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RELACIONES ENTRE PARÁMETROS GEOMÉTRICOS Y POTENCIAL REDOX DE COMPLEJOS DE COBRE CON LIGANTES POLIPIRIDÍNICOS. MEMORIA PARA OPTAR AL TÍTULO DE QUÍMICO DANIEL ALEJANDRO ARAVENA PONCE PATROCINANTE Y DIRECTOR DE MEMORIA DRA. EVGENIA SPODINE SPIRIDONOVA DIRECTOR DE MEMORIA DR. DIEGO VENEGAS YAZIGI SANTIAGO, NOVIEMBRE 2009 UNIVERSIDAD DE CHILE Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas Departamento de Química Inorgánica y Analítica

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RELACIONES ENTRE PARÁMETROS GEOMÉTRICOS Y POTENCIAL REDOX DE COMPLEJOS DE COBRE CON LIGANTES 

POLIPIRIDÍNICOS.  

 

MEMORIA PARA OPTAR AL TÍTULO DE QUÍMICO 

 

DANIEL ALEJANDRO ARAVENA PONCE 

 

 

PATROCINANTE Y DIRECTOR DE MEMORIA 

DRA. EVGENIA SPODINE SPIRIDONOVA 

DIRECTOR DE MEMORIA  

DR. DIEGO VENEGAS YAZIGI    

SANTIAGO,  NOVIEMBRE 2009 

 

 

UNIVERSIDAD DE CHILE 

Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas

Departamento de Química Inorgánica y Analítica

 

 

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Índice. 

 

 

 

 

1. Introducción 

 

2. Métodos Computacionales 

2.1 Programas 

2.2 Estructuras Iniciales 

2.3 Cálculos de Energía y Optimizaciones de Geometría 

2.4 Cálculo de Potenciales de Óxido‐reducción 

2.5 Determinación del Parámetro de Distorsión Geométrica   

2.6 Análisis de Densidad Electrónica  

 

3. Fundamentos Teóricos 

3.1 Teoría del Funcional de la Densidad 

3.2 El Parámetro   

 

4.  Resultados y Discusión 

4.1 Estructuras Analizadas 

4.2 Potenciales de Óxido‐reducción Calculados 

4.3 Análisis de los Compuestos Tetracoordinados (familia A) 

4.3.1 A‐Neopentil  

4.3.2 A‐MetilButil  

4.3.3 A‐Etil y A‐Butil 

4.3.4 Relaciones Entre Distorsión Geométrica y Potencial Redox 

 

 

13 

 

18 

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4.3.5 Análisis Orbital 

4.4 Análisis de los Compuestos Pentacoordinados (familia B) 

4.4.1 Relaciones Entre Estructura y Distorsión Geométrica 

4.4.2 Relaciones Entre Distorsión Geométrica y Potencial Redox 

 

5. Conclusiones 

 

6. Bibliografía 

 

7. Anexos 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

32 

37 

37 

42 

 

45 

 

47 

 

 

 

 

 

 

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RELACIONES ENTRE PARÁMETROS GEOMÉTRICOS Y POTENCIAL REDOX DE COMPLEJOS 

DE COBRE CON LIGANTES POLIPIRIDÍNICOS. 

 

Resumen:  

 

A partir de potenciales de óxido‐reducción experimentales publicados en  literatura para 

complejos de cobre del tipo: [Cu(L1n)(MeCN)]+ y [Cu(L2R)(Cl)]+, en los que L1n corresponde a 

ligantes  tripodales  de  fórmula  3­n(2‐piridilmetil)n(6‐metil‐2‐piridilmetil)amina  y  L2R  a 

ligantes bipiridínicos de tipo R‐bis(2‐piridilmetil)amina, donde R corresponde a diferentes 

sustituyentes  alifáticos  se  obtuvieron  relaciones  entre  el  valor  del  potencial  redox  y  la 

geometría  de  la  esfera  de  coordinación  del  centro  de  cobre,  caracterizada  por  el 

parámetro  estructural  .  Los  potenciales  de  óxido‐reducción  calculados  utilizando  la 

funcional BP86 y  la base orbital TZVP para el átomo de cobre y TZV para el resto de  los 

elementos  reprodujeron  las  tendencias  experimentales  y  mostraron  una  buena 

correlación con los valores experimentales (R2=0,94). Los valores de potencial redox para 

los  compuestos  tetracoordinados  [Cu(L2R)(Cl)]+  correlacionan  con el  carácter  tetraédrico 

de  la conformación de  la esfera de coordinación del cobre, estableciéndose una relación 

entre  la  energía  del  orbital  HOMO  de  las  formas  reducidas  y  el  potencial.  Para  los 

compuestos pentacoordinados  [Cu(L1n)(MeCN)]+ existe una relación entre la magnitud del 

efecto estérico causado por la presencia de sustituyentes metilo en los anillos piridínicos y 

el potencial de óxido reducción. 

 

 

 

 

 

 

 

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RELATIONSHIPS  BETWEEN  GEOMETRIC  PARAMETERS  AND  REDOX  POTENTIAL  OF 

COPPER COMPLEXES WITH POLYPYRIDINE LIGANDS. 

 

Summary: 

 

Experimental REDOX potentials for compounds [Cu(L1n)(MeCN)]+ and [Cu(L2R)(Cl)]+, where 

L1n  corresponds  to  tripodal  ligands 3­n(2‐pyridilmethyl)n(6‐methyl‐2‐pyridilmethyl)amine 

and L2R  is R‐bis(2‐pyridilmethyl)amine,  (R corresponds to different aliphatic substituents) 

were  correlated  with  ,  a  geometric  parameter  that  measures  the  distortion  of  the 

copper  coordination  sphere  with  respect  to  ideal  reference  shapes.  Calculated  redox 

potentials using the BP86 functional, TZVP basis set for copper atom and TZV basis set for 

light  elements  accounted  for  experimental  trends  and  showed  a  good  correlation with 

reference  data  taken  from  published  experimental  measurements  (R2=0.94). 

Electrochemical potential values  for  tetracoordinate compounds  [Cu(L2R)(Cl)]+ correlated 

with  the  tetrahedral  character  of  copper  coordination  sphere  and  the  HOMO  orbital 

energies  of  the  reduced  forms.  Pentacoordinate  complexes  [Cu(L2R)(Cl)]+  showed  a 

correlation between  the magnitude of  the  steric effect  from methyl substitution on  the 

pyridine rings and the redox potential. 

  

 

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1. Introducción. 

 

La  complejidad  inherente  a  los  procesos  químicos  conduce  de  forma  natural  a  la 

construcción  de  modelos  que  permitan  racionalizar  los  resultados  experimentales  y 

realizar  predicciones  referentes  a  nuevos  compuestos.  Para  construir  un  modelo  es 

necesario  identificar  los  parámetros  del  sistema  en  estudio  que  pueden  dar  cuenta  en 

mayor medida de la respuesta experimental, de este modo es posible predecir con cierto 

grado de confianza el valor de mediciones en sistemas relacionados. 

 

Identificar  los  factores  que  determinan  la  respuesta  experimental,  su  comportamiento 

bajo distintas condiciones y  las  interrelaciones que se puedan presentar no sólo permite 

determinar la relación cuantitativa entre los parámetros de un modelo, además ayuda en 

el  análisis  de  su  desempeño,  alcance  y  finalmente  en  la  comprensión  del  fenómeno 

mismo. 

 

La  comparación  entre  mediciones  experimentales  y  cálculos  teóricos  ha  sido  una 

herramienta  insustituible  en  el  desarrollo  de  aproximaciones más  precisas  y  eficientes 

para  la  determinación  de  energías moleculares,  ya  sea  a  través  de  la  resolución  de  la 

ecuación de Schrödinger o por métodos de campo de fuerza. Sin embargo, el refinamiento 

de  los  resultados  no  permite  por  sí  solo  una  mejor  comprensión  de  los  fenómenos 

químicos. 

 

Las herramientas de análisis en química computacional son importantes porque ayudan a 

comprender los resultados de cálculos teóricos en los términos conceptuales propios de la 

química, no es de extrañar entonces que a partir de un análisis de la densidad electrónica 

obtenida  por  un  método  cuántico  se  hable  de  cargas  parciales,  electronegatividad, 

estados de oxidación o carácter covalente de un enlace en circunstancias que ninguno de 

estos conceptos es utilizado en la generación de la densidad electrónica investigada. 

 

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Existen  variados  estudios  en  los  que  se  han  encontrado  relaciones  entre  propiedades 

moleculares diversas (constantes de estabilidad, corrimiento de señales espectroscópicas, 

potenciales de óxido reducción) y parámetros estructurales como longitudes y ángulos de 

enlace.[1]  En  esta  investigación  se  profundizará  en  las  relaciones  entre  estructura  y 

potencial redox existentes en la literatura para familias de compuestos de coordinación de 

cobre, unidos a ligantes polipiridínicos.[2] 

 

El objetivo del presente estudio es encontrar nuevas  relaciones estructura‐propiedades 

para  complejos  de  cobre,  comprender  la  influencia  de  los  sustituyentes  en  la 

conformación molecular y buscar los factores que explican la existencia de las relaciones.  

 

Antes de cualquier tipo de análisis estructural es necesario obtener potenciales redox que 

reproduzcan  las  tendencias  experimentales,  para  luego  investigar  en  detalle  las 

geometrías optimizadas. Se emplearán  cálculos basados en  la  teoría del  funcional de  la 

densidad  (DFT), ya que este método ha mostrado un desempeño aceptable en sistemas 

similares a un costo computacional accesible. 

 

La predicción computacional de potenciales de óxido  reducción es un  tema que ha sido 

ampliamente investigado en sistemas orgánicos e inorgánicos, [3, 4, 5] el desempeño de los 

métodos DFT varía según el sistema y el método en particular, con errores que van desde 

varios  cientos hasta decenas de milivolt. Un estudio  sobre potenciales  redox  calculados 

por DFT para diversos  compuestos de  coordinación ha determinado un error promedio 

cercano a 0,16 V, donde las funcionales BP86 y PBE logran una muy buena correlación con 

los resultados experimentales (R2=0,97). [6]   

 

Después de obtener una predicción satisfactoria de los potenciales redox se analizarán las 

geometrías optimizadas con el fin de comprender el efecto geométrico de las diferencias 

estructurales  entre  compuestos  de  la  misma  familia,  estableciendo  relaciones  con 

respecto a la conformación de la esfera de coordinación del centro de cobre.  

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El parámetro geométrico   [7] permite determinar cuantitativamente el grado de similitud 

entre una geometría arbitraria y formas de referencia correspondiente a conformaciones 

ideales  (tetraedro,  plano  cuadrado,  bipirámide  trigonal,  octaedro,  entre  otras),  de  esta 

forma  se  caracterizan  colectivamente  las distancias y ángulos de enlace de  la esfera de 

coordinación  en  lugar  de  considerar  parámetros  estructurales  por  separado.  Una  vez 

calculados los valores de   para las diferentes moléculas se buscarán correlaciones con el 

potencial de óxido‐reducción calculado y experimental. 

 

Finalmente  se explorará  la posibilidad de  racionalizar  las  relaciones estructura‐potencial 

redox que eventualmente se encontraron, en función de parámetros químicos tales como 

energías orbitales, de solvatación y potencial de ionización, de este modo se cubrirán los 

aspectos cuantitativos y cualitativos del modelo. 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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2. Métodos Computacionales. 

 

2.1 Programas. 

 

• ORCA  2.6.35  (Frank  Neese,  Chair  of  Theoretical  Chemistry,  University  of  Bonn, 

Alemania, 2008) 

• SHAPE v1.1b (Llunell, M.; Casanova, D.; Cirera, J.; Bofill, J. M.; Alemany, P.; Alvarez, 

S.; Pinsky, M.; Avnir, D.; Barcelona, España, 2003.) 

• Molekel 5.3 (Swiss National Supercomputing Centre (CSCS), 2006, 2007, 2008) 

• AIMPAC (R. F. Bader, et al. (Eds.), McMaster University, Ontario, Canadá) 

• Gaussian03, Revisión D.01 (Gaussian Inc., Pittsburg PA, Estados Unidos, 2003) 

 

2.2 Estructuras Iniciales. 

 

Las estructuras moleculares utilizadas como punto de partida para  las optimizaciones de 

geometría  fueron  obtenidas  desde  la  base  de  datos  de  estructuras  cristalográficas CSD 

(The Cambridge Structural Database).  

 

2.3 Cálculos de Energía y Optimizaciones de Geometría. 

 

Para obtener geometrías optimizadas, evaluaciones de energía y contribuciones térmicas 

de la forma oxidada y reducida de los complejos de cobre se utilizaron cálculos basados en 

la teoría del funcional de la densidad, implementados en el programa ORCA. [8] Se empleó 

la funcional BP86, la base orbital TZVP para cobre y TZV [9] para el resto de los átomos y el 

modelo de solvatación COSMO [10] para las estructuras en solución. 

 

 

 

 

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2.4 Cálculo de Potenciales de Óxido‐reducción. 

 

El potencial de óxido‐reducción de una reacción está relacionado con el cambio de energía 

libre y el número de electrones transferidos a través de la ecuación de Nernst: 

 

 

 

Existen diferentes esquemas para calcular potenciales de óxido‐reducción. El más popular 

está basado en el ciclo de Born‐Haber, que consiste en calcular  la diferencia de energía 

libre  de  Gibbs  de  las  especies  en  solución  como  la  suma  de  la  energía  libre  de 

desolvatación de los reactantes, el potencial redox de la reacción en fase gas y la energía 

libre de solvatación de los productos. 

 

El esquema anterior ha sido aplicado en diferentes estudios,  [11, 12] y se han desarrollado 

variantes que consideran directamente la diferencia de energía entre las especies oxidada 

y  reducida  en  solución,  pero  incluyen  de  alguna manera  la  variación  de  energía  de  las 

especies en  fase gas,  [13] o añaden  términos adicionales  relacionados  con el  sistema en 

estudio. [14]  

 

Otra aproximación para calcular potenciales redox es a través de simulaciones dinámicas, 

determinando el potencial a partir de  la modelación explícita de  la  interacción solución‐

electrodo,  [15]  sin  embargo  esta  aproximación  es  mucho  más  costosa  en  términos 

computacionales que la anteriormente mencionada.  

 

 

 

 

 

 

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En el presente estudio se empleará el esquema basado en el ciclo de Born‐Haber: 

 

 

Figura 1: Representación del ciclo de Born‐Haber. 

 

: Energía Libre de Gibbs de especie oxidada en fase gas. 

 : Energía Libre de Gibbs de especie oxidada en solución. 

 : Energía Libre de Gibbs de especie reducida en fase gas. 

 : Energía Libre de Gibbs de especie reducida en solución. 

: Energía Libre de Gibbs del electrón en fase gas. 

 : Variación de energía libre de Gibbs de solvatación de la especie oxidada. 

: Variación de energía libre de Gibbs de solvatación de la especie reducida. 

  : Variación de energía  libre de Gibbs de  la semirreacción de reducción en fase 

gas.  

:  Variación  de  energía  libre  de  Gibbs  de  la  semirreacción  de  reducción  en 

solución.  

 

El potencial absoluto de la semirreacción es  . Para comparar este valor con datos 

experimentales hace falta conocer o calcular el potencial absoluto asociado a  la reacción 

de  algún  electrodo  de  referencia  de  uso  común  o  de  alguna  molécula  de  potencial 

conocido  bajo  las  condiciones  experimentales  en  que  se  determinó  el  potencial  de  la 

molécula de interés. 

 

 

 

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Ejemplo: 

 

Se ha calculado un potencial absoluto de 4,495 V para  la semirreacción de oxidación de 

uno de los compuestos de cobre a estudiar (en Metanol): 

 

Figura 2: Oxidación de Cloro‐(2‐metilbutil‐bis(2‐piridilmetil)amino)cobre. 

 

El potencial absoluto calculado para la reducción del ferrocenio a ferroceno es de ‐4,898 V 

 

Figura 3: Reducción de ferrocenio a ferroceno. 

 

Considerando que el potencial del ferroceno en metanol a temperatura ambiente es 0,4 V 

contra Ag/AgCl,  [16]  el potencial del complejo de cobre contra Ag/AgCl es:  

 

  

El valor experimental del potencial para el compuesto es:  ‐0,47 V  contra Ferroceno,  [17]     

(‐0,07 contra Ag/AgCl). La diferencia entre el valor teórico y el experimental es de 67 mV. 

 

No es posible calcular directamente la energía libre de Gibbs para las especies en solución 

sin  realizar  una  simulación  dinámica  del  sistema  soluto‐solvente,  ya  que  no  existen 

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expresiones  para  las  contribuciones  entrópicas  y  entálpicas  (electrónicas,  vibracionales, 

rotacionales y traslacionales) de una molécula en presencia de solvente. La energía  libre 

de las especies en solución es obtenida a través de un modelo de solvatación que estima 

la  variación  de  energía  de  una molécula  al  pasar  de  fase  gas  a  solución,  tratando  el 

solvente  de  una  manera  simplificada,  generalmente  como  un  potencial  externo  que 

interactúa con la molécula. 

 

Por  otro  lado,  se  puede  calcular  la  energía  libre  de Gibbs  para moléculas  en  fase  gas 

utilizando  las  expresiones  correspondientes  de  termodinámica  estadística  para  las 

contribuciones entrópicas y entálpicas. La energía  libre de  las especies en  solución  será 

(por ejemplo, para la especie oxidada): 

 

 

 

De este modo  se obtienen  todos  los  términos del ciclo excepto  , que  se cancelará al 

restar el potencial absoluto de referencia, por lo tanto, no se considera.  

 

2.5 Determinación del Parámetro de Distorsión Geométrica  . 

 

El parámetro   para  las diferentes moléculas fue calculado con el programa SHAPE, que 

obtiene  la  desviación  (S)  de  la  geometría  con  respecto  a  diferentes  poliedros  de 

referencia,  con  el  valor de  S es posible determinar    conociendo  el  ángulo de mínima 

distorsión del camino correspondiente. 

 

2.6 Análisis de Densidad Electrónica. 

 

El  análisis  de  la  densidad  electrónica  basada  en  la  teoría  de  átomos  en moléculas  fue 

realizado utilizando el paquete de programas AIMPAC,  los archivos de  función de onda 

correspondientes fueron generados en Gaussian03. 

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3. Fundamentos Teóricos. 

 

3.1 Teoría del Funcional de la Densidad. 

 

El  primer  intento  de  obtener  la  energía  de  sistemas  atómicos  a  través  de  la  densidad 

electrónica en  lugar de  la  función de onda  se  remonta a 1927, cuando Thomas y Fermi 

desarrollaron una expresión para la energía cinética de un gas de electrones: [18]  

   

 

 

 : Densidad electrónica. 

 

Combinando    con  términos  clásicos  para  la  atracción  núcleo‐electrón  y  repulsión 

electrón‐electrón resulta una ecuación para la energía de un átomo que sólo depende de 

la densidad electrónica: 

 

  

 : Número atómico. 

 : Distancia núcleo‐electrón. 

 : Distancia electrón‐electrón. 

 

En 1964, 37 años después de la publicación del modelo de Thomas‐Fermi, los teoremas de 

de Hohenberg  y  Kohn  sentaron  las  bases  de  la  teoría  del  funcional  de  la  densidad.  El 

primer  teorema señala: “El potencial externo   es una  funcional única de   y, 

dado que   determina  , el estado basal del sistema es funcional única de  .” 

 

 

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10  

La energía del estado basal depende entonces sólo de su densidad electrónica: 

 

 

 

 : Densidad electrónica del estado basal. 

 : Potencial nuclear, este término puede incluir potenciales externos. 

 : Energía cinética de los electrones. 

 : Energía de repulsión electrón‐electrón. 

 

El   primer término del  lado derecho de  la ecuación anterior depende del sistema ya que 

  está  determinado  por  las  posiciones  nucleares,  sin  embargo    y    son 

términos válidos para cualquier sistema. 

 

Se define el funcional de Hohenberg‐Kohn como: 

 

 

 

Aunque  la  forma de   es desconocida, es posible  separar  la  contribución  coulómbica 

clásica   de los efectos no clásicos representados por el término  : 

 

 

 

Si se conociera la forma de   sería posible resolver la ecuación de Schrödinger de forma 

exacta, por lo que la búsqueda de expresiones para   es el mayor reto en el desarrollo 

de la teoría del funcional de la densidad. 

 

El  segundo  teorema  de  Hohenberg‐Kohn  señala  que  la  energía  obtenida  al  aplicar  el 

funcional   será mínima si y sólo si la densidad electrónica corresponde al estado basal. 

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11  

Con  el  fin  de  obtener  mejores  aproximaciones  para  el  valor  de  ,  Kohn  y  Sham 

introdujeron  la  idea de calcular  la energía cinética utilizando orbitales de un sistema no 

interaccionante cuya densidad electrónica corresponda a la del sistema real. 

 

Al  igual  que  en  la  teoría  de Hartree‐Fock,  la  función  de  onda  es  representada  por  un 

determinante de Slater: 

 

 

 

Las expresiones para el operador monoelectrónico  y la energía cinética del sistema no 

interaccionante    son  análogas  a  los  términos  de  la  aproximación  de  Hartree‐Fock 

correspondientes: 

 

 

 

 

Finalmente el funcional   es expresado de la siguiente forma: 

 

 

 

 

 

El  término    se  conoce  como  energía  de  intercambio  y  correlación  y  reúne  los 

funcionales  de  forma  desconocida    y  .  Tal  como  ocurre  con  ,  conocer  la 

expresión para   permitiría la resolución exacta de la ecuación de Schrödinger. 

 

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12  

Las funcionales aproximadas para   se dividen en tres grupos principales: 

 

Funcionales  LDA  (aproximación  de  densidad  local):  Dependen  sólo  de  la  densidad 

electrónica, su forma general es: 

 

 

 

Funcionales  GGA  (aproximación  de  gradiente  generalizada):  Incluyen  además  términos 

dependientes del gradiente de  la densidad. Dentro de este grupo se clasifica el funcional 

utilizado en el presente estudio (BP86). 

 

 

 

Funcionales Híbridos: El término de intercambio es evaluado a través de las integrales de 

intercambio de la aproximación de Hartree‐Fock utilizando los orbitales de Kohn‐Sham y el 

término de correlación es estimado con funcionales aproximadas. 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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13  

3.2 El Parámetro  . 

 

Desde los trabajos llevados a cabo por Alfred Werner, la simetría ha sido una herramienta 

fundamental en la comprensión de la química de los compuestos de coordinación. Gracias 

a consideraciones de este tipo es posible entender el desdoblamiento de los orbitales d de 

un  metal,  interpretar  información  espectroscópica,  comprender  la  existencia  de 

enantiómeros, compuestos quirales, etc. 

 

En  la  descripción  de  estructuras moleculares  generalmente  se  clasifica  una  geometría 

arbitraria según su similitud con algún poliedro de referencia de cierto grado de simetría, 

es común hablar de estructuras tetraédricas distorsionadas sin que  formalmente existan 

los grados de simetría propios de un tetraedro en la geometría analizada. El problema con 

este  tipo  de  descripciones  aparece  al  intentar  cuantificar  el  nivel  de  similitud  de  un 

ordenamiento atómico cualquiera con respecto a la forma con que se compara. 

 

Avnir  y  colaboradores  [19]  han  definido medidas  de  simetría  y  forma  continuas  (CSM  y 

CShM, por  sus  siglas en  inglés), que permiten  cuantificar el grado de distorsión de una 

estructura dada con respecto a diferentes poliedros de referencia. En este modelo, para 

obtener una medida de forma de una geometría P dada, es necesario encontrar la forma 

de referencia R que más se acerque a P optimizando con respecto al tamaño, orientación 

y emparejamiento de vértices. [20]  

 

 

Figura 4: Estructura P (representada por círculos) y forma  de referencia R ajustada (cuadrado). 

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14  

La fórmula para la medida de forma es: 

 

 

 

 : Factor de normalización. 

 : distancias entre  los pares de vértices emparejados de  la forma de referencia y de  la 

estructura.  

 

El factor de normalización determina que  los valores posibles de   se encuentren entre 

cero y cien. En el caso que la geometría se ajuste perfectamente a la forma de referencia, 

el valor de   es cero. 

 

Para analizar compuestos utilizando medidas de forma resulta útil graficar el valor de   

de una estructura dada con  respecto a dos polígonos de  referencia distintos P y S, esta 

representación se denomina mapa de forma.

 

Figura 5: Mapa de forma para compuestos tetracoordinados, las formas de  referencia son plano cuadrado (eje y) y tetraedro (eje x). 

 

En  la  figura  anterior,  el  punto  (0;  33,33)  corresponde  al  tetraedro  perfecto  y  el  punto 

(33,3; 0) a la conformación cuadrado planar. 

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15  

Las medidas de  forma continuas permiten además definir caminos de mínima distorsión 

que  unen  pares  de  formas  de  referencia.  Se  ha  demostrado  que  el  camino  de mínima 

distorsión entre dos geometrías está definido por la siguiente ecuación: [21]  

 

 

 

 : Medida de forma de una geometría X con respecto a la forma de referencia P. 

 : Medida de forma de una geometría X con respecto a la forma de referencia T. 

 : Constante definida para el par de formas P y T, en el caso de la interconversión entre 

tetraedro y cuadrado planar es igual a 35,264º. 

 

La  definición  anterior  permite  introducir  una  expresión  para  la  desviación  de  una 

conformación dada con respecto al camino de mínima distorsión que une a  los poliedros 

de referencia P y T: 

 

 

 

será igual a cero si y sólo si la estructura está en el camino de mínima distorsión. 

 

Finalmente se define el parámetro   que indica la posición de la geometría en el 

camino de mínima distorsión que va desde T hasta P: [22] 

 

 

 

 están relacionados por la expresión: 

 

 

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16  

Ejemplo: 

 

Para la siguiente estructura (E) correspondiente a un compuesto tetracoordinado: 

 

M 0.0000 0.0000 0.0000

L1 -0.9700 -1.5000 -1.5300

L2 0.7100 2.3100 0.7500

L3 -1.4700 0.6200 1.1900

L4 1.9300 0.0900 -0.4300

 

Se  ha  calculado  el  valor  de  SE  con  respecto  a  la  geometría  cuadrado  planar  (SE(PC))  y 

tetraédrica (SE(Th)): 

 

SE(PC) = 5,50730 

SE(Th) = 20,54907 

 

 

Figura 6: Superposición de la estructura E (rojo) y la geometría de referencia ajustada (azul): a la izquierda plano cuadrado, a la derecha tetraedro. 

 

Se observa que el ajuste con respecto a la conformación plano cuadrado es mejor que el 

tetraédrico, consistente con que SE(PC) < SE(Th). A continuación graficamos ambos valores 

en el mapa de forma correspondiente: 

 

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17  

 

Figura 7: Mapa de forma para estructura E. 

 

Al  comparar  el  valor  de  (PC  Th)  y  (Th    PC)  (38,49  y  76,44  respectivamente)  se 

comprueba que la estructura E está mas cercana a la geometría cuadrado planar perfecta 

representada por el punto (33,3 ; 0) que del tetraedro perfecto (0 ; 33,3) y presenta una 

desviación  con  respecto  al  camino  de mínima  distorsión  que  une  ambas  geometrías, 

representado por el valor de Δ(PC,Th)=0,149.  

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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18  

4. Resultados y Discusión. 

 

4.1 Estructuras Analizadas.  

 

Considerando  las mediciones de potenciales de óxido reducción publicadas en  literatura 

para  compuestos de  coordinación de  cobre unido a  ligantes polipiridínicos,  se eligieron 

dos familias de cuatro compuestos cada una, que se denominarán A y B. 

 

La  familia  A  [17]  está  constituida  por  complejos  de  cobre  coordinados  con  un  ligante 

tridentado  (derivados  de  bis(2‐piridilmetil)amina)  y  un  ión  cloruro.  En  lo  sucesivo,  se 

denominarán según el grupo unido al nitrógeno amínico y la letra de la familia. 

 

 

Figura 8: Estructuras y denominaciones de los compuestos pertenecientes a la familia A:  a) Cloro‐(etil‐bis(2‐piridilmetil)amino)cobre (A‐Etil);  

b) Cloro‐(butil‐bis(2‐piridilmetil)amino)cobre (A‐Butil);  c) Cloro‐(neopentil‐bis(2‐piridilmetil)amino)cobre (A‐Neopentil);  d) Cloro‐(metilbutil‐bis(2‐piridilmetil)amino)cobre (A‐MetilButil). 

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19  

La  familia  B  [23]  está  compuesta  por  complejos  de  cobre  coordinados  con  un  ligante 

tetradentado  (derivados de  tris(2‐piridilmetil)amina) y una molécula de acetonitrilo.  Los 

compuestos  se  diferencian  en  el  número  de  anillos  piridínicos  sustituidos  con  grupos 

metilo en posición seis, que va desde cero (compuesto B‐0Me) hasta tres (B‐3Me). 

 

 

Figura 9: Estructuras y denominaciones de los compuestos pertenecientes a la familia B:  a) Acetonitrilo‐(tris(2‐piridilmetil)amino)‐cobre (B‐0Me);  

b) Acetonitrilo‐(bis(2‐piridilmetil)(6‐metil‐2‐piridilmetil)amino)‐cobre (B‐1Me);  c) Acetonitrilo‐(bis(6‐metil‐2‐piridilmetil)(2‐piridilmetil)amino)‐cobre (B‐2Me);  

d) Acetonitrilo‐(tris(6‐metil‐2‐piridilmetil)amino)‐cobre (B‐3Me). 

 

 

   

 

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20  

4.2 Potenciales de Óxido‐reducción Calculados. 

 

Los  potenciales  de  óxido  reducción  experimentales  y  calculados  para  las  moléculas 

pertenecientes a las familias A y B se muestran en las Tablas 1 y 2: 

 

Compuesto  Potencial Calculado (V contra Fc/Fc+) 

Potencial Experimental (V contra Fc/Fc+) 

Error (V) 

A‐Etil  ‐0,54  ‐0,49  ‐0,05 A‐Butil  ‐0,50  ‐0,49  ‐0,01 

A‐Neopentil  ‐0,21  ‐0,35  0,14 A‐MetilButil  ‐0,41  ‐0,47  0,06 

Tabla 1: Potenciales de óxido‐reducción experimentales (medidos en metanol) y calculados para los compuestos pertenecientes a la familia A.  

 

Compuesto  Potencial Calculado (V contra Ag/AgNO3)

Potencial Experimental (V contra Ag/AgNO3) 

Error (V) 

B‐0Me  ‐0,16  ‐0,32  0,16 B‐1Me  ‐0,14  ‐0,26  0,12 B‐2Me  ‐0,07  ‐0,14  0,07 B‐3Me  0,22  0,07  0,15 

Tabla 2: Potenciales de óxido‐reducción experimentales (medidos en acetonitrilo) y calculados para los compuestos pertenecientes a la familia B. 

 

Los  resultados para  las dos  familias  reproducen en general  la  tendencia experimental, y 

presentan una desviación media cuadrática  igual a 0,108 V con un error que varía entre 

0,01 y 0,16 V. 

 

El nivel de error  en  la predicción de potenciales  redox de  este  estudio  es  aceptable  al 

compararlos con los valores publicados en literatura para sistemas similares. [6] Es posible 

calificar  los  resultados  como  satisfactorios  ya  que  permiten  realizar  los  análisis 

estructurales  de  las  moléculas  estudiadas  al  reproducir  correctamente  las  tendencias 

experimentales observadas entre los compuestos de cada familia. 

 

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21  

 

Figura 10: Relación entre los potenciales de óxido reducción experimentales y calculados para los ocho compuestos estudiados, la línea segmentada indica la recta ideal (intercepto cero y 

pendiente uno) y la línea sólida corresponde a la regresión lineal de los datos  (y = 0,15605 + 1,2483 x ; R2 = 0,94244). 

 

 

4.3 Análisis de los Compuestos Tetracoordinados (familia A). 

 

Los valores de  para el camino de mínima distorsión que une las geometrías tetraédrica 

(T)  y  cuadrado planar  (S) en ambos  sentidos  (   y  ) de  las estructuras 

optimizadas de la familia A son presentados en la Tabla 3:  

 

Compuesto     Fase Gas  Solución  Fase Gas  Solución 

Ox  Red  Ox  Red  Ox  Red  Ox  Red 

A‐Etil  92,33  97,61  97,04 76,58  17,23  31,86  16,62  38,37 

A‐Butil  92,37  94,31  96,01 100,56 17,24  32,79  16,83  28,49 

A‐Neopentil  74,61  51,50  85,34 48,56  31,69  63,52  22,37  64,59 

 A‐MetilButil  89,04  66,75 92,96 64,93  18,76  42,50  17,54  44,04 

Tabla 3: Parámetro   a través del camino de mínima distorsión tetraedro‐plano cuadrado para geometrías optimizadas de la familia A. 

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22  

Al obtener un potencial de óxido‐reducción utilizando el ciclo de Born‐Haber es necesario 

calcular  la  energía de  la molécula  en  los  cuatro  estados que  componen  el  ciclo, por  lo 

tanto, al optimizar geometrías en ambos estados de oxidación (oxidado/reducido) y fases 

(gas/solución) se obtienen cuatro geometrías que describen la conformación molecular en 

cada paso y tendrán diferentes valores de   

 

El valor de   de A‐Neopentil es siempre el menor de la familia al comparar dentro 

del mismo  estado  de  oxidación  y  fase, mientras  que  A‐Etil  y  A‐Butil  presentan  valores 

mayores  y  similares  entre  si,  excepto  para  la  estructura  reducida  en  solución  en  que  

 de A‐Etil es menor que A‐Butil  (76,58 y 100,56 respectivamente), A‐MetilButil 

se encuentra en un rango intermedio. 

 

Se aprecia un ordenamiento inverso en el caso de  , con valores mayores para A‐

Neopentil.  Se  puede  concluir  que  la  geometría  de  A‐Neopentil  es  la más  cercana  a  la 

forma tetraédrica mientras que A‐Etil y A‐Butil son  las más parecidas al plano cuadrado, 

finalmente A‐MetilButil presenta una  situación  intermedia, ordenamiento que  se  repite 

independientemente del estado de oxidación y la fase en que se optimice la geometría de 

la molécula.   

 

 

4.3.1  A‐Neopentil. 

 

El  compuesto  A‐Neopentil  presenta  conformaciones  marcadamente  más  cercanas  al 

tetraedro  que  el  resto  de  las moléculas  de  la  familia  A,  esto  es  consecuencia  de  una 

interacción  tipo  puente  de  hidrógeno  (anagóstica)  entre  un  átomo  de  hidrógeno 

perteneciente al sustituyente neopentilo y el centro de cobre: 

 

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23  

 

Figura 11: Geometrías y distancias de interacción Cu‐H (Å) en A‐Neopentil; conformaciones reducida (izquierda) y oxidada en solución (derecha). 

 

Las interacciones anagósticas [24] tienen una intensidad que oscila entre 7 y 15 kcal/mol y, 

tal como en el puente de hidrógeno, involucran la participación de un hidrógeno unido a 

un  átomo  electronegativo  y  un  centro  de  alta  densidad  electrónica.  Se  presentan  en 

metales de bajo estado de oxidación y mayoritariamente en centros d8, aunque también 

en  d9 y d10, en concordancia con el requerimiento de una alta densidad electrónica en el 

metal.  

 

Estructuralmente las interacciones anagósticas se caracterizan por una distancia de enlace 

que generalmente oscila entre 2,3 y 2,9 Å y un ángulo M∙∙∙H‐C entre 110 y 170º tal como 

ocurre en el caso de A‐Neopentil. 

 

Parámetro/Forma  Ox, Gas  Ox, Solución  Red, Gas  Red, Solución 

Distancia Cu‐H (Å)  2,26  2,30  2,62  2,57 

 C‐H‐Cu (º)  130,0  123,0  145,2  145,3 

Tabla 4: Distancia Cu‐H y ángulo C‐H‐Cu para A‐Neopentil. 

 

Al  analizar  el  camino  de  enlace  Cu‐H  de A‐Neopentil mediante  la  teoría  de  átomos  en 

moléculas  se  encuentra  un  punto  (3,‐1)  que  indica  la  presencia  de  un  enlace.  Para 

interacciones anagósticas, la magnitud de la   en el punto crítico de enlace se ubica en 

el  rango  comprendido  entre  0,002  y  0,035  u.a.  y    entre  0,024  y  0,139  u.a.  Los 

resultados para A‐Neopentil se presentan en ese orden de magnitud (Tabla 5).  

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24  

Parámetro/Forma  Ox, Gas  Ox, Solución  Red, Gas  Red, Solución 

  n/e  0,018  0,010  0,011 

  n/e  0,050  0,021  0,023 

Distancia Cu‐PCE (Å)    n/e  1,34  1,58  1,55 

Distancia Cu‐PCE (Å)    n/e  1,40  1,53  1,51 

Tabla 5:   en el punto crítico de enlace y distancia del átomo de cobre al punto crítico de enlace (PCE) para A‐Neopentil. 

 

Como sucede a veces con este tipo de análisis, no se encontró el punto crítico de enlace 

para la geometría oxidada en fase gas de A‐Neopentil, sin embargo es posible apreciar que 

existe la interacción Cu‐H al graficar la densidad electrónica de la molécula con un valor de 

contorno de 0,015 u.a. 

 

 

Figura 12: Mapa de contorno (valor: 0,015 u.a.) de la densidad electrónica para la forma oxidada en fase gas de A‐Neopentil. 

 

En  las  geometrías  reducidas  de  A‐Neopentil,  la  interacción  Cu‐H  provoca  un 

desplazamiento  del  carbono  del  sustituyente  (C1)  unido  directamente  al  nitrógeno 

amínico (Np) hacia el lado en que se produce la interacción anagóstica, obligando al grupo 

piridínico del  lado opuesto  a  salir del plano que  forma  con  el otro  grupo piridina para 

coordinar  con  el  cobre,  aumentando  el  carácter  tetraédrico  de  la  conformación  de  la 

esfera de coordinación.  

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25  

 

Figura 13: Vista de la desviación del enlace C1‐Np con respecto al plano Cl‐Cu‐Np en A‐Neopentil (31º en solución, 19,4º gas) 

 

 

Figura 14: Asimetría en los ángulos de los enlaces Np‐C2 y Np‐C3 con respecto al plano Cl‐Cu‐Np producto de desviación del enlace Np‐C1 con respecto al plano Cl‐Cu‐Np. 

 

Además del movimiento del grupo piridina, la interacción Cu‐H crea una tensión adicional 

en la molécula que “levanta” el enlace Cu‐Np del plano del grupo piridínico más cercano a 

la interacción anagóstica, esta modificación conformacional se explica por la formación de 

un anillo que involucra el átomo de cobre, el nitrógeno amínico, tres carbonos del ligante 

y el hidrógeno interaccionante. Dentro de la teoría de átomos en moléculas, la presencia 

de un punto (3,1) indica la presencia de un anillo, que fue posible encontrar en todas las 

conformaciones de A‐Neopentil.   

 

 

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26  

 

Figura 15: Conformación de A‐Neopentil, se destaca en amarillo el anillo Cu‐Np‐C1‐C‐C‐H. 

 

  Ox, Gas  Ox, Solución  Red, Gas  Red, Solución 

Cu  1,73  1,73  1,92  1,92 

Np  1,68  1,67  1,73  1,70 

C1  1,72  1,71  2,02  1,94 

C  1,77  1,78  2,05  1,98 

C  1,65  1,62  1,83  1,79 

H  1,37  1,38  1,26  1,24 

Tabla 6: Distancias (Å) entre el punto crítico de anillo y los átomos que lo componen para A‐Neopentil. 

 

 

4.3.2  A‐MetilButil. 

 

En el compuesto A‐MetilButil también se ha encontrado una interacción anagóstica entre 

un  hidrógeno  del  sustituyente  y  el  centro  de  cobre,  en  este  caso  no  se  presenta  el 

desplazamiento  de  uno  de  los  grupos  piridina  anteriormente  descrito,  debido  a  que  la 

orientación del sustituyente no produce una  inclinación tan  importante del enlace Np‐C1 

con respecto al plano Cl‐Cu‐Np como  la observada para A‐Neopentil  (9,6º y 9,0º para  la 

estructura en solución y fase gas respectivamente).  

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27  

La distorsión intermedia de A‐MetilButil se explica por el levantamiento del enlace Cu‐Np 

que ocurre, tal como en el caso de A‐Neopentil, por la formación de un “anillo” producto 

de la interacción anagóstica Cu‐H. 

 

 

Figura 16: Conformación de A‐MetilButil, se observa que los ligantes piridínicos se ubican aproximadamente en el mismo plano. 

  

Los  parámetros  estructurales  y  de  análisis  de  densidad  electrónica  de  A‐MetilButil  son 

concordantes con una interacción anagóstica. 

 

Parámetro/Forma  Ox, Gas  Ox, Solución  Red, Gas  Red, Solución 

Distancia Cu‐H (Å)  2,30  2,28  2,49  2,48 

Ángulo C‐H‐Cu (º)  136,9  136,6  147,8  147,8 

Tabla 7: Distancia Cu‐H y ángulo C‐H‐Cu para A‐MetilButil. 

 

 

Parámetro/Forma  Ox, Gas  Ox, Solución  Red, Gas  Red, Solución 

  0,017  0,018  0,012  0,012 

  n/e  n/e  0,026  0,027 

Distancia Cu‐PCE (Å)    1,36  1,35  1,50  1,49 

Distancia Cu‐PCE (Å)    n/e  n/e  1,49  1,48 

Tabla 8:   en el punto crítico de enlace y distancia del átomo de cobre al punto crítico de enlace (PCE) para A‐MetilButil. 

 

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28  

  Ox, Gas  Ox, Solución  Red, Gas  Red, Solución 

Cu  1,72  1,72  1,91  1,91 

Np  2,78  2,75  2,88  2,94 

C1  1,70  1,69  1,88  1,86 

C2  1,75  1,74  1,96  1,94 

C3  1,72  1,71  1,80  1,78 

H  1,34  1,33  1,25  1,23 

Tabla 9: Distancias (Å) entre el punto crítico de anillo y los átomos que lo componen para A‐MetilButil. 

 

 

4.3.3  A‐Etil y A‐Butil. 

 

Las conformaciones de  los compuestos A‐Etil y A‐Butil  son más cercanas a  la geometría 

cuadrado planar que  los  compuestos A‐Neopentil  y A‐MetilButil,  como es de esperar  a 

partir  de  la  forma  del  ligante  tridentado  y  la  ausencia  de  interacciones  entre  el 

sustituyente y el centro metálico. 

 

Las  orientaciones  de  los  sustituyentes  de  los  compuestos  A‐Etil  y  A‐Butil  no  son 

compatibles con  la presencia de  interacciones Cu‐H, como se aprecia en sus geometrías 

optimizadas: 

 

 

Figura 17: Geometrías optimizadas oxidadas en solución de A‐Etil (Izquierda) y A‐Butil (derecha).  

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29  

En general, los valores de   para A‐Etil y A‐Butil confirman esta tendencia, excepto para la 

geometría  optimizada  en  solución  de  la  forma  reducida  de  A‐Etil,  que  muestra  una 

conformación menos  cercana al  cuadrado planar que A‐Butil  (  76,58 y 100,56 

para  A‐Etil  y  A‐Butil  respectivamente).  La  diferencia  estructural más  importarte  entre 

ambos compuestos es la ubicación del grupo cloruro, que depende de la orientación que 

tomen los grupos piridina, como se explicará a continuación. 

 

Los  compuestos  A‐Etil  y  A‐Butil  siguen  una  tendencia  general  ya  observada  para 

compuestos pentacoordinados con ligantes tripodales [7] en que el ángulo N‐Cu‐Np (donde 

N es el nitrógeno de uno de los ligantes piridina y Np es el nitrógeno amínico) disminuye a 

medida que aumenta la distancia Cu‐Np. 

 

Figura 18: Relación entre distancia Cu‐Np y ángulo Np‐Cu‐N para los compuestos de la familia A. 

 

Las  formas  oxidadas  de  A‐Etil  y  A‐Butil  exhiben  una  distancia  Cu‐Np menor  a  2,1  Å  y 

ángulos N‐Cu‐Np mayores a 80º, los grupos piridina se ubican prácticamente en un mismo 

plano. 

 

En  las  formas  reducidas  de  A‐Etil  y  A‐Butil  la  distancia  Cu‐Np  es  mayor  a  2,5  Å, 

consecuentemente el ángulo N‐Cu‐Np disminuye a alrededor de 75º. Los anillos piridínicos 

ya  no  son  coplanares  debido  a  la  tensión  que  provocaría  esta  conformación  sobre  el 

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30  

ángulo  C1‐Np‐C2,  que  debería  disminuir  considerablemente  por  debajo  del  valor  típico 

para un nitrógeno   

 

 

Figura 19: Estructura de A‐Etil (oxidada en solución), se observa a la izquierda el ángulo Np‐Cu‐N cercano a 90º y a la derecha la ubicación prácticamente coplanar de los grupos piridina. 

 

 

Figura 20: Estructura de A‐Etil (reducida en fase gas), se observa a la izquierda el ángulo Np‐Cu‐N y a la derecha la ubicación de los grupos piridina. 

 

 

Figura 21: Estructura de A‐Etil (reducido, fase gas), se destaca en amarillo el ángulo C2‐Np‐C1, las flechas indican el movimiento que debieran tomar los grupos piridina para ubicarse en el mismo 

plano, con la consecuente tensión del ángulo.  

Como consecuencia de  la disminución del ángulo N‐Cu‐Np y de  la mayor distancia Cu‐Np 

en  las  geometrías  reducidas,  el  ión  cloruro  se  ubica  próximo  al  plano  formado  por  los 

nitrógenos de los ligantes piridina y el centro de cobre, adoptando una conformación tipo 

trigonal plana. Dependiendo de la ubicación del enlace Cu‐Np con respecto al plano N‐Cu‐

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31  

N,  la  geometría  de  los  cuatro  ligantes  y  el  centro  de  cobre  puede  ser más  cercana  al 

tetraedro  o  al  plano  cuadrado.  Este  sería  el motivo  por  el  cual  la  estructura  de  A‐Etil 

reducida en solución es menos próxima al cuadrado planar que A‐Butil en la misma fase y 

estado de oxidación. 

 

 

Figura 22: Estructura de A‐Etil (reducido, en solución), el ión cloruro (en verde) se ubica cercano al plano N‐Cu‐N (en rojo). 

 

 

4.3.4 Relaciones Entre Distorsión Geométrica y Potencial Redox. 

 

Los valores de   (y consecuentemente  ) correlacionan con el potencial 

de óxido‐reducción como se muestra en la Figura 23, 

 

 

Figura 23: Relación entre   y potencial redox calculado (izquierda) y experimental (derecha). Los círculos representan a las estructuras en solución y los cuadrados a las 

conformaciones en fase gas, el color blanco las formas reducidas y el negro las oxidadas. Los potenciales son expresados referidos a Fc/Fc+. 

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32  

  Fase Gas  Solución  Potencial Redox (V vs. Fc/Fc+)

Compuesto  Ox  Red  Ox  Red  Experimental  Calculado 

A‐Etil  17,23  31,86  16,62 38,37  ‐0,49  ‐0,54 

A‐Butil  17,24  32,79  16,83 28,49  ‐0,49  ‐0,50 

A‐Neopentil  31,69  63,52  22,37 64,59  ‐0,35  ‐0,21 

 A‐MetilButil  18,76  42,50  17,54 44,04  ‐0,47  ‐0,41 

Tabla 10: Valores de   y potenciales de óxido reducción experimentales y calculados para los compuestos pertenecientes a la familia A. 

 Es posible observar que el potencial de óxido‐reducción es menos negativo al aumentar el 

carácter  tetraédrico  de  las  conformaciones,  la  tendencia  se  mantiene 

independientemente  del  estado  de  oxidación  y  la  variación  de    es  mayor  para  las 

estructuras reducidas. El único punto que se aleja de esta tendencia es A‐Etil reducido en 

solución debido a la posición del ión cloruro, explicada anteriormente. 

 

4.3.5 Análisis Orbital. 

 

Los  términos  involucrados  en  el  cálculo  de  potenciales  de  óxido‐reducción  pueden  ser 

clasificados en tres grupos: potencial de ionización, contribuciones térmicas y energías de 

solvatación. Dependiendo de  las  características del grupo de  compuestos estudiados es 

posible que uno de los términos contribuya en mayor medida que los otros en dar cuenta 

de las diferencias en el potencial redox del conjunto. En el caso de la familia A, el potencial 

de ionización es el término dominante. 

 

  PI (u.a.)   (u.a)   (u.a) 

A‐Etil  0,2007  0,0035  ‐0,0438 A‐Butil  0,1996  0,0048  ‐0,0426 

A‐Neopentil  0,2080  0,0053  ‐0,0409 A‐MetilButil  0,2030  0,0043  ‐0,0421 Tabla 11: Potencial de ionización, contribuciones térmicas y energías de solvatación para las 

moléculas de la familia A. 

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33  

 

Figura 24: Relación entre potencial de ionización y potencial redox calculado para la familia A.  El potencial calculado es expresado referido a Fc/Fc+.  La ecuación correspondiente al ajuste lineal 

es: y = 0,21322 + 0,024882x; R=0,97179.  

En  estudios  computacionales  de  propiedades  electroquímicas  de  diferentes  tipos  de 

sistemas  [25]  se  han  encontrado  relaciones  entre  la  energía  del  último  orbital  ocupado 

(HOMO)  de  la  forma  reducida,  potenciales  de  ionización  y,  finalmente,  potenciales  de 

óxido reducción. En cálculos DFT, la energía del orbital HOMO no corresponde al potencial 

de ionización, sin embargo se ha demostrado que reproduce tendencias de manera similar 

a los cálculos Hartee‐Fock, [26] donde la energía del orbital HOMO corresponde al potencial 

de ionización dentro de la aproximación. 

 

Para  la  familia  A  se  observa  que  la  enegía  del  orbital  HOMO  de  la  forma  reducida 

disminuye al aumentar el potencial de ionización. El punto correpondiente a la especie A‐

Etil  reducido  en  solución  nuevamente  se  aparta  del  comportamiento  general,  una 

situación similar se observa al graficar el potencial de óxido‐reducción contra  la energía 

del último orbital ocupado (Figura 25). 

 

El potencial redox es menos negativo y  la energía del orbital HOMO disminuye a medida 

que la esfera de coordinación del cobre toma una geometría más tetraédrica. 

 

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34  

 

Figura 25: Izquierda: Relación entre energía del orbital HOMO y potencial de ionización;  Derecha: Relación entre energía del orbital HOMO y potencial de óxido‐reducción calculado.  

En ambos gráficos, los cuadrados negros representan a las estructuras en fase gas, los blancos en solución y el cudrado rojo representa el punto A‐Etil en solución. 

 

La teoría de campo cristalino predice una energía de   para el último orbital (dx2­

y2)  de  la  conformación  cuadrado  planar  perfecta  y  de    para  la  geometría 

tetraédrica (orbitales dxz, dyz, dxy).  [27] A partir de este dato es razonable pensar que  la 

energía del último orbital para geometrías más cercanas al tetraedro sea menor que para 

estructuras  plano  cuadrado  y  que  consecuentemente  el  potencial  de  ionización  sea 

mayor. 

 

Para estudiar  la variación de  la energía de  los orbitales d a través del camino de mínima 

distorsión  entre  tetraedro  y  plano  cuadrado  se  construyó  un  sistema modelo  el  cual 

consiste en un átomo de cobre(I) y cuatro moléculas de amoniaco, donde  la orientación 

relativa de los ligantes es modificada a través del camino de mínima distorsión. [28]  

 

 

Figura 26: Representación y estructuras del sistema modelo [Cu(NH3)4]+ pertenecientes al camino 

de mínima distorsión plano cuadrado‐tetraedro. 

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35  

Las energías de los orbitales moleculares correspondientes a los orbitales d del centro de 

cobre  fueron  calculadas  con  la  misma  metodología  que  el  resto  de  las  moléculas 

pertenecientes a este estudio, se observa  la disminución de energía del orbital HOMO al 

disminuir el carácter plano cuadrado. 

 

 

Figura 27: Variación de la energía de los últimos cinco orbitales moleculares ocupados del cobre a través del camino de mínima distorsión plano cuadrado‐tetraedro. 

 

El  orbital  HOMO  de  la  conformación  cuadrado  planar  perfecta  está  principalmente 

compuesto por el orbital dx2­y2 del cobre (80,4%) y orbitales s y p de los nitrógenos (que 

en  conjunto  suman  17,6%).  Los  últimos  tres  orbitales  moleculares  ocupados  para  la 

estructura tetraédrica perfecta son degenerados y están compuestos por contribuciones 

de  diferentes  orbitales  d  del  cobre,  disminuyendo  el  aporte  del  orbital  dx2­y2,  las 

contribuciones de cada orbital atómico d del cobre son presentados en la tabla 12.  

   

Orbitales moleculares  dx2‐y2  dz2  dxz  dyz  dxy 

1  63,5  24,2  0,2  0,3  0,0 

2  16,5  41,9  0,3  0,6  29,2 

3  1,0  0,0  29,4  57,6  0,3 

Tabla  12:  Contribuciones  (%)  de  los  cinco  orbitales  atómicos  d  del  cobre  en  los  tres  orbitales degenerados HOMO para la conformación tetraédrica perfecta del compuesto modelo [Cu(NH3)4]

+. 

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36  

Para  todas  las  moléculas  de  la  familia  A,  el  orbital  HOMO  de  la  forma  reducida 

corresponde a un orbital d que apunta hacia  los  ligantes, de una  forma  similar a  la del 

orbital  x2­y2,  por  lo  tanto  el  argumento  que  explicaría  la  variación  del  potencial 

electroquímico con respecto a la estabilización del último orbital en entornos tetraédricos 

es plausible en este caso. 

 

 

Figura 28: Arriba: Orbital HOMO para las formas reducidas en fase gas de los compuestos pertenecientes a la familia A; de izquierda a derecha: A‐Etil, A‐Butil, A‐Neopentil, A‐MetilButil; 

Abajo: Orbital HOMO para las formas reducidas en solución de los compuestos pertenecientes a la familia A; de izquierda a derecha: A‐Etil, A‐Butil, A‐Neopentil, A‐MetilButil. 

             

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4.4 Análisis de los Compuestos Pentacoordinados (familia B).  

A  partir  de  la  forma  del  ligante  tripodal  que  permite  la  coordinación  de  un  ligante 

adicional  y  considerando  que  las mediciones  de  potencial  redox  de  referencia  fueron 

realizadas en acetonitrilo, es razonable esperar que exista coordinación de una molécula 

de solvente al centro de cobre. 

 

Los potenciales calculados para los compuestos de la familia B sin incluir una molécula de 

acetonitrilo  en  la  esfera  de  coordinación  del  cobre  no  son  cercanos  a  los  valores 

experimentales ni reproducen las tendencias observadas, a diferencia de los cálculos que 

consideran la molécula de solvente adicional. Es posible concluir que los compuestos de la 

familia B serían pentacoordinados por la participación de una molécula de acetonitrilo en 

la esfera de coordinación del centro metálico. 

 

Compuesto  Potencial Calculado (V vs. Ag/AgNO3) 

Potencial Experimental  (V vs. Ag/AgNO3) 

Error (V) 

B‐0Me sin ACN  0,57  ‐0,32  0,89 B‐1Me sin ACN  0,52  ‐0,26  0,78 B‐2Me sin ACN  0,50  ‐0,14  0,64 B‐3Me sin ACN  0,52  0,07  0,45 

Tabla 13: Potenciales de oxido‐reducción experimentales y calculados para los compuestos pertenecientes a la familia B en ausencia del ligante acetonitrilo. 

 

 

4.4.1 Relaciones Entre Estructura y Distorsión Geométrica. 

 

La  forma del  ligante  tripodal determina que  las  geometrías de  los  compuestos de  esta 

familia  (excepto para el caso de B‐3Me, que  se analizará en detalle más adelante)  sean 

cercanas a  la conformación de bipirámide  trigonal, donde el cobre central se encuentra 

fuera del plano trigonal descrito por los ligantes piridínicos, con ángulos N‐Cu‐Np menores 

a 90º.  

 

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Las restricciones estructurales que impone el ligante tripodal en la esfera de coordinación 

del  cobre  impiden  modificaciones  geométricas  que  involucren  el  paso  de  una 

conformación  de  bipirámide  trigonal  a  alguna  de  las  otras  formas  de  referencia 

disponibles  para  estructuras  pentacoordinadas  (pentágono,  octaedro  vacante,  pirámide 

de base cuadrada), por lo tanto no sería adecuado emplear el parámetro   en este caso. 

El parámetro S, que mide  la desviación de una geometría con  respecto a una  forma de 

referencia en particular, sería el más útil para este tipo de distorsiones.  

 

Compuesto   Gas  Solución 

Ox  Red  Ox  Red 

B‐0Me  0,68  1,43  0,61  1,34 

B‐1Me  1,08  2,03  1,07  1,97 

B‐2Me  1,50  2,81  1,51  2,84 

        B‐3Me  1,22  12,27*  1,15  13,99* 

Tabla 14: Valores de S(BPT) (S con respecto a la geometría bipiramidal trigonal) para los compuestos pertenecientes a la familia B. 

 

Llama la atención inmediatamente los valores de S(BPT) para las formas reducidas en fase 

gas  y  solución  del  compuesto  B‐3Me,  mucho  mayores  que  el  resto  de  los  datos.  La 

conformación  optimizada  en  este  caso  es  tetracoordinada,  donde  uno  de  los  ligantes 

piridina no está unido al cobre.   

 

Figura 29: Conformación de B‐3Me reducida en solución, uno de los grupos piridina no está coordinado al centro de cobre. 

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El cambio de número de coordinación de las geometrías optimizadas de la forma reducida 

del compuesto B‐3Me puede ser entendido considerando el efecto estérico de los grupos 

metilo  ubicados  en  posición  seis  de  los  anillos  piridínicos.  Los  sustituyentes  metilo 

desplazan el enlace cobre‐acetonitrilo fuera del eje axial de  la bipirámide trigonal, como 

se observa en la siguiente figura: 

 

 

Figura 30: Conformaciones reducidas en solución de los compuestos B‐0Me,  B‐1Me, B‐2Me y B‐3Me. 

 

 

Compuesto 

Np‐Cu‐ACN 

Gas  Solución 

Ox  Red  Ox  Red 

B‐0Me  180,0  179,8  180,0  179,8 

B‐1Me   73,2  164,2  172,3  163,9 

B‐2Me  171,6  157,9  171,3  157,0 

B‐3Me  179,9  127,1  180,0  129,1 

Tabla 15: ángulo axial Np‐Cu‐ACN para los compuestos pertenecientes a la familia B. 

 

La  forma oxidada de B‐3Me presenta una conformación pentacoordinada, a pesar de  la 

presencia de tres grupos metilo en posición seis de  los  ligantes piridina. Sin embargo,  la 

geometría reducida presenta un grupo piridina no enlazado en  la esfera de coordinación 

del cobre y es, por lo tanto, tetracoordinada. La diferencia entre ambas configuraciones es 

producto de  la menor distancia entre el grupo metilo y el eje axial determinado por  la 

orientación del enlace Cu‐Np de las estructuras reducidas en comparación a las oxidadas, 

que incrementa el efecto estérico del grupo metilo sobre el ligante acetonitrilo. 

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La  posición  relativa  del  sustituyente metilo  y  el  eje  axial  Cu‐Np  es  determinada  por  la 

orientación  de  los  anillos  piridínicos  que,  como  vimos  en  el  caso  de  los  compuestos 

pertenecientes a  la  familia A, depende de  las  tensiones que  se produzcan en el  ligante 

polidentado, principalmente con respecto a los ángulos N‐Cu‐Np y C1‐Np‐C2. 

 

 

Figura 31: Conformación en solución de la forma reducida de B‐1Me, la línea representa el eje axial Cu‐Np. 

 

Los  ángulos  C1‐Np‐C2,  C2‐Np‐C3  y  C3‐Np‐C1  son  evidentemente muy  similares,  por  lo 

tanto  la orientación que tome el anillo piridínico dependerá de  la distancia Cu‐Np, que a 

su  vez  determina  el  ángulo  N‐Cu‐Np.  La  distancia  Cu‐Np  en  compuestos  reducidos  es 

mayor que en compuestos oxidados, con lo que el ángulo N‐Cu‐Np disminuye y los grupos 

metilo quedan orientados más cerca del eje axial Cu‐Np. 

 

 

Figura 32: Izquierda: vista de B‐0C a través del eje axial; Centro: B‐0Me (reducido, gas); Derecha: B‐0Me (oxidado, gas). 

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En la figura 32 se presenta el ángulo entre el carbono seis del grupo piridina, el hidrógeno 

en  posición  seis  del  anillo  piridínico  y  el  nitrógeno  del  ligante  acetonitrilo,  el  ángulo 

aumenta en  las especies reducidas  indicando que el sustituyente en  la posición seis está 

más orientado hacia el grupo acetonitrilo.  

 

Al  superponer  las  estructuras  de  B‐0Me,  B‐1Me  y  B‐2Me  se  observa  que  la  mayor 

diferencia estructural en la esfera de coordinación del cobre es el movimiento del enlace 

Cu‐ACN  anteriormente  descrito,  la  variación  de  S  en  estas  estructuras  será  entonces 

reflejo de esa distorsión. 

 

 

Figura 33: Superposición de geometrías optimizadas reducidas de B‐0Me (negro), B‐1Me (rojo),  B‐2Me (azul); a la izquierda, estructuras en solución, a la derecha en fase gas. 

 

 

Figura 34: Superposición de geometrías optimizadas oxidadas de B‐0Me (negro), B‐1Me (rojo),  B‐2Me (azul); a la izquierda, estructuras en solución, a la derecha en fase gas. 

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4.4.2 Relaciones Entre Distorsión Geométrica y Potencial Redox. 

 

Al graficar  los valores de S para B‐0Me, B‐1Me y B‐2Me en función de  los potenciales de 

óxido reducción se observa que a mayor valor de S el potencial redox es menos negativo. 

Sin  embargo,  no  es  posible  entender  este  comportamiento  en  términos  de  energías 

orbitales, como se explicará a continuación. 

 

 

Figura 35: Relación entre S(BPT) y potencial de óxido reducción calculado (izquierda) y experimental (derecha) para B‐0Me, B‐1Me y B‐2Me. Los potenciales son expresados referidos al 

electrodo Ag/AgNO3.  Compuesto    Potencial Redox (V vs. Ag/AgNO3) 

Gas  Solución  Experimental  Calculado 

Ox  Red  Ox  Red    

B‐0Me  0,68  1,43  0,61  1,34 ‐0,32  ‐0,16 

B‐1Me  1,08  2,03  1,07  1,97 ‐0,26  ‐0,14 

B‐2Me  1,50  2,81  1,51  2,84 ‐0,14  ‐0,07 

Tabla 16:   y potenciales redox para los compuestos B‐0Me, B‐1Me y B‐2Me.  

Al  descomponer  el  potencial  redox  calculado  en  energías  de  solvatación,  potencial  de 

ionización y contribuciones térmicas es posible observar que el potencial de ionización es 

el término de mayor valor absoluto en todos los casos (alrededor de 0,3 u.a.), la diferencia 

de energías libres de solvatación oscila entre 0,14 y 0,15 u.a. y el término correspondiente 

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a la diferencia de contribuciones térmicas es siempre el menor, con valores entre 0,0018 y 

0,0036 u.a. 

   PI (u.a.)   (u.a)   (u.a) 

B‐0Me  0,3189  0,0018  ‐0,1481 B‐1Me  0,3183  0,0020  ‐0,1470 B‐2Me  0,3175  0,0036  ‐0,1454 B‐3Me  0,3268  0,0020  ‐0,1415 Tabla 17: Potencial de ionización, contribuciones térmicas y energías de solvatación para las 

moléculas de la familia B. 

 Al analizar la relación entre potencial redox y potencial de ionización se observa que en el 

caso de la familia B no basta con considerar sólo el término de mayor valor absoluto para 

dar cuenta de  las variaciones del potencial de óxido reducción calculado,  los cambios en 

las energías de solvatación y contribuciones térmicas son indispensables para obtener un 

ordenamiento correcto de los potenciales de los compuestos B‐0Me, B1‐Me y B‐2Me. 

 

 

Figura 36: Relación entre potencial de ionización y potencial redox calculado para la familia B, se destacan en un círculo rojo los compuestos B‐0Me, B‐1Me y B‐2Me. Los potenciales son 

expresados referidos al electrodo Ag/AgNO3.  

Al analizar  las diferencias en  las contribuciones de  los diferentes grupos al potencial de 

óxido‐reducción para pares de moléculas, se observa que el potencial marcadamente más 

positivo  de  B‐3Me  está  influenciado  mayormente  por  el  cambio  en  el  potencial  de 

ionización.  En  cambio  las  diferencias  entre B‐0Me,  B‐1Me  y  B‐2Me  son  principalmente 

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producto de  la variación de  las energías de solvatación, aun cuando en el caso de B‐Me2 

también son importantes las contribuciones térmicas. 

 

  PI (eV)   

(eV) 

 

(eV) 

Potencial 

Calculado (V) 

B‐Me1 ‐ B‐Me0  ‐0,016  0,005  0,030  0,019 

B‐Me2 ‐ B‐Me1  ‐0,021  0,043  0,043  0,065 

B‐Me3 ‐ B‐Me2  0,253  ‐0,043  0,106  0,316 

Tabla 18: Diferencia entre potencial de ionización, contribuciones térmicas y energías de solvatación para pares de moléculas de la familia B. 

 

Experimentalmente  se ha  relacionado  el potencial de óxido‐reducción  en  complejos de 

cobre  con  diversos  ligantes  polidentados  con  la  constante  de  estabilidad  de  la  forma 

oxidada,  encontrándose  que  la  forma  reducida  3d10  se  adapta  de mejor manera  a  las 

restricciones estructurales impuestas por diferentes ligantes. [29]  

 

A medida que aumenta el número de sustituyentes metilo en posición seis de  los anillos 

piridínicos,  la distancia Cu‐N  se alarga hasta 2,2 Å en  las  formas oxidadas, por  sobre  la 

distancia típica de 2,0‐2,1 Å observada para este tipo de enlaces,  [30, 31] Es posible que  la 

tensión  de  origen  estérico  introducida  por  los  grupos metilo  desestabilice  las  formas 

oxidadas  en  mayor  medida  que  las  reducidas,  de  este  modo  el  potencial  de  óxido‐

reducción deberá ser menos negativo, tal como ocurre en el caso de la familia B. 

 

  Distancias Cu‐N (Å) 

  Gas  Solución Gas  Solución Gas  Solución 

B‐0Me  2,10  2,09  2,10  2,09  2,10  2,09 

B‐1Me  2,11  2,09  2,11  2,09  2,16  2,16 

B‐2Me  2,12  2,10  2,16  2,14  2,18  2,16 

B‐3Me  2,20  2,18  2,20  2,18  2,20  2,19 

Tabla 19: Distancias Cu‐N para las formas oxidadas de los compuestos de la familia B. 

 

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5. Conclusiones.  

La  magnitud  del  error  en  el  cálculo  de  potenciales  redox  del  presente  estudio  se 

encuentra  en  un  rango  aceptable  al  comparar  con  sistemas  similares  y  reproduce  las 

tendencias experimentales observadas en ambas familias de compuestos.   

 

La  rigidez del  ligante  tetradentado  impide modificaciones estructurales que permitan  la 

utilización del parámetro   para  los  compuestos pertenecientes  a  la  familia B.  En este 

caso es apropiado emplear el parámetro S, que mide  la distorsión de una geometría con 

respecto a una forma de referencia particular. 

 

Parámetros estructurales y de análisis de densidad electrónica indican que los compuestos 

A‐Neopentil y A‐MetilButil presentan interacciones anagósticas entre el centro de cobre y 

un  hidrógeno  del  sustituyente  unido  al  nitrógeno  amínico.  En  A‐Etil  y  A‐Butil  no  se 

observan interacciones anagósticas debido a la forma de los sustituyentes etilo y butilo. 

 

El potencial de óxido‐reducción es menos negativo al aumentar el carácter tetraédrico de 

las conformaciones para los compuestos pertenecientes a la familia A. 

 

El potencial de ionización es el término que da cuenta en mayor medida de las diferencias 

en potencial de óxido‐reducción para las moléculas pertenecientes a la familia A. 

 

Las  relaciones  entre  potencial  de  óxido  reducción,  parámetro    y  energía  del  orbital 

HOMO  pueden  entenderse  al  considerar  la  energía  predicha  por  la  teoría  de  campo 

cristalino  para  el  último  orbital  ocupado  de  un  complejo  d10,  que  disminuye  con  el 

aumento  del  carácter  tetraédrico  para  geometrías  que  se  encuentren  en  el  camino  de  

mínima distorsión plano cuadrado‐tetraedro.  

 

Los  potenciales  calculados  para  las  formas  tetracoordinadas  de  los  compuestos 

pertenecientes a la familia B, junto con el carácter coordinante del solvente en el cual se 

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realizaron  las  mediciones  de  potencial  confirman  la  presencia  de  una  molécula  de 

solvente en la esfera de coordinación del cobre. 

 

Las estructuras reducidas optimizadas de B‐3Me resultaron ser tetracoordinadas, ya que 

uno  de  los  grupos  piridina  no  está  coordinado  al  centro  de  cobre  producto  del  efecto 

estérico de los grupos metilo que desplazan al enlace cobre‐acetonitrilo del eje axial de la 

conformación de bipirámide trigonal.  

 

La mayor diferencia estructural entre B‐0Me, B‐1Me y B‐2Me es  la ubicación del enlace 

cobre‐acetonitrilo,  que  progresivamente  se  va  alejando  del  eje  axial  Cu‐Np  al  añadir 

sustituyentes metilo  al  ligante.  Las  diferencias  en  el  valor  de  S  entre  compuestos  son 

principalmente producto de esta distorsión. 

 

No existe relación entre la energía del último orbital ocupado y el potencial redox para las 

moléculas de la familia B, debido a que el potencial de ionización por sí solo no da cuenta 

las diferencias en los potenciales de óxido‐reducción. 

 

Las variaciones en el potencial de óxido‐reducción para los compuestos B‐0Me, B‐1Me y B‐

2Me de la familia B pueden ser explicadas al considerar la tensión estérica introducida por 

los grupos metilo en posición seis de los anillos piridínicos.  

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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47  

6. Bibliografía: 

 

[1]  Computation  of  structures  and  properties  of  transition  metal  compounds;  P.  Comba,  M. Kerscher; Coordination Chemistry Reviews 253, 564–574 (2009).  [2]  Electrochemical  Behavior  of  Copper  Complexes  with  Substituted  Polypyridinic  Ligands:  An Experimental and Theoretical Study; W. Cañon‐Mancisidor, E. Spodine, D. Venegas‐Yazigi, D. Rojas, J. Manzur, and S. Alvarez; Inorg. Chem. 47, 3687‐3692 (2008).  [3] Computational Electrochemistry: The Aqueous Ru3+|Ru2+ Reduction Potential; P. Jaque, A. V. Marenich, C. J. Cramer, and D. G. Truhlar; J. Phys. Chem. C 111, 5783‐5799 (2007).  [4] Density Functional and Reduction Potential Calculations of Fe4S4 Clusters; R. A. Torres, T. Lovell, L. Noodleman, and D. A. Case; J. Am. Chem. Soc. 125, 1923‐1936 (2003).  [5]  Quantum‐Chemical  Predictions  of  Absolute  Standard  Redox  Potentials  of  Diverse  Organic Molecules and Free Radicals in Acetonitrile; Y. Fu, L. Liu, H. Yu, Y. Wang, and Q. Guo; J. Am. Chem. Soc. 127, 7227‐7234 (2005).  [6]  Calculation  of  One‐Electron  Redox  Potentials  Revisited.  Is  It  Possible  to  Calculate  Accurate Potentials with Density  Functional Methods?;  L.  E. Roy,  E.  Jakubikova, M. G. Guthrie,  and  E. R. Batista; J. Phys. Chem. A 113, 6745–6750 (2009).  [7] Continuous symmetry measures of penta‐coordinate molecules: Berry and non‐Berry distortions of  the  trigonal  bipyramid;  S. Alvarez  and M.  Llunell;  J. Chem.  Soc., Dalton  Trans.  3288  –  3303 (2000).  [8]  An  Improvement  of  the  Resolution  of  the  Identity  Approximation  for  the  Calculation  of  the Coulomb Matrix; F. Neese.; J. Comp. Chem. 24, 1740‐1747 (2003).  [9] Fully optimized contracted Gaussian basis sets for atoms Li to Kr; A. Schaefer, H. Horn and R. Ahlrichs; J. Chem. Phys. 97, 2571 (1992).  [10] COSMO: A New Approach to Dielectric Screening  in Solvents with Explicit Expressions for the Screening Energy and its Gradient; A. Klamt and G. Schuurmann; J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2, 799 (1993).  [11] Computation of equilibrium oxidation and reduction potentials for reversible and dissociative electron‐transfer  reactions  in  solution; P. Winget, C.  J. Cramer, D. G. Truhlar; Theor. Chem. Acc. 112, 217–227 (2004).  

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48  

[12]  Computing  Redox  Potentials  in  Solution:  Density  Functional  Theory  as  A  Tool  for  Rational Design of Redox Agents; M. Baik and R. A. Friesner; J. Phys. Chem. A 106, 7407‐7412 (2002).  [13] Density  functional  theory  response  to  the  calculation of electrode potentials of quinones  in non‐aqueous  solution of acetonitrile; M. Namazian;  Journal of Molecular Structure  (Theochem) 664‐665, 273–278  (2003).  [14] Calculation  of Redox  Potentials  and  pKa Values  of Hydrated  Transition Metal Cations  by  a Combined Density  Functional  and  Continuum Dielectric  Theory;  J.  Li,  C.  L.  Fisher,  J.  L.  Chen, D. Bashford, and L. Noodleman; Inorg. Chem. 35, 4694‐4702 (1996).   [15] Ab  initio molecular dynamics  for molecules with variable numbers of electrons; T.  Ivano; V. Rodolphe; S. Michiel; Physical review letters 88(21), 213002 (2002).  [16]  Synthesis,  Structures,  and  Redox  Properties  of  Copper  Complexes  with  Chiral  and  Achiral Amino Acid Derived  Ligands; N. Niklas,  F. Hampel, O. Walter, G.  Liehr,  and R. Alsfasser;  Eur.  J. Inorg. Chem. 1839‐1847 (2002).  [17]  CH Metal(II)  axial  interaction  in  planar  complexes  (metal  =  Cu,  Pd)  and  implications  for possible  environmental  effects  of  alkyl  groups  at  biological  copper  sites; O.Yamauchi,  T.Yajima, R.Fujii,  Y.Shimazaki,  M.Yabusaki,M.Takani,  M.Tashiro,  T.Motoyama,  M.Kakuto,  Y.Nakabayashi; J.Inorg.Biochem. 102, 1218 (2008).  [18] A Chemist’s Guide to Density Functional Theory, Second Edition; W. Koch, M. C. Holthausen; WILEY‐VCH, Alemania, (2001).   [19] Continuous Symmetry Measures; H. Zabrodsky, S. Peleg, and D. Avnir; J. Am. Chem. Soc. 114, 7843‐7851 (1992).  [20] Shape maps and polyhedral interconversion paths in transition metal chemistry; S. Alvarez, P. Alemany, D. Casanova, J. Cirera, M. Llunell, D. Avnir; Coordination Chemistry Reviews 249, 1693–1708 (2005).  [21] Minimal Distortion Pathways in Polyhedral Rearrangements; D. Casanova, J. Cirera, M. Llunell, P. Alemany, D. Avnir and S. Alvarez; J. Am. Chem. Soc. 126, 1755‐1763 (2004).  [22]  Shape  and  Spin  State  in  Four‐Coordinate  Transition‐Metal  Complexes:  The  Case  of  the  d6 Configuration; J. Cirera, E. Ruiz, and S. Alvarez; Chem. Eur. J. 12, 3162 – 3167 (2006).   [23]  Modulation  of  the  Copper‐Dioxygen  Reactivity  by  Stereochemical  Effect  of  Tetradentate Tripodal  Ligands; H.Hayashi, K.Uozumi, S.Fujinami, S.Nagatomo, K.Shiren, H.Furutachi, M.Suzuki, A.Uehara, T.Kitagawa; Chem.Lett. 416 (2002). 

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49  

[24] Agostic  interactions  in  transition metal  compounds; M. Brookharta, M.  L. H. Green  and G. Parkin; PNAS 17, 104, 6908–6914 (2007).  [25] Computational  electrochemistry  :  aqueous one‐electron oxidation potentials  for  substituted anilines; P. Winget, E. J. Weber, C. J. Cramer and D. G. Truhlar; Phys. Chem. Chem. Phys. 2, 1231‐1239 (2000).  [26] What Do the Kohn‐Sham Orbitals and Eigenvalues Mean?; R. Stowasser and R. Hoffmann; J. Am. Chem. Soc. 121, 3414‐3420 (1999).  [27]  Inorganic Chemistry; C. E. Housecroft and A. G. Sharpe; Second Edition, Pearson Education Limited, Inglaterra. (2005).  [28] Mapping the Stereochemistry and Symmetry of Tetracoordinate Transition‐Metal Complexes; J. Cirera, P. Alemany, and S. Alvarez; Chem. Eur. J. 10, 190 – 207 (2004).  [29]  Influence of Coordination Geometry upon Copper(II/I) Redox Potentials. Physical Parameters for Twelve Copper Tripodal Ligand Complexes; E. A. Ambundo, M. Deydier, A. J. Grall, N. Aguera‐Vega,  L.  T. Dressel,  T. H.  Cooper, M.  J. Heeg,  L. A. Ochrymowycz  and D. B.  Rorabacher;  Inorg. Chem. 38, 4233‐4242 (1999).   [30] Copper(II)‐activated transformation of azomethine to imidate: synthetic and structural studies; N. R. Sangeetha, S. Pal, S. Pal; Polyhedron 19, 2713–2717 (2000).  [31]  Copper(II)  Nitrate  Compounds  With  Heterocyclic  Ligands:  Structures  Of  [Cu(NO3)(2,2'‐Dipyridyl)2][NO3] • H2O and [Cu(H2O)(1,10‐Phenanthroline)2] [NO3]2; K. J. Catalan, S. Jackson And J. D. Zubkowski; Polyhedron 14, 2165 ‐ 2171 (1995). 

 

 

 

 

 

 

 

 

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A‐1  

7. Anexos: 

 

7.1 Modelos de Solvatación. 

 

En  1920, Max  Born  publicó  un  artículo  sobre  la  energía  libre  de  solvatación  de  iones 

considerando el solvente como un continuo dieléctrico y definiendo una frontera esférica 

que  representa  el  radio  iónico.  La  energía  de  solvatación  es  definida  a  través  de  la 

siguiente fórmula: [1]  

 

 

 

: Energía de solvatación del ión en el solvente S. 

 : Constante dieléctrica del solvente S. 

 : Carga del ión. 

: radio iónico. 

 

La idea de Born fue generalizada para moléculas neutras por Kirkwood y Onsager 

añadiendo la contribución de los momentos multipolares, [2,3] la expresión para la energía 

libre se convierte en una sumatoria de la forma: 

 

 

 

 : Energía libre de solvatación de la molécula X en el solvente S. 

 : Momento multipolar de orden l de la molécula X. 

 : Radio molécula X. 

 : Constante dieléctrica solvente. 

 

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A‐2  

A diferencia de la carga total de la molécula considerada en el modelo de Born original, los 

momentos multipolares de orden superior son dependientes de la polarización mutua del 

solvente y  la molécula, esta  interacción debe ser calculada  iterativamente, dando  lugar a 

los modelos de campo de reacción autoconsistente (SCRF, por sus siglas en inglés). 

 

Los  modelos  SCRF  dependen  del  valor  de  los  momentos  multipolares,  la  constante 

dieléctrica  del medio  y  el  radio  de  la molécula,  este  último  término  es  complicado  de 

tratar, ya que no es realista definir una cavidad esférica para moléculas de diferente forma 

y por otro  lado,  al definir una  cavidad no  esférica el  campo de  reacción deja de  tener 

solución analítica. [4]  

 

Como una forma de sortear la dificultad de resolver el SCRF utilizando cavidades de forma 

molecular se han propuesto modelos conocidos como Born Generalizado (GB), en los que 

se  incluyen  parámetros  ajustados  empíricamente  a  las  soluciones  del  problema  de 

polarización,  de  este  modo  se  obtiene  un  método  rápido  que  permite  realizar 

optimizaciones de geometría en fase solvente para moléculas de gran tamaño. 

 

Otra  línea  de  modelos  está  basada  en  la  resolución  numérica  de  las  ecuaciones  de 

Poisson‐Boltzmann para la polarización volumétrica: 

 

 

 

: Polarización volumétrica. 

 : Constante dieléctrica local. 

 : Campo Eléctrico. 

 

Los modelos  de  carga  superficial  aparente  (ASC)  tratan  el  problema  de  la  polarización 

soluto‐solvente a través de la densidad de carga superficial de polarización en lugar de la 

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A‐3  

polarización volumétrica, dentro de este grupo de encuentra el modelo COSMO, utilizado 

en este estudio. 

 

7.1.1 El Modelo COSMO. 

 

En  el  modelo  COSMO,  la  constante  dieléctrica  del  medio  es  sustituida  por  , 

correspondiente a un conductor perfecto, de este modo la expresión para la condición de 

borde se simplifica y resulta: 

 

 

   :  Potencial  generado  por  la  distribución  electrónica  de  la  molécula  dentro  de  la 

cavidad. 

: Matriz de interacción coulómbica de los segmentos de superficie. 

 : Cargas de polarización de los segmentos de superficie. 

 

La  densidad  de  carga  superficial  debe  ser multiplicada  por  un  factor  de  escalamiento 

dependiente de  la  constante dieléctrica del  solvente particular,  la expresión  finalmente 

resulta: 

 

 

 

 

 1] Volumen und hydratationswärme der ionen; M. Born; Z. Phys. 1, 45 (1920).  [2] Theory of Solutions of Molecules Containing Widely Separated Charges with Special Application to Zwitterions; J.G. Kirkwood; J. Chem. Phys. 2, 351 (1934).   [3] Electric Moments of Molecules in Liquids; L.J. Onsager; J. Am. Chem. Soc. 58, 1486 (1936).  [4] Quantum Mechanical Continuum Solvation Models;  J. Tomasi, B. Mennucci and R. Cammi; Chem. Rev. 105, 2999‐3093 (2005). 

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A‐4  

7.2 Teoría de Átomos en Moléculas. 

 

La  teoría  de  átomos  en  moléculas  (AIM)  divide  el  volumen  molecular  en  secciones 

atómicas mediante el análisis de  la densidad electrónica correspondiente,  las superficies 

interatómicas  se  definen  como  las  superficies  en  que  el  flujo  del  campo  vectorial  del 

gradiente de la densidad electrónica es igual a cero. Las cargas atómicas serán entonces la 

diferencia entre  la carga del núcleo y  la carga electrónica total encerrada en el volumen 

atómico. 

 

A diferencia de otros esquemas de asignación de cargas atómicas, la teoría de átomos en 

moléculas permite definir volúmenes atómicos que no se solapan, de una manera rigurosa 

y sin introducir parámetros arbitrarios. 

 

 

Mapa de contorno de la densidad electrónica del BF3 en el plano molecular, indicando los caminos de enlace, puntos críticos de enlace y superficies interatómicas.  

 

Además  de  cargas  atómicas,  el  análisis  AIM  permite  investigar  la  presencia  de  enlaces 

químicos, que se presentan en el campo vectorial del gradiente de la densidad electrónica 

como  pares  de  trayectorias  que  se  originan  en  un  punto  crítico  donde    y  que 

apuntan hacia los núcleos de los átomos vecinos. El valor de la densidad electrónica en ese 

punto está relacionado con la fuerza del aporte covalente  al enlace. 

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A‐5  

 

Mapa del campo vectorial  del gradiente de la densidad electrónica (  en el plano molecular del etileno, en la figura de la derecha se indican además los puntos críticos de enlace, caminos de 

enlace y superficies interatómicas. 

 

También es posible investigar la presencia de anillos en una molécula al buscar el mínimo 

de densidad electrónica correspondiente en el interior del anillo. 

 

 

Mapa de contorno (valor: 0,030 u.a.) de la densidad electrónica para una 

 de las moléculas en estudio (A‐Etil). 

 

 

 

Electron Densities, Atomic Charges, and Ionic, Covalent, and Polar Bonds; R. J. Gillespie; Journal of Chemical 

Education 78, 1688 (2001). 

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A‐6  

7.3 Bases Orbitales.  

 

Una base orbital es un conjunto de funciones utilizadas para  la construcción de orbitales 

moleculares en que cada orbital es representado por una combinación lineal de funciones 

base. [1]  

 

 

 

En  general,  un  número mayor  de  funciones  base  permitirá  una mejor  descripción  del 

sistema, pero también una mayor demanda de recursos computacionales, por lo tanto, la 

elección de una base orbital adecuada debe considerar ambos aspectos. 

 

Existen dos tipos principales de bases orbitales de uso común en química computacional, 

los orbitales tipo Slater (STO) y gaussianos (GTO): 

 

Los  orbitales  tipo  Slater  tienen  la  ventaja  de  describir  muy  bien  el  comportamiento 

electrónico  por  su  similitud  a  las  funciones  propias  de  la  solución  de  la  ecuación  de 

Schrödinger para el átomo de hidrógeno. [2]  

 

Por otro lado, la implementación computacional de los orbitales tipo Slater no es eficiente 

ya que no existen soluciones analíticas para todos los términos de las ecuaciones de Kohn‐

Sham (o del operador de Fock para métodos basados en la función de onda). 

 

El  segundo  grupo  de  funciones  (GTO)  no  describe  tan  adecuadamente  la  forma  de  los 

orbitales  en  comparación  con  los  orbitales  tipo  Slater,  por  lo  tanto  se  requiere  de  la 

superposición de varias funciones GTO para acercarse a la forma de los orbitales STO, esta 

desventaja  es  compensada  por  la  implementación más  eficiente  de  los  orbitales  tipo 

gaussiano. 

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A‐7  

 

Superposición de tres funciones gaussianas ajustadas para imitar el comportamiento de una función de Slater (línea sólida). 

 

En  el  presente  estudio  se  emplearon  bases  orbitales  GTO  denominadas  TZVP  y  TZV, 

desarrolladas por Dunning, el nombre TZV  (triple  zeta valence) de  la base orbital  indica 

que cada orbital de valencia es representado por tres funciones base,  la  letra P de TZVP 

indica que además se adicionan funciones de mayor momento angular (funciones –f). 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

[1] Essentials of Computational Chemistry; C.  J. Cramer;  John Wiley and Sons  Ltd. The Atrium, Southern Gate, Chichester, Inglaterra (2004).  [2] Introduction to Computational Chemsitry; F. Jensen; John Wiley and Sons Ltd. Baffins Lane, Chichester, Inglaterra (1999).