6
!"" #$%% & " ’ The 6 th National Biotechnology Congress of Iran 13-15 Aug, 2009, Milad Tower Conference Hall, Tehran-Iran RAPD !" # $ ## % &’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ompressor Pro

Sex determination past of flowering in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Sex determination past of flowering in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers

Citation preview

Page 1: Sex determination past of flowering in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers

������������� �������������������������������

�� ���!��"�"���#$%%��� ����������&"����'���

The 6th National Biotechnology Congress of Iran��13-15 Aug, 2009, Milad Tower Conference Hall, Tehran-Iran

�������������� ����������������������������������������RAPD� �

������ !�"��#�$##%�����&����'�(������)$�*�(+������ ,�����)�$�-� ,��(./0�1���2&�)(� �

1��������������-� �

# �(�)�"�����*����+������������� ��!�,�)�"������*�������+��

��� -�.��*�!+��)�"� ��!�,�)�"���+����*��������

�$� ��/*��������������������.�0��1�2��3���0��1�.�456���7�����*���

��

�3���

�� 4859�"� �������2�."������ .�4���3:�������)���+����� ;<�"�=5>��?�3�� -�� !"����������"��������@��5��

<�4��@AB)����)������ &+���� .�C�� )D�4)�"���E�FF����4*�@���G.��+:�"�����H��D�IJ�=3���"�!"�K5������

-�.��"�.���+����� ;B�� ��������"�L�=3��@��"��� ���@��*�4�:�6�)J�M�����-��N2�.�@��$������4�C���4��L��

�+�<�����.�����O��+�+��� ;�8����@AB)�41�/���"��O��@�*���� &�FP#���)�4��!"������"�(�"���� ;<��������!��+>�6�

���0.-��.�*B������QR��������+;���������&B�����@<������?�3��-�������5���R���S��>��)�Q�@B;���"����

������������*����-��&��RAPD�������������2��"�*�L���G�.������T��4��U�������B�����+��!"�K5��@�;-� ����

��2�����-���������*����."�!+���VW.�V%W-���@K�� ����4��T��4��U�����H��B�����<��"�@��@+���)�.�!"�������

+�D�;<�4����"�L.���*����<��"�.�@��"���XC�!"��������@��+)���XC��)������;�8���<��"�0."��*����&���"��.��)�����

���"�.�@��"��Y�<�-��Z�@��+)�"��.�!"��������;�5)�Z�*������-��S:�C�[����������7��@AB)��<�-����!"���.��)�����

�9�S:�CT�����.�+��+�����X6�S\��/��.�]D�.���"�*�.�@�*�����4��<��*�<�@�*�4�����^�=59��!"���������

�+��;��

��

�4�$.�� ����.�5�����������(�������(RAPD� �

� �

� �

� �

� �

� �

� �

���6���

B���@+�E�!"�����2�."�4)�<���<�-��4���(��?�3��-�����������������+�.�!��B���4��@AB)�4)�"�@��������)���_

"��!"��"���;����&<�H�G����2�."���������0.-��.�*�+>�6�4B������QR����+�����;���������&B�����?�3��-������D�@

PDF Compressor Pro

Page 2: Sex determination past of flowering in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers

������������� �������������������������������

�� ���!��"�"���#$%%��� ����������&"����'���

The 6th National Biotechnology Congress of Iran��13-15 Aug, 2009, Milad Tower Conference Hall, Tehran-Iran

�����5���& R���S��>�)�Q�@B�;��<��"�S��������2�."�!�4��������4*�B����@���L� )�+�<�-��+T��� �����QR���

��"��� )�/����D�I��:�4��"��"�"��.�`F;a�������9�"���485������&/A�4��)�����2."�&�����&4���3:����)���#�

�� !"��)�9-�� .�+)���4� ��+����`b� ;a�� �"�<� ���@AB)� 41�/�� �"� �O��@�*� ��� !�FP#�� �)� 4�� !"������ "�(�"����;

�8�����"�&��<+)-�S�����<����!�$�����)����-�L����+�<�4�C���4�����@��-������c����.���\��+�+���`#�;a�d-��

"�=5>������������d-�����0���@�1�4��� ��.�@T�:��"�4*�@��4)�"��"�!+��+���D�0-����4�����!"�K5���"���`�;a���

5)�� I�1�M�� "��.� 0+1� I��:� �"�������T����B��� ��<� �"� @��2� ."� ��������*���-�� !"�K5�� &4�������������

R�����Q���)�������eO2�������!"���.��)��������4*�+�������4�����*������-���/�"�4��)����"� ��C�:���<�������

�2� ."�)� 4��� !"�K5�� /�+)���`#W� ;aRAPD�.����� &!"������� ��-��� .� fR�����2� Q�6���������� .� gB���

5��*�������2�."��6�I�T��7��.�4�5)�������h)�"����I�K:�]�R5)��.�Z�+����`$�;ad��/<���-��"����"�T��"������

B���<�@�"��"� "��.�i�5R������� ;� �*���� -�RAPD����R����B���Q�<�@��� !��+��2�2� .� 45B2� &��� �`�� &#W.�%�a

@�� !+�� !"�K5�� ;B��� �<��<� 4�C��� �"� �������@��� 48������ )�)� ������� 41�/�� 4�����j5)�� -��SA>� .����&"���

�������� )�5B�� )�����@AB)����F�.��)�+:�"�kF����9�!"���+:�"�@��"�g�;��

��

���7$��$�������

�����������8��9:0��$�DNA��&4����

���l��j3��/*��� -�� ��������-�.��*�!+��)�"�4)�R�<� .�0� ��I�j ��!�,�)�"���.D�f���������++)+��� ;DNA�

��)���d.�����CTAB`�V�am�����.������+��'��R5���;*�.�@h�G�K�@DNA �5��56.�5�n��o����������"������>�

@6�<�;�8���*�&��K��@DNA.������-��<D�L��%pW+:�"� )�����/�+���;�NnDNA� )�@h�G�������FW����0�<�)�)�

���.���>���5����*�.��"�.�qPCR@6�<����>�!"�K5��"�����;��

;�����PCR

PCR��"�����*�.�Z�F����.����5+��0�()��� ;�S������*�.�U��R��pW���������-��L���dNTP� &�/)D�+C�.�Z��g

Smar Taq"�������2���&-���Fp#������L���Mgcl2&��pW�����2��J��.���2������.�+Fp�����.����6����5x #W 2������D�

`.�C�FWW������L���Kcl�.�#WW������L���Tris-Hcl�a�.FW�����0�<�)�)���.�����5DNA����+����;���*�.RAPD-

PCR����@3���-�o�@6�<�0�()����P��L.��S�k��I+��4��4��"�F>"���Nn�.�4j�W��S��Pk��I+��4��4��"��F�

)�r��&4$��4��"�`��2���#F�a�.�W�4��"�`��2���#WF�a�I+��4��F)�r���&4b��I+��4��4��"�#>"��+��0�()��4j�;�8����&�

\���� )������"��"��b��I+��4��4��"�b>"��+��0�()��4j�;�s��(���"�W��2��2�����-���+������+�;�IJ�=3��-��6.�5���

\����-��<D�L�����!+���#���5�.����.�+:�"�%W�I+��4��$\���I�T7>�.�0�()��@1�����D�t)��-��N2��/�������+��0�

��.���"�<�QR���+�+)+;��

��

1Sonoran 2�Salix viminalis

PDF Compressor Pro

Page 3: Sex determination past of flowering in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers

������������� �������������������������������

�� ���!��"�"���#$%%��� ����������&"����'���

The 6th National Biotechnology Congress of Iran��13-15 Aug, 2009, Milad Tower Conference Hall, Tehran-Iran

�:&+<,��$�=���

���"���-D���\���I�T7>�"�+T�����-�������#��-��I�T7>�!-�+)��.�4T7>��WW�����WWW��2��"�-���@K��������i�5R��

"���I.�K5��;��-�����W��2�����!"�������-D�"����������2���2����6������s��(���"�.�&+)"�"����)����gBbW�u����)���+)���

�.��2�+)����+��!+�����u�����;��-�����������2����2�."�&��������`#F�.�#WF�a������������5�-AGGAGTCGGA-3� .�

5�-GGGCCACTCA-3� ���� 4����+)��� H��VW� .�V%W-��� @K���� ������2� 4*� &+)"��)� "�(��.�� ����4�� U����� +)���

B����������!"���@�<�4����"�4*�"��)�+�<��"�.�@��"���XC�!"���������@��+)���XC�)�����`�S��#�a��2�.��+)���0."���

B���4��U������� ����)�@���4*�&"��)�"�(�<��"�+)�����"�����@��"�"��.��)�����<����+�)�QR���!"�������`�S����;a

��������� &����I�T7>������*��������1�4��+�)����������T����B������+�<�-��SA>�SC�����"�@��!"�K5��"����c���� .�

<����>�+)��;�5)���-��S:�C�[����������46�:�v1����� ����S��>��"�=5>��f�����.����-��"����4��)����"�C�:����

�8���.�+��+���9��/6�����&��<�"�+T������!"��������)�41�/���"�"����1���/��/6��/�������+��;

�>�'%�?\���I�T7>���DNA��)�����2�o����������������RAPD�;��2����F1�+)���!+��"����)��VW-���@K���@��

<��"�4*�<��"�.�"��"�"��.�!"��������"��+)�"��.��)������;M�P���*���5)���;��

PDF Compressor Pro

Page 4: Sex determination past of flowering in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers

������������� �������������������������������

�� ���!��"�"���#$%%��� ����������&"����'���

The 6th National Biotechnology Congress of Iran��13-15 Aug, 2009, Milad Tower Conference Hall, Tehran-Iran

��>�')?��2�����F10�+)���!+��"����)�V%W-���@K��<��"�oj6�4*�@���"��"�"��.��)������;M�P5)���*������;��

&����1�$���@��5�*�-������<���"�5��4�-�.��*�!+��)�"��"� ��!�,�)�"����/*���.�����*�������+����������.�0��1�

�������2���������47�.�4��456������������0��"���������L��*;��

A����� �

1-Agrawal, V., Sharma, K., Gupta, S., Kumar, R., Prasad, M. 2007. Identification of sex in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers. Plant Biotechnol Rep. 1: 207-210.

2-Alstrom-Rapaport, C., Lascoux, A., Wang, Y.C., Roberts, G. and Tuskan, G.A., 1998. Identification of a RAPD marker linked to sex determination in the basket willow (Salix viminalis L.). Journal of Heredity. 89: 44-49.

3-Belaj, A., I. Trujillo, R. Rosa, Rallo and M.J. Gimemez. 2000. Polymorphism and discrimination capacity of randomly amplified polymorphic marker in olive germplasm bank. Journal American Society Hort Science. 126: 64-71.

4-Mills �� D. �� Zhang�� G. and Benzioni�� A., 2001. Effect of different salts and ABA on growth and�mineral uptake in jojoba shoots grown in vitro. J. Plant Phsiol. 158: 1031-1039.

5-Parasnis, A.S., Gupta, V.S., Tamhankar, S.A. and Ranjekar, P.K., 2000. A highly reliable sex diagnostic PCR assay for mass screening of papaya seedling. Molecular Breeding. 6: 337-344.

6- Saghari, Maroof, M.A., Soliman, K.M., Jorgensen, R.A., Allard R.W. 1984. Ribosomal DNA spacer-length polymorphism in barley: Mendelian inheritance, choromosomal location, and population dynamics. Proc Natl Acad Sci USA. 81: 8014-8018.

7-Tyagi� R.K. and Prakash� S., 2004. Genotype-and sex-specific protocols for in vitro micropropagation�and medium-term conservation of jojoba. Biologia Plantarum. 48:19-23.

8-Chaves-Bedoya, G., Nunez, V. 2007. A SCAR marker for the sex type determination in colombian genotype of Carica papaya. Euphytica. 153: 215-220.

9-Xu, W.J., Wang, B.W. and Cui, K.M. 2004. RAPD and SCAR markers linked to sex determination in Eucommia ulmoides Olive. Euphytica. 136: 233-238

PDF Compressor Pro

Page 5: Sex determination past of flowering in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers

������������� �������������������������������

�� ���!��"�"���#$%%��� ����������&"����'���

The 6th National Biotechnology Congress of Iran��13-15 Aug, 2009, Milad Tower Conference Hall, Tehran-Iran

10-Yakubov, B., Barazani, O. and Goldhirsh-Goldhirsh, A., 2004. Combination of SCAR primers and touchdown-PCR for sex identification in Pistacia vera L. Journal Scientia Horticulture. 103: 473-478

��

��

��

��

PDF Compressor Pro

Page 6: Sex determination past of flowering in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers

������������� �������������������������������

�� ���!��"�"���#$%%��� ����������&"����'���

The 6th National Biotechnology Congress of Iran��13-15 Aug, 2009, Milad Tower Conference Hall, Tehran-Iran

Sex determination past of flowering in Simmondsia chinensis (Jojoba) using RAPD markers� �

Hosseini, F1* , **. Shahsavand Hassani, H2. Arvin, M. J2,3. Mohammadinejad, Gh2B Baghizadeh, A3 1Agricultural Biotechnology MS.c student of Shahid Bahonar Univercity of Kerman, Kerman, Iran; 2 college of

agriculture, Shahid Bahonar Univercity of Kerman, Kerman, Iran; 3 International Center for Science, High Technology and Environmental Science, Kerman, Iran.

Abstract Simmondsia chinensis is a dioecious tree native to sonoran desert. The pistillate plants are economically more useful than the staminate plants. The seed containing of 55% oil that it is suitable for using of cosmetics products and pharmaceutic. The waiting time from planting to harvesting is very long and it does not flower or produce seeds until 3-4 years after transplantation. With cultivation seed in the field obtained 5:1; mle:female ratio. The jojoba plant is without distinguishable sex chromosomes. Therefore, the plant sex isn’t distinguish by cytological methods. Since there is no methodes available to determine the sex at the seedling stage, current investigations have been carried out to generate a sex-specific RAPD marker in jojoba. Two marker 460 bp and 680 bp produced, that related to female and male plants, respectively . The first marker present in the female plants and absent in male plants. Also, second marker obtained in male plants and absent in female plants. by result of this study, a desired ratio of male and female plants can be achieved, and resources like, planting space, fertilizers, water and the labor costs can be devoted to the cultivation of the desired sex.

Key words: Sex determination, Jojoba, RAPD markers

PDF Compressor Pro