Embed Size (px)
Citation preview
Bakteriyemi Hızlı Tanısı
İccedilin Youmlntemler
Prof Dr Fuumlsun Can
Koccedil Uumlniversitesi Tıp Fakuumlltesi
Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
1
Surviving Sepsis Campaign (SSC) 2002
7 oumlnemli Nokta
1Sepsis farkındalığının artırılması
2Tanı youmlntemlerinde iyileştirme
3Uygun tedavi ve bakım uygulamaları
4Yoğun bakım sonrası hasta bakımının iyileştirilmesi
5Sağlık personelinin eğitimi
6Bakım ile ilgili kılavuzların geliştirilmesi
7Performans iyileştirme program uygulaması
Sepsis
2
İhtiyaccedillarampBeklentiler
bull Klinik yanıtın iyileştirilmesi
bull Etkin tedavi iccedilin zamanlama
bull İlaccedil ile ilişkili yan etkilerin azaltılması
bull Beklenmeyen etkilerin azaltılması
bull Antibiyotiklerin uygun kullanımı
bull Doğru ilaccedil doz ve zamanlama
bull De-escalation
bull Antibiyotik direncinin azaltılması
3
2012 SSC Guidelines
Dellinger RP Critical Care Medicine 41(2)580-637 February 2013
4
6
Levy Mitchell ve ark Critical Care Medicine 43(1)3-12 January 2015
Figure 2 Resuscitation compliance by duration of years of Surviving Sepsis Campaign (SSC) participation (A 2 to B 3-4 years C) and hospital mortality (panel D) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
Figure 1 Resuscitation (A) and management (B) Surviving Sepsis Campaign (SSC) bundle compliance and hospital mortality (C) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
SSC Bundle Uygulamaları NeKadar Başarılı
5
Problemler
bull Semptomlar etkene oumlzguumln değil
bull Patogenez ile ilgili bilinmeyenler var
bull Duyarlılık profili tahmin edilemiyor
bull Etkene youmlnelik tedavi başlanması 2-7 guumln
bull Geniş spektrumlu antibiyotikler kullanılıyor
bull Direnccedil problemi artıyor
6
Birinci Basamakta İhtiyaccedillar
bull Baktreyemi riskini goumlsteren parametre yok
bull Hangi hastanın kliniğe sevk edilmesi gerektiğini goumlsteren parametre yok
bull Hızlı ucuz duyarlılığı yuumlksek hasta başı biyobelirteccedil testi yok
7
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
AMS UP
AMS-Antimicrobial stewardship
UP-Usually practice
pe
rce
nt
Fishman N Am J Med 2006
Antimikrobiyal Youmlnetim Uygulamalarında Etkene
Youmlnelik Tedavi
8
2
Kumar ve ark Critical Care Medicine2006
bull Etkin antimikrobiyal tedaviye başlama zamanı - Uygun ampirik tedavi
- Hızlı etkene youmlnelik tedavi
- Dakikalar oumlnemli
bull Antimikrobiyal direnccedil artıkccedila oumlnemi artıyor
Mikrobiyoloji laboratuvarı oumlnemli destek
Antimikrobiyal Youmlnetimde Oumlnemli Strateji
9
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Surviving Sepsis Campaign (SSC) 2002
7 oumlnemli Nokta
1Sepsis farkındalığının artırılması
2Tanı youmlntemlerinde iyileştirme
3Uygun tedavi ve bakım uygulamaları
4Yoğun bakım sonrası hasta bakımının iyileştirilmesi
5Sağlık personelinin eğitimi
6Bakım ile ilgili kılavuzların geliştirilmesi
7Performans iyileştirme program uygulaması
Sepsis
2
İhtiyaccedillarampBeklentiler
bull Klinik yanıtın iyileştirilmesi
bull Etkin tedavi iccedilin zamanlama
bull İlaccedil ile ilişkili yan etkilerin azaltılması
bull Beklenmeyen etkilerin azaltılması
bull Antibiyotiklerin uygun kullanımı
bull Doğru ilaccedil doz ve zamanlama
bull De-escalation
bull Antibiyotik direncinin azaltılması
3
2012 SSC Guidelines
Dellinger RP Critical Care Medicine 41(2)580-637 February 2013
4
6
Levy Mitchell ve ark Critical Care Medicine 43(1)3-12 January 2015
Figure 2 Resuscitation compliance by duration of years of Surviving Sepsis Campaign (SSC) participation (A 2 to B 3-4 years C) and hospital mortality (panel D) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
Figure 1 Resuscitation (A) and management (B) Surviving Sepsis Campaign (SSC) bundle compliance and hospital mortality (C) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
SSC Bundle Uygulamaları NeKadar Başarılı
5
Problemler
bull Semptomlar etkene oumlzguumln değil
bull Patogenez ile ilgili bilinmeyenler var
bull Duyarlılık profili tahmin edilemiyor
bull Etkene youmlnelik tedavi başlanması 2-7 guumln
bull Geniş spektrumlu antibiyotikler kullanılıyor
bull Direnccedil problemi artıyor
6
Birinci Basamakta İhtiyaccedillar
bull Baktreyemi riskini goumlsteren parametre yok
bull Hangi hastanın kliniğe sevk edilmesi gerektiğini goumlsteren parametre yok
bull Hızlı ucuz duyarlılığı yuumlksek hasta başı biyobelirteccedil testi yok
7
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
AMS UP
AMS-Antimicrobial stewardship
UP-Usually practice
pe
rce
nt
Fishman N Am J Med 2006
Antimikrobiyal Youmlnetim Uygulamalarında Etkene
Youmlnelik Tedavi
8
2
Kumar ve ark Critical Care Medicine2006
bull Etkin antimikrobiyal tedaviye başlama zamanı - Uygun ampirik tedavi
- Hızlı etkene youmlnelik tedavi
- Dakikalar oumlnemli
bull Antimikrobiyal direnccedil artıkccedila oumlnemi artıyor
Mikrobiyoloji laboratuvarı oumlnemli destek
Antimikrobiyal Youmlnetimde Oumlnemli Strateji
9
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
İhtiyaccedillarampBeklentiler
bull Klinik yanıtın iyileştirilmesi
bull Etkin tedavi iccedilin zamanlama
bull İlaccedil ile ilişkili yan etkilerin azaltılması
bull Beklenmeyen etkilerin azaltılması
bull Antibiyotiklerin uygun kullanımı
bull Doğru ilaccedil doz ve zamanlama
bull De-escalation
bull Antibiyotik direncinin azaltılması
3
2012 SSC Guidelines
Dellinger RP Critical Care Medicine 41(2)580-637 February 2013
4
6
Levy Mitchell ve ark Critical Care Medicine 43(1)3-12 January 2015
Figure 2 Resuscitation compliance by duration of years of Surviving Sepsis Campaign (SSC) participation (A 2 to B 3-4 years C) and hospital mortality (panel D) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
Figure 1 Resuscitation (A) and management (B) Surviving Sepsis Campaign (SSC) bundle compliance and hospital mortality (C) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
SSC Bundle Uygulamaları NeKadar Başarılı
5
Problemler
bull Semptomlar etkene oumlzguumln değil
bull Patogenez ile ilgili bilinmeyenler var
bull Duyarlılık profili tahmin edilemiyor
bull Etkene youmlnelik tedavi başlanması 2-7 guumln
bull Geniş spektrumlu antibiyotikler kullanılıyor
bull Direnccedil problemi artıyor
6
Birinci Basamakta İhtiyaccedillar
bull Baktreyemi riskini goumlsteren parametre yok
bull Hangi hastanın kliniğe sevk edilmesi gerektiğini goumlsteren parametre yok
bull Hızlı ucuz duyarlılığı yuumlksek hasta başı biyobelirteccedil testi yok
7
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
AMS UP
AMS-Antimicrobial stewardship
UP-Usually practice
pe
rce
nt
Fishman N Am J Med 2006
Antimikrobiyal Youmlnetim Uygulamalarında Etkene
Youmlnelik Tedavi
8
2
Kumar ve ark Critical Care Medicine2006
bull Etkin antimikrobiyal tedaviye başlama zamanı - Uygun ampirik tedavi
- Hızlı etkene youmlnelik tedavi
- Dakikalar oumlnemli
bull Antimikrobiyal direnccedil artıkccedila oumlnemi artıyor
Mikrobiyoloji laboratuvarı oumlnemli destek
Antimikrobiyal Youmlnetimde Oumlnemli Strateji
9
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
2012 SSC Guidelines
Dellinger RP Critical Care Medicine 41(2)580-637 February 2013
4
6
Levy Mitchell ve ark Critical Care Medicine 43(1)3-12 January 2015
Figure 2 Resuscitation compliance by duration of years of Surviving Sepsis Campaign (SSC) participation (A 2 to B 3-4 years C) and hospital mortality (panel D) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
Figure 1 Resuscitation (A) and management (B) Surviving Sepsis Campaign (SSC) bundle compliance and hospital mortality (C) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
SSC Bundle Uygulamaları NeKadar Başarılı
5
Problemler
bull Semptomlar etkene oumlzguumln değil
bull Patogenez ile ilgili bilinmeyenler var
bull Duyarlılık profili tahmin edilemiyor
bull Etkene youmlnelik tedavi başlanması 2-7 guumln
bull Geniş spektrumlu antibiyotikler kullanılıyor
bull Direnccedil problemi artıyor
6
Birinci Basamakta İhtiyaccedillar
bull Baktreyemi riskini goumlsteren parametre yok
bull Hangi hastanın kliniğe sevk edilmesi gerektiğini goumlsteren parametre yok
bull Hızlı ucuz duyarlılığı yuumlksek hasta başı biyobelirteccedil testi yok
7
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
AMS UP
AMS-Antimicrobial stewardship
UP-Usually practice
pe
rce
nt
Fishman N Am J Med 2006
Antimikrobiyal Youmlnetim Uygulamalarında Etkene
Youmlnelik Tedavi
8
2
Kumar ve ark Critical Care Medicine2006
bull Etkin antimikrobiyal tedaviye başlama zamanı - Uygun ampirik tedavi
- Hızlı etkene youmlnelik tedavi
- Dakikalar oumlnemli
bull Antimikrobiyal direnccedil artıkccedila oumlnemi artıyor
Mikrobiyoloji laboratuvarı oumlnemli destek
Antimikrobiyal Youmlnetimde Oumlnemli Strateji
9
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
6
Levy Mitchell ve ark Critical Care Medicine 43(1)3-12 January 2015
Figure 2 Resuscitation compliance by duration of years of Surviving Sepsis Campaign (SSC) participation (A 2 to B 3-4 years C) and hospital mortality (panel D) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
Figure 1 Resuscitation (A) and management (B) Surviving Sepsis Campaign (SSC) bundle compliance and hospital mortality (C) All panels are based on an unadjusted generalized estimating equation population-averaged logistic regression model where circles represent observed values lines are based on the regression and shaded areas are the 95 CIs
SSC Bundle Uygulamaları NeKadar Başarılı
5
Problemler
bull Semptomlar etkene oumlzguumln değil
bull Patogenez ile ilgili bilinmeyenler var
bull Duyarlılık profili tahmin edilemiyor
bull Etkene youmlnelik tedavi başlanması 2-7 guumln
bull Geniş spektrumlu antibiyotikler kullanılıyor
bull Direnccedil problemi artıyor
6
Birinci Basamakta İhtiyaccedillar
bull Baktreyemi riskini goumlsteren parametre yok
bull Hangi hastanın kliniğe sevk edilmesi gerektiğini goumlsteren parametre yok
bull Hızlı ucuz duyarlılığı yuumlksek hasta başı biyobelirteccedil testi yok
7
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
AMS UP
AMS-Antimicrobial stewardship
UP-Usually practice
pe
rce
nt
Fishman N Am J Med 2006
Antimikrobiyal Youmlnetim Uygulamalarında Etkene
Youmlnelik Tedavi
8
2
Kumar ve ark Critical Care Medicine2006
bull Etkin antimikrobiyal tedaviye başlama zamanı - Uygun ampirik tedavi
- Hızlı etkene youmlnelik tedavi
- Dakikalar oumlnemli
bull Antimikrobiyal direnccedil artıkccedila oumlnemi artıyor
Mikrobiyoloji laboratuvarı oumlnemli destek
Antimikrobiyal Youmlnetimde Oumlnemli Strateji
9
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Problemler
bull Semptomlar etkene oumlzguumln değil
bull Patogenez ile ilgili bilinmeyenler var
bull Duyarlılık profili tahmin edilemiyor
bull Etkene youmlnelik tedavi başlanması 2-7 guumln
bull Geniş spektrumlu antibiyotikler kullanılıyor
bull Direnccedil problemi artıyor
6
Birinci Basamakta İhtiyaccedillar
bull Baktreyemi riskini goumlsteren parametre yok
bull Hangi hastanın kliniğe sevk edilmesi gerektiğini goumlsteren parametre yok
bull Hızlı ucuz duyarlılığı yuumlksek hasta başı biyobelirteccedil testi yok
7
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
AMS UP
AMS-Antimicrobial stewardship
UP-Usually practice
pe
rce
nt
Fishman N Am J Med 2006
Antimikrobiyal Youmlnetim Uygulamalarında Etkene
Youmlnelik Tedavi
8
2
Kumar ve ark Critical Care Medicine2006
bull Etkin antimikrobiyal tedaviye başlama zamanı - Uygun ampirik tedavi
- Hızlı etkene youmlnelik tedavi
- Dakikalar oumlnemli
bull Antimikrobiyal direnccedil artıkccedila oumlnemi artıyor
Mikrobiyoloji laboratuvarı oumlnemli destek
Antimikrobiyal Youmlnetimde Oumlnemli Strateji
9
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Birinci Basamakta İhtiyaccedillar
bull Baktreyemi riskini goumlsteren parametre yok
bull Hangi hastanın kliniğe sevk edilmesi gerektiğini goumlsteren parametre yok
bull Hızlı ucuz duyarlılığı yuumlksek hasta başı biyobelirteccedil testi yok
7
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
AMS UP
AMS-Antimicrobial stewardship
UP-Usually practice
pe
rce
nt
Fishman N Am J Med 2006
Antimikrobiyal Youmlnetim Uygulamalarında Etkene
Youmlnelik Tedavi
8
2
Kumar ve ark Critical Care Medicine2006
bull Etkin antimikrobiyal tedaviye başlama zamanı - Uygun ampirik tedavi
- Hızlı etkene youmlnelik tedavi
- Dakikalar oumlnemli
bull Antimikrobiyal direnccedil artıkccedila oumlnemi artıyor
Mikrobiyoloji laboratuvarı oumlnemli destek
Antimikrobiyal Youmlnetimde Oumlnemli Strateji
9
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
AMS UP
AMS-Antimicrobial stewardship
UP-Usually practice
pe
rce
nt
Fishman N Am J Med 2006
Antimikrobiyal Youmlnetim Uygulamalarında Etkene
Youmlnelik Tedavi
8
2
Kumar ve ark Critical Care Medicine2006
bull Etkin antimikrobiyal tedaviye başlama zamanı - Uygun ampirik tedavi
- Hızlı etkene youmlnelik tedavi
- Dakikalar oumlnemli
bull Antimikrobiyal direnccedil artıkccedila oumlnemi artıyor
Mikrobiyoloji laboratuvarı oumlnemli destek
Antimikrobiyal Youmlnetimde Oumlnemli Strateji
9
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
2
Kumar ve ark Critical Care Medicine2006
bull Etkin antimikrobiyal tedaviye başlama zamanı - Uygun ampirik tedavi
- Hızlı etkene youmlnelik tedavi
- Dakikalar oumlnemli
bull Antimikrobiyal direnccedil artıkccedila oumlnemi artıyor
Mikrobiyoloji laboratuvarı oumlnemli destek
Antimikrobiyal Youmlnetimde Oumlnemli Strateji
9
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Laboratuvarı kliniğe zamanında ulaştırmak oumlnemli
10
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Bakteriyemi Tanısında Biyobelirteccediller
11
Biyobelirteccedil
Loumlkosit sayısı
Eosinofil sayısı
Fibrinojen
Eritrosit sedimentasyon hızı
C-reaktif protein (CRP)
Prokalsitonin (PCT)
Interleukin-6
sTREM-1
Soluble urokinase-type plasminogen
activator receptor (suPAR)
Proadrenomedullin (pro-ADM)
Presepsin
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Biyobelirteccediller ve klinik uygulamaları
bull Hastada enfeksiyon var mı
bull Klinik tablo ne kadar ciddi
bull Hasta tedaviye yanıt veriyor mu
12
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
A multicenter study showed that IL-6 can predict survival on the 28th day after sepsis onset[The value of IL-6 to distinguish between SIRS and sepsis is controversially discussed since high levels can also be detected after trauma surgery or in patients with autoimmune diseases]
Biyobelirteccedil IL-6
13
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
2-4 saat
12-24 saat
CALC-1 ekspesyonu
14
Sepsis Tanısında Prokalsitonin
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Sepsisli Hastada Prognozun Değerlendirilmesinde Procalcitonin
15
Comparison of procalcitonin
between survivors and non
survivors on day-1 Data are
presented as box plots with
median lines 25- and 75-
percentile boxes and 10- and 90-
percentile error bars The stars
represent the outliers
Saransh Jain BMC Research Notes 20147458
Avrupa ve Asya
340 hasta
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Prokalsitonin Destekli Tedavi Antibiyotik Kullanım Suumlresini ve Mortaliteyi Azaltır
16
Andreas Hohn BMC Infectious Diseases201313158
Evelien de Jong Lancet Infect Dis 2016 819ndash827
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Hızlı Tanı Testleri
1 Fenotipik Testler
Kromojenik Agar
17
2 Genomik Testler
Patojen spesifik PCR
PNA-FISH
Panel Based PCR
Panel Based Mikroarray
Kandan direkt tanı testleri
3 Proteomik Testler MALDI-TOF
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Day 1 Day 2 Day 4
Targeted Rx
Gram Stain
Positive
Blood Culture
Species ID
Empiric Rx Targeted Rx
Empiric Rx Broad Spectrum Rx
Conventional Species ID
Blood
Culture
Blood
Culture
Tre
atm
en
t b
y R
DTs
Tre
atm
en
t b
y C
on
ve
nti
on
al D
x
Gram Stain
Positive
Blood
Culture
Day 3
bull Hızlı ve doğru yanıt
bull Etkene youmlnelik tedavi 48 saat oumlnce
Sepsiste hızlı tanı testleri ne kadar yararlı
18
Can F Antimicrobial Stewardship Elsevier 2017
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Nicole C Nicolsen et al J Clin Microbiol 2013514126-4129
CHROMagar
Sepsis Tanısında Fenotipik Testler
19
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
bull Matrix laser desorption ionization time-
of-flight mass spectrometry
bull Bakteri ve bazı mantarların
tiplendirilmesi hızlı ve guumlvenilir
bull Pozitif kan kuumlltuumlrlerinden direkt
ccedilalışılabilir olması avantaj
MALDI-TOF
20
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Lockwood AM Infect Control Hosp Epidemiol 2016 Apr37(4)425-32
Maldi-TOF ile tanı etken antibiyotik
başlama suumlresini kısaltıyor
21
151 hasta
242 hasta
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Outcome Pre-intervention
cohort (n = 157)
Intervention
cohort (n = 112)
Pvalue
30-Day all-cause
mortality
33 (21) 10 (89) 001
60-Day all-cause
mortality
48 (306) 14 (125) 0001
Inpatient mortality 29 (185) 9 (8) 002
Maldi-TOF ve AMY mortaliteyi azaltıyor
22
Katherine K Perez Journal of Infection 2014 216ndash225
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal Youmlnetim ile Klinik
Yanıtta İyileşme
23
Konvansiyonel Maldi_TOF
Klinik Yanıt 807 905
Yanıt Suumlre 4 guumln 2 guumln
Joseph J Carreno ve ark Infect Control Hosp Epidemiol2016
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Maldi-TOF ve Antimikrobiyal youmlnetim uygulamalarının Etkinliği
Outcome
Total
Preintervention (n = 256) Intervention (n = 245) PValue
Clinical outcomes
30-day all-cause mortality 52 (203) 31 (127) 021
Time to microbiological
clearance d 33 plusmn 48 33 plusmn 57 928
Length of hospitalization 142 plusmn 206 114 plusmn 129 066
Length of ICU stay 149 plusmn 242 83 plusmn 90 014
Recurrence of same BSI 15 (59) 5 (20) 038
30-day readmission with
same BSI 9 (35) 4 (16) 262
Treatment-related outcomes
Time to effective therapy 301 plusmn 677 204 plusmn 207 021
Time to optimal therapy h 903 plusmn 754 473 plusmn 1215 lt001
Clinical and Treatment-Related Outcomes
Angela M Huang Clin Infect Dis (2013) 57 (9) 1237-
1245
24
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Antimikrobiyal youmlnetimde MALDI-TOF Gerekli mi
bull Her enfeksiyon iccedilin 2439 $
bull Yıllık 234 million $
Pre- intervention
(n=247)
Intervention
(n=233)
Relative Risk
Reduction P-value
30 Day Mortality 52 (21) 28 (12) 43 plt001
Hospital LOS
(days) 142 plusmn 167 130 plusmn 165 p=044
Clinical Outcomes of Pre-intervention Compared to Intervention Groups
480 kan kuumlltuumlruuml alınan hasta (oumlnce 247amp sonra 233)
Patel TS ve ark JCM2016
TeKippe E JCM 2017
25
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Tanı suumlresinin kısaltılmasında oumlnemli adım
Sorun
bull Duyarlılık duumlşuumlk
bull (Charcoal ve besiyerindeki diğer maddlelerin
inhibe edici etkisi)
bull Polimikrobiyal kuumlltuumlrler
Philippe R S Lagaceacute-Wie J Clin Microbiol 2013
26
Maldi-TOF ile Kan kuumlltuumlruumlnden patojenin direkt
tanımlanması
343 saat
265 saat
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Antibiyotik Duyarlılık Testlerinde Maldi-TOF
27
Konvansiyonel ADT
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Hangi Direnccedil Mekanizmaları
bull Enterobactericeae beta-laktam antibiyotik
bull Acinetobacter baumannii karbapenem
bull Klebsiella OmpK36 kaybı
bull Bacterioides fragills
bull MSRA VISA
bull VRE
28
SorunPikler farklı nedenlerle oluşabilir Mirande C Eur J Clişn Mic 2015
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Maldi-TOF Epidemiyolojik Suş Tiplendirme
Berrazeg M PLoS One 2013
29
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
MALDI-TOF Protein DATABASE
30
Uluslararası ve lokal veritabanları oluşturulması ilaccedil dizaynı tanı ve
epidemiyolojik ccedilalışmaları iccedilin oumlnemli
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
MALDI-TOF ile tanışma şansı bulduğum bakteriler
bull Kocuria rhizophila
bull Arthrobacter cumminsii
bull Veillonella atypica
bull Porphyromonas somerae
bull Corynebacterium confusium
bull Hellcococus kunzii
bull Weeksella virosa
31
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Liesenfeld O Eur J Microbiol Immunol 201441ndash25
Bakteriyemi Hızlı Tanısında Molekuumller Testler
32
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Assay Technology Volume Input
(mL)
Number of
Pathogens
Detected
(Library)
Limit of Detection
(CFU)
Turnaround Time
(h)
SeptiFast Real-time PCR 15 19 bac6 f 3ndash30 6
Iridica
PCR
+ electrospray
ionization MS
5 gt750 bac gt200 f
gt130 v 6
SepsiTest 16S rDNA PCR +
sequencing 1ndash5 gt300 2ndash460 8
Looxster Vyoo
PCR
+
electrophoresis
microarray
5 34 b 7f 5ndash100 7
Magicplex Nested real-time
PCR 1 90 6
T2Candida
T2Bacteria PCR + NMR 2 5f 1ndash3 3
PolarisIdylla Real-time PCR 5ndash10 10 b 6f 5ndash10 2
PCR polymerase chain reaction MS mass spectrometry bac bacteria f fungi v virus CFU colony-forming
units
Sepsisli Hastalarda Kandan Direkt Patojeni Goumlsteren
Platformlar
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Multiplex PCR
bull Bakteri kandida ve viruumlsler
bull CTX-M VIM IMP OXA KPC NDM
VanA and mecA direnccedil genleri
bull Etken spesifik tedavi suumlresini azalır
( 24 saat )
bull De-escelation suumlresi 21 saat amp 34 saat
bull Hastanede kalış suumlresi 217 guumln
34
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ
Hybridization
Saureus KNS Negatif
Enterokok Saureus Candida bakteriyemi tanısı 38 guumln erken
Maliyet 415 USD azalmış
Holtzman C et al JCM 2011 AMY ile birlikte yapılmazsa etkisiz
35
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Genotipik testler muumlkemmel mi
bull Genotiplendirme testlerinde-genlerin varlığıyokluğu araştırılır duyarlılık değil
bull Genlerin pozitif veya negatif olması her zaman direnccedil veya duyarlılığı goumlstermez
36
bull Genotipik testler direnccedil ile ililşkili bazı genleri goumlstermez bakterinin duyarlılk profilini yansıtmaz
bull ldquoDuyarlırdquo ne kadar duyarlı
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Philippe Morency-Potvin ve ark Clin Microbiol Rev 201730381-407
Kan kuumlltuumlrlerinin Laboratuvardan Kliniğe Ulaştırılmasının
Organizasyonu Başarı İccedilin Oumlnemlidir
37
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Başarının anahtarı İletişim
bull En iyi teknolojiye sahip tanı testleri tek başına AMY uygulamasında yararlı değil
bull Test sonuccedillarının en uygun şekilde ve zamanında iletilmesi gereklidir
bull Tek başına mikrobiyolog veya klinisyenin ccedilabaları yetersiz
bull İletişim ağı kurulması AMY başarısını artıracaktır
Pogue JM ve ark CMI2015302-312
38
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
Beklentilerhellip
bullPatogenezin goumlsterilmesi
bullDuyarlılığı yuumlksek ve ucuz biyobelirteccedillerin kullanılması
bullHızlı tanı testlerinin duyarlılığı ve maaliyetlerinde iyileştirmeler
bullUlusal ve uluslararası veritabanlarının kurulması
39
