Upload
dag-endresen
View
115
Download
1
Tags:
Embed Size (px)
DESCRIPTION
Crowdsourcing portal for transcription of label information from images of the specimens in the natural history collections in Norway, http://gbif.no/transcribe
Citation preview
Antall&samlings+objekter&i&de&naturhistoriske&museer&og&universitets+samlinger&rundt&om&i&verden&er&omkring&2"#l"3"milliarder&prøver&(Ariño&2010;&Duckworth&et#al.&1993).&&Disse&samlinger&gir&oss&et&helt&unikt&innblikk&El&biologiske&og&økologiske&prosesser&over&Ed&og&sted.&Samlingene&gir&en&effek#v"og"kostnadseffek#v"mekanisme"for&å&studere&biologisk&mangfold&og&artsdiversitet&i&naturen.&
Photo:&Botany&CollecEon,&Algae,&Smithsonian&NaEonal&Museum&of&Natural&History&Museum,&by&Chip&Clark.&
Den&største&uRordringen&for&effekEv&utnyTelse&av&disse&samlingene&er&mangelfull"#lgang"#l"elektronisk"informasjon"om"objektene"som&er&arkivert&(Berendsohn&et#al.&2010).&&Global&Biodiversity&InformaEon&Facility&(GBIF)&er&en&verdensomspennende&organisasjon&som&arbeider&for&fri&og&åpen&Elgang&El&informasjon&om&biodiversitet&og&biologiske&samlinger&fra&hele&verden.&hTp://www.gbif.org&&
Photo:&Ornithology&CollecEon,&Smithsonian&NaEonal&Museum&of&Natural&History&Museum,&by&Chip&Clark.&
Naturhistoriske&samlinger&utgjør&en&helt&eksepsjonell&ressurs&–&når#de#er#digitalisert#og#gjort#offentlig#0lgjengelig.&&Naturforskere&kan&studere&historiske&prøver&og&deres&egenskaper&fra&individer&som&er&arkivert&sammen&med&fundamental&informasjon&om:&&
&Hva"–"Hvor"–"Når""De&arkiverte&fysiske&prøvene&gir&dagens&forskere&Elgang&El&DNA&fra&individer&som&ble&samlet&for&flere&hundre&år&siden&–&noen#ganger#0l1og1med#fra#før#Linne#(170711778).&
IllustraEon&from&Parkes,&K.&C.&(1963)&
9&%&
29%&
45%&
8%&
9%&
Museumsobjekter"(≈"8,5"millioner)"
Vertebrater&
Planter&
insekter&
Invertebrater&
Sopp&
11&%&
47%&
26%&
6%& 10%&
Digitaliserte"objekter"(≈"65%)"
Vertebrater&
Planter&
insekter&
Invertebrater&
Sopp&
2%&
15%&
44%&
20%&
19%&
Antall"arter"i"Norge"(≈"42"000)"
Vertebrater&
Planter&
insekter&
Invertebrater&
Sopp&
4%&
69%&
13%&
0%& 14%&
GBIF"(≈"2,4"millioner"museumsobjekter)"
Vertebrater&
Planter&
insekter&
Invertebrater&
Sopp&
Lysbilde&laget&av&Eirik&Rindal&(NHM+UiO)&
≈&8,5&mill&objekter&i&Norges&naturhistoriske&samlinger&
Sopp:&640&000&
Karplanter:&2,2&millioner&
Virveldyr:&&&670&000&
Virvelløse&dyr:&&&600&000&
Insekter:&&&3,4&millioner&
Foto:&Karsten&Sund&(NHM+UiO);&lysbilde&laget&av&Eirik&Rindal&(NHM+UiO)&
Paleontologi:&&&900&000&
Digitalisering&av&objekter&Sopp:&640&000&
Karplanter:&&2,2&millioner&
Virveldyr:&670&000&
Virvelløse&dyr:&600&000&
Insekter:&3,4&millioner&
Foto:&Karsten&Sund&(NHM+UiO);&lysbilde&laget&av&Eirik&Rindal&(NHM+UiO)&
Paleontologi:&&&900&000&&&&&&
Registrering&av&eEkeinformasjon&
Photo:&Smithsonian&NaEonal&Museum&of&Natural&History,&USNM+445024+Eutoxeres+aquila&
Catalog&number:&O+L+000014&&&&&&&hTp://purl.org/nhmuio/id/41d9cbb4+4590+4265+8079+ca44d46d27c3&
Photo:&Curator&Einar&Timdal&making&images&of&type&specimens&in&the&NHM+UiO&lichen&herbarium&in&2013&by&Dag&Endresen,&CC+by.&
Masse+digitalisering&ved&NHM+UiO&
• 3+årig&prosjekt&– Oppstart&i&2012&(varighet&fra&2013&El&2015)&– 3&millioner&NOK&hvert&år&(≈365&000&€&/&year)&
• NHM+UiO&karplanter&(240&000&–&280&000)&– Fotografering&i&høy&oppløsning&– QR+barkodning&med&hTp+PURL+UUID&nøkler&– Registrering&av&artsnavn"og&land"– Import&El&MUSIT&og&publisering&El&Artskart&og&GBIF&
Karplante&herb
ariet&(175&k&ob
jekter)&
Registrering:&&
Fotografering:&
13 13&
Foto:&Digitarium&
Foto:&NHM+UiO&
Nedpakking&av&herbariet&i&Oslo,&Norge&
Opp+pakking&av&herbariet&i&Joensuu,&Finland&
Status#i#mai#2014:#• Kostnad"for"hvert&objekt:&– Tradisjonell&ca.&40+80&NOK&&– Masse+dig.&17,5&NOK&
• NHM+UiO&karplanter&&&(240&000&–&280&000)&
• De&første&175&000&objekter&er&ferdige&
• Foto:&ca.&15&Terabyte&• 50&000&objekter&er®istrert&(30%)&– Artsnavn&og&land&
Notes&from&Nature&&Hver&eEkeT&blir®istrert&av&tre&ulike&frivillige&amatørbiologer&for&å&sikre&korrekt&tolkning.&&NHM+UiO&har&her&idag&lansert&en&ny&norsk&portal&for&“transkribering”,&basert&på&Notes#from#Nature&portalen.&
Notes&from&Nature&
ALA&Volunteer
&Portal&
(Australia)&
NaEonal&M
useum&of&Na
tural&
History&(M
NHN)&Paris
&
Smithsonian&Tran
scripEon&&
Center&(USA)&
Hvert&samlingsobjekt®istreres&av&tre&frivillige&amatørbiologer&
Figur&fra&Hill&et#al.&2012&
hTp://gbif.no
/dugnad/&
hTp://gbif.no
/transcribe&
hTp://gbif.no
/dugnad/&
Hensikten&med&idenEfikasjonsnøkler&&…er&å&gi&navn&El&Eng,&&
slik&at&det&blir&mulig&å&referere&El&dem.&&&&“Each&idenEfier&refers&to&one&and&only&one&thing”&(Coyle&2006).&&“A#assosia-on#between#a#string#and#a#thing”&(Kunze&2003).&&“A#stated&associa-on&between#a#symbol#and#a#thing;#that#the#symbol#may#be#used#to#unambiguously#refer#to#the#thing#within#a#given#context”&(Campbell&2007).&
UUID&QR+koder&for&museums+&objekter&ved&NHM+UiO&gir:&&• Maskinlesbare"idMnøkler.&• Nye&og&effekEve&arbeidsflytskjema&
for&kuratering&og&arbeide&med&samlingene.&
• Implementering&av&stabile"idMnøkler"som&er&egnet&for&elektroniske&databaser&og&moderne&løsninger&på&InterneT.&
hTp://purl.org/nhmuio/id/d91e8253+0ac1+4681+ac69+e50070af86a2&
hTp&–&PURL&–&UUID&&hTp://purl.org/nhmuio/id/41d9cbb4+4590+4265+8079+ca44d46d27c3&
hTp://purl.org/nhmuio/id/UUID&&&&!&&&&hTp://gbif.no/resolver/UUID&&&
Inkludert"maskinlesbare"formater"
GBIF&portal:&&
13,8"million"artsdata&med&lokaliteter&i&Norge.&Publisert&fra&31&ulike&land.&
GBIF&portal:&&
14,7"millioner"artsdata&publisert&fa&norske&insEtusjoner.&Norge&publiserer&artsdata&fra&181&land.&
Danmark& Finland&
Norge& Sverige&
Island&
Status"mai"2014" Datasets" Artsdata"Danmark& 48& 9&326&796&Finland& 58& 16&832&224&Island& 4& 458&705&Norge& 81& 14&672&882&Sverige& 39& 46&127&797&
Status&for&de&nordiske&GBIF&dataseT&
hTp://www.gbif.o
rg/cou
ntry/&
Node"medlemmer"&Dag&Endresen,&Nodeleder&ChrisEan&Svindseth,&Databaseingeniør&Fridtjof&Mehlum,&Forskningssjef&Einar&Timdal,&Førsteamanuensis&(lav)&Vegar&Bakkestuen,&Seniorforsker&Geir&Søli,&Førsteamanuensis&(insekter)&&&&&Wouter&Koch,&Artsdatabanken&Nils&Valland,&Artsdatabanken&
36&