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Slicer 3 チュートリアルSPL における腹部アトラス

Ion-Florin Talos, M.D.

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謝辞

NIH P41RR013218 (Neuroimage Analysis Center)

NIH U54EB005149 (NA-MIC)

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免責条項

• 使用者は添付ライセンス内の内容と関連法に遵守して slicer を使用すること

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使用するソフトウェア , データセット

• Slicer 3( このチュートリアルでは slicer3-3.0 を使用 )

→http://www.slicer.org/pages/Special:SlicerDownloads

• アトラスデータ→http://www.spl.harvard.edu/publications/item/view/1266

• CT 画像• ラベルマップ• 3D モデル

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学習目標

• アトラスデータの読み込み

•　体内の独自の 3Dviewの製作と表示

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チュートリアルにおける必要条件

• Slicer Training データの読み込みと表示のチュートリアルを行うこと→http://wiki.na-mic.org/Wiki/index.php/Slicer:Workshops:User_Training_101

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要旨

• Part 1: 腹部アトラスデータの読み込み

• Part 2: 体内の独自の 3Dview の製作と表示

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腹部アトラスデータの読み込み

•　解剖学的な濃淡値データ　 (CT や MRI 等の画像データ ) ………………….

•　ラベルマップ……………………………

• 3D モデル………………………………

• MRML シーン ………………………… .

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アトラスデータの読み込みFile メニューより ,Load Scene を選択 .ポップウィンドウにおいて , Abdominal_Atlas2008.mrml を選択し , Open をクリック .

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3D モデル

アトラスデータの読み込み

ラベルマップでオーバーレイされたCT 画像

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要旨

• Part 1: 腹部アトラスデータの読み込み

• Part 2: 体内の独自の 3Dview の製作と表示

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独自の 3Dview の製作

Models モジュールの visibility より ,3D モデルが各構造毎に表示するかどうかを選択できることから ,独自の体内の 3Dview を製作することが可能 .

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独自の 3Dview

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独自の 3Dview の製作 (1)

Modules より ,Models モジュールを選択 .Hierarchy & Display タブを開く

Model Display 欄より ,Select Model or Hierarchy において ,モデルを選択し , そのモデルを3DViewer 内で表示したいならば ,Visibility のチェック欄にチェックを入れる .( チェックを入れなければ , 表示されない )

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独自の 3Dview の製作 (2)

Modules より ,Data モジュールを選択 .

Create Scene Snapshot をクリックし , ポップアップウィンドウにおいて , 独自の 3Dviewの名前を記入 . ( 例： Portal Circulation)

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独自の 3Dview の製作 (3)

•Scene Snapshot の右側の欄をクリックすると , これまでに作成したスナップショットのデータファイル名も出てくるので ,そこから選ぶことも可能である .•保存ファイル名が決定すれば ,Restore をクリック .

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補足 (1)

• スライド 14~16 に関しては ,slicer3-3.0 バージョンにおけるスナップショット方法である .

• Slicer3-3.0 以降のもの (3.2 や 3.4 等 ) では上記のスナップショット方法と異なる .

• 3.2,3.4 バージョンにおけるスナップショット方法を説明する .

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補足 (2)

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補足 (3)

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補足 (4)

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翻訳

スライド翻訳：木西　基 **　　　　 　 監守：波多　伸彦 *

* Surgical Plannninng Laboratory, Harvard Medical School** 知的画像処理研究室 , 立命館大学