MAKALAH PRESENTASI MIKROBIOLOGI Keanekaragaman Domain
Archaea
Disusun Oleh: Hasnil Hafid Arini Novianti Wiwin Wirmasari BI/
BI/ BI/7975
Fatmawati Sugiharja BI/8015 Indah Riwantrisna D. BI/8032
FAKULTAS BIOLOGI UNIVERSITAS GADJAH MADA YOGYAKARTA 2012
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT atas
segala limpahan karunia dan rahmat-Nya sehingga penulis dapat
menyelesaikan Makalah Mikrobiologi yang bertema Keanekaragaman
Domain Archaea. Penyusunan makalah ini tidak lepas dari bantuan
berbagai pihak. Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima
kasih yang sebesar-besarnya kepada : 1. Drs. Langkah Sembiring,
M.Sc.,Ph.D, selaku Dosen Mata Kuliah Mikrobiologi yang telah
membantu terselesaikannya makalah ini. 2. Ayah, ibu dan kakak yang
selalu mendoakan dan memberi motivasi bagi penulis selama
pelaksanaan penelitian dan penyusunan makalah ini. 3. serta teman
teman yang tidak dapat penulis sebutkan satu persatu atas bantuan
tenaga, pikiran, dan kerjasama selama penyusunan makalah ini.
Penulis menyadari bahwa penelitian ini masih jauh dari sempurna dan
masih terdapat banyak kekurangan. Oleh karena itu, kritik dan saran
yang membangun sangat penulis harapkan. Semoga penelitian ini dapat
bermanfaat dan menambah khasanah ilmu bagi kita semua. Amin.
Yogyakarta, 9 Maret 2012
Penulis
DAFTAR ISI
Cover i Halaman Judul Prakataiii Daftar Isi iv ii
Daftar
Tabel..................................................................................................................
Daftar Gambarv I. PENDAHULUAN A. Latar Belakang 1
B.
Tujuan..................................................................................................................
II. KEANEKARAGAMAN DOMAIN ARCHAEA A. Domain Archaea B. Ciri-ciri 2
2 1
C. Penggolongan
D. Perbedaan dengan Domain Bakteria dan Eucarya 2III.
PENUTUP................................................................................................................
DAFTAR PUSTAKA 37
BAB I. PENDAHULUAN
A. Latar Belakang Definisi spesies merupakan tujuan dari
sistematik. Sistematik diperlukan untuk mengenali kelompok
organisme yang serupa dalam suatu skema hirarki. Dalam sistematik,
keanekaragaman diatur dalam suatu tatanan melalui proses
karakterisasi dan pengelompokan. Unit fundamental dari
keanekaragaman adalah spesies, sehingga definisi yang tepat
mengenai spesies penting untuk mempelajari keanekaragaman hayati di
alam. Prokaryota menempati dua domain kehidupan, yaitu Bacteria dan
Archaea. Kelompok mikroorganisme ini memiliki peran yang penting di
alam dan sangat mudah tumbuh (versatile). Mereka berperan dalam
berbagai siklus biogeokimia dan degradasi berbagai senyawa, baik
senyawa alami maupun xenobiotik. Metabolisme yang dimiliki kelompok
ini sangat beragam, seluruh jalur metabolisme yang dikenal pada
makhluk hidup dapat ditemukan pada prokaryota. Mengingat pentingnya
peranan prokaryota dalam menjaga stabilitas ekosistem, perlu
dipahami keanekaragaman dan peranan komunitas mikroorganisme ini di
alam. Walau mikroorganisme lebih berperan jika berada dalam suatu
komunitas dibandingkan dengan jika berada sebagai individu yang
berdiri sendiri (Buckley dan Schmidt, 2002), pengetahuan mengenai
spesies-spesies yang menyusun struktur
komunitas penting untuk memahami keseluruhan sistem. Dalam
makalah ini akan dibahas mengenai keanekaragaman Archaea.
B. Tujuan
BAB II. KEANEKARAGAMAN DOMAIN ARCHAEA
A. Sejarah Domain Archaea tidak diakui sebagai domain utama dari
hidup sampai akhir-akhir ini. Sampai abad ke-20, ahli biologi
menganggap semua makhluk hidup harus diklasifikasikan sebagai
tanaman atau binatang. Tapi di tahun 1950-an dan 1960-an, ahli
biologi akhirnya menyadari bahwa sistem ini gagal untuk
mengakomodasi jamur, protista, dan bakteri. Pada tahun 1970-an,
sistem Lima Kerajaan telah diterima sebagai sebuah model dari mana
semua makhluk hidup dapat diklasifikasikan. Pada tingkat yang lebih
mendasar, perbedaan dibuat antara prokariotik bakteri dan empat
kerajaan eukariotik (tanaman, hewan, jamur, & protista).
Perbedaan tersebut terdapat pada ciri umum sel eukariotik yaitu
terdapat bagian yang berbeda nyata seperti nukleus, cytoskeletons,
dan membran internal. Masyarakat ilmiah dikejutkan di akhir 1970-an
oleh penemuan sebuah kelompok organisme yang sama sekali baru
Archaea. Archaea merupakan salah satu dari tiga domain di mana
semua kehidupan yang diketahui dapat dibagi menjadi bacteria,
eukariota, dan archaea. Eukaryota mencakup tanaman, hewan, jamur,
dan protista. Bakteria pertama kali diamati pada abad ke-17 di
bawah mikroskop oleh orang-orang seperti naturalis Belanda Antony
van Leeuwenhoek. Ukuran kecil bakteri membuat mereka sulit untuk
dipelajari. Klasifikasi awal bergantung pada bentuk individu,
munculnya koloni di laboratorium, dan karakteristik fisik lainnya.
Ketika biokimia berkembang sebagai ilmu pengetahuan modern,
karakteristik kimia juga digunakan untuk mengklasifikasikan spesies
bakteri, tapi bahkan informasi ini tidak cukup untuk terpercaya
mengidentifikasi dan mengklasifikasikan mikroba kecil. Klasifikasi
bakteri tidak dapat ditentikan sampai akhir abad 20 ketika biologi
molekuler memungkinkan untuk menguraikan urutan DNA . Molekul DNA
ditemukan pada sel-sel semua makhluk hidup, dan menyimpan informasi
yang dibutuhkan sel untuk membangun protein dan komponen sel lain.
Salah satu komponen yang paling penting dari sel adalah ribosom,
dan kompleks molekul besar yang mengubah pesan DNA menjadi produk
kimia. Sebagian besar komposisi kimia ribosom adalah RNA, molekul
yang sangat mirip dengan DNA, dan yang memiliki urutan tersendiri.
Dengan teknik pengurutan, ahli biologi molekuler dapat mengambil
blok
bangunan RNA satu per satu secara terpisah dan mengidentifikasi
masing-masing. Hasilnya adalah urutan dari blok bangunan tersebut.
Karena ribosom sangat kritis penting adalah fungsi makhluk hidup,
mereka tidak rentan terhadap evolusi. Sebuah perubahan besar dalam
urutan ribosom dapat membuat ribosom tidak dapat memenuhi tugasnya
membentuk protein baru untuk sel. Karena itu, kita dapat mengatakan
bahwa urutan dalam ribosom adalah kekal bahwa tidak banyak berubah
dari waktu ke waktu. Evolusi secara molecular yang lambat ini
membuat urutan ribosom menjadi salah satu kunci yang baik untuk
mengetahui evolusi bacteria. Dengan membandingkan sedikit perbedaan
dalam urutan ribosom antara keanekaragaman bakteri, kelompok urutan
yang sama dapat ditemukan dan diakui sebagai grup terkait. Pada
1970-an, Carl Woese dan koleganya di University of Illinois di
UrbanaChampaign mulai menyelidiki urutan bakteri dengan tujuan
mengembangkan gambaran yang lebih baik tentang hubungan bakteri.
Temuan mereka dipublikasikan pada tahun 1977, dan termasuk kejutan
besar. Tidak semua mikroba kecil memiliki kaitan dengan lainnya.
Selain bakteri dan kelompok eukariota, ada kelompok ketiga mikroba
penghasil metana. Methanogen ini sudah terkenal akan keanehan
kimiawi di dunia mikroba, karena mereka dimusnahkan oleh oksigen,
menghasilkan enzim yang tidak biasa, dan memiliki dinding sel yang
berbeda dari semua bakteri yang dikenal. Inti dari pengamatan Woese
adalah bahwa ia menunjukkan mikroba ini berbeda pada tingkat yang
paling mendasar dari kondisi biologis mereka. Urutan RNA mereka
tidak lebih seperti yang dimiliki bakteri dibandingkan ikan seperti
atau bunga. Untuk mengenali perbedaan yang sangat besar, ia bernama
kelompok Archaebacteria untuk membedakan mereka dari Eubacteria
(bakteri sejati). Ketika pemisahan antara organisme ini menjadi
jelas, Woese menyingkatkan nama aslinya dengan Archaea untuk
menjaga orang dari pemikiran yang archaea itu hanya sebuah kelompok
bakteri. Salah satu pendekatan yang digunakan dalam menangani
pertanyaan adalah dengan melihat urutan gen duplikasi. Beberapa
urutan DNA terjadi di lebih dari satu salinan dalam sel
masing-masing, mungkin karena salinan tambahan dibuat di beberapa
titik di masa lalu. Ada beberapa gen dengan jumlah sangat kecil
yang diketahui ada dalam duplikasi dalam semua sel hidup,
menunjukkan bahwa duplikasi terjadi sebelum pemisahan dari tiga
domain kehidupan. Dalam membandingkan dua set urutan, para
ilmuwan telah menemukan bahwa Archaea sebenarnya mungkin lebih
berhubungan erat dengan kita (dan eukariota lainnya) daripada
bakteri. Secara tradisional, prokariotik dikelompokkan berdasarkan
karakter fisiologi, komposisi molekuler, dan reaksinya terhadap
pewarnaan gram, yang dibandingkan berdasarkan hubungannya secara
evolusi. Berdasarkan perbandingan rangkaian RNA ribosomnya, para
ahli membagi makhluk hidup prokariotik menjadi dua kingdom, yaitu
kingdom Eubacteria dan kingdom Archaebacteria. Carl Woese (1970-an)
dari Universitas Ulions (USA) menggunakan teknik biologi molekuler,
yaitu analisis sekuen rRNA sub unit kecil untuk mempelajari
kekerabatan semua makhluk, yaitu berdasarkan rRNA 16s atau 18s.
Hasil yang diperoleh adalah anggota kelompok prokariot sangat
berkerabat dengan dan sangat mirip satu sama lain. Berdasarkan
hasil klasifikasi yang dibuat dengan mengacu pada analisis variasi
molekul rRNA tahun 1978, Woese mengajukan pendapat bahwa
sesungguhnya prokariot terdiri atas dua kelompok yang berbeda
secara fundamental, yaitu Archaebacteria dan Eubacteria sehingga
secara garis evolusioner kehidupan yang ditentukan berdasar
analisis rRNA tersebut ada tiga, yaitu: Eubacteria, Archaebacteria,
dan Eukariot. Kini Eubacteria disebut bacteria dan Archaebacteria
disebut Archaea.
Gambar 1. Pembagian 3 domain kehidupan. (Madigan, et al.,
2003)
Dr Carl Woese dan rekan-rekannya di University of Illinois
sedang mempelajari hubungan antara prokariota menggunakan rangkaian
DNA, dan menemukan bahwa ada dua kelompok yang jelas berbeda.
bakteri yang hidup pada suhu tinggi atau yang terdapat metana
terkumpul bersama sebagai sebuah kelompok jauh dari bakteri biasa
dan eukariota. Karena perbedaan luas di genetik, Woese mengusulkan
bahwa kehidupan dibagi menjadi tiga domain: Eukaryota, Eubacteria,
dan Archaebacteria. Dia kemudian memutuskan bahwa istilah
Archaebacteria keliru, dan menyingkatnya menjadi Archaea. Pada awal
tahun 1970, Woese dan lain-lain mulai membandingkan sekuens asam
nukleat untuk menemukan hubungan evolusi di antara mikroorganisme.
Woese berfokus pada asam ribonukleat ribosomal (rRNA) karena ini
adalah molekul yang sangat penting yang oleh karenanya tidak banyak
berubah dari waktu ke waktu evolusi. Semakin sama urutan rRNA
adalah antara dua mikroba, baru-baru ini mereka berbagi leluhur.
Karena sekuensing asam nukleat belum ditemukan, Woese menggunakan
metode tidak langsung untuk membandingkan urutan rRNA. Dia memotong
molekul rRNA-potong dengan enzim, kemudian divisualisasikan
potongan untuk ukuran menggunakan teknik yang disebut
autoradiografi. Pola yang berbeda dari potongan rRNA ciri
prokariota diketahui pada saat (bakteri), dan eukariota. Atas saran
seorang rekan, Woese berkelana melampaui menyelidiki rRNA strain
laboratorium umum bakteri dan dianalisis mikroba yang seorang
mahasiswa pascasarjana telah dikumpulkan dari sistem septik
dekatnya. Mikroorganisme ini adalah methanogen, mereka memproduksi
metana (gas rawa) dari hidrogen dan karbon dioksida di lingkungan.
Anehnya, pola rRNA untuk mikroba sistem septik tidak memiliki
beberapa potongan yang telah diidentifikasi dalam lebih dari empat
puluh jenis bakteri, dan memiliki beberapa tempat misterius
sendiri. Woese menemukan metanogen lain yang tidak sesuai dengan
pola prokariotik yang diharapkan atau fragmen rRNA. Pada tahun
1977, ia dan rekan-rekannya menerbitkan sebuah makalah penting yang
dijelaskan sepuluh jenis methanogen bahwa "tampaknya hanya jauh
dengan bakteri yang khas" (Woese 1977, hal. 5088). Meskipun
publikasi selanjutnya terus membuat kasus untuk dua jenis
prokariota, ide domain pada umumnya, dan dari archaea yang baru
dibedakan khususnya, membutuhkan waktu lama untuk mendapatkan
penerimaan. Kebingungan muncul atas penamaan awal "baru" organisme
sebagai "archaebacteria." Bukan sebagai bakteri, melainkan
archaea.
B. Deskripsi Archaea
Sejak tahun 1977, ahli mikrobiologi telah mengidentifikasi dan
menggambarkan lebih banyak anggota beberapa domain Archaea. Sebuah
ironi awal adalah bahwa mikroba ini hanya ditemukan dalam apa yang
para ilmuwan sebut lingkungan yang ekstrim, seperti mata air panas
dan laut dalam ventilasi hidrotermal. Penelitian lanjutan
menunjukkan bahwa ini tidak terjadi. Archaea telah ditemukan di
sawah, tanah, rawa, air tawar, dan di seluruh lautan. Sebagai ahli
mikrobiologi lebih datang untuk menerima gagasan bahwa archaea
tidak bakteri, perbedaan lebih muncul. Archaean RNA transfer (tRNA)
molekul berbeda dalam urutan dari rekan-rekan mereka bakteri atau
eukariotik. Dinding sel Archaean tidak memiliki peptidoglikan yang
merupakan bagian dari dinding sel bakteri, namun membran sel
Archaean termasuk molekul lipid tidak terlihat di jenis-jenis
organisme. Archaea membuat metana menggunakan enzim yang berbeda
daripada methanogen bakteri. Perbedaan paling mencolok antara kimia
Archaea dan makhluk hidup lainnya terletak pada membran sel mereka.
Mereka empat perbedaan mendasar antara membran archaea dan
orang-orang dari semua sel-sel lain: (1) kiralitas gliserol, (2)
ikatan eter, (3) rantai isoprenoid, dan (4) percabangan rantai
samping. Ini mungkin terdengar seperti perbedaan kompleks, tetapi
sedikit penjelasan akan membuat perbedaan tersebut dimengerti.
Kiralitas gliserol merupakan unit dasar dari membran sel yang
dibangun adalah fosfolipid tersebut. Ini adalah molekul gliserol
yang memiliki fosfat ditambahkan ke salah satu ujungnya, dan rantai
samping dua terpasang pada ujung lainnya. Ketika membran sel
diletakkan bersama-sama, molekul dari ujung gliserol dan fosfat
keluar di permukaan membran, dengan rantai samping panjang terjepit
di tengah. Lapisan ini menciptakan penghalang kimia yang efektif di
sekitar sel dan membantu menjaga keseimbangan kimia. Gliserol
membuat fosfolipid archaea adalah stereoisomer dari gliserol yang
digunakan untuk membangun membran bakteri dan eukariotik. Dua
molekul yang stereoisomer adalah cerminan satu sama lain. Sementara
bakteri dan eukariota memiliki D-gliserol di membran mereka,
archaea memiliki L-gliserol. Komponen kimia sel harus dibangun oleh
enzim, dan kidal (kiralitas) dari molekul ditentukan oleh bentuk
enzim tersebut. Sebuah sel yang membangun salah satu bentuk tidak
akan mampu membangun bentuk lain.
Ketika rantai samping ditambahkan ke gliserol, sebagian
organisme terikat bersama-sama menggunakan ikatan ester. Rantai
yang ditambahkan memiliki dua atom oksigen pada salah satu ujung.
Salah satu dari atom-atom oksigen digunakan untuk membentuk link
dengan gliserol, dan yang lainnya menjorok ke sisi lain ketika
ikatan dilakukan. Sebaliknya, rantai archaea terikat menggunakan
keterkaitan eter, yang kekurangan atom oksigen tambahan. Hal ini
berarti fosfolipid yang dihasilkan memiliki sifat mekanik kimia
yang berbeda dari lipid membran organisme lain. Rantai lain dalam
fosfolipid bakteri dan eukariota adalah asam lemak, rantai dari
biasanya 16 sampai 18 atom karbon. Archaea tidak menggunakan asam
lemak untuk membangun fosfolipid membran mereka. Sebaliknya, mereka
memiliki sisi rantai 20 atom karbon dibangun dari isoprena.
Isoprena adalah anggota paling sederhana dari kelas bahan kimia
yang disebut terpene. Menurut definisi, terpene adalah molekul yang
menghubungkan molekul isoprena bersama-sama.. Setiap unit isoprena
memiliki kepala dan ekor akhir, tetapi tidak seperti rekan-rekan
mereka, blok isoprena dapat bergabung dalam banyak cara. Sebuah
kepala dapat disambungkan ke ekor atau ke ujung kepala, dan ekor
bisa juga bergabung. Berbagai senyawa terpene yang dapat dibangun
dari unit isoprena sederhana termasuk beta-karoten (vitamin a),
alam dan karet sintetis, minyak esensial tumbuhan (seperti
spearmint), dan hormon steroid (seperti estrogen dan
testosteron).
Tidak hanya rantai samping dari membran achaea yang dibangun
dari komponen yang berbeda, tetapi rantai itu sendiri juga memiliki
struktur fisik yang berbeda. Karena isoprena digunakan untuk
membangun rantai, ada sisi cabang diluar dari rantai utama. Asam
lemak dari bakteri dan eukariota tidak memiliki cabang-cabang
samping ini. Sebagai contoh, rantai samping isoprena bisa bergabung
bersama-sama. Ini dapat berarti bahwa dua rantai samping dari
fosfolipid tunggal dapat bergabung bersama-sama, atau mereka
dapat
bergabung ke rantai fosfolipid sisi lain di sisi lain membran.
Tidak ada kelompok lain dari organisme dapat membentuk fosfolipid
transmembran tersebut. Sifat lain yang menarik dari cabang-cabang
samping adalah kemampuannya untuk membentuk cincin karbon. Hal ini
terjadi ketika salah satu cabang mengelilingi dan mengikat atom
bawah rantai untuk membuat cincin lima atom karbon. Cincin tersebut
diperkirakan memberikan stabilitas struktural membran, sehingga
dapat membuatnya bertahan di lingkungan bersuhu tinggi. Archaeans
sensitif terhadap obat antibiotik yang berbeda dari bakteri,
menunjukkan perbedaan mendasar dalam struktur sel. Namun, archaea
juga berbagi karakteristik dengan anggota dua domain lainnya.
Mereka memiliki beberapa molekul permukaan yang sama sebagai
bakteri dan ion transportasi dalam banyak cara yang sama. Tapi
archaea memiliki protein yang terkait dengan DNA mereka yang
menyerupai protein histon dari eukariota dan mensintesis protein
dengan cara yang mirip dengan eukariota. Juga seperti eukariota,
genom Archaean memiliki gen lebih terganggu dengan urutan intron,
dan urutan lebih diulang, daripada genom bakteri.
C. Pembagian Filum pada Archaea
Berdasarkan karakteristik yang ditemukan Archaea terbagi ke
dalam 4 filum yaitu Crenarchaeota, Euryarchaeota, Korarchaeota dan
Nanoarchaeota.
1. Crenarchaeota Berikut ini adalah klasifikasi Archaea anggota
filum Crenarchaeota Class : Thermoprotei Order : Thermoproteales
Family : Thermoproteaceae Genus : Thermoproteus Genus : Caldivirga
Genus : Pyrobarculum Genus : Thermocladium Genus : Vulcanisaeta
Family : Thermofilaceae Genus : Thermofilum Order : Caldisphareales
Family : Caldisphaeraceae Genus : Caldisphaera Order :
Desulfuroccales Family : Desulfuroccaceae
Genus Desulfurococcus Genus Acidilobus Genus Aeropyrum Genus
Ignicoccus Genus Ignisphaera Genus Staphylothermus Genus Stetteria
Genus Sulfophobococcus Genus Thermodiscus Genus Thermosphaera
Family : Pyrodictiaceae Genus Pyrodictium Genus Hyperthermus Genus
Pyrolobus Order : Sulfolobales Family : Sulfolobaceae Genus
Sulfolobus Genus Acidianus Filum ini kebanyakan terdiri dari
organisme yang dikenal sebagai organisme termofilik. Beberapa
organisme dari filum ini tumbuh pada temperature di atas titik
didih air. Kebanyakan mengandalkan metabolism sulfur sebagai sumber
energy atau akseptor elektron. Sebagai contoh, beberapa oksidasi
reduksi senyawa sulfur secara aerobic untuk
menghasilkan asam sulfat. Lainnya mereduksi elemen sulfur dan
menggunakannya sebagai akseptor wlwktron untuk membentuk hydrogen
sulfide. Beberapa organism mereduksi besi dan mangan. Tidak semua
Crenarchaeota bersifat termofilik. Crenarchaeota juga ditemukan di
lingkungan dasar lautan seperti di laut kutub. Banyak archaea
memiliki temperature optimal lebih dari 80 0C, dan Pirolobus,
merupakan ekstrim termofil yang berhasil diisolasi, memiliki
temperature optimal 1060C. Archaea seperti Pirolobus yang dapat
tumbuh pada suhu 900C atau di atasnya juga disebut hipertermofi.
Yang menarik, Archaea ekstrim termofil jumlahnya menjadi melimpah
hanya di atas temperature yang membuat bakteri termofilik menjadi
sedikit jumlahnya. Archaea tersebut ,memiliki temperature optimal
di bawah 800 C, baik itu yang metanogenik, ekstrim halofil atau
termofilik moderat dan asidofilik. Jadi, archaea memiliki relung
(niche) yang membuat bakteri jarang atau tidak terdapat di
dalamnya. Lebih jelasnya, Archaea hanya melimpah pada habitat yang
tidak memungkinkan bakteri untuk tumbuh seperti pada temperature
tinggi atau berkadar garam tinggi atau jika mereka tidak memperoleh
energy yang dibutuhkan seperti pada metanogenesis. Archaea ekstrim
termofili terbagi menjadi aerob obligat dan fakultatif dan anaerob
obligat. Aerob biasanya bersifat asidofil dan memiliki pH optimum
sampai 2,0. Obligat anaerob kebanyakan neutrofilik dan memiliki pH
optimum lebih dari 5,0. Kendatipun kondisi ekstrim selalu ditemukan
organism ini, adaptasi terhadap lingkungannya adalah sama
kompleksnya dengan yang ditemukan pada kondisi mesofil. Contohnya,
hipertermofil Pyrodictium abyssi membentuk suatu bola putih tipis
dalam air kaldu panas pada temperature 970 C yang disusun dari
kompleks jaringan tubul tiga dimensi. Meskipun alasan secara
fisiologis untuk struktur ini tidak diketahui, sel dengan jelas
menyediakan diri dengan proporsi yang besar dari sumber dayanya
untuk membuatnya.
2. Euryarchaeota Berikut ini adalah klasifikasi singkat anggota
filum Euryarchaeota Class : Methanobacteria
Order : Methanobacteriales Family : Methanobacteriaceae Genus :
Methanobacterium Genus : Methanobrevibacter Genus : Methanosphaera
Genus : Methanothermobacter Family : Methanothermaceae Genus :
Methanothermus Class : Methanococci Order : Methanococcales Family
: Methanococcaceae Genus : Methanococcus Genus :
Methanothermococcus Family : Methanocaldococcaceae Genus :
Methanocaldococcus Class : Methanomicrobia Order :
Methanomicrobiales Family : Methanomicrobiaceae Genus :
Methanomicrobium Genus : Methanoculleus Genus : Methanofollis Genus
: Methanogenium
Genus : Methanolacinia Genus : Methanoplanus Family :
Methanocorpusculaceae Genus : Methanocorpusculum Family :
Methanospirillaceae Genus : Methanospirillum Genera incertae sedis
Genus : Methanocalculus Order : Methanosarcinales Family :
Methanosarcinaceae Genus : Methanosarcina Genus : Methanococcoides
Genus : Methanohalobium Genus : Methanohalophilus Genus :
Methanolobus Genus : Methanomethylovorans Genus :
Methanimicrococcus Genus : Methanosalsum Family : Methanosaetaceae
Genus : Methanosaeta Class : Halobacteria
Order : Halobacteriales Family : Halobacteriaceae Genus :
Halobacterium Genus : Haloarcula Genus : Halobaculum Genus :
Halobiforma Genus : Halococcus Genus : Haloferax Genus :
Halogeometricum Genus : Halomicrobium Genus : Halorhabdus Genus :
Halorubrum Genus : Halosimplex Genus : Haloterrigena Genus :
Natrialba Genus : Natrinema Genus : Natronobacterium Genus :
Natronococcus Genus : Natronomonas Genus : Natronorubrum Class :
Thermoplasmata
Order : Thermoplasmatales Family : Thermoplasmataceae Genus :
Thermoplasma Family : Picrophilaceae Genus : Picrophilus Family :
Ferroplasmataceae Genus : Ferroplasma Class :Thermococci Order :
Thermococcales Family : Thermococcaceae Genus : Thermococcus Genus
: Palaeococcus Genus : Pyrococcus Class : Archaeoglobi Order :
Archaeoglobales Family : Archaeoglobaceae Genus : Archaeoglobus
Genus : Ferroglobus Genus : Geoglobus Class : Methanopyri Order :
Methanopyrales
Family : Methanopyraceae Genus : Methanopyrus
Organisme Euryarchaeota sebagian besar terdiri dari halophiles
ekstrim dan methanogen. Organisme halofilik ekstrim hidup di
habitat asin. Mereka membutuhkan lingkungan asin untuk bertahan
hidup. Kita dapat menemukan organisme tersebut di danau berkadar
garam atau daerah di mana air laut terevaporasi (menguap).
Methanogen membutuhkan oksigen bebas (anaerobik) kondisi untuk
bertahan hidup. Mereka menghasilkan gas metana sebagai produk
sampingan dari metabolisme. Anda akan menemukan organisme ini dalam
lingkungan seperti rawa-rawa, lahan basah, keberanian binatang
(sapi, rusa, manusia), dan dalam limbah. Contoh Euryarchaeota
meliputi:-
Halobacterium - termasuk beberapa spesies organisme halofilik
yang ditemukan di danau berkadar garam dan lingkungan laut berkadar
garam tinggi. Methanococcus - Methanococcus jannaschii adalah
organisme Archaea hasil sequencing genetik pertama. Metanogen ini
tinggal di dekat ventilasi hidrotermal.
-
3. Korarchaeota Organisme Korarchaeota dianggap bentuk kehidupan
yang sangat primitif (kelompok Archaea tertua) dibanding kelompok
Archaea yang lain. Anggota kelompok ini ditemukan di lingkungan
sumber mata air panas di dasar samudra dan daratan. Sampai saat ini
belum ada strain yang dapat diisolasi dalam kultur murni, sehingga
sedikit yang diketahui dari sifat-sifat fenotiknya.
Gambar 4. Nanoarchaeota Pada tahun 2005 dikenal sebagai
organisme terkecil.(400 nm). Organisme Nanoarchaeota merupakan
organisme anaerobic, ekstrim termofilik, dan sifatnya mampu
bersimbiosis dengan Archaea lain. Merupakan Archaea yang anggotanya
hanya memiliki satu genus yaitu Nanoarchaeum. Organisme ini
Merupakan parasit yang hidup melekat pada sel Ignicoccus (Solomon
et al., 2008). .
I.
PENUTUP
Archaeota merupakan
DAFTAR PUSTAKA
Brooker, R.J., E.P. Widmaier, L.E. Graham, & P.D. Stiling.
2011. Biology 2nd Edition. McGraw-Hill. New York. p: 547.
Delong.,E.F.2003.Ocean of archaea: abundant oceanic crenarchaeota
appear to derive from 510. Dworkin, M., S. Falkow, E. Rosenber, K.
Schleifer, & E. Stackebrandt. 2006. The Prokaryotes. Springer.
New York. pages: 14, 29, 61, 71, 84, 106, 116, 182, & 242.
thermophilic ancestors that invaded low-temperature marine
environments.ASM (American Society for Microbiology News.P Vol 59
(10) : 503-
Forterre,P.,C.Brochier,and H.Philippe.2002.Evolution the
archaea.Theoretical population biology. Vol 61.Elsevisier
Science.USA.pp.409-422. Huber,H.2011. Investigations on the novel
purely archaeal biocoenosis Ignicoccus hospitalis and Nanoarchaeum
equitans.
http://www.biologie.uniregensburg.de/Mikrobio/Thomm/Arbeitsgruppen/huber_en.htm
(Diakses tanggal 17 Desember 2011). Karner, M. B., E. F. DeLong.
2001. Archaeal dominance in the mesopelagic zone of the Pacific
Ocean. Nature 409 (6819): 507510. Setiawan, A. 2011. Tiga Domain
Kehidupan. http://id.shvoong.com/exact(Diakses
sciences/biology/2231520-tiga-domain-kehidupan/#ixzz1gZiQNn00
tanggal 14 Desember 2011).
Solomon, E.P., L.R. Berg, & D.W. Martin. 2008. Biology 8th
Edition. Thomson Brooks/Cole. Belmont. pp: 519-521. Stewart,R.
2010. Microbial Food Webs.
http://oceanworld.tamu.edu/resources/environment-book/microbialwebE.html
(Diakses tanggal 15 Desember 2011). Trivedi, P.C., S. Pandey, &
S. Bhadauria. 2010. Text Book of Microbiology. Aavishkar Publisher.
Jaipur. pp: 252-253. Zillig. 1989. In Bergeys Manual of Systematic
Bacteriology, Vol. 3,
J.T. Staley et al. eds., Williams & Wilkins pub., p.
2241.
