Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

Preview:

DESCRIPTION

Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance - Travaux Dirigés de la 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RASON Marie-Ange et RANDRIANARIVELOJOSIA Milijaona

Citation preview

1

�������������� � ������ ��������������������� �� ����������������� � ������ ��������������������� �� ���

��������� ������������������ ���������������

��������� ������ ������������ ���������� ������ ������������ ��������� �������� ��������� ������������ �������� ��������� ����

��������������� ���������������������������������������������� �������������������������������

����������������������������������������������������������������������������������������������������������

2

������������������������������������������������������������������

������������������

�� ������

��������������� �� ���������������������� �� ������������������������������� �������������� ��������������

�� ������ �������� �� ������� �� ���

����������������������������� ������������� ����

�� ���� �� ����

3

�������������!��������������������� ��������������!��������������������� ����������� ����������

������������� ����������������� ����

!! "�#$%&'$%'$���$())(�*+"�#$%&'$%'$���$())(�*+

!! "�#$��,-.�*)++"�#$��,-.�*)++

� ���������� ���������

!! ��� ������/� ����� ���/������/�����0��������������� ������/� ����� ���/������/�����0������������

!! ��� ������������� ��������������� ���������� �����������/�1���� ������������� ��������������� ���������� �����������/�1�

&�����������2�/�������0�������� ����������&�����������2�/�������0�������� ����������

��$�������� ��3��������$�������� ��3������

���������������

���2��� ����4

"�����#

4

���������� ������� �� ���������� ������� ��

55 6�� ������� ��/����0���������/���7��������������� ��8����� �����6�� ������� ��/����0���������/���7��������������� ��8����� �����������������/�����������2�� �������������/�����������2�� ���������99 :����� ������ ����������;:����� ������ ����������;99 ���������;���������;99 �����<�����/���������� ��0���;�����<�����/���������� ��0���;99 ��!!��7����������;��7����������;99 ,�3 �����������/���������8�/���������7����;,�3 �����������/���������8�/���������7����;

55 ,��������� �������������������������������� �������� ��/����0���,��������� �������������������������������� �������� ��/����0������/��/�1�����0������/��/�1�����0���

5

�� �������� �� ������ �������� �� ��������������

����������� ����������������� ������#�'=�%�&$��,$-+�()�#�'=�%�&$��,$-+�()�������(�())*��(�())*

$�������������%�&'�&(�)) $�������������%�&'�&(�)) ���������������������������������� ���/�())*>�.*4?@?���/�())*>�.*4?@?!!?+?+A����A���� �����������������������3���������3������������%��������%�������� ())(>�@.4*.?B())(>�@.4*.?B!!.@.@

*������ �������������������*������ ������������������������� &���������=�%����&���������=�%���������������������� �������� *-+->�(.4C(+*-+->�(.4C(+!!(-(-,������=�,������=�����D����/�D����/������� �1�1 *-BC>�C(4�@@+*-BC>�C(4�@@+!!?*?*

* ������������* �������������� ����� � ��� ����� � �

����� �����

�� ���1/��

� ��������E�4

"������#

$������$������ ���������������������/��1�����������/��1���������������� %1������1%1������1*--+>�(+4�B@*--+>�(+4�B@!!-*-*

*��������������*�������������� ������������������ %��3���������� ��D����/���� �1 ())@>�+)4**-!(@

6

+���������������'����������������������������������+���������������'����������������������������������

7

+����� ��������!���������������+����� ��������!��������������� !����������!���������������� ��� ��!"�,�������� ���� ��!"�,�������� �

+

�1/�2�������!C�

�&A�/�����������&A�/������������ 3�������������� 3������������ "�,�����������"�,�����������

������

8

$�������-� �������������������������������$�������-� �������������������������������

��%��/���������������������� ���%��/���������������������� �����������8��8�� �����������������������3��������3���

�� %����������%����������$)./�$)./�����������������������������������3�������?)F�����3�������?)F�

9

A 3019 3126 3174 3221 3053 3288 2593 2464 3185 2963 3017 3174B 2582 2951 2315 875 1006 870 2472 2446 2484 2570 2772 2608C 1737 1767 1685 102 100 110 1678 1552 1557 1526 1716 1732D 482 415 595 120 106 101 702 651 541 695 762 795E 164 138 192 82 77 85 112 122 119 218 327 276F 96 133 94 90 73 75 66 72 87 110 155 131G 90 108 3040 78 104 3340 105 76 3552 111 122 2943H 103 100 3276 101 114 3045 77 104 3187 113 135 3017

Chloroquine Amodiaquine Mefloquine Quinine

(� ��� �����������������������������(� ��� �����������������������������

���� �������� �� �������� �������� �� �������������� ������������������������������

$������ �������� ����0�����1���������� � �� �����������

2��������������

2�������������

10

������������������������������������������������������������������

������������������

�� ������

��������������� �� ���������������������� �� ������������������������������� �������������� ��������������

�� ������ �������� �� ������� �� ���

����������������������������� ������������� ����

�� ���� �� ����

11

��������� ��������� �������� ��������� ������������� ��������� �������� ��������� ����

�$(3 �����4����$(3 �����4���

�$(3+���������5�� �$(3+���������5��

(�(�66�$(�$(

���� �-�"�,������ �-�"�,��������������������

�$(3(2%��$(3(2%�

G ���1/���������E4"������#

12

+�����4�����!���� ��������� +�����4�����!���� ���������

����/4$$����/4$$HHH����/����������7�HHH����/����������7���

13

����������������������������������

$�����78$�����78"""""" �,1��������I�J�������=��,1��������I�J�������=�%:%:!!�����3�������3����""$$"" ���� �����������J���� =����� �����������J���� =�%:%:!!� �������� ���������

14

�$(���+�����������������$(���+���������������� !���� ���� !���� ����

$���4���� �����������0�������������������� 0������8�� ������

+����4���� �����0���/������������� �������

���� ����������������� �0�������/�����<���������/� ���������� ������ 0�������/ ��7�0�������� ����=���/�3�������������K����/����13������������������0����������� 0������/����/�������������������7��������

(http://www.inrp.fr/Acces/biotic/biomol/techgen/html/telechar.htm)

15

�$(���+�����$(���+����

16

+�������������������������������������+������������������������������������������������������������� ����������������������������� �����

17

(�(�66�$(����$(������� ����������$(�������� �$(����$(������� ����������$(��������

��/��7������������������L���� ��/���0�������%�������0����/��7������������������L���� ��/���0�������%�������0��

��!!�%�% ���������������������������� ����������� ���� ����������� ���� /�������������/�������������0�����7�������������������� ��������������0�����7�������������������� ����������������/�������/����� 7��� �������/��7��� �������/��� ���8����0����1����� ���8����0����1����

���������������� ��������/��� ���/���������� ���������������� ��������/��� ���/�����������%�%��

���/4$$HHH����!�1���7�$�,M�$�%$����������$�/����N������0���$��/��$��

���������� ������=�������=�,�����,�����())@>�C.@4�@CB())@>�C.@4�@CB!!@+��/7����@+��/7����� 7��0����� 7��0���� ��������������%���������������%�

18

���� �-�"�,������ �-�"�,��������������������

������������������������������������������������������������� ��!����� ���������� ���������� ��!����� ���������� ��9�� ��9�� ��8���8�� � ��������� �������� ����<������/��������<������/����

�������� ����� �������� ����� 44

��O�3���������������/������O�3���������������/�������� /����������������3������ /����������������3�����13�����������13����������,��������,������������1������������ ��������1������������ ��������/����������/��7�����������/����������/��7����� ��2/���������2/�������

���/4$$HHH���������/���������7�$��3$/�����������$/�����/���/�/

19

20

�$(3(2%���(� �����2��������$(3(2%���(� �����2�������%����%������������ ��������� �

������������������������!������������������ ��!������������������ �� ������� 0�������������� 0������� ��&A�8���&A�8����������������� ���P1���������������������P1������������������

�/�<�������%=����7���������/��7� ������� � �/��������/�<�������%=����7���������/��7� ������� � �/���������:���������:��������� ������ ���� ���������� ����������� ��� ���������������/ ��7�0��������������������������/ ��7�0������������ 0������������� �������� 0������������� �������

� �����������/���������������������/�<�� � �����������/���������������������/�<�� � ����/���<�� � ����/���<�� ��������������/������������������/������������������ !�� �������������� ������!�� �������������� ������ !����������-�!����������-���������������������� ���������������������������������� �������������

������0��������� ��/����������0��������� ��/������������������������������� ���������������������������� ��9�� ��������� �����9�� ��������� ���� ����/������������/������������/������������/��������

21

*������� �������� ������ ��������*������� �������� ������ ��������������������������������

����/�����0�������������G<����������/�����0�������������G<������ �����������������������������7����/�����������������7����/����������������������������������7� 07� 0

"������ "������

�1��� ��������1��� ������� /7��7������������������?*=�?-=�/7��7������������������?*=�?-=�;/<;/<

%1��������%1�������� /7��7������������������*.=�/7��7������������������*.=�;/<;/<=�*.@=�*.@

'��7���2���'��7���2��� /7��/�����������������@C.=�@C+=�?@)/7��/�����������������@C.=�@C+=�?@)

�//���������4�//���������4

������������������������������������������������������������7���7� ��������������/���/� /� �������������� �����/� �������������� ������� ��/�� ��/���'���O�����������'���O��������

22

)������������ ��� ��� �����$(3(2%�)������������ ��� ��� �����$(3(2%�

@

%��������� ������ =���������� ���/��7�����������<���/7��7�������7����/�����

*4����0�������������������/��������3�����>�.��;.4��(#�� ������ ���7�������&A�>;6>6?6@4�� �����/�����7���/�������!*)B>�8�-�;@4��������������7����/����/� ��� ��������������

;///�� <A/��

*� ;�������>����?�����@�����.�����* 8�����7�����<�����A�����;/���;;���;>���;?���;@����;.��*

23

��� ��������"%B�)�.!���"���$�C?! ��� ��������"%B�)�.!���"���$�C?!

�?!����$���"C.! �?!����$���"C.!

;///��

.//��

..;��

<A/���

??A��

%������ ������ 4���������������������������� ���P1�������������������,6�M

,��������������7����������-))/3�������(�7��������?+?/3����C(?/3���,�����/����/���� ���P1����,6!M�����0������/� ���������/����������� ���1/���������� �����G%!*)B���*4����0������������������"��QMR�>�;4�������2$*�>A�����������!*)B�>�>4�������?�7��������'��!*)B�>�?4��(#4�� ������ ���7>�@�-�;/4��2��/��������������� ��7����/����/� ��� �������������>�<A/��4��������� ���/����� ������ � >�..;�����??A��4������������/��������������������

;��������>��������?�������* @��������.�������8�������7�������<���������A������;/������*

24

��� ���������� �������5 �5 �66)) �.!C"$���,�C?! �.!C"$���,�C?!

�?!C��"$�$,C.! �?!C��"$�$,C.!

%������ ������ 4�/�������������������������� ���P1���������������������!M

,��������������7�������� ��&A����-))/3�������(�7���������C(?/3����?+?/3��,�����/����/���� ���P1������!M����0������/� ����������/�������������������/���������%!*)B��*4����0���������������>;.4�2$*>A�����������!*)B�>�;84�?�7�������'��!*)B�>�;�-�.���� � ���� ���1/� /7��7�����!!*)B>�8'7'<';> ���� � ���� ���1/����2���/7��7����/������!*)B����� ����!*)B>�

;//��

<//��

??A��

..;��

<A/��

* ;������>������?�����@������.������8������7������<�����A���� ;/����;;���;>���;?����;@����;.�����;8���*

25

��� ����������� ��������+���+���66)) �.!C$$�,��C?! �.!C$$�,��C?!

�?!C��,�$$C.! �?!C��,�$$C.!

%������ ������ 4�/�������������������������� ���P1���'��7!M�

,��������������7�������� ��&A����B-)/3�������(�7���������CC-/3����??*/3���,�����/����/��� ���P1���'��7!M ����0������/� ����������/��������������������� �������%%!*)B��*4����0���������������>;74����������� �������� ����!*)B>�;�-�;84��2��/���������������������7����/����/� ��� �������������>�<A/��4��������� ���/����� ������ � >�..;�����??A��4�������������/�������������������������������������!*)B�� ��� � �� ���� �

<//�� <A/��

??A��

..;��

*��;���>����?���@���.���8���7���<���A��;/�;;�;>�;?�;@��;.�;8�;7�*

;//��

Recommended