaylıkla kullanılabilir

• Örnekleme, Taşıma ve saklama süresince soğuk zincire ihtiyaç olmadan arazide ve laboratuvarda kullanılır

• Nükleik asit testlerinde diğer taşıma ortamlarına göre daha sensitiftir.

References

Daum LT, Worthy SA, Yim KC, Nogueras M, Schuman RF, Choi YW, and Fischer GW. 2010. A Clinical Specimen Collection and Transport Medium for Molecular Diagnostics and Genomic Applications. Epidemiology and Infection. In press, 2010.

Luke T. Daum, Sue A. Worthy, James P. Chambers, Demetra Kelenis, John Rodriquez, Dennis J. Reeder and Gerald W. Fischer. 2011. Commercial Viral Transport Medium (VTM) Inhibits Nucleic Acid Testing. Manuscript Submitted, 2010.

Luke T. Daum, Sue A. Worthy, Deena E. Sutter, Marty Ottolini , Kathryn E. Myhre, Robert L. Elwood, Gerald W. Fischer. Comparison of Influenza Virus Detection Methods from Pediatric Patients and Household Contacts. Journal of Medical Virology. In press, 2011.

Longhorn Vaccines & Diagnostics1747 Citadel Plaza, Suite 206San Antonio, TX 78209Phone: (210) 826-0910Email: Longhorn-VandD@sbcglobal.net

Luke T. Daum, Ph.D.Gerald W. Fischer, M.DBülbin Sunar-Reeder,Ph.D

QUESTIONS?

SORULARINIZ?

THANKS!