Баранова А. Облачные биомаркеры патологических...

Полнопрофильные композитные биомаркеры

патологических состояний тканей человека

Анча БарановаМедико-Генетический Научный Центр РАМН, Москва, Россия

George Mason University, Fairfax VA, USA

На решение какой практически-значимой проблемы направлено Ваше исследование?

Как ее решение позволит улучшить этот мир?

НОВЫЙ ТИП БИОМАРКЕРОВ ДЛЯ МОНИТОРИНГА СОСТОЯНИЙ,

в том числе здоровья

Биомаркеры заболеваний – в принципе, хорошая идея.

Однако, все годные биомаркеры уже были найдены.

Зачем эволюции нужно отбирать на биомаркеры????

НИЗАЧЕМ !!!!

Объективные показатели общего состояния для здорового человека

Самый лучший биомаркер здоровья

– это состояние гомеостаза

которое для каждого человека индивидуально

Чтобы определить гомеостаз

Давайте откажемся от минимизации числа

измеряемых параметров

Для каждого состояния мы определяем

«дистаницию» до усредненного

состояния

Может быть описано как Броуновское движение с исходной точкой в центре гомеостаза

Если «случайно» отошли слишком далеко от точки гомеостаза, вернуться “в молодость / “в здоровье”все сложнее

Только точка тут – не один параметр,

а тысячи – сколлапсированные

в дистанцию

Пространство ,занимаемоеБОЛЕЗНЕННЫМИ СОСТОЯНИЯМИ

Центр пространства НОРМАЛЬНОГО

(молодого) организма

DNormal

Индивидуальное Пространство Состояния здорового человека(норма реакции)

ДИСТАНЦИЯ – ЭТО ЛИНЕЙНАЯ МЕТРИКА

DN – Avg dist from normal sample spaceDNglobal DNspecific

(Tone et al. 2008)

(Wurmbach et al. 2007)

DNglobal DNspecific

Тоже самое можно делать и с помощью NextGen Seq

Вполне возможно что потребуется достаточно небольшой уровень перекрытия (удешевление)

Чего Вам удалось и чего еще не удалось добиться

в своей работе?

1) Концепция доказана для опухолей

2) Разработаны общие методические подходы ( но не оптимизированы) 3) Сделаны первые прикидки для хронических заболеваний

и для СТАРЕНИЯ

ПЕРСПЕКТИВНЫЕ ВОПРОСЫ КОТОРЫЕ МОЖНО ПОЗАДАВАТЬ :

DNglobal DNspecific

ЕСТЬ ЛИ РАЗНИЦА В ПРОГНОЗЕ МЕЖДУ ЭТИМИ ДВУМЯ ОПУХОЛЯМИ

Distance to normal center

Correlation to actual survival

Significant!!!

Насколько плоха моя опухоль?

Ответ: дистанция от идеальной нормы

Ваша опухоль

Нормальные эпит клетки

предзлокач

Поле, где катаются злокач клетки

Нормальные МЕЗЕНХИМ клетки

Метастаз.Клетки после транзиции

АТТРАКТОРЫ !!!

George Mason University, Fairfax, VA, USA

A.Baranova, M.Sikaroodi, G,Manyam, P. Gillevet

Нужны ли Вам студенты, какими они должны обладать компетенциями,

и какие для них есть задачи?

Уметь считать Уметь писать