Upload
others
View
12
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Hastane enfeksiyonları ve moleküler epidemiyoloji:
Hastane infeksiyonlarının gerçek-zamanlı takibi ve enfeksiyon
oranlarına etkisi
Barış Otlu
İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi
Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
“Hasta oluyordum ve sen hemen geldin
Yanında yüz öğrenciyle, oh Simmakus
Yüz soğuk el bana dokundu
Hiç ateşim yoktu, oh Simmakus, şimdi var”
Hastane İnfeksiyonları Tarihi
Kurtuluş Töreci, Hastane İnfeksiyonlarının tarihçesi
Hastane İnfeksiyonları Kirabı, 2003
3. Yüzyıl Roma Şiiri, Bir hastanın Dr. Simmakus’a seslenişi
Hastane İnfeksiyonları Tarihi
• Hastane kavramı ile hastane infeksiyonları kavramının birlikte geliştiği
düşünülebilir.
18.yy’ da Hotel Dieu;
ampütasyonlardan ölüm oranı %60 ,
salgın sırasında lohusalık hummasından ölüm oranı 19/20
Hastane İnfeksiyonları Tarihi
• 1840 Hastane İnfeksiyonlarının tespiti ve önlenmesi
ile ilgili ilk bilimsel yaklaşım. El hijyenin önemi
Ignaz Semmelweis
from Notes on Hospitals published in 1863
Hastane İnfeksiyonları Tarihi
Yoğun Bakımlar
• 1952
Yoğun Bakım ve Salgınlar
Yoğun Bakım ve Salgınlar
imipenem (MK0787)
PubMed’de son 35 yılda 200 den fazla Acinetobacter spp.
salgını yayın haline gelmiş !!!
0
2
4
6
8
10
12
14
16
18
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 341980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 2013
Son dört ayda 112 Hastane Salgın
Hastane İnfeksiyonları ve direnç problemi
FDA ve EMA tarafından onaylanan yeni antibiyotik sayısı
Hastane İnfeksiyonları-Sınıflandırma
• Endemik Hastane İnfeksiyonları
Bir hastalığın belirli bir yerde (örneğin bir hastanede) her zaman
beklenen görülme düzeyi.
Hastane İnfeksiyonlarının %90-95
• Epidemik Hastane İnfeksiyonları
Hastane infeksiyonların yaklaşık %5-10
Görülme sıklığı: 1/10.000 yatış
Epidemik Hastane İnfeksiyonları-Salgınlar
vaka
say
ısı
zaman
• Kaos ve kargaşa başlar.
• Komplo teorileri üretilir ve gerçeklerden daha çok bu bilgilere inanılır.
• Suçlamalar başlar
Epidemik Hastane İnfeksiyonları-Salgınlar
Hastane İnfeksiyonları ve Mikrobiyoloji Laboratuvarı
• İnfeksiyona neden olan etkenin belirlenmesi
• İzolatlar arasındaki klonal ilişkinin ve bulaş kaynağının araştırılması
₋ Etkenin hızla tespiti
₋ Antimikrobiyal duyarlılığın belirlenmesi
₋ Antibiyotik direnç genlerinin tespit edilmesi
₋ Virülans genlerinin belirlenmesi
₋ Hastane salgınlarının araştırılması
₋ Salgının kaynağının belirlenmesi
₋ Dirençli bakterilerin izlenmesi
₋ Re-aktivasyonun yeni bulaştan ayırt edilmesi
₋ Hastane ve toplum kaynaklı infeksiyonların ayırt edilmesi
₋ Endojen-ekzojen kaynaklı infeksiyonların ayrımı
Hastane İnfeksiyonlarının Hızla Belirlenmesi
Moleküler Epidemiyoloji
“Moleküler Epidemiyoloji 21. yüzyılın
en önemli ve heyecan verici
araştırma alanlarından biridir”
Hasnain SE. Molecular epidemiology of infectious diseases: a case for increased surveillance. Bull World Health Organ. 2003;81(7): 474.
Moleküler Epidemiyoloji
Moleküler Epidemiyoloji
Moleküler Epidemiyoloji
• Bugün için ise moleküler epidemiyoloji terimi;
genellikle “moleküler biyolojik yöntemlerle suş tiplendirme”
çalışmalarına verilen ortak bir isim gibi kullanılmaktadır.
Moleküler Epidemiyoloji
Moleküler epidemiyolojinin sınırlarını;
- etken mikroorganizmanın tespiti
- bulaşma yollarının araştırılması
- virülanslarından sorumlu genlerin belirlenmesi ve
- izolatlar arası klonal ilişkilerin araştırılmasını
kapsayan geniş bir yelpazede çizilmiştir.
Ne ?
Nezam
an
?
Niçin?
Nasıl?
Moleküler
Epidemiyoloji
Moleküler Epidemiyoloji
• Etkenin belirlenmesi ve izolatların moleküler karekterizasyonu
• İzolatlar arasındaki klonal ilişkinin araştırılması
Moleküler Epidemiyoloji
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• İzole edilen mikroorganizmaların;
• antimikrobiyal direnç genleri
• virülans genleri
• mobil genetik elemanları
plazmid
transpozon
İntegron
• hücre duvar yapıları araştırılmalıdır.
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Yoğun bakım ünitesinden izole edilen;
zaman ve mekan açısından kümeleşme gösteren
27 P. aeruginasa izolatı.
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Karbapenem dirençli 16 P. aeruginasa izolatında (karbapenemaz +)
karbapenem ile ilişkili olduğu bildirilen direnç genleri in-house PCR ile
araştırıldı.
- OXA-48 - OXA-23 - OXA-2 - VIM - KPC
- NDM - GES - SMP - GIM - SIM
- OXA-10 +
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Orijinal OXA-10 gen ürünün alfa yapısı beta’ya döndüğünde OXA-48
benzeri karbapenemaz benzeri etkin gösteriyor.
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
16 izolatta
• OXA-10 geninin PCR ile gösterilmesi ve dizi analizi
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Class I İntegron üzerinde taşınıyor.
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Class I İntegronun karakterizasyonu
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Class I Integronun karakterizasyonu
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Karbapenemaz aktivitesinin araştırılması
• Karbapenemaz (-)
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Karbapenem direncinin nedeni OXA-10 olamaz!
• Hücre duvarından karbapenem geçişini etkileyecek bir değişim var mı?
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Karbapenem direncinin tek nedeni bu olabilir mi?
• Hücre duvarından karbapenem geçişini etkileyecek bir değişim var mı?
CR-Pa CR-Pa
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• OXA-10 taşıyan Class I İntegrona sahip izolatlarda
47 kDa OMP eksiklik var.
Class I İntegron
bakteri genomu
OM
P
CR-Pa
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Neden sadece OXA-10 taşıyan izolatlar karbapenem direncine sahip?
Class I İntegron
genomda hemen her zaman aynı yere
insersiye oluyor
karbapenem geçini sağlayacak dış membran
proteinin sentezini önlüyor (47 kDa)
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Nedensadece OXA-10 taşıyan izolatlar karbapenem direncine sahip?
Class I İntegron
İzolatların Moleküler Karakterizasyonu
• Suşla ilgi tüm veriler ve sekans bilgisinin GenBank kaydı yapıldı.
İzolatlar Arasındaki Klonal İlişkilerin Araştırılması
PFGE
AP-PCR
MLST
RFLP AFLP
RAPD
Dizi analizi
- Pulsed field gel electrophoresis (PFGE)
- PCR-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP)
- Random amplified polymorphic DNA (RAPD)
- Arbitrarily primed polymerase chain reaction (AP-PCR)
- Repetitive extragenic palindromic element-PCR (rep-PCR)
- Amplified ribozomal DNA restriction analysis (ARDRA)
Moleküler epidemiyoloji için yöntemler
• Sağlık bakımı ile ilişkili mikroorganizmaların moleküler tiplendirilmesinde;
kromozomal DNA polimorfizmine dayalı olan yöntemler, hızlı ve güvenilir olmalarıyla ön
plana çıkmaktadırlar.
Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE)
• Bir çok mikroorganizma için halen «altın standart»
genotiplendirme yöntemidir.
Infect Genet Evol. 2010 Oct;10(7):866-75. Epub 2010 Aug 6.
Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE)
• Kromozomal DNA polimorfizmine dayalı,
tüm genomu hedef alan genotiplendirme yöntemidir.
• Sağlık bakımı ile ilişkili salgınların araştırılması ve bulaş kaynağının belirlenmesinde
• Bu yöntemlerle izolatlar arasındaki ilişkilerin belirlenmesinde;
− bant paternlerinin benzerlik yüzdesine ya da
− bant sayısı ve büyüklüğündeki farklılıklara göre değerlendirme yapılır.
Pulsed Field Gel Electrophoresis
Bakterilerin Parçalanması ve diyaliz
Elektroforez
• Yöntemin ana basamakları
Bakteri Kalıplarının hazırlanması
10 m
m
Sonuçların Analiz
RE ile kesim
En iyi ihtimalle 2-3 ya da üç gün
• Görüntüleme
− Fotoğraflar dijital kamerayla ve programların çoğunun kabul ettiği TIFF formatında
çekilmelidir. İyi görüntülenememiş tiplendirme sonucu veri olarak değer
kazanmamaktadır.
Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE)
• Sonuçların analizi ve yorumlanması
Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE)
• Sonuçların analizi ve yorumlanması
• İlk defa Tenover ve arkadaşları 1995 yılında PFGE sonuçlarının
yorumlanması için belirli kriterler önermişlerdir.
“aynı” “yakın ilişkili” “muhtemel ilişkili” “ilişkisiz”
Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE)
Pulsed Field Gel Electrophoresis
• Sonuçların analizi ve yorumlanması
• Sonuçların analizi ve yorumlanması
• Bu amaçla en çok kullanılan bilgisayar programları;
- Gel-Compar (Applied Maths, Kortfijk, Belgium)
- Dendron (Solltech, Oakdale, Iowa)
- Diversity Database Fingerprinting Software (Bio-Rad)
- Gene Profiler (Scanlytics, Fairfaz, Va)
- Phoretix 1-D (Nonlinear USA, Durham, N.C.)
- Quantar Pro (KeyGene Producrts, Wageningen, Netherlands)
- Taxotron (Taxolab, Institut Pasteur, Paris, France)
Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE)
Genotip P-VIII -Suşlar anestezi-reanimasyon
yoğun bakım ünitesinden, beş
aylık bir dönemde izole
edilmiştir.
Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE)
• Sonuçların analizi ve yorumlanması
Arbitrarily Primed- PCR (AP-PCR)
• Moleküler epidemiyolojik çalışmalar için kullanılan bir hızlı
DNA fingerprinting yöntemidir.
• Kısa primerler kullanılarak
DNA’daki benzer bölgelerin amplifikasyonu yapılır.
ürün 2 ürün 1 ürün 3 ürün 4
ürün 5 ürün 6
PCR Reaksiyonu
Arbitrarily Primed- PCR (AP-PCR)
Otlu B, Durmaz R. Farklı bakteri ve maya türlerinin alttiplendirilmesinde için ortak bir “arbitrary primed” polimeraz zincirleme reaksiyon (AP-PZR) protokolü. Durmaz R (editör). Uygulamalı Moleküler Mikrobiyoloj. 2. Baskı. İstanbul: Nobel Tıp Kitabevleri, 2001:208-213
• Bu yöntemin başarısı ;
- kullanılan primerlere
- amplifikasyon karışımının içeriğine
- ısı döngülerine
- elektroforez koşullarına
- ve sonuçların yorumlanmasında kullanılan kriterlerden önemli ölçüde
etkilenmektedir.
• Standardizasyon zor
Arbitrarily Primed- PCR (AP-PCR)
Rep-PCR
• Hastane salgınlarının hızlı tespiti için geliştirilmiş olan Diversilab
Sistemi (Biomerieux, Fransa) Rep-PCR tabanlı otomatize bir
tiplendirme sistemidir.
• Tekrarlanan gen bölgelerini hedef alır.
― REP-PCR (DiversiLab Sistemi)
― REP-PCR (DiversiLab Sistemi)
• Hızlı
• Tekrarlanabilirliği yüksek
• Amplifikasyon ve elektroforez aşamaları
standardizde edilmiş
• Bant pattern analizleri için yazılama sahip
Rep-PCR
Moleküler Epidemiyolojiye Başlarken
• İzolatlar tür düzeyinde doğru olarak tanımlanmalı
• Klasik epidemiyolojik veriler eksiksiz olarak toplanmalı
• En uygun yöntemler seçilmeli
- Hızlı
- Uygulaması kolay
- Ayrım gücü ve tekrarlanabilirliliği yüksek
- Sonuçları kolay yorumlanabilmeli
• Çalışılacak mikroorganizmanın genom özellikleri iyi bilinmeli.
Moleküler Epidemiyolojiye Başlarken
• Yoğun bakımdaki 4 hastanın trakeal aspiratından ve 5 hastanın
balgamında S. maltophilia üretildi
• Çevre kültürlerinden, 1 nebulizatörde aynı organizma üretildi.
• Çalışılacak mikroorganizmanın genom özellikleri iyi bilinmeli.
Moleküler Epidemiyolojiye Başlarken
Moleküler Epidemiyolojiye Başlarken
• S. maltophilia suşları hiper mutasyona sahip
Moleküler Epidemiyolojiye Başlarken
• S. maltophilia suşları hiper mutasyona sahip.
• Aynı suşun seri pasajları;
500 bp
Moleküler Epidemiyolojiye Başlarken
• S. maltophilia suşlarının moleküler karakterizasyonu.
Class I Integron
Class I integron PCR Miniprep ile Plazmid DNA ekstraksiyonu
Plazmid profil analizine ihtiyaç var
Moleküler Epidemiyoloji Ne Zaman Kullanılmalı ?
• Her zaman
Moleküler Epidemiyoloji Ne Zaman Kullanılmalı ?
• Real-time monitorization of nosocomial infections in intensive care units with
molecular epidemiologic tools: Impact on infection rate.
Real- memonitoriza onofnosocomialinfec onsinintensivecareunitswith
molecularepidemiologictools:Impactoninfec onrate.
RESULTS
INTRODUCTION
Ac vesurveillanceprogramsarerequiredforrapiddetec onofoutbreaksandtransmissionsourcestoreducenosocomialinfec onrates.Molecularepidemiologicalinves ga onshaveplayedanimportantpartin
exposingtherela onshipbetweencausa veagents(1).However,theretrospec venatureofsuchstudieslimittheirrelevanceinrou neclinicalprac ce.Ouraimistodeterminetheclonalrela onshipbetween
nosocomialinfec onagentsisolatedfromourhospital'sIntensiveCareUnit(ICU)inreal me(onthedayofisola on)andtoinformtheHospitalInfec onControlCommi ee(HICC)topromptlytakenecessary
precau onsandac ons.Thepreliminaryresultsofthefirstninemonthsarepresented.
MATERIAL AND METHOD
Only clonally similar strains with rep-PCR genotyping were confirmed with pulsed-field gel
electrophoresis(PFGE)followingarapidPFGEprotocoldescribedpreviouslywithminormodifica on
(3).Briefly,bacterialcoloniesgrowninthenutrientagarwerecollectedandsuspendedin1mlcell
suspensionbuffer,andthenre-suspendedin2%low-mel ngpointagarose(GibcoBRL,Paisley,UK)
plugs,andwerelyzedinthecelllysissolu on-1andcelllysissolu on-2.A.baumannii,P.aeruginosa,E.
coliandK.pneumoniaDNAwasdigestedrespec velywithusingApaI,SpeIandXBAIenzyme(Promega
Corpora on,US).FragmentedDNAwaselectrophoresedin1%pulsed-fieldcer fiedagarose(Bio-Rad
Laboratories,US)byusingwithaCHEF-DRIIsystem(Bio-RadLaboratories,Belgium).TheDNAbandson
thegelwerevisualizedundertheUVlight,photographedusingtheGelLogic2200imagingsystem
(Kodak,USA),andthebandprofileswereanalyzedusingtheGelCompareso ware(AppliedMaths,
Belgium).DendogramsofthePFGEbandingpa ernswerecreatedbyusingDicesimilaritycoefficient
and“Unweightedpairgroupmethodwithmathema calaveraging(UPGMA)”andclusteranalysiswas
performed.TheisolateswithDicesimilaritycoefficient≥90%(toleranceof1%inbandposi on)were
designatedas“clonallyrelated”8whiletheywereclassifiedasindis nguishable,closelyrelatedand
possiblyrelatedwhentheyhadDicesimilaritycoefficientvaluesof100%,95-100%and90-95%,
respec vely.
Duringthestudyperiod,atotalof5340pa entsand33410pa entsdaysweremonitoredinICU's.In
251ofthesepa ents,310(5.8%)hospital-onsetinfec onsweredetected,reflec ngadecreaseof
2.6%comparedtothepreviousyear(p=0,006).Eighty-fourA.baumanniiisolateswereassignedto34
differentsetswithaclusteringrateof67.8%.For32P.aeruginosa,23E.coliand29K.
pneumoniaeisolates,theclusteringratewascalculatedrespec velyas6.5%,25%and13%.When
comparingtheinfec onrateswiththepreviousyearanincreasewasobservedfrom8to10per1000
pa entdaysinthefirstquarter.However,inthesecondquarter,theinfec onratedecreasedfrom
12.2to7.9,andfrom11to9.7per1000pa entdaysinthethirdquarter.Thetotalinfec onratefrom
10.7to9.2per1000pa entdayscomparedtothepreviousyear(Z=1.8p=0,036).
ThisstudywascarriedoutinInonuUniversityTurgutOzalMedicalCenterwithacapacityof255ICU
beds out of 1140 total beds. Isolated A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli or K.
pneumoniamicroorganismsfromICU'shavebeensubjectedtotheRep-PCR-basedDiversiLab®system
formoleculartypinginreal mesinceJanuary1st,2013.Briefly,theDNAoftheisolateswasextracted
usingtheUltraCleanMicrobialDNAIsola onkit(MoBioLaboratories,SolanaBeach,CA,USA)kits,
then,therep-PCRwasperformedusingGeneampPCRSystem9700thermocycler(AppliedBiosystems,
FosterCity,CA,USA)andDiversiLabKit.Theamplifiedfragments,ranging100-1000bpinsize,were
separatedelectrophore callywiththemicrofiluidlabchip.Electrophorogramsweredownloadedand
automa callyanalyzedbytheDiversiLab(version3.4).Finally,theso warecreatedacustomized
reportpresen ngadendogram,electrophorograms,virtualgelimages,andsca erplots.Clonal
rela onshipsoftheisolatesweredeterminedaccordingtopreviouslydescribedcriteria(2).Eachnewly
typedisolatewasinves gatedforclonalrela onshipbetweenthepreviouslytypedisolatesusing
DiversiLabso ware,andHICCwasinformedwhenanewisolatewasincludedinanycluster.The
epidemiologicallinksbetweenclonallyrelatedstrainswereanalyzedbyHICC,routesoftransmission
inves gated,precau onstakenandmee ngsappointedasrequired.
CONCLUSION
Baris Otlu1, Yasemin Ersoy2, Çigdem Kuzucu1, Yasar Bayindir2, Uner Kayabas2, Funda Yetkin2, Emine Tunc1, Nalan Parmaksiz3, Canan Kizilkaya4, Yusuf Yakupogullari1
1Medical Microbiology, Inonu University Faculty of Medicine, Malatya, Turkey. 2Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Inonu University Faculty of Medicine, Malatya, Turkey.
3Infection Control Nurse, Inonu University Faculty of Medicine, Malatya, Turkey. 4Medical Microbiology, Ankara University Faculty of Medicine, Ankara, Turkey.
Togetherwiththeaddi onalac onsheld,annualinfec onratedecreasedtofrom10.7to9.2per1000pa entdayscomparedtothepreviousyear.Molecularepidemiologicaldatahasbecomeaconvincing
evidencetoencouragethecliniciantoembracetheprecau onstobetakentowardsanoutbreak.
Ourresultsshowsthatmoleculartypingwouldshortenorevenpreventanepidemicandthereducetheincidenceofnosocomialinfec ons.Inourhospitalintensivecareunits,themostfrequentisolatedspecies
wasA.baumannii.Theseisolatesalsodisplayedsignificantlyhigherclusteringra o.WewerenotabletoameliorateA.baumaniiinfec onratestodesiredlevels,opposedtootherpathogenswhichsharesimilar
transmissionroutes.Therefore,thesefindingssuggestthepossibilityofalterna vetransmissionroutesforA.baumaniiwai ngtobeunveiled.
Ourresultsemphasizethat,rapidmoleculartypingofmicroorganismsinhospitalswithmolecularepidemiologytoolsshouldbeoneoftheessen alcomponentsofacomprehensiveinfec oncontrolprogram.
Obviously,epidemiologicalandmoleculartypingdatashouldbeevaluatedtogethertodevelopeffec veinfec onpreven onstrategy.
REFERENCES
1-SabatAJ,BudimirA,NashevD,Sá-LeãoR,vanDijlJm,LaurentF,GrundmannH,FriedrichAW;ESCMIDStudyGroupofEpidemiologicalMarkers(ESGEM).Overviewof
moleculartypingmethodsforoutbreakdetec onandepidemiologicalsurveillance.EuroSurveill.2013Jan24;18(4):20380.
2-ArianeDeplano,OlivierDenis,HectorRodriguez-Villalobos,RafDeRyck,MarcJ.Struelens,MarieHallin.ControlledPerformanceEvalua onoftheDiversiLabRepe ve-Sequence-BasedGenotypingSystemfor
TypingMul drug-ResistantHealthCare-AssociatedBacterialPathogens.JClinMicrobiol.2011October;49(10):3616–3620.
3-DurmazR,OtluB,KoksalF,HosogluS,OzturkR,ErsoyY,AktasE,GursoyNC,CaliskanA.Theop miza onofarapidpulsed-fieldgelelectrophoresisprotocolforthetypingofAcinetobacterbaumannii,
EscherichiacoliandKlebsiellaspp.JpnJInfectDis2009;62(5):372-7.
cluster5
cluster6
cluster5a
DiversiLabTyping Confirma onwithPFGE
Figure1.A)rep-PCR-baseddendogramandvirtualgelimagefingerprintsobtainedfromA.baumanniistrainswithusingtheDiversiLabsystem.
B)FoundsimilarwithDiversilabofstrainsconfirmedbyPFGE.
similarityline%95
A B
Gen
otype10
Gen
otype15
similarityline%90
A B
Figure1.A)rep-PCR-baseddendogramandvirtualgelimagefingerprintsobtainedfromE.colistrainsusingtheDiversiLabsystem.B)
FoundsimilarwithDiversilabofstrainsconfirmedbyPFGE.
• Yoğun bakımlardan izole edilen sağlık
bakımı ilişkili tüm etkenleri aynı gün Rep-
PCR ile tiplendirdik.
• Klonal ilişki konusunda HİKK ne hızla bilgi
verip, ilişkili bulunan suşları PFGE ile
doğrulama çalışmaları başlatıldı.
• Dirençli izolatların moleküler
karakterizasyonları yapıldı.
Moleküler Epidemiyoloji Ne Zaman Kullanılmalı ?
Yoğun bakım hastaları kültürde üreme ve identifikasyon
Rep-PCR ile tiplendirme ve izolatlarla karşılatırma
Komiteye bilgi ver ve ilişkiyi PFGE ile
doğrula
Karbapenemaz aktiviteisi
Direnç genlerini OXA-48, NDM1, VIM, IMP, GES
Mobil genetik elementler
Hastane infeksiyon kontrol komitesi
Hastane infeksiyonu
İzolatın moleküler karakterizayonu İzolatın genotiplendirilmesi
Kümeleşme yok İzolatlar “ayrı”
Kümeleşme var İzolatlar “benzer”
Moleküler Epidemiyoloji Ne Zaman Kullanılmalı ?
Moleküler Epidemiyoloji Ne Zaman Kullanılmalı ?
• Hastane infeksiyon kontrol komitesinin haftalık toplantılarına katıldık.
• Yoğun bakımlarda salgınlardan etkilenen hasta sayısı artmadan
müdahale edilmesine katkıda bulunduk.
• Vaka sayısının arttığı ancak
klonal ilişkili bulunmayan durumlarda HİKK farklı yollar izledi
• Örneğin;
*DEĞER+,1
21,41
15,98
14,23
11,01 9,3 9
8,34
0
5
10
15
20
25
30
2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015
Hasta günü Hastane İnfeksiyonu Hızı %
Moleküler Epidemiyoloji Ne Zaman Kullanılmalı ?
• Hastane infeksiyon kontrol komitesinin çalışmaları ve aldığı önlemler ile;
Eldeki tüm imkanlar kullanılmalı
Ne yapmak gerekiyor ?
• Hastane İnfeksiyonları,
sık görülen komplikasyonlar olduğundan bu enfeksiyonlar sürekli olarak takip edilmeli
ve salgınların önlenmesi için stratejiler geliştirilmelidir.