60
GENETICA CUANTITATIVA Biól. Ramsés Salas Asencios

GENETICA CUANTITATIVA

Embed Size (px)

Citation preview

Page 2: GENETICA CUANTITATIVA

Herencia cuantitativa

•¿Qué es la variación fenotípica cuantitativa? •Naturaleza de la variación continua •Poligenes y loci de caracteres cuantitativos •Métodos estadísticos para la descripción de la variación continua •Heredabilidad y familiaridad •Componentes genético y ambiental de la varianza fenotípica de una carácter cuantitativo •Heredabilidad en sentido amplio y restringido •Métodos para el recuento y cartografía de loci que actúan sobre caracteres cuantitativos •Herencia cuantitativa en el hombre: la frontera de la genética en el siglo XXI

Puntos principales a tratar:

Page 3: GENETICA CUANTITATIVA

Variación fenotípica

cuantitativa

Page 4: GENETICA CUANTITATIVA
Page 5: GENETICA CUANTITATIVA

CUALITATIVOS

• Caracteres de clase.

• Variación discontínua: clases fenotípicas discretas.

• Efectos discernibles de un solo gen.

• Apareamientos individuales y su progenie.

• Se analiza por conteos y proporciones.

CUANTITATIVOS

• Caracteres de grado.

• Variación contínua:

mediciones fenotípicas de

un espectro.

• Control poligénico: efectos

de un solo gen demasiado

sutiles para detectarse.

• Población de organismos

con todos los tipos posibles

de apareamientos.

• Análisis estadísticos dan

estimaciones de

parámetros poblacionales.

Page 6: GENETICA CUANTITATIVA

¿Qué es la variación fenotípica cuantitativa?

•Cualquier carácter fenotípico (morfológico, fisiológico, conductual) que toma distintos valores cuantificables en diferentes individuos y no sigue una patrón de herencia mendeliana simple es un carácter cuantitativo

•variación continua (altura, peso, temperamento, C.I., tasa metabólica, producción lechera,...) •variación discreta (número de facetas en Drosophila, vértebras en serpientes, bandas en caracoles, plumas en aves, escamas en peces...)

•Para describir su variación se utilizan métodos estadísticos tales como la media y la varianza •Son caracteres de gran importancia

•Agrícola y ganadera •Médica y social

•El estudio de la herencia de estos caracteres son el objeto de la Genética Cuantitativa

Page 7: GENETICA CUANTITATIVA

Variación cuantitativa vs mendeliana (o cualitativa)

Caracteres cualitativos mendelianos Distribución de la altura de varones adultos de Boston

Page 8: GENETICA CUANTITATIVA

Variación cuantitativa: continua o discreta

Caracteres cuantitativos discreto Carácter cuantitativo continuo

Page 9: GENETICA CUANTITATIVA

Planta guisante Maíz

P

F1

F2

Altura planta

Altura planta

Altura planta Altas 3/4

Enanas 1/4

Enanas X altas

F1 X F1 = Altas X altas

Longitud de la mazorca

Gama completa

Cortas X largas

F1 X F1

Longitud de la mazorca

Longitud de la mazorca

Variación mendeliana vs cuantitativa

Fre

cuen

cia

Fre

cuenc

ia

Fre

cuenc

ia

Page 10: GENETICA CUANTITATIVA
Page 11: GENETICA CUANTITATIVA
Page 12: GENETICA CUANTITATIVA
Page 13: GENETICA CUANTITATIVA
Page 14: GENETICA CUANTITATIVA

Preguntas qué trata de responder la genética cuantitativa

•¿Qué parte de la variación fenotípica de un carácter cuantitativo se debe a diferencias genética entre los individuos y qué parte a diferencias en el ambiente? •¿Qué parte de la variación fenotípica puede ser seleccionada por un mejorador o por la selección natural? •¿Cuántos genes o loci influyen sobre el carácter? •¿Cómo se distribuyen los loci por el genoma? •¿Qué efecto tienen los loci y como interactúan entre sí?

Page 15: GENETICA CUANTITATIVA

Variación ambiental

Altura planta

aa Plantas enanas AA Plantas altas

Altura planta

aa AA aa AA aa AA

Altura planta

Sin variación ambiental

Alguna variación ambiental

Mucha variación ambiental

Fre

cuenc

ia

Page 16: GENETICA CUANTITATIVA

ADITIVIDAD

• Tres genes para un carácter.

• Aporte de cada alelo dominante: 10 cm.

• Aporte de cada alelo recesivo: 5 cm.

• AABBCC: 60 cm.

• aabbcc: 30 cm.

• Heterocigotos: AaBbCc, AABbcc, aabBCC,

etc.: 45 cm.

Page 17: GENETICA CUANTITATIVA

• Proporción Genotipo Fenotipo

• 1/64 AABBCC 60 cm.

• 6/64 AABBCc, 55 cm. » AaBBCC, etc…

• 15/64 AABBcc, 50 cm. » AaBbCC, etc…

• 20/64 AABbcc, 45 cm. » AaBbCb, etc…

• 15/64 AAbbcc, 40 cm. » aaBBcc, etc…

• 6/64 Aabbcc, 35 cm. » aaBbcc, etc…

• 1/64 aabbcc 30 cm.

Page 18: GENETICA CUANTITATIVA

• (Rojo) (Blanco)

• P: R1R1R2R2 x r1r1r2r2

• F1: R1r1R2r2 (rojo claro)

• F2: r1r1r2r2 (blanco)

R1r1r2r2, r1r1R2r2 (rosado)

R1R1r2r22, R1r1R2r2, r1r1R2R2 (rojo claro)

R1R1R2r2, r1R1R2R2 (rojo medio)

R1R1R2R2 (rojo)

Page 19: GENETICA CUANTITATIVA

0

5

10

15

20

1

PROGENITORES

A1

A2

A3

A4

A5

0

5

10

15

20

1

F1

A1

A2

A3

A4

A5

0

5

10

15

20

1

F2

A1

A2

A3

A4

A5

Page 20: GENETICA CUANTITATIVA

Proporciones de homocigotes según

el número de loci génicos

• 1 2 3 4 n

• 1/4 1/16 1/64 1/256 1/4n

Page 21: GENETICA CUANTITATIVA

• Las frecuencias menores y mayores (1/4n)

pertenecen a los homocigotes en la distribución

normal, por tanto, el número de genes será “n”.

• Se asume que los valores del fenotipo aumentan a

medida que aumentan los alelos dominantes.

• Aporte de cada alelo dominante: A = D/n , donde D:

diferencia entre la media de la poblaciòn menos el

valor mínimo y n= número de genes.

Cálculo del número probable de genes

(con datos solo de una generación):

Page 22: GENETICA CUANTITATIVA

VARIANZA (s2)

• s2 fenotípica = s2 genotípica + s2 ambiental

+ s2 interacción g-a

• s2 fenotípica = s2 genotípica + s2 ambiental

+2 covarianza g-a

Page 23: GENETICA CUANTITATIVA

Varianzas en el Peso de seres

humanos al nacimiento

• Genotipo descendencia

• Sexo

• Genotipo materno

• Ambiente materno

• Orden cronológico de nacimiento

• Edad materna

• Inexplicable (error)

• Total

• 16

• 2

• 20

• 24

• 7

• 1

• 30

• 100

Page 24: GENETICA CUANTITATIVA

P:

F1:

F2:

Page 25: GENETICA CUANTITATIVA

Cálculo del número de genes (con

datos de cruces por dos generaciones)

• La varianza ambiental debe ser la misma en

la F1 y en la F2.

• La forma de la curva de la F2 se debe a

varianzas genotípicas.

• Por tanto: varGF2 = varFF2 – varFF1

• Sea A: aporte de cada alelo dominante

Page 26: GENETICA CUANTITATIVA

• VarGF2 = (A2n)/2 , pero A = D/2n

• varGF2 = varFF2 – varFF1 = A2n/2 = D2/8n

• Por tanto: n = D2/[8(varFF2 – varFF1)]

Page 27: GENETICA CUANTITATIVA

Fórmulas Estadísticas

Page 28: GENETICA CUANTITATIVA

CORRELACION

• El coeficiente de correlación varía desde –1 hasta +1, lo que significa una relación lineal negativa o positiva, respectivamente. Si r es igual a O, no hay una relación lineal entre las dos variables.

• La correlación se explica cuando hay una proporción lineal en cuanto a la variación de un dato con respecto a otro. Pero puede haber una relación no lineal también entre los datos.

Page 29: GENETICA CUANTITATIVA

rXY >0 rXY <0 rXY = 0

• Correlación no lineal

Page 30: GENETICA CUANTITATIVA

REGRESION

• Medir la correlación proporciona sólo la

precisión de la relación entre dos variables.

La regresión permite predecir el valor de

una variable a partir del valor de la otra.

• Si hay correlación lineal, la relación de dos

variables será determinada por la ecuación

de la recta: Y = a + b X

Page 31: GENETICA CUANTITATIVA

• Si se analiza la correlación de un parámetro

en un par de individuos, se pueden obtener

datos útiles en genética cuantitativa.

• Ejm: correlación entre la altura del

progenitor (x) y la altura de su hijo (y), o

del promedio de la altura de los parentales

(valor parental medio) con la del

descendiente.

Page 32: GENETICA CUANTITATIVA

HEREDABILIDAD

• H = varianza genotípica/varianza fenotípica.

Page 33: GENETICA CUANTITATIVA

HEREDABILIDAD

Alta heredabilidad: > 0.5

Heredabilidad Media: 0.2 – 0.5

Baja heredabilidad: < 0.2

Page 34: GENETICA CUANTITATIVA
Page 35: GENETICA CUANTITATIVA
Page 36: GENETICA CUANTITATIVA
Page 37: GENETICA CUANTITATIVA
Page 38: GENETICA CUANTITATIVA

RELACION DE

PARENTESCO Y

COEFICIENTE DE

ENDOGAMIA

Page 39: GENETICA CUANTITATIVA

• RELACION DE PARENTESCO (axy)

• Un individuo está genéticamente

relacionado así mismo en un 100%, la

relación entre los padres y sus hijos es

de 50%, con sus nietos el 25% y con sus

bisnietos el 12.5%.

Page 40: GENETICA CUANTITATIVA
Page 41: GENETICA CUANTITATIVA

• El ancestro “A” transmite la mitad de sus genes a B {aAB = (½)1 = ½} El individuo “B” transmite la mitad de sus genes a C {aAC = (½)(½)=(½)2 = 1/4}. Similarmente el individuo C transmite la mitad de sus genes a D {aAD = (½ )(½)(½) = (½)3 = 1/8}

Page 42: GENETICA CUANTITATIVA

• Para establecer el grado de parentesco entre A

y G (aAG). Contabilizar el número de

generaciones (n) para cada ruta diferente que

une al individuo G con su ancestro A. Así:

• nGEA = 2 , nGFCA = 3 , nGEDA = 3

Page 43: GENETICA CUANTITATIVA

• Como cada individuo transmite la mitad

(½)de sus genes, entonces :

Page 44: GENETICA CUANTITATIVA

• Para establecer la relación de parentesco de dos individuos con más de un ancestro en común pero que no son descendientes directos (colaterales). Como por ejemplo :

Page 45: GENETICA CUANTITATIVA
Page 46: GENETICA CUANTITATIVA
Page 47: GENETICA CUANTITATIVA
Page 48: GENETICA CUANTITATIVA

COEFICIENTE DE

ENDOGAMIA (Fx)

Page 49: GENETICA CUANTITATIVA

• El coeficiente de endogamia de un

individuo mide el porcentaje de genes

idénticos que tiene con sus

antepasados. En una población indica

el porcentaje de un loci, que son

heterocigotas en la población, y que se

han convertido en homocigotas por

efecto de cruces consanguíneos o

endogámicos.

Page 50: GENETICA CUANTITATIVA

• Es decir, el coeficiente de

endogamia mide el aumento en la

homocigosis en una población de

individuos estrechamente

relacionados por consanguinidad.

Page 51: GENETICA CUANTITATIVA

100

25 50 25

25 12.5 12.5 25 25

12.5 6.25 6.25 37.5 37.5

6.25 3.125 3.125 43.75 43.75

AA Aa aa

1/4 1/2

1/2

1/2

1/2

1/4 1/4

1/4

1/4

1/4

1/4

1/4

1/4

Page 52: GENETICA CUANTITATIVA

% Heterocigosidad % Homocigosidad

• 100

• 50

• 25

• 12.5

• 6.25

• 0

• 50

• 75

• 87.5

• 93.75

Generación

1

2

3

4

5

Page 53: GENETICA CUANTITATIVA

• 1. En función de la relación de parentesco

(axy)

• FX = ½ axy FX : 0 1

(Mayor Homocigosis)

Page 54: GENETICA CUANTITATIVA

• 2. Por fórmula:

• FX = (½)n n = Número de

individuos que unen a los

parentales del individuo

X con el ancestro común.

Page 55: GENETICA CUANTITATIVA

• 3. Si hay un antepasado consanguíneo

entonces:

• FX = (½)n (1+FA)

• FA : Coeficiente de

Endogamia del

antepasado común.

Page 56: GENETICA CUANTITATIVA
Page 57: GENETICA CUANTITATIVA
Page 58: GENETICA CUANTITATIVA
Page 59: GENETICA CUANTITATIVA
Page 60: GENETICA CUANTITATIVA