Embed Size (px)
Citation preview
1
ÖZGEÇMİŞ
1. Adı Soyadı : Baha ŞEN
2. Doğum Tarihi : 20.05.1974
3. Unvanı : Yrd. Doç. Dr.
4. Öğrenim Durumu:
Derece Alan Üniversite Yıl
Lisans Elektronik-Bilgisayar Sist.Eğt. Gazi Üniversitesi 1996
Yüksek Lisans Bilgisayar Sistemleri Abd Gazi Üniversitesi FBE 1999
Doktora Bilgisayar Sistemleri Abd Gazi Üniversitesi FBE 2006
Doktora Tez Konusu : Üç Boyutlu Sanal Şehirler İçin Zeki Bir Platformun Sayısal Coğrafik Haritalar
Üzerinde Geliştirilmesi
Y.Lisans Tez Konusu : Yüksek Performanslı Dörtgensel Desen Haritalama Algoritmasının
Geliştirilmesi
5. Akademik Ünvanlar
Arş.Gör. Gazi Üniversitesi 1997 - 1999
Öğr. Gör. Ankara Üniversitesi 2002 - 2006
Öğr. Gör.Dr. Ankara Üniversitesi 2006 - 2008
Yrd. Doç.Dr. Karabük Üniversitesi 2008 -2012
Yrd .Doç.Dr. Yıldırım Beyazıt Üniversitesi 2012 -
6. Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri
6.1 Yüksek Lisans Tezleri
Nesrin AYDIN, “Grib Türü Meteorolojik Dosyalardan Elde Edilen Verilerin İstasyonel Verilerle
Verifikasyonu İçin Bir Uzman Sistem Geliştirilmesi”, 2010.
Oğuzhan MENEMENCİOĞLU, “ Kümeleme Metoduyla Sanal Sınıf Uygulamalarındaki Performans
Artışının Değerlendirilmesi”, 2011.
Serpil EROĞLU, “Kullanıcı Direktifli Rastgele Arazi Yüzeylerinin Kolay ve Hızlı Üretimi”, 2011.
Emrullah SONUÇ, “REGCM4 Bölgesel İklim Modeli Verilerinin Verifikasyonu”,2012.
Kemal AKYOL, “Biokimya Labaratuvar Test Sonuçlarının Logistic Regression Yöntemiyle Analizi”,
2012.
Fazıl AYDEMİR, “Ucuz Bilgisayar ve Tarayıcı Kullanılarak Verimli ve Kullanışlı Optik İşaret
Okumak”, 2012.
Alperen KETHUDAOĞLU, “Yapay Zeka Teknolojilerini Kullanarak Tanıtılan Figürlerin Hedef
Kitlelere Öğretimini Sağlayan Uzman Sistem”, 2012.
2
Kazım DURAKLAR, “Transformatör Performanslarının Gerçek Zamanlı Olarak Kullanıcı Arayüzü
Yazılımıyla İzlenmesi”, 2012.
İdris BUDAK, “Veri Madenciliği Teknikleri ile Bilgisayar Ağlarında Anomali Tespiti”, 2013.
Servet ÖZMEN, “Veri Madenciliği Yöntemleri ile Doğalgaz Sektöründe Regresyon Yöntemleriyle
Talep-Tüketim Analizi”,-Dönem Projesi (UzE), 2013.
6.2 Doktora Tezleri
Emine UÇAR, “Ortaöğretime Geçiş Sistemi (OGES) Yerleştirme Puanlarının Uzman Sistemleri ile
Tahmini”, 2013.
Musa PEKER, “EEG Sinyallerinden Otomatik Epileptik Nöbet Tespiti için Yeni Yaklaşımlar”, 2014.
Recep KILINÇ, “Grid Tipi Veriler Üzerinde Kullanıcı Tanımlı İşlem Yapabilen Dinamik Bir Modül
Tasarımı”, 2015.
Caner ÖZCAN, “Lokal Olmayan Ortalama Filtre İle Karmaşık Normlar Kullanılarak Gürültü
Giderme”, 2015.
Murat UÇAR, “Keratokunus Hastalığının Teşhisi için Yüksek Performanslı Bir Uzman Sistem
Geliştirilmesi”, 2016.
Ferhat ATASOY, “Kranyoplasti Uygulamaları İçin Medikal Görüntüler Üzerinde Esnek Kayıt İle
Birleştirilmiş Dağınık Veri Kestirimi”, (Devam Ediyor).
Emrullah SONUÇ, -İkinci Danışman-, “Benzetilmiş Tavlama Algoritmasının Grafik İşlemci Ünitesi
Kullanılarak Paralelleştirilmesi”, (Devam Ediyor).
7. Yayınlar
7.1 Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler (SCI,SCI-E,SOC,EI)
1. GÖKTAŞ H., ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., TOKTAŞ, İ., "The Use Of Artificial Neural
Networks In Simulation Of Mobile Ground Vehicles", Mathematical and Computational
Applications. Vol:12, No:2, pp:87-96, Manisa, TURKEY,2007.
2. GÖKTAŞ H. H., ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., "AUTOCITY : A System for Generating 3D
Virtual Cities for Simulation Systems on GIS Map", AutoSoft - Intelligent Automation and Soft
Computing, Vol.15, No:1, pp.29-39, USA, 2009.
3. TOPÇU S., ŞEN B., TÜRKEŞ M., ŞEN B., "Observed and projected changes in drought
conditions of Turkey",Options Mediterraneennes, CHIEAM, A no.95, p.123-127, 2010.
4. SEN B., TOPCU S, TURKES M, SEN B., WARNER JF.,"Projecting climate change, drought
conditions and crop productivity in Turkey",Climate Research(Interactions of Climate with
Organisms, Ecosystems, and Human Societies)/International and Multidisciplinary Journal
,ISSN:0936-577X, vol:52, p.175-191, DOI:10.3354/cr01074, 2012.
5. PEKER M., ŞEN B., "Expert system-based educational tool for practice lessons in a vocational
high school", Energy Education Science and Technology Part B: Social and Educational
Studies, Volume (issue) 4(4): 2165-2176, 2012.
6. ŞEN B., ÇAVUŞOĞLU A., GÖKTAŞ H.H., AYDIN N., “Population based procedural artificial
city generation using beta distribution”, Mathematical and Computational Applications, vol:17,
no:1, pp.9-17,Manisa, TURKEY, 2012.
7. ŞEN B., UÇAR E., DELEN D., “Predicting and Analyzing Secondary Education Placement-
Test Scores: A Data Mining Approach”, Expert Systems with Applications, vol:39, issue: 10,
pp.9468-9476, USA, 2012 (DOI : 10.1016/j.eswa.2012.02.112).
3
8. UÇAR E., ŞEN B., BAYIR Ş., "Placement score estimation of secondary education transition
system (SETS) using artificial neural networks", Energy Education Science and Technology
Part A: Energy Science and Research, Volume (issues) 30(1): 13-20, 2012.
9. ŞEN B., PEKER M., “Novel approaches for automated epileptic diagnosis using FCBF feature
selection and classification algorithms”, Turkish Journal of Electrical Engineering and
Computer Sciences, vol:21, pp.2092-2109, 2013, (DOI: 10.3906/elk-1203-9).
10. PEKER M., ŞEN B., KUMRU P.Y., “An efficient solving of the traveling salesman problem:
the ant colony system having parameters optimized by the taguchi method”, Turkish Journal of
Electrical Engineering and Computer Sciences, vol:21, pp.2015-2036, 2013, (DOI: 10.3906/elk-
1109-44).
11. ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., ÖZCAN C., GÖRGÜNOĞLU S., “Cropped Quad-Tree Based
Solid Objet Colouring With CUDA”, Mathematical and Computational Applications, Vol. 18,
No. 3, pp. 301-312, 2013.
12. PEKER M., ŞEN B., BUT A., “i-EEG: A Software Tool for EEG Feature Extraction, Feature
Selection and Classification”, GAU Applied Journals, vol:06 (10-05), pp.42-59, 2014.
13. ŞEN B., PEKER M., ÇAVUŞOĞLU A., ÇELEBİ F.V., "A comparative study on classification
of sleep stage based on EEG signals using feature selection and classification algorithms",
Journal of Medical Systems, vol:38(3), No:18, 2014. (#JOMS-D-13-00026R1; DOI:
10.1007/s10916-014-0018-0).
14. ŞEN B., KILIÇ R., ŞEN B., SONUÇ E., “Validation of a daily precipitation estimates of the
regional climate model RegCM4 over the domains in Turkey with NWP verification
techniques”, Fresenius Environmental Bulletin, Parlar Scientific Publications, vol.23-No 8a.,
pp. 1892-1903, 2014.
15. PEKER M., ŞEN B., DELEN D., “A Novel Method for Automated Diagnosis of Epilepsy using
Complex-Valued Classifiers”, IEEE International Journal of Biomedical and Health
Informatics, February 03, 2015 (10.1109/JBHI.2014.2387795).
16. PEKER M., ŞEN B., GÜRÜLER H., “Rapid Automated Classification of Anesthetic Depth
Levels using GPU Based Parallelization of Neural Networks”, Journal of Medical Systems,
39:18, 2015 (DOI 10.1007/s10916-015-0197-3).
17. PEKER M., ŞEN B., DELEN D., “Computer-Aided Diagnosis of Parkinson's Disease Using
Complex Valued Neural Networks and mRMR Feature Selection Algorithm”, The Journal Of
Healthcare Engineering, vol.6, no.3, p:281-302, 2015.
18. ÖZCAN C., ŞEN B., NAR F., "Sparsity Driven Despeckling for SAR Images”, IEEE
Geoscience and Remote Sensing Letters, December 2015 (accepted, Manuscript ID GRSL-
00761-2015, DOI 10.1109/LGRS.2015.2499445).
19. KAYA H., ÇAVUŞOĞLU A., ÇAKMAK H.B., ŞEN B., DELEN D., "Supporting The
Diagnosis Process and Processes After Treatment By Using Image Segmentation And Image
Simulation Techniques: Keratoconus Example", Journal of The Faculty of Enginnering and
Acrhitecture of Gazi University, 2015 (accepted).
20. AKYOL K., ŞEN B., BAYIR Ş., "Automatic Identification of Hard Exudates in Retinal Fundus
Images using Techniques of Information Retrieval", IJCA -International Journal of Computer
Applications, 2015 (doi: 10.5120/21286-4236).
21. AKYOL K., ŞEN B., BAYIR, Ş., ÇAKMAK, H.B., “Assessing the importance of features for
detection of hard exudates in retinal images”, Turkish Journal of Electrical Engineering and
Computer Sciences, 2016 (Available online: 13.04.2016, Last modified on 19.03.2016, DOI:
10.3906/elk-1508-71).
22. AKYOL K., ŞEN B., BAYIR, Ş., “Automatic detection of optic disc in retinal image by using
keypoint extraction, texture analysis and visual dictionary techniques ”, Computational and
4
Mathematical Methods in Medicine Volume 2016, 2016 (Article ID: 6814791,
http://dx.doi.org/10.1155/2016/6814791).
23. UÇAR M., ÇAKMAK H.B., ŞEN B., “A Novel Classification Approach for Detecting
Keratoconus”, IJO International Journal of Ophthalmology, 2016 (accepted).
7.2 Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan
bildiriler.
1. TOPCU S., ŞEN B., ŞEN B., "Impacts of Irrigation Projects on Local Climate in The
Southeastern Anatolia Project (GAP) Region in Turkey", International Symposium on Water
and Land Management for Sustainable Irrigated Agriculture, Adana, Turkey, 4-8 April,
2006.
2. GÖKTAŞ H.H., ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., "Algoritmic 3D Virtual City Production Using
Genetic Algorithms", The 5th International Symposium On Intelligent Manufacturing
Systems(IMS2006), May 29-31 2006, Sakarya, Turkey.
3. ŞEN B., TOPÇU S., ŞEN B., AYDIN A., "Analysis of Climate Trends in The Southeastern
Anatolia Projects (GAP) Region in Turkey", Sustainable Development and New
Technologies for Agricultural Production in GAP Region, Çukurova University,
Adana/Turkey, May 23-25, 2007.
4. TOPÇU S., ŞEN B., ŞEN B., ALTUNBEY H., "Climate Variability in The Cukurova Plain in
Turkey", Sustainable Development and New Technologies for Agricultural Production in
GAP Region, Çukurova University, Adana/Turkey, May 23-25, 2007.
5. ŞEN B., TOPÇU S., TÜRKEŞ M., ŞEN B., “Past and Future Drought Regimes in Turkey”,
Geophysical Research, Vol.12. EGU2010, EGU General Assembly, Vienna, Austria, 2-7 May
2010 (accepted and forthcoming in 2010).
6. AYDIN N., ATASOY F., ŞEN B., “Developing Web Based Content of Microcontroller Course
For Distance Education” , 10th. International Educational Technology
Conference&Exhibition, IETC2010, TURKEY, April 26-28, 2010.
7. UÇAR E., ŞEN.B., “Kurumsal Risk Değerlendirmesi”, 4th. International Information
Security&Cryptology Conference, ISC2010, TURKEY, 6-8 May 2010.
8. ŞEN B., AYDIN N., “A real-time Verification System Development Using Regional Climate
Model Results”, The 1st International Symposium on Computing in Science & Engineering
ISCSE 2010, Kusadası, Aydin, TURKEY, 3-5 June 2010.
9. ŞEN B., UÇAR E., “Placement Score Estimation of Secondary EducatIon TransItIon System
Using Expert Systems”, The 1st International Symposium on Computing in Science &
Engineering ISCSE 2010, Kusadası, Aydin, TURKEY, 3-5 June 2010.
10. AYDEMİR F., KAYA H., ŞEN B., “Web-Based Optical Reading System for Evaluation Of
Students Performances”, The 1st International Symposium on Computing in Science &
Engineering ISCSE 2010, Kusadası, Aydin, TURKEY, 3-5 June 2010.
11. ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., ATASOY F., “Developing A Terrain Sensetive Flexible Simulation
Platform For Mobile Vehicles”, The 1st International Symposium on Computing in Science
& Engineering ISCSE 2010, Kusadası, Aydin, TURKEY, 3-5 June 2010.
12. ŞEN B.,AYDIN N.,ŞEN B.,"A web-based expert verification system for Regional climate
models",Fifth ICTP Workshop on the Theory and Use of Regional
Climate,Trieste,ITALY,31 May-11 June,2010.
13. TOPÇU S., ŞEN B., ÖDEMİŞ B., ŞEN B., 2010. “Vulnerability Of Water Resources Under
Changing Climate Conditions In Upper Mesopotamia”, British Hydrological Society Third
International Symposium on “Role of Hydrology in Managing Consequences of a
5
Changing Global Environment, 19-23 July 2010, Newcastle (accepted and forthcoming in
2010).
14. TOPÇU S., ŞEN B., TÜRKEŞ M., ŞEN B., “Observed and Projected Changes in Drought
Conditions of Turkey”, The International Conference on Economics of Drought and
Drought Preparedness in the Mediterranean, 2-4 March 2010, Istanbul, Turkey. (Options
Mediterraneennes, CIHEAM in press).
15. PEKER M., ŞEN B., “Meslek Liselerinde Sistem Bakım ve Onarım Dersi İçin Performans
Artırımına Yönelik Bir Uzman Sistem Gerçekleştirimi”, 11th. International Educational
Technology Conference (IETC 2011), İstanbul-Turkey, May 25-27 2011.
16. GÖRGÜNOĞLU S., ALTAY Ş., ŞEN B., “Estimation of Dominant Motion Direction on Video
Sequences”, 2nd International Symposium on Computing in Science and Engineering
(ISCSE 2011), Kusadasi, Aydın Turkey, June 1-4 2011.
17. EROĞLU S., ŞEN B., GÖRGÜNOĞLU S., “A Real-Time Generation and Modification of GIS-
based Height Maps”, 2nd International Symposium on Computing in Science and
Engineering (ISCSE 2011), Kusadasi, Aydın Turkey, June 1-4 2011.
18. ŞEN B., ÇELİK A., “Support Vector Machines with the COIL-20 Image Library Classification
Practice”, 2nd International Symposium on Computing in Science and Engineering
(ISCSE 2011), Kusadasi, Aydın Turkey, June1-4 2011.
19. AKÇAY M., ŞEN B., ORAK İ.M. and ÇELİK A. , “Paralel Hesaplama ve CUDA”,
International Advanced Technology - IATS’2011, Elazig Turkey, May 26-28 2011.
20. PEKER M., ŞEN B., BAYIR S.; “Using Artificial Intelligence Techniques for Large Scale Set
Partitioning Problems”, First World Conference on Innovation and Computer Sciences
(INSODE 2011), Bahcesehir University, Istanbul – Turkey, 02-04 September 2011, doi :
10.1016/j.protcy.2012.02.010 .
21. AYDIN N., ŞEN B., SELÇUK B.; “Using Gaussian Jordan Elimination Method with Cuda for
Linear Circuit Equation System”, First World Conference on Innovation and Computer
Sciences (INSODE 2011), Bahcesehir University, 02-04 September 2011, Istanbul – Turkey,
doi: 10.1016/j.protcy.2012.02.008
22. ÖZCAN C., ŞEN B., “Investigation of the performance of LU decomposition method using
CUDA”, First World Conference on Innovation and Computer Sciences (INSODE 2011),
Bahcesehir University, Istanbul – Turkey, 02-04 September 2011, doi:
10.1016/j.protcy.2012.02.011.
23. SONUÇ E., ŞEN B., ŞEN B., “Verifying Regional Climate Model Results With Web-Based
Expert-System”, First World Conference on Innovation and Computer Sciences (INSODE
2011), Bahcesehir University, Istanbul – Turkey, 02-04 September 2011,
doi:10.1016/j.protcy.2012.02.007.
24. GÖRGÜNOĞLU S., PEKER M., ŞEN B., ÇAVUŞOĞLU A., “An Efficient Pseudo
Microprocessor for Engineering Education”, First World Conference on Innovation and
Computer Sciences (INSODE 2011), Bahcesehir University, Istanbul – Turkey, 02-04
September 2011, doi:10.1016/j.protcy.2012.02.009.
25. ŞEN B., ÖZCAN C., AYDIN N., “An Implementation for Quad-Tree Based Solid Object
Coloring Using CUDA”, 2nd World Conference on Information Technology (WCIT-2011),
Antalya-Turkey, 24-27 Nov 2011.
26. ŞEN B., AYDIN N., ÖZCAN C., “Performance Comparison of Gauss-Jordan Elimination
Method Using OpenMP and CUDA”, 2nd World Conference on Information Technology
(WCIT-2011), Antalya-Turkey, 24-27 Nov 2011.
6
27. KAYA H., ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., UÇAR M., “Estimating School Dropout Rates at The
Secondary Education Level Using Data Mining Methods”, 2nd World Conference on
Information Technology (WCIT-2011), Antalya-Turkey, 24-27 Nov 2011.
28. MENEMENCİOĞLU O., ŞEN B., ATASOY F., SONUÇ E., “LMS (Moodle) Automatic
Enrollment Approach by Flat File with Student Information System Data”, 2nd World
Conference on Information Technology (WCIT-2011), Antalya-Turkey, 24-27 Nov 2011.
29. ATASOY F., AYDIN N., ŞEN B., BAYIR Ş., “Developing Low Cost Server Room Monitoring
and Control Device”, 2nd World Conference on Information Technology (WCIT-2011),
Antalya-Turkey, 24-27 Nov 2011.
30. ŞEN B., ŞEN B., SONUÇ E., TOPÇU S., KRICHAK S.O., KILINC R., “Assessing the
capturing capacity of RegCM4 for the precipitation over Med-CORDEX using boundary data
with higher resolution and improved accuracy”, 6th ICTP Workshop on The Theory and Use
Of REGional Climate Models, Trieste-Italy, 7-18 May 2012.
31. ÇAVUŞOĞLU A., ÇELEBİ F., ŞEN B., ATASOY F., MENEMENCİOĞLU O., “An
Integrated e-Learning System for Engineering Education”, IEEC 2012- 2nd International
Engineering Education Conference, Antalya-Turkey, 4-6 Nov 2012.
32. AKYOL K., ÇALIK E., ŞEN B., “Analyses of Factors Creating Coronary Artery Disease
Susceptibility”, 3rd World Conference on Information Technology (WCIT-2012),
Barcelona, Spain, 14-16 Nov. 2012.
33. ŞEN B., UYSAL M., ÇELİK C., “Hidden Surface Removal Using BSP Tree with CUDA”, 3rd
World Conference on Information Technology (WCIT-2012), Barcelona, Spain, 14-16 Nov.
2012.
34. PEKER M., ŞEN B., “A New Complex-Valued Intelligent System for Automated Epilepsy
Diagnosis Using EEG Signals”, 3rd World Conference on Information Technology (WCIT-
2012), Barcelona, Spain, 14-16 Nov. 2012.
35. ŞEN B., PEKER M., "An efficient approach based on mrMR feature selection and decision tree
for automatic sleep stage scoring", 3rd World Conference on Innovation and Computer
Science, Antalya, Turkey, 23-28 April 2013.
36. KAYA H., ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., ÇALIK E., "Disaster Management and Disaster
Preparedness:xamples of Practices in California and Turkey", ISTEC'13 International Science
and Technology Conferences, Sakarya University &Suny University & TASET, Rome,
Italy, 18-20 July 2013.
37. ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., UÇAR E., UÇAR M., “Analysing The Success Of Level
Determination Exam According To The School Type And Lesson Type That Is Represented By
Questions In The Exam”, 13th International Educational Technology Conference, Sakarya
University&University of Malaya, Kuala Lumpur, Malaysia, 13-15 May 2013
38. ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., ÖZCAN C., GÖRGÜNOĞLU S., "Cropped Quad-Tree Based
Solid Object Colouring with CUDA", 4th International Conference on Mathematical and
Computational Applications, Manisa – TURKEY, 11-13 June 2013,.
39. ÇALIK E., KAYA H., ÇAVUŞOĞLU A., AKKUŞ S., ŞEN B., “Disaster Readiness of Hospital
Information Systems: A Case Study from a Turkish University Hospital”, ISTURKEY’13 -
International Conference on Information Security and Cryptology 2013, Ankara-
TURKEY, 20-21 September 2013.
40. ŞEN B., PEKER M., BUT A., “i-EEG: A Software Tool for EEG Feature Extraction, Feature
Selection and Classification”, International Symposium on Engineering Artificial
Intelligence & Applications, Girne American University, NORTH CYPRUS, 6-8 November
2013.
7
41. UÇAR M., ŞEN B., “A Novel Classification Approach for Detecting Keratoconus Disease with
Intelligent Systems”, 8th International Conference on Electrical and Electronics
Engineering, ELECO 2013, Bursa-TURKEY, 28-30 November 2013.
(10.1109/ELECO.2013.6713897)
42. AKYOL K., ŞEN B., GÖRGÜNOĞLU S., “Prioritization of Graduate Education Courses with
Analytic Hierarchy Process”, 4th World Conference on Information Technology - WCIT-
2013, Maison N.-D. Chat d'Oiseau Brusells, BELGIUM, 26-28 November 2013.
43. AKYOL K., ÇALIK E., ŞEN B., ÇALIKOĞLU D., “The Importance of Univariate Logistic
Regression Analysis in Logistic Regression Analysis”, 4th World Conference on Information
Technology - WCIT-2013, Maison N.-D. Chat d'Oiseau Brusells, BELGIUM, 26-28
November 2013.
44. PEKER M, ŞEN B., DELEN D., "Classification of Parkinson's Disease Using Complex-Valued
Neural Networks", Global Conference on Healthcare Systems Engineeirng (GCHSE) 2014,
İstanbul Technical Unviersity, İstanbul, TURKEY, 5-8 August 2014.
45. KAYA H., ÇAVUŞOĞLU A., ÇAKMAK H.B., ŞEN B., DELEN D., "Determining The Correct
Diagnosis and Appropriate Treatment Method on Keratoconus: A3-D Decision Support
Application", Global Conference on Healthcare Systems Engineeirng (GCHSE) 2014,
İstanbul Technical Unviersity, İstanbul, TURKEY, 5-8 August 2014.
46. KAYA H., ÇAVUŞOĞLU A., ÇAKMAK H.B., ŞEN B., ÇALIK E., "Keratoconus Disease and
Three-Dimensional Simulation of the Cornea throughout the Process of Cross-Linking
Treatment", BIOCOMP'14 - The 2014 International Conference on Bioinformatics &
Computational Biology, Las Vegas, USA, July 21-24, 2014.
47. ÖZCAN C., ŞEN B., NAR F., “GPU Efficient SAR Image Despeckling Using Mixed Norms”,
Proc.SPIE 9247, High-Performance Computing in Remote Sensing IV, Amsterdam
Netherlands (92470D October 15, 2014, doi : 10.1117/12.2067074), September 22, 2014.
48. AKYOL K., BAYIR Ş., ÇALIK E., ŞEN B., ÇAVUŞOĞLU A., "Analysis of Demographic
Characteristics Creating Coronary Artery Disease Susceptibility using Random Forests
Classifier", International Conference on Soft Computing and Software Engineering
(SCSE'15), California at Berkeley (UC Berkeley), Sutardja Dai Hall, USA from March 5-6,
2015.
49. AKYOL K., KAYA H., ŞEN B., BAYIR Ş., "Automated Detection of Optic Disk in Retinal
Fundus Images using Gabor Filter Kernels”, 5th World Conference on Innovation and
Computer (INSODE-2015), Antalya, Turkey 14-16, May 2015.
50. ÇALIK E., KAYA H., AKYOL K., ŞEN B., ÇELEBİ F.V., ATİLLA R., "The Medical Module
For Disaster Information Systems", Third International Conference on Advances in
Computing, Communication and Information Technology (CCIT 2015), 26-27 May 2015,
Birmingham, UK.
51. YAYLA R., ŞEN B., "Observing Of The Euro Sales Changes By The Exchange Rate Changes
Based On Monte Carlo Simulation Method With Cuda", 3rd International Symposium on
Innovative Technologies in Engineering and Science (ISITES 2015), Valencia, Spain, 3-5
June 2015.
52. ARSLAN A., ŞEN B., PEKER M., "A Comparison of Different Classification Algorithms For
Determining The Depth of Anesthesia Level on A New Set of Attributes", IEEE International
Symposium on Innovations in Intelligent Systems and Applications (INISTA 2015),
Madrid, Spain, 2-4 September, 2015.
53. PEKER M., ARSLAN A, ŞEN B., ÇELEBİ F.V., BUT ABDÜLKADİR, “"A Novel Hybrid
Method for Determining the Depth of Anesthesia Level: Combining ReliefF Feature Selection
and Random Forest Algorithm (ReliefF+RF)", IEEE International Symposium on
8
Innovations in Intelligent Systems and Applications (INISTA 2015), Madrid, Spain, 2-4
September, 2015.
54. ÖZCAN C., ŞEN B., NAR F., “CPU and GPU Parallelization of Sparsity Driven Despeckling
in SAR Images”, IRSC’16 International Remote Sensing Conference, Riyadh, Saudi Arabia,
January 17-20th, 2016 .
55. ÇALIK E., ATİLLA R., DİCLE O., KAYA H., ŞEN B., ÇELEBİ F.V., “An Approach for
Information Systems in Disaster: The Medical Module Development”, International
Symposium on Natural Hazards and Hazard Management 2016, Karabuk University,
Turkey, March 2-4, 2016.
7.3 Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler
1. KAYA H.,ÇAVUŞOĞLU A., CAKMAK H.B., ŞEN B., ÇALIK E., "Keratoconus Disease and
Three-Dimensional Simulation of the Cornea Throughout The Process Of Cross-Linking
Treatment", Emerging Trends in Computational Biology, Bioinformatics, and Systems
Biology - Algorithms and Software Tools, Elsevier/MK, pp.561-576, ISBN: 978-0-12-802508-
6, 2015.
7.4 Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler
1. ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B.,"A Cellular Positioninig and Neighborhood Determination System
For Shared Agricultural Machine Usage"; Teknoloji/Z.K.Ü. Karabük Teknik Eğitim Fakültesi
Dergisi, 7(1-2):235-239, 2004.
2. GÖKTAŞ H.H., ÇAVUŞOĞLU A., ŞEN B., GÖRGÜNOĞLU S., "Simülasyon Sistemleri İçin
3 Boyutlu Sanal Şehirlerin GIS Haritaları Üzerinde Oluşturulması", Teknoloji/Z.K.Ü. Karabük
Teknik Eğitim Fakültesi Dergisi, 9(1); 27-38; 2006.
3. NUMANOĞLU G., ŞEN B., "Bilgisayar ve Öğretim Teknolojileri Eğitimi Bölümü
Öğrencilerinin Öğrenme Stilleri", Ahi Evran Üniversitesi Kırşehir Eğitim Fakültesi Dergisi,
Sayı(2), Cilt(8), s(129-148), 2007.
4. AKYOL K., ŞEN B., BAYIR, Ş., “Detection of Hard Exudates in Diabetic Retinopathy Retinal
Images by Utilizing Visual Dictionary and Classifier Approaches”, Mugla Journal of Science
and Technology, 2016 (review).
7.5 Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler
1. TÜZÜN A.Mekin, YENİGÜN Ruhsar, MUTLU Nusret, BÖLÜKOĞLU Prof.Dr. Halil, ŞEN
Baha, PEKCAN İbrahim, "Bilgisayar Destekli Sulama ve Ortak Makina Kullanımı Yönetimi"
Bildiri, K.Maraş.S.İ.Ünv.Tarımda Bilişim Sistemlerinin Kullanımı Sempozyumu, s(7),
03/08/2001.
2. NUMANOĞLU G., ŞEN B., "Bilgisayar ve Öğretim Teknolojileri Eğitimi Bölümü
Öğrencilerinin Öğrenme Stilleri", 15. Ulusal Eğitim Bilimleri Kongresi, Muğla Üniversitesi
13-15 Eylül 2006, Muğla, Türkiye.
3. ŞEN B., ÖZCAN C., "Karabük Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Bilgisayar Mühendisliği
Bölümü Lisans/Y.Lisans/Doktora Programlarının Tanıtımı", Elektrik Elektronik Bilgisayar
Biyomedikal Mühendislikleri Eğitimi 4. Ulusal Sempozyumu, Eskişehir, 22-24 Ekim 2009.
4. ŞEN B., ATASOY F., AYDIN N., “Düşük Maliyetli Web Tabanlı Uzaktan Eğitim Sistemi
Uygulaması”, AB’2010 Akademik Bilişim Konferansları Muğla Üniversitesi,
Muğla/TÜRKİYE, 10-12 Şubat 2010
9
5. YILMAZ E., ÖZER M., ŞEN B., “Stokastik Ölçeksiz Nöral Ağda Eşik-altı Uyartımın
Kodlanması”, IEEE 18. Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları Kurultayı, Diyarbakır, 22-24
Nisan 2010.
6. ŞEN B., MENEMENCIOGLU O., ATASOY F., OZCAN C., “Kümelenmiş Sanal Sınıf
Uygulaması”, AB’2011 Akademik Bilişim Konferansları, Malatya-Türkiye, 2-4 Şubat 2011.
7. PEKER M., KUMRU P.Y., ŞEN B., “Rota Planlama Problemleri İçin Taguchi Yöntemi ve
Karınca Koloni Sistemi Tabanlı Bir Yaklaşım”, 31. Ulusal Yöneylem Araştırması ve Endüstri
Mühendisliği Kongresi, YAEM’11, Sakarya-Türkiye, 5-7 Temmuz 2011.
8. KETHUDAOĞLU A., ŞEN B., “Sayısal Kalem (Digital Pen) ile Gerçekleştirilen Çizimlerde
GiriĢ Verisindeki Hataların Azaltılması”, AB’2012 Akademik Bilişim Konferansları, Uşak-
TÜRKİYE, 1-3 Şubat 2012.
9. AKYOL K., ŞEN B., ÇALIK E., “Biyokimya ve Hemogram Laboratuvar Test Sonuçlarının
Lojistik Regresyon Yöntemiyle Analizi”, AB’2012 Akademik Bilişim Konferansları, Uşak-
TÜRKİYE, 1-3 Şubat 2012.
10. TOPÇU S., ŞEN B., TÜRKEŞ M., ŞEN B., “Türkiye de İklim Değişikliği ve Olası Etkileri”, II.
Ulusal Sulama ve Tarımsal Yapılar Sempozyumu, Ege Üniversitesi, Bornova-İzmir, 24-25
Mayıs 2012.
11. PEKER M., ŞEN B., “CuEEG: EEG Verilerinin Hızlı İşlenmesi için GPU Tabanlı Bir
Yaklaşım”, ELECO 2012, Bursa, 29 Kasım-1Aralık 2012.
12. BUDAK İ., ŞEN B., YILDIRIM M.Z., “Lojistik Regresyon İle Bilgisayar Ağlarında Anomali
Tespiti”, AB2013 Akademik Bilişim Konferansları, Antalya-TÜRKİYE, 23-25 Ocak 2013.
13. ÖZMEN S., ŞEN B., “Veri Madenciliğinde Regresyon Yöntemleri İle Doğalgaz Sektöründe
Talep-Tüketim Analizi”, AB’2013 Akademik Bilişim Konferansları, Antalya-TÜRKİYE, 23-
25 Ocak 2013.
14. DURAKLAR K., ŞEN B., ATASOY F., “Enerji Üretimi İçin Kullanılan Bir Egzersiz Bisikleti
İçin Fiziksel Aktivite Monitörü Tasarlanması”, AB’2013 Akademik Bilişim Konferansları,
Antalya-TÜRKİYE, 23-25 Ocak 2013.
15. ŞEN B., KILINÇ R., ŞEN B., SONUÇ E. “Niğde Yöresi İçin RegCM4 Modeli Yağış
Verifikasyonu”, İç Anadolu Bölgesi 1. Tarım Ve Gıda Kongresi, Niğde-TÜRKİYE, 2-4 Ekim
2013.
16. ŞEN B., BAYAZİT Y., ŞEN B., KANIT E.G., “Niğde İli Hidrometeorolojik Verilerinin İklim
Değişebilirliği Açısından Analizi”,İç Anadolu Bölgesi 1. Tarım Ve Gıda Kongresi, Niğde-
TÜRKİYE, 2-4 Ekim 2013.
17. AKYOL K.., ŞEN B., ORAK Muharrem İ.., “Bir Veritabanı Tasarımı ve Web Uygulaması”,
AB’2014 Akademik Bilişim Konferansları, Mersin-TÜRKİYE, 1-4 Şubat 2014.
18. TEKİN N.O., ÇELEBİ F.V., ÇALIK E., ŞEN B., ORAK İ.O., “Coğrafi Bilgi Sistemi Tabanlı
e-Triaj Sistemi”, AB’2014 Akademik Bilişim Konferansları, Mersin-TÜRKİYE, 1-4 Şubat
2014.
19. ÖZCAN C., ŞEN B., NAR F., "Hızlık Öznitelik Korumalı Benek Gürültü Azaltma", IEEE
22.Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları (SİU 2014) Kurultayı, Karadeniz Teknik
Üniversitesi, Trabzon TÜRKİYE, 23-25 Nisan 2014.
20. ATASOY F., ŞEN B., NAR F., FERAT M., "Kranyoplasti Uygulamaları için Medikal
Görüntüler Üzerinde Dağınık Veri Kestirimi", EEE 22.Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları
(SİU 2014) Kurultayı, Karadeniz Teknik Üniversitesi, Trabzon TÜRKİYE, 23-25 Nisan 2014.
21. AKYOL K., BAYIR Ş., ŞEN B., "Demografik Özelliklerin Koroner Arter Hastalığına Etkisinin
Analizi", AB’2015 Akademik Bilişim Konferansları, Anadolu Üniversitesi, Eskişehir-
TÜRKİYE, 4-6 Şubat 2015.
10
22. SONUÇ E., ŞEN B., BAYIR Ş., "Gezgin Satıcı Probleminin Benzetilmiş Tavlama Yöntemiyle
Çözümünde Paralel Hesaplamanın Kullanılması", AB’2015 Akademik Bilişim Konferansları,
Anadolu Üniversitesi, Eskişehir-TÜRKİYE, 4-6 Şubat 2015.
23. ÖZCAN Ö., ŞEN B., NAR F., "SAR Görüntülerde Karmaşık Norm Kullanarak Gürültü
Azaltımı İçin Erken Çıkış Eniyilemesi", IEEE 23.Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları (SİU
2015) Kurultayı, İnönü Üniversitesi, Malatya, TÜRKİYE, 16-19 Mayıs 2015.
24. ARSLAN A., ŞEN B., "Kodlanamayan RNA’ların Optimize Edilmiş Destek Vektör Makinaları
ile Tespiti", IEEE 23.Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları (SİU 2015) Kurultayı, İnönü
Üniversitesi, Malatya, TÜRKİYE, 16-19 Mayıs 2015.
25. AKYOL K., BAYIR Ş., ŞEN B., "Gabor Özellikleri ve Görsel Sözlük Kullanarak Retinal
Görüntülerdeki Sert Eksudaların Tespiti", AB’2016 Akademik Bilişim Konferansları, Adnan
Menderes Üniversitesi, Aydın-TÜRKİYE, 30 Ocak-5 Şubat 2016.
26. AKYOL K., ŞEN B., BAYIR Ş., "Retinal Görüntülerdeki Mikroanevrizmaların ve
Hemorajilerin Tespiti", AB’2016 Akademik Bilişim Konferansları, Adnan Menderes
Üniversitesi, Aydın-TÜRKİYE, 30 Ocak-5 Şubat 2016.
27. ARSLAN A., ŞEN B., ÇELEBİ F.V., SERTBAŞ S., “Automatic Segmentation of Region of
Interest for Dry Eye Disease Diagnosis System”, IEEE 24.Sinyal İşleme ve İletişim
Uygulamaları (SİU 2016) Kurultayı, Bülent Ecevit Üniversitesi, Zonguldak, TÜRKİYE, 16-19
Mayıs 2016.
28. ATASOY F., ŞEN B., NAR F., ÖZCAN C., BOZKURT İ., “Total Variation Based 3d Skull
Segmentation”, IEEE 24.Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları (SİU 2016) Kurultayı, Bülent
Ecevit Üniversitesi, Zonguldak, TÜRKİYE, 16-19 Mayıs 2016.
29. ÖZCAN C., ŞEN B., NAR F., “Düşük Hafıza Kullanımlı Seyreklik-güdümlü Benek Gürültü
Azaltma Yöntemi”, IEEE 24.Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları (SİU 2016) Kurultayı,
Bülent Ecevit Üniversitesi, Zonguldak, TÜRKİYE, 16-19 Mayıs 2016.
7.6 Diğer yayınlar
Ortak Makina Kullanımı Pilot Uygulama Projesi Final Raporu, Anonim, OMAK-Sistem
Yazılım Danışmanlığı), GAP Bölge Kalkınma İdaresi Başkanlığı, Ankara, 2001.
8. Projeleri
“Elektronik ve Bilgisayar Teknolojilerindeki Gelişmeler”; A.B. Leonardo Da Vinci Projesi
(TR/04/A/F/EX1-025), Leipzig/Almanya’da 01-21/02/2005.
“Akıllı Trafik Eğitimi Simülatörü Için 3 Boyutlu Veritabanı Üretilmesi” . Proje Kodu : 07/2003-
45, Gazi Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Projesi, Çavuşoğlu A., Şen B., Vural M., 07/2003-
01/2006.
“Sürücü Adayları İçin Akıllı Sanal Sürüş Eğitimi Platformunun Geliştirilmesi”, DPT Projesi,
Çavuşoğlu A., Şen B., Vural M., 2006.
“Kullanıcı Direktifli Rastgele Arazi Yüzeylerinin Kolay ve Hızlı Üretimi”, KBÜ-BAP-C-11-Y
017, KBÜ BAP Projesi, 2011-2012.
“RegCM4 Bölgesel İklim Modeli Verilerinin Verifikasyonu”, KBÜ-BAP-C-11-Y 016, KBÜ
BAP Projesi, 2011-2012.
“Grid Verilerde Kullanıcı Tanımlı Fonksiyonları Gerçekleştiren Dinamik Modül Tasarımı”,
KBÜ-BAP-C-11-D005, KBÜ BAP Projesi, 2011-2012.
11
ERASMUS, Tallin University of Technology, Department Of Electronics, 02-07/05/2011.
SANTEZ , 1318.STZ.2012-1, “e-Triage Karar Destek Sistemi Yazılımı”,(Yardımcı
Araştırmacı), Bütçe: 152.940,57 TL, 15/09/2012-15/04/2014.
YBÜ-BAP-587, “Kranyoplasti Uygulamaları İçin Medikal Görüntü Tamamlama”, (Proje
Yürütücüsü”, Bütçe:37.654,00 TL, 14/08/2013-17/09/2015.
YBÜ-BAP-590, “Görüntüler Üzerindeki Gürültüyü Gidermede Hibrit Yöntem Geliştirilmesi”,
(Proje Yürütücüsü), Bütçe:34.100,00 TL, 14/08/2013-31/08/2015.
SANTEZ, 0477.STZ.2013-2, “Keratokonus Hastalığının Teşhisi ve Çapraz Bağlama
Operasyonu Sonrası Korneanın 3 Boyutlu Benzetimi”, (Proje Yürütücüsü), Bütçe : 158.901,04
TL, 01/04/2014- (Devam ediyor).
9. İdari Görevler
11.12.2009-31.12.2011 KBÜ Mühendislik Fak.Bilgisayar Donanımı Anabilim Dalı Başkanı
15.01.2010-31.12.2011 KBÜ Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi Yönetim
Kurulu Üyesi.
18.01.2010-31.12.2011 KBÜ Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi Md.Yrd.
31.01.2011-31.12.2011 KBÜ Müh.Fak.Bilg.Müh.Bölüm Bşk.
08.04.2013-19.02.2014 YBÜ Bilgi İşlem Dairesi Bşk. V.
30.12.2013-19.02.2014 YBÜ Uzaktan Eğitim Merkezi Müdürü V.
19.02.2014-21.07.2015 TÜBİTAK-Başkanlık, Bilişim Müdürü V.
21.07.2015- TÜBİTAK-Başkanlık, Bilgi İşlem Dairesi Başkanı V.
10. Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler
ULAKBİM, Ulusal-Grid Çalıştay Üyesi., 09/2005 –
TUBİTAK, ARBIS Üyesi, 2006 –
IEEE (2011- )
IEEE Computer Society (2011- )
11. Ödüller
TÜBİTAK Yayın Teşvik (UBYT) 208831, 2009 (SCI-C Class).
TÜBİTAK Yayın Teşvik (UBYT) 272812, 2012 (SCI-B Class).
TÜBİTAK Yayın Teşvik (UBYT) 275937, 2012 (SCI-A Class).
TÜBİTAK Yayın Teşvik (UBYT) 280598, 2012 (SOC-C Class).
TÜBİTAK Yayın Teşvik (UBYT) 306487, 2013 (SCI-C Class).
YBU Yayın Teşvik, No:1130, 2014 (SCI-A Class).
12. Son iki yılda verdiğiniz lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler
Akademik Yıl Dönem Dersin Adı Haftalık Saati Öğrenci
Sayısı Teorik Uygulama
2014-2015 Güz CENG550-Advanced GPU Computing with
CUDA (Ph.D.) 3 0 5
12
Akademik Yıl Dönem Dersin Adı Haftalık Saati Öğrenci
Sayısı Teorik Uygulama
CENG550-Advanced GPU Computing with
CUDA M.Sc..) 3 0 6
CENG800-Master’s Thesis I 0 0 2
CENG890-Seminar (Ph.D.) 3 0 3
CENG890-Seminar (M.Sc.) 3 0 2
80196-Special Studies (Ph.D.) 8 0 5
80196-Special Studies (M.Sc.) 8 0 4
2013-2014 Bahar
CENG506-Advanced Data Mining (Ph.D.) 3 0 5
CENG506-Advanced Data Mining (M.Sc.) 3 0 5
CENG500-Seminar (M.Sc.) 3 0 3
80196-Special Studies (M.Sc.) 0 0 4
80196-Special Studies (Ph.D.) 0 0 4
2013-2014 Güz
CENG103- Computer Programming I
(Lisans I.Ögrt.) 3 2 45
CENG103- Computer Programming I
(Lisans II.Ogrt) 3 2 43
CENG550-Advanced GPU Compıting
with CUDA (Ph.D) 3 0 3
CENG550-Advanced GPU Compıting
with CUDA (M.Sc.) 3 0 2
80196-Special Studies (Ph.D.) 0 0 1
80196-Special Studies (M.Sc.) 0 0 2
13. Çalıştaylar
“Raylı Sistemler ve Teknolojileri (JİVET) Çalıştayı”, TCDD, Akçay, Balıkesir, TÜRKİYE,
10-14 Mayıs 2010.
“Uzaktan Eğitimde Karşılaşılan Sorunlar Çalıştayı”, 19 Mayıs Üniversitesi, 12-13 Temmuz
2010, Samsun, TÜRKİYE.
PARDUS Çalıştayı, 25 Haziran 2014, Ankara, TÜRKİYE.
“Eğiticilerin Eğitimi, ANKÜSEM, 18-19 Ocak 2016.
14. Toplantılar
.“TURCom 2010 Digital Kampüs”, TURCom Teknoloji, Silivri, İSTANBUL, 17-18 Nisan
2010.
“1. Üniversite Yöneticiler Zirvesi”, ORACLE, Kemer, Antalya, TÜRKİYE, 7-8 Mayıs 2010.
“Bilgisayar Mühendisliği Bölüm Başkanları Toplantısı”, Süleyman Demirel Üniversitesi,
Isparta, TÜRKİYE, 20-22 Ekim 2011.
“Apple Leadership Tour”, Apple in Education, Ankara, 27 Haziran 2012.
“NETCOM-IPv6’ya geçiş ve IT Management”, NETCOM Akademi Zirve (N.A.Z.4) ,
Antalya, 19-22 Ocak 2013.
15. Konferans, Sempozyum, Dergi, Proje Hakemlikleri
OAM-RC, Optoelectronics and Advanced Materials – Rapid Communications, 2012.
13
ELECO 2010, 2011, 2012, 2013, 2014.
INISTA 2010,2011.
ASYU 2012.
SIU 2013, 2014, 2015.
TEYDEB Proje Hakemliği, 2008, 2010, 2011, 2012, 2013, 2014.
Turkish Journal of Electrical Engineering & Computer Sciences, 2010, 2011, 2012,2015.
IJARED (International Journal Of Engineering Research and Development), 2010
Computer and Education (Elseveir Publications) 2011, 2012.
Applied Soft Computing (Elsevier Publications) 2014, 2015.
Mathematical & Computational Applications 2013, 2104.
Computers in Biology and Medicine (Elsevier Publications), 2014.
Computer Methods and Programs in Biomedicine, 2015.
Biomedical Engineering/Biomedizinische Technik, 2015.
WCIT 2011, 2012.
TURJAF / Turkish Journal of Agriculture - Food Science and Technology, 2014.
SIVP / Signal, Image and Video Processing, 2014, 2015
Artificial Intelligence Review (AIRE), 2015.
International Journal of Information Security Science, 2013.
3rd World Conference On Innovatıon And Computer Scıences - INSODE-2013.
Sanayi Bakanlığı Teknogirişim Paneli, 2012, 2013, 2014, 2015.
Sanayi Bakanlığı Ar-Ge Merkezleri Denetleme Hakemliği, 2012, 2013
KOSGEB, Proje İzleyici, 2012, 2013, 2014, 2015.
16. İş Tecrübeleri
Haziran 2001 – Mayıs 2002, HAVELSAN A.Ş.(Yazılım Mühendisi), Ankara
Temmuz 2000- Haziran 2001, Logo Business Solutions (Yazılım Mühendisi), İstanbul
Eylül 1999 – Temmuz 2000, Milli Savunma Bakanlığı, Proje Subayı (Tnk.Tğm.), Ankara
Mart 1998 – Mayıs 2000, TEMAV (Bilgisayar Uzmanı), Ankara
