18
Gelişme raporu Mustafa Kemal SOYLU 1 Atatürk Bahçe Kültürleri Merkez Araştırma Enstitüsü

Kulacık Mantarı Geliştiriciliği

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Kulacık Mantarı Geliştiriciliği

Citation preview

  • 1. Gelime raporu Mustafa Kemal SOYLU 1Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits

2. Proje ekibi 1. M.Kemal SOYLU 2. Mustafa ztrk 3. Ethem Emre zko 4. Dr. Mehmet zdemir 5. Orhan nc 6. Gkhan Yldrml 7. Ahmet Yiit 8. Fahrettin Doan 9. Mustafa Yein 10.Prof.Dr.Kaya BOZTOK Proje yararlancs: Yalova Orman letme mdrl Proje ortaklar: Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits Ege niversitesi Bahe Bitkileri Blm Proje sresi: 12 ay (ekim 2011-ekim 2012) 2Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 3. Genel Amalar Blgemiz mantarclk sektrnn ulusal ve uluslar aras rekabet gcn arttrmak Mantar rn eitliliini arttrmak Tarmsal kalknmay salamak Krsal alanlarda yeni i ve ististam olanaklar salanarak kyden kente g azaltmak ve isizlii nlemek Blge plan uygulanarak model ormancln geliimine katkda bulunmak 3Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 4. zel Amalar Yabani kulack mantarlarnn (Pleurotus eryngii kompleks trleri) molekler karakterizasyonunu yaparak farkl rk ve varyetelerini belirlemek Yeni kulack mantar eit ve/veya eit adaylarn slah etmek Kulack mantarnn yetitiriciliini gelitirmek 4Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 5. Temel Faaliyetler 5Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits No Faaliyet Sre Uygulama birimi Grevliler 1. P. eryngii kompleks trlerinin molekler karekterizasyonu 1-6. ay PSU Mustafa Kemal SOYLU Prof. Dr. Daniel ROYSE 2. Kulack mantarnn seleksiyon slah 7-9.ay ABKMAE Mustafa Kemal SOYLU Prof. Dr. Kaya BOZTOK 3. Kulack mantarnn yetitiriciliinin demonstrasyonu ve eitimi 10- 12.ay YOM Dr. Mehmet zdemir Mustafa ztrk Orhan nc Gkhan Yldrml 6. Faaliyet 1. Pleurotus eryngii kompleks trlerinin molekler karakterizasyonu 1.1. Kltr koullar ve DNAnn izolasyonu Pleurotus eryngii kompleks trleri izolatlar, steril Patates dekstroz broth (PDB) ieren 125 mllk erlenlerde gelitirilecektir. Broth ve miselyum, miracloth (Calbiochem) dan geirilerek filtre edilecektir. Miselyum steril suyla alkalanacak ve iki kez suyu sklacaktr. 2 mllik epandorf tplere yerletirilerek liyofilize edilecek ve oda scaklnda bir cam desikatrde depolanacaktr. Liyofilize miselyum elle 1.5 ml epandorf tp iinde bir mikro havaneli ile tlecektir. DNA ekstraksiyonu DNeasy bitki kiti (Qiagen) kullanlarak, retici firmann protokolne gre yaplacaktr. DNA konsantrasyonu, agoroz jelde ve spektrometrede hesaplanacaktr. DNA stok solsyonlar 20 g/lye steril distile su ile ayarlanacak ve kullanlncaya kadar -20 OCde saklanacaktr (Rodriguez ve ark. 2010). 6Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 7. 1.2. Kullanlacak gen blgeleri ve primerler almada EF-1 ve RPB2 gen blgelerinin kullanlmas planlanmaktadr. EF-1 gen blgesi iin kullanlacak primerler: EF160R (5CCGATCTTGTAGACGTCCTG 3) ve EF595F (5 CGTGACTTCATCAAGAAGATG 3) primerleri, 4-6 ekzonlar hedefleyen ve 4 ve 5 intronlarn uzatan EF1 geninin bir ksmn oaltmak iin kullanlacaktr. RPB2 gen blgesini oaltmak iin: fRPB2 5F (5 GAYGAYMGWGATCAYTTGG) ve bRPB2 7.1R (5 CCCATRGCYTGYTTMCCCAT AGC 3) primerleri kullanlacaktr PCR karm hazrlanrken toplam PCR reaksiyonu 25 l olacak ekilde, her primerden 10 M ve 60 ng DNA kullanlacaktr. PCR koullar, Rodriguez ve ark. 2010nn belirttii ekilde yaplacaktr: EF1 amplikasyon iin 94 OC/4 dk; 36 dng 94 OC/1 dk, 55 OC/1 dk, 72 OC/1 dk ve son uzama basama 72 OC/10 dkdr. RPB2 geninin amplikasyonu iin PCR koullar; 94 OC/5 dk; 35 dng 94 OC/1 dk, 57 OC/1 dk, 72 OC/90s ve son uzama basama 72 OC/10 dkdr. PCR rnleri ethidium bromide (0.16 l/ml) ile boyanarak %1 lik agaroz jel iinde elektroforez ile grntlenecektir. DNA ykleme buffer (5x, 2 l/ml) + 5 l PCR rn jele yklenerek ve 2.3 3.3 v/jel ile yaklak 30 dakika elektroforezlenecektir. 7Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 8. 1.3. DNA Sekans Analizi PCR rnleri, saflatrma kitiyle, temin edilecei retici firmann talimatlarna gre saflatrlacaktr. Sekans analizi iin saflatrlm rnek, DNAnn 40 ng/ lye ayarlanmas iin (SPD1010 SpeedVac system ile) younlatrlacak veya seyreltilecektir. EF-1 (EF595 F) iin forward primer ve RPB2 (b11R1 ve bRPB2 7.1 R) iin reverse primerleri sekans analizlerinde (1 M her biri) kullanlacaktr. Birok rnekle ayn anda alabilmesi iin sekans analizleri iin tasarlanm 96lk plateler kullanlacaktr. Sekans analizi, Beckman CEQ 8800 marka DNA sekans analiz cihaznda yaplacaktr. 1.4.Sekans Veri Analizleri Sekans kromotogramlar, Sequencer version 4.10 (Gene Codes, Ann Arbor, MI) yazlm ile grntlenecek ve incelenecektir. Sekans dizilimleri, istatistik analizleri ve dendogramlarn hazrlanmas PAUP 4.0b10 (Swofford, 2002) programnda yaplacaktr. 8Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 9. Faaliyet 2.Kulack mantarnn seleksiyon slah 2.1 Farkl scaklklarda geliebilen stn performansl izolatlarn seimi Elde edilen ve molekler karekterizasyon sonucunda seilen izolatlar ve standart eit (M 2600), PDA ortamnda, drt farkl scaklkta (15, 20, 25, 30 OC) kltre alnarak farkl scaklklarda geliebilen, misel geliim hz yksek olan stn performansl izolatlar seilecektir. Deneme tesadf parselleri deneme deseninde 3 tekerrrl olarak kurulacaktr. 9Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 10. 2.2. Farkl scaklklarda mantar oluturabilen P. eryngii kompleks trleri izolatlarnn belirlenmesi Daha nceki aamalarda seilen izolatlardan tohumluk miseller elde edilecektir. P. eryngii kompleks trleri mantarnn tohumluk misel retiminde buday tanesi kullanlacaktr. Misel sardrma materyalinin nem oranlar % 60-70 civarna ayarlandktan sonra, al ve kirele pHlar 6.5 civarna ayarlanarak kavanozlara 2/3 oranlarnda ya da otoklav ssna dayankl plastik torbalara doldurulacaktr. Otoklavda 121oCde 1.2 atm basnta bir saat tutularak sterilize edilecektir. Alama odasnda misellerden her bir kavanoza ya da plastik torbaya 2 para ilave edilecektir. Misellerin optimasyonu aamasnda belirlenecek olan en uygun scaklkta tohumluk misel geliimleri salanacaktr. %48 tala, %22 pamuk iidi kspesi, %25 Buday kepei, %3 msr kspesi, %1 eker, %1 al ieren standart bir yetitirme ortam %70 nem iermesi salandktan sonra 1 kglk otoklava dayankl plastik torbalara doldurularak 121 oCde 1 saat sterilize edilecektir (Royse 2003). P. eryngii kompleks trleri mantarlarna ait tohumluk miseller sterilize edilmi olan yetitirme ortamna % 5 orannda inokle edilecek ve 25 OC ve %90 neme ayarlanan inkbasyon odasnda misel geliimleri salanacaktr. Misel geliimi tamamlandktan sonra; primordiyum ve mantar oluum aamasnda ise drt farkl scaklkta (15-20-25 ve 30 OC) farkl kulack mantar izolatlar yetitirilecektir. Dier iklim zellikleri (Ik: 750 lux, nem:% 90, havalandrma: 4-5 kez/s) sabit tutulacaktr. Yaplacak olan verim ve kalite zelliklerine gre daha stn nitelikli izolatlar eit aday olarak seilecektir. Deneme tesadf bloklarnda blnm parsellerde 3 tekerrrl olarak kurulacaktr. Ana parseller, Scaklklar; alt parseller ise farkl izolatlar olacaktr. 10Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 11. Denemede incelenecek gzlem ve analizler Misel geliimi ile ilgili lmler 1. Kltrlerin gelimeye balama sreleri (gn) 2. Kltrlerin gelime hz (mm), tipi ve formu 3. Kltrlerin geliim sreleri (gn) 11Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 12. Yetitirme ortamnda incelenecek analiz ve gzlemler 1. Toplam Azot Analizi 2. Kl Analizi 3. Karbon Hesaplamas 4. C:N Orannn Hesaplanmas 5. Fosfor Analizi 6. Dier Mineral Madde Analizleri 7. pH Analizi 8. Nem erii 12Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 13. Verim ile ilgili lmler Ortamda misel geliim sresi (gn) Primordium oluum sresi (gn) Primordium says Mantar says ve oran Toplam Verim Biyolojik etkinlik Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 13 14. Mantarlarn kalitesi ile ilgili yaplacak analizler ve lmler 1. Mantar Arl 2. apka ap 3. Sap ap 4. Sap Uzunluu 5. Protein ierii 6. Renk 7. Toplam Kuru madde 8. Kl tayini 9. Askorbik asit 10. pH 11. Antioksidan Aktivitesinin Tayini 12. Toplam Fenolik Madde Miktar 14Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 15. Faaliyet 3. Kulack mantarnn yetitiriciliinin demonstrasyonu ve eitimi Kulack mantar yetitiricilii iin Orman ve Krsal alandaki kylerden birinde demostrasyon amal kulack mantar retimi gerekletirilecektir. Mantarn retilecei tohum ve yetitirme ortam Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstitsnde yaplacaktr. Tohumluk misel ekili torbalar demostrasyon alanndaki odaya yerletirilecektir. Odann iklimlendirmesi yaplarak retim iin gerekli sulama ve bakm ileri Orman letme Mdrlnce yrtlecektir. Ayrca Hedef gruplara Kulack mantar yetitiricilii ile ilgili eitim verilecektir. Eitim srasnda Penisylvanya State niveristesinden Prof.Dr. Daniel Royse seminer verecektir. Uygulamal bir eitim verilecektir. Eitim iin ifti bror, kitapk ve afi hazrlanacaktr. Bror ve Kitapklar eitime katlan hedef gruba datlacaktr. Afiler ise Tarm ve Orman tekilatlarna ve konu ile ilgili sivil toplum rgtlerine ve Mantar iletmelerine datlarak buralarda aslacaktr. 15Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 16. BEKLENEN SONULAR P.eryngii kompleks trlerinin filogenetik analizi yaplarak Trkiyede farkl rk ve varyeteler belirlenecektir. Bu mantar kompleks trlerinin bir rk (var. nebrodensis) IUCNin tr ok tehlikede olan krmz listesindedir. lkemizde de P.eryngii kompleks trleri bulunduu doal alanlarda yok olma tehlikesi ile ba baa kald grlmtr. Bu proje ile bu mantar trnn gen kayna olarak saklanmas salanm olacaktr. Ayrca bu alma ile, farkl scaklklarda mantar oluturabilen eit veya eit adaylar da elde edilebilecektir. Trkiyenin yaklak 25 bin ton kltr mantar retimi vardr. Bu mantar retiminde kullanlan tohumluk misel eitleri yabanc eitlerdir. Henz yerli bir eidimiz yoktur. P. eryngii kompleks trleri, farkl scaklklarda da gelitirilebildiinden (15-20-25-30 OC) enerji maliyeti de byk lde dm olacaktr. 16Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 17. BTE 17Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits Bte Miktar (TL) Oran Ajanstan talep edilen bte 210.000 % 70 E-finansman 90.000 % 30 Toplam bte 300.000 % 100 18. TEEKKRLER Atatrk Bahe Kltrleri Merkez Aratrma Enstits 18