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Laurent Audeguin (IFV), Patrice This (INRA) et Loïc Le Cunff (IFV) présentents la problématique de l'amélioration génétique au niveau de la viticulture.
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Atelier 2Quel est le rôle de l'amélioration génétique
pour la limitation des intrants ? Les axes de recherche de la viticulture
Laurent Audeguin, IFV
Patrice This, INRA
Loïc Le Cunff, IFVMontpellier le 6 novembre 2009
Photo Nicolas JegouicDomaine La Tapy
La viticulture en France :
872 000 ha en 2000 (dont 475 VQPRD et 397 autres)Source Vitisphère
1 Catalogue Officiel National : 321 variétés
� 234 variétés de cuve (dont 20 hybrides producteurs directs),� 234 variétés de cuve (dont 20 hybrides producteurs directs),
� 52 variétés de table (dont les variétés à double fin),
� 4 variétés d’agrément pour amateurs,� 1 variété pour la conserverie,� 30 variétés porte-greffe.
Arrêté du 20 février 2009 : les variétés de cuveinscrites au catalogue sont classées sur l’ensemble du territoire national(suppression du classement départemental).
Conditions d’inscription d’une variété :Règlement technique – Section vigne du CTPS , arrêté du 21 mars 20083 listes distinctes:Liste A1 : Commercialisation au sein de l'UE, et en France.Liste A2 : Commercialisation au sein de l'UE, mais non éligible en France.Liste B : Plants produits en France et exportés vers les pays tiers
Pour être proposée à l'inscription au catalogue fra nçais, une variété doit Pour être proposée à l'inscription au catalogue fra nçais, une variété doit obligatoirement :Etre reconnue DHS (distincte, homogène et stable)
Etre désignée par une dénomination conformément aux règles applicables.
Examen VAT : valeur agronomique et technologique . Minimum de 3 années de production normale - Au moins 2 implantations - Au moins 1 variété témoin.
- Variétés de cuve : au moins 3 répétitions, nombre total de pieds au moins égal à 90
- Variétés de table : au moins 3 répétitions, nombre total de pieds au moins égal à 24.
.
Conditions d’agrément de clones
Un clone est la descendance végétative d’une souche choisie pour son identité indiscutable, son état sanitaire et ses ca ractères phénotypiques (OIV)Viroses : graves et transmissibles au greffage.
Sélection sanitaire : dépistage de viroses (Court-noué, Enroulement, Marbrure), Sélection sanitaire : dépistage de viroses (Court-noué, Enroulement, Marbrure), méthode officielle : indexage.
Sélection génétique : définition du profil agronomique et technologique (dégustation) dans zone de culture traditionnelle du cépageSuivi viticole : 5 années – Vinifications : 3 années
.
Organisation de la sélection et de la création vari étales :
2 centres de sélection officiels : IFV (ENTAV-ITV France ) et INRA
Un réseau de 32 partenaires conventionnés (Chambres d’agriculture, Interprofessions, …) : la CTNSP Interprofessions, …) : la CTNSP
Une UMT dédiée à la valorisation des ressources génétiques Vigne :Géno-Vigne®
.
Baisse des intrants phytosanitaires et solutions gé nétiques
Grenelle de l'environnement
Plan Ecophyto 2018 : diminution de moitié de l'usage des pesticides d'ici 10 ans et suppression des molécules les plus dangereuses du marché.
Quel est le rôle de l'amélioration génétique pour la limitation des intrants ?
Les axes de recherche de la viticulture
Sélection clonale : prise en compte du Botrytis, observatoire des maladies du bois
Créations variétales : Variétés de tableVariétés destinées à l’élaboration de jus de raisin Variétés de cuve : constructions monogéniques vs pol ygéniques
Sélection clonale
Botrytis cinerea : différence intra-variétale prise en compte dans les critères d’agrément des clones
Exemple des clones de Sauvignon
Autres maladies (mildiou, oïdium, maladies du bois) : pas de différence intra variétale observée actuellement : sensibilité variétale
Le Genre Vitis
L’utilisation des ressources génétiques
Utilisation de Muscadinia rotundifoliadans la sélection de variétés résistantes à l’oïdiu m
et au mildiou = Gènes Run et Rpv (A. Bouquet)Gène dominant assurant une résistance totale
sur feuilles, tiges et grappes
Créations variétales
Run1 - Run1 +Run1 -Run1 + Rpv1+ Rpv1 -
VMC4F8
ACA/CTA-A
ACA/CTG-OVMC8A7
PGM
VVIQ57VMCNG2G7 ACA/CTC-UVVIP60AAG/CTT-BAAC/CTT-S
VVIM25AGC/CAA-FVMC4D2VMC8E8VMC9F2AGG/CAA-RVVIF52
C01
68.6 cM
AAC/CAT-I
VVIB01
VVMD34 AGG/CAA-SACA/CAA-I
VMC6F1
VrZAG93 ACT/CTG-IVVIO55VMC2C10.1
VMC6B11VMC5G7COLORVMC8C2AAG/CAA-TVMC7G3
C02
79.8 cM
VVS112VVMD28AAG/CTA-AAAG/CAA-OVVIH02bVMC1G7 VVIH02cVMC9F4A VMC9F4CVMC9F4B AAG/CAA-UVVMD36
AAC/CTA-EVMC2E7VMC8F10
C03
47.2 cM
ACA/CTG-L ADH2ACA/CTA-KACA/CTT-P ACA/CTT-IACA/CTT-HVrZAG83AAC/CTT-IVVMD32 ACA/CTA-DAAG/CTT-RVMC2B5
VH43VMC7H3AAG/CTT-IVMC4D4ACC/CTT-AACA/CTG-KVVIR46VVIQ58VMCNG1F1.1
C04
64.5 cM
ACT/CTG-BVMC4C6ACA/CTG-QVVMD14AAAC/CTA-PVVMD14E AAC/CTT-FVVMD14GAAG/CTG-IAAC/CTT-WVVMD14F ACA/CTC-DAAG/CTG-B ACA/CAA-DVVMD14B VVMD14CVMC6E10AAC/CAA-TVMC5E11 ACA/CAT-CACC/CTT-HACA/CTC-WVVIT68AGG/CAA-DVrZAG79VVMD27VMC3B9
C05
56.9 cM
VVIM43VVIN31VMC4G6VMC5G1.1AAG/CAA-FVMC4H5 ACC/CTT-PAAG/CTA-JAAG/CTT-PAAG/CTG-TACA/CTC-FVMC2F10a
VMC2G2 VMC2H9AAG/CTG-R
AAC/CAA-A
C06
51.6 cM
ACC/CTT-Y
VVIN56
VVIV04
VMC1A12
ACA/CAA-GVMC8D11ACC/CTT-MACA/CAA-P AAG/CTT-AAACA/CAT-Q AAC/CAT-BVMC9A3.1VMC1A2 ACA/CTG-JVMC7A4AGC/CAA-PAGC/CAA-HAAG/CTA-RVVMD31VMC5H5AAG/CAA-HVVMD6ACC/CTT-G ACA/CAA-X
VVMD7VMC16F3
C07
91.8 cM
VMC2H10
VMCNG2B6
AAC/CAT-D VVIB66A47DVMC3F8VMC1E8 VMC3C9
VMCNG2E2
VMC1B11
C08
VMC2D9
AGC/CAA-RVMC2E11ACA/CAT-DACA/CAT-F AAG/CAA-SAAG/CAA-K AAG/CAA-LACA/CTC-E
C09AAC/CAT-NAAC/CAT-OACC/CTT-OAAC/CTT-KAGG/CAA-PAAC/CTT-LAAC/CAA-KVVIV37AAC/CTT-E
VMC8D3
C10
AAG/CTA-VVVIP36AACA/CAT-GVVIV35AGG/CAA-EVVIP02 AAC/CAA-Q
VMC6G1 AAG/CTT-AD
C11ACA/CAA-JACA/CAA-MVMC8G9AAG/CTA-S AAG/CAA-YVVIV05VMC4F3.1VVIT65 VMCNG2D11ACA/CAA-N ACC/CTT-IACA/CTT-G AAG/CAA-BACA/CTC-GACT/CTG-CAAG/CTG-O ACT/CTG-E
C12
VVIN70
VMCNG1G1.1 VVIS70AAC/CAA-P AAC/CTT-AAA27EVVMD24VMC2A5VMC5B3AGG/CAA-L
C14AGC/CAA-NVVIN62AGC/CAA-LVVIH54AGC/CAA-GACA/CAA-KAAC/CAT-MVVIM01 AAG/CTG-EACA/CTC-MVMC3D12
C13
Run1
Rpv1
Résistance
Oïdium : 1 QTL majeur (C12), 1 QTL mineur
(C15)
Mildiou : 3 QTLs majeurs (C12, C18), 3 QTLs
mineurs (C04, C05, C18)VMC1B11
VMC5G6.1VMC9F4DVVIH02aAAG/CAA-AVVIV15b VVIV15aAAG/CAA-JACA/CTA-BAAG/CTT-A AAC/CTT-AACA/CTC-BVMC6G8ACA/CTT-FVMC2F12VMC1F10
84.9 cM
ACA/CTC-EVMC2E2 VMC5C1VMC4H6
VMC3G8.2
VMC1C10
72.4 cM
VMC8D3VrZAG25VMC2A10 ACA/CAT-XAAG/CTA-LVVIN85VMC4F9.1VrZAG64AAC/CAT-CAAC/CTT-G
VVIH01AAG/CTT-KAAG/CAA-XVMC3D7
64.8 cM
VVIB19 ACA/CAT-SAAC/CAA-H
VVS2 ACT/CTG-KACT/CTG-F
AATVMC6C3VVMD25VMC2A12VMC3E12
62.9 cM
AAG/CTG-O ACT/CTG-EAAC/CTA-BAAG/CTT-HAGC/CAA-KVMC2H4 AAG/CAA-VAAG/CTA-BVMC8G6
58.3 cM
AGG/CAA-LVMC6C10VMC2C3AAG/CTT-OACA/CTA-MAAC/CAT-H AGG/CAA-BAAG/CAA-C AAC/CAT-U
SKACA/CTT-CVMC2H12 AAG/CTT-MAAC/CAT-EVMC1E12VMC8H10 ACA/CTT-LVMCNG1E1
73.2 cM
ACA/CTC-S AAC/CAT-PAAC/CAT-LACC/CTT-XAAC/CTA-NAGC/CAA-JAGG/CAA-G AAC/CAA-DVVS16VVIV67 AAG/CAA-DAAG/CAA-EVVIQ61 ACA/CTA-LACA/CTG-HAGG/CAA-AVMC5G8VVIV24 VVMD30ACC/CTT-RACC/CTT-WVMC8G3.2AAC/CTA-FAGG/CAA-CACT/CTG-HACA/CAT-R
C15
65.1 cM
VMC4B7.2VMC5A1
VVMD5VVMD37
AAC/CAA-R
AAG/CTG-MVMC1E11 AGG/CAA-MAAG/CTA-TAAC/CAA-S ACC/CTT-DACA/CAT-IACA/CAT-L ACC/CTT-CACA/CAT-O AAC/CTA-KACC/CTT-V
VVIN52 AAC/CTA-LACA/CAT-P
C16
72.9 cM
AAC/CTT-ABACA/CTA-C AAC/CAA-GAAC/CAT-KAAC/CAA-M ACC/CTT-EVVIB09VMC9G4
ACA/CTG-N
VMC3A9VVIQ22BACA/CTA-HAAG/CTT-U
VMC3C11.1
C17
49.0 cM
AAG/CTA-KVMC2A3AAC/CAA-B
VMC8B5VVIV16
VMCNG1B9AAG/CTA-P
VVIM93
VMC8F4.2GPI
VMC2A7AAG/CTA-FVVMD17 AAG/CTG-LAAC/CTA-AACC/CTT-JAGG/CAA-XVMC6F11 AAG/CTG-PC08-1020 SCC8SdIVMC7F2AAG/CTG-DAAG/CTG-CAAG/CTA-O P18-530ACA/CAT-KAAG/CAA-IAGC/CAA-I ACC/CTT-TACA/CAT-W
C18
117.8 cM
ACA/CAT-AAAAG/CTA-QACT/CTG-A
VVIV33 AAG/CTA-DACA/CTC-H AAG/CTT-ACAAG/CTT-QAAC/CTA-G AAC/CTT-VAAC/CTA-DVVIP31VMC3B7.2VMC5D11
VMC5H11VMC9A2.1VVIP17a
C19
53.3 cM
VMC3D12VVIV61 ACC/CTT-UACA/CTT-Q AGG/CAA-UVMC5G11ACC/CTT-N VMC2F10bACA/CTC-QVMC9H4.2AAG/CTT-SVMC2C7
AAG/CTG-SVMC8E6
72.2 cM
Rpv1
Rpv2
mineurs (C04, C05, C18)
Rpv3
Résistances monogéniques
Résistances polygéniques ou « pyramidales »
Utilisation de Muscadinia rotundifolia dans la sélection de variétés résistantes
à l’oïdium et au mildiou = Gènes Run (résistance à Uncinula necator) et Rpv
(résistance à Plasmopara viticola)
Création de variétés résistantes
Utilisation de Muscadinia rotundifolia associée à d’autres sources de résistance
(mildiou, oïdium)
Travaux de l’INRA Montpellier et Colmar : Résistance polygénique
3 sources de résistance :
• Muscadinia rotundifolia
• et autres Vitis américaines : co-évolution avec les parasites (mildiou, oïdium)
• Vitis asiatiques : évolution indépendante des parasites
Création en 1970
Les schémas d’introgression : la
recherche de quelques
caractéristique d’une espèce sauvage
Plantation en 2006
espèce sauvage éloignée
Un process long pour aboutir à une variété
offrant une résistance monogénique
Arômes Pépins Résistances
Mtp3197-78
Mtp3181-24-9
Mtp3197-233
Mtp3197-469
Arôme
Non
Arôme léger
M1
Run1
Oui
Oui
Oui
Exemple des constructions polygéniques cas des variétés de table
Amandin
Villard-blanc
Primus
Roucaneuf
Mtp3184-47-9
Himrod
Non Oui
Muscaté
Foxé
Simple
Sauvage
Assez aromatique
Oui
Oui
Oui
Très petits
S
MR mildiou/R oïdium
R mildiou/AS oïdium
Objectifs
Obtenir environ des variétés de raisin de cuve et de table présentant :
• des résistances durables et des qualités • des résistances durables et des qualités organoleptiques incontestables
• une bonne adaptation aux conditions pédo-climatiques du vignoble français