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1 T T É É CNICAS AVANZADAS DE CNICAS AVANZADAS DE RECONSTRUCCI RECONSTRUCCI Ó Ó N DE N DE IMAGEN NUCLEAR IMAGEN NUCLEAR PET, X PET, X - - CT Y SPECT CT Y SPECT JOAQU JOAQU Í Í N L N L Ó Ó PEZ HERRAIZ PEZ HERRAIZ TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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Page 1: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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TTÉÉCNICAS AVANZADAS DECNICAS AVANZADAS DERECONSTRUCCIRECONSTRUCCIÓÓN DEN DE

IMAGEN NUCLEARIMAGEN NUCLEARPET, XPET, X--CT Y SPECTCT Y SPECT

JOAQUJOAQUÍÍN LN LÓÓPEZ HERRAIZPEZ HERRAIZ

TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

Page 2: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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ííNDICENDICE

INTRODUCCIÓN

OBJETIVO DEL TRABAJO

MÉTODOS

RESULTADOS

CONCLUSIONES

Page 3: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

3

ííNDICENDICE

INTRODUCCIINTRODUCCIÓÓNN

OBJETIVO DEL TRABAJO

MÉTODOS

RESULTADOS

CONCLUSIONES

Page 4: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

4

• Es una técnica de imagen biomédica funcional que permite estudiar el metabolismo de moléculas marcadas con un átomo emisor de positrones

• A partir de la radiación detectada se logra una imagen de la distribución de estas moléculas en el paciente, indicando cómo metaboliza ese trazador

LA TOMOGRAFLA TOMOGRAFÍÍA POR A POR EMISIEMISIÓÓN DE POSITRONESN DE POSITRONES

CT PET

IMAGEN ANATÓMICA

IMAGEN FUNCIONAL

Page 5: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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Datos

CICLOTRÓN(18F, 11O...)

Radioisótopo+

TrazadorInyección

en el paciente

Emisión β+

yAniquilación (2γ)

Detección de 2 rayos γ en coincidencia

LA TOMOGRAFLA TOMOGRAFÍÍA POR A POR EMISIEMISIÓÓN DE POSITRONESN DE POSITRONES

COLIMACIÓN ELECTRÓNICA

Reconstrucciónde Imagen

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6

RECONSTRUCCIRECONSTRUCCIÓÓNNTOMOGRTOMOGRÁÁFICAFICA

MODO 2DAnillo de detectores

• Inicialmente los datos PET se adquirían en modo 2D

• Sólo se permiten pasar rayos gamma perpendiculares al eje axial

• Se van adquiriendo cortes transversales del paciente

Page 7: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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RECONSTRUCCIRECONSTRUCCIÓÓNNTOMOGRTOMOGRÁÁFICAFICA

MODO 2D

Los datos 2D de cadacorte transversal se reconstruyen de maneraindependiente obteniendouna imagen CONJUNTO DE

PROYECCIONES PET

IMAGEN

Las coincidencias detectadas se organizan según las coordenadas de su línea de respuesta

El conjunto total de datos se reconstruye con métodos tomográficos

RECONSTRUCCIÓN

2D

Page 8: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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10 30 50

0

500

1000

1500

2000

2500

0 10 20 30 40 50 600

500

1000

1500

2000

2500

0 10 20 30 40 50 600

500

1000

1500

2000

2500

0 10 20 30 40 50 60

ITERACIONES DE OSEM DATOSPET

MODELO DEL SISTEMA

PROYECCIÓN DATOS ESTIMADOS

OBJETO INICIAL(Uniforme)

RETRO-PROYECCIÓN

DATOSPET

MODELO DEL SISTEMA

DATOS ESTIMADOS

OBJETO INICIAL(Uniforme) DATOS PETMODELO DEL SISTEMA

PROYECCIÓN DATOSESTIMADOS

OBJETO ESTIMADO

RECONSTRUCCIRECONSTRUCCIÓÓNNTOMOGRTOMOGRÁÁFICAFICA

ITERATIVO 2D(OSEM)

BASADO EN MÉTODOS

ESTADÍSTICOS

REQUIERE UN MODELO DEL

SISTEMA

FBP

MÉTODOS ANALÍTICOS DATOS

PETIMAGENFILTRO

MODELO SIMPLEDEL SISTEMA

RETRO-PROYECCIÓN

Page 9: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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RECONSTRUCCIRECONSTRUCCIÓÓNNTOMOGRTOMOGRÁÁFICAFICA

MODO 3D

OPCIÓN 1: DATOS 3D DATOS 2D Y RECONSTRUCCIÓN 2D

OPCIÓN 2:RECONSTRUCCIÓN 3D

PROYECCIÓN Y RETROPROYECCIÓN EN 3D

SSRB FORE

Los datos se adquieren no solo en cortes transversales. Se disponen de muchos más datospero su reconstrucción es máscompleja.

Colapsar los datos 3D en datos 2D implica una cierta pérdida de resolución

Page 10: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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MMÉÉTTOODDOO

MODO DE ADQUISICIÓN

+ CALIDAD+ COMPLEJO

3DRP

MODO 3D

PÉRDIDA DE RESOLUCIÓN

BAJA SEÑAL-RUIDO

MODELO REALISTA

DEL SISTEMA

FORE+ITER. 2D

ITER. 2DESTADÍSTICO

MODO 3D MODO 2DMODO 2D

ANALÍTICO

MODELO SIMPLE

DEL SISTEMA

FORE+FBP

FBP

RECONSTRUCCIRECONSTRUCCIÓÓNNTOMOGRTOMOGRÁÁFICAFICA

ITER. 3D

Page 11: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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INTRODUCCIÓN

OBJETIVO DEL TRABAJOOBJETIVO DEL TRABAJO

MÉTODOS

RESULTADOS

CONCLUSIONES

Page 12: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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OBJETIVO DEL TRABAJOOBJETIVO DEL TRABAJO

1 ) Obtener mediante simulaciones un modelo realista de un escáner PET de pequeños animales

2 ) Desarrollar un programa de reconstrucción iterativa completamente 3D basado en dicho modelo realista

3 ) Optimizar este programa para que a partir de adquisiciones reales pueda reconstruir imágenes de gran calidad (resolución de 1mm y con poco ruido) en menos de 2 horas

SIM

ULA

CIÓ

N

OSEM3DDATOS ADQUIRIDOS

IMAGEN RECONSTRUIDA

Page 13: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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OBJETIVO DEL TRABAJOOBJETIVO DEL TRABAJO

HIPÓTESIS PRINCIPAL“La calidad de las

imágenes reconstruidas se ve mejorada

considerablemente si se tiene en cuenta un modelo físico realista de la emisión

y la detección de la radiación”

IMIMÁÁ

GEN

ES DE U

N R

AT

GEN

ES DE U

N R

AT ÓÓ

N O

BTEN

IDA

S N

OB

TENID

AS

MED

IAN

TE ESTUD

IOS C

ON

M

EDIA

NTE ESTU

DIO

S CO

N 1818FF

RECONSTRUCCIÓNANALÍTICAFORE+FBP

RECONSTRUCCIÓN ITERATIVAOSEM3D

La reconstrucción iterativa OSEM3D permite hacer uso de

este modelo físico

Page 14: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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INTRODUCCIÓN

OBJETIVO DEL TRABAJO

MÉTODOS

RESULTADOS

CONCLUSIONES

Page 15: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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MMÉÉTODOSTODOS

( 4 )CREACIÓN DEL

CÓDIGO DE RECONSTRUCCIÓN

OSEM3D

( 1 )CREACIÓN DE MÉTODOS DE

RECONSTRUCCIÓN 2D

( 2 )SIMULACIÓN

REALISTADEL SISTEMA

( 3 )ALMACENAMIENTO

DE LA MATRIZDEL SISTEMA

Page 16: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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MMÉÉTODOSTODOS

(1) CREACIÓN DE MÉTODOS DE RECONST. 2D

FBP

SECCIÓN 2.4

ITERATIVO 2D

SECCIÓN 4.3

Antes de crear un código complejo OSEM3Dconviene implementar métodos más sencillos

SSRB / FORE

SECCIÓN 2.6

DATOS3D DATOS2D

Page 17: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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MMÉÉTODOSTODOS

(2) SIMULACIÓN REALISTA DEL

ESCÁNER

RadioisRadioisóótopotopoComptonCompton

No No colinealidadcolinealidadRangoRango

AniquilaciAniquilacióónn

PositrPositróónn

FotFotóón n γγ 511 keV511 keV

KleinKlein---- NishinaNishina

FotoelFotoelééctricoctrico

CristalCristalCentelleadorCentelleador

FotFotóón n γγ 511 keV511 keV

CristalCristalCentelleadorCentelleador

PROCESOSFÍSICOS

SECCIÓN 4.7, 4.8

Page 18: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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MMÉÉTODOSTODOS

(2) SIMULACIÓN REALISTA DEL

ESCÁNER

PROCESOSFÍSICOS EN PET

PeneloPET – Programa de simulación Montecarlo para PET basado en

PENELOPE

SIMULACIÓNMONTECARLO

Desarrollado por el grupo de Fisica Nuclear de la UCM

Se basa PENELOPE, un programa de simulación de la interaccióncon la materia de fotones y electrones en el rango de energías desde1 keV hasta cientos de MeV (F.Salvat et al., Univ. Barcelona)

Permite considerar los principales procesos físicos de PET:- Rango del positrón- No colinealidad- Interacción de los rayos gamma dentro de los cristales- Determinación de la posición de interacción en el cristal- Electrónica

Es más flexible y más rápido que otrossimuladores para PET

SECCIÓN 4.7, 4.8

Page 19: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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MMÉÉTODOSTODOS

(2) SIMULACIÓN REALISTA DEL

ESCÁNER

PROCESOSFÍSICOS EN PET

SIMULACIÓNMONTECARLO

PROBABILI-DADES

¿Cuál es la probabilidad de que un positrón emitido en un determinadopunto, genere una coincidencia en un determinado par de cristales?

Se puede apreciar cómo esla forma y el ancho de lasprobabilidades para este

escáner

SECCIÓN 4.7, 4.8

eXplore Vista escáner (GE)

Page 20: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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QUASI-SIMETRÍAS

MMÉÉTODOSTODOS

(3) ALMACENAR MODELO DEL

ESCÁNER

300MBNo Nulos y Con simetríasy Quasi-simetrías

2.5GBNo Nulos y Con simetrías

>100GBNo Nulos y Sin simetrías

>10TBTodos los coeficientes

Tamaño Modelo del Escáner

Almacenar todas las probabilidades es imposible Usarsimetrías y métodos de compresión del modelo

SIMETRÍAS

SECCIÓN 4.9

Page 21: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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MMÉÉTODOSTODOS

(4) CREACIÓNOSEM3D

Optimización de acceso a las probabilidades

Optimización de la proyección y de la retroproyección

Paralelización del código

SECCIÓN 4.9, 4.10

Page 22: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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INTRODUCCIÓN

OBJETIVO DEL TRABAJO

MÉTODOS

RESULTADOS

CONCLUSIONES

Page 23: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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OSEM3DFORE+ FBP

SSRB+ FBP

Datos 2D+ FBP

RESULTADOSRESULTADOS

RECONSTRUCCIÓN CON DISTINTOS MÉTODOS DE UNA ADQUISICIÓN REAL EN EL ESCÁNER EXPLORE VISTA

DEL MANIQUÍ DEFRISE RELLENO DE FDG

TRA

NSV

ERSA

LSA

GIT

AL

Page 24: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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Imagen reconstruida con OSEM3D de una rata inyectada

con 18F en fluorina

Imágenes reconstruidas con OSEM3D de ratón de 20g (Izda.) y rata de 200g

(Dcha.) inyectadas con FDG

RESULTADOSRESULTADOS

Page 25: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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RESULTADOSRESULTADOS

RECONST.OSEM3DDE UNA

ADQUISICIÓN DINÁMICA

(GATED CARDIACO)

ADQUISICIÓN REALIZADAEN EL HGGM

Page 26: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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INTRODUCCIÓN

OBJETIVO DEL TRABAJO

MÉTODOS

RESULTADOS

CONCLUSIONES

Page 27: TRABAJO DEL MASTER DE FÍSICA BIOMÉDICA

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CONCLUSIONESCONCLUSIONES

Los objetivos de este trabajo se han cumplido ampliamente

En la actualidad disponemos de un modelo realista de escáneres PET de pequeños animales, y el programa de reconstrucción iterativa OSEM3D que se ha implementado necesita tan sólo 2 minutos en un ordenador con dos quads-CPU para reconstruir imágenes con resolución submilimétrica y con bajo nivel de ruido

Esta calidad de las imágenes se logra incluso en adquisiciones de muy bajo número de cuentas, donde el algoritmo 3D es muy superior a cualquier otro

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