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RM multiparamétrica de próstata Optimización de la técnica Protocolos actuales Ángel Alberich-Bayarri, PhD 1. QUIBIM S.L., Valencia, España 2. Grupo de Investigación Biomédica en Imagen (GIBI2^30), Instituto de Investigación Sanitaria La Fe, Valencia, España [email protected] Twitter: @aalberich

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RM multiparamétrica de próstata

Optimización de la técnica

Protocolos actuales

Ángel Alberich-Bayarri, PhD

1. QUIBIM S.L., Valencia, España

2. Grupo de Investigación Biomédica en Imagen (GIBI2^30), Instituto de Investigación Sanitaria La

Fe, Valencia, España

[email protected]

Twitter: @aalberich

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1. Introducción

2. Protocolos actuales

3. RM multiparamétrica de próstata

4. Radiomics

5. Conclusiones

Contenido

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Introducción

20-30%

70-75%

<5%

Weinreb, J. C., Barentsz, J. O., Choyke, P. L., Cornud, F., Haider, M. A., Macura, K. J., …

Verma, S. (2016). PI-RADS Prostate Imaging - Reporting and Data System: 2015, Version 2.

European Urology, 69(1), 16–40.

Glándula prostática y cáncer de próstata

• Incidencia variable según el contenido

glandular

• Cáncer más diagnosticado entre la población

española de varones

• Consumo de una gran cantidad de recursos

en su tratamiento, alcanzando cifras entre

106,7-179,0 millones de euros en la Unión

Europea en 2016

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RM Multiparamétrica

Difusión PerfusiónT2

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Perfusión

1. Localizador

2. Secuencia anatómica T2 – FSE

3. Secuencia difusión con varios valores b

4. Secuencia dinámica 3D GRE T1 (LAVA/THRIVE)

5. Secuencia Post-Gd T1

Protocolos actuales

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Secuencia anatómica T2-FSE

– TE: 80ms (1.5T), 160ms (3T)

– TR: 3280ms (1.5T), 7665ms (3T)

– ETL: 21 (1.5T), 32 (3T)

– Campo de visión: 200 x 200mm

– Tamaño de vóxel: 0.4 x 0.4mm

– Espesor de corte: 3mm

– Matriz reconstrucción: 512 x 512

Protocolos actuales

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Secuencia potenciada en difusión

– TE: 70-90ms

– TR: 3000-5000ms

– Campo de visión: 240 x 240

– Tamaño de vóxel: 0.94 x 0.94mm

– Espesor de corte: 4mm

– Matriz reconstrucción: 256 x 256

Protocolos actuales

b=0 b=50

b=200 b=400

b=1000 b=2000

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Secuencia dinámica de realce con contraste (DCE)

– TE: 1.6ms

– TR: 6.1ms

– Ángulo: 25-35º

– Campo de visión: 300 x 300

– Tamaño de vóxel: 1.56 x 1.56mm

– Espesor de corte: 4mm

– Matriz reconstrucción: 192 x 192

– Dosis habitual: 0.1mmol/kg

– Velocidad de inyección: 2-4 mL/s

Protocolos actuales

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RM multiparamétrica

PerfusiónT2

Análisis de texturas

Difusión

Curtosis

Asimetría

Autocorrelación

Energía

Entropía

···

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RM multiparamétrica

Difusión PerfusiónT2

ADC

1000 2000

Valor b

ln(S

/So

)

IVIM

1000 2000

Valor b

ln(S

/So

)

Kurtosis

1000 2000

Valor bln

(S/S

o)

Stretched diffusion

1000 2000

Valor b

ln(S

/So

)

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RM multiparamétrica

PerfusiónT2

Análisis semicuantitativo Análisis farmacocinético

Difusión

Tiempo

[Gd

]

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RM multiparamétrica

Procesos implicados en análisis farmacocinético

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RM multiparamétrica

Perfusión

- Cálculo del T1

Ángulo

Magnetización

SI2º 5º

10º 20º

30º 45º

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Perfusión

1. Localizador

2. Secuencia anatómica T2 – FSE

3. Secuencia difusión con varios valores b

4. Secuencias T1 – GRE varios ángulos de magnetización, mapas T1

5. Secuencia dinámica 3D GRE T1 (LAVA/THRIVE)

6. Secuencia Post-Gd T1

Protocolos actuales

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RM multiparamétrica

Procesos para analisis multivariante

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Aprendizaje profundo (Deep Learning)

▪ Registro T2 Difusión (registro)

Perfusión(registro)

Campo de

deformación

Verdaderos positivos

Falsos negativos

Falsos positivos

DICE COEFFICIENT:

Training: 91,25%

Validation: 82,47%

Test: 81,83%

RM multiparamétrica

▪ Segmentación (IA y uso de CNN)

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Aprendizaje profundo (Deep Learning)

RM multiparamétrica

NVIDIA Quadro GP100

HARDWARE SOFTWARE

DATA SCIENTISTS

LABELED DATA

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Aprendizaje profundo (Deep Learning)

RM multiparamétrica

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RM multiparamétrica

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Machine Learning No Supervisado (Clustering)

ADC Ktrans

Mapa nosológico

Clustering voxel a voxel

Standardized Euclidean

RM multiparamétrica

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T2 ADC Ktrans

Prostata

RM multiparamétrica

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Próstata

▪ Anatomía Patológica

▪ PI-RADS

▪ Mapa nosológicoG

lea

so

n 6

Gle

as

on

7G

lea

so

n 9

A.P. PI-RADS Mapa nosológico

(automático)

RM multiparamétrica

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Informe estructurado cuantitativo

RM multiparamétrica

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Radiomics

Data miningData integrationSource images Segmentation Feature

extraction

PE

RF

US

ION

DIF

FU

SIO

NA

NA

TO

MY T2w

Organ extraction

Nosological image

Volume/Shape features

Histogram features

Texture Features

Clinical

Genomic

Metabolomic

Radiogenomics

Predictive/prognostic models

Diagnostic models

DWI

DCE-MRI

Clustering

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Agradecimientos

POST-DOCAlejandro Torreño, PhD - Technology DevelopmentAlejandro Rodríguez, PhD - Image Analysis Engineer

PhD STUDENTSAmadeo Ten - Image Analysis EngineerSara Carratalá - CNS Analysis

CLINICAL TRIALS AND PREBISandra Pérez - Data ManagerJuan Ramón Terrén - Data ManagerRebeca Maldonado - Technician & PREBI

ADMINISTRATIONAna Penadés - Economic & Financial Manager

GIBI230

QUIBIMIMAGE ANALYSIS SCIENTISTSFabio García Castro - Chief Image Analysis ScientistBelén Fos Guarinos - Image Analysis ScientistAna María Jiménez Pastor - Image Analysis ScientistRafael López González - Image Analysis Scientist

DEVELOPMENTRafael Hernández Navarro - Chief Technology OfficerAlejandro Mañas García - Full Stack Senior DeveloperEduardo Camacho Ramos - Front-End Developer

CLINICAL TRIALSIrene Mayorga Ruíz - Clinical Trials CoordinatorRaúl Yébana Huertas - Image Analysis Technician

MARKETING AND COMMUNICATION Katherine Wilisch Ramírez - Marketing Manager

MANAGEMENTIsabel Montero Valle – Team CoordinatorEncarna Sánchez Bernabé - Chief Operating OfficerDaniel Iordanov López - Assistant to Business Development

Luis Martí Bonmatí MD, PhD. GIBI Principal Investigator

QUIBIM Founder

Ángel Alberich Bayarri, PhD. GIBI Scientific-Technical DirectorQUIBIM CEO & Founder

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RM multiparamétrica de próstata

Optimización de la técnica

Protocolos actuales

Ángel Alberich-Bayarri, PhD

1. QUIBIM S.L., Valencia, España

2. Grupo de Investigación Biomédica en Imagen (GIBI2^30), Instituto de Investigación Sanitaria La Fe, Valencia, España

[email protected]

Twitter: @aalberich